Lag0022536 (gene) Sponge gourd (AG‐4) v1

Overview
NameLag0022536
Typegene
OrganismLuffa acutangula (Sponge gourd (AG‐4) v1)
DescriptionUnknown protein
Locationchr7: 32060773 .. 32067242 (-)
RNA-Seq ExpressionLag0022536
SyntenyLag0022536
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGCTGCGAAAACTTTTGCTCCAAGACAACTTGACGTCACAGCGTCTCGACGCTACCGACTTGTTCAGCAAGAAATTTCCAGCCCCTTTCCCTATAAAAAGCCCCCTCTCCCAAGGTGAAAATAATCCCAATTTGGGGGAGCTCTCCCCTAGCTCAATAGAGAGAAAAGTGAGAAGAATTATGGAGAAAAAGGTGGAATTGAGCGAGATTCCAAGGCTCAAGATTCGAGATGATCATAGCGGGAACTTGGGATCAACTTACCGGTTGTTTCTTCCTTACTTCTTTGTAATTTCTTATTTTAATTTGAGTTAGGCCTATGGATCAAGATCACTTGGGCAAAATTATTTCCATTTTGTGAGTAGATCTTGAGACCTAGGGTCGTTATTCTAGTTAATTGGATATTGTAGCGCAATTACTTGGAGTATGTAATGAATTTCTTCATATTTCATCTATGCAATTCTTGCTTAATGCCTTTAATCTCTTGATCACGGATTAATTGTTATGTTGGTCTAGATTGATACTCGACAGAGAGAAATTAGATTAGATCTTAATTGCATGGCTAACGATTGCTTGGAGCACGAGAGTGAAAGAGAATTGTTAGAAATTGATAATGAAGTTGCTTAATGTCATACTATGATTAACTAAGGAGATGGACACATAAATTAGTTATGTTAGTATGAGATGTGGAGGAACTTGAAAGAGAAATCCGCTTATAATTACTTCTAGATTTATGAAATTGAAGATTTTTAGTTATATGCATCCATGTAATTGAGCTACAAATTCAAGAAAGCTAGATAACACCCTAGGTCAAGCCCATTTAATTGGATATTTTCATTTTGTTATTGCATGTTTATTTTTATTAGTTTCTTTAATTTTCACTTCATCATTCGAATTGGAATTCTAAATAAAATTAAAACATGATGGTTCTTGGTTCTTAATGGGATTAATTCAATTTCCCTGAGGATTCGATACTCAGAATACTTTTCGTTTTATTTTACTTGCGGCCCGTGCACTTTGCGGTCAGTGAGCCGCACGTGATTGATTAAATGAGGTGGCGTTTTATGAATTAATCTCGGATCTAGGAAGCGTGGAGAGCCCTCCACGTGTAAAGTTTGACCTAATTAGGGTTGACTCCACTCTATAAAAGGAAGTAGCAGTCTCAAGTCAAGTCATTCGAGAGAGGAAAGTCTAATTCCATTTTGGGAGACTCACTTTCGATCTTTGGAAGTCGAATAAAGGAGGAACGATTAGAGACTTCAAGAAGACCATTAGCTACGGATTTATTCAAGGGAAATAATATTTTCTTGTAAAATTCTTGTAGTTATGGATGCACATACTCAGATTGTAGCGTGTGCTACCTTGTACTCCATGAACTAAATTTACTTAGGTGTTGGTTAGGATCTATGTAATTGTCGTACTTCATGCTCTATGCAATTGATATTGATTTGAGCATCTTGATTATTTGCAGTGTTTATTTCTATTTTGTGCCCGCCTGGCCAGTCGGTATGAATATCACCTCTTAGTTTTAGAAATGGTTTGAGAGGTGTGTGGCATTTAATCACACTAGACCATTATGTGTTGGTGGACGCCAGTAACTGAGTTAGGGATAACTAGTCACCTAGTGCTTGATCGGTAGTACGTCATTGGAGTTGAAACACATTCCAAAAAATTCAGAGTTCCGGGAGGATCCTGCTAATAAGGCCGCAAGAGAATTGTCTAATCAATATTATTGCTAGAGCATCTTTTTAAACAATTACAGAAATCTTAACCAACGCTTGTTTCCAATCTGTCTACTTTATCTGTTTACATTCTACTCTGTTATTTCTTTTGCTTCAGCATTATTCTAAAATCAATCAATTTAACAACCTTGAAACCATTAAAAAGTTACACAAGATAGGTAGAGTGAAAGCTATTCAAAACCTCATGGAGACGATAAATTACTTATCACTTTCTACAGATTGTGTATACTTGCACAGTATTCTAGAGCTTATTTTTATCATATTTTTAACCCAGTCTAGAAGGCAACAACTACCATCCCCATTTGTCTTTAGGCCAAATTCATCTTCTTGTATCCAACCTTCTTGTCCACTACAAGGCCAAGGTTATGAAACAGTTTAATCAAGTAAGATGTTCAATGCTAAGAATTACTATTGATAGTTCTCCAAACTAGCACATGGAAGCACTTCAAAAAGCCTTACCAAGCCATTTGTTCAGCATACATGATCTCTTTCAAGTTGAGCAACCTTGATTGACACATACAATCTCTTTCAAGTGTTGAAAGCATCGAAAAGAAAAGGAAAAGAAGAGAAAAAAAAACAAAAAAAAAAAGAAAAAGGAAAGAAAAATAATAGAAAAATAATAAGAAAAAAGAAAGAGAATGAAAGGCAATCAAGATCTGAGGATATCTATTGTTATATACTTTGAAAGCTTCCTTGACTGATAAATCTTTATTTCCTCTCATTAGACTCATGGGTAGCTTAATGCTTTTATTGTCAATGCAATACCAATTAAAAGTGTTCGATGTCTGGATGTCTAAAGCAATGACGATTATTCAATAGACTTTGATAGAAGAGAATCCGAAGTGCAGAGGGTTTAGTGGGAAGAACGTTGGAAAAGTTCACTCACAAGACGAATTGCTATGAGACGTGGGGAAGTCTTTAAACCAAGACCTCAAAGTGTTTTTGTTCATCGTTAGCGAAGCAGCCTGATTCACTTCGTCTATGTCTCAATCTATAGAGGCAGAGCACAAGAAATGAGTTATTTTATAGTTCTGGTTTTCAAAACTCGCTAATTTAAAAGTTTGTGTTTTTGAAACTTGTGCCTTGCACATTTTTGTGCTGCATGTAAATTTGCATCTCATGCATTTAAGCATACTCTACATTTTGAGATTCTACAACTCTATGGTCAAAGTAAAGTGTCGAAGAAAATTTGGCTGATTTTTTATGATTCACTTCTTGGTGGGTTAAATCGAACCCTGCTAGTCAGTAAAGGTCAAAGCCTAGTCAGAGTTAGGTCCATTTTCGTTTCCCTTTGGTTAAATCGAACCCTGCTAGTTAGTAGAGGTCGAAGCCTGGTTGGAGTCAGGTTCATTTCCTGTTTTATTAGGTTGGTTAAATCGAACCCTGCTAGTTAGTAGAGGTTGAAGCCTAATCAGAGTTAGGTCCATTTTTGTTTCCTTTTGGTTAAATCGAACCCTGCTAATCAGTAGAGGTCGAAGCCTAGTCAGAGTTAGGTTCATTTTCGTTTCCCTTTGGTTAAATCGAACCCTACTAGTTAGTAGAGGTCGAAGTCTAGTCAGAGTTAGGTCCATTTTCGCTTCCCTTGGGTTAAATTGAACCCTGCTAATCAGTAGAGGTCGAAGCCTAGTCAGAGTTAGGTTCATTTTCATTCCCCTTTGGTTAAATCAAACCCTGCTAGTTAGTAGAGGTCGAAGCTGGTTGGATTCAAGTTCATTTCTTGTTTTATTTGGTTGGTTAAATTGAACCCTACTAATTAATAGAGGTCGAAGCCTAGTCAGAGTTAGGTCCTTTTCCTTTTCCTTTTTCTTTTGGTTGAATCGAACCTTATCCTGTTTAGAGGTCGAAGCCTAATCAGAGTCAGGTTCATTTCCTGTTTCACTTGGTGGGTTAAATCGAACTTTGCTCGTTAGTAGAGGTCGAAGCTTAGCCAGAGTCAGGTTTATTCCCTTTTCTACTTGGTTAGGCGTGAAACCACATTTCTTTTATTTTAATTAAAAGCTTCGCCTCTCCAATACTTTGTCTTATTCCTTTGTCTACCCTTTCAATCCTTCAAGGATCCACAAAGGGGGGCAAACTGTAGACACCGTATTTAGTGCGGCTCAATTTTTAATAAAGTTTATAATTTCTCCAAATTAATCCCGAATTTGGGGCCTTGATCGGAATGTATTTTATTGTTATGTAATTCATTAGATTTTTATTATTATTATTATTATTTTATATAGTTTTGCTTATCTTTTTTTTCCTTTTCTTTCTATTTTATTTTATTTTACTATTCTTTGTTTTATTTTATTTTATTTTATTTTATTTATTTTTATCTCATTTATTTTTATTATTATTATTCTATTTATTCATTTATTTTATTCTTTTTTTATTGTATTTTTATCATATTTTTGGGGTTTTATTTTTTTATTTATATTTTATTTTATTTTACTTTATCATTATTATTATTTTCTTTTTCTCCCTTTTTCTTTTTCCTTCTCTTTCTTCTTCCTCTCCCTTCCCACACGTTTTCCTCTTCTCCCATTCAACCCTATTTCCCTATTCAAATGCCACCTTCATGAGAAGAGACTTAAAAGTCTCTCCACCATCTCCCCAATTTTGGCATCCCCTTCAAATATAAAAGGGGGGGGGGGGAGATGGAGGAGGATGAAGAGGGGACAACAAAGGAAAAAGGTGAAGGAGTAAAAGTGAGCTTGAAAGAGTGAAGAAATTTGAGAAAGAGCCTAGAGAGAGAAAGTGAGTTTGAGAGAGAAAAGTAGAGATTTTAGAAGGATTTTCAAAGATCTAAGCTCATTGTCGTACGCTACCGCCACTCACCGCCGCACACTGCCGCACCTCACCGTTGTCTGCCTGTTGATTCCGACGAGGTTCCTAAGTGAAGTTTAAGAGAAAAGAGGAGGAAAGGTGGAAGAGCTAAAAGGAGAAAAGAGGGAAGGAAAATAAAAAAAGAGAGAAGGAATCGTGAGGAAAAAGAAGAGGGTGAAAGAAAGAGAAAGAGTATGTGATGGGTGGGTCCCACCTTGTTTTGTCATTTCCCTTTTATTTTTATTTCTTTTTCATTTCTTTTTTATTTATGATTTGTTATTATTTATTATCATTAATGCTTTTATTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACTGAGTATTTTTTTTCTCCTTTGTTTGTTTTGTTTTTTTTTTTTCCCTTTCTTTAGTCTTGATTTACAATTTTCAATTAAAGTTCTAGTCTTGTTTAATTGGCCTAAAATTTGAAATTCATATTAAAATTTTGATTTGGAATTTTAAGTTGACTCATGAATCCCAAATTTTCATTTCGAATTATCTTTTAATTTGACATTATTGCCTAAACAAATCTTAAATTAGATTTTAATTTGGAGGGTTTATATGATTTTCATATTAGATTTTGATTTGTATGCTCAAACTAATGTCAAATTGAATTTAATTTGGAGTTTCAAATTAAATTACCTTTCACTTTCCAAGCTAATTTCATTTTTTTTTTTTTTTGGACAAAATGACAAGAGAGAAAAGAAAGAACATTGATTATTAAACTCTTAGCCTAAAGTTTTGAAGTTAGCCTAAAATTTTGTTTTGAAATTAATTTCAATTTACTTTGCTTTGGGAGTTTCCATTCAATTTCTTTTCAAAATTGAATTTCATTTCATAAAGTGAGATTGAGTTTAATTTGGAAATTGAATTGAATGTCAATTTTGGTTTTAAATTAAAATTTCAAAAAGGCTTTAAAATATTAGATAATGTTTTTCCTAATTGAATGGTTTTATCACTCATAATTGTTAATTTACATTTTGTTGTTAAAGTGTAAATTAATAAATATGAGACAAAATAATTCATGTAGAACCTATGATGAAGTTGAAATAATTTTCAAATTCTTGAGGTAAATAATTTCCTTTAACTTAGGAAATTCTACATGATAATAAAGCCATGGGTAACCCCACTCACAAAATTAAATCCTTACTTTATTTAAAGATAAGGTGAAATTAGTGAGACATTTAATTTTCATTTTTTTTAAAAAATTTGATTTATGTATTTTCATTAAGATATGGACCTTTGATTAATGAATTTGAGTAATAAATAAAATGTTTTCAGACGGGTGTTGTAGGGTGCTAATACCTTCTCTACACATAACTGACCCCCGAACCTAATTTTGGTTTCTAAGACCAATTTATTTTTTAAAATGGGTGACCAATCACACCCCAAGATGATTGGTAATGACTCCAAACCTTCAACCTCGAAAGAGATCCTTAGGAAAGGACGTCGACCGCTCCGCGTCGCGATGACGTTGCGGCACTCGTCGTTAAGTTGTCAATAGTCATAGAGATTCATGGAAATAATTGATGTCTTATTTGTTTGCACGTTTTTATAATGATGTGCAGAATGTGGACCAACTACTCATTTTTGTGAAGAAGAAACTATCCTCAAGACCAGAGCTATGCATCAACAAATTCACGATCATGCCACTTCCTCTTCTGGTATAACGTACTTGAAAAATTAATTACAGTTGTTCGAAGTTACACCTCTGTGTTTACGCTGATGTGTATTGGTTTCCAATAGGACTTCCTGAACTGTACCGAAGGCCTATACCCGGAGATAAAAGATAAGTCATTAGAAGACACTAAATCAAGCTGGCAACGTGAGCAGACATACTTGGACTACGCGCTAGGACTCGACAATGATTTTGCTCCTGCACGGGGGACGTCGACTTTCTGTACATGGTGA

mRNA sequence

ATGCTGCGAAAACTTTTGCTCCAAGACAACTTGACGTCACAGCGTCTCGACGCTACCGACTTGTTCAGCAAGAAATTTCCAGCCCCTTTCCCTATAAAAAGCCCCCTCTCCCAAGGTGAAAATAATCCCAATTTGGGGGAGCTCTCCCCTAGCTCAATAGAGAGAAAAGTGAGAAGAATTATGGAGAAAAAGGTGGAATTGAGCGAGATTCCAAGGCTCAAGATTCGAGATGATCATAGCGGGAACTTGGGATCAACTTACCGGTTGTTTCTTCCTTACTTCTTTTGTTTATTTCTATTTTGTGCCCGCCTGGCCAGTCGTCTAGAAGGCAACAACTACCATCCCCATTTGTCTTTAGGCCAAATTCATCTTCTTGTATCCAACCTTCTTGTCCACTACAAGGCCAAGGTTATGAAACAGTTTAATCAAAATGTGGACCAACTACTCATTTTTGTGAAGAAGAAACTATCCTCAAGACCAGAGCTATGCATCAACAAATTCACGATCATGCCACTTCCTCTTCTGGACTTCCTGAACTGTACCGAAGGCCTATACCCGGAGATAAAAGATAAGTCATTAGAAGACACTAAATCAAGCTGGCAACGTGAGCAGACATACTTGGACTACGCGCTAGGACTCGACAATGATTTTGCTCCTGCACGGGGGACGTCGACTTTCTGTACATGGTGA

Coding sequence (CDS)

ATGCTGCGAAAACTTTTGCTCCAAGACAACTTGACGTCACAGCGTCTCGACGCTACCGACTTGTTCAGCAAGAAATTTCCAGCCCCTTTCCCTATAAAAAGCCCCCTCTCCCAAGGTGAAAATAATCCCAATTTGGGGGAGCTCTCCCCTAGCTCAATAGAGAGAAAAGTGAGAAGAATTATGGAGAAAAAGGTGGAATTGAGCGAGATTCCAAGGCTCAAGATTCGAGATGATCATAGCGGGAACTTGGGATCAACTTACCGGTTGTTTCTTCCTTACTTCTTTTGTTTATTTCTATTTTGTGCCCGCCTGGCCAGTCGTCTAGAAGGCAACAACTACCATCCCCATTTGTCTTTAGGCCAAATTCATCTTCTTGTATCCAACCTTCTTGTCCACTACAAGGCCAAGGTTATGAAACAGTTTAATCAAAATGTGGACCAACTACTCATTTTTGTGAAGAAGAAACTATCCTCAAGACCAGAGCTATGCATCAACAAATTCACGATCATGCCACTTCCTCTTCTGGACTTCCTGAACTGTACCGAAGGCCTATACCCGGAGATAAAAGATAAGTCATTAGAAGACACTAAATCAAGCTGGCAACGTGAGCAGACATACTTGGACTACGCGCTAGGACTCGACAATGATTTTGCTCCTGCACGGGGGACGTCGACTTTCTGTACATGGTGA

Protein sequence

MLRKLLLQDNLTSQRLDATDLFSKKFPAPFPIKSPLSQGENNPNLGELSPSSIERKVRRIMEKKVELSEIPRLKIRDDHSGNLGSTYRLFLPYFFCLFLFCARLASRLEGNNYHPHLSLGQIHLLVSNLLVHYKAKVMKQFNQNVDQLLIFVKKKLSSRPELCINKFTIMPLPLLDFLNCTEGLYPEIKDKSLEDTKSSWQREQTYLDYALGLDNDFAPARGTSTFCTW
Homology
[Close]
BLAST of Lag0022536 vs. NCBI nr
Match: XP_038899753.1 (uncharacterized protein LOC120086987 [Benincasa hispida] >XP_038899754.1 uncharacterized protein LOC120086987 [Benincasa hispida])

HSP 1 Score: 58.9 bits (141), Expect = 6.5e-05
Identity = 24/63 (38.10%), Postives = 44/63 (69.84%), Query Frame = 0 

Query: 150 IFVKKKLSSRPELCINKFTIMPLPLLDFLNCTEGLYPEIKDKSLEDTKSSWQREQTYLDY 209
           IF+K+KL ++P++C++KFTI+ + +   LN   G++  IK+K+L +   +W+ E TY +Y
Sbjct: 47  IFMKEKLYTQPDMCMHKFTILSIGVTSHLNAHGGVFRRIKNKTLLEAALAWEDEDTYKNY 106

Query: 210 ALG 213
            +G
Sbjct: 107 VIG 109

The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Lag0022536 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
XP_038899753.16.5e-0538.10uncharacterized protein LOC120086987 [Benincasa hispida] >XP_038899754.1 unchara... [more]
BLAST of Lag0022536 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Lag0022536 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Lag0022536 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Lag0022536.1Lag0022536.1mRNA