Lag0009357 (gene) Sponge gourd (AG‐4) v1

Overview


Name	Lag0009357
Type	gene
Organism	Luffa acutangula (Sponge gourd (AG‐4) v1)
Description	Unknown protein
Location	chr9: 38485361 .. 38487861 (+)
RNA-Seq Expression	Lag0009357
Synteny	Lag0009357

Sequences

The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide

Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.

ATGATGCTCCTAGCCCACACGAGCTTAAAAGGTGAGTGCAAAAAAATCTTGAACTACGTTATGACTTGATCCCTATTCCATAAGGGTACGTAGGCAGCTTAAAGAAAACTTTAAGTTCAGTCTCTATAAACAAAAAAAAAAAGGTTTTCGCTGCAGTTCCTTCTCTCCAAGTTCGAGGGTCCTTACACTGTACGCTATTGCGTTGTTCCTTCTCCAAGTTCGAAGGTTCTTCGTTGTATCCTGCTGCGTTGTTCCTTCTCCAAGTTCGAGGGTTCTCAGTTGTACACTGCTACGTTGTTCCTCCTCCAAGTGCGAAGGATCTTATGTGGTGCGTTGTTGCATTGTTCCTCTTCTCTCAAGTTCGATGGTTCTCACGCAGCTTTGCTGAGTTTCTTCTCCCCAAGTTCGAAGGTTCTCACGCGCTCCGTTGCAGTTCCTTCTTTCCAAGGTCGAAGGTTCTCACTCGCTGCGTTGCAGTTCTTTCTCCCCAAGTTCGAAGGTTCACGCACTTCGCTGCAGTTCCTTCTCCCAAATTCGAAGGTTCTCACGCGCTTCGCTGCAGTTCCTTCCTCCAAGTTCGAAGGTTCTCCGCTGCTGTAGTTCATTCTTCCAAGTTCGAAGGTTCTCACGTCGCTTCGCTGCAGTTCCTTCTCCAAGTTCGAAGGTTCTCACGTGCTTCGCTGCAGTTCCTTCTCTCCAAGGTCGAAGGTTCTCACGCGCTGCGTTGCAGCTCTTTCTCCCCAAGTTCGAAGGTTCACGCACTTCGCTGCAGTTCCTTCTCCCAAATTCGAAGGTTCTCACGCGCTTCGCACTGCAGTTCCTTCCCTCCAAGTTTGAAGGTTCTCACATCGCTTCGCTGCGATCCTTCCTCCAAGTTCGAAGGTTCTCACGCGCTTCGCTCTGCAATTCCTTCCCCCAAGTTCGAAGGTTCTCACGCGCTTCGTGCAGTTCCTTCCTCCAAATTCGAAGGTTCTCACGAGCTTCGTTGCATTTCCTTCCCCCCAAATTCGAAGGTTCTCACGCGCTTCGCTGCAACTCCTTCCTCCAAGTTGAAGGTTCTCACGCGCTTCGCTCTGCAATTCCTTCCCCAAGTTCGAAGGTTCTCACGCGCTTCGTGCAGTTCCTTCCTCCAAATTCGAAGGTTCTCACGCGCTTCGTTGCATTTCCTTCCCCCCAAATTCGAAGGTTCTCACGCGCTTCGCTGCAGTTCCTACCTCCAAGTTCGAGGTTCTCACGCGCTTCGCTGGAGTTCCTTCCTCCAAGTTCGAGGGTTCTCACGCGCTTCGCTGCAGTTCCTTCCTCCAAGTTCGAGGTTCTCACGCGCTTCACTGCAGTTCCTTCCCCCAAGTTCGAAGGTTCACGCACTTCGCTGCAGTTCCTTCTCCCAAATTCGAAGGTTCTCACGCGCTTCGCACTGCAGTTCCTTCCCTCCAAGTTTGAAGGTTCTCACATCGCTTCGCTGCGATCCTTCCTCCAAGTTCGAAGGTTCTCACGCGCTTCGCTCTGCAATTCCTTCCCCAAGTTCGAAGGTTCTCACGCGCTTCGTGCAGTTCCTTCCTCCAAATTCGAAGGTTCTCACGAGCTTCGTTGCATTTCCTTCCCCCAAATTCGAAGGTTCTCACGCGCTTCGCTGCAACTCCTTCCTCCAAGTTGAAGGTTCTCACGCGCTTCGCTCTGCAATTCCTTCCCCCAAGTTCGAAGGTTCTCACGCGCTTCGTGCAGTTCCTTCCTCCAAATTCGAAGGTTCTCACGCGCTTCGTTGCATTTCCTTCCCCCCAAATTCGAAGGTTCTCACGCGCTTCGCTGCAGTTCCTACCTCCAAGTTCGAGGTTCTCACGCGCTTCGCTGGAGTTCCTTCCTCCAAGTTCGAGGGTTCTCACGCGCTTCGCTGCAGTTCCTTCCTCCAAGTTCGAGGGTTCTCACGCGCTTCACTGCAGTTCCTTCCCCCCAAGTTCGAAGGTTCTCACGTCGCTTCGCTGCGCTCATGCGCTTTGCTACAGTTCCTTCCTCCAAGTTTGAAGGTTCTCACATCGCTTCGCTGCGATCCTTCCTCCAAGTTCGAAGGTTCTCACGCGCTTCGTGCAGTTCCTTCCTCCAAATTCGAAGGTTCTCATGCGCTTCGTTGCATTTCTTCCCCCAAATTCGAAGGTTCTCACGCGCTTCGCTGCAGCTCCTTCCTCCAAGTTCGAAGGTTCTCACGCGTTTCGCTCTGCAATTCCTTCCCCCAAGTTCGAAGGTTCTCACGCGCTTCATTGCAGTTCCTTCCTCCAAGTTCGAAGGTTCTCACGCGCTTCGTTGCAGTTCCTTCCTCCAAGTTCGAAGGTCCTCATGCTACGCTCGGTTGCACTGCTGTGCTACTTCCTAAAGTCCAAAGACGTCAATTGTCCTCACGCTGCGCTGCTTCCTTCTCCAAGTTCGAAGGTCCTCATGCTACGCTCGGCTACACTGCTGCGCTACTTCCTAAAGTCCAAAGACGTCAATTGTCCCTGCACTCATGCTGA

mRNA sequence

ATGATGCTCCTAGCCCACACGAGCTTAAAAGTTCCTTCTCTCCAAGTTCGAGGGTCCTTACACTGTACGCTATTGCGTTGTTCCTTCTCCAAGTTCGAAGGTTCTTCGTTGTATCCTGCTGCGTTGTTCCTTCTCCAAGTTCGAGGGTTCTCAGTTGTACACTGCTACGTTGTTCCTCCTCCAAGTGCGAAGGATCTTATGTGGTGCGTTGTTGCATTGTTCCTCTTCTCTCAAGTTCGATGGTTCTCACGCAGCTTTGCTGAGTTTCTTCTCCCCAAGTTCGAAGGTTCTCACGCGCTCCGTTGCAGTTCCTTCTTTCCAAGGTCGAAGGTTCTCACTCGCTGCGTTGCAGTTCTTTCTCCCCAAGTTCGAAGGTTCACGCACTTCGCTGCAGTTCCTTCTCCCAAATTCGAAGGTTCTCACGCGCTTCGCTGCAGTTCCTTCCTCCAAGTTCGAAGGTTCTCCGCTGCTGTAGTTCATTCTTCCAAGTTCGAAGGTTCTCACGTCGCTTCGCTGCAGTTCCTTCTCCAAGTTCGAAGGTTCTCACGTGCTTCGCTGCAGTTCCTTCTCTCCAAGGTCGAAGGTTCTCACGCGCTGCGTTGCAGCTCTTTCTCCCCAAGTTCGAAGGTTCACGCACTTCGCTGCAGTTCCTTCTCCCAAATTCGAAGGTTCTCACGCGCTTCGCACTGCAGTTCCTTCCCTCCAAGTTTGAAGGTTCTCACATCGCTTCGCTGCGATCCTTCCTCCAAGTTCGAAGGTTCTCACGCGCTTCGCTCTGCAATTCCTTCCCCCAAGTTCGAAGGTTCTCACGCGCTTCGTGCAGTTCCTTCCTCCAAATTCGAAGGTTCTCACGAGCTTCGTTGCATTTCCTTCCCCCCAAATTCGAAGGTTCTCACGCGCTTCGCTGCAACTCCTTCCTCCAAGTTGAAGGTTCTCACGCGCTTCGCTCTGCAATTCCTTCCCCAAGTTCGAAGGTTCTCACGCGCTTCGTGCAGTTCCTTCCTCCAAATTCGAAGGTTCTCACGCGCTTCGTTGCATTTCCTTCCCCCCAAATTCGAAGGTTCTCACGCGCTTCGCTGCAGTTCCTACCTCCAAGTTCGAGGTTCTCACGCGCTTCGCTGGAGTTCCTTCCTCCAAGTTCGAGGGTTCTCACGCGCTTCGCTGCAGTTCCTTCCTCCAAGTTCGAGGTTCTCACGCGCTTCACTGCAGTTCCTTCCCCCAAGTTCGAAGGTTCACGCACTTCGCTGCAGTTCCTTCTCCCAAATTCGAAGGTTCTCACGCGCTTCGCACTGCAGTTCCTTCCCTCCAAGTTTGAAGGTTCTCACATCGCTTCGCTGCGATCCTTCCTCCAAGTTCGAAGGTTCTCACGCGCTTCGCTCTGCAATTCCTTCCCCAAGTTCGAAGGTTCTCACGCGCTTCGTGCAGTTCCTTCCTCCAAATTCGAAGGTTCTCACGAGCTTCGTTGCATTTCCTTCCCCCAAATTCGAAGGTTCTCACGCGCTTCGCTGCAACTCCTTCCTCCAAGTTGAAGGTTCTCACGCGCTTCGCTCTGCAATTCCTTCCCCCAAGTTCGAAGGTTCTCACGCGCTTCGTGCAGTTCCTTCCTCCAAATTCGAAGGTTCTCACGCGCTTCGTTGCATTTCCTTCCCCCCAAATTCGAAGGTTCTCACGCGCTTCGCTGCAGTTCCTACCTCCAAGTTCGAGGTTCTCACGCGCTTCGCTGGAGTTCCTTCCTCCAAGTTCGAGGGTTCTCACGCGCTTCGCTGCAGTTCCTTCCTCCAAGTTCGAGGGTTCTCACGCGCTTCACTGCAGTTCCTTCCCCCCAAGTTCGAAGGTTCTCACGTCGCTTCGCTGCGCTCATGCGCTTTGCTACAGTTCCTTCCTCCAAGTTTGAAGGTTCTCACATCGCTTCGCTGCGATCCTTCCTCCAAGTTCGAAGGTTCTCACGCGCTTCGTGCAGTTCCTTCCTCCAAATTCGAAGGTTCTCATGCGCTTCGTTGCATTTCTTCCCCCAAATTCGAAGGTTCTCACGCGCTTCGCTGCAGCTCCTTCCTCCAAGTTCGAAGGTTCTCACGCGTTTCGCTCTGCAATTCCTTCCCCCAAGTTCGAAGGTTCTCACGCGCTTCATTGCAGTTCCTTCCTCCAAGTTCGAAGGTTCTCACGCGCTTCGTTGCAGTTCCTTCCTCCAAGTTCGAAGGTCCTCATGCTACGCTCGGTTGCACTGCTGTGCTACTTCCTAAAGTCCAAAGACGTCAATTGTCCTCACGCTGCGCTGCTTCCTTCTCCAAGTTCGAAGGTCCTCATGCTACGCTCGGCTACACTGCTGCGCTACTTCCTAAAGTCCAAAGACGTCAATTGTCCCTGCACTCATGCTGA

Coding sequence (CDS)

ATGATGCTCCTAGCCCACACGAGCTTAAAAGTTCCTTCTCTCCAAGTTCGAGGGTCCTTACACTGTACGCTATTGCGTTGTTCCTTCTCCAAGTTCGAAGGTTCTTCGTTGTATCCTGCTGCGTTGTTCCTTCTCCAAGTTCGAGGGTTCTCAGTTGTACACTGCTACGTTGTTCCTCCTCCAAGTGCGAAGGATCTTATGTGGTGCGTTGTTGCATTGTTCCTCTTCTCTCAAGTTCGATGGTTCTCACGCAGCTTTGCTGAGTTTCTTCTCCCCAAGTTCGAAGGTTCTCACGCGCTCCGTTGCAGTTCCTTCTTTCCAAGGTCGAAGGTTCTCACTCGCTGCGTTGCAGTTCTTTCTCCCCAAGTTCGAAGGTTCACGCACTTCGCTGCAGTTCCTTCTCCCAAATTCGAAGGTTCTCACGCGCTTCGCTGCAGTTCCTTCCTCCAAGTTCGAAGGTTCTCCGCTGCTGTAGTTCATTCTTCCAAGTTCGAAGGTTCTCACGTCGCTTCGCTGCAGTTCCTTCTCCAAGTTCGAAGGTTCTCACGTGCTTCGCTGCAGTTCCTTCTCTCCAAGGTCGAAGGTTCTCACGCGCTGCGTTGCAGCTCTTTCTCCCCAAGTTCGAAGGTTCACGCACTTCGCTGCAGTTCCTTCTCCCAAATTCGAAGGTTCTCACGCGCTTCGCACTGCAGTTCCTTCCCTCCAAGTTTGAAGGTTCTCACATCGCTTCGCTGCGATCCTTCCTCCAAGTTCGAAGGTTCTCACGCGCTTCGCTCTGCAATTCCTTCCCCCAAGTTCGAAGGTTCTCACGCGCTTCGTGCAGTTCCTTCCTCCAAATTCGAAGGTTCTCACGAGCTTCGTTGCATTTCCTTCCCCCCAAATTCGAAGGTTCTCACGCGCTTCGCTGCAACTCCTTCCTCCAAGTTGAAGGTTCTCACGCGCTTCGCTCTGCAATTCCTTCCCCAAGTTCGAAGGTTCTCACGCGCTTCGTGCAGTTCCTTCCTCCAAATTCGAAGGTTCTCACGCGCTTCGTTGCATTTCCTTCCCCCCAAATTCGAAGGTTCTCACGCGCTTCGCTGCAGTTCCTACCTCCAAGTTCGAGGTTCTCACGCGCTTCGCTGGAGTTCCTTCCTCCAAGTTCGAGGGTTCTCACGCGCTTCGCTGCAGTTCCTTCCTCCAAGTTCGAGGTTCTCACGCGCTTCACTGCAGTTCCTTCCCCCAAGTTCGAAGGTTCACGCACTTCGCTGCAGTTCCTTCTCCCAAATTCGAAGGTTCTCACGCGCTTCGCACTGCAGTTCCTTCCCTCCAAGTTTGAAGGTTCTCACATCGCTTCGCTGCGATCCTTCCTCCAAGTTCGAAGGTTCTCACGCGCTTCGCTCTGCAATTCCTTCCCCAAGTTCGAAGGTTCTCACGCGCTTCGTGCAGTTCCTTCCTCCAAATTCGAAGGTTCTCACGAGCTTCGTTGCATTTCCTTCCCCCAAATTCGAAGGTTCTCACGCGCTTCGCTGCAACTCCTTCCTCCAAGTTGAAGGTTCTCACGCGCTTCGCTCTGCAATTCCTTCCCCCAAGTTCGAAGGTTCTCACGCGCTTCGTGCAGTTCCTTCCTCCAAATTCGAAGGTTCTCACGCGCTTCGTTGCATTTCCTTCCCCCCAAATTCGAAGGTTCTCACGCGCTTCGCTGCAGTTCCTACCTCCAAGTTCGAGGTTCTCACGCGCTTCGCTGGAGTTCCTTCCTCCAAGTTCGAGGGTTCTCACGCGCTTCGCTGCAGTTCCTTCCTCCAAGTTCGAGGGTTCTCACGCGCTTCACTGCAGTTCCTTCCCCCCAAGTTCGAAGGTTCTCACGTCGCTTCGCTGCGCTCATGCGCTTTGCTACAGTTCCTTCCTCCAAGTTTGAAGGTTCTCACATCGCTTCGCTGCGATCCTTCCTCCAAGTTCGAAGGTTCTCACGCGCTTCGTGCAGTTCCTTCCTCCAAATTCGAAGGTTCTCATGCGCTTCGTTGCATTTCTTCCCCCAAATTCGAAGGTTCTCACGCGCTTCGCTGCAGCTCCTTCCTCCAAGTTCGAAGGTTCTCACGCGTTTCGCTCTGCAATTCCTTCCCCCAAGTTCGAAGGTTCTCACGCGCTTCATTGCAGTTCCTTCCTCCAAGTTCGAAGGTTCTCACGCGCTTCGTTGCAGTTCCTTCCTCCAAGTTCGAAGGTCCTCATGCTACGCTCGGTTGCACTGCTGTGCTACTTCCTAAAGTCCAAAGACGTCAATTGTCCTCACGCTGCGCTGCTTCCTTCTCCAAGTTCGAAGGTCCTCATGCTACGCTCGGCTACACTGCTGCGCTACTTCCTAAAGTCCAAAGACGTCAATTGTCCCTGCACTCATGCTGA

Protein sequence

MMLLAHTSLKVPSLQVRGSLHCTLLRCSFSKFEGSSLYPAALFLLQVRGFSVVHCYVVPPPSAKDLMWCVVALFLFSQVRWFSRSFAEFLLPKFEGSHALRCSSFFPRSKVLTRCVAVLSPQVRRFTHFAAVPSPKFEGSHALRCSSFLQVRRFSAAVVHSSKFEGSHVASLQFLLQVRRFSRASLQFLLSKVEGSHALRCSSFSPSSKVHALRCSSFSQIRRFSRASHCSSFPPSLKVLTSLRCDPSSKFEGSHALRSAIPSPKFEGSHALRAVPSSKFEGSHELRCISFPPNSKVLTRFAATPSSKLKVLTRFALQFLPQVRRFSRASCSSFLQIRRFSRASLHFLPPKFEGSHALRCSSYLQVRGSHALRWSSFLQVRGFSRASLQFLPPSSRFSRASLQFLPPSSKVHALRCSSFSQIRRFSRASHCSSFPPSLKVLTSLRCDPSSKFEGSHALRSAIPSPSSKVLTRFVQFLPPNSKVLTSFVAFPSPKFEGSHALRCNSFLQVEGSHALRSAIPSPKFEGSHALRAVPSSKFEGSHALRCISFPPNSKVLTRFAAVPTSKFEVLTRFAGVPSSKFEGSHALRCSSFLQVRGFSRASLQFLPPKFEGSHVASLRSCALLQFLPPSLKVLTSLRCDPSSKFEGSHALRAVPSSKFEGSHALRCISSPKFEGSHALRCSSFLQVRRFSRVSLCNSFPQVRRFSRASLQFLPPSSKVLTRFVAVPSSKFEGPHATLGCTAVLLPKVQRRQLSSRCAASFSKFEGPHATLGYTAALLPKVQRRQLSLHSC

Homology

[Close]

BLAST of Lag0009357 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6Q2XP57 (Uncharacterized protein OS=Esox lucius OX=8010 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 60.1 bits (144), Expect = 4.9e-05
Identity = 66/184 (35.87%), Postives = 71/184 (38.59%), Query Frame = 0


Query: 497 GSHALRCNSFLQVEGSHALRSAIPSPKFEGSHALRAVPSSKFEGSHALRCISFPPNSKVL 556
           GSHALR  S    EGSHALR        EGSHALR    +  EGSHALR           
Sbjct: 142 GSHALREGSHALREGSHALR--------EGSHALREGSHALREGSHALR----------- 201

Query: 557 TRFAAVPTSKFEVLTRFAGVPSSKFEGSHALRCSSFLQVRGFSRASLQFLPPKFEGSHVA 616
                                    EGSHALR                      EGSH  
Sbjct: 202 -------------------------EGSHALR----------------------EGSHAL 252

Query: 617 SLRSCALLQFLPPSLKVLTSLRCDPSSKFEGSHALRAVPSSKFEGSHALRCISSPKFEGS 676
              S AL +          +LR    +  EGSHALR    +  EGSHALR  S    EGS
Sbjct: 262 REGSHALRE-------GSHALREGSHALREGSHALREGSHALREGSHALREGSHALREGS 252

Query: 677 HALR 681
           HALR
Sbjct: 322 HALR 252

[Close]

BLAST of Lag0009357 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A4Z2J208 (Uncharacterized protein OS=Liparis tanakae OX=230148 GN=EYF80_006030 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 55.8 bits (133), Expect = 9.2e-04
Identity = 79/327 (24.16%), Postives = 126/327 (38.53%), Query Frame = 0


Query: 433  SFPPSLKVLTSLRCDPSSKFEGSH--------ALRSAIPSPSSKVLTRFVQFLPPNSKVL 492
            +FPP++   + L   P+  F  S         A   AI   SS++ T        +S++ 
Sbjct: 992  AFPPAILFSSRLAIPPTILFSSSRLAILFSRLATLPAILFSSSRLATLPAILFSSSSRLA 1051

Query: 493  T-----------SFVAFPSPKFEGSHALRCNSFLQVEGSHALRSAIPSPKFEGSHALRAV 552
            T                P+  F  S  L   S +    S  L + +P+  F  S  L  +
Sbjct: 1052 TLPAILFSSSSSRLAILPAILFSSSSRLAILSAILFSSSSRL-ATLPAILFSSSIRLAIL 1111

Query: 553  PSSKFEGSHALRCISFPPNSKVLTRFAAVPTSKFEVLTRFAGVPSSKFEGSHALRCSSFL 612
            P+  F  S  L  +   P     +R A +P   F   +R A + +  F  S  L     +
Sbjct: 1112 PAILFSSSSRLATL---PAILFSSRLATLPAILFSSSSRLATLSTILFSSSSELAILPAI 1171

Query: 613  QVRGFSRASLQFLPPKF--EGSHVASLRSCALLQF----LPPSLKVL-------TSLRCD 672
                FS + L FLP K+  +  H  S  +  +LQ     LP  ++++        SL+ +
Sbjct: 1172 ----FSSSGLAFLPAKYSRQAIHFTSRPATRILQLLHMELPKCIQMVYIIVTLGKSLQSN 1231

Query: 673  PSSKF-EGSHALRAVPSSKFEGSHALRCISSPKFEGSHALRCSSFLQVRRFSRVSLCNSF 727
            P  ++  GS +L   P+S          ISS          C  +  V R+  VS+C  +
Sbjct: 1232 PEQQWASGSSSLAITPNSS-----CSLAISSCSLAIKPIAICPRYPSVSRYPSVSICPRY 1291

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of Lag0009357 vs.


Match Name	E-value	Identity	Description

BLAST of Lag0009357 vs.


Match Name	E-value	Identity	Description

BLAST of Lag0009357 vs. ExPASy TrEMBL


Match Name	E-value	Identity	Description
A0A6Q2XP57	4.9e-05	35.87	Uncharacterized protein OS=Esox lucius OX=8010 PE=4 SV=1	[more]
A0A4Z2J208	9.2e-04	24.16	Uncharacterized protein OS=Liparis tanakae OX=230148 GN=EYF80_006030 PE=4 SV=1	[more]

BLAST of Lag0009357 vs. ExPASy TrEMBL


Match Name	E-value	Identity	Description

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:


Feature Name	Unique Name	Type
Lag0009357.1	Lag0009357.1	mRNA