Lag0026150 (gene) Sponge gourd (AG‐4) v1

Overview
NameLag0026150
Typegene
OrganismLuffa acutangula (Sponge gourd (AG‐4) v1)
DescriptionUnknown protein
Locationchr10: 30791178 .. 30797398 (+)
RNA-Seq ExpressionLag0026150
SyntenyLag0026150
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide
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ATGGAAAACAAGCAAGCGAACAACACAGAGGAGCTGGTCGTCCTCATGCCAAGGCCGAGGCCGACCATCCAGAGGCCAAGGTCGAGTTCCGCCCCTAGAGGCCCAGGTACGAAGTTAGTTTCTCCTTACTCAAAAAATGCACGCCCAAGGTATTGAACGCATATTTTGAGTGGGGGGTTGGGAGTAAGGACAAACCGAGTCCATCATAATCATGGTCATGTTGCGATAATTCTGATTTTCCTTTCTTACTTATTCAAGTTAGGATAACGTTATGAATATCAGTGGAGCTATTGGGGCAATTACTTATTTTCATTTTGTATAACACATGTCCACAACTTTTCTCCATGGTACAATGTTGACACTTGCAAATTAGATAAAGTTCTTTATACTGTGTTTGTGCAAAAGCATTTTTCTATAGGATGTGGTGCATGTGGCTAGACAGGAATGATTCTTGTAGAGGCCAAACTTCCACACTTTCCCGTGGAAAGAGACTAAACTCTTGCAGAGAGGTTGACGCATGCCCTCAACCTCCCCAAGTTTTGCCCAAAAGAGTGTACGCACCCTCGGGATGGATACAACAGAGAAAAGTAGCAAGCAAAGCAGAAGAAATGCTCAGCCTCATGCCAAGGCCGAGGCCGAGCATCCTAGCTCCAAAGCCAACCCTCAGTACGCATTCACTTTTTAACATGGCCGAAATGCTCAAAGCCACAGGGAGATGCTTAAGGTAGGACCGGACAAATACACACATAAGCCTAACCGTGGAGCGGGCAAGAAAACAGCACGGAGGAGTTGGTCAGCCTCATGCCAAGGCCGAGGCCGACCAGTCACCTGCAAAAGCCCCGGATCTGGAATGAAGCGTTCCGAATGACCAAGTACAGGGGTTTAGCTGCTGTGCTCAGCCTCTTCCCGAGGCCGAGGCCGACCAGATAAGCTAAAGAGAGAGATTGATGTGCTCGGCCTCTTCCCGAGGCCGACCAGAGCCATTGTTGTAATCTCTCAACTCTACTTTGTCCAGTTTATCATATCTTGCAGGATAACCAGGAATCATACATAAGTCGGCATGGAACGAGAGTTATACTCTTAAATCAGGCTTAAGGAGCTCAACCCTGCAGGAGGTCAAGTGTTACTAGGCCGCACCAACGAGTCTATCTCACCACCTCCTCTGGCCCGAGCACCTCTTGCCGAGGCCAGGCACAAACTTTAATGGTATTCTCCTATTTCCTCAACCATACTTTATGTTTCAGTGAAGTTCTACTTAAGATTGGGGGCTACAGAGGGGATATGCACTCCCAATTAAACAAAAAGCAAGTAACCAGGGATATGCACTCCCTATTAAACAAAAAGCACCTATGTTTAACATGTTCTACTAAAATTTACATGTTCGAACCTATTCTCTTATTATTTTCCTACAAGGACTAACATATGGATGCAGGGAGTCAAATTTTAGGCTAACGGGGGCTTAAGGCCGAGGCCGACCCTAGCCTTTTCCCTAACTCTTCTCTTGCAGACATGAACCTGAAATGAAGCACTCCGAATGACCTAGTACGGGGGTCTCGCTGCCCGGTCAGCGAGTCGGGGTCCAGGGGCGAAGCGCCCGGTGGGGGTTCGGGGCAACGCCCCTAAGCAAAATTAGAAAAATGCTCGGCCTCTCCCGAGGCCGAGGCCGACCAGTACCATTTTTGCAATCCCTCACCTTTTTCATTTCCATTTCATCTAACCCCTAGTCAGGGAGCGTCTACTTCTATCCTATTTTGCAGGATGACAACAAAAGCTACACATAAGCCAATCCAAGGCAAGGGTCATTACTCTTAAATCGGGCTTAAGGAGCTCACCCAATAACACTAAGTCACACCTGAATCCCAATTCAAGAGTGGGGGCTTAATGTTATAGGTAATTTTGGACCACCACAGCGTACGAGGAGCTGACAGGACAACCGGGAGGAGATAGGACCAGGAAAGGGACCCAGAGGAAGACCATACCGACGGGCCGGGCCAACGTGGCCCAACCCGTACGGTCGGCCTCGGCCTTGGGCCGAGGCCGAGGCCGACCACTCGGCCCGTTTGCGCGGGCCGAGTCCGTTTGCCTCCGCTCGGCCCCTACCGCTTCCAGCTGCCTCGGTCCAGCCTGCTTCGTCCCAGAACGCCTCCAAACCCTAGGAGTCCGAGCAGGTATTTATACCCCTCTTCGCCATCGAAGAAGGGGGCCGGAAAACTCCATTCTTGACTTCTTTCTCTATTTTCTAGCTGCCCAGTTTCCTGACTTAGGCATCGGAGGCGGTGTGGCCTACACCACACCGGTGTCCAGCGATTCCTGCTGGTCTTGCAGGTCACGTCTTCCCCAGCTTCTACAAATTCATTGTTGGTGTCACGTGAAGGGCATGTGGATTGCTTGGCCAAATTTTGGCATCAACAGAAACGTAGCAAATTTGTAATTTAACCAAAACTATTGTTTCTCCTAAAATCACACATTAATAACATTTCAAAAAAGAAATCACACATTAAGAAATATCAACTCCAATTTACAATAACAAAAATCTTACCATTTTGTTAACAAAAAAATAAAATAAATAACAAAAACCTTACCATTCAATTAAAAAAATTGAAAAGAAGGAAGACAAAGGAAAGAAAATTAAATTTTGGGGGGAAGAGTTTTGGAAAATCCAAAGTGAAGAACGCAGAGATGCGCATGTGGGTATCCAAAAGATTGGAAGTGATTTGACAACACGAGAAGAAGTAGTGGCATCAAAAGAGGTAATCAGATTAAGACATTTGAACTGACCTTTCAAACCCCAAAAAAAACAAAAAAACAAAACAAAACCCTCTCTCTCCGTCTCAAACTGCAGGAGGGTATAATTCTAGGGTTAAATTTTTTAAACATTTGTATTATTATTATTTATTATTATTATATTAAAAGTGTGAGAAAGGCAAGGCACTGATTCTCACGTGGCGTATTTAAGTGTGAGGCAGCGATCAGTCTGTGAATCTGCTGTCTCTGGTAAAGATGTTGCGTACACAAGGCCCCAGTTGGTTGGTGATTGTAATGGGACTCTTCATTAAATTACACAGAGAGAAATGACTGAAGACAACACTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTCTCACATGTCTCGTCTCGTCTCTCTTTCAGGGTTTTGTTTCATTCCTTTTGCTGCCTTTCTGGATTTCCCTGTCCTCATTGCATGTGTTTTGTGCAATAACACGACTCGTTTAATTATCTAAACACTACACAGTCTTAACTGCAGTTAACAGCTTCCTTCGTCCGTTGGTTATTTCTATTTAATCAATCTAACACACAACACACAGACAGATGTTGCTTTCTGTGGTCTATATCACTACTTGCTAATTTCCAATGGGACTGCTTTTCTTGGGATTTTAACCATTATTATTTGTTGCTTTAATTTACTACCGTTTCTGTCTTTAACTAATTATTATTTATTTTCTTTTTATTAACTTTTTTTTTTTTTTTATAAAGACTTTTGTATAATCTCGAGTCATGAGTTTGTGTGTGATTTTTCCTTTTTTTTTAAAAAAAAAAAAAAATTATTTTGAGGGTGGAAGGGATGGGTGAAATGTTATGCTATCCAGGAAGTGGAATAGAAGGGTTTGAATGCTGAAACCTACTCCAAATATATATAAATATTGAGGAAGTGAAGAAGAAAGAACCATATGTCAACCAAGGCCAATTAGCAAAAAGAAAATGTAAATTTTATAGTTTTTTACTAATGACTAAATATATGTGTTTAGACTTGCAATGAAAATTAATGGTGTGTTTGTTTTAACTTTTCAAGTATTTAATTTTGAAAATAAACCATTTTGAAAAATTTTCTAGTGTTTGACAACCACTAAAAATGACTTATTACATAATGAGATTGATAAATAAACCATTTTGAGAGAAACACTTGAAACCAACTTTTTAAAAAAAAAAACTTTTTAAGTAAAAAATAACTCGTGTATAAAAACATTTGTGGGGAAATGCAAGCAAACATATGAGTGTTTAAATTCTAAACAATTTTTATAAAAATGTTTTTTAAAAAATGCATTCTTGAAAAACATTTAAATTAAAATGTATTCCAAACGGACCCTAAAATTGGTTGGAAATTGACAAAAGAAATTATAATAAGAAAAATATCTTAAGAGGAAAATTTTTCATTCCTTCAAACTTCTAAGAATAAATGGTCTCTTTAATAACAATTTTCTGCTCTAATTTATTTAAATTTACTAAGTTCTATGTCAAATAAGTTTATCATCTATCAATTTTAACATTTATGAACAATGAAATACACTAAATTGAGAAACTTTTAAACCATAGGGACTAAATTTAAAAATACTTAAACATTTTAGGGACTAAAACATATATGTAGCCATCTATTGATCCCTCCCACATTAACAAAATCAATCAACTCACTGTTACATCATCTTTCCGTTAGGGTTAGCTAATGATTATTAGTTGTATTCATGGGCTATTTACAACTATTTGATAAAACATATTAAAAAAAAAAAGAACAAAAAAACTATTTGCTAAACTTCAAGTACTAAAATGTCATTTTCGAAATTTCAAGGACAAAATTGAAACCCGAGTCAAACTTCAACCAACTCAGTTATAATATTTATCTACAAAAACAATACTTCTTAATGAAGAATTTTGCTTTCACACAATTCAATTCTCATTGTCATGATTGTTTGGCCTTGAACATCTCTTTACTTCTACTACATTTTCTATTTAATCGATTCTAATACAATTTTCCTCTAAAGTATTCTTGTTTCCCCTCACATTAGTCGTTTTTTTTAATCTCTACTTGGAATACCAATGTATAATACTAAGAATCACTAAAAACAATATTTAACACTTCTTATCTTAGACTATCACAATTCATCTTAGGAATGAAGGGATAGGGAGGCTAACCCCATAAAGTTCCAATGTAGCCGTTTTTTAAATTTTTTTATTATCATGATTTTTAAATTAGGTCTTAGTTGTCCTCTACATATATATAGTTGATCTCCAATCCAACTCGGTAATTAGTTTTTCATTTAAGTTGACTTAATTTTTTATTGTTCTTTTGTCTTCTCAAGATGGTTTATTAATTGAATGTCAATTTAACCTATTGATTTGTGGATGCTCTTTATTAAAAATATTAAAAAGAAAAAAAAAACTTTAATAAATTTTTTTTTCTATACTTGCTCTTGTACCATAGCTTAAGTCAAATGGACAAATTATATCTACCATATAATAATTCTTCGGGATATTTCAAATCACCACCTTGTCAAACGACATAAGAGAATTATTTTGTTCAACATTTGATCATGTATGGTTGCAAGTAATGATTAGATGTCACTTTTGACTTTGTATAATATTTTCAACCTATGGAGAAAAAATAAGATTTTTTCTTTTCCATTTTCTTGTGATAAATTTTGTGGGGTTATTAAGATATGATAACATATTATGCATCTTCTCAAAAAAATAAATTAATTAATTAAAATATTATGCTTTCTTCTCTTATGTCAATAGTTGAAATTCTATGATGTATGAGAGAAAATGAGTCATTCTTTCTTTAAAATGAGATTAGCAATGAGACATAAGTAGTTTCTTCAACAAAGATTTAATGAGAATAATTATTTCTTACCAACAAATTAAGACTAAAACTTCACCTTAATGAAAGGATTTGCTCCTGATTAAGTAGTCATTGATGGTCAAATGTTTCACAACTAAACTAAAGGTCATGATCATTAGACTAAGATAGTAACAACAATAAGTAGATTGTTTCCCAATTGAATGTATATATACTTGCTATGGTCAGAACCACTCTAATTATTAACACTCTAGAAGTCTTATGGATTGCTCCTCCATTTATATTTATTTCTATTTGTTGGGCCTTCTACAAATGTCTAAGCCCAAAAATGAGAGAATGTTAAAGTGTGGTTATAATTATACCCTAACTTGTTATAGCTAAAGTAAACTTTTGGATTGAGTGGTAATGTAACCCACATAACTAAATGTCTTTCGTGACTATCAGACTTGATTGAGATTTAGTAGGTTGCAGGTTGGAGTATTTAGGTAGGATATTCTGGTGTGTGGAGTGAGTTAATGTGTGTTTATTTTCCTGTGCTAATTTGCTGTAATTGGATTGTGAACTTTCAGGCCTAGAGTGCGAGGATGAGGGTTGGCTTGAGGCGGGAGTTAAGGCAGACGGGAGCAGAACTAGTTGTTAG

mRNA sequence

ATGGAAAACAAGCAAGCGAACAACACAGAGGAGCTGGTCGTCCTCATGCCAAGGCCGAGGCCGACCATCCAGAGGCCAAGGTCGAGTTCCGCCCCTAGAGGCCCAGGTACGAAGTTAGTTTCTCCTTACTCAAAAAATGCACGCCCAAGGAATGATTCTTGTAGAGGCCAAACTTCCACACTTTCCCGTGGAAAGAGACTAAACTCTTGCAGAGAGGTTGACGCATGCCCTCAACCTCCCCAAGTTTTGCCCAAAAGAGTGTACGCACCCTCGGGATGGATACAACAGAGAAAAGTAGCAAGCAAAGCAGAAGAAATGCTCAGCCTCATGCCAAGGCCGAGGCCGAGCATCCTAGCTCCAAAGCCAACCCTCAGTACGCATTCACTTTTTAACATGGCCGAAATGCTCAAAGCCACAGGGAGATGCTTAAGCACTCCGAATGACCTAGTACGGGGGTCTCGCTGCCCGGTCAGCGAGTCGGGGTCCAGGGGCGAAGCGCCCGGTGGGGCGTACGAGGAGCTGACAGGACAACCGGGAGGAGATAGGACCAGGAAAGGGACCCAGAGGAAGACCATACCGACGGGCCGGGCCAACGTGGCCCAACCCGTACGGTCGGCCTCGGCCTTGGGCCGAGGCCGAGGCCGACCACTCGGCCCGTTTGCGCGGGCCGAGTCCGTTTGCCTCCGCTCGGCCCCTACCGCTTCCAGCTGCCTCGGTCCAGCCTGCTTCGTCCCAGAACGCCTCCAAACCCTAGGAGTCCGAGCAGGTATTTATACCCCTCTTCGCCATCGAAGAAGGGGGCCGGAAAACTCCATTCTTGACTTCTTTCTCTATTTTCTAGCTGCCCAGTTTCCTGACTTAGGCATCGGAGGCGGTGTGGCCTACACCACACCGGTGTCCAGCGATTCCTGCTGGTCTTGCAGGTCACGTCTTCCCCAGCTTCTACAAATTCATTGTTGGTGTCACGTGAAGGGCATGTGGATTGCTTGGCCAAATTTTGGCATCAACAGAAACGTAGCAAATTTTGTGAGGCAGCGATCAGTCTGTGAATCTGCTGTCTCTGGTAAAGATGTTGCGTACACAAGGCCCCAGTTGGTTGGTGATTGCCTAGAGTGCGAGGATGAGGGTTGGCTTGAGGCGGGAGTTAAGGCAGACGGGAGCAGAACTAGTTGTTAG

Coding sequence (CDS)

ATGGAAAACAAGCAAGCGAACAACACAGAGGAGCTGGTCGTCCTCATGCCAAGGCCGAGGCCGACCATCCAGAGGCCAAGGTCGAGTTCCGCCCCTAGAGGCCCAGGTACGAAGTTAGTTTCTCCTTACTCAAAAAATGCACGCCCAAGGAATGATTCTTGTAGAGGCCAAACTTCCACACTTTCCCGTGGAAAGAGACTAAACTCTTGCAGAGAGGTTGACGCATGCCCTCAACCTCCCCAAGTTTTGCCCAAAAGAGTGTACGCACCCTCGGGATGGATACAACAGAGAAAAGTAGCAAGCAAAGCAGAAGAAATGCTCAGCCTCATGCCAAGGCCGAGGCCGAGCATCCTAGCTCCAAAGCCAACCCTCAGTACGCATTCACTTTTTAACATGGCCGAAATGCTCAAAGCCACAGGGAGATGCTTAAGCACTCCGAATGACCTAGTACGGGGGTCTCGCTGCCCGGTCAGCGAGTCGGGGTCCAGGGGCGAAGCGCCCGGTGGGGCGTACGAGGAGCTGACAGGACAACCGGGAGGAGATAGGACCAGGAAAGGGACCCAGAGGAAGACCATACCGACGGGCCGGGCCAACGTGGCCCAACCCGTACGGTCGGCCTCGGCCTTGGGCCGAGGCCGAGGCCGACCACTCGGCCCGTTTGCGCGGGCCGAGTCCGTTTGCCTCCGCTCGGCCCCTACCGCTTCCAGCTGCCTCGGTCCAGCCTGCTTCGTCCCAGAACGCCTCCAAACCCTAGGAGTCCGAGCAGGTATTTATACCCCTCTTCGCCATCGAAGAAGGGGGCCGGAAAACTCCATTCTTGACTTCTTTCTCTATTTTCTAGCTGCCCAGTTTCCTGACTTAGGCATCGGAGGCGGTGTGGCCTACACCACACCGGTGTCCAGCGATTCCTGCTGGTCTTGCAGGTCACGTCTTCCCCAGCTTCTACAAATTCATTGTTGGTGTCACGTGAAGGGCATGTGGATTGCTTGGCCAAATTTTGGCATCAACAGAAACGTAGCAAATTTTGTGAGGCAGCGATCAGTCTGTGAATCTGCTGTCTCTGGTAAAGATGTTGCGTACACAAGGCCCCAGTTGGTTGGTGATTGCCTAGAGTGCGAGGATGAGGGTTGGCTTGAGGCGGGAGTTAAGGCAGACGGGAGCAGAACTAGTTGTTAG

Protein sequence

MENKQANNTEELVVLMPRPRPTIQRPRSSSAPRGPGTKLVSPYSKNARPRNDSCRGQTSTLSRGKRLNSCREVDACPQPPQVLPKRVYAPSGWIQQRKVASKAEEMLSLMPRPRPSILAPKPTLSTHSLFNMAEMLKATGRCLSTPNDLVRGSRCPVSESGSRGEAPGGAYEELTGQPGGDRTRKGTQRKTIPTGRANVAQPVRSASALGRGRGRPLGPFARAESVCLRSAPTASSCLGPACFVPERLQTLGVRAGIYTPLRHRRRGPENSILDFFLYFLAAQFPDLGIGGGVAYTTPVSSDSCWSCRSRLPQLLQIHCWCHVKGMWIAWPNFGINRNVANFVRQRSVCESAVSGKDVAYTRPQLVGDCLECEDEGWLEAGVKADGSRTSC
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (AG-4) v1
Date Performed: 2022-08-01
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 44..61
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 1..61
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 152..214

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Lag0026150.1Lag0026150.1mRNA