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Lag0027432 (gene) Sponge gourd (AG‐4) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGTCGTCAAGTCTCGAGTACTTCGCTCTGCTGCCAATGGAGAGCTGCATTCTCCAGTAACTCCCGAGGAGAAGCCGAAGCGTGGCAAAGTAGCTTCGCATGGCCGAAAGAATGCTAAAGCAAAGGGAGATGCGGAGGAGCCGTCTCCTTCTCCTCAGAGGCGGACCAGTGCTCGAATCCAGATAAAGCAGCTGGCTGAGAAGGAGCTCCTAGTGCGACAAAGAGTAGAGCTCCTCGATGAAACCGACAGTGCGAGGAAAAGGAAGAAGACGAACGGCCAGGTGAAAAGTAAGCGTAACACTGTGAGTGTTGAGGATGAGGTGGTGGAAGATAAGGCCATTGCTGTTCCGGTATCCACCGATGTCACCAAATCTAAAGACGGTGATGCGAGCGAGCCAAGGGAGGTGTGTGCGCCAGAAAATAGTAGAACGGGTGACGAAGGTGGTCCGGCTAATATGGTTGAGAAGAGTGACCATGTCAAGGTGAAGGAGACTCTCAGGTTGTTCAACAAGTACTATCTTCATTTTGTACAGGTTCGTCGCTTGGAAACGTCACTTCGTTTGGAGTTATTTCAAAATCTTTGTACATCGAAGTTTATAGTCAGCTAACTTTTGGTCATTGTATGTATGTTCATCTAAACCAAAAGGAAGAGGAAAAGAGGTGCAAAAAAGCCGAAGTAGCTCGAAAAGCTTCCAAAGGGTCAAAATCTAAGGTAGGCTTGTGTGTCGACCTTCTATAATTCATGCAAGTCATCGATAGTCTTTCTCTGAGTGTCCCACGCAAAGAGTTGTTAGTTCATTTGATGAAAAATGACATCTATATCAGACTGAATAAATGGTAGCCTCCGAGTTCTCTCATCTCGCACTACCTGTCGCATTAAAGGAAATCAAAGAACAAATACTATGTACATCATTAATCTTCGAATTCAGATTTTTTGGGGGCTTTCGAATCATTCACTCATTTCTATGTTTCGGATCATTTGGAACTGGCTCTCTTTGTCTCAATCCAAAATGATTCATCTAAGTGAGACAAATTATGACATGAACTGTCATCATGATTTTCCACATTTATCTTATTAGTTGAAATTTGTACAGAAGGCGGATCCTGTAGAAGACACAAAAAACAAATCTAAGCGACCAGATTTGAAGGCAATTTCTAAGGCAAGTTGTAATTGAACGCATCAAGCCTCTAGAACCTTTCTTGCTAGTGTTTAATTAATCATTACTCAACCCGTGTGGTGTTCAATTGAAGATTCCATTTGTGATCTACCATGTAATTTTATGCCTTTGCTTAATCTTCCTTTAACGTTTTAGTTCAGTTACTGGATTTTTTTGTGACTGATATGTTGTCTTTGAACATTTATTAACAGTCTCTCTTTAGGAAACAGAAAAGTATCTATGATTCTTCCTGCTGGAATCAGGAAGGCTAGGAGTAGGAGAGGAGAGGAGAGGAGAACAATTTTTTTCTTTGGGGGGGGGGATTTCAATTTTCAATGGTAGTTTTCAGATGTTCAATTCAACGTTTGTTTAGCTAGGAATAGAGTTTGCAGCTGGTGGGGGAGGTTCTTTGGCTTTCATGGTAGAGGTTGAATTTTGTGGCAGGCTAGCTTTTTCGTAGTCCTATGGGGCCTTTTGATCGAGATGAACAATAGGATTTTTAGAGGTTTGGAGAGATTCTGTGAGGAAGCATGGTTGCATGTTGATTTAATGCTTCTATTTGATTGTTAGTGTCCAAGGATTTTTGTAATTACTCATTAGTAAGCTGAAGCCCTCTTTTGTATAACATCTGGCTCTTGTTGGTGGTTTGTCTTTTTTTGTATGCCACCTTGCTTTCCCTTTTGTTCTCTTTCCTTCTCTTCCGATGAAAGTTTGATTTCTCATCAAAAAGGAAAAAAAATCTTGAAAATGATTCAATTTTTTCTTGGCTTGTAGCCTTGTAGAGGATCTTTTTTAAAATGTATGAGTATTCAGACTAGCTTGTATACACTTCAACCATTTTCATGAGACAACACTTGACCTTTTTATATTTGATGATTGTCGATAAAACTTGTAGGATGTTAAATCTTATGTAGGTTGCCACCACGATTTGCACCTATTTCCTCTAAGTCCTTTATTATTCATATTGACTCTTATCAACTGCTATGCCAACCCATGGTAGTTAGTAGCCTTGTGGAGGATTAACATGATTAGAATTTTAGTAGGAAGCTTCCACTTTTTGTTCTTGGTGTACATTGATGTGTTTTGTGTAGGTCTGATGCAAAGTATTCTCTTCGCACCTTTGGTTGTTCCTTTTCAATCCCTCTCTCTCTTCTGTTTTTTGTTTTTTTGTTTTTTTTTGGAAAGGAGGAAGAACCTAATTTCATTAATATAATGAAATTTACATAAGACTAAGGGGTAACAAAAATCTCATCCAATTTCCACAAATATCAATAAGAGAGTAATTACAACAGGATTTATCTAGTTTGCACCAAATGGCCTTTGTTACTCTCTATTCAAATGTTCCAAGGAAGCTCCTTATCAGATTCAGCAATAAGGGTTTAGAATGCCTTTTGAAATGGTGAGCCACCATAGTTGAAGATTGTTCATGACTGTTGTGCATATGGATGGGGATGGACCATCCAAAAGCCTGAATGAGATTGTTTCAAAAAAATAGATGTAAAGTGGTAGCTAACAAAAAATTTGATCTTGGGACTCACAGTTGAGCTTGTAAAGGGAGCAAATGTTGGGGGAAAGGGCAACTTAGGGACATATTTTCTACGTGTAAGTCCATGGTATTAATCTTGCCCATGACGACCTTTCACAGAAGGATTTGTGCCTAAGCACCAGACCATCAATGTTGCCCATCAAGAGAAACCAATCTTTGTATTCATCATCTTCTAAATTCCTCCTAAACTCCTAAAAAGAAATTTCTCATAAACTGAATGTTCCAGGAGCTAGTGGTCCTATTCCAAAGGGCGGCCACTATCTCATTTGTAATAGTGGAGACGCAATAGGGATGTGGGAAGGTGGAGCACAAGGTAGACAAATTGATCCATGGGTTTGCCTGAAAACGAGTGTTTAGTTCTGGTGTAGCCGGATTCATGCTATTATAATCCTTTTCTTTTATTTAGATCATGTGACAAGCACATGCTTTGTAACTGCTTTGTAACTACTTTTAGTTGTGGCCTTTGCCTATTTAAAGGCTAGAGTCTATCAATAAAGGATTATTATTCATTGTTTTAAAAAGAAGACTCTCGGCCACACTAAGATTTGGTATCAGAGCACCAAGATTTTGGGCACAATCTTATGGCAACCAAGAAGATTTCGACCAACATTGTGGGCGACTCCTCTTCGGTTGGAAAAGAGACGGAGCTTACCGTCGTCCTCTCTCCACGATCAACAACCATACATTTGCTGTTGGTTGAACAAGACACAAAGGAATTAAAGGATGATGTGGGTGAGATAAAGAAAATTTTGGAAATGATTTGTGAAAAATTGGGCTGCAAAACCAACCATGCAAAACCAACCAGCAGAATGTCGAACCAAGAAGTCACATAAATCCCGAGAAGAATCAGCAAGATCATCCACATGAGGATTTTAGAACGAGGCAGTGGCAAGGAAGACATGTTTTTGAGCATAAGATGACACAAGGAATGAAACAGGTTCCAAGGTTCTTTCAAGAACACCACACAGGACAACAAAAAGTCAAGTGCAATCCTTTATTTCGAAGGCAAGTTGAATGGAATGATGACAGCTCTAGTGAGGAAGATTATGACTTTCAAGAAACCTTAAAGGAAGGCCAACAAAACTATCAGTATCAATATCAACAAGAAGCTCCAAGGGAAGGCCAACAATATAATCTGTATCAATATCAACAAGAAACACCAAGGGAAGGCCAGCAAAATCACAGGTATCAAAATCAGCAAGACAATGATTTTAAAATGAAGATTGATATACCGACTTATAGTGGGAAGATGGAGATTGAAGCCTTTTTAGAATGGGTTAGACACATAGAAAAATTTTTCAACTACATGAACACACTTGAGACCAAAAAAGTTAAATTAGTGGCTTTAAAATTAAAGGGAGGTGCCCAAGCATGGTGGGACCAATTGGAACTCAACCGCCAGAGATATGGTAAACGACCAATCCGAAGATGGGAAAGAATGAAAAGATTGATGAAAGAAAGATTCTTGCCTATGAATTTTGAACAAATCCTATATGACCTATATCAAAATTGTAAGCAAGGTAATAGATCGATCATGGAGTACACGAAAGAACTCCATCAGTTAGGGGCAAGAACGAATCTTGGAGAAAGTCAACAATATTTAGTTGCAAGATACAAAGGCGGCCTTCGAAATGATATTAAAGAACAACTTTCTTTACAACCAATCAGATACTTGAATGAAGCCATCTCCGCTGCAGCTGTAATCGAGGAACAAATTACTAATCGTTTTAAAAGAACTTATTCCAGAAGGGTCACAGGTGAACAAACCAGTAACTTCAAAACTGCACTTGGTGATAGAACTTTACAACAAAATTCGATGGCAACCCTTAAAGGAAAACAGATAGAGGTCAATTCAACAAGGGAAAACAAGAACTCTGATGGTACAACCACAAAAAGAACTTCAAACACATATTCAAGACCGACTCTAGGGAAATGCTTACGATGTAATCAATCGGGCCATTTATCCAATGAATGCCCTCAGCGGAAGACACTAGCAATTGCAGACACTGTCGAGTATCAAAATGAGGAAGAGGATGAAGACACTAACGATAATATCGACTTTCTTGAACCAGATGACGGTGAACCAATATCTTTGGTCATTCAGAGACTTCTTTTAGCTCCTAAAATAGATCCAAGTTATCAACGACACATGTTATTTAAGACTAGATGCACAATAAACGGGAAAATATGCAATGTGATCATTGATAGTGGCAGCACTGAAAATGTGGTTGCGAGTAAGCTTGTTTCCACTTTAAATTTGCCCTTACATCCTCATTCAACACCTTACAAG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MVVKSRVLRSAANGELHSPVTPEEKPKRGKVASHGRKNAKAKGDAEEPSPSPQRRTSARIQIKQLAEKELLVRQRVELLDETDSARKRKKTNGQVKSKRNTVSVEDEVVEDKAIAVPVSTDVTKSKDGDASEPREVCAPENSRTGDEGGPANMVEKSDHVKVKETLRLFNKYYLHFVQEEEKRCKKAEVARKASKGSKSKKADPVEDTKNKSKRPDLKAISKMLEENEILNHEKRIGNVPGINIGHRFYSRAEMVAVGFHSHWLNGIDYMGLSYSKMYSNYSFPLAVAIVLSGMYEDDLDNAEDVIYTGQGGQNLTGNKRQIRDQVMERGNLALKNCIEQAVPVRVVRGHESASSYCGKLYTYDGLYKVIQYWAEKGISGFTVFKFRLRRIEGQSLLTTNQVQFIYGRVPKSVSEIRGLVCEDITGGQEDIPIPATNLVDDPPVAPTGFTYCRSIKVAHGVKLPSNANGCDCSGSCIASRTCSCAKLNGLDFPYVHRDGGRLIEAKDVVYECGPHCGCGPGCVNRTSQRGIKYRLEVFRTPKKGWAVRSWDFIPSGAPVCEYTGILTRTEDLDHVSENNYIFDIDCLQTIRGIGGRERRSRDASLPANNSLDGIEDQRSESVPEFCIDACSTGNIARFINHSCEPNLFVQCVLSSHHDIKLARVVLFAAENIPPLQELTYDYGYALDSVYGPDGKIKQMPCFCGATECRKRLF Homology
BLAST of Lag0027432 vs. NCBI nr
Match: KAG6581138.1 (Histone-lysine N-methyltransferase, H3 lysine-9 specific SUVH4, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 1332.4 bits (3447), Expect = 0.0e+00 Identity = 666/718 (92.76%), Postives = 688/718 (95.82%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0027432 vs. NCBI nr
Match: XP_022934519.1 (histone-lysine N-methyltransferase, H3 lysine-9 specific SUVH4 isoform X1 [Cucurbita moschata] >XP_022934520.1 histone-lysine N-methyltransferase, H3 lysine-9 specific SUVH4 isoform X1 [Cucurbita moschata] >XP_022934521.1 histone-lysine N-methyltransferase, H3 lysine-9 specific SUVH4 isoform X1 [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 1331.2 bits (3444), Expect = 0.0e+00 Identity = 666/718 (92.76%), Postives = 687/718 (95.68%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0027432 vs. NCBI nr
Match: XP_022982665.1 (histone-lysine N-methyltransferase, H3 lysine-9 specific SUVH4 isoform X1 [Cucurbita maxima] >XP_022982666.1 histone-lysine N-methyltransferase, H3 lysine-9 specific SUVH4 isoform X1 [Cucurbita maxima] >XP_022982667.1 histone-lysine N-methyltransferase, H3 lysine-9 specific SUVH4 isoform X1 [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 1325.8 bits (3430), Expect = 0.0e+00 Identity = 663/717 (92.47%), Postives = 684/717 (95.40%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0027432 vs. NCBI nr
Match: XP_023527226.1 (histone-lysine N-methyltransferase, H3 lysine-9 specific SUVH4 isoform X1 [Cucurbita pepo subsp. pepo] >XP_023527227.1 histone-lysine N-methyltransferase, H3 lysine-9 specific SUVH4 isoform X1 [Cucurbita pepo subsp. pepo] >XP_023527228.1 histone-lysine N-methyltransferase, H3 lysine-9 specific SUVH4 isoform X1 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 1324.7 bits (3427), Expect = 0.0e+00 Identity = 665/718 (92.62%), Postives = 684/718 (95.26%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0027432 vs. NCBI nr
Match: XP_022928428.1 (histone-lysine N-methyltransferase, H3 lysine-9 specific SUVH4-like isoform X1 [Cucurbita moschata] >XP_022928429.1 histone-lysine N-methyltransferase, H3 lysine-9 specific SUVH4-like isoform X1 [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 1317.0 bits (3407), Expect = 0.0e+00 Identity = 651/716 (90.92%), Postives = 682/716 (95.25%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0027432 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8GZB6 (Histone-lysine N-methyltransferase, H3 lysine-9 specific SUVH4 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=SUVH4 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 739.2 bits (1907), Expect = 4.4e-212 Identity = 375/685 (54.74%), Postives = 475/685 (69.34%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0027432 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8VZ17 (Histone-lysine N-methyltransferase, H3 lysine-9 specific SUVH6 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=SUVH6 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 349.0 bits (894), Expect = 1.3e-94 Identity = 229/575 (39.83%), Postives = 297/575 (51.65%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0027432 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O82175 (Histone-lysine N-methyltransferase, H3 lysine-9 specific SUVH5 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=SUVH5 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 346.3 bits (887), Expect = 8.3e-94 Identity = 234/666 (35.14%), Postives = 333/666 (50.00%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0027432 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9C5P4 (Histone-lysine N-methyltransferase, H3 lysine-9 specific SUVH3 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=SUVH3 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 330.5 bits (846), Expect = 4.7e-89 Identity = 201/522 (38.51%), Postives = 278/522 (53.26%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0027432 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q93YF5 (Histone-lysine N-methyltransferase, H3 lysine-9 specific SUVH1 OS=Nicotiana tabacum OX=4097 GN=SUVH1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 322.8 bits (826), Expect = 9.9e-87 Identity = 193/508 (37.99%), Postives = 268/508 (52.76%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0027432 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1F7X9 (histone-lysine N-methyltransferase, H3 lysine-9 specific SUVH4 isoform X1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111441673 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1331.2 bits (3444), Expect = 0.0e+00 Identity = 666/718 (92.76%), Postives = 687/718 (95.68%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0027432 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1IZZ3 (histone-lysine N-methyltransferase, H3 lysine-9 specific SUVH4 isoform X1 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111481473 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1325.8 bits (3430), Expect = 0.0e+00 Identity = 663/717 (92.47%), Postives = 684/717 (95.40%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0027432 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1EP01 (histone-lysine N-methyltransferase, H3 lysine-9 specific SUVH4-like isoform X1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111435244 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1317.0 bits (3407), Expect = 0.0e+00 Identity = 651/716 (90.92%), Postives = 682/716 (95.25%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0027432 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1EK99 (histone-lysine N-methyltransferase, H3 lysine-9 specific SUVH4-like isoform X2 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111435244 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1311.2 bits (3392), Expect = 0.0e+00 Identity = 650/716 (90.78%), Postives = 681/716 (95.11%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0027432 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BN95 (histone-lysine N-methyltransferase, H3 lysine-9 specific SUVH4 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103491710 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1296.2 bits (3353), Expect = 0.0e+00 Identity = 655/723 (90.59%), Postives = 672/723 (92.95%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0027432 vs. TAIR 10
Match: AT5G13960.1 (SU(VAR)3-9 homolog 4 ) HSP 1 Score: 739.2 bits (1907), Expect = 3.1e-213 Identity = 375/685 (54.74%), Postives = 475/685 (69.34%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0027432 vs. TAIR 10
Match: AT2G22740.2 (SU(VAR)3-9 homolog 6 ) HSP 1 Score: 349.0 bits (894), Expect = 9.2e-96 Identity = 229/575 (39.83%), Postives = 297/575 (51.65%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0027432 vs. TAIR 10
Match: AT2G22740.1 (SU(VAR)3-9 homolog 6 ) HSP 1 Score: 349.0 bits (894), Expect = 9.2e-96 Identity = 229/575 (39.83%), Postives = 297/575 (51.65%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0027432 vs. TAIR 10
Match: AT2G35160.1 (SU(VAR)3-9 homolog 5 ) HSP 1 Score: 346.3 bits (887), Expect = 5.9e-95 Identity = 234/666 (35.14%), Postives = 333/666 (50.00%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0027432 vs. TAIR 10
Match: AT1G73100.1 (SU(VAR)3-9 homolog 3 ) HSP 1 Score: 330.5 bits (846), Expect = 3.4e-90 Identity = 201/522 (38.51%), Postives = 278/522 (53.26%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (AG-4) v1
Date Performed: 2022-08-01 Position : 0 Zoom : x 1
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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