
HG10020726 (gene) Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: CDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGGGGATTCACCAAAAAGTCCAGAGAGCGGCAGTGGGGGAGGGCGTTGCTCGTCGTCGTTAATGGAAAGTTTATTGGGTCTTCTTCGGATTCGGATCATTCGCGGCGTCAACCTCGCCGTTCGCGATGTCCGCAGCAGCGATCCTTACATTGTCGTTAAAATGTCCAAACAGGTTTATTACTTTTATACCCTCTCTTTCTTTATTTTTTTCCATCACCAATGTACAAATTTTATACAACTCCAGTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTTATTAGTTCGATAGAAAAGAACTGTAGATGTGAAGATTTGAAAATTTTACATTTTAATAAATATTACTTTTATCTCAAGTTAATATGTTTTAGGGAAATTATTTTAAATGATATAATGGTGTAAATATTTATAAATATAACAAAATTTTTATTATCTATGTGTAATAGACTACTATTTGTATTGCGATATGTTACAAATAGATAATTTATCGCGGTCTATCACAATGAAATTTGACTATATTTTTAAATAATTTTGTTTATTTTCCTATATTTGAAAACAACCTTATGTTTTAATTAGATTAAATTATAAAAAAAATGTCCATGAACTATACATTTTGTTTCAAAATACCCCTTGACTTTTAAAAGTTTTAAAAATACCCTTAACTTTAAAAAAGAGTTAAAAAAAATACTTCTATCATTAGTTTTAAACCGTTAAAATTTTATTTAAAAAACCTAAACTTTTCAAAAGTTTCAAAAATACTATTAACTAAAAAAATAGTTAAAAAAATACAGAAACATCAATTTGTTTGAAGTTTTTTTAAATTTGAAAATAATGAACTTTAAAACAAATTATAAAGATATCTTCGTTTATTTTTTTCATATAGATACTCTCATTTTTATCTTAATTTTCCAACTCTTAGCTTACACCAATTTTCTCACCAACTAAAATTTTAAGTTAAAACATAAAATCTCATAAAACTCACATAATTCTAAAATCAAAATCTCCTCTTAAACATACCAAAGTAATAAATACACGCTCAACTACTAATGTTTTTTTTTTCTTTTTATCGTTTAGGGTAAGTTAAGAATTGAAAAATTTAGAGAAAATAAGAATATCTATATGAAAAAATGAGGATGTCTATACATTTTGTTTTCCATTCAAAACTAATTGTCGGGCTATTTTTTAACTCTTTTTAAAAGTTGTATTTTTGAACTCTTTTTAAAAGTTGTATTTTTGAACTATCTTAAAGAGTTTAAAGATATGTTTGAACTCTTTTAAAAGTTTAAAGGTATTTTTGAACTCTTTTAAAAATTCAAGGCTATTTTTGACACAAAGTACATAGTTCAGGGACATTTTCTATAATTTAGCCTTTCAATTACAATGTGATTCAATTCGGATTTACATTACCCAACTTTAAAATAGGAGAACAAAAATATGCTTGGATAATAATTTGATAATTTTTTTTTTAATATTTGTAAAATTCAAGTCCAGTTGTTGAAAACTAAAAGAAATAAATGCAATATCTGTTTGGTAATCATTTGATTTTTTATAGTTCAATTGGGTCGATATCAAAGTGTTTGATTCCACCAACCCCACATATTATATATTATAAAAAAAAAACATTTGATTTTTGGTTTTAGAAAATGGTGAGTGTTTTCCTACTCGTTCATAGGTAGACATTAGAGTTTTTAGCCAATTTCCAAAAACAAAAAGTTTTTGAATTTTTTTTTTTTTTGTTTAGTTTTCAAATTTTGACTTTGATTTTGAAAATATTTCTAAAATGTAAACTATAAAAATATAGAAAACAATAAATGAAAGTGGTATTTTTAAGCTTAATATTAAAAAAAAAAAAATCAAATGGATACCAAACAAAAGCAATAATTTTTGTTTTTAGAATCAGAAAAAATCAAATGTTTTTTTTTATATATATAAACTAAGAAAATCTTAGTAAAAAAATATAAAAATAAAAACGAAATTGTTCCACCGTTATAATTTTAAGATATTTATTTTAATATAAGGCAATATGTTATTGCAAATTTTAACATAACATATATATATTGTTTTCTTTTTTCATTGGCAGAAATTGAAGACTCGTGTGATTAAGAAGGATGTTAATCCAGAATGGAACGAGGACCTCACTCTATCTGTTACAGATCCCAACGCTTCAGTCAAATTGGTACACACTTTTACTTAAACCACCCGTAACAATTAAAAAAAAAAAAATTATTTTCAAATATAGAAAAACGAGTAAAATTATTTATAAATATAAAAAAAAATTATTGTCTATCAATGAAAACTTAGTAAATATATTGTAGTAAACTTAGGGTCCGTTTAGATTGACTTAAAAAAAATGTTTTAAAAAAATTTCATTTTTATTTAAACTTTTTTATTAAAAGCTATTTTTTTTAAATGATTTATTTTTTAAATTAAATACTTAAAATGTATACCAAACACATCATTAATCATATCGATACTTTAAATTACATGATAGACGGTGTACGACCACGACACGTTTAGCATGGACGACAAGATGGGGGATGCGGAGTTCGAGATAGGAACATACATAGAAGCATTGAAGATGGATTTGACAGGAGTACCAAGTGGAACCATAGTGTCAAAAGTGCAACCAAGTAGACAAAATTGCTTAGCCGAAGAGAGCGCCATTGTTTGGGAAGAAGGCAAAGTTGTTCAAAACATTTGCCTACGCTTACGCAATGTTGAATGTGGCGAAGTCGAAATCCAATTGCAATGGATTGATCTTCCTGGTTCTAAAGGTTTGTAAAATGCCTTACAAAATATTAAAAAACACACACACTGTTTTTTCTTCTTAAATGGGATCCATTTTCACAATTTGATCCCCTTGTTTTGTTCCAATATTTTATGTACTTTCTTTTTTCTTTTGCATATGGAAATTCAACTCACTATGGCTTTTGAGACCCATAAATTCGAATGATATACCATGTAAAATCATGATATATCATGGATTGGTTTGATTTTCTAATCGTTATTATTAAATTTATACATTAAAAGAGTGTTTGGGGCGCTAAATTAGTTATTATAGTCGGGTTATAAAAATCTATGAATTATAATAGTTTGTGTGTGAGATGCAAACTATTTTAGTCTAGGTTATAATACTATGCATTTGGGGTGCAAAGTAGAAAATAATAAATACTATAGTGAAGAGGGTTTTGAAATAGTACTTATTATACTTAATTGTAGGTTATAAATAGTTGTAAACACTACTATTATATTTGGTGCCCAAAACATGGAGTGAACTATAATAACCCACTCCACCAACTTTGAATATGATAAGGGTGTTACGAATGTATCAACCTTAGTTGAGATATTCTGGTGCACCTATTAACCCATTATACTACGTATCTTTTTTCTTTGCATATGGAAATTCAACTCACTATGGCTTTTGGTACCCATAAATTCCAATGATATACCATGCAAAATCATGAAGCCATCCTCTAATTTTCATGTCTTTTTTATGGATTGGTTTGATTTTCTAATTGTTACTACTAAATTTATACATTAAGAAGGTGTTTGAGGTGCTAAATTGGTTATTATAGTCGGGTTATAAAAATCAATGGATTATAGTAGTTTGTGTGTGAGGTGCAGACTATTTTATAATAAAGACAACAGTGAATAGGATTTTGAAATAGTACTTACTATACTTAATTGCATGTTATAAATAGTTGTAAACACCACTATTATATTTGGTGCCCCAAACATGGAGTGAGCTATAATAACCAACTCCACCAACTTGAGATATGATGAGAGTGCTACAAATGTGTCAACCCTAGTTGAGATATTCTGGTGCACCTACTAACCCGTTATACTACGTATCTTTTTTTTAAAAGAAAAAATTCACACCACCAACTTCAAGTTGGTGCCGTAAACACTCTATAAGTCTCTCCCTCCGGCAATCGTAAAGAATGAAAGAATATGCGTAGTTGCGTGAGTTCTGATTTTTTTTTTTCGAGTTTTAAATTAGTGATGGTGTTTGTTGACTAATTAAATTTTGAAACTTATGAACCACATGTAATCATTGATTGTCGACGAACATGATGATATAGCTGCATTGATCACGAGGAAGTCGACATGGTTGGAAGTGAGTGGGAAGAATTCAATTCAAAGTAGTAGAGATGTGGATGGTTTTGAGAGGTTACCTGGCAAAACAAAGAAGCTCTGGACACCTGTGTGGCGTCTACCTAGCGTATTTCGTTATGTTAATCGCTTCAAGTCTTCACTTCTTCTCCAACGTTGTTTATATAAGAAATGAAATGAAGTTCGTTGTCATTTTATACTAACACACACATATATATAGGCTTAATTTTGGTATCAACCGCATCTCGGTTGCTTGCATACCAACGTTGAATATGGCTTCTTTTTTTTGTTTTTCTTTTTTAAAGTTCAATAACATGTGGAGTGAGAGATTTCAAACGTCGTTTTCTAACTTTCTAATAGATAATATACATTTTTAATCAACTGAGTTATATTTAGGTCGACCTTTTATGTACCTAATTGATCAATTTGTTTTGAACGTTAGGATATACGTATATGAACCACTTAATAACTCGAGCTTAATGACTTCTTGTCTTGTTCACTAAGTGACAACACACTTGAGTCCTAATTAATTGTACATTGTCACATAATTGAGCTATGATCGATTGACTAGCACAAAAGTGGTTTATTGTCTCTTACACCCTTGCAATTATTTTCACTTTCACTTGATTGGAATACACTTAAGTGAAAATGGGAGTTGATCTCATGTAGCCCAAGTATTACTCTTTTTAGTAAGTTGGGGTATCGACTACTAGACGAACTTGTTCATGGTTTTAACTTAATTAGGACATGCGTTTCGAGGAATTTTGAAATGGTTAAAACCATTTTTTAACTCATTTAAAATCACTCTCACATATGTGATTTAATCATCTAAAATCAATTTAATGTTTATTATCACTTTTACAACATAGTTTTTCATACAAA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ATGGGGGATTCACCAAAAAGTCCAGAGAGCGGCAGTGGGGGAGGGCGTTGCTCGTCGTCGTTAATGGAAAGTTTATTGGGTCTTCTTCGGATTCGGATCATTCGCGGCGTCAACCTCGCCGTTCGCGATGTCCGCAGCAGCGATCCTTACATTGTCGTTAAAATGTCCAAACAGAAATTGAAGACTCGTGTGATTAAGAAGGATGTTAATCCAGAATGGAACGAGGACCTCACTCTATCTGTTACAGATCCCAACGCTTCAGTCAAATTGACGGTGTACGACCACGACACGTTTAGCATGGACGACAAGATGGGGGATGCGGAGTTCGAGATAGGAACATACATAGAAGCATTGAAGATGGATTTGACAGGAGTACCAAGTGGAACCATAGTGTCAAAAGTGCAACCAAGTAGACAAAATTGCTTAGCCGAAGAGAGCGCCATTGTTTGGGAAGAAGGCAAAGTTGTTCAAAACATTTGCCTACGCTTACGCAATGTTGAATGTGGCGAAGTCGAAATCCAATTGCAATGGATTGATCTTCCTGGTTCTAAAGAGATGGGGAGCAGCGACGACTATAAATTCATGGAGATTAGAGATGCTATTGCCTCCATAAACCAGAAGGTTAACCTTATTGGCGTTATCATCGAGTTTGGTTTCCCCAGGCGAACTAAGGGCACTGATTGCTTTTGTGCTGTAAAAATTGTTGACCAATCTCATAAAAAACCTGGAATTACTGCAAATATTTTTGCTGAAAGTTTGGAAAAGCTTCCCCATGTTGCTTCAGCAGGAGATATCATTGAACTTTCGCATGTTACGATGAAAACTCATCAGGGGGAAATATATGCTGTCTTCAATAAGAAGTTTTCTTCATTTGCTTTGTATGAAGGAAAAGATGGATCGGGCTTTCTACCATATGACGTATCACCAAAATTTCGATGCAGAGATCTTGATAAAAAGTTTATTATGAGTCTGAGGGATTGGCTGGTTGGTTTTGAACTTGATGAAGGATCAACCAACTTTTCATTTCTGAGAGATTTGAAGGAAAGCGAACATGTAAATTTGATCGGCAAGGCATGGCCCAGGTTAGCAAATGAAATTGGTTATGTACATCAATTGGGACCATTGGTTTTGCCAAGAGATATATTATGTACATTACCTCCTGTTGGCTCTATCTTGAGGTTGATCTTTGACAAAGGGATTGAGAAGCAGAGTTTATCCATGCTCAACACTGGTAAATGGATGAAATTTATGAACGTCTTATGTGAAATGCAAGTTGGATCTTTCCAAATTGTGGTGACGACATTTTCAAAGCTTCGTTATACATCGAATGAAGATATTGCCATACAATTGCACCAAAGATCATACGAGGAGCGTTTAGCATCAGTTTTGGGGAGAATTCCTTTTTGGAGCTTTCCTTCGCCTTCGCCCATTACAGAGGTTGATCACAATAATGAACCATTTGCCACATTGATGGATGTTTTGACATATTCAAAGGTGACTGCAAAATTCAAATGTGTAGTTCGTGTCTTAGCAATATATCCATTACAGGCCAAGGACTTCCGCTCTCCTGAAGGGACTTACCGGGTTAGGCTGTGCCTAGAAGATCCAACTGCAAGAATCCATGCCCTATTATACTCGGAAGATGGATACAAATTCTTTGGTGGCTATCTGTCAATTGATGCTTTGACGAGGAAACGAAACAAGTTACTTGGGGTTTCAGCAAGTGAGAAAAATGAGGCCAGTACAAGTAATCCTCCATGGGTGCAGTGCTGCTTAAAATCTTATTACCTTAACAAACAAGACGTATGGGGAAGTAGACAGTACAGAATATTTGGCACTCGGCTGGTAGCAGATTAA MGDSPKSPESGSGGGRCSSSLMESLLGLLRIRIIRGVNLAVRDVRSSDPYIVVKMSKQKLKTRVIKKDVNPEWNEDLTLSVTDPNASVKLTVYDHDTFSMDDKMGDAEFEIGTYIEALKMDLTGVPSGTIVSKVQPSRQNCLAEESAIVWEEGKVVQNICLRLRNVECGEVEIQLQWIDLPGSKEMGSSDDYKFMEIRDAIASINQKVNLIGVIIEFGFPRRTKGTDCFCAVKIVDQSHKKPGITANIFAESLEKLPHVASAGDIIELSHVTMKTHQGEIYAVFNKKFSSFALYEGKDGSGFLPYDVSPKFRCRDLDKKFIMSLRDWLVGFELDEGSTNFSFLRDLKESEHVNLIGKAWPRLANEIGYVHQLGPLVLPRDILCTLPPVGSILRLIFDKGIEKQSLSMLNTGKWMKFMNVLCEMQVGSFQIVVTTFSKLRYTSNEDIAIQLHQRSYEERLASVLGRIPFWSFPSPSPITEVDHNNEPFATLMDVLTYSKVTAKFKCVVRVLAIYPLQAKDFRSPEGTYRVRLCLEDPTARIHALLYSEDGYKFFGGYLSIDALTRKRNKLLGVSASEKNEASTSNPPWVQCCLKSYYLNKQDVWGSRQYRIFGTRLVAD Homology
BLAST of HG10020726 vs. NCBI nr
Match: XP_038894977.1 (protection of telomeres protein 1b isoform X1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 812.0 bits (2096), Expect = 3.6e-231 Identity = 404/459 (88.02%), Postives = 414/459 (90.20%), Query Frame = 0
BLAST of HG10020726 vs. NCBI nr
Match: XP_008464669.1 (PREDICTED: protection of telomeres protein 1a-like isoform X1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 793.5 bits (2048), Expect = 1.3e-225 Identity = 395/454 (87.00%), Postives = 407/454 (89.65%), Query Frame = 0
BLAST of HG10020726 vs. NCBI nr
Match: XP_011650817.1 (protection of telomeres protein 1a isoform X1 [Cucumis sativus] >KGN64177.1 hypothetical protein Csa_013134 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 775.8 bits (2002), Expect = 2.8e-220 Identity = 386/457 (84.46%), Postives = 402/457 (87.96%), Query Frame = 0
BLAST of HG10020726 vs. NCBI nr
Match: XP_004137504.2 (protection of telomeres protein 1a isoform X2 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 771.9 bits (1992), Expect = 4.1e-219 Identity = 386/457 (84.46%), Postives = 402/457 (87.96%), Query Frame = 0
BLAST of HG10020726 vs. NCBI nr
Match: XP_023001782.1 (protection of telomeres protein 1b-like isoform X1 [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 768.5 bits (1983), Expect = 4.5e-218 Identity = 381/458 (83.19%), Postives = 399/458 (87.12%), Query Frame = 0
BLAST of HG10020726 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q6NKX5 (Protection of telomeres protein 1b OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=POT1B PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 303.5 bits (776), Expect = 5.4e-81 Identity = 174/449 (38.75%), Postives = 252/449 (56.12%), Query Frame = 0
BLAST of HG10020726 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q56Y52 (Protection of telomeres protein 1a OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=POT1A PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 292.4 bits (747), Expect = 1.2e-77 Identity = 167/466 (35.84%), Postives = 259/466 (55.58%), Query Frame = 0
BLAST of HG10020726 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9LVH4 (Protein C2-DOMAIN ABA-RELATED 4 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=CAR4 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 265.0 bits (676), Expect = 2.1e-69 Identity = 131/167 (78.44%), Postives = 147/167 (88.02%), Query Frame = 0
BLAST of HG10020726 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9LP65 (Protein C2-DOMAIN ABA-RELATED 5 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=CAR5 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 255.0 bits (650), Expect = 2.2e-66 Identity = 126/167 (75.45%), Postives = 145/167 (86.83%), Query Frame = 0
BLAST of HG10020726 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9C6B7 (Protein C2-DOMAIN ABA-RELATED 3 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=CAR3 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 238.4 bits (607), Expect = 2.1e-61 Identity = 112/165 (67.88%), Postives = 141/165 (85.45%), Query Frame = 0
BLAST of HG10020726 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CM53 (protection of telomeres protein 1a-like isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103502471 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 793.5 bits (2048), Expect = 6.3e-226 Identity = 395/454 (87.00%), Postives = 407/454 (89.65%), Query Frame = 0
BLAST of HG10020726 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0LTS7 (Telo_bind domain-containing protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_1G042840 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 775.8 bits (2002), Expect = 1.4e-220 Identity = 386/457 (84.46%), Postives = 402/457 (87.96%), Query Frame = 0
BLAST of HG10020726 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1KHL8 (protection of telomeres protein 1b-like isoform X1 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111495820 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 768.5 bits (1983), Expect = 2.2e-218 Identity = 381/458 (83.19%), Postives = 399/458 (87.12%), Query Frame = 0
BLAST of HG10020726 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1E898 (protection of telomeres protein 1b-like isoform X1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111431722 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 767.3 bits (1980), Expect = 4.9e-218 Identity = 382/458 (83.41%), Postives = 399/458 (87.12%), Query Frame = 0
BLAST of HG10020726 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3BL04 (Protection of telomeres protein 1a-like isoform X1 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold248G002390 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 752.7 bits (1942), Expect = 1.2e-213 Identity = 395/550 (71.82%), Postives = 407/550 (74.00%), Query Frame = 0
BLAST of HG10020726 vs. TAIR 10
Match: AT5G06310.1 (Nucleic acid-binding, OB-fold-like protein ) HSP 1 Score: 303.5 bits (776), Expect = 3.8e-82 Identity = 174/449 (38.75%), Postives = 252/449 (56.12%), Query Frame = 0
BLAST of HG10020726 vs. TAIR 10
Match: AT2G05210.1 (Nucleic acid-binding, OB-fold-like protein ) HSP 1 Score: 292.4 bits (747), Expect = 8.8e-79 Identity = 167/466 (35.84%), Postives = 259/466 (55.58%), Query Frame = 0
BLAST of HG10020726 vs. TAIR 10
Match: AT2G05210.2 (Nucleic acid-binding, OB-fold-like protein ) HSP 1 Score: 292.4 bits (747), Expect = 8.8e-79 Identity = 167/466 (35.84%), Postives = 259/466 (55.58%), Query Frame = 0
BLAST of HG10020726 vs. TAIR 10
Match: AT2G05210.3 (Nucleic acid-binding, OB-fold-like protein ) HSP 1 Score: 292.4 bits (747), Expect = 8.8e-79 Identity = 167/466 (35.84%), Postives = 259/466 (55.58%), Query Frame = 0
BLAST of HG10020726 vs. TAIR 10
Match: AT3G17980.1 (Calcium-dependent lipid-binding (CaLB domain) family protein ) HSP 1 Score: 265.0 bits (676), Expect = 1.5e-70 Identity = 131/167 (78.44%), Postives = 147/167 (88.02%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1
Date Performed: 2022-08-01 Position : 0 Zoom : x 1
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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