Lcy01g012780 (gene) Sponge gourd (P93075) v1

Overview
NameLcy01g012780
Typegene
OrganismLuffa cylindrica cv. P93075 (Sponge gourd (P93075) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationChr01: 33990494 .. 33993785 (-)
RNA-Seq ExpressionLcy01g012780
SyntenyLcy01g012780
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGGATCAGGGCACAGGGCTCACAGCAGACAGCTCTAGGAGTGGTGGGGATGGTGGCCTACGCCTCTTCTTCCTGCAGCAGTTGGTGAGTAGGGACACAAACCCTCTGTGCTGCACACTATATATAATATCATTTCAAGCTTGAAATCTTAAGAACATGGTTGAATGAAAGAGTGGTGATATTGACATGATTGAAAGCCCTTATTAATTAGAAACGATGGAAACTTTGCCAATCTTCTTCTTTTAGAACTACTTTGACTGGTTTCTTTTTTTACTCATTAAAGATGATTTTCTACTTTATTGATAGGCATTGCTGCATTGTTGGTATTTGATGTAGTATAATGGTTCGAATTTATAACTCTTGTGGCTTAATAAAAAGGTGTGAAAGCAAAAGAAGTACCTTGTCTGTATCCCTTATGGTTTCTTTGTCTTTCAGTATAATTACAAAAGGGAAGGAGACATCACCCGTAAAAGAAGGTAAGCAGCTGTTCCCTCCTTTTCATTTACTAATACACTTTTAATCTAATGGCACTGTTGCTAATTTCGTAATTAAATGCATGATAATGTAAAGGTAATCCAATCCCACGTCTCAAAATCAAAGCTTACGTCTGCTGATTTGTTGTCTGATTTCTTTGTTGTGCATGCGAACCAAATTAGAGACCACTGTTGCTGGTCAAAGGTCAAGAACCAGGCAGTGTTCTTTATGTAGGATAGGAAGCGAGACAAAGCCTGTGTAGATCATCATCGTGTTCGTTTACTTTGGACCCATTAGCCGTAAAAGATTCTTTATTTGAAGCGTTTCAACCTTTTCTTTTAATCATTAAATGTGAATTATAAGTCTCTTTTTGTTACATGATTTGGCAATTATATGTTGTAGAAGGCATATAGGGACAGTTTTATGTGTTAGACTCAATCTGATTTGAAGATTATTTTTTGTTCTAAATGATATATTTGTTAATTAGGGTGTGTTTGGACTGGAGTGCTAAAAAAGAAGAAATACCCGTACGAGTTCAACTTCTATATTATATATATTGAAACTTATCTAAGAGCATGAGCTGTATTTTGAAGAAGAAAGAGTGAAATGAAATATAAAGGCTGCAGAAATTGGCAGATAAAGATGATAAGACCTTAATTGGAAGTAGTGAAGATTCATAGGGAATCTATGAATTATTTATGTATTGAAAACAAACAAATACAGAGATTATTTCGTTCAAAATTAGGAAAGAAAGAAAGAAAGAGAAAGGAAAAGAGTAAGACTGGCAACATTGTTGAAAGTTCAAACCGAAAAATGTAGTGGGGTTGGTCCACAGAATAATGCAATGATTATTGACGATAAGGAAATACACGACAGCATAAAAAAGGGTAATACTAATGGTTTGGTTAATTGTTTTTGTTTAGAATATTGTGTTTAAATTACGGGTATATTATAAAAAATACCTCAGAACTATAGAGTTGGTGAATTATACCCCCGAACTTTCAAAAGTTTCGTTTTAGCCCTTCAAGTTTGTAATTTGTCTTAAAACAACACTTGGAGACACTTTTTGCTAAACATGATGTGTTTGTCTGTGTTTTTATTGTTTTTTTCCACATATATGTTCAAATCTATTCATATGAGTAACATTACGTATGCAAACACATTATTTTTGTCCATGAATTTATCTAAAAAAAACATTCAAGGGTTATTTTGAAACAAATTTCAAACTTTAAAGGCTAAAACCAAACTTTTGAAATTTCAGAGGTATAATTGAAACTAACCCAGTAGTTCAATAGTATTTTTGATAATTTAACCTAAAATTATTGGATGGTTCCTTCTCGGAAAAAAAAAAAAAAGAAATCTCCTCGTGTTCAGAATATAGTATTAAATTTCTTGGATGGATTTTTTTTTTTTACCAAAAAATAGTTTATTTGGTGAAGATTCAAAGTTTTGACCTATTGAACAAATTACTAGTTAAATTTACTTTTTAGTCTTTATAGTAAGTCATAGGATGTAAGTTGGTAAGTTTAGTCCCTATACTTTCAGTGTTATGTCAATTTGGTCTTTAAACTTTAAAAAGTTTTAAATTGGTCATTAAACTTTCAATTTTATGTCTAATAGGCCTCTCGACTTTAAATTTTGTGTTTGATAAGTTTTTGACCTATTCGATATTTTTTAAAATTCATAAGTCTACCAGATATAAAATTGGAAGTTTAAGATCCCAATAGGCATAAAATTTAATTTTATATCTAGTAGATTGGTTAATTTTAAAAAATCTCGACTATGCTATGCTAGGATTAGACACAAAATTGAAAGTTGGGAAACCAATTAGACATTTTTAAAGTTCAAAGATTTATTAAACACAAATTTGAAAGTTCATGGATCTATTAGACACCTTTTTGAAATTCAGAGTCCAAATTGACACAATTCTGAAAGTTTGGGACTAAACCTACAATTGAACCAAGGTAAGTTTTATATCAATATTGGAAGTTTAACTGATAACTTTGTTGTTTAAATCATATTGAATAATGCTAACATAACAAGTTATTATGTGTAGATGCAACAAATGACGTTTGTGAGAAAAATTGATACGTCAGTTTGAAATGGCAAGATATTTAATTTTGTTAAGAACGAAGAATTGGATTGGATTTTAAAATGAAATTTGAAAGTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGAAAAACTTGATTATATATCAACCCATGAAACCAGGTCTATTACATCTACAAATAATTTGTATTAAAATTCTGTTACCTCTCATTAATTATTTAGATGTTTTAAACCCAATAATGGGCAATAAGAGTTGTGTAAACTTGTAGAGGAAACAAGTTCAGGTTATATCACCACTTTTAATATCCTATAATTTATTTGTAGAACTAAATGTAATAGGATCAGAACGATTGTCCTAAAAAAAATAGTTGATATGCATATGTGCAAGCTAACTCGAGATCTCACAAATTAAATTTGAAATGTAAAAATGTTGCCATTTATTTCAAAAAGATATATGCCCTCCAATCCAATGGCAAATTTCATGAAGTAAATTGCAGTAAAGAGCGGGTGATGTTGAAAACGGGTTAAGTCCATTCACCAAGAAAAATAACCAAGGAACTCAAACGAACCAAGGAACCTACTGGACTCAAAACGTTGCTTATCACAGATCTGAGGTGCTGGCGGCAATGAGACCAGCAACGGTAAGCGGACAAATGCGGGTAAAAGAGGCTGAAACGCGCGACGCAGAAGACCCGATAGCGACAGTTCACGGCGCGATCGAATGA

mRNA sequence

ATGGATCAGGGCACAGGGCTCACAGCAGACAGCTCTAGGAGTGGTGGGGATGGTGGCCTACGCCTCTTCTTCCTGCAGCAGTTGTATAATTACAAAAGGGAAGGAGACATCACCCGTAAAAGAAGATCTGAGGTGCTGGCGGCAATGAGACCAGCAACGGTAAGCGGACAAATGCGGGTAAAAGAGGCTGAAACGCGCGACGCAGAAGACCCGATAGCGACAGTTCACGGCGCGATCGAATGA

Coding sequence (CDS)

ATGGATCAGGGCACAGGGCTCACAGCAGACAGCTCTAGGAGTGGTGGGGATGGTGGCCTACGCCTCTTCTTCCTGCAGCAGTTGTATAATTACAAAAGGGAAGGAGACATCACCCGTAAAAGAAGATCTGAGGTGCTGGCGGCAATGAGACCAGCAACGGTAAGCGGACAAATGCGGGTAAAAGAGGCTGAAACGCGCGACGCAGAAGACCCGATAGCGACAGTTCACGGCGCGATCGAATGA

Protein sequence

MDQGTGLTADSSRSGGDGGLRLFFLQQLYNYKREGDITRKRRSEVLAAMRPATVSGQMRVKEAETRDAEDPIATVHGAIE
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (P93075) v1
Date Performed: 2021-12-06
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 57..80

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Lcy01g012780.1Lcy01g012780.1mRNA