
HG10019868 (gene) Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: CDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGCCTTCATTTCCTCCTCCTGGATCTGTTACCATCTGCGAAATCAATCGTGACCTCAGTTAGTATCTAAATCTTACTTTGCTTCTCACTTGTGAAGTTCTAGTGTTCTATTTTCTATGATGTTGATCATTATTTTTTTGTGAATTTGTTGCTGTTCAGTTACTGCCGATTGCCTCTCCGATGATCGAGCGAACGATACTTATGGGAAAGTCCTTGTGAGTAATGATGATTGAAATTTATAGTTGATGTTACCTTCGCTCAGACTCGATGTTTTTGTTTATGGAAATTTGGAATTTGGAATTTGTGCTGTGGCGTTTAATAGGGTATGGTGTTTAGCCCTGTTCCATTTCAGTCGGATTTTTTGGTGTCGCCATCTCCTGAACCGAACAATGAGCCTAGGAACGATGAAGCGAATGGGGAAATTATTCAAAGGAAGAGTGTAATTGCATCTTTGCAGGGATTCCTCGAGGGCTCCATCAACCGTTTTTTGCGTCCTAATGATGTAAGTTTGATATTTGTTGATAACGAATCGTGTGGTTCAGAAGTATTTCTGAATGCCGGTACACCAGTTTACTGACTCTGAGGCATTCCCGTACAGGTTTTCTGAAATGAAATAATCGAAAGGCCACTAATCTTTTTTTAGCAGTCGAAAGAAGTAATTGATTGAGCAGTTGACAACCTTTCCATAATAATAATAAAAAAAAAGAATAATCCTTCAATATCGTTTTTTGTAAGGCACTGGAAATCCTAGATGATGTTCAATATGATTCACACCTAAGGCACTGTAACAAGAGAAGAGAATTGTTAGATTAGGGAATATTTGCAAGAATTTCTGCATAGCAAACTTCATTGAATTTTGTAACATATAACGAAGGTAAAAGACCTACCTTAAGTATATTGGCAACAAAAATTTGTAGTTCATGATGCATTTAAGTTTTTAATTCAATATGCTTGTTGGAGTTCAACAAAATCGAATACAAAATATGAAATTTGAAATGGTTTCTTTAAGATACGCCTCCATTGTAATTTTAAGGAAGTTCGACATTTTTTTCCCTTATTCTTTTGCATGGAAGAAAAGGTTGCTATCTGTATGTGGCATTTCTTAAGGAAGTTGAACCTTGGAAACTTGACTTGGCATCTTGCTATCTGTATGTGGCATTTATGGGGCTTATATTCATGATTGGTTATATAATACATCTACAGATAGAATTAGAGTTCATGGTCTGGCCTAACATAAATAGAATACCTATGGAATGACGAGAACTCTATTTACTTTGAAGTTTTGAAGTTGTTAAAGATGCAGAATCATTGAAGTTTAGTAAATTGACTGCACAGGCATTCCAAAATCAAAACACATGCTTTATATAACTTTTGAAAGAAAGTTGAGCACCTTATGCTCAATGATCCTTTTTTTTCTTTGGATAAGAAACCTTATGCTCACTGATCAATTTTATAGGTAAAGTACTTGCCAGCAGAATATCTTCAAGGAGTGAGTTGGCACCGGCACAAACATATTATAGCATTCATATCTGGGACGAATCAAGTTGTTGTCCGCGATTATGAAAATGCAGGTCATCAAATCTAGTTCACCATATGATTTGGTTAAAATTTTGTAATCTTTTTATTTGTATATAGAAGTAGATTTATTGTTTTGTGATCTTTTTATTTTTATGTGGAAGTAGCTTGATTGTTTTTGTACTGTTCATTTCATCTTAAACTTTCTTGTTCAATTTCTATCAAATAACATGGATGTATTTTATGCTCTGAACAGAAGGAAAAGACCCTTGCATTTTGACCCACGACTTGCAACGAGATGTTAAAGTTCTTGAGTGGAGACCAAATGGCGGGAGGACTCTATCTGTTGCATGCAAGCAAGTACCATAGAGCTGCAATCTTATCATTTAAAATAAGCACTATATATCTTAGAACCAAGGATAAAACCATTTCTCGCAAGAATGTTTACCATACGTAAATTTTTATACTTTAACTTGACTTGAACTTCTTGGTTTGGGTATTCTTTCAGAGGTGGAATTTGCATATGGGCTGCTTCTTTCCCAGGAAATGCTGCTTCTGTGAGACCTGGTGCCGTGTCCTTCTTAGGATCATTCTCAAGAGGCTCTGGGGTTCGATATACGCTAGTTGATTTTCTTCGAAGCCATGATGAACAGATTAGTGCCCTGTCATGGAGTCCTGATGGAAGATATCCAAATCAATTAAAAGTTTGAAGTCATTTTATTATACTTGCTGATGACATTTTACTTGTGCTCTATTTTTATTATTCTTTTTCCACTGTCTCCCCGCCAAAGTATTTCAACGCGATACTGGAGATTTCCTTGACTCATTGGCACATATCTAGCATCTGCCTCTTACGAGAGCTCCTCTTTTACCATTTGGGATGTTGCTCAAGGTATGTCAAAGACTCGAGGGATAAATGGATGCTATTTTTCGAGAAGAATAATACTAGCGATTCATTTCGTACTTTTATATCTCTGATTTTGTCTATCAAAAGGGGTTTGAAAAAGCATATTGTTGCAGGTAGCATGACTATGGAAAATGCTATCCTTAGTATTATATCAACAATACTTGACTTGCCTGATTATTTTGTTTTGTTTCTCATCTTAATTACCAGATGATTTATTAATTTATTTTTTATTATTTCAAATAATTCTCTCCCGTCCCCTCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCATATTTCTTGAAGAATTCCTTTGACTTTTGAGACTTTCCAGGGTTGGGAACACCTATTAGGCGTGGATTAGGGTGTGTATCAACAATCAAGTGGTCACCTACTGGAGATTACTTTTTTGCTGCGAAATTGTAAGTACTATCCAACTGTCTTGTAAATTTTGTTACATAATACCCAGCCATTTTTCTGCATATATAAGACCATTTATTTTGCAGCGATGGAACATTTTATCTTTGGGAAACGAACACATGGACATCTGAGCAATGGTCTTCAACAAGTGGTTTTGTCACGGTACAAAGAGAAAAAAAATTATGTTTTATTTATTTAATCTTGTCCAGGGATGTTCACCTTCTCTCTATGTATCTGTCTTTTTCTCTTGCTTGCTCTCTCTTTTGTGTCTGAAAAAATGCTTGGTATTTAATTGAAATAATGAAACATAGATAGGCAGATAGGGGAGAAGCTTCCAATTTACTTCAGTTTGTCATGAGGAAAATAGACAAGGATGTAGAAGAAATGCAACGCATGATCTAATTAATCCATTTGTTCGCATTTAGTAGTTGAAGCAAATTCTAGTATTGAATTTCATAACTGGATAAGGATAAGGTTTTAACTATGCCAGATATGGCATCAGAAATTTCATTGTTAGCTCGCCCCTTCTCTTAACCCTTCCATCTCATTATTAGGTTAAAGTATTCAACAATTGTCCTGAATTAATATCTAGACATTGCATGAAAATTATTGGTTTATTTGGTTCTCACTTTTGTCAGTCAAGTTAAAATTTATAGTTGTTAGCAATCTTTGTCTAATCGCCACTGTAACTAATGAAGAAGTCTTTCATGAGTTAATTTTTTTACTTTGCATCCACTAATCAGTGTCATGATATCAGGGAGCAATATGGGATCCTGATGGACGTATGATACTACTCGCTTTCTCTGATTCTTCAGTATTGGGTTCGATTCACTTTGCTTCTAAGCCTCCGTCATTAGGTATATGAATTGCTTTTACAGTTGTTGTGCCTATGTCATGTTATACAGTGGATTTGTGCACATTGTCTCGCATATTCTGCAAGAATTGAGGTGTTTGGAAGTTTTTCTTATGATATCTGTAGAAATAATAGGATTCAGACAATGAGAGTTGGGTGAAAAGAAGGAACTGACGGAAGTTTTCTGGAACTTTCATGGTAGTCTGCCAATAATGAATTAATTATCAGTTTAGTCTTAATGATTGCGATAAACTCTTTCCCAGTTTGGATTCAGGTGCATTATGCAAGGTATTGAGTAATGTTCATTCAACTTCACTTCTTCACCTAATAACTCTACAGGGACAATATTTTCATTGCAGATGTTGCCTGGTTAATGTGATGGAATCTATTTACCTTTTATAAAATTGCAAAATGCGCTAGCCATTAATGTGGATCTTCAGTTTTCACTTGTTTGTAGATCTGATGCATTCTCAATGATTTTTGTCTTCCAGTTGCACATCTGCTAGCTGTTGACTTGCCCGAGATTACTACTTTGACGAACAGGTATATATGTTTCGTTTGTTAGGCACCCATCTTTTACATGACCAAGATTTTTAACCATAAAATTTTGACAACTGTGCATTATCCTGTCAGTCAAGGTATTGAGAAGATAGCATGGGATGCTTCAGGAGAGCGACTGGCTGTGTCTTTCAAGGATGGAGATGAATTATACAATGGCCTGATCGCAGTATATGATGTTAAAAGGACTCCCCTGATTTGTCCATCCTTGATGTAAGTTATCGACATCATACTCGACTCAAATAACTTGGGAATTCAACTGACCTGCATGTGCAATTGTTTCATCTTTGTCCAGTGGCTTTATTAGAGGACCTGGAGACAATCCAAAGCCAGTTGCATTTTCGTTCCATGGCAAGTTCAAGCAGGGACCTTTGCTTTCAGTGGTATGTTCCATAAGAATCACTTGCCTTTTATAAATGCCAGTATTTATATCATCGAAACGTAGGAAACGGTATAGGAATATTGTTTAAGTTTCATCTTTTTTCACTTCAAATCTTATGAGGTTTTTGTACGGATGACCCAGTCCTAGAGACGTTAATGCAGAATGATCCAATCCTAAAAAATGAATGAAAACTAACCTTCTGCTGATGTCACAGACCACTATTGCGTCAGGGGCATCTCTCCCATCGTGAAATAATTGGAGCTCTAACACGATATTCATTTCAATTGCGATTTTTCTTTTAAATCAACCATTTTTTAAAAAATCAATTGTGATTAGAAATGAAAATCGCATGACTATTTCGC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MPSFPPPGSVTICEINRDLITADCLSDDRANDTYGKVLGMVFSPVPFQSDFLVSPSPEPNNEPRNDEANGEIIQRKSVIASLQGFLEGSINRFLRPNDFTDSEAFPYRGGICIWAASFPGNAASVRPGAVSFLGSFSRGSGVRYTLVDFLRSHDEQISALSWSPDGRYPNQLKSSSFTIWDVAQGLGTPIRRGLGCVSTIKWSPTGDYFFAAKFDGTFYLWETNTWTSEQWSSTSGFVTGAIWDPDGRMILLAFSDSSVLGSIHFASKPPSLVAHLLAVDLPEITTLTNSQGIEKIAWDASGERLAVSFKDGDELYNGLIAVYDVKRTPLICPSLIGFIRGPGDNPKPVAFSFHGKFKQGPLLSVYQIRRRLILNLPHPTTELHQKVPVATRLSSGPHILFFLSLFTNYFISPISLSTATIHPYPLMEDERALRRTSNGGTLNHSVLPYPTLSTTFTIPLTRYTTRLISSDRHRPLLADCAEEDHSDFDDFTRRSFIRENCSYSMPILVLDVVWNLAFVLVSILVLLSTFKERPSTPLRLWISGYGLQCLLHVAFVFFEYQRSMAHHGFEDRAAHRSIMKRLESMNTMTSSVWWVVGFYWIVMGGQALLQDSPRLYWLTVVFLAFDLFFILFCIGMACVIFFSLCCCIPIVAFAYAMTTREGASEEDIRTLPKYTFRQAAVLGTFNHGKEREPIRATMELDNDHRIKELALHPEDSVSYLSFYVKL Homology
BLAST of HG10019868 vs. NCBI nr
Match: XP_008443209.1 (PREDICTED: aladin [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 677.2 bits (1746), Expect = 1.6e-190 Identity = 344/429 (80.19%), Postives = 350/429 (81.59%), Query Frame = 0
BLAST of HG10019868 vs. NCBI nr
Match: XP_038905166.1 (aladin [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 674.5 bits (1739), Expect = 1.0e-189 Identity = 344/429 (80.19%), Postives = 349/429 (81.35%), Query Frame = 0
BLAST of HG10019868 vs. NCBI nr
Match: KAA0053915.1 (aladin [Cucumis melo var. makuwa] >TYK25490.1 aladin [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 663.7 bits (1711), Expect = 1.8e-186 Identity = 337/422 (79.86%), Postives = 344/422 (81.52%), Query Frame = 0
BLAST of HG10019868 vs. NCBI nr
Match: XP_011652161.1 (aladin [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 661.8 bits (1706), Expect = 7.0e-186 Identity = 335/429 (78.09%), Postives = 346/429 (80.65%), Query Frame = 0
BLAST of HG10019868 vs. NCBI nr
Match: XP_022152054.1 (aladin isoform X2 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 660.2 bits (1702), Expect = 2.0e-185 Identity = 334/429 (77.86%), Postives = 347/429 (80.89%), Query Frame = 0
BLAST of HG10019868 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8GWR1 (Aladin OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=AAAS PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 463.4 bits (1191), Expect = 4.8e-129 Identity = 251/434 (57.83%), Postives = 291/434 (67.05%), Query Frame = 0
BLAST of HG10019868 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q93Z92 (E3 ubiquitin-protein ligase At4g11680 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At4g11680 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 186.0 bits (471), Expect = 1.5e-45 Identity = 101/239 (42.26%), Postives = 142/239 (59.41%), Query Frame = 0
BLAST of HG10019868 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9LN71 (E3 ubiquitin-protein ligase At1g12760 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At1g12760 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 181.8 bits (460), Expect = 2.8e-44 Identity = 94/219 (42.92%), Postives = 133/219 (60.73%), Query Frame = 0
BLAST of HG10019868 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8LDB8 (E3 ubiquitin-protein ligase At1g63170 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At1g63170 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 181.0 bits (458), Expect = 4.7e-44 Identity = 99/229 (43.23%), Postives = 135/229 (58.95%), Query Frame = 0
BLAST of HG10019868 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8GUU2 (E3 ubiquitin protein ligase RIE1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=RIE1 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 176.4 bits (446), Expect = 1.2e-42 Identity = 87/202 (43.07%), Postives = 127/202 (62.87%), Query Frame = 0
BLAST of HG10019868 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3B899 (aladin OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103486859 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 677.2 bits (1746), Expect = 7.8e-191 Identity = 344/429 (80.19%), Postives = 350/429 (81.59%), Query Frame = 0
BLAST of HG10019868 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7UJP0 (Aladin OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold352G006370 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 663.7 bits (1711), Expect = 8.9e-187 Identity = 337/422 (79.86%), Postives = 344/422 (81.52%), Query Frame = 0
BLAST of HG10019868 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0LH99 (WD_REPEATS_REGION domain-containing protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_3G816680 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 661.8 bits (1706), Expect = 3.4e-186 Identity = 335/429 (78.09%), Postives = 346/429 (80.65%), Query Frame = 0
BLAST of HG10019868 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DEW4 (aladin isoform X2 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111019858 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 660.2 bits (1702), Expect = 9.8e-186 Identity = 334/429 (77.86%), Postives = 347/429 (80.89%), Query Frame = 0
BLAST of HG10019868 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1F6N8 (aladin OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111441364 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 659.8 bits (1701), Expect = 1.3e-185 Identity = 336/429 (78.32%), Postives = 348/429 (81.12%), Query Frame = 0
BLAST of HG10019868 vs. TAIR 10
Match: AT3G56900.1 (Transducin/WD40 repeat-like superfamily protein ) HSP 1 Score: 463.4 bits (1191), Expect = 3.4e-130 Identity = 251/434 (57.83%), Postives = 291/434 (67.05%), Query Frame = 0
BLAST of HG10019868 vs. TAIR 10
Match: AT4G11680.1 (Zinc finger, C3HC4 type (RING finger) family protein ) HSP 1 Score: 186.0 bits (471), Expect = 1.0e-46 Identity = 101/239 (42.26%), Postives = 142/239 (59.41%), Query Frame = 0
BLAST of HG10019868 vs. TAIR 10
Match: AT1G68070.1 (Zinc finger, C3HC4 type (RING finger) family protein ) HSP 1 Score: 185.7 bits (470), Expect = 1.4e-46 Identity = 103/242 (42.56%), Postives = 148/242 (61.16%), Query Frame = 0
BLAST of HG10019868 vs. TAIR 10
Match: AT1G12760.1 (Zinc finger, C3HC4 type (RING finger) family protein ) HSP 1 Score: 181.8 bits (460), Expect = 2.0e-45 Identity = 94/219 (42.92%), Postives = 133/219 (60.73%), Query Frame = 0
BLAST of HG10019868 vs. TAIR 10
Match: AT1G12760.2 (Zinc finger, C3HC4 type (RING finger) family protein ) HSP 1 Score: 181.8 bits (460), Expect = 2.0e-45 Identity = 94/219 (42.92%), Postives = 133/219 (60.73%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1
Date Performed: 2022-08-01 Position : 0 Zoom : x 1
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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