IVF0022546 (gene) Melon (IVF77) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.GTCAATGAAAAAATGGTAAAGAAACAAAATTGAGGCAAAAAGAAGAAAAAGAAAAGAGAAAGGAAAACGTTACTGACGAGCAGAACAAGACGAGGAGGAGAAGAAGAGAGATAGAGGGAGTGGGGGCATGGACGCACTGAAGTACATCTGGGAAGGTGCAATTCCATTACAGATTCATCTCCATGAGTCTGAAGTCACCACCGTCCCTCCTCCACCACCTGCAATGGTAAGTCTCTGCTTTTCCCCTTCTGCTGCACTTCCCCTTTTCGATCTATCTGATTTCTTCAACCGATGAACATCATGGGTTCATTCTGTTCATTTATCTCTTTTTCTCTGAGAAATTTGAGTTTGGGTACAAGGGTTGTTAGTACTTCCTGCTTCTTGTGTTTTCAATTTGGTGTTTTGAACGAGGGATGCTTTTTATGTGTCTAATGTACGCCCAAGTAGAACTTTGATTGAGCTTAATCGAATTGAATTGCTTTTCATATGGGATTTTGTTTTTTGATCTACTTTAGGTCTTAGCTCCTCGGATTGGCTACCTGCCTCTGTTGGCTTCTCAGATTAAACCTTACTTCGGTAGCACGCTTCCTCCTGGAGTTGACACCATCTGGTTTGAGTACCAGGGTTTGCCCCTTAAATGGTACGCTCTTCTTTGCTCTTTTAAATTTCATCTTTTGCTAATAGTTTGTTGCAATTTTGTAGATTAGTTTTAACTTTCTTTAACAATCTGCCAATTGATTCTCTCTTTTGGGGAAGTACTTGTGGCTGTCTAACATAATTATTCATGCTACTTTTTTGCTTTTGATCCAATTCTTTCTCCCTCTCATTTGTATGTCTCACAAGATACATGGTGCACCATCTCACAAGGTACACTCTGTAGAAGAAGCTGAAAATTGAAACATGTTAAGTTAAGATTATTGTTATGTATTCTTTTTAGTAGGAAGGACTTCAGTTAATATAGAAACTGGAAAAAAGAAAATAAGATGTGATAGTTATCTCAACCTGGGCAAGTATGATTACAAACAGTCATCATTTAGAAGGGAAGAAGATGGTTGACACTCATGAAAAAGGAAAATGTAGAAGGGAAACAATATCACTGGTAAAGTAAAATAAATGAGAGGAAAGAAGAGCCTTCACCAATCCTAATGGGAATTATAAAAGGATTGGTAGCAACTTAGCGTATGTATATCTGTTTAAGAATGATTACAAAAGGCTTTGTTAAGTCTACAACATGAATATGCTGTTTAAAGGATGCAATCCCCAAGAAAGGGGGAAGTTTTCTCCAACCACTGGAAACACATTGATTCCATTTTAACCAAAGATTCCATAAAAATGTTGATCAAACTAATCCATACAGCATACAAAATTAGCCTTTTCCTTGGAGGTTGGTTTTGTAAGAGGTGAGCAGTCGAACTGGTTAACGCATATGCCCTGGATCAAGAAGTTTGAGGTTTCAATCCCTCCACCTGCACATGTTATTGAACTAAAAAAGGGGGCAGTGAAGATTGGAAATAATGTCTTTATCTCGTGGATGGGCCTAGCAAAAAACAGGTTGTACAAGTAACAAGATTACACATAGTGGAAACAAACTTGCAATGAACAAAAATGTGATATTGTTGTTTTGAGCTCCTCTTGCAAAGAGCAAACCAGTTAGGGGAGAGGATGCAAATTACTCTTCTGAATTTGTCATGGCTATTGGTGTTGTATAGACTATTTATGCCATTTACAAAATGAAAACCTCCCAATTGCCTTGCAAGAATCAGAATGTAATAAGTTCCTATTGACGTTTAGGTCTTGGGAAGAGACTTGCTCATTAAATATTCTGAAAGATCAAAAGTCCAAGATCGTGAATCTGGAAAACTAGAGGAGAATCCTTTCATACGTCACAAGGGAGAGAATCATTCTGCAAACATTAGTCTTTCTTGTGAACAAATTCCAAATCAAAAGTTTATTGACCAAATTTGGGTGACTGCGTTATTTGAATAAACGTAAAGGGAATAAAGTTCTGGGCAGAGGAAGCAAGGGAACCTCGTCAAGAGTCTTGATACATTCAACACTAAGAACTTTGGTTTAGGCTATCCTTTGCAATTCTTTGGTTGTGTGGACCTCCCGGCCATAACTTAAGGAAAATATCAGAAACGGATAATTTTATCAAGAGATCCAAGAATTCATTCTTATCATGGGTTGAAACACTCCACAAGTTTGGTAACTAAACTTGAATATCTCAAGATTTGCAATCTAGACACAAGGCTTGTACGGGGAGTTCACTCTCTAATATAAAAAACAATCAAAGATTCATCATCAGTGCTTTAGAAGAATATGACACTCCTTGAGTGTATATAGTCAATGGTGGAAAAAAAAGAGAATCTAAAAACCCTAGGTCTTGAAAATTCTTGAGGAGTTGTTTGGGAGGATGGAATGTAATCAAGATTATTGGGAATCTTAGGGATGTTGAAATGAGTGGGGAATTGAGGGAGGAACATGAATGGGATGATGAAGCTTCTACACGGTAGGAAAGAGTGTTGGATTGAAAACTATAGGAAGAGAATGAGTTTGGTATTACAAACAAGATCCAAAATGCTTTGAAATCTAAACCCATTACAAGCTCATTCCATTCCATCCTCCCAAACGTGCCCGAAATAATTTGGGGTGGTTCAAAATTTGTTGTAAGAATATGAATTTCAAAATAATTGAAAATTGTTCCATCTAACCTTCACTCCTAAAAATCATATAGTGTTAAAATAGCAAAATTTGAAACAAGCAAAATTCTTTTGGAAGGAGGCAAGGGACAATGGTGTAGGGGTGATGCTTAATAAGCCGCTGGTGGGCGTGCACCTAGGTGATTGTTGAGTAGCATGGGCGTTATGGGCAACATGGCTATCAACACACTATGCAAAGCAGGGCCATAAGGTAGGGTCCAAATGCACGGCATATGGTTGTGAGCGCATGTAGACTTGTGCTGATGGGGTTGGCTGTGTATGTGGGGTTCCTCCATGGATGCACGTTGATGGCTACATGAAGAAATTGCTAATGGGCTGTGGAAATCAGTCGTGCATACCCATGCACAAGTTGTCTGTGCAATGGGCCATGCAGATTTGTTGTTGGGCATTAATGGTGTGAGTGTGTGGATGGAAATGGACGGATGATTATTTAAATCAAAAAATGGACTGATGATTAAGTGGTGTGAGGAATTGAGCTTCCTCCTTAGAGTTTTTTGACGAGCTTACTTGAGCTTCTTGTGCAATGTCGTATTCAGCTTATTAGGTGGCTTCCAACTCTTAGGTCAGGTACATGCAATCTTGGATCTTCTTGGACTTGGTCCAGATTGTCATCACATCAGGTGGTGGCTCATAAAATGGTGCAAGACCATTTTCAAGAGAATGGATAACTCGGCAAGAGGTTAGCTTGTTTGTTTTTTAAATATCCTTCCAAGGGCATTGGAGTGCTTTGTTGTGTCATTCTGCCACTACCCCCCAGGAGAAGACCCAAATTTAGCTTCAATTATTTTCCTCGAAAGAGAGCATTTTTTTTGAGAGCATATAGCTGTGCCAACTACTAATAGACTAACACTCTTGAAATGACATAAAAAAAGTGAAGGATTCATTACAACAAGCTCTATAAACATCACTTCAATTAGAGCCACCAAAATAAATAAGCTCTCAAGATTTCAGAAAGTATTTTGAATCTTTCCTCTCCTTGAAAAACTATTTATCTATTTTTCTCAAGTCAAATATGTCTAATTGTGGGGGCAAAAAAGAAAACAAAAGGTAGTAATTCTTTAAGATCGTTGGGCTGTTTTCAATTATTATATTTTTCTGTTCTTAGTGGAGAAGCAGAATTTATAACTTATGATTTTCTAGATATTTGTTTCAAATTATCTATAATTTAGTAGGGGTGCAAGGGCAAATGGAAAAACCGATAAAACCGGGCGAAACCGTTGTTGGCTTGGTTTACTACCTGTTCGGTTTTCACATTTCAAAGAACTGTTTAAAATGGGTTGGTTTCAGTTTTGGAATTGAACAAGGATAATATAACCAAGCCGGCCGAACAACTATATCTATATTAAAAACAATTGTGTAAGCAACTTAAAGAGGCGGCTCTAGTGGCAACGTGTCTCAATTGAATGTTCTAGTGCACGAATTCAAGCTAGAATGAACGCAGAACTTCTATTTTGAATATGTTTAACACCCGAGTGCCACAAATTTCTTGACTTGCTTTGGGCTTGATCCAATAATACGTAATGGACTTGAATTGCATCATATATCCCTTCATGGGCTCGTGTTTGGAGAGACAATCGTCATTAATGATGTGAACCGAAACCGAACCGAGTAAACTGGTTTTCACCGGTTTGGAGCGGTACAGTTAATATTCCTACATGGTTCGGCACAGTTTTCTCATTCTCATTGTAATATATGGCAGTTCAGTTTTTGTTCGAGGCTAGAACCGAGCCGAACTGAACTGATTACAGGCCTATTATTTAGTACTATATCTGGAAGAACATAAGTGTTTAAGATGGTAATAAATAATACTTCAAGACCAGACTGTTATACAACTGAATTCTTTGAAAAGCATTGGAACATCCTTAAAAATGTATCAAAAGGGTGTTCCGAGACTTTCTTGAGAAAGCCATTATTGATGCCAACCTCAATCAGACTCATATTTGCTTGACTTCTAAAAAGATTGATGGGTTGGTGATTATTATAGATTGATCAGCCATACCACGTTTATACAAAATTAGTGCGCAAGTTATAACAGAAACTCTGAAGGGAGTTGTCCCCCATACACTCTGAAGGGAGTTGTCCCCCATACACTTTCCAAGAATAAATTTGCTTTTGTAGCTAATCGCCGAATCATTGATGCCTCCTTAATTGCTAATGAACTGATTGATCCCTACTTCCTTTCCAAGACTAAAGGTATGGTGAAAAGCTTGACATTGAGAAGGCATTTGATATGGCTGATTGGGAATTTTTTAACATCATGATTTTCAAAGGTTT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BLAST of IVF0022546 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9FFI2 (Autophagy protein 5 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=ATG5 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 441.0 bits (1133), Expect = 1.2e-122 Identity = 215/350 (61.43%), Postives = 264/350 (75.43%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0022546 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: A2X052 (Autophagy protein 5 OS=Oryza sativa subsp. indica OX=39946 GN=ATG5 PE=3 SV=2) HSP 1 Score: 380.6 bits (976), Expect = 2.0e-104 Identity = 187/359 (52.09%), Postives = 257/359 (71.59%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0022546 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q6ZGL4 (Autophagy protein 5 OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=ATG5 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 376.7 bits (966), Expect = 2.8e-103 Identity = 186/359 (51.81%), Postives = 256/359 (71.31%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0022546 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9H1Y0 (Autophagy protein 5 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ATG5 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 136.3 bits (342), Expect = 6.4e-31 Identity = 93/347 (26.80%), Postives = 149/347 (42.94%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0022546 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q3MQ24 (Autophagy protein 5 OS=Bos taurus OX=9913 GN=ATG5 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 135.2 bits (339), Expect = 1.4e-30 Identity = 92/347 (26.51%), Postives = 148/347 (42.65%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0022546 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7T773 (Autophagy protein 5 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold379G001340 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 720.3 bits (1858), Expect = 3.8e-204 Identity = 349/349 (100.00%), Postives = 349/349 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0022546 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3C294 (Autophagy protein 5 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103496203 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 720.3 bits (1858), Expect = 3.8e-204 Identity = 349/349 (100.00%), Postives = 349/349 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0022546 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3C2S2 (Autophagy protein 5 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103496203 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 638.3 bits (1645), Expect = 1.9e-179 Identity = 319/349 (91.40%), Postives = 319/349 (91.40%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0022546 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1F3F6 (Autophagy protein 5 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111442026 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 624.4 bits (1609), Expect = 2.9e-175 Identity = 301/351 (85.75%), Postives = 327/351 (93.16%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0022546 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1F9G3 (Autophagy protein 5 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111442026 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 620.9 bits (1600), Expect = 3.2e-174 Identity = 301/352 (85.51%), Postives = 327/352 (92.90%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0022546 vs. NCBI nr
Match: XP_008456193.1 (PREDICTED: autophagy protein 5 isoform X1 [Cucumis melo] >KAA0037219.1 autophagy protein 5 isoform X1 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 719 bits (1856), Expect = 7.71e-262 Identity = 349/349 (100.00%), Postives = 349/349 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0022546 vs. NCBI nr
Match: XP_004140815.1 (autophagy protein 5 isoform X2 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 680 bits (1754), Expect = 3.06e-246 Identity = 333/350 (95.14%), Postives = 338/350 (96.57%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0022546 vs. NCBI nr
Match: XP_031739164.1 (autophagy protein 5 isoform X1 [Cucumis sativus] >KAE8650491.1 hypothetical protein Csa_009525 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 674 bits (1740), Expect = 4.66e-244 Identity = 333/353 (94.33%), Postives = 338/353 (95.75%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0022546 vs. NCBI nr
Match: XP_038906800.1 (autophagy protein 5 isoform X2 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 659 bits (1699), Expect = 8.91e-238 Identity = 321/350 (91.71%), Postives = 332/350 (94.86%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0022546 vs. NCBI nr
Match: XP_038906792.1 (autophagy protein 5 isoform X1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 655 bits (1690), Expect = 2.18e-236 Identity = 321/351 (91.45%), Postives = 332/351 (94.59%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0022546 vs. TAIR 10
Match: AT5G17290.1 (autophagy protein Apg5 family ) HSP 1 Score: 441.0 bits (1133), Expect = 8.7e-124 Identity = 215/350 (61.43%), Postives = 264/350 (75.43%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Melon (IVF77) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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