HG10018325 (gene) Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: CDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGTAGACGTCGTTCACTGGTGGAAAGTAAATCGGCACATAATTTCTCTCTACTTTCTCGCCCAGAGAAATCTTGTTTCAAGAAGAACAGAATCATCAGATAGTGAAGGAGAGAGCTCAGAGCGAAGAACTTCAGAAATGGGAGAAGAACAAGAGGATTCACAGAGGTTGAAGAGAGTAGCGGCGGCAGCATATGACTACGAGAACGATCCCAGATGGGCTGATTACTGGTCCAACATTCTGATCCCTCCTCACATGGCTTCTCGACCCGATGTTGTTGACCATTACAAGCGCAAGTTCTACCAGCGATACATCGTGGGTTCTCTCCCTTTTGATTCTTTTCGATTTGGGTATCGCTGTTCTCTTCAATTTAGAATCCGTACTCAGTAATCGCTTATTGGGGTTGTTTTCTTTCTATTGGATTATTACGCTGTCTGGCGTTATGTTCTGGATTTTGGGATGTGACTTAACTCTTTTTGTTGTTTTCGCATTATATCAGTTGGTTCTCGCTAATTTCTGCTTTGTGGAGTGTTACTGTTAGTGCAATTTTTTTGGGGGGAATTTTATCTTTTAAATTTTGAGATTTCTTGTGGATTTTGGGTTCTTGGAGTTAAGAGAAGATGTTCAAGTTCAATTACAAGGCAATCAGCTAAAATCTTAGTGCAATTTTTGTTGTTTTCGCATTATATCATTTGGTTCTTGCTAATTTCTGCTTTCTGGACTGTTACTGTTAGTGCATTTTTATTGGGATTTTTCTCTTTTAGATTTTGAGATTTCTTGTGGATTTAGGGTTCTTGGAGTTGAAAGAAGATGTTCAAGTTCAATTACAAGGCAATCAGTTAAAATCTTGGACTGGTTTTGTGTTAAGCTGCGAAATGGGTTTTTGTTTAACTGTCCTCTTTTATAGAATTTGTGCTCTTTGGTGGTTGTTGAGAATTCAAATGTGTTCATGCATTTGTTTTAAATTCTTACTCTATGCTTCTTTTCCTTACTCGGTTTTGAAAGACAGGATCCCGAACTTGTGGTAGAGGCCATGTCTTCAAGTAGTTCAACTCAGTCATCTAGACCTTCAGCTACATCTTCCGCAGCACCCCCTCCTACTAATGATCGAAGTCGACCACAAAGTGCAGGTAGAAGTTCTGTTTTTCCCCCTCTTAATGTTAGACATCAAGATCTAGATATTTCTTTAATGTTCATGTTGAATTTACCTGATTGCATTTCTATAACGCATTGCTCATGATGAAGCAGGATCAACAACGACTAGGACTTCAGGTACATCTGCAAGTGCAGATGCTAATCCGACTCCATTGCGCTGGGATCGGCAAACAATTCAGTTTTCTGTCAATGCATGGGTAGGTAGCTTAGTTCATACTTGCTTATATGATGTTGCAAAGTTGGCATTACTACAGAATGTTTGAGGGCTGCACAATGTTATGTTATTTATGTATTTTGTTTTTTTTCTTAAATTTGAGGTGCTGGTTTTCTGAAAGTTTGTACGAACTTTTAATTACAAAGGTTCCATCATTTCTGATAGATGAAATGTAATTCTCATAGGTTTTGTTGAATATTTTTTGTGCATACCGCCATACACTATTTGTATCTGAAATGTTTTTTCTTCCTTCTCTTTGTGGAGCTATCCCTTTCATTACTGAAACCGTCCTCTGTTTGTGTGTGCTTGGGTACGCTTGTTATGCACTTCAATTCCTAGATATAAAGAGTAAGGTGTACATCATCTCTTCTACTCTGTAAGTTCTTATTTGACAGTGCCCTGATCTTTCTCCAAGATTTACTACCAGGTTTTCTCTATTAATTCAAGTTCTGTTCGTTTTACCTCGATTGAGATTTTCAACTGCCCCTTTTTGGGTAAACTGCAAATAAAAGACATTCTATTGGACTTTGTGATATCCTGGAGTATTAGTTTATTTATGGAAAGCTCATTCATAGCAGATTTTAGTCATCAAATTTTTAGAGGTTATATGTGAGCATTGTCCATGGGCTTCTTTTCCTTCATGGAAACTTGGAACCTCCAAGAAAAATCTTTATTAGAAAAGTTATGAACATTATTTTAAATTTGAGCATGAAAGCTATATACTAAGGGTATTTTCATAAAAAATTATTGGTTGTCTTCAGTATTGGCTCATGGTTATGGATAGTTCTGTTCTGCTTCCATCTTTTTTAATATATTTTTCAATTTTGGGATCTATTCTGAAAAGTTAATTTTCTTTTCTTCTGCAGGTGTTTATTGTGGCTGTACTGGCAATTTTCCCCCTAATACCCAAAAATCTTTCGCAGAGGGCATACAGGCTATCTTTTATGGGCACAACTTGTTCTTCTTTATATTCTTTGTACTCGTTGTATGGAGTAAGTTCTCCATACTAATTTCACAGCGTCATTTCCAATTCTATGAAAACGTTTGGTTTCTTCCAATCTAAAGAAAAGAAAAGAAAGAAAATGTTTGATTTACTATCATCAAAAGGAACAAAAAAGAAAAATAATAATAATAATAAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAATAAAACAGCTCCTTTATGTTCATCTAGTTTTATGTATTATCTTTCTATCTTGAATTATTAATTTTTTAATGTTTGCAGAAGCCCAGGGCGTGGAATTTGCAAGCATTGCAAGCTTATTTCCAGTCCATAATTGCGACAAAAGATTTCATTTACTTCACTTACTGTATCACCTTTGTGACTTCAAATATTTGTCTTAAATGTAAGCGTAGCTTTGCTGATCAAGTTTTGTTTACTGATCTCTTTAAGAGATCACCGTATTCATTCATTGAAACATGACTTTGTTTATATGATGTTTTTCTACAATTTCATACTTGTGCGGCAAGATTTTTAAACTTCTTTTTTTAATATTGTTAATGCAGTTGCTTTAATTCCTATCCTATGTCGGGCTCTTGAACATGTTGCAAAGTTTCTTAGGCGTAATTTTGCACGTTCGTCTTTATACAGGTAGCGTGTTGTCAATTTTTAATTCAGTTTATTTGTTGTATGAAATATATGAATATATGTCTACTTGGATTTTGAACCCTCCCCCCACCAAAAAAAAATATTAAATCCTTAGTCTCTGCTTACATTTAAGATTGCATGTGTTCTTTATTTTATATCCTCCATCTTTGCTTTTATGGAAGGGGAAGGTGCTCACAGTTTCTTCCTTGTTGTGCCTAGAGAAGGATATACTTCTTAGGAGAAAATCAAGTGGTGTACGAACAGAAAAGAGAGAATAGATCTGATTAAAGTTCCTTTAATTTCAAATTTGGAAGGTGAATATTATTAATAAGAGACGCATTATGTGCTCTTGAGGGAATTAATGGGTGTTCAAGGATATAGGAGAAATCAAGTGTGTGAGCTCTCCTGTCTACATGCAGGAAGAATAGATGAATGTGTATTGCCTGACTCTTACTTTTCTCGTGTGCTTAAAATCTGCTGGTTGACTTCTTTTATCGCTCAAGTTTATAACAATATGTCTTTAATTTGTTGCAGGAAATATTTGGAAGAGCCTTGCGTATGGGTGGAGTCAAATTCAACTACTCTCAGCATCCTATCTTCACAGGCTGAGATTGGAATTGGCTTCATTCTAATCATCTCTTTGCTCTCGTCAGTTTTTACTCCCTTTTGGCTCTTGTCAACTTCTTCTAAATCCACCCCCCCCCCCCCCATAACACACTCACTTTTTTAATGGTCATTTCTCTTCAATGATCTCCTCAAACTTATGTTCTACAGGTGGCAACGCAACTTCTTACATACATTCATGTACTGGCAGGTGCGCTTTCTTGTAATCGTTACATAATAGCATATTCTTTATTATTATTATTTTTTCTTTTTTAGTACAACATAATAGATATTCAGGCACACAAACAATATTATAAAACATAGAAGATGAGTTTACTATCCTAAATGTGGGGGGTGGGGTGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGCTATATTGAGCTTAGTTTCTTGAACCATTAACTCGAGAATAATTCTCTTGGATTTTTAACCAAACAATTGGTATGTTGTTTGTAATATGATCTCATTTTGGTGTTATAACTCATGAGTAGACTGGTGACCATCTTTAGGGTGTTTCTCTTGTTGAAACTATATATGTTGTTTTCATAATAAAAAAAAAAAAAGAGTTGGTGACTCACTTTTTTTTGTTCTGGACAATTGCAAAACAGCTGCTAAAGCTCATGTATCATGCTCCTGTCACTTCTGGATATCATCGTAGCGCCTGGTCCAATATTGGGAGGGTTGTTTCCCCGCTGATCTACCGTTATGCCCCGTTCCTCAATACTCCTCTTTCAATGGCGCAAAGATGGTGGTTCAGGTAGAATCTAATAGAGGAAGAAGATGCAACTCTGATGTATGAAAAGTTTTAGACTAATCCCAGTAGTGACTCTCCTTCCACTTTTTCAAGCTATAACTTGGATGACATTCTCACTTAGGTCTGTGGAACAAGTTTGGCTTCCAAATGCAACTTCTTATATATTTATTATTGATATACATTATACATCTTAGGAGATTGTTATGTTTGAAATGTGGGTTCTCTATCCTGCACTCTGTTCATGGTGATGGAGGGAAGGTTCTTCATTATTTCTTTCATTTTGTAGACTTCATGTCTGACATTTTAATATCTAATGAGGTTCTGAAAACAGATCTTTGAATCACAATTAAAATGAGGTATAAATCTCCAATAAATAATTGCACTATTATTGACTTTGTGAGATAAATTTCACTTGTTCTTATATATATGCACATATATATGTATATATATATATATTATGTTTTTGTTGATCAGATGAAATTGAAACTTTTAAAACAGTTGAGATATTCGCTGATCCTTTTTCGATCATTTCTCATCCAAAATTTTGTCGTTTTGTTTCGATATTCTTCTCTATATACACTTTTTTTCTGTATTTTTTGATTCGATTATTGTTATTTGTAAATATGGTTCGTTCAGATAATATAT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MVDVVHWWKVNRHIISLYFLAQRNLVSRRTESSDSEGESSERRTSEMGEEQEDSQRLKRVAAAAYDYENDPRWADYWSNILIPPHMASRPDVVDHYKRKFYQRYIDPELVVEAMSSSSSTQSSRPSATSSAAPPPTNDRSRPQSAGSTTTRTSGTSASADANPTPLRWDRQTIQFSVNAWVFIVAVLAIFPLIPKNLSQRAYRLSFMGTTCSSLYSLYSLYGKPRAWNLQALQAYFQSIIATKDFIYFTYCITFVTSNICLKFALIPILCRALEHVAKFLRRNFARSSLYRKYLEEPCVWVESNSTTLSILSSQAEIGIGFILIISLLSWQRNFLHTFMYWQRLVQYWEGCFPADLPLCPVPQYSSFNGAKMVVQNCPFYLHFMGTEDFIALPGSGDSGNETESNESLSFNETREAYSQSSVLKCKDDDASIEKVELADDVHLEDMPCIPQSDLTDETQRSDSDMEIEDLNNLPDFSKTRSRSENNKILSETDYLPVNSADENILPSSEPLQQNELHTRYEDEDWVDNSSFLKTGGQLTVMNGVSIEFNGLNSGVPIEYGSAASHHHGGPTISGVKRPRMAMDEQQPSVHIVYTSLTRDSKQKLDELLKQWSEWHALRGSLSHDDKDSENLESGEETFFPALCVGTKKTSAVTFWIDNQKSEQQQNFVPIDDNSVPLYDRGFTLGLTSANDSSKVEGGLKIIDDASRCFNCGSYNHSLKDCRKPRDNAAVNNARNKYKKYHSSGSRNSTRYYQNSRGGKYDDLRPGALDAETRQLLGLKELDPPPWLNRMRELGYPPGYLDLEDEDQPSGITIYADEKTDEQEDGEITEAEYRKPRKKMSVEFPGINAPIPENADERLWAAEPSSSGLPRNRSNQRLNHYTEYDGKGNDHHQRWSRDYRDDRPPGVDSVKSPPMFTPRYGGHDFSSDSQTPRGNFSSSRSPNLGRPHSDRGRRSPLLDDDYSRYGSSYSSSLFSPPRRR Homology
BLAST of HG10018325 vs. NCBI nr
Match: KAG7016075.1 (Zinc finger CCHC domain-containing protein 8 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]) HSP 1 Score: 1369.4 bits (3543), Expect = 0.0e+00 Identity = 753/1014 (74.26%), Postives = 795/1014 (78.40%), Query Frame = 0
BLAST of HG10018325 vs. NCBI nr
Match: XP_038890370.1 (uncharacterized protein LOC120079961 [Benincasa hispida] >XP_038890371.1 uncharacterized protein LOC120079961 [Benincasa hispida] >XP_038890372.1 uncharacterized protein LOC120079961 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1079.3 bits (2790), Expect = 0.0e+00 Identity = 555/614 (90.39%), Postives = 566/614 (92.18%), Query Frame = 0
BLAST of HG10018325 vs. NCBI nr
Match: XP_008459423.1 (PREDICTED: uncharacterized protein LOC103498564 isoform X2 [Cucumis melo] >ADN34281.1 nucleic acid binding protein [Cucumis melo subsp. melo] >KAA0039389.1 zinc finger CCHC domain-containing protein 8 isoform X2 [Cucumis melo var. makuwa] >TYK00577.1 zinc finger CCHC domain-containing protein 8 isoform X2 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 1073.9 bits (2776), Expect = 7.5e-310 Identity = 544/610 (89.18%), Postives = 563/610 (92.30%), Query Frame = 0
BLAST of HG10018325 vs. NCBI nr
Match: XP_008459422.1 (PREDICTED: uncharacterized protein LOC103498564 isoform X1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1067.8 bits (2760), Expect = 5.7e-308 Identity = 544/617 (88.17%), Postives = 564/617 (91.41%), Query Frame = 0
BLAST of HG10018325 vs. NCBI nr
Match: XP_011656031.1 (uncharacterized protein LOC101212144 [Cucumis sativus] >KGN52565.1 hypothetical protein Csa_009343 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1053.5 bits (2723), Expect = 1.1e-303 Identity = 542/617 (87.84%), Postives = 559/617 (90.60%), Query Frame = 0
BLAST of HG10018325 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q6DD45 (Zinc finger CCHC domain-containing protein 8 OS=Xenopus laevis OX=8355 GN=zcchc8 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 93.6 bits (231), Expect = 1.3e-17 Identity = 54/151 (35.76%), Postives = 88/151 (58.28%), Query Frame = 0
BLAST of HG10018325 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q5F3D1 (Zinc finger CCHC domain-containing protein 8 OS=Gallus gallus OX=9031 GN=ZCCHC8 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 86.3 bits (212), Expect = 2.1e-15 Identity = 48/148 (32.43%), Postives = 78/148 (52.70%), Query Frame = 0
BLAST of HG10018325 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9CYA6 (Zinc finger CCHC domain-containing protein 8 OS=Mus musculus OX=10090 GN=Zcchc8 PE=1 SV=3) HSP 1 Score: 83.2 bits (204), Expect = 1.8e-14 Identity = 52/148 (35.14%), Postives = 77/148 (52.03%), Query Frame = 0
BLAST of HG10018325 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q5R789 (Zinc finger CCHC domain-containing protein 8 OS=Pongo abelii OX=9601 GN=ZCCHC8 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 72.8 bits (177), Expect = 2.4e-11 Identity = 64/236 (27.12%), Postives = 105/236 (44.49%), Query Frame = 0
BLAST of HG10018325 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q6NZY4 (Zinc finger CCHC domain-containing protein 8 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ZCCHC8 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 72.4 bits (176), Expect = 3.2e-11 Identity = 64/236 (27.12%), Postives = 105/236 (44.49%), Query Frame = 0
BLAST of HG10018325 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3BMZ1 (Zinc finger CCHC domain-containing protein 8 isoform X2 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold169G001930 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1073.9 bits (2776), Expect = 3.6e-310 Identity = 544/610 (89.18%), Postives = 563/610 (92.30%), Query Frame = 0
BLAST of HG10018325 vs. ExPASy TrEMBL
Match: E5GCT2 (Nucleic acid binding protein OS=Cucumis melo subsp. melo OX=412675 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1073.9 bits (2776), Expect = 3.6e-310 Identity = 544/610 (89.18%), Postives = 563/610 (92.30%), Query Frame = 0
BLAST of HG10018325 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CBD3 (uncharacterized protein LOC103498564 isoform X2 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103498564 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1073.9 bits (2776), Expect = 3.6e-310 Identity = 544/610 (89.18%), Postives = 563/610 (92.30%), Query Frame = 0
BLAST of HG10018325 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CAN3 (uncharacterized protein LOC103498564 isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103498564 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1067.8 bits (2760), Expect = 2.8e-308 Identity = 544/617 (88.17%), Postives = 564/617 (91.41%), Query Frame = 0
BLAST of HG10018325 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0KSK4 (CCHC-type domain-containing protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_5G643930 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1053.5 bits (2723), Expect = 5.4e-304 Identity = 542/617 (87.84%), Postives = 559/617 (90.60%), Query Frame = 0
BLAST of HG10018325 vs. TAIR 10
Match: AT3G02420.1 (unknown protein; FUNCTIONS IN: molecular_function unknown; INVOLVED IN: biological_process unknown; LOCATED IN: membrane; EXPRESSED IN: 25 plant structures; EXPRESSED DURING: 15 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Uncharacterised protein family UPF0121 (InterPro:IPR005344); Has 72 Blast hits to 71 proteins in 25 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 2; Fungi - 2; Plants - 60; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 8 (source: NCBI BLink). ) HSP 1 Score: 452.6 bits (1163), Expect = 8.1e-127 Identity = 231/301 (76.74%), Postives = 264/301 (87.71%), Query Frame = 0
BLAST of HG10018325 vs. TAIR 10
Match: AT5G38600.1 (Proline-rich spliceosome-associated (PSP) family protein / zinc knuckle (CCHC-type) family protein ) HSP 1 Score: 347.8 bits (891), Expect = 2.8e-95 Identity = 209/409 (51.10%), Postives = 265/409 (64.79%), Query Frame = 0
BLAST of HG10018325 vs. TAIR 10
Match: AT1G67210.2 (Proline-rich spliceosome-associated (PSP) family protein / zinc knuckle (CCHC-type) family protein ) HSP 1 Score: 334.7 bits (857), Expect = 2.5e-91 Identity = 177/304 (58.22%), Postives = 228/304 (75.00%), Query Frame = 0
BLAST of HG10018325 vs. TAIR 10
Match: AT1G67210.1 (Proline-rich spliceosome-associated (PSP) family protein / zinc knuckle (CCHC-type) family protein ) HSP 1 Score: 334.0 bits (855), Expect = 4.2e-91 Identity = 177/305 (58.03%), Postives = 228/305 (74.75%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1
Date Performed: 2022-08-01
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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