Lag0038487 (gene) Sponge gourd (AG‐4) v1

Overview


Name	Lag0038487
Type	gene
Organism	Luffa acutangula (Sponge gourd (AG‐4) v1)
Description	Extensin
Location	chr2: 18532256 .. 18532894 (+)
RNA-Seq Expression	Lag0038487
Synteny	Lag0038487

Sequences

The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide

Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.

ATGGGAGAATCTAGGTCTTCAATGGCTTATCTAGTAGCGGCAGTTTTGGTGGCAACTTTGAGTTTAACTTCAGTGGTCGCTACTGATTATGCCTACTCTCCCCCGCCACCTCCCTACTATACTTATAAATCTCCTCCTCCTCCTGTCTATCATTCTCCACCACCACCAAAGGTGAAGTATGAATACAAATCACCGCCACCTCCAGTTTACCATTCTCCACCTCCTCCAGTTTATCATTCTCCCCCACCACCAGTCTATCATTCTCCACCGCCTCCGGTCTACCATTCTCCTCCACCACCGGTCTACCATTCTCCACCGCCTCCAGTTTACCACTCTCCTCCACCACCTGTTTACCATTCTCCACCTCCTCCAGTGTACCACTCTCCTCCACCACCGGTCTACCATTCTCCACCGCCTCCAGTTTACCACTCTCCTCCACCACCTGTTTACCATTCTCCACCTCCTCCAGTTTACCACTCTCCACCACCACCAAAGAAGCTTGAGTATAAATCACCTCCACCTCCAGTTTATTACTCCCCACCACCACCAAAGTACGAATACAAATCACCACCACCTCCAGTTTACTATTCTCCTCCCCCACCCGTTTACAAGTCTCCACCACCTCCCCACCACTATTAG

mRNA sequence

ATGGGAGAATCTAGGTCTTCAATGGCTTATCTAGTAGCGGCAGTTTTGGTGGCAACTTTGAGTTTAACTTCAGTGGTCGCTACTGATTATGCCTACTCTCCCCCGCCACCTCCCTACTATACTTATAAATCTCCTCCTCCTCCTGTCTATCATTCTCCACCACCACCAAAGGTGAAGTATGAATACAAATCACCGCCACCTCCAGTTTACCATTCTCCACCTCCTCCAGTTTATCATTCTCCCCCACCACCAGTCTATCATTCTCCACCGCCTCCGGTCTACCATTCTCCTCCACCACCGGTCTACCATTCTCCACCGCCTCCAGTTTACCACTCTCCTCCACCACCTGTTTACCATTCTCCACCTCCTCCAGTGTACCACTCTCCTCCACCACCGGTCTACCATTCTCCACCGCCTCCAGTTTACCACTCTCCTCCACCACCTGTTTACCATTCTCCACCTCCTCCAGTTTACCACTCTCCACCACCACCAAAGAAGCTTGAGTATAAATCACCTCCACCTCCAGTTTATTACTCCCCACCACCACCAAAGTACGAATACAAATCACCACCACCTCCAGTTTACTATTCTCCTCCCCCACCCGTTTACAAGTCTCCACCACCTCCCCACCACTATTAG

Coding sequence (CDS)

ATGGGAGAATCTAGGTCTTCAATGGCTTATCTAGTAGCGGCAGTTTTGGTGGCAACTTTGAGTTTAACTTCAGTGGTCGCTACTGATTATGCCTACTCTCCCCCGCCACCTCCCTACTATACTTATAAATCTCCTCCTCCTCCTGTCTATCATTCTCCACCACCACCAAAGGTGAAGTATGAATACAAATCACCGCCACCTCCAGTTTACCATTCTCCACCTCCTCCAGTTTATCATTCTCCCCCACCACCAGTCTATCATTCTCCACCGCCTCCGGTCTACCATTCTCCTCCACCACCGGTCTACCATTCTCCACCGCCTCCAGTTTACCACTCTCCTCCACCACCTGTTTACCATTCTCCACCTCCTCCAGTGTACCACTCTCCTCCACCACCGGTCTACCATTCTCCACCGCCTCCAGTTTACCACTCTCCTCCACCACCTGTTTACCATTCTCCACCTCCTCCAGTTTACCACTCTCCACCACCACCAAAGAAGCTTGAGTATAAATCACCTCCACCTCCAGTTTATTACTCCCCACCACCACCAAAGTACGAATACAAATCACCACCACCTCCAGTTTACTATTCTCCTCCCCCACCCGTTTACAAGTCTCCACCACCTCCCCACCACTATTAG

Protein sequence

MGESRSSMAYLVAAVLVATLSLTSVVATDYAYSPPPPPYYTYKSPPPPVYHSPPPPKVKYEYKSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPKKLEYKSPPPPVYYSPPPPKYEYKSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPHHY

Homology

[Close]

BLAST of Lag0038487 vs. NCBI nr
Match: XP_022976067.1 (extensin-3-like [Cucurbita maxima])

HSP 1 Score: 296.6 bits (758), Expect = 1.7e-76
Identity = 185/229 (80.79%), Postives = 193/229 (84.28%), Query Frame = 0


Query: 1   MGESRSSMAYLVAAVLVATLSLTSVVATDYAYSPPPPPYYTYKSPPPPVYHSPPPPKVKY 60
           MGES+ SMAYLVA VLVA LS TSV+A DY+YS PPPPYY YKSPPPPVYHSPPPPKVKY
Sbjct: 1   MGESKCSMAYLVATVLVALLSFTSVIAIDYSYSSPPPPYYVYKSPPPPVYHSPPPPKVKY 60

Query: 61  EYKSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYH-----------------SPPPPVYH 120
           EYKSPPPPVY+SPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYH                 SPPPPVY+
Sbjct: 61  EYKSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSSPPPVYYSPPPKKEYKSPPPPVYY 120

Query: 121 SPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPP 180
           SPPPPVY SPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPP+Y SPPP VYHSPPPPVYHSPPP
Sbjct: 121 SPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPIYKSPPPLVYHSPPPPVYHSPPP 180

Query: 181 PKKLEYKSPPPPVYYSPPPPKYEYKSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPHHY 213
           P    YKSPPPPVY+SPPP    YKSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPP +Y
Sbjct: 181 P---IYKSPPPPVYHSPPP--QVYKSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPVYY 224

[Close]

BLAST of Lag0038487 vs. NCBI nr
Match: XP_038899768.1 (extensin-3-like [Benincasa hispida])

HSP 1 Score: 291.6 bits (745), Expect = 5.5e-75
Identity = 182/229 (79.48%), Postives = 191/229 (83.41%), Query Frame = 0


Query: 1   MGESRSSMAYLVAAVLVATLSLTSVVATDYAYSPPPPPYYTYKSPPPPVYHSPPPPKVKY 60
           MG+SRSSM YLV A+LVATLS TSV+  DY YS PPPPYY YKS   PVY SPPPPKVKY
Sbjct: 1   MGKSRSSMTYLVVAILVATLSSTSVITADYVYSSPPPPYYVYKS---PVYQSPPPPKVKY 60

Query: 61  EYKSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYH- 120
           EYKSPPP VY++PPPPVYHSP PPVYHSPPPPVYHSP PPVYHSPPPPVYHSPPPPVY+ 
Sbjct: 61  EYKSPPPSVYYAPPPPVYHSPSPPVYHSPPPPVYHSPSPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYYS 120

Query: 121 ----------SPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPKKLEY 180
                     SPPPPVY+SPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVY+SPPPPKK EY
Sbjct: 121 PPPPKKQEYKSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPKKQEY 180

Query: 181 KSPPPPVYYSPPPPKYE------YKSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPHHY 213
           KSPPPPVYYSPPPP Y       YKSPPPPVY SPPPPVY SPPPP +Y
Sbjct: 181 KSPPPPVYYSPPPPIYHSPPPPVYKSPPPPVYPSPPPPVYHSPPPPVYY 226

[Close]

BLAST of Lag0038487 vs. NCBI nr
Match: XP_023536462.1 (extensin-1-like [Cucurbita pepo subsp. pepo])

HSP 1 Score: 287.0 bits (733), Expect = 1.4e-73
Identity = 181/220 (82.27%), Postives = 188/220 (85.45%), Query Frame = 0


Query: 8   MAYLVAAVLVATLSLTSVVATDYAYSPPPPPYYTYKS-PPPPVYHSPPPPKVKYEYKSPP 67
           MAYLVA VLVA LS TSV+ATDY+YS PPPPYY YKS PPPPVYHSPPPPKVKYEYKSPP
Sbjct: 1   MAYLVATVLVAILSFTSVIATDYSYSSPPPPYYVYKSPPPPPVYHSPPPPKVKYEYKSPP 60

Query: 68  PPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVY 127
           PPVY+SPPPPVY SPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVY SPPPPVYHSPPPPVY SPPPPVY
Sbjct: 61  PPVYYSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVY 120

Query: 128 HSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPKKLEYKSPPPPVYYSPPPPKYE 187
           HSPPPPVY SPPPPVY+SPPPPVY SPPPPVY+SPPPP    YKSPPPPVYYSPPPP Y+
Sbjct: 121 HSPPPPVYKSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPVYYSPPPP---VYKSPPPPVYYSPPPPVYK 180

Query: 188 --------------YKSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPHHY 213
                         Y SPPPPVYYSPPPPVYKSPPPP +Y
Sbjct: 181 SPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPVYY 217

[Close]

BLAST of Lag0038487 vs. NCBI nr
Match: KAG6592187.1 (Extensin-3, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia])

HSP 1 Score: 286.2 bits (731), Expect = 2.3e-73
Identity = 179/218 (82.11%), Postives = 190/218 (87.16%), Query Frame = 0


Query: 1   MGESRSSMAYLVAAVLVATLSLTSVVATDYAYSPPPPPYYTYKSPPPPVYHSPPPPKVKY 60
           MGES+ SMAYLVA VLVA LS TSV+ATDY+YS PPPPYY YKSPPPPVY+SPPPPK +Y
Sbjct: 1   MGESKPSMAYLVATVLVAILSFTSVIATDYSYSSPPPPYYVYKSPPPPVYYSPPPPKKEY 60

Query: 61  E------YKSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPP 120
           +      Y SPPPPVY SPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVY SPPPPVYHSPP
Sbjct: 61  KSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVYHSPP 120

Query: 121 PPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPKKLEYKSPPP 180
           PPVY SPPPPVY+SPPPPVY SPPPPVY+SPPPPVY SPPPPVYHSPPPP    YKSPPP
Sbjct: 121 PPVYKSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPP---VYKSPPP 180

Query: 181 PVYYSPPPPKYEYKSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPHHY 213
           PVYYSPPPP   YKSPPPP+Y+SPPPPVY SPPPP +Y
Sbjct: 181 PVYYSPPPP--VYKSPPPPIYHSPPPPVYHSPPPPVYY 213

[Close]

BLAST of Lag0038487 vs. NCBI nr
Match: XP_004139745.3 (extensin-3 [Cucumis sativus] >KAE8646192.1 hypothetical protein Csa_016078 [Cucumis sativus])

HSP 1 Score: 283.5 bits (724), Expect = 1.5e-72
Identity = 181/231 (78.35%), Postives = 190/231 (82.25%), Query Frame = 0


Query: 1   MGESRSS-MAYLVAAVLVATLSLTSVVATDYAYSPPPPPYYTYKSPPPPVYHSPPPPKVK 60
           M +SR S MAYL+A +LVATLSL SV+A +Y YS PPPPYY YKSPPPPVY SPPPPKVK
Sbjct: 1   MRKSRPSLMAYLLATILVATLSLPSVLAAEYVYSSPPPPYYVYKSPPPPVYSSPPPPKVK 60

Query: 61  YEYKSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYH---------------SPPPPVYHSPPPPVYHS 120
           YEYKSPPPPVYHSPPPP+YHSPPPPVYH               SPPPPVYHSPPPPVY S
Sbjct: 61  YEYKSPPPPVYHSPPPPIYHSPPPPVYHSPPPPVYSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPVYKS 120

Query: 121 PPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPP 180
           PPPPVY+SPPPPVYHSPPPPVY SPPPPVYHSPPPPVY SPPPPVYHSPPPPVYHSPPPP
Sbjct: 121 PPPPVYYSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPP 180

Query: 181 KKLEYKSPPPPVYYSPPPPKYE------YKSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPP 210
               YKSPPPPVY+SPPPP Y       YKSPPPPVY+SPPPPVY SPPPP
Sbjct: 181 ---VYKSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPP 228

[Close]

BLAST of Lag0038487 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9FS16 (Extensin-3 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=EXT3 PE=1 SV=3)

HSP 1 Score: 189.5 bits (480), Expect = 3.9e-47
Identity = 162/258 (62.79%), Postives = 167/258 (64.73%), Query Frame = 0


Query: 6   SSMAYLVAAVLVATLSLT--SVVATDYAYSPPPPPYYTYKSP-----PPPVYHSPPPPKV 65
           S MA LVA +LV T+SLT  S    +Y YS PPPP   Y  P     PPPVYHSPPPPK 
Sbjct: 3   SPMASLVATLLVLTISLTFVSQSTANYFYSSPPPPVKHYTPPVKHYSPPPVYHSPPPPKK 62

Query: 66  KYEYKSPPPPVYHSPPPPVYHSP--------------------PPPVYHSPPPP----VY 125
            YEYKSPPPPV H  PPPVYHSP                    PPPVYHSPPPP    VY
Sbjct: 63  HYEYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYVY 122

Query: 126 HSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPP----VYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPP----VYHSPP 185
            SPPPPV H  PPPVYHSPPPP    VY SPPPPV H  PPPVYHSPPPP    VY SPP
Sbjct: 123 KSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYVYKSPP 182

Query: 186 PPVYHSPPPPVYHSPPPPKK-LEYKSP--------PPPVYYSPPPPK--YEYKSPPPPVY 213
           PPV H  PPPVYHSPPPPKK   YKSP        PPPVY+SPPPPK  Y YKSPPPPV 
Sbjct: 183 PPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVK 242

[Close]

BLAST of Lag0038487 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q38913 (Extensin-1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=EXT1 PE=2 SV=2)

HSP 1 Score: 181.8 bits (460), Expect = 8.1e-45
Identity = 136/190 (71.58%), Postives = 152/190 (80.00%), Query Frame = 0


Query: 30  YAYSPPPPPYYT----YKSPPPPVYHSPPPPKVKYEYKSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPV 89
           Y   PPP  YY+    YKSPPPPV H  PPP     YKSPPPPV +  PPPVY SPPPPV
Sbjct: 191 YKSPPPPVKYYSPPPVYKSPPPPVKHYSPPP----VYKSPPPPVKYYSPPPVYKSPPPPV 250

Query: 90  YHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSP 149
           ++SPPP VYHSPPPPV++SPPP VYHSPPPPV++SPPP VYHSPPPPV++SPPP VYHSP
Sbjct: 251 HYSPPPVVYHSPPPPVHYSPPPVVYHSPPPPVHYSPPPVVYHSPPPPVHYSPPPVVYHSP 310

Query: 150 PPPVYHSPPPPVYHSPPPPKK-LEYKSPPPPVYYSPPPPKYEYKSPPPPV-YYSPP--PP 209
           PPPV++SPPP VYHSPPPPKK  EYKSPPPPV+YSPP     Y SPPPPV +YSPP  P 
Sbjct: 311 PPPVHYSPPPVVYHSPPPPKKHYEYKSPPPPVHYSPPT---VYHSPPPPVHHYSPPHQPY 370

Query: 210 VYKSPPPPHH 212
           +YKSPPPPH+
Sbjct: 371 LYKSPPPPHY 373

[Close]

BLAST of Lag0038487 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9XIL9 (Pollen-specific leucine-rich repeat extensin-like protein 3 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=PEX3 PE=2 SV=1)

HSP 1 Score: 142.5 bits (358), Expect = 5.4e-33
Identity = 134/181 (74.03%), Postives = 137/181 (75.69%), Query Frame = 0


Query: 32  YSPPPPPYYTYKSPPPPVYHSPPPPKVKYEYKSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPP 91
           +SPPPPP Y+   PPPPVY  PPPP V   Y  PPPP  HSPPPPV HSPPPPV HSPPP
Sbjct: 508 HSPPPPPVYS-PPPPPPVYSPPPPPPV---YSPPPPPPVHSPPPPV-HSPPPPV-HSPPP 567

Query: 92  PVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYH 151
           PV HSPPPPV HSPPPPV HSPPPPVY  PPPPV HSPPPPV HSPPPPV HSPPPPVY 
Sbjct: 568 PV-HSPPPPV-HSPPPPV-HSPPPPVYSPPPPPV-HSPPPPV-HSPPPPV-HSPPPPVYS 627

Query: 152 SPPPPVYHSPPPPKKLEYKSPPPPVYYSPPPPKYEYKSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPHH 211
            PPPP  HSPPPP      SPPPPV +SPPPP Y   SPPPPV YSPPPP  KSPPPP  
Sbjct: 628 PPPPPPVHSPPPP----VFSPPPPV-HSPPPPVY---SPPPPV-YSPPPPPVKSPPPPPV 667

Query: 212 Y 213
           Y
Sbjct: 688 Y 667

[Close]

BLAST of Lag0038487 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9M1G9 (Extensin-2 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=EXT2 PE=2 SV=1)

HSP 1 Score: 126.3 bits (316), Expect = 4.0e-28
Identity = 130/219 (59.36%), Postives = 141/219 (64.38%), Query Frame = 0


Query: 30  YAYSPPPPPYYT------YKSPPPP-VYHSPPP----PKVKYEYKSPPPPVYHSPPPPVY 89
           Y YS PPPPYY+      YKSPPPP VY SPPP    P  K +YKSPPPP  +S PPP Y
Sbjct: 325 YVYSSPPPPYYSPSPKVDYKSPPPPYVYSSPPPPTYSPSPKVDYKSPPPPYVYSSPPPPY 384

Query: 90  HSPPPPV-YHSPPPP-VYHSPPPPV--------YHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYH- 149
           +SP P V Y SPPPP VY SPPPP         Y SPPPP  +S PPP Y+SP P VY+ 
Sbjct: 385 YSPSPKVEYKSPPPPYVYSSPPPPTYSPSPKVYYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVYYK 444

Query: 150 SPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYH-SPPPP-VYHSPPPP-----KKLEYKSPPPP-VYYS 209
           SPPPP  +S PPP Y+SP P VY+ SPPPP VY SPPPP      K+ YKSPPPP VY S
Sbjct: 445 SPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVYYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVYYKSPPPPYVYSS 504

Query: 210 PPPPKYE------YKSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPHHY 213
           PPPP Y       YKSPPPP  YS PPP Y SP P  HY
Sbjct: 505 PPPPYYSPSPKVYYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVHY 543

[Close]

BLAST of Lag0038487 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9LJ64 (Pollen-specific leucine-rich repeat extensin-like protein 1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=PEX1 PE=1 SV=1)

HSP 1 Score: 122.1 bits (305), Expect = 7.6e-27
Identity = 123/178 (69.10%), Postives = 129/178 (72.47%), Query Frame = 0


Query: 32  YSPPPPPYYTYKSPPPPVYHSPPPPKVKYEYKSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPP 91
           +SPPPP Y    SPPPPV HSPPPP V     SPPPPV HSPPPPV HSPPPPV HSPPP
Sbjct: 668 HSPPPPVY----SPPPPV-HSPPPPPV----HSPPPPV-HSPPPPV-HSPPPPV-HSPPP 727

Query: 92  PVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYH 151
           PV HSPPPPV HSPPPPV   PPPPV+  PPP   +SPPPP  HSPPPPV HSPPPP  H
Sbjct: 728 PV-HSPPPPV-HSPPPPVQSPPPPPVFSPPPPAPIYSPPPPPVHSPPPPV-HSPPPPPVH 787

Query: 152 SPPPPVYHSPPPPKKLEYKSPPPPVYYSPPPPKYEYKSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPP 210
           SPPPPV HSPPPP      SPPPPV +SPPPP   +  PPP   YSPPPPV+  PP P
Sbjct: 788 SPPPPV-HSPPPP----VHSPPPPV-HSPPPP--VHSPPPPSPIYSPPPPVFSPPPKP 822

[Close]

BLAST of Lag0038487 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1IER1 (extensin-3-like OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111476580 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 296.6 bits (758), Expect = 8.3e-77
Identity = 185/229 (80.79%), Postives = 193/229 (84.28%), Query Frame = 0


Query: 1   MGESRSSMAYLVAAVLVATLSLTSVVATDYAYSPPPPPYYTYKSPPPPVYHSPPPPKVKY 60
           MGES+ SMAYLVA VLVA LS TSV+A DY+YS PPPPYY YKSPPPPVYHSPPPPKVKY
Sbjct: 1   MGESKCSMAYLVATVLVALLSFTSVIAIDYSYSSPPPPYYVYKSPPPPVYHSPPPPKVKY 60

Query: 61  EYKSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYH-----------------SPPPPVYH 120
           EYKSPPPPVY+SPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYH                 SPPPPVY+
Sbjct: 61  EYKSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSSPPPVYYSPPPKKEYKSPPPPVYY 120

Query: 121 SPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPP 180
           SPPPPVY SPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPP+Y SPPP VYHSPPPPVYHSPPP
Sbjct: 121 SPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPIYKSPPPLVYHSPPPPVYHSPPP 180

Query: 181 PKKLEYKSPPPPVYYSPPPPKYEYKSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPHHY 213
           P    YKSPPPPVY+SPPP    YKSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPP +Y
Sbjct: 181 P---IYKSPPPPVYHSPPP--QVYKSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPVYY 224

[Close]

BLAST of Lag0038487 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1F6U4 (extensin-1-like OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111442872 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 270.4 bits (690), Expect = 6.4e-69
Identity = 173/216 (80.09%), Postives = 182/216 (84.26%), Query Frame = 0


Query: 8   MAYLVAAVLVATLSLTSVVATDYAYSPPPPPYYTYKSPPPPVYHSPP------PPKVKYE 67
           MAYLVA VLVA LS TSV+ATDY+YS PPPPYY YKSPPPPVYHSPP      PP  K  
Sbjct: 1   MAYLVATVLVAILSFTSVIATDYSYSSPPPPYYVYKSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPKKG 60

Query: 68  YKSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSP 127
           YKSPPPPVY+SPPPPVY SPPPPVY+SPPPPVY SPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSP
Sbjct: 61  YKSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSP 120

Query: 128 PPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPKKLE-----YKSPPPPV 187
           PPP+Y SPPPPVYHSPPPPVY SPPPPVY+SPPPPVY SPPPP         YKSPPPPV
Sbjct: 121 PPPIYKSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPV 180

Query: 188 YYSPPPPKYEYKSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPHHY 213
           Y+SPPPP   Y SPPPPVYYSPPPPVYKSPPPP ++
Sbjct: 181 YHSPPPP--VYMSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPIYH 214

[Close]

BLAST of Lag0038487 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3E640 (Extensin-3-like OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold172G00260 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 258.5 bits (659), Expect = 2.5e-65
Identity = 175/232 (75.43%), Postives = 189/232 (81.47%), Query Frame = 0


Query: 1   MGESRSSMAYLVAAVLVATLSLTSVVATDYAYSPPPPPYYTYKSPPPPVYHSPPPPKVKY 60
           M +SRS MAYLVA +LVATLSL SV A +Y YS PPPPYY YKSPPPPVY+SPPPPKVKY
Sbjct: 1   MRKSRSFMAYLVATILVATLSLPSVFAAEYVYSSPPPPYYVYKSPPPPVYYSPPPPKVKY 60

Query: 61  EYKSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHS 120
           EYKSPPPP+YHSPPPPVYHSPPPP+Y+SPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHS
Sbjct: 61  EYKSPPPPIYHSPPPPVYHSPPPPIYYSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHS 120

Query: 121 PPPPVYHSPPPPVYHSPPPP---VYHSPPPPVYHSPPPPVYH-----SPPPPKK-LEYKS 180
           PPPPVY SPPPP+Y+SPPPP    Y SPPPP+Y+S PPP+YH     SPPPPKK  EYKS
Sbjct: 121 PPPPVYQSPPPPIYYSPPPPKKYEYKSPPPPIYYS-PPPIYHSPPPQSPPPPKKDYEYKS 180

Query: 181 PPPP----VYYSPPPPK--YEYKSPPPP----VYYSPPPP----VYKSPPPP 210
           PPPP     Y SPPPPK  YE+KSPPPP     Y SP PP     +KSPPPP
Sbjct: 181 PPPPKKDYEYKSPPPPKKEYEHKSPPPPKKDYEYKSPSPPKKDYEHKSPPPP 231

[Close]

BLAST of Lag0038487 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7U062 (Extensin-3-like OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold43G001090 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 258.1 bits (658), Expect = 3.3e-65
Identity = 176/234 (75.21%), Postives = 187/234 (79.91%), Query Frame = 0


Query: 1   MGESRSSMAYLVAAVLVATLSLTSVVATDYAYSPPPPPYYTYKSPPPPVYHSPPPPKVKY 60
           M +SRS MAYLVA +LVATLSL SV A +Y YS PPPPYY YKSPPPPVY+SPPPPKVKY
Sbjct: 1   MRKSRSFMAYLVATILVATLSLPSVFAAEYVYSSPPPPYYVYKSPPPPVYYSPPPPKVKY 60

Query: 61  EYKSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHS 120
           EYKSPPPP+YHSPPPPVYHSPPPP+Y+SPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHS
Sbjct: 61  EYKSPPPPIYHSPPPPVYHSPPPPIYYSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHS 120

Query: 121 PPPPVYHSPPPPVYHSPPPP---VYHSP-------PPPVYHSPPPPVYHSPPPPKK-LEY 180
           PPPPVY SPPPP+Y+SPPPP    Y SP       PPP+YHSPPP VY SPPPPKK  E 
Sbjct: 121 PPPPVYQSPPPPIYYSPPPPKKYEYKSPPPPIYYSPPPIYHSPPPQVYKSPPPPKKDYED 180

Query: 181 KSPPPP----VYYSPPPPK--YEYKSPPPP----VYYSPPPP----VYKSPPPP 210
           KSPPPP     Y SPPPPK  YEYKSPPPP     + SPPPP     YKSP PP
Sbjct: 181 KSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKEYEHKSPPPPKKDYEYKSPSPP 234

[Close]

BLAST of Lag0038487 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1CRA7 (extensin-1 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111013522 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 247.7 bits (631), Expect = 4.4e-62
Identity = 180/251 (71.71%), Postives = 189/251 (75.30%), Query Frame = 0


Query: 1   MGESRSSMAYLVAAVLVATLSLTSVVATDYAYSPPPPPYYTYKSP-------PPPVYHSP 60
           MG+ RSSMAYLVAA+LVATLSL SV+ATDY YS PPPPYY Y SP       PPPVYHSP
Sbjct: 1   MGKPRSSMAYLVAAILVATLSLPSVMATDYVYSSPPPPYYAYNSPPPHIYYSPPPVYHSP 60

Query: 61  PPPKV------KYEYKSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYH----------SPPPPVYHSP 120
           PPP        KYEYKSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVY+          SPPPPVY+SP
Sbjct: 61  PPPAYYSPPPPKYEYKSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPAKYEYKSPPPPVYYSP 120

Query: 121 PPPVYHSPPPPVYHSPPPP----VYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSP 180
           PPPVY+SPPPPVY SPPPP     Y SPPPPVYHSPPPPVY+SPPPPVY+SPPPP+YHSP
Sbjct: 121 PPPVYYSPPPPVYKSPPPPKKDYEYKSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPVYYSPPPPMYHSP 180

Query: 181 PPPVYHSPPPPKK-LEYKSPPPP----VYYSPPPPK--YEYKSPPPP----VYYSPPPP- 210
           PPPVY SPPPPK   EYKSPPPP     Y SPPPPK  YEYKSPPPP     Y SPPPP 
Sbjct: 181 PPPVYKSPPPPKNDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPK 240

[Close]

BLAST of Lag0038487 vs. TAIR 10
Match: AT1G21310.1 (extensin 3 )

HSP 1 Score: 189.5 bits (480), Expect = 2.8e-48
Identity = 162/258 (62.79%), Postives = 167/258 (64.73%), Query Frame = 0


Query: 6   SSMAYLVAAVLVATLSLT--SVVATDYAYSPPPPPYYTYKSP-----PPPVYHSPPPPKV 65
           S MA LVA +LV T+SLT  S    +Y YS PPPP   Y  P     PPPVYHSPPPPK 
Sbjct: 3   SPMASLVATLLVLTISLTFVSQSTANYFYSSPPPPVKHYTPPVKHYSPPPVYHSPPPPKK 62

Query: 66  KYEYKSPPPPVYHSPPPPVYHSP--------------------PPPVYHSPPPP----VY 125
            YEYKSPPPPV H  PPPVYHSP                    PPPVYHSPPPP    VY
Sbjct: 63  HYEYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYVY 122

Query: 126 HSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPP----VYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPP----VYHSPP 185
            SPPPPV H  PPPVYHSPPPP    VY SPPPPV H  PPPVYHSPPPP    VY SPP
Sbjct: 123 KSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYVYKSPP 182

Query: 186 PPVYHSPPPPVYHSPPPPKK-LEYKSP--------PPPVYYSPPPPK--YEYKSPPPPVY 213
           PPV H  PPPVYHSPPPPKK   YKSP        PPPVY+SPPPPK  Y YKSPPPPV 
Sbjct: 183 PPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVK 242

[Close]

BLAST of Lag0038487 vs. TAIR 10
Match: AT2G43150.1 (Proline-rich extensin-like family protein )

HSP 1 Score: 147.5 bits (371), Expect = 1.2e-35
Identity = 136/208 (65.38%), Postives = 140/208 (67.31%), Query Frame = 0


Query: 15  VLVATLSLTSVVATD-YAYSPPPPPYYTYKSPPPPVYHSPPPPKVKYEYKSPPPPVYHSP 74
           V +  L + S +AT+ Y YS PPPP Y YKSPPPPV  SPPPP   YEYKSPPPPV   P
Sbjct: 15  VAMLALLVGSAMATEPYYYSSPPPP-YEYKSPPPPV-KSPPPP---YEYKSPPPPVKSPP 74

Query: 75  PPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPV 134
           PP  YHSPPPPV   PPP VY SPPPPV   PPP  YHSPPPPV   PPP  YHSPPPPV
Sbjct: 75  PPYYYHSPPPPVKSPPPPYVYSSPPPPVKSPPPPYYYHSPPPPVKSPPPPYYYHSPPPPV 134

Query: 135 YHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPKKLEYKSPPPPVYY-SP------PPPKYE 194
              PPP  YHSPPPPV   PPP  YHSPPPP     KSPPPP YY SP      PPP Y 
Sbjct: 135 KSPPPPYYYHSPPPPVKSPPPPYYYHSPPPP----VKSPPPPYYYHSPPPPVKSPPPPYL 194

Query: 195 YKSPPPPVYYSPPPPV--YKSPPPPHHY 213
           Y SPPPPV  SPPPPV  Y SPPPP HY
Sbjct: 195 YSSPPPPV-KSPPPPVYIYASPPPPTHY 212

[Close]

BLAST of Lag0038487 vs. TAIR 10
Match: AT1G26250.1 (Proline-rich extensin-like family protein )

HSP 1 Score: 145.6 bits (366), Expect = 4.6e-35
Identity = 149/212 (70.28%), Postives = 151/212 (71.23%), Query Frame = 0


Query: 30  YAYSPPPPPYYTYKSPPPP--VYHSPPPPKVKYEYKSPPPP--VYHSPPPP--VYHSPPP 89
           Y YS PPPP Y YKSPPPP  VY SPPPP   Y YKSPPPP  VY SPPPP  VY SPPP
Sbjct: 95  YVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPP--PYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYSSPPP 154

Query: 90  P--VYHSPPPPVY-HSPPPP---VYHSPPPP--VYHSPPPP--VYHSPPPP--VYHSPPP 149
           P  VY SPPPP Y +SPPPP   VY SPPPP  VY SPPPP  VY SPPPP  VY SPPP
Sbjct: 155 PPYVYKSPPPPPYVYSPPPPPPYVYQSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPP 214

Query: 150 P--VYHSPPPP--VYHSPPPP--VYHSPPPP--VYHSPPPPKKLEYKSPPPP--VYYSPP 209
           P  VY SPPPP  VY SPPPP  VY SPPPP  VY SPPPP  + YKSPPPP  VY SPP
Sbjct: 215 PPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYV-YKSPPPPPYVYSSPP 274

[Close]

BLAST of Lag0038487 vs. TAIR 10
Match: AT1G26240.1 (Proline-rich extensin-like family protein )

HSP 1 Score: 144.8 bits (364), Expect = 7.8e-35
Identity = 151/221 (68.33%), Postives = 153/221 (69.23%), Query Frame = 0


Query: 30  YAYSPPPPPYYTYKSPPPP--VYHSPPPPKVKYEYKSPPPP--VYHSPPPP--VYHSPPP 89
           Y YS PPPP Y YKSPPPP  VY SPPPP   Y YKSPPPP  VY+SPPPP  VY SPPP
Sbjct: 95  YVYSSPPPPPYIYKSPPPPPYVYSSPPPP--PYVYKSPPPPPYVYNSPPPPPYVYKSPPP 154

Query: 90  P--VYHSPPPP--VYHSPPPP--VYHSPPPP--VYHSPPPP--VYHSPPPP--VYHSPPP 149
           P  VY SPPPP  VY SPPPP  VY SPPPP  VY SPPPP  VY SPPPP  VY SPPP
Sbjct: 155 PPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPP 214

Query: 150 P--VYHSPPPP--VYHSPPPP--VYHSPPPP--VYHSPPPPKKL---------EYKSPPP 209
           P  VY SPPPP  VY SPPPP  VY SPPPP  VY SPPPP  +          YKSPPP
Sbjct: 215 PPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPP 274

[Close]

BLAST of Lag0038487 vs. TAIR 10
Match: AT2G15880.1 (Leucine-rich repeat (LRR) family protein )

HSP 1 Score: 142.5 bits (358), Expect = 3.9e-34
Identity = 134/181 (74.03%), Postives = 137/181 (75.69%), Query Frame = 0


Query: 32  YSPPPPPYYTYKSPPPPVYHSPPPPKVKYEYKSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPP 91
           +SPPPPP Y+   PPPPVY  PPPP V   Y  PPPP  HSPPPPV HSPPPPV HSPPP
Sbjct: 508 HSPPPPPVYS-PPPPPPVYSPPPPPPV---YSPPPPPPVHSPPPPV-HSPPPPV-HSPPP 567

Query: 92  PVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYH 151
           PV HSPPPPV HSPPPPV HSPPPPVY  PPPPV HSPPPPV HSPPPPV HSPPPPVY 
Sbjct: 568 PV-HSPPPPV-HSPPPPV-HSPPPPVYSPPPPPV-HSPPPPV-HSPPPPV-HSPPPPVYS 627

Query: 152 SPPPPVYHSPPPPKKLEYKSPPPPVYYSPPPPKYEYKSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPHH 211
            PPPP  HSPPPP      SPPPPV +SPPPP Y   SPPPPV YSPPPP  KSPPPP  
Sbjct: 628 PPPPPPVHSPPPP----VFSPPPPV-HSPPPPVY---SPPPPV-YSPPPPPVKSPPPPPV 667

Query: 212 Y 213
           Y
Sbjct: 688 Y 667

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of Lag0038487 vs. NCBI nr


Match Name	E-value	Identity	Description
XP_022976067.1	1.7e-76	80.79	extensin-3-like [Cucurbita maxima]	[more]
XP_038899768.1	5.5e-75	79.48	extensin-3-like [Benincasa hispida]	[more]
XP_023536462.1	1.4e-73	82.27	extensin-1-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]	[more]
KAG6592187.1	2.3e-73	82.11	Extensin-3, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]	[more]
XP_004139745.3	1.5e-72	78.35	extensin-3 [Cucumis sativus] >KAE8646192.1 hypothetical protein Csa_016078 [Cucu...	[more]

BLAST of Lag0038487 vs. ExPASy Swiss-Prot


Match Name	E-value	Identity	Description
Q9FS16	3.9e-47	62.79	Extensin-3 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=EXT3 PE=1 SV=3	[more]
Q38913	8.1e-45	71.58	Extensin-1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=EXT1 PE=2 SV=2	[more]
Q9XIL9	5.4e-33	74.03	Pollen-specific leucine-rich repeat extensin-like protein 3 OS=Arabidopsis thali...	[more]
Q9M1G9	4.0e-28	59.36	Extensin-2 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=EXT2 PE=2 SV=1	[more]
Q9LJ64	7.6e-27	69.10	Pollen-specific leucine-rich repeat extensin-like protein 1 OS=Arabidopsis thali...	[more]

BLAST of Lag0038487 vs. ExPASy TrEMBL


Match Name	E-value	Identity	Description
A0A6J1IER1	8.3e-77	80.79	extensin-3-like OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111476580 PE=4 SV=1	[more]
A0A6J1F6U4	6.4e-69	80.09	extensin-1-like OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111442872 PE=4 SV=1	[more]
A0A5D3E640	2.5e-65	75.43	Extensin-3-like OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold172G0026...	[more]
A0A5A7U062	3.3e-65	75.21	Extensin-3-like OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold43G00109...	[more]
A0A6J1CRA7	4.4e-62	71.71	extensin-1 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111013522 PE=4 SV=1	[more]

BLAST of Lag0038487 vs. TAIR 10


Match Name	E-value	Identity	Description
AT1G21310.1	2.8e-48	62.79	extensin 3	[more]
AT2G43150.1	1.2e-35	65.38	Proline-rich extensin-like family protein	[more]
AT1G26250.1	4.6e-35	70.28	Proline-rich extensin-like family protein	[more]
AT1G26240.1	7.8e-35	68.33	Proline-rich extensin-like family protein	[more]
AT2G15880.1	3.9e-34	74.03	Leucine-rich repeat (LRR) family protein	[more]

InterPro

Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (AG-4) v1
Date Performed: 2022-08-01


IPR Term	IPR Description	Source	Source Term	Source Description	Alignment
IPR006706	Extensin domain	PFAM	PF04554	Extensin_2	coord: 125..175 e-value: 2.2E-5 score: 24.4 coord: 29..68 e-value: 1.7E-4 score: 21.6
None	No IPR available	PANTHER	PTHR36586:SF22	EXTENSIN-3-LIKE	coord: 28..211
None	No IPR available	PANTHER	PTHR36586	PROLINE-RICH EXTENSIN-LIKE	coord: 28..211

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:


Feature Name	Unique Name	Type
Lag0038487.1	Lag0038487.1	mRNA

GO Annotation

GO Assignments

This gene is annotated with the following GO terms.

Category	Term Accession	Term Name
biological_process	GO:0009664	plant-type cell wall organization
molecular_function	GO:0005199	structural constituent of cell wall