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Lag0014602 (gene) Sponge gourd (AG‐4) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGACAACTCCTTGGCGGCAATGGATGATTCTCCTACCAATCCCGTCAAGGCCTTGGCTACCTTTCTAATTCGCCGCCACTCCGATCAGCTCCATTCCATTGCTCATTGCCCTGATCCAAAGCTCCATTATCCTTTATTCGTGGAGTAAGCAATGCCATGTCTCGTTCCTTTCCTTTCTCTTCTCATTCTTCTGTTTTCTCTTCTTCTCATGCGCCTTCGTCCTTACTATTAGATTCGCAGAGCTGATGGACGACGACCCACCTCTTGCTTGTCTTGTCTTCTCCCATCCGACCGAGTATTTGCGTATTTTTGACGATGCAGCTGTTTGGGCTCACGTATGTAATCTGATAGTTTTGCAAAGCTTAGTTATGCTCGCTTCGCGTGTTGTTGATGTTCGTTTTTCTGCTGCAGAAGATCATTTTGGGTGATTCGAAAGGTTGCATGAATGGAATTAGGAAAGATTTCATCCATGTTCGTATTAATGTCACTGGCTCCCCGCTGGAATGGCCTGGTTTGTTTCTGTTTCCGAGTTTTATTACTGTAGTGTTGAATAATCGTTAGTCAGTTGCTGGGGTTGGTTTAATTGAGTTCTTGTTGTTCGCGTTTTGCTTGGTTTTAGAGACTTTTCCAAGTATTGGGTCTGTCAGAGTGAAGCATCGTGGAGTGCTTCTCACACTTAAGGGGACGGTAATCAGGTCTGGGGCAATTAAGATGTATGAGGGGGAGAGGTGGTACATGTGCCGGAAATGCAAGCACAAGTGAGTTGAATTTTACTCAAGTTTCAGGCTTCGTTTGTATACGTATATACTTGCATGAAACGCATTCCGGGTTCAAGTTTTCACTGTGTAATGATTCGGTTCTACCATCGCCTACAAAATTTTGATCGACATTGTTGGGAATTAGAGAGTGCAACCAAAGTCACACATTAGCTAGACAAGGGGATGATCATGGGTTTATAAGAGAGGACAAGTATCTCTGTTGGTATGGGGCTTTTTGGATGGATCCAAAAGCAAAGCCATGAGGACTTATGTCCAAAGTGGACAATATCGTACCATTGTGGAGATCTGTGTTGTGTCCTCATCCTTAACAGAGTTCACCCCATACACATCTAGAATTTAGGAGCGAGGTTTGCACACTTTGGGTAGAAAAGCCAAGTAACAGACGTGGCTGCCTTGCTCAGATGAATAAATTAGATCATGATGGTAACAAAGGTCGCATCATGAGGGAGAAAAGGGCAAAAAGTTATTATCCTTTAGCAAGAGAAAAAAATTAAAACCTTCTTTGCTGAGGGGAAGTCTAATATGTCCTTAGACAGCTCCTTTCAACAATGTGGACTCTGACATGTACTTATCCAGTCCTCTCCAAAAAAACAGCCCAACAAGATACAAGCCTGATGGAAAAAGCCCCCATATCAACCATCAACATGGAGAGGTCTTTACGCATTATTTTTGAGGAAATTAGAAGGGAGCGGTCTCTTTTGTAGTTATAGTTATACTAATCTCATGTCCAGTTGGAAGAGGGGTGCAAAAACACCTTTTCAAGCATGGAATGATAATCTTTGTTACACGTCAAACACAACCCAAACAACTCCAAAACCTCATTCCACAACAAATGAGTAAATTGGCAGCCCCATAGAACATGATCTAAATTCTCCGACGCTTCTCTGCACTGAAACACCACCATTGTGACCTCAAAAGGAAGGAAAAATACATGATGTGTTCAAACTCATAATTCATCAGATACTTTTTATGAATGTCAACTAAGTATCAGAAGTAAATTACTCCCTGGTTATTCAATCATTTGATAACCAGAGTCATTCTTTGATAAATGATCACAACCCTGTCGTAGTTCTCAATCATTTCGTGGCACCGGATGTGACTGAACCATCTATGATGAGGGAGCGGATGCACCAGGAAGAAAGCTTACATAAGAGAATATATTCTCGCATCATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTAGAAAACTCGACCAACAAGAAAAAGTGTTTGGCTTAAGCCAAAAAGAGGTTGACCCACTTCATTCGCCAAGCGAACGATCTTTGTTTCGCAGGAACAACAAAAACAACCATCTACTAGGGGCTCATGTAGCCCATGTCGGATTAATCGTATTCTGGCTGGAGCAAAAAAGGGAAGGAGAAGTATCTTCTTCGGTGGATCCCTCTTGTTCCTGTTTAGTTCCCTTCGTTTCGAAAGTGGTTTCTATTTCTACATCTGTTTCTTCCTGTATAGTGTATACAATCTAAACTGTTGATTTTCCCGAGCAAAACTTGTCAAGATCTTCTTGGGGATCTTCACCTTCTAGAGAGAGTTGAACAAGGGAGATGGTTAGAGTCTTTGCTTCTAATTGGTCTGCCATTTCAAGTGATTATTGTAACTACTCTGTTCATATTTATCCCAATTAGGAAGCTTTTTTGTAGTCCCCTTGGCTTGATGGGGACCCCCTGTCTCCCTCTTTTGTACCCCTTTTTGGTAATGAAATTCTTGTTTCTTAGAAAAGAAATCTAAGTAGTAGTCATATGGTTACATAATGAAGAGAGATATTAATCTCAATATATGAAAAATGACTGAAAAGAAAAACATTTTCATAATGTTGAAATTGCATACATAGATAAATATCACAAACTACAACACTACGTAGAAGCATGCTCAACTTCACGATGTTGCATTAAGCTTAAATAACTACATAATTAAAGAAGTTACATATTGGCAGGTCGGGAGGGAGAGAGTAAAGAAGGGAGAGAGAAAAGAGTAATATGGAGAATATCGATATGAGATATTTCCTCAACACTGTTTGACTTTTTCTCAATATTTCTCAACATCTCATAATTCTCTCAACAACTCGCCATATTCGCTACATTTTAGAAAAATAATATTAATCCCTTGTTGAGATGTTGGACGTAAATGTTGCTAGCCATTTTAAACACCGCAAGCGAGTATGGCTGGGTATTAGATGGTAAGGTTACTGATAAGTACGAGAGATGAACCTGGCCTTTTTTGTTTTTCCTGTTTGGTTAAGTTTGGTTTTGTTTTGTTTTTCCTTTTTACTGTTTTCATTTGTAGTTGGCTTCTGAAGTACCTTCAGTTTTTGGTTTCAAAGTTTCCCCATCAATTAAAAAAATTCTTGTACAGTTTGAATATGATGTAAAATCATTCTGCAAAAATACAGTGTTACGTGGTATAACTGTTCTTTGTCATCGATGTTTTATATTTAATATGTAGCTGAAATCTGTTGGAACTCCCATTTACATGAAGTAAAAAGGATAACTTTTGTGATGATTCTATTGTATATTTTTATTCCTCAGAAATTTTGTATGTGGTATTGGATTTTAATCTTTACGATTAATATATCATTGTCCGCTTACTGAAGATAATCTAGCATGCCTATTTGTTACTCACCATTTCTAGATTATTCTTATTACTTTTACAGTTCTACTTTATTCTGTGAAGGTTCCCAGTTTATCCAGAGCTAGAAACTAGAAACTCAATACAGTTACCATCATTTTGCCCCTCTCAGGTACTTAGTTTTCTAATTCCACGTCATCTGTCATATTTTTATTAGTCAGACATCGCTATCAAATTATCTCTGGTTTCCCATACATTATGCATAGGAACCATAACCAACATGCTAGCATATTGCTCCAAATGGTTCTAATAAATACTCGGTATTATCAACATAAAGTTGGGGTTTGTAGATGTAATAAGCCACCTGCTATGAGGTGTCTCTCTTTCTATTAGTAGCCAGTGTGTGGGTTTACGAGAAACTTAATTACAGTGATAACTCAACCTATACATAAGGTACACGTACTAAAAGAGCTAAAATACATGATTCGGCAATGATTGTCCCAGAATTCCCAATCATTGCAATCATTGTATACCAGAAAATATTCTCTAGGCAATAATTACAGCAGGGGGTGTGACACATTACAGTTGCTCAGTGTTTGGAGGGAGGAAGAGAATAGCATTAAGTCCAATGACATCATTTAGCAACATGTTCTCCCATCCTCCTCAAACAAGGGTGTAGTTCAGTTACCTGATTTTGCTCTTGAGAAGCTAAAATTTTGAGCTTGGTGATGTCTTAGTGGGGCGATCAAATATCTGATTAATGGATTCAACATCATGAACTTCAATTTAATTATGTGAGACTTGATAGTAAATTACATGATTTAGCAACATGTTCTCCCATCCTCCTCAAACAAGGGTGTAGTTCAGTTACCTGATTTTGCTCTTGAGAAGCTAAAATCTTGAGCTTGGTGATGTCTTAGTGGGGCGATCAAATATCTGATTAATGGATTCAACATCATGAACTTCAATTTAATTATGTGAGACTTGATAGTAAATTACATGATTTGGAGAATAATAATATTATGTTATATTCAAATATGTACGGCCTAGGTTTTCTAATGTAGGAGAAGAGCGAAAAAATAAAGACAATAAGGACTAGACATTGACAACTAATATTTACACAAATAATGCTTCCCTTGGTTTAAAGATGTTTACCATAGTTACTTTGTCAATTAGTTTGTTGAATTCTTTGGAAGTGCCTTATTTAGTATATCGACAAATTGCTCAATTGTTGGAAGATAAAGAATACACATTGCACCTATGTCAATCTTTTCTTTAATAGAATCCTTGTCAAACGTTTTTTTTTTTTTTTTAATTATGTAGAATTGGATTATGAGTTATAGATATGACAACCTTATTGTCACAATAACCCTATAGAGGTGTAGTCTTAAAGAACCTCAATTCTTCAAGTATCCTTTCTATCCATATACCTTGGTAAACTCTATGGGCTAAGACTCTAGACTCGGCTTCACACTACTCCTAGCCACCACATTTTGTTTTCTTTTTTTGCTTTGCAAAGTAACTCCAACAAAGGAATAATAACCAAAAGTACATCTTCTATTAGTAGCACTTCCTTGCTCAGTAAGCATTATTGTAAGTTTCTACTCGGAAGTGATTGTT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BLAST of Lag0014602 vs. NCBI nr
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BLAST of Lag0014602 vs. NCBI nr
Match: XP_022971956.1 (probable DNA helicase MCM9 isoform X1 [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 1270.8 bits (3287), Expect = 0.0e+00 Identity = 632/664 (95.18%), Postives = 648/664 (97.59%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0014602 vs. NCBI nr
Match: XP_022952900.1 (probable DNA helicase MCM9 isoform X1 [Cucurbita moschata] >XP_022952901.1 probable DNA helicase MCM9 isoform X1 [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 1268.8 bits (3282), Expect = 0.0e+00 Identity = 632/665 (95.04%), Postives = 649/665 (97.59%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0014602 vs. NCBI nr
Match: XP_022971957.1 (probable DNA helicase MCM9 isoform X2 [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 1264.2 bits (3270), Expect = 0.0e+00 Identity = 631/664 (95.03%), Postives = 647/664 (97.44%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0014602 vs. NCBI nr
Match: XP_022952902.1 (probable DNA helicase MCM9 isoform X2 [Cucurbita moschata] >KAG6571851.1 putative DNA helicase MCM9, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 1262.3 bits (3265), Expect = 0.0e+00 Identity = 631/665 (94.89%), Postives = 648/665 (97.44%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0014602 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: F4IFF3 (Probable DNA helicase MCM9 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=MCM9 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 991.5 bits (2562), Expect = 4.6e-288 Identity = 498/639 (77.93%), Postives = 561/639 (87.79%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0014602 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: B8B406 (Probable DNA helicase MCM9 OS=Oryza sativa subsp. indica OX=39946 GN=MCM9 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 885.9 bits (2288), Expect = 2.7e-256 Identity = 451/636 (70.91%), Postives = 523/636 (82.23%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0014602 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q69QA6 (Probable DNA helicase MCM9 OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=MCM9 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 883.2 bits (2281), Expect = 1.8e-255 Identity = 450/636 (70.75%), Postives = 522/636 (82.08%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0014602 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: F1QDI9 (DNA helicase MCM9 OS=Danio rerio OX=7955 GN=mcm9 PE=3 SV=2) HSP 1 Score: 593.2 bits (1528), Expect = 3.7e-168 Identity = 323/642 (50.31%), Postives = 418/642 (65.11%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0014602 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: I0IUP4 (DNA helicase MCM9 OS=Gallus gallus OX=9031 GN=MCM9 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 585.9 bits (1509), Expect = 5.8e-166 Identity = 322/642 (50.16%), Postives = 422/642 (65.73%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0014602 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1I4M2 (DNA helicase OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111470623 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1270.8 bits (3287), Expect = 0.0e+00 Identity = 632/664 (95.18%), Postives = 648/664 (97.59%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0014602 vs. ExPASy TrEMBL
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BLAST of Lag0014602 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1I3C7 (DNA helicase OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111470623 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1264.2 bits (3270), Expect = 0.0e+00 Identity = 631/664 (95.03%), Postives = 647/664 (97.44%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0014602 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1GLN8 (DNA helicase OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111455445 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1262.3 bits (3265), Expect = 0.0e+00 Identity = 631/665 (94.89%), Postives = 648/665 (97.44%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0014602 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1CJH1 (DNA helicase OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111012180 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1251.9 bits (3238), Expect = 0.0e+00 Identity = 624/665 (93.83%), Postives = 639/665 (96.09%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0014602 vs. TAIR 10
Match: AT2G14050.1 (minichromosome maintenance 9 ) HSP 1 Score: 991.5 bits (2562), Expect = 3.3e-289 Identity = 498/639 (77.93%), Postives = 561/639 (87.79%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0014602 vs. TAIR 10
Match: AT1G44900.1 (minichromosome maintenance (MCM2/3/5) family protein ) HSP 1 Score: 266.2 bits (679), Expect = 7.3e-71 Identity = 196/592 (33.11%), Postives = 307/592 (51.86%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0014602 vs. TAIR 10
Match: AT1G44900.2 (minichromosome maintenance (MCM2/3/5) family protein ) HSP 1 Score: 266.2 bits (679), Expect = 7.3e-71 Identity = 196/592 (33.11%), Postives = 307/592 (51.86%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0014602 vs. TAIR 10
Match: AT3G09660.1 (minichromosome maintenance 8 ) HSP 1 Score: 256.9 bits (655), Expect = 4.4e-68 Identity = 197/590 (33.39%), Postives = 301/590 (51.02%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0014602 vs. TAIR 10
Match: AT2G16440.1 (Minichromosome maintenance (MCM2/3/5) family protein ) HSP 1 Score: 252.3 bits (643), Expect = 1.1e-66 Identity = 186/606 (30.69%), Postives = 299/606 (49.34%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (AG-4) v1
Date Performed: 2022-08-01 Position : 0 Zoom : x 1
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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