IVF0003040 (gene) Melon (IVF77) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: five_prime_UTRexonCDSpolypeptidethree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.AAACAGCCCAAAGGGTTTAGGTTTGCGCGCAACGACAGTACCAAAATCCCACTGTTGCTAGTCCACAGGTTCCTTCGTCATAGCCATTGTCCTCTTCTTTCTCCGAATCAGTTCGTCAGTTTTTGAAGAAGTAATAGGAGCAAATATCAGAGTTGAGTAAATGTGGTATCTCTGTGTGTTCTATCACCGTCTTTTGGATTACCGGAAGACCGAGGTCGAGTCTCTGGCCGAGTTGTTTGGTGAAAATGGCGACCACAAAGGGAAGAAGTTGGAGTGGAAGCTTCCTCTTCACCATCACCCCGATTCTCCTTTCCATTTCGTTGACCTCTCTTCAGACGATATCGCTCGGAGCATTGCTAATCGAAGTCAGCCATCTCGTTTCGTTTTTGGTTTTTGTCTTAATTGGTTCCAATTTCTTTCATTTAGTTTGGTTTGGTTTGGTTTTGGGTAGGTATACTAGTGAAGGGGATGTATGAACTCTGGGGTCAAGGAAGTGACTACGAGGAGCTAGAGGAGTCTATTAGAAATTTTCCGGAAGAACGGAAGTTCCCATACTTACAACCCGGAAGCTCTTTCAAGATTTCTGTAGAGAGCTTTGGGAAGGCTATCAGCTTCCAGGAACAAAATGAACGTATTCAGGGGCTAGCATACATCCCTTTCAAGGTATGGTAGTTTTGTAATATAGTTTATACTCCCTTGTATTAATTAATTTATTTATTTTTGAGCAATTGAAATCCAATTGTTTTGCTTATTATGGATACTAGAGACTATATCGTTATAGTTTGGAATGCATACTTCAGTGGATGGAATCAAATTAATGTGTTAAAACTCTTATAATGTGGACAGACTATTTGAGCTTGAAGAGTCTTGAAGAGTTTGTTTAAGTGATGAATCAAAGCCAATCAGGCTAGAAATTATCAATTCTGGTACCACTCATTTTTTAGGTAAAGAATTGATAGATAAAACAAAATTGCAAAGCAATTTGTGAATTGTAGCTCTTGACAAGCTATAAGCACCGAGAATAAATTGAAGTATTATGGCCAAATCATATTTTTTCGTTAATGGCAGCTAGGGTTTCATTGTTTCTTTGCTCTGATACTATATTCAAAAGAAGGAAGAAGAGAAAACACAAGGTATATGAGAAAAACCCTAGTATAGGGAGAAGAAACCATGATAGTAGCCTTTCTTATTATTTTCTAAATAATCAAAAGAATTCATGGGGAAGCATATATATAGGCCGTAATAAGTCTTAACAAAAAAGGAAATAAAACTAGGGTACAATAAATTACAAATTACCTTTGGGGCTATAAACACTCAACTAACCCCTTAATTCCAAAAGAAAAGAAAAGAAAGAAAAGATGAAAATAGAAAGTACTATCCATCTACCCAACTTCTTAGGGGGCATTGGAGCAAGTAGTTGGTTGTTATAGTCCTAGGTTATTATAGTTGAGTTATAATAGTTTGTGTTCAAAGTGTAGATTATTTTAGTTGCAATTATAATAGTATGTATTTGAGGAGTAAACTATTTTAGTTTGAAAAGGAAATAGCAAACATGGTAGTAAAGAATAAAAAATGATGAATGTAAAAATATAAATTGTAGCAAATAGTCAATGATGTAGCAAATGGGGGGTTTTGGATAATTGGGATTACAAAACAGTATATTTTGTTAAGATGTTATCTCTATTGTCCTTGGGAGAAGGATATGATGAGGGCACTATGGGGGTTTCAACTTAGTTGAGATATTCAGGTGCACCTCCTGATTCTTAGTTCTTTCCTTTTGGATGCTCCTTGTATAAGTCTCGTACTTTGAGCTTTAGTCTTGATTTTATTAATAAAATTTTGATGTTTTTCTCCTTTAAGAAAAATAGTATTTATTGTAGCAAGAGGTGATTATTTTAGTCTTAGATAATCCTTGCCCCAAACGCCCCTTGCTTGTTTCATTCATGCAAATGAGAAAATACAATCAATTTTCTTAATTTCGTACATTTATTTTCTTCATGTTTCACTTCCTGACCTGGGAATTTTATTCTTTTTGAAGAAACTTGGTGGTATGTTGATCAATTGGGGAAGTTATGCGACCTCATGCTTCATTTATGTTACAATTGCATTTACATTTACTTCTTAACTTAGTTAAGACATGGTCTCATGCAATTATCATGGCATAAACGGTATCAATTAAGTAGTAGAAGTCCTATCAATGTCATTTTCTTCATGCTTCATTTATGTTACAATGGCATTTACATTTGCATACCAAAAGCCAGGGGTTACAACTTTTGGAGATCTGGCAAGGCCAAAAGACCATGTATCAGTCAAATGAATGGTATGTAGTTCCACTGGTTGGGTTGTGGAAGCCAAACCATTAGAAAACCAAACTTTCCTTAGCCGTTAAATGTATTCTTCCAGATTTTGGTCCATCTTTAGTCTTTCTGGGTTTTCTCTTCATGTGGGGGGCAAGTCAAGCCTCTTTGCTGATGCTGATATTTTGAAAGACTTTTTTTAGCCTCTTCTGGTTTTTGGACTACTTTGGCACAATAGCTACGAGGCTGCCAGTTGCATCTTCTTGCAAGTCTCTAGATTCGAATGGGTTCCTTATGAGAGAGATATTTCGTTATGCTTTGCATTTAAATTTCTTTGTTTTGGTTTTCTTTAACTTAAGTTTTTCTGTTGGCATTTGCTTATTAGCTTGTCATCTCTTTTGTTTGCCTAATTTTAGCATTTGTTGTGGTTGACTGAATTCTTTTCTATTTTTTGCTCTTAGTATAACATTCTTGTACTTTGAGCTCAAGCCTCATTTATTAATAATAAATAAAGAGGCTTGTCTTCGTTTTTTTTAAAAATAAAGTAGTAGAAGTCCTGTCATGGTCATTTTCTTCTGTTAGCTCTTCTAGGTTCTACAGGTAACACCTGAATTTTGACACTTCTTAATATTCATTTGCTACACAAGCTCAACATGTCAATGTCTTCATTTTTTAATAAATGGACGTGGATGGAATATTTCAGGGTCAAGTTAATTTAAAAAGTCCAGATCATAAATTTTGTCTTTTGGAAACTGCTGATTATGGACTCAATAATGGACTTCCACCAATTGCTCAAAGGAGAATTTTTTTTGGCCGGGAGGTCGGTGGCGCCGATAGGAAGCTTATACCAACATATCAGTTAAAAAGTCGCACTTATCTTGGGCCAACTGCCATGGATGCTGAAATGGCTTTCTTAATGGCCAACCAAGCATTAGCAACATCTGGAAAACTTGTCTTTGATCCTTTTGTTGGCACTGGGAGCATTCTTGTTGGTGCAGCTCATTTTGGAGCAATGACAATGGTAACTACTTTAAGTACATCTCAATTTATCTCATAAAGAAATTGTCTGATTTTACAACATTTGGCTGATAGAAAACATGTGGGAGGCTTAATATTCTAAATTGATAGCTTTGAACACATTCCTCTGAAGTCTTTTACTTTCTTTCTCGTACATGAGTCATGGGGGTACTTTTGCTATCCATTGGATATTAGATTATAAGTTTGGTTTCAATCTTGTAGCAGACATTCGTTGCATTTAGGGAACTTAATTTAAGGTAGTTTTCAGTTCTCATAGAATGCGTGTGGGAGAGAGACCATTTGAATTCTAACCGACCAAAATGTCTCAGGGGGCAGACATTGACATTAGGGTGGTACGTGATGGTCGTGGCCCTGATTGTAATGTTTGGAGCAACTTCAAGCAGGTAAATATGTTTTATAAATTCTTAGAACTCAAGGATACAAATGTACAACCTATAGAACAAATCCTGTTCAAGTAAGGTCATGCTTTATAATAAAACTCTAAAATGCTGTTTAGAAATTTTGTTCATGGTGCCAGTCTTGGTTTATAATGTTTTATGTTGAAAGTTGAAACTCTATGAACGCATGAACTAACAGTTAAAATACATGTGAGGGTGACAAGCATGATAGAGGATGACTGACTGTACTGCTAGCATTTTGCTCGTGCAATTTCCTGGGATTCAACTGATTATGATAATATCAAGTTTTGATGCTTTATGTTCCTATGTATGTAATTATGATCATAGATGTTTCATGCTGTATTGGTACTAATCTGTTTATTACTGCTTGCAGTATGGCTTACCACCTCCAATTGCACTGTTAAGAGCAGATAATAATCTTCCTCCCTGGCGTCCAGGATTGAAGGAGGTACAGCAGTAATATTTTAGCACCTGTACTATTTGTTTATTCTTCGTGGTGTTTGAAGTTTTCACTACCATTGTTATATTCTGAAGTTTCACTACCATTTTACAGATTTTCAATCATTTACTTTTTATTTTTCTTAACAAGAACCTAATTTTTTCATTGGGTAAATGTTTCAATGAGTAAATGAAAAGCGACTGATGCCTAAAGAAAAAAATGTAAAGTCATATCTAAGTGAATAAGGAACATAAACAAGAAAAAAATTTCAAGGAAGTGTTCCAAAAAAAAAATTGAAAGAATAATCTGAAAAAGAATTTGAAGCGCCAACCAAATTCGAAGCTTCAAAAACCTCAAGAGCTTAGAGAACAAAAAAAAAAGAAAAAAAAAAAGAAAAGAAAAAAGAACTTCCAAAGCAAGCTTGCTGGAAGAACACTAAATACAACAGTAAGCATGAAAGAACCTCCTCCAAAACACTCGGAAGCCTTTATGTTGAAAGAGGAGAGATAGTCCTTAAAATGTCAGTTTCCCAAGGTGATTAGAAGGGAGTCTTGTGCTGGGGCTTAAAAGGTGAAGGTGGCTTGGGGTAAAGATGGTGATTGCTATACTTCTTTCTTTCATTGAATGGTGATTTGAAGGAAAACTAGGAACAACTGGTCCTTTGGTCGTGGATTCAAGAGAGGTCTATACAGTCTGCCAATTTTGGTTTTTATATAATTGATATCTGCTACAGTCTACTAATCGTGGTTTTAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAAATGGGTTCCTGTCCATTGTCCTCCTCCATCCACCGCTCCCCTCCGTC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BLAST of IVF0003040 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q7Z4G4 (tRNA (guanine(10)-N2)-methyltransferase homolog OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TRMT11 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 305.1 bits (780), Expect = 1.4e-81 Identity = 175/455 (38.46%), Postives = 257/455 (56.48%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0003040 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q5R962 (tRNA (guanine(10)-N2)-methyltransferase homolog OS=Pongo abelii OX=9601 GN=TRMT11 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 305.1 bits (780), Expect = 1.4e-81 Identity = 176/455 (38.68%), Postives = 256/455 (56.26%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0003040 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q05B63 (tRNA (guanine(10)-N2)-methyltransferase homolog OS=Bos taurus OX=9913 GN=TRMT11 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 303.5 bits (776), Expect = 4.2e-81 Identity = 175/455 (38.46%), Postives = 258/455 (56.70%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0003040 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q7TNK6 (tRNA (guanine(10)-N2)-methyltransferase homolog OS=Rattus norvegicus OX=10116 GN=Trmt11 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 303.5 bits (776), Expect = 4.2e-81 Identity = 170/443 (38.37%), Postives = 256/443 (57.79%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0003040 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9CWH5 (tRNA (guanine(10)-N2)-methyltransferase homolog OS=Mus musculus OX=10090 GN=Trmt11 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 302.0 bits (772), Expect = 1.2e-80 Identity = 174/455 (38.24%), Postives = 257/455 (56.48%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0003040 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BG98 (tRNA (Guanine(10)-N2)-methyltransferase homolog OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103489693 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 993.8 bits (2568), Expect = 2.5e-286 Identity = 480/480 (100.00%), Postives = 480/480 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0003040 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1F3J0 (tRNA (Guanine(10)-N2)-methyltransferase homolog OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111439552 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 936.8 bits (2420), Expect = 3.6e-269 Identity = 448/480 (93.33%), Postives = 465/480 (96.88%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0003040 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1ICG5 (tRNA (Guanine(10)-N2)-methyltransferase homolog OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111472466 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 925.2 bits (2390), Expect = 1.1e-265 Identity = 442/480 (92.08%), Postives = 462/480 (96.25%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0003040 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7TF32 (tRNA (Guanine(10)-N2)-methyltransferase-like protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold67G003460 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 920.6 bits (2378), Expect = 2.7e-264 Identity = 448/452 (99.12%), Postives = 449/452 (99.34%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0003040 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1D5Q5 (tRNA (Guanine(10)-N2)-methyltransferase homolog OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111017553 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 899.8 bits (2324), Expect = 4.9e-258 Identity = 434/484 (89.67%), Postives = 461/484 (95.25%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0003040 vs. NCBI nr
Match: XP_008447182.1 (PREDICTED: tRNA (guanine(10)-N2)-methyltransferase homolog [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 989 bits (2557), Expect = 0.0 Identity = 480/480 (100.00%), Postives = 480/480 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0003040 vs. NCBI nr
Match: XP_031744574.1 (tRNA (guanine(10)-N2)-methyltransferase homolog [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 977 bits (2525), Expect = 0.0 Identity = 474/480 (98.75%), Postives = 476/480 (99.17%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0003040 vs. NCBI nr
Match: KAE8646077.1 (hypothetical protein Csa_015923 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 951 bits (2458), Expect = 0.0 Identity = 462/469 (98.51%), Postives = 465/469 (99.15%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0003040 vs. NCBI nr
Match: XP_038888658.1 (tRNA (guanine(10)-N2)-methyltransferase homolog [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 942 bits (2436), Expect = 0.0 Identity = 452/480 (94.17%), Postives = 469/480 (97.71%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0003040 vs. NCBI nr
Match: XP_022932935.1 (tRNA (guanine(10)-N2)-methyltransferase homolog [Cucurbita moschata] >XP_023511692.1 tRNA (guanine(10)-N2)-methyltransferase homolog [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 932 bits (2409), Expect = 0.0 Identity = 448/480 (93.33%), Postives = 465/480 (96.88%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0003040 vs. TAIR 10
Match: AT3G26410.1 (methyltransferases;nucleic acid binding ) HSP 1 Score: 744.6 bits (1921), Expect = 5.0e-215 Identity = 357/480 (74.38%), Postives = 412/480 (85.83%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Melon (IVF77) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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