IVF0007919 (gene) Melon (IVF77) v1

Overview
NameIVF0007919
Typegene
OrganismCucumis melo L. ssp. agrestis cv. IVF77 (Melon (IVF77) v1)
DescriptionUnknown protein
Locationchr03: 22105921 .. 22108737 (-)
RNA-Seq ExpressionIVF0007919
SyntenyIVF0007919
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGACATCGCCTACCAAAGGTTGGTTGCAACGATGTGCTCCCTACCTTCTCTTGTTTTTTTTATGTTCAGGGAAAAAAAAGTGGTTGTTAGACAAAGGCCTACACATCGGGTATTATTGGGACCAAGGGAACCGGCCCGTTATCCTTCCACCGACAGAAGCGGGGGGTAACGCTGCTCTGTGAGACCAGCCTCACGCGGTGTCCCCCACTTTAAGGGCAATTAACTCTCGGCCTTCGCCCAAAGCCAAAGGCCCAACTTCCTACTTGGAATGGGCGGGCTAGTACGTCTTCCCAAAGAGACCCTACCAAATGGGTTGAGCCCGCTTCCAACCACATTAATGCCTCCATTTGGATTACAAGCTCACATTACCGAGCTCGGCGATAAAGGGCGGTCGGATGCGTCTTTATTAAAGAAACTCTACATCATCCTTCTAGCGATGTGGGATTCTTTGTGTTGAGACAATAATATAGACTCACAACTTTGGTTTGTATACTCTCTATTCTCCTATTGTGTTCGTGAGTCAAATGTGTTAATGGTTTTCATATATAAATATATATGTTGGGATAATTTTAGTATGTTCCAATTTAATCTTTTTTATGGTATTTCAAATAGATTTTTTTTTTTATTTTGTGCTTATTTCAAATTTATCCAAGAAAGTTTCTTAAATTTTACAATTCATGTCTTGAGTTGCATGCTAAAAACATTCAAGTTGATTGACCATCCTATCTCGTGAAGTGTTCGAATTCGAAGCCAAAAAACTTGTCTTTTGCCTCATGGTATTTGATATTAGGAAATATCTGTTTAACCAAATTTTTAGATATTTTCATTATACTTTTAACAGTTTTAGATTTGTAACTTTCTTCTTAAATTTCCTAAAATTATAATATACTTCATATCTAGATTTTGGCTTAATTATCGGACAAACTTATCTTCAATACTCGTTTTCTTTCCTATTAAAAATTTTAAAATTCTTATCATTTATTTTTTTGAAAAAAATCAATAGGGCATTATTTAAATATTAAAAATATTTGAATTAACAATTAATACTGTATATATGCAATTCATATTTGAGATTTGACTTTATACAGTATTTATTCATTCAATCGCCATTCTCTATTGTTGGATTCTACAATTTATATTAGCATTATATAAATTAGAAAATTAAAATCTCTTTGAGTCACATCATTTTGAAAAATTTGAAGAAAAGTATTTAAGCCATACGATTTTTATTTTTTCTACGATATTTGTATTTTTCTATTTTTTAATAAATAGACTATAAATAAATAGGATGTTATAGACTTTTTAGACCTGATTTTTATGTAATAGGATAACATATTAGACTATTCATAAAAAGACGACTATAACTAGGGGAAAAATTTAAAAACCGATCCTAACTAGAGGACTAAGTATCCTTTAAACATGCACATCTAAATCACACTGATCGGCAACCCTAATTTCCATAGTAGTCGTGCAGACGAACATTTATGTAGACTATCATTTTTCTAAACAACAACGTAACGACATTTTTCTAAACAACAACGTAACGACATTTCATAAAATCTAACAACTCAAATAAATTTATCACTGTATTAACAATAAGATATTTTTAATTTAAAATTACATTCTCAATGAGATATTAAGCCATTAAACACAAAGTTTGATAGTTGGTTCGTTCATATTTAGTAAGAAAAAAGTCCGAACCTAATCTTTTCCTCAACAAGCTTTATTCTTAATCTTACCTTATGCTAAACTCAAATTACTTAATCCAAGAAGAAACTGTATGAAACCTAATTTCTTATCTTTTTATTAGTTATAATGTTAGCAAACATGAGCATGAATTTAATGTTAACTTAATAAAGAATTGAATAAGGAGAGAGACATTTTAAATTATATTTGCATATCTCATATGTTACCCTAAGAAAATTAATTTTATAATTTTATATCAACTCCAACAATAATAATAATTATAAATAAAGATGGGGCTTTCATTTTTTTTTAGTAAGTTTGACATTGTTCTATGGAAGCAAAGGGATCCCCAGGCATCAAAGCTTTAGAATGGACGATTTTGGAGCAGCTGCAGCTGAGTTTCCTGGCTTTCAAATCAATGTTGCTCAAAACAACCTTCTCCTGTTGAAAAAACAATAAGGGTGCGTTTGGAGGAGGGAAAGAGTTAGGGGGAAAAGGATTATAATAATTCTAGGATTATGATAATATGTGTTTGGGGGAAAGAATATAAAAGGAAGTATTATAATAGTATGTGTTTGGGAGAGAGATTATGATAGTAGTGTTATAGTAATATGTGTTTAGGGGAAGGATTATGATTGTAGTAATTTAAAAAATAATAATAGAATTTAGATTGGGTTATTTAGGCAGTGTAATATAGGGTTGTAAGAAAGTAAAAATAGGATAAGATAGAGTTATTTAGGGATTAAAATTATTTATCATATTTCTTGGGTCAAGGCCCAATTTCCTAATCCTTTTCCCTCTAAAACCCCACCCAAACATGCCATAATTGTGATTTTTCTTCAACATCAAATACATCTCTTCATTCTACAGATCTGATCCATTACTTTCATCCCTTTTACCAATCTCGAAATAACTTGTAATTCTTGTATAAATTGGAAATTAAAACTTTCGCTTATTCTGTTGAATTTTTTTTGTTTGTGTGGATGGGAGGAAAAAGTGGTTGTCAGTCAGAGGCCTACCTATCGGGTATTATTGGGCCCAAGGGAACCGGCCCGTTATCCTTCCACCGACAGAAGCGGGGGGTAACGCTGCTCTGTGAGACCAGCCTCACGCGGTGTCCCCCACTTTAA

mRNA sequence

ATGACATCGCCTACCAAAGGTTGGTTGCAACGATGTGCTCCCTACCTTCTCTTGTTTTTTTTATGTTCAGGGAAAAAAAAGTGTGGTTGTCAGTCAGAGGCCTACCTATCGGGTATTATTGGGCCCAAGGGAACCGGCCCGTTATCCTTCCACCGACAGAAGCGGGGGGTAACGCTGCTCTGTGAGACCAGCCTCACGCGGTGTCCCCCACTTTAA

Coding sequence (CDS)

ATGACATCGCCTACCAAAGGTTGGTTGCAACGATGTGCTCCCTACCTTCTCTTGTTTTTTTTATGTTCAGGGAAAAAAAAGTGTGGTTGTCAGTCAGAGGCCTACCTATCGGGTATTATTGGGCCCAAGGGAACCGGCCCGTTATCCTTCCACCGACAGAAGCGGGGGGTAACGCTGCTCTGTGAGACCAGCCTCACGCGGTGTCCCCCACTTTAA

Protein sequence

MTSPTKGWLQRCAPYLLLFFLCSGKKKCGCQSEAYLSGIIGPKGTGPLSFHRQKRGVTLLCETSLTRCPPL
Homology
[Close]
BLAST of IVF0007919 vs. NCBI nr
Match: KAG7016110.1 (UDP-glycosyltransferase 83A1, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma])

HSP 1 Score: 55.8 bits (133), Expect = 6.38e-07
Identity = 25/34 (73.53%), Postives = 28/34 (82.35%), Query Frame = 0 

Query: 37  SGIIGPKGTGPLSFHRQKRGVTLLCETSLTRCPP 70
           S I GP G+  LSFHR+KRGVTL CETSLT+CPP
Sbjct: 231 SVIEGPPGSSLLSFHRRKRGVTLFCETSLTQCPP 264

The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of IVF0007919 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of IVF0007919 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of IVF0007919 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
KAG7016110.16.38e-0773.53UDP-glycosyltransferase 83A1, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperm... [more]
BLAST of IVF0007919 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
IVF0007919.1IVF0007919.1mRNA