Lag0042170 (gene) Sponge gourd (AG‐4) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGACAAAGATGAAATAGATGGGGAACTCCAAGTAGATGGGTCTATCCCCCACCCACTTATCCTCCCAAAAGTACGTGTCTTTCTCGTCCCCCACCACACAATGAACAAGGCTAGAGAAAGAAGGGAGCTCCATGACAATATCTTTCCAAAGATTTCTGGAAGTGCCCCTAACCTCACCCAACAACCACTCGAAAGGATGAACGTCGTATTTACTCACAATTATCTATACCATAAGGATAAAGACTCATGGGGAAAATACCAAAGCCATTTAGCTAACAGAGTTTTGTCACGGATCCTAAGGGTCCGTTTGGTAGGTGATCTGAAAACAGAAATTTAAAAACAAGGGATTCAATGAAAACAGAGTTGTATTTCATGTTTTCAGATATGTGTTTGGTAGCAAATTCAAAAATTTGATTCCAATTTCAAAAATTGTTCAAAATGTGTTTGATAATATATTTATAAACCATAAATTATTTGTAGTTATCAATTAAAGTATTAAGTTGAATATAGACTATTATTAATTAATTTATAAACATTTTATATGTTTTTTTTTTTAAAAGGAAACAATCTTTTCATTGAAGAAATGAAAAGTGACTAATGCTCAAAATATAATGATACAAAAAAACATTTTATATGTTATAAATTTTGTATAATTATTATTTTATAATATCATATAATTTATAATACATTATATTATAGATATCCCCCCCGAATGCTCTCTCCTCTTTCCTCTCTTTCCCTCTCGTCGGCCTTCATCCGTCGGATCAGTGTTTGTTCTTAGCCTTCATCCATTGAATCGTGCTTCAACTTGTCTACTGGTTATTGTCGTTGTTGTTTTGTCTCTTTTCTGGATTTTTCATCCTCCTTTTACTATGGAAGCCATCAGTTGTTGTATCCAAAATAGGTACTTTTATATTTGGAGGGAAGGAAATGTATATTTTATTGAAGATTTGTGCAAAAAGCAGTTGATTCCATTGTCCATCTCCTTTTTTCAGTGGTTTGAAAATGTTCTAGTTGAGTTATTGCAGAATCCTGTTTCTTCTTTCTTTCATCAGAAAATTAAGGAAGACTTTGGAGTCATTAGGTTGATTAAGTTCTTTTCGGATAATGAATGGTTTTTTGAATGTGCTGTTTGGCCTTCCACGGGTAGGAGGAGGACTATTCAAGTTCCAACGGGTTTGAATAAGAAAGGTTAGTATGTATTTTGGGAAATGATTAGGGATTTCTCTCTCAAAATTCACTCTTATGAGAATCAGTCAAATCGGTCATTGTTGAACAATTTGGAGGGTTTTCCTGTTTTAGCTAATGACTCAGAAGGTCAAGTCTTTCCTAACTCCTATGCTGAAGTGGGTAAGCGAGGTGGCTCTATGAAGAATTCATTCTCCCTGGAAGATTCAGGTAGAAATGTTAAGTTTGTTAATGAAGAAGCTTACTGGGTTTGTAAGAATTGGGATGTGCTGAAAATAGATTTGGAAAGTTCACTCGTTGTTTCTAGATTGATGGCCCATTATTCTTGGAAGAATGTTAAGATTGCCCTTGAGGATTTCTTTAAATCTTCAGTCTTTATCGACCCTTTTATGGATGATAAAGCTGTGATTCAGGTGGCAGATGGTTGTTTGGATCTTGTTGTGAATGGCAAGTGGAAGAAATTTGGGAACCTTCACTTGAAATTGGAATTGTGGTCCTCTGAAATCCATTCACAGCCAAAATTTATAAAAACTACGGAGGTTGGATTGCAATCAGAAATTTACCTTTGAATTTGTGGCATCGTGATTCCTTTGAAGCTATTGGAAAGAACCTTGGAGGGTTGGTTAGTATTTCATCTAATACGCTTAATTTATTAGATTGTTCTGAAGCCTTCATTGAAGTAGAAAAGAATTTTTGTGGCTTTATCCCTGTTGATATTAATGTTAAGATTGGTAATAAGTTTGAATTCTCTTTAAGATTTGGTGATATTAATGCATTAGAGGACAGTAATTTGAAGTTTGATTCAAGTAGAAAGTTAATAGTCAATGACTTTTCAAATTCCCTGGATGTAATTAGGGTTAAGCAAGTGATATTGGATGAAGAAGTGGACCTTGTAAATGAAGGGGTAAGGTTGAATGAATCGCCATTTATTTCTTGTTATCATGAGGAATTTAATGCGGCAATGGGTTCTCCAAAAGTTGCTTCAATGCATGATGAGCATATTAATTTCACAGGCTGTATTGTATCTCCCTCCAAGATGATTAATGACAGCAATTGCAATGTGAAAGATGATATACAGCAGCTACTGGGATCGTCAAATATCAGTTCTGAAAATGGGTTAATTCAGTCTAAGGATTTTAAGGAATTGTCTGACCAAATTCCAAGGGAGAGAGACCATTTTAATGAGGTATTGGGTTCTCCAAAAGGTGCTTCATTACATGATAAGTGTATTAATATTGCTGGCTGTAAAGATATTAATGTTAGCATTAATGAGACGGTTTCTTTTCTCTCTCCTTCTAAAGATGTTAATGCTATTAACAGTCTCCCCTCCTTCAAAGATGTTGATGCTATTAATGAGGCGTTGGGTCCTCAAGTTCAGCCGCCCCAGATTTATGAAACTCCTTCCAAGAATTTTAATGTCGTTACTTGCAATTTAAATAAGGATGTCCAGCACGTAACATTAAAGACCTATTCTCGAAAAAAGGCTTCTCATTCATTGGCTGTTAAGTCCAACGTTAATGCTAATCAATTGGAAGCTGAATGCACTCATCTAATTGTTGCAAATAAGGCTGTGGGATCTGCAAATGTCAGTGCTGGAAATGGGTTGTTTCAGGCCAAGGAATTTAAAGAATCTTCTGTTCGAATTCCAGGGGGAGTAATATTTTCGTCAGAGGTATTGGCAATTCTTATAAACATAGTACTCATTCTCCAGTGGAATCAGACTTTCGTCAGAGGTATTGGCAATTCTTATAAACATAGTACTCATTCTCCAGTGGAATCAGACGATGAGTCTACTGTTAGTGTAAGCAGTGAGGACTCTGATCACTTGTTGGATAAAGAGGAATGTGAGGAGCTCTTTTTAGAAGACCAAATTGGTGAGTCTTTGAATTCTATTTTTCCTGAGAATGATGATGGTCTAAGCTCTCAAGATTCCATTATTCATGAGTCTTTATTATCTCCTTCTCAAATTCCTAACCAGTTCTCTTCGTTAGTTGAAATTTGTGGACTTAAATTGTGCAAAATTTCACCCCAGGCTTCTAAAGTGGTTGTTTGATTCCTTCTTAATCAATTATGAAGATTGTTTCGTGAAATACCGACGGTCTTAGTGATAGGTCTATAAGGTTGTCGTTGAATGGGTTTCCTGGAATGTATCATGAATGTTCAAAAGTTCAGATCATCATCCTTCATCAAGTCTATCCGTGACCTTGAATTTGGAGAGGTCACTTGTTGTTTCTTCTAGTTTGTGTTTTGAGGTTGTGGCTGATTTTCAGTTGTTATGGTGGATTTGAGGATCAATTCCTAGAAGAATCTATCAATATGGGGTCCATTTGTTTCTCCGGGAAAGATTTTTTTTTTGGTGATTTTGTTGTTAAAGGATTTTAGCGTCCAATTACATCTATCATTCTTCATCTCTCTGGAGATGAAGGGTTGTACATGTCCCTGCTAGTTCTCCAATTTGTGGGACAAAACACGCAGTAAAAAGGTATGGAAGCTATATTTTTCTGGTGGCCAAAAGCTCCTCCAGGGTTTGTTTTGCCTGCATAGGTTTGTCGAAGCTTCTAGTCTCAAGTGCAATGGGATGCATGCGGATGGATATGGTATCATGGGATCAGTTTTTGGAGGAAAATGTTTGGGATTCTTCAGATGCCAGTTATTATCAGAGTCATTCAGCATTTGGATAG ATGGACAAAGATGAAATAGATGGGGAACTCCAAGTAGATGGGTCTATCCCCCACCCACTTATCCTCCCAAAAGTACGTGTCTTTCTCGTCCCCCACCACACAATGAACAAGGCTAGAGAAAGAAGGGAGCTCCATGACAATATCTTTCCAAAGATTTCTGGAAGTGCCCCTAACCTCACCCAACAACCACTCGAAAGGATGAACGTCGTATTTACTCACAATTATCTATACCATAAGGATAAAGACTCATGGGGAAAATACCAAAGCCATTTAGCTAACAGAGTTTTGTCACGGATCCTAAGGGTCCGTTTGTGGTTTGAAAATGTTCTAGTTGAGTTATTGCAGAATCCTGTTTCTTCTTTCTTTCATCAGAAAATTAAGGAAGACTTTGGAGTCATTAGGTTGATTAAGTTCTTTTCGGATAATGAATGGTTTTTTGAATGTGCTGTTTGGCCTTCCACGGGTAGGAGGAGGACTATTCAAGTTCCAACGGGTTTGAATAAGAAAGCTAATGACTCAGAAGGTCAAGTCTTTCCTAACTCCTATGCTGAAGTGGGTAAGCGAGGTGGCTCTATGAAGAATTCATTCTCCCTGGAAGATTCAGGTAGAAATGTTAAGTTTGTTAATGAAGAAGCTTACTGGGTTTGTAAGAATTGGGATGTGCTGAAAATAGATTTGGAAAGTTCACTCGTTGTTTCTAGATTGATGGCCCATTATTCTTGGAAGAATGTTAAGATTGCCCTTGAGGATTTCTTTAAATCTTCAGTCTTTATCGACCCTTTTATGGATGATAAAGCTGTGATTCAGGTGGCAGATGCCAAAATTTATAAAAACTACGGAGGTTGGATTGCAATCAGAAATTTACCTTTGAATTTGTGGCATCGTGATTCCTTTGAAGCTATTGGAAAGAACCTTGGAGGGTTGGTTAGTATTTCATCTAATACGCTTAATTTATTAGATTGTTCTGAAGCCTTCATTGAAGTAGAAAAGAATTTTTGTGGCTTTATCCCTGTTGATATTAATGTTAAGATTGGTAATAAGTTTGAATTCTCTTTAAGATTTGGTGATATTAATGCATTAGAGGACAGTAATTTGAAGTTTGATTCAAGTAGAAAGTTAATAGTCAATGACTTTTCAAATTCCCTGGATGTAATTAGGGTTAAGCAAGTGATATTGGATGAAGAAGTGGACCTTGTAAATGAAGGGGTAAGGTTGAATGAATCGCCATTTATTTCTTGTTATCATGAGGAATTTAATGCGGCAATGGGTTCTCCAAAAGTTGCTTCAATGCATGATGAGCATATTAATTTCACAGGCTGTATTGTATCTCCCTCCAAGATGATTAATGACAGCAATTGCAATGTGAAAGATGATATACAGCAGCTACTGGGATCGTCAAATATCAGTTCTGAAAATGGGTTAATTCAGTCTAAGGATTTTAAGGAATTGTCTGACCAAATTCCAAGGGAGAGAGACCATTTTAATGAGGTATTGGGTTCTCCAAAAGGTGCTTCATTACATGATAAGTGTATTAATATTGCTGGCTGTAAAGATATTAATGTTAGCATTAATGAGACGGTTTCTTTTCTCTCTCCTTCTAAAGATGTTAATGCTATTAACAGTCTCCCCTCCTTCAAAGATGTTGATGCTATTAATGAGGCGTTGGGTCCTCAAGTTCAGCCGCCCCAGATTTATGAAACTCCTTCCAAGAATTTTAATGTCGTTACTTGCAATTTAAATAAGGATGTCCAGCACGTAACATTAAAGACCTATTCTCGAAAAAAGGCTTCTCATTCATTGGCTGTTAAGTCCAACGTTAATGCTAATCAATTGGAAGCTGAATGCACTCATCTAATTGTTGCAAATAAGGCTGTGGGATCTGCAAATGTCAGTGCTGGAAATGGGTTGTTTCAGGCCAAGGAATTTAAAGAATCTTCTGTTCGAATTCCAGGGGGAGTAATATTTTCGTCAGAGGTATTGGCAATTCTTATAAACATAGTACTCATTCTCCAGTGGAATCAGACTTTCGTCAGAGGTATTGGCAATTCTTATAAACATAGTACTCATTCTCCAGTGGAATCAGACGATGAGTCTACTGTTAGTGTAAGCAGTGAGGACTCTGATCACTTGTTGGATAAAGAGGAATGTGAGGAGCTCTTTTTAGAAGACCAAATTGGTTTGTCGAAGCTTCTAGTCTCAAGTGCAATGGGATGCATGCGGATGGATATGGTATCATGGGATCAGTTTTTGGAGGAAAATGTTTGGGATTCTTCAGATGCCAGTTATTATCAGAGTCATTCAGCATTTGGATAG ATGGACAAAGATGAAATAGATGGGGAACTCCAAGTAGATGGGTCTATCCCCCACCCACTTATCCTCCCAAAAGTACGTGTCTTTCTCGTCCCCCACCACACAATGAACAAGGCTAGAGAAAGAAGGGAGCTCCATGACAATATCTTTCCAAAGATTTCTGGAAGTGCCCCTAACCTCACCCAACAACCACTCGAAAGGATGAACGTCGTATTTACTCACAATTATCTATACCATAAGGATAAAGACTCATGGGGAAAATACCAAAGCCATTTAGCTAACAGAGTTTTGTCACGGATCCTAAGGGTCCGTTTGTGGTTTGAAAATGTTCTAGTTGAGTTATTGCAGAATCCTGTTTCTTCTTTCTTTCATCAGAAAATTAAGGAAGACTTTGGAGTCATTAGGTTGATTAAGTTCTTTTCGGATAATGAATGGTTTTTTGAATGTGCTGTTTGGCCTTCCACGGGTAGGAGGAGGACTATTCAAGTTCCAACGGGTTTGAATAAGAAAGCTAATGACTCAGAAGGTCAAGTCTTTCCTAACTCCTATGCTGAAGTGGGTAAGCGAGGTGGCTCTATGAAGAATTCATTCTCCCTGGAAGATTCAGGTAGAAATGTTAAGTTTGTTAATGAAGAAGCTTACTGGGTTTGTAAGAATTGGGATGTGCTGAAAATAGATTTGGAAAGTTCACTCGTTGTTTCTAGATTGATGGCCCATTATTCTTGGAAGAATGTTAAGATTGCCCTTGAGGATTTCTTTAAATCTTCAGTCTTTATCGACCCTTTTATGGATGATAAAGCTGTGATTCAGGTGGCAGATGCCAAAATTTATAAAAACTACGGAGGTTGGATTGCAATCAGAAATTTACCTTTGAATTTGTGGCATCGTGATTCCTTTGAAGCTATTGGAAAGAACCTTGGAGGGTTGGTTAGTATTTCATCTAATACGCTTAATTTATTAGATTGTTCTGAAGCCTTCATTGAAGTAGAAAAGAATTTTTGTGGCTTTATCCCTGTTGATATTAATGTTAAGATTGGTAATAAGTTTGAATTCTCTTTAAGATTTGGTGATATTAATGCATTAGAGGACAGTAATTTGAAGTTTGATTCAAGTAGAAAGTTAATAGTCAATGACTTTTCAAATTCCCTGGATGTAATTAGGGTTAAGCAAGTGATATTGGATGAAGAAGTGGACCTTGTAAATGAAGGGGTAAGGTTGAATGAATCGCCATTTATTTCTTGTTATCATGAGGAATTTAATGCGGCAATGGGTTCTCCAAAAGTTGCTTCAATGCATGATGAGCATATTAATTTCACAGGCTGTATTGTATCTCCCTCCAAGATGATTAATGACAGCAATTGCAATGTGAAAGATGATATACAGCAGCTACTGGGATCGTCAAATATCAGTTCTGAAAATGGGTTAATTCAGTCTAAGGATTTTAAGGAATTGTCTGACCAAATTCCAAGGGAGAGAGACCATTTTAATGAGGTATTGGGTTCTCCAAAAGGTGCTTCATTACATGATAAGTGTATTAATATTGCTGGCTGTAAAGATATTAATGTTAGCATTAATGAGACGGTTTCTTTTCTCTCTCCTTCTAAAGATGTTAATGCTATTAACAGTCTCCCCTCCTTCAAAGATGTTGATGCTATTAATGAGGCGTTGGGTCCTCAAGTTCAGCCGCCCCAGATTTATGAAACTCCTTCCAAGAATTTTAATGTCGTTACTTGCAATTTAAATAAGGATGTCCAGCACGTAACATTAAAGACCTATTCTCGAAAAAAGGCTTCTCATTCATTGGCTGTTAAGTCCAACGTTAATGCTAATCAATTGGAAGCTGAATGCACTCATCTAATTGTTGCAAATAAGGCTGTGGGATCTGCAAATGTCAGTGCTGGAAATGGGTTGTTTCAGGCCAAGGAATTTAAAGAATCTTCTGTTCGAATTCCAGGGGGAGTAATATTTTCGTCAGAGGTATTGGCAATTCTTATAAACATAGTACTCATTCTCCAGTGGAATCAGACTTTCGTCAGAGGTATTGGCAATTCTTATAAACATAGTACTCATTCTCCAGTGGAATCAGACGATGAGTCTACTGTTAGTGTAAGCAGTGAGGACTCTGATCACTTGTTGGATAAAGAGGAATGTGAGGAGCTCTTTTTAGAAGACCAAATTGGTTTGTCGAAGCTTCTAGTCTCAAGTGCAATGGGATGCATGCGGATGGATATGGTATCATGGGATCAGTTTTTGGAGGAAAATGTTTGGGATTCTTCAGATGCCAGTTATTATCAGAGTCATTCAGCATTTGGATAG MDKDEIDGELQVDGSIPHPLILPKVRVFLVPHHTMNKARERRELHDNIFPKISGSAPNLTQQPLERMNVVFTHNYLYHKDKDSWGKYQSHLANRVLSRILRVRLWFENVLVELLQNPVSSFFHQKIKEDFGVIRLIKFFSDNEWFFECAVWPSTGRRRTIQVPTGLNKKANDSEGQVFPNSYAEVGKRGGSMKNSFSLEDSGRNVKFVNEEAYWVCKNWDVLKIDLESSLVVSRLMAHYSWKNVKIALEDFFKSSVFIDPFMDDKAVIQVADAKIYKNYGGWIAIRNLPLNLWHRDSFEAIGKNLGGLVSISSNTLNLLDCSEAFIEVEKNFCGFIPVDINVKIGNKFEFSLRFGDINALEDSNLKFDSSRKLIVNDFSNSLDVIRVKQVILDEEVDLVNEGVRLNESPFISCYHEEFNAAMGSPKVASMHDEHINFTGCIVSPSKMINDSNCNVKDDIQQLLGSSNISSENGLIQSKDFKELSDQIPRERDHFNEVLGSPKGASLHDKCINIAGCKDINVSINETVSFLSPSKDVNAINSLPSFKDVDAINEALGPQVQPPQIYETPSKNFNVVTCNLNKDVQHVTLKTYSRKKASHSLAVKSNVNANQLEAECTHLIVANKAVGSANVSAGNGLFQAKEFKESSVRIPGGVIFSSEVLAILINIVLILQWNQTFVRGIGNSYKHSTHSPVESDDESTVSVSSEDSDHLLDKEECEELFLEDQIGLSKLLVSSAMGCMRMDMVSWDQFLEENVWDSSDASYYQSHSAFG Homology
BLAST of Lag0042170 vs. NCBI nr
Match: KAA0063414.1 (uncharacterized protein E6C27_scaffold508G00510 [Cucumis melo var. makuwa] >TYK11672.1 uncharacterized protein E5676_scaffold828G00460 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 119.8 bits (299), Expect = 1.0e-22 Identity = 78/256 (30.47%), Postives = 128/256 (50.00%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0042170 vs. NCBI nr
Match: KAA0062494.1 (uncharacterized protein E6C27_scaffold130G00900 [Cucumis melo var. makuwa] >TYK27390.1 uncharacterized protein E5676_scaffold325G00720 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 104.8 bits (260), Expect = 3.5e-18 Identity = 53/134 (39.55%), Postives = 82/134 (61.19%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0042170 vs. NCBI nr
Match: KAA0051433.1 (hypothetical protein E6C27_scaffold55G001850 [Cucumis melo var. makuwa] >TYK22220.1 hypothetical protein E5676_scaffold333G001030 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 103.6 bits (257), Expect = 7.8e-18 Identity = 50/121 (41.32%), Postives = 75/121 (61.98%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0042170 vs. NCBI nr
Match: XP_038904899.1 (uncharacterized protein LOC120091119 isoform X2 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 100.1 bits (248), Expect = 8.6e-17 Identity = 50/114 (43.86%), Postives = 71/114 (62.28%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0042170 vs. NCBI nr
Match: XP_031738083.1 (uncharacterized protein LOC116402658 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 99.4 bits (246), Expect = 1.5e-16 Identity = 69/232 (29.74%), Postives = 112/232 (48.28%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0042170 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7V878 (DUF4283 domain-containing protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold828G00460 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 119.8 bits (299), Expect = 5.1e-23 Identity = 78/256 (30.47%), Postives = 128/256 (50.00%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0042170 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3DVS9 (Uncharacterized protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold325G00720 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 104.8 bits (260), Expect = 1.7e-18 Identity = 53/134 (39.55%), Postives = 82/134 (61.19%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0042170 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7U6A9 (Uncharacterized protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold333G001030 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 103.6 bits (257), Expect = 3.8e-18 Identity = 50/121 (41.32%), Postives = 75/121 (61.98%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0042170 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7TQZ7 (Copper-transporting ATPase PAA1 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold316G00460 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 93.6 bits (231), Expect = 3.9e-15 Identity = 64/189 (33.86%), Postives = 97/189 (51.32%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0042170 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1D6X4 (uncharacterized protein LOC111018186 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111018186 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 89.0 bits (219), Expect = 9.6e-14 Identity = 44/157 (28.03%), Postives = 78/157 (49.68%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (AG-4) v1
Date Performed: 2022-08-01
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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