
IVF0008903 (gene) Melon (IVF77) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.CGTTTCCCTTCCTCCGTCTGTCAAATCTCTTCCGTTTTGCTATCGGAATTTCAATAATTTTCATCTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTATACAACACTTGCAATTTCAGTTTTCTTTGCACTATCTTCGAAACAAAGAACCCATATTTGCCTCATCAAGATCTCCCTCGTTCTTCCTCTATCGAACCAACTCTCGATCAGATTGATAATTGTTCTTCGATTGCCATTTGCCCCCCTCTCCAGGCTAGGCAGTCACTGTCGTGAACAACAACTTCGAGTGAAATCATATTTTAACCTTCGTTTCTAAGATGGGTTGGGTTTAGGATACAGAATGATTACTGGGTTTCTGAATTCGGGGCTCCTCTGATTGTTCAGCCATGTGGTTTTCCTTCTGGAGATCCAGGGATCGATTCTCGTTAGAAGAACTCAGGTTTGGAACTGAATTTCAGATAATTTTGTTTGCTCTTACTATTTGTGTTATACTGGGGCACCATCAGTATGACTGTTAGCAACTCGGCATTGCAACAATTGCCCAACCGGAAAATTTTCGTGAAAACTGCTATTTCTTCAACCTTGTTGGGGTGAAAAGTGTGGAAAGTCTGTAATTTTGTTTCATTCTCTCTGTTGCCGCGGTACTTGCTTCAAGTTTCTAAGTGGCTAAAATTGCACTCCATGTTGCATAATTTCGACGATCTTTGTCTCTTATGATGTATTTATGTATTCTAAAAAACTTGATTATATCTCGGCTATTTGTTGTAAATTATTCTTATGCTTTATTCATGGAACAAATTGAGCTGTATATGACTCGGACTTTGCAGCTGCTTAGAGCGTTTGTTTTTCTGTAAGACTGCAACGCCGATCATATGGATCAAATACGGAATATTTGTCTTTTTTCAAACTTACTTGGTGTATTCTTCGGACTCCCTTGCGTGAGTTTATTTTTTCTGCTAGTTTGAGAATTAAGATTCCAAGGAAAGTTAAGTTCGTAACCTTGGTAACTTCTACATGGAAGAGCTAACAATGTAAAATGGATTGTGAAGAAAATGCCCTTGTTATTTTGTTCGCTTTATTGCATTCTCTGTTGAAAGAATACAGCAGAAAGGCCCAACCCACGACAACATCTTCCTGACAACTTACAAGCCCATCCAATGCACTAATAATACAGCCGTGAAGAACTTGCCAAGACAATGAGGGATTTTAGGAGGGAGTTGAGGAGGGGAAAGGATAGCATTTGGTGTGTTAGGAAGGCATTGGACTTGGGTGTTTAGGTATTAGAAATGTGGGGGGTTGAGAGATAAGATCTCATGTAATTTTGGTCTAGGTTTGGATATGATGAGAGTGCTAAGGAGGTGTCAACTTACTTGAGATGTTCGGTGCACTTGTTGATCCATAGGGCTTAAGGTATTGTCTTTTCATTGTAAATTTTATCTTTGTATTGTCTATTCATTTTCTTAATGGCTCATTTCCTTATTTCTTTTTAAATAAGAAATAAGACCTTGTAGGCGAAATGGCTCTAGTGATTCTATCATGAAGCCAACACCTTATGGCAAAAGGTTATTGGTAGTTAGTAAGTATGGGCCTCACCTTGGGAATGGACTGATGGTCAGTCCTAGGCACCTCCTAGAATTCGTGGAAAGATATCTCGTTTGAGTTCCATTCTTTTTCACAGTTTGTTCATTTGGTGGTGGGAGATGGGAGATATACTTATTTTTCAGAATATAAGTTGTTGAGTGATAGACCCCTTTGATATGTGTTTCCCCATTGATTTTAGTTTTCCTCTCTTAGGCATTGTTCTGTTGCATCTATCCTTTCTCTGCTGAAGTCTCACGTGTCTCCCTCTTTTGTTTTCCATTACCATTAACCAATAGTGAAATAATAGATGCCTTGGCGTTGTTAGCTGTGGTTGATGATTTTCATTTGAAGCCAAATAGAAGGGATACTCATCTTTGGCATCCTTCTTCGTTGTGTTAGAACTCTAATTCTCAAGAAGAATATTACTCTTTATTGAATCAATCTCTGTAGAAATGGAAGAATCGAGGAAATCTCAATTCTCTTGTACAATCTTTTCTGCACTTCTCTCTCTCAAGAAGATGTCAGAAAACTAACTCTCACACAGAAATTACATGCCTTTCCCGCCCAAAAGAAAACTATTTATACTGACCCCCCCTTACCGACCTATTTATATCCCACGTGTTCAATTAAAAAAATATCTATTTCTTCCTTCTACTATACACATGCTTAATAAGGGGTCTAACATTACTCCCCCCTTTCAAATTCACCTTGTCCTCAAGGTGAAAAGTTGGGTATTTTAATTGCATTTCATCATAGGATTCCCAAGTAGCTTCATGCTTAGGTAAGCCTTCCCAACTTACCAAAACTTCCCATTGTCCAGCCACAGTCTTTCGATACTCAACAGCCTCTTCCGGAATAGATTTCCACTCATAATTCTCATTAACAAACTGAATAGTTGGCTGTAAATTCTCATGCTGTCCAACTAACTTTCTCAACTGTGAAATGTGAAAAACAGGATGAATTTTTGAACTGTCCGGTAACTCAAGGCGATAAGCAATAGGTCCAACCTTCTCTACGATTTTATAAGGACCCATAAATCGGGGCGAAAGCTTTTCATTTCGTTTCCTCCACAGAGTAGCTTGTCGATAAGGACGAATACGCAGAAACACATAATCACCCACACAATATTCTACATTTGGCCTTTTACGATCCGCATACACTTTCATTTGCTCCTGTGCTAAGCGCAAATGTTCACACAAAGTAATCAGAACCGCATCCCTTTCCTGCAACATCTCCTCCGCAGTTGAATTCTTAGAAAGGGTACTTCCATAAGACATAATAGTAGGAGGTTGTCGACCATAAACAATCTGAAAAGGAGTCATCCCGATAGCCTGTTGGAAAGTGGTGTTATACCAATATTCCGCCCATGGAAGCCACCTCACCCACTCCTTAGGCTTCTCATTACAAAAGCACCATAAGTAGGTTTCCACTCCTCTGTTGACAACCTCAGTTTGGCCGTCAGATTGAGGATGATAGGCCATGTTTCTATTCAGTTTAGTGCCCGATAAACGAAACAGCTCAGTCCAGAAATGACTAAGGAAAATCTTGTCTCTATCCGACACTATGGACAAAGGAAAACCATGCAGCCTCTCTACATCTTTCACAAATAATTCTGCCACCAGCTTAGCAGTAAAAGGATGTTTAAGTGGAAGAAAATGTCCATATTTACTCAATCTATCCACCACGACCAGAATCACTTCAAATCCGCCAAATTTCGGAAGACCTTCCACAAAATCCATTGAAATATCTCTCCATATGGATTGAGGAATATATAACGGTACTAACAACCCGGCTGGAGACAAAGCTAATGATTTACTTCTTTGGGATGTTAAACACTCTTCACAGTGTTTTTTAACATCAGCCTTCATCCCATCCCAATACAGTTCACCGACTATTCTTTTATAGGTTCTTAAAAACCAGAATGTCCCCCAACCACTGAATTATGGAAAGTGTCTAAAATAGCTGGTATTAAGGAAGAATTCTTTAAAATCACTAGTCGATCCTTAAACATCAAAATTCCATTCTGTAAAGAATATTTGCTAACGGCTGGTTCCTCAAGTTGTTTAATTTCATCGACAATTTTCATGAACTTTGGATCTTGGAAAACCTCCTTTTTAATCACTTCCAAGTCTAAAGTTATCGGCACTGACAACCCAAATAGCTGTACTCCAGTCAGTTTTCTAGAGAGCGCATCAGCCGCTCTATTTTCAGCTCCCAGTTTATAAACAACCTCAAACGAATACCCCAAAAGTTTGGCTATCCATTTTTGATATTGGGGTTGAATTATCCTCTGATCTGGCAAAAACTTCAGCGCCTTCTGATCAGTTTTCACTTTAAATTTGCCTATCAACAAATAAGGTCGCCATCTTTGTACAACCATGAGCTCCCTTTCCTACACTGGCCGAACTCTGTCTCTCAATGCCAATGTATGGCTATAATATGCTATCGGCCTCTTATCTTGAACTAGAACTGCGCCAACCCCAAAACCAGATGCATCAGTTTCGATTTCAAACGGTTGGTTGAAATCTGGAAGAGCTAATATCGGCAAAGATAACATCGCAGTCTTCAGTTTGTCAAAGGCTATGGTTGCTTCTTCAGTCCATTTATACCCTCCTTTCTTTAACAACTGAGTTAAAGGAGCAGCAATAGCTCCATAATTGCGCACAAAACGGCGGTACTACCCCGTTAAACCCAAAAATCCTCTGATTTCTTTTATATTTGTGGGCTGCAGTCAATCTGTTATAGCTTTGATCTTCTCCGGATCCATTGCCACACCTTCACCAGAGATCACATGGCCCAAATACTCTATTTTTTTCTGAGTAAAATTACATTTCTTCTGATTTGCATATAACTCATGTTGCCGCAGAATTGACAATACTTTTCCCATATGCAAAACATGATCAGCCTCATTTTTACTATATATAGTATATCATCAAAGAATACTAATACGAGTTTTCTCAAAAATGGCTTGAAAATTGTATTCATCAAAGCTTGAAAAGTAGCCGTGCATTGGTTAGCCCAAATGGCATTACCAAAGATTCATAATGACCTTCGTGCGTTCTGAAAGCAGTTTTCTCTATATCCTCATCGGCCATTCTGATTTGATGATATCCGGACTTCAAATCAATCTTTGAAAACATAGATGCACCACAAAGTTCATCAAACAATTCTTCCATTACCGGAATGGGAAACTTGTCCGGAATAGTTGCATTATTGACTGCTCTATAATCAACACAAAAACGCCAACTACCATCCTTCTTCTTGACCAATAAAACAGGACTAGAATAAGGGCTGGTGCTAGGCCTTATTACCTCGGAATTAAGCATTTCTTTCACCAACTTCTCCATCTCTTCTTTTTGATGAAAACCATAGCGATACGGTTGTACATTGATGGGATTGGTTCCTTCCTTCATATG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BLAST of IVF0008903 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8W4P9 (Protein TRANSPARENT TESTA 9 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=TT9 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 1003.0 bits (2592), Expect = 2.0e-291 Identity = 538/849 (63.37%), Postives = 637/849 (75.03%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0008903 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q54GS1 (Protein CLEC16A homolog OS=Dictyostelium discoideum OX=44689 GN=DDB_G0289943 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 238.0 bits (606), Expect = 3.9e-61 Identity = 123/327 (37.61%), Postives = 212/327 (64.83%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0008903 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9VEV4 (Protein CLEC16A homolog OS=Drosophila melanogaster OX=7227 GN=ema PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 204.1 bits (518), Expect = 6.2e-51 Identity = 112/287 (39.02%), Postives = 184/287 (64.11%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0008903 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q2KHT3 (Protein CLEC16A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CLEC16A PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 194.1 bits (492), Expect = 6.4e-48 Identity = 118/324 (36.42%), Postives = 191/324 (58.95%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0008903 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q80U30 (Protein CLEC16A OS=Mus musculus OX=10090 GN=Clec16a PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 192.2 bits (487), Expect = 2.4e-47 Identity = 118/324 (36.42%), Postives = 189/324 (58.33%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0008903 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BQN1 (uncharacterized protein LOC103492441 isoform X4 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103492441 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1684.1 bits (4360), Expect = 0.0e+00 Identity = 856/858 (99.77%), Postives = 857/858 (99.88%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0008903 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BRC0 (uncharacterized protein LOC103492441 isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103492441 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1670.2 bits (4324), Expect = 0.0e+00 Identity = 856/883 (96.94%), Postives = 857/883 (97.06%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0008903 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BQN8 (uncharacterized protein LOC103492441 isoform X2 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103492441 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1663.3 bits (4306), Expect = 0.0e+00 Identity = 855/883 (96.83%), Postives = 856/883 (96.94%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0008903 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BRQ5 (uncharacterized protein LOC103492441 isoform X3 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103492441 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1659.4 bits (4296), Expect = 0.0e+00 Identity = 853/883 (96.60%), Postives = 854/883 (96.72%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0008903 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0LKC6 (FPL domain-containing protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_2G061590 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1635.5 bits (4234), Expect = 0.0e+00 Identity = 831/858 (96.85%), Postives = 842/858 (98.14%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0008903 vs. NCBI nr
Match: XP_008451065.1 (PREDICTED: uncharacterized protein LOC103492441 isoform X4 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1678 bits (4346), Expect = 0.0 Identity = 856/858 (99.77%), Postives = 857/858 (99.88%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0008903 vs. NCBI nr
Match: XP_008451037.1 (PREDICTED: uncharacterized protein LOC103492441 isoform X1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1664 bits (4310), Expect = 0.0 Identity = 856/883 (96.94%), Postives = 857/883 (97.06%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0008903 vs. NCBI nr
Match: XP_008451046.1 (PREDICTED: uncharacterized protein LOC103492441 isoform X2 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1658 bits (4293), Expect = 0.0 Identity = 855/883 (96.83%), Postives = 856/883 (96.94%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0008903 vs. NCBI nr
Match: XP_008451054.1 (PREDICTED: uncharacterized protein LOC103492441 isoform X3 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1654 bits (4283), Expect = 0.0 Identity = 853/883 (96.60%), Postives = 854/883 (96.72%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0008903 vs. NCBI nr
Match: XP_004149506.1 (protein TRANSPARENT TESTA 9 isoform X1 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1630 bits (4220), Expect = 0.0 Identity = 831/858 (96.85%), Postives = 842/858 (98.14%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0008903 vs. TAIR 10
Match: AT3G28430.1 (unknown protein; FUNCTIONS IN: molecular_function unknown; INVOLVED IN: biological_process unknown; LOCATED IN: mitochondrion; EXPRESSED IN: 17 plant structures; EXPRESSED DURING: 6 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein of unknown function FPL (InterPro:IPR019155); Has 243 Blast hits to 233 proteins in 101 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 110; Fungi - 0; Plants - 53; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 80 (source: NCBI BLink). ) HSP 1 Score: 1003.0 bits (2592), Expect = 1.4e-292 Identity = 538/849 (63.37%), Postives = 637/849 (75.03%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Melon (IVF77) v1
Date Performed: 2021-10-25 Position : 0 Zoom : x 1
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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