
Lag0026522 (gene) Sponge gourd (AG‐4) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGCCTATTGTTTATACAAGAAGAAAAGAGGTTACCTTGCAAAATCACGAATGTCAACCACCTGAACCGGATTCATCATCGCTGAATTCCACTGATGAGAACATCACATCTATGGCACCTGTGATCGATGATCTAACCCTACCAATTGCTAAGAGAAAAGGTGTTAGAAGTTGCACTAACCATCCCATTGAAAAATATGTTGCATATGGGAAATTGCTTCCTGATTATAAAGCATTTATTAGTCAACTGGATAGTATTCATATTCCACAAACCATTCATGATGCACTCAAAGATCCGAAATGGAAAAAGACAGTGGATGAAGAAATCAAAGCTCTTGAAAGCAATGGAACGTGGACTCTTACTCAACTTCCTCATGGAAAGAATCCAGTTGGTTGTAAATGGATTTTCACAGTTAAATATAAATCTGATGGTAGTGTGGAACGATTTAGAGCCAGACTTGTTGCGAAGGGCTTCACTCAGTCATACGGTATAGATTACCAAGAAACTTTTGCCCCAGTTGCAAAATTAAATACTGTGCGTGTTTTGTTGTCTCTAGCTGTGAACCAGGATTGGCCTCTTCACCAACTGGATGTTAAAAATGCATTCTTAAATGGTGATCTCGAAGAAGAAGTTTATATGAAAATTCCCCCTGGAATGGAAGACAAGTCCAATAATAACTTGGTGTGTAAGTTGAGAAAGTCTCTATATGGATTGAAACAATCTCCACGTGCTTGGTTTGATAGATTTGCTAAAACACTGATTAAAAGCGGCTATTATCAATGTCAAGCTGATCATACTTTGTTTGTGAAATCCTCGAATAACAAAACTGCAATTTTGATTGTATATGTGGATGACATCATCATTACAGGGAATGATGTAGATGAGATCCTCAACCTCAAAAGGATGCTTGCAACTGAGTTTGAAATCAAAGATCTGGGAAGCTTGAGATATTTTCTAGGCATGGAAGTGGCACGATCCAATAATGGGATTATAATTTCTCAGAGAAATTATATCCTAGATTTATTAAGGTAGACAGGAAATCTTGGGTGTAAACCTGCAGAAACACCCATGGATCCAAATCTAACTTTACACCAAAGTGAAGAAGTTATTCCAGTTGACAAAGGCATGTATCAAAGACTTGTGGGAAAGTTAATTTATTTATCGCATACCAGACCAGACATTGCATACTCTGTAAGTATTGGTAGCCAGTATATGAATAATCCAAATGAACGCCATCTTGGAGCTGTGAACAGAATTTTGAAATACTTGAAAGGCACCCCAGGTCATGGTCTATTATTCAAAAAATCTTCAAGCAGAATGGTAGAACTTTATACTGATGCTAGTTGGGCTGGAGAATTAACTGATCGAAAATGTACGACTGGCTATTGCTCCTATGTTTGGGGTAACTTGGTCACTTGGAGAAGTAAAAAACAAGCTGTTGTTGCAAGAAGCAGTGCAGAAGCTGAATACAGAGCTCTTGCTTTAGGAATATGTGAAGGAATATGGATTCAAAAACTTTTGACAGAACTGAAAATTGACACTCAGAACACAGTTAAAATGTTTTGTGATAGTCAATCAGCCATCAGTATTGCAAAGAATCCTATTCATCATGACAGAACAAAGCACATAGAGATAGATCGACATTTCATATTTGAGAAGGTCAACAATAGAATAGTGGAACTAAACTATGTTCCATCTCGTAATCAAGTTGCTGACATTCTCACCAAAGCATTACCAAGGGCAAGCTTTGAAGAATTCAACTCCAAGCTTGGCTTGTATACTATATACAATCCAACTTGAGGGGAGTGTAGATTATTTCATTCTATTTTATTTTTCCCTTATTTAGATTAGATTTTATTCTATCTTAATGTCTTTCCTTTTCTGTATTTTTCCTCAACTCTATATCTTATTGTTTTTTGGAGATTAGTAAATGAGACATTATTTTTCTTCCAAAAACTACATTTCTTATAAAAAATATTTATGCTTTCATGTTCTTTTATGTGCTTTTGACTAAAATATTGTCTTCTTTATTATATATTATCACTTGAAAGGATATAATTATGTGGAGTCATGTATGCCATGTCATGTCATCATGTATTTTATCATTGTTAACAATATGTAATTCTGCTTCTTCTATTTTAAAAGGTGCACCTCACTTGAAAATTGTTTTTTTTTTCAACCAATAAAATTTGTAGCTTTAGAATGCATCTTACACATCACGTTGAAAGCAAAAGGTCATCGTTTCCCTGAAGGAAATGGGCCAGCTCATTCAATTAAATCCAATGTTTTATCCATGTTTTCTTATGCATTTAAATTTTGGTAATCACTTTCCTTTATTTCAATTTTTATTTACTGTTACTGCCTTGTTTCTCTTAGTTTATCATCGGCTTGTATATGAGAAATACAAGAAATAATATTAGCAATTTATAATGAAGTCTTAGGGTTTGAAACATTTTGCTATCATGTTTTGTCACCATTATTTTATTGAACATGAAGTAAAAAAGAAAGCACGTTTTAAAATTGATTTGGCTGCTCAACTTAATTCTTGGTTTTACCTCTATTTTGATTATTTTGTCAGAAGATTTTATTTGCATCAAGAATTTCCCTTCTAGAGAAAGCATACTGGGTGATGCATGGTGATGATGTTGACATAAAAGTAATGTAGTTTTATTTGATATATTATGTGGCATGTTATTTTGAGTGATAATTTAGACGTAAGCATGCTGATGAGTTGGTGGAATGTTTTGCTAATAAAGGGCAGTAAGTAATTTTATTTAGCCTCTTTAGAAAATCTTGTTATTGTAAGTAGAAATGGGAACTGTTAACTAAAAGTTGGTGCTAACTTTTCTGACTGCCCCAACAATTGGTAAAGGTTCTTCTGCAACACTGTATAGAAATTAGCCAAATGACCACTTTTTCATTGAAAATGACATCGTATTATGTGCAAAATAATTGTGTAGTATGACTGAACAGCGGCCAAGTACTGATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCACTCACACACGCGCACACACATGACTCTGGCCTTTTTTTTACCCTTTTTTGAGAATGACATGAAATATTGGTGGTAAAGAAGTTTCCTGTTCCACATAACGTTCAGACTAACTTATTAAAAAAATTGATTTTGTTTGACTTGATTGCTCGTTTGACCAGAGAAATTACCTGGACGTTTACCGCTTTGAATCATGGGGAGGTTCAACTATTCCAACTTACGTTTCTGGGCAACAGGTTTCTGTTCACTCATTACATTTTATATTGATTACTCTATCATGGTAGTCCTGCATATGGGTGCTTTTGTGCAAATCAATCACAATCATGCAAACACACAAGTTCAGTTAAGCCACCAATAAAGAATTCATATGTTAGAAGAAATAAGGATGGGCTAAAGGGATAGGTCGCTGGGATGATCCACGAATATTTAATCTATTATTAAGTATTCTTGGCTGTTAGTATTCTATGATTATGTATTTTGGGCTTATAGTAATTGGGAATATAATCCCATGTCTACAAGTTATGTGTCTTGGGTTTAGGAAGAGTCATTAAGTAATTATGTTGTCTTGGAATATGAATAAGTCTTTTATTTATTTATTAGAGGTCTAGGGGGTTGGGGAGGATATGGAATTTGTAAGGAAGTAGTCCTTGGAGAGATTGCAGCCCTTTCGAATTGGCTGAGGCCTGAGTTATTTGAAACTCTAATTCCAATTATGTTATTCAACTTTAAGGAAATACCTTACAAGTTCATTCATTATTCATATATGGGAAAGTTTTTTTTCAATAATTTGTTTTTGGATGAAAAATCATTCACTCACGTAAAAAAAAGGATAAACAATGAGCAATACAAAATACCAGCCAAGTTTCATACCAATAATAATTATTCAGCATATAGGAAAGTATTTCATATGAAAACCAAAATATCCTTTAAATTGACCCAAAGTTAAATTATGAGGTTTTGAATTAATTATAATTTATGTGACCCTATTATTGCATTGAGAAATAGAATCATTCATATTGTTGGGGTAAATGGCGGGATCATTTACTAGTGTAAGGATACTAAGAGCAGCAAACTCTCAACTGAAGCATTATCTGGTTCATGGTCAAGATTTTTTTTTTGGAAATAAAGAATTAGGTAGTAAACAAAATTGTATTTCTCGTTTTTATTATTTTCTGAGGTTAAATTATTAAAAATACCCCTAGACAATGAGGTATGTTTCAATTATGCCCCTGACCTTCAAAAGTTTAATTTTAGCCCTTGGATTTTGATTGAAGTTTGTTTCAAAACAATTCTTGAAGGTTTTTTTTCGTTAAATTCATGAACGGAAAATGACGTGTTTGCCTATTTATTGTTGTTTATGTGAACAAATTTGAATACTTACGTGGAAAATACGATAAAAACGCATGCAAAACATCATTTTTCGTTCATAAATTTAATGGAAAATATATCTAAGGGTCGTTTTGAAACAAATTTCAAACTTCAAGGGTTAAAATGAAACTTTTGAAAGTTCAGGAGTATAATTGAAACCAACCTCATAATTCAGAGGTATTTGTAATAATTTAACCTTTTCTAAGAAATGAATTTGGTTGTAAATTGAAAACTCTAATTTTCTTCAGATACCTTTTTTCCCCATGGATTGACCTAGTGGTCATTGAGACAAGTAAAGAAAGTTAAGTGACTTTGAACTTTGGAGGAATGAGTTCAAACTCCATGGTGACAATCAACTAAGAATATTAAAATTCTATTTGTTTCCAAAAACCAAATATTGCAGAGTTAGATAGTTGACTCGAACGGTTAGTTACGGTGTGCCTAAATCACCCTGGACACTTATGGATAACAATAAAAAACTTTTTCATTGATATATAAAAGAGAGTACAAGAAAGGTGAGAGGAACCTCAAGCAAAACGAAAAAAGTTACAAAAAACCCTTCCAAGATTGATGAGGGTCTTTCTGATTTGAATTTTGATGGAAATTGGTGTCTTG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ATGCCTATTGTTTATACAAGAAGAAAAGAGGTTACCTTGCAAAATCACGAATGTCAACCACCTGAACCGGATTCATCATCGCTGAATTCCACTGATGAGAACATCACATCTATGGCACCTGTGATCGATGATCTAACCCTACCAATTGCTAAGAGAAAAGGTGTTAGAAGTTGCACTAACCATCCCATTGAAAAATATGTTGCATATGGGAAATTGCTTCCTGATTATAAAGCATTTATTAGTCAACTGGATAGTATTCATATTCCACAAACCATTCATGATGCACTCAAAGATCCGAAATGGAAAAAGACAGTGGATGAAGAAATCAAAGCTCTTGAAAGCAATGGAACGTGGACTCTTACTCAACTTCCTCATGGAAAGAATCCAGTTGGTTGTAAATGGATTTTCACAGTTAAATATAAATCTGATGGTAGTGTGGAACGATTTAGAGCCAGACTTGTTGCGAAGGGCTTCACTCAGTCATACGGTATAGATTACCAAGAAACTTTTGCCCCAGTTGCAAAATTAAATACTGTGCGTGTTTTGTTGTCTCTAGCTGTGAACCAGGATTGGCCTCTTCACCAACTGGATGTTAAAAATGCATTCTTAAATGGTGATCTCGAAGAAGAAGTTTATATGAAAATTCCCCCTGGAATGGAAGACAAGTCCAATAATAACTTGGTGTGTAAGTTGAGAAAGTCTCTATATGGATTGAAACAATCTCCACGTGCTTGGTTTGATAGATTTGCTAAAACACTGATTAAAAGCGGCTATTATCAATGTCAAGCTGATCATACTTTGTTTGTGAAATCCTCGAATAACAAAACTGCAATTTTGATTGTATATGTGGATGACATCATCATTACAGGGAATGATGTAGATGAGATCCTCAACCTCAAAAGGATGCTTGCAACTGAGTTTGAAATCAAAGATCTGGGAAGCTTGAGATATTTTCTAGGCATGGAAGTGGCACGATCCAATAATGGGATTATAATTTCTCAGAGAAATTATATCCTAGATTTATTAAGACCAGACATTGCATACTCTGTAAGTATTGGTAGCCAGTATATGAATAATCCAAATGAACGCCATCTTGGAGCTGTGAACAGAATTTTGAAATACTTGAAAGGCACCCCAGGTCATGGTCTATTATTCAAAAAATCTTCAAGCAGAATGGTAGAACTTTATACTGATGCTAGTTGGGCTGGAGAATTAACTGATCGAAAATGTACGACTGGCTATTGCTCCTATGTTTGGGGTAACTTGGTCACTTGGAGAAGTAAAAAACAAGCTGTTGTTGCAAGAAGCAGTGCAGAAGCTGAATACAGAGCTCTTGCTTTAGGAATATGTGAAGGAATATGGATTCAAAAACTTTTGACAGAACTGAAAATTGACACTCAGAACACAGTTAAAATGTTTTGTGATAGTCAATCAGCCATCAGTATTGCAAAGAATCCTATTCATCATGACAGAACAAAGCACATAGAGATAGATCGACATTTCATATTTGAGAAGGTCAACAATAGAATAGTGGAACTAAACTATGTTCCATCTCGTAATCAAGTTGCTGACATTCTCACCAAAGCATTACCAAGGGCAAGCTTTGAAGAATTCAACTCCAAGCTTGGCTTAATTTCCCTTCTAGAGAAAGCATACTGGGTGATGCATGGTGATGATGTTGACATAAAAAGAAATTACCTGGACGTTTACCGCTTTGAATCATGGGGAGGTTCAACTATTCCAACTTACGTTTCTGGGCAACAGTTTGTTCCAACAACATTGACTCTTGATTCAGGAGTCACGAGACCACCCCCCCTTCTGAGTGAAGCTGATTTGCTTTCGTGTATGGACAAGGAGGGAATTGGTACAGATGCAACAATGCATGACCACATCAAGAAGCTGTTAGATAGATTTTATGCAACAAAGGATGCAAACACTCGCTTCACACCAACTAACCTAGGTGAGGCTCTGGTAATGGGATATGACGACATGGGGTATAAACTGTGGAAACCACATCTTAGAGCTGTCATGGAGCATGAGATGAAATCAGTTAGCGAGGGCACTAAGAGAAAAGATGAATTTTTGGCTACATCCTTGCAGCAGATGAAAACTTGCTTCTTAGATGATGCATACGAGATAGATAAAGCAGTCTTCCAACAAGTCTGA MPIVYTRRKEVTLQNHECQPPEPDSSSLNSTDENITSMAPVIDDLTLPIAKRKGVRSCTNHPIEKYVAYGKLLPDYKAFISQLDSIHIPQTIHDALKDPKWKKTVDEEIKALESNGTWTLTQLPHGKNPVGCKWIFTVKYKSDGSVERFRARLVAKGFTQSYGIDYQETFAPVAKLNTVRVLLSLAVNQDWPLHQLDVKNAFLNGDLEEEVYMKIPPGMEDKSNNNLVCKLRKSLYGLKQSPRAWFDRFAKTLIKSGYYQCQADHTLFVKSSNNKTAILIVYVDDIIITGNDVDEILNLKRMLATEFEIKDLGSLRYFLGMEVARSNNGIIISQRNYILDLLRPDIAYSVSIGSQYMNNPNERHLGAVNRILKYLKGTPGHGLLFKKSSSRMVELYTDASWAGELTDRKCTTGYCSYVWGNLVTWRSKKQAVVARSSAEAEYRALALGICEGIWIQKLLTELKIDTQNTVKMFCDSQSAISIAKNPIHHDRTKHIEIDRHFIFEKVNNRIVELNYVPSRNQVADILTKALPRASFEEFNSKLGLISLLEKAYWVMHGDDVDIKRNYLDVYRFESWGGSTIPTYVSGQQFVPTTLTLDSGVTRPPPLLSEADLLSCMDKEGIGTDATMHDHIKKLLDRFYATKDANTRFTPTNLGEALVMGYDDMGYKLWKPHLRAVMEHEMKSVSEGTKRKDEFLATSLQQMKTCFLDDAYEIDKAVFQQV Homology
BLAST of Lag0026522 vs. NCBI nr
Match: RVX02146.1 (Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon TNT 1-94 [Vitis vinifera]) HSP 1 Score: 724.5 bits (1869), Expect = 8.7e-205 Identity = 366/605 (60.50%), Postives = 439/605 (72.56%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0026522 vs. NCBI nr
Match: RVW70260.1 (Copia protein [Vitis vinifera]) HSP 1 Score: 724.2 bits (1868), Expect = 1.1e-204 Identity = 366/605 (60.50%), Postives = 439/605 (72.56%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0026522 vs. NCBI nr
Match: RVW35064.1 (Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon TNT 1-94 [Vitis vinifera]) HSP 1 Score: 723.4 bits (1866), Expect = 1.9e-204 Identity = 366/605 (60.50%), Postives = 439/605 (72.56%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0026522 vs. NCBI nr
Match: RVW86492.1 (Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon TNT 1-94 [Vitis vinifera]) HSP 1 Score: 723.4 bits (1866), Expect = 1.9e-204 Identity = 366/605 (60.50%), Postives = 439/605 (72.56%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0026522 vs. NCBI nr
Match: RVX19036.1 (Copia protein [Vitis vinifera]) HSP 1 Score: 723.4 bits (1866), Expect = 1.9e-204 Identity = 366/605 (60.50%), Postives = 439/605 (72.56%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0026522 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q94HW2 (Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon RE1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=RE1 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 409.5 bits (1051), Expect = 8.1e-113 Identity = 230/581 (39.59%), Postives = 313/581 (53.87%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0026522 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9ZT94 (Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon RE2 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=RE2 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 403.3 bits (1035), Expect = 5.8e-111 Identity = 221/578 (38.24%), Postives = 318/578 (55.02%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0026522 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P04146 (Copia protein OS=Drosophila melanogaster OX=7227 GN=GIP PE=1 SV=3) HSP 1 Score: 369.0 bits (946), Expect = 1.2e-100 Identity = 192/498 (38.55%), Postives = 290/498 (58.23%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0026522 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P10978 (Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon TNT 1-94 OS=Nicotiana tabacum OX=4097 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 346.3 bits (887), Expect = 8.4e-94 Identity = 195/519 (37.57%), Postives = 294/519 (56.65%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0026522 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: C7J0A2 (DNA topoisomerase 3-alpha OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=TOP3A PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 254.2 bits (648), Expect = 4.4e-66 Identity = 118/149 (79.19%), Postives = 133/149 (89.26%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0026522 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A438IZK5 (Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon TNT 1-94 OS=Vitis vinifera OX=29760 GN=POLX_1704 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 724.5 bits (1869), Expect = 4.2e-205 Identity = 366/605 (60.50%), Postives = 439/605 (72.56%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0026522 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A438GDK0 (Copia protein OS=Vitis vinifera OX=29760 GN=GIP_418 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 724.2 bits (1868), Expect = 5.5e-205 Identity = 366/605 (60.50%), Postives = 439/605 (72.56%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0026522 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A438KPB7 (Copia protein OS=Vitis vinifera OX=29760 GN=GIP_387 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 723.4 bits (1866), Expect = 9.4e-205 Identity = 366/605 (60.50%), Postives = 439/605 (72.56%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0026522 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A438DHV4 (Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon TNT 1-94 OS=Vitis vinifera OX=29760 GN=POLX_19 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 723.4 bits (1866), Expect = 9.4e-205 Identity = 366/605 (60.50%), Postives = 439/605 (72.56%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0026522 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A438KCU4 (Copia protein OS=Vitis vinifera OX=29760 GN=GIP_373 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 723.4 bits (1866), Expect = 9.4e-205 Identity = 366/605 (60.50%), Postives = 439/605 (72.56%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0026522 vs. TAIR 10
Match: AT4G23160.1 (cysteine-rich RLK (RECEPTOR-like protein kinase) 8 ) HSP 1 Score: 401.7 bits (1031), Expect = 1.2e-111 Identity = 205/503 (40.76%), Postives = 304/503 (60.44%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0026522 vs. TAIR 10
Match: AT5G63920.1 (topoisomerase 3alpha ) HSP 1 Score: 252.3 bits (643), Expect = 1.2e-66 Identity = 118/147 (80.27%), Postives = 128/147 (87.07%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0026522 vs. TAIR 10
Match: ATMG00810.1 (DNA/RNA polymerases superfamily protein ) HSP 1 Score: 132.1 bits (331), Expect = 1.8e-30 Identity = 74/223 (33.18%), Postives = 114/223 (51.12%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0026522 vs. TAIR 10
Match: ATMG00820.1 (Reverse transcriptase (RNA-dependent DNA polymerase) ) HSP 1 Score: 104.8 bits (260), Expect = 3.0e-22 Identity = 51/116 (43.97%), Postives = 73/116 (62.93%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0026522 vs. TAIR 10
Match: AT2G32000.1 (DNA topoisomerase, type IA, core ) HSP 1 Score: 77.4 bits (189), Expect = 5.2e-14 Identity = 39/127 (30.71%), Postives = 69/127 (54.33%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (AG-4) v1
Date Performed: 2022-08-01 Position : 0 Zoom : x 1
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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