Lag0041347 (gene) Sponge gourd (AG‐4) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGGAGCGCCATTTCAATGGAGCTCATCTCTTCACGCTGCTCCGATCAAGCTCAAATCGCCCATTTTCCTACCCTCGCCATCCAATTTCATCTACTATTATTGTAAACGATCTCGTGTCAATGATTCGTCAACTCGTCGTGGCGCTGTTTGTGCTCAGAACTCCAATTTGCCGCGGCCTAAATCCACGTCCACCAACTCCGATGCTCCGAGTTCGAAATTGGTCGTTCTCGGTGATTGCCAAGGGAACGAGGTTGTTCGAGTTTCTTCGACTCCGATTCGACGGCGTAAAAGTGTGATTCTGTCTATAGTGTCTTTGTTTGATAAACGTTCTCTTTGGCGAAGGATCTTTTTTGCCTCCAAGAAAGTTAGGAGTATCATTCTGCTCAATGTCGTCACGATTGTTTACGGTGAGCTTCTGTTTAACCCCCCCCACTCTTCTATTAGGTCAGTTGTTGATGTTGTCGAGCAAATATGTAAGATATATCTATGCTGAAGCGGAATTCGTACACGGCTATTCTTGAATTATTTCATTAAAACGATTCAGCTTTTTTCCTGATTCTCCGGGGAGACGAGACTTTGTACTACTTTTCATACTATTTCTGCTGTTTGCTTTGAATTTACACATAGTAAGAAGAGTCCACTAATTTAAGCTATTCCCGCGGAATGTTATCTCAAAGTTGGGATCCATTTTTCTTTGGCAATCAACTCTCTCATGTATTTGGACTGGAATTTTGTTGTGTGCTTTATTCTTGATAGTTGCAATGCAACCATGATATTCTCCTATCACCTATCATATTAGGTCCATGCTTTGTTGGCCAACATTGTCAACATGGCATCTCTGTAGAGTGTCGTGATGTATACTATTCTTATAAGTTTGTGAAATTCTTGTGAAATATTAATCTCTTAGGTAAATTACTTTGTACTTTCAGTTATCTTAATGAAAGCTGGTTTCTTCTTAAAAGAAAAAGAAGACAATTTTATTCCTACTAATAAAAATGTTTGCTACAAAAGTCTTGAAGTTTCCTTCTTTTTCTATGATAAGAAATTCCTTCAGTTCTTCAACTAAAATACCATTCCATATTTTCAAATCTTGGCTGCTGTAGCTAGCAGTATTCCAGTTGTGAAAGAGGTTGAAGAATTAGTGGATCCAGCAACCTTCAATGCCGTGCGATTTGCCATGACTGCTATTCCATTTGTTCCACTTGTATTGTATGAATGGGATGATGTTGAGACCCGTAATGCTGGAATAGAGTTGGGTTTCTGGGTTAGTCTAGGGTACCTGATGCAGGCATTTGGACTTCTTACATCTGATGCTGGGCGTGCATCCTTCATATCAATGCTCACGGTGAGATTCTGAATTATATGTAAGGTATACATGGTGTAGTAAATTTTCTTGACATAATATTCTGTATTAAGGTACTTGTGTATCAATAATCAGGTACTTGTAGTTCCTTTTCTTGATGGACTTTTAGGGGCTGTAGTTCCTGCTCGTACCTGGTTTGGAGCTCTCATGTCTGTCATTGGAGTTGCAATGCTGGAATCCAGTGGATCCCCTCCATGTGTATGTTTAGTCTCAAAATTATTTGATTACCAAGTAATGAAACTTGTAATAATTGGTAGAATCTAATCAGACATTTTTAACAATTTCTGAATGCTCTAAAATTGAGATTTTGATATATGGTATAGATAGCCATTCAACTAATTCGTATGATCTAATTCAGGTGGGAGATCTTTTGAACTTCTTGAGTGCAATATTTTTTGGTGTGCATATGCTTCGAACAGAGCATATTTCAAGACGTACAGACAAGGATAAATTCTTACCACTCCTTGCTTATGAGGTTAATATTTTCTCATATATAGTAGATACTGGGGGGCAGAAATGTTAGTTTTGGTGCACAGTTTGAATGATTTTAATTACTTCTTCAGGTTTGCGTTGTTTCTATTCTATCGATGGTATGGTATTTTATTTGGAGATGGATTGATGGAACTGAAACAATTAGCGAGTCATGGAATTGGAAAACATATTTAGATTGGGTGTTCATGTTTCCTTGGGTACCTGCTTTGTACACAGGCTTATTGTCCACTGGTTTTTGCCTGTGGCTAGAGGTATGCCTTCTCATTTTGTCTCTCTATATAACATTTTTATTAGAGTTTTGCTTTTCGTTTGAGTTGCTATTCAATTTTACTGATCCTCTGTCTTGAGCGTTTTTGCTTTTCTTGTTGTATTCCTTTTGTAACTTAATTGAAATTTACTGTGCTGCAATTTGTAATGCTTATATAGAAAAATAGAATGAGAAAAGCTATTATCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAAAAGAAAAAAGAAAAAAAGAAAAATAGAATGAGAGAAGCTAATTGTATTTAAGCATACATTTTTCTGTGAACTTCTTGCTCATGGCTGCACATATTTATGAATAAAGTTTGATGTGAAAAACCCTAGAGAATTATTATTAGCAATCCTTTGGGTATATGAGAACCCCTAATTCATAAACTCTAAAACCCCCAAATCAATTTGGTTTCATTCAATCCTAAATGTTGGATTAGAAACAGATTGCCTTAAGATCAAATGTTTGAGATAAAGAACAAGTTCCCTAACTCAAGAGTCAAACACTCCACAAACAGGATGAAAAGTCCTACTTGAAAGTTCTTTGGCATGCAACTCAAGACCATAATTGCCATGTATGAAGAAGCTCTTAGTTATCTTGAAAGAAAATCTCTAGGCTACTAAATTTTATTAATCATCAAATTGTCAATAAAACATCCTAATGACACGACTATACATAGCTTCCCAACTGTATGTATATATCCCTTACAATGTAGGATTAGAGTTTCCTAATTCAAATACCTAATGATTGGCCCACATGGGCCAACAAAGTCTAAAGTAAACTAAATAACACTGAGGTCCACAAAGGCCCAAAGTTTATAAAATAAAGTACAATCCCTATTTGACGATCATAGTTAAAAGACATTAATGCCCCTACCAAATACATCAAACTAGGGGTAAAATAGTAAATTGGAATGGTCGTGATAATTGTGTATCCTGATAGACCTCCTATCAAATATGTGTATAGCAGAAGACGTAAGAAAAGTAAGGGTGGGGACCAGTAGTATTCTGTTAAGTAGTTGGAGTCTGTTATGGGTAGTTTTAGATACCTATATAGTTAGGAGTCTGTAGATGGAGAAGATACCTTTTGGCTAGTCAGTTGTAGTGGGTCAAGGTGGAGAGATTAGGAAGCTCTCGAACTCTTTCCAGGGTTGTAATCGATACTTGTTCATAAATAATATCGAGATTCTATCATTTTGGTATCAAAGCAAATTTTTTTTCCTTTCCTGATTTCCAATGGCGACTTGTATGGAATCATGAATGGAAGCTCTTGAGACAAATTTGGCTTTACAGATGAAGGATATAACTGCGATACAAAGTTCCATGGGGAATTTTACGGAAATGGCTTTACAAATGAAGGAAGGTTTTTTGGCGATGATGACTTAGATCGAAAGTTTGAAGTCCGAGAAAGGTGTTTCTAAGAAAAAGCAGGCGAAGAAATTTGACGAAGCAGCAAGTGCGGTGGTTCCAGTTGAGGTTGCGACCGTCGATCCGCAGGCTCAATTAACCAAAGCATTGGCTCCTGTGTTTGATCTTCGACTACGGAAACTCGAGATTCCAGTGTTTTCTGGAGCGAATCCGTATGAATGGCTTCACCAGGTGGAAAGGTATTTTGTGGTTAATCGGCTGACCGATTCTGAGAAAGTTGAATCGGCGGTACTCTGTTTGGATGGTGTAGCTTTGAAGTGGCATTATTATGAAAAGCGTCGACGTCCAATCGACTGTTGGGAAGAGTTTTGTCGGTTGCTTCTTAAACGTTTCTTGCCGACAAAGGAAGGTAGCCTTCACGAAAGGTTCTTTGCCCTTAAACAAGAGTCTACTGTTGCTGAGTATCGGGAGAAGTTCGAAGACTATGTTGCACCTTTGGATAACTTGGACAATGCTACTCTTGAAGGCAAGTTCGTAGATGGGTTGAAAGAAGATATCAAGATCAAGCTAAGAGTGGCTAGACCTATTGGGCTTGATATGACTATGGAGACGACCCAAAAATTAGAGGATGAGCTTCTTCATTTTGAGGAAAAATATTTTGGGGCTCCCTTCAATCCTAAATCTTCGGCCTAAGCAAGTACAACTGTGCAGTCTAAGTCCGCTACTTACGGGGCAGGGTCTATAGCCCAAACAATTTCTGTTAACCCGAGCAAATTAGGCTTCATTTTTCGAAAGGAGTTTGCTATGAAACATTCTGAAGTTCATTTAAGAGATTGACAGACTCAGAACTTCAAATCAAAAGAGAAAAGGTGCTCTGCTTTCATTGTGAAGAGAAATTTTTTCATGGTCACCGGTGTAAGAAGAAGGAGCTTCAAGTAATGGTGGTTCAAGATGAAGAAACAGTCTTTGATGAGCAAGTAGAAGATGTTGCCATGCAGTCTGCAGAGTTGGCTGATGACAACATTCTGCCTACAGATGATCAAGAGAAGGTTGAGGAAGTTGCTTTGCATTCTATGACCAGTGTGGGCTCACCGAAGACTATTAAACTAAAGGGGTTGATCGATGCTACGGAGGTGATCGTCCTTGTTGACAGTGGTGCAATCCATAATTTCATTGCCTTAAAGTTGGTACAAGATTTAAAGTTGCTGATGAGTGATACAGATGGGTATGAAATTTATTTTGGGTACTGGTTTGTTGGTTAGAGGTGCCCAAATTTGTAAAGATGTTGTGCTTTCTTTGGGTTCGGTGACCATTGTTTAGGATTTTCTGCCCATTGCTTTGGGTACAGCGGACGTGATTTTGGGTGTAAAATGGCTTGAAACTTTGGGAGACGTTACATCCAATCATCAGATCTTACTATTGAGCTTTACGTTGGATGGTTCTAAGGTTGTCCTTCACGGGGATCCATTGTTAGTACGATCTCAGGTCACGTTGAAGTCTTT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Match: XP_023551258.1 (uncharacterized protein LOC111809127 isoform X1 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 809.3 bits (2089), Expect = 2.0e-230 Identity = 409/459 (89.11%), Postives = 429/459 (93.46%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0041347 vs. NCBI nr
Match: XP_022987075.1 (uncharacterized protein LOC111484651 isoform X1 [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 806.2 bits (2081), Expect = 1.7e-229 Identity = 407/459 (88.67%), Postives = 428/459 (93.25%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0041347 vs. NCBI nr
Match: KAG6600804.1 (hypothetical protein SDJN03_06037, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 800.4 bits (2066), Expect = 9.4e-228 Identity = 404/459 (88.02%), Postives = 424/459 (92.37%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0041347 vs. NCBI nr
Match: XP_038877380.1 (uncharacterized protein LOC120069670 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 798.1 bits (2060), Expect = 4.7e-227 Identity = 403/461 (87.42%), Postives = 422/461 (91.54%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0041347 vs. NCBI nr
Match: XP_022150064.1 (uncharacterized protein LOC111018331 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 785.0 bits (2026), Expect = 4.1e-223 Identity = 397/459 (86.49%), Postives = 422/459 (91.94%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0041347 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O29470 (Uncharacterized transporter AF_0788 OS=Archaeoglobus fulgidus (strain ATCC 49558 / VC-16 / DSM 4304 / JCM 9628 / NBRC 100126) OX=224325 GN=AF_0788 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 67.4 bits (163), Expect = 5.7e-10 Identity = 74/293 (25.26%), Postives = 130/293 (44.37%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0041347 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1JFT3 (uncharacterized protein LOC111484651 isoform X1 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111484651 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 806.2 bits (2081), Expect = 8.3e-230 Identity = 407/459 (88.67%), Postives = 428/459 (93.25%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0041347 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1D8X4 (uncharacterized protein LOC111018331 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111018331 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 785.0 bits (2026), Expect = 2.0e-223 Identity = 397/459 (86.49%), Postives = 422/459 (91.94%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0041347 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BNU1 (uncharacterized protein LOC103491903 isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103491903 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 769.6 bits (1986), Expect = 8.6e-219 Identity = 398/462 (86.15%), Postives = 417/462 (90.26%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0041347 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1JIE8 (uncharacterized protein LOC111484651 isoform X2 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111484651 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 726.9 bits (1875), Expect = 6.4e-206 Identity = 366/404 (90.59%), Postives = 381/404 (94.31%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0041347 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BNS3 (uncharacterized protein LOC103491903 isoform X2 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103491903 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 696.4 bits (1796), Expect = 9.2e-197 Identity = 356/406 (87.68%), Postives = 371/406 (91.38%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (AG-4) v1
Date Performed: 2022-08-01 Position : 0 Zoom : x 1
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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