HG10011667 (gene) Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1

Overview


Name	HG10011667
Type	gene
Organism	Lagenaria siceraria cv. Hangzhou Gourd (Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1)
Description	Unknown protein
Location	Chr01: 9042017 .. 9050651 (+)
RNA-Seq Expression	HG10011667
Synteny	HG10011667

Sequences

The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: CDSpolypeptide

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ATGCTAAAAATTATGGCAGGACAATACAGTGCTGTGAAGGCTGAGGCTTGGCCTGAAGGTCAGCCCAACAATAGAACCCCTTATCTGAAACAGACAGTAAATGCCCTCGCAAAATCCAAGCTTTACAAATAGCCACCAGTAGCCACCACCTTCAAGTCTTCTTCCCAAAACACAAGCGAATGGCTTTCACCCCAAAACCCAACTTTAAGAACAATTGTCAGGAATCCAAAATAAGGGAATAATCTTACCCTGAATCGAACAGTGAACCTATTGTAGCCCCCCCCCCAAAAAAAAAAACAGAAACGACGAGAAACGATGCAGCGGGGTGGCTGATCGGCGGCGTGAAACGGCGCTACGACGCGACGGATCGCGGATCGAGCAGCGGCTACGAACGCCGACGGCCGTTGCGGCTGGGTGTAAACGACGACAGGCACGAACGGCGGCGGCGGCTGGAACTCAACGAGCGGTTGTGAGACGCGATCAGTTGCAGACGAACGCACGGTGGAGAGAAACTGAGCGGCGCGAGGAAGAAGAAGAGTTTCTCTCTCTTTTTTTAGTTGCACGTAAATCGAGACCCCCATAAATTAATATTATATATTATAATATATAAATTAGAATAATATATTTAAATTAATATTATATACCTTTTTCTTCTCCCAAAATTCACCATATTCTCCAAAATAAACATCCAATTCAAATTTGAATTCCATAATTAAGTATTAGATCCAAAATATTAAACCAAATTCAAATAAATCCCAACAATTAATGTTCAAACACTTGAAAAAAAAATTTGGGATGTTACAGCATCGATCTCTAGCTCCTCTTCCTCTAAAGGATTCATTTGAGTTTTGAGAAACGTCGGTGTTGGCTTCACTTCGACCACCACAACCTCTTCCACGTCTACGACTATTCTCCTCATTGAGTTTGAGTTGGAGAAGTTGTTCAATGGTCTCCGTTTGCTCCATTCTTTTCTTTTACTCCTCATAGGCTTGTAATGAGCCTATAAATTGTTCAATCGTCATAGTCTTAAGATCTTTTGTCTCCTCGATTGTCATGGGGATGATCTCAACTTAGATTTTAGGCTCCATAGAATCTTTTCCATGACACGAACATCGGCGATTTCTTCACTGGTCCATCTTAATTGGTTGACAACAGTCATAATTTTGGTGTGATATTCCCCATCACTTCCTCTCCTTCATCTATAATGATTCAACCCACCACGTAAAGTTTGTAATCGTACCTTTTTAACACAATCAGCTCCTCTATGAGTCGATTGGTGCTTGTCCCATGCTACCTTTGACGTCTCGGCATTGCAGATATTTTGAAATGTGTCTTCGTCAGCTGATTGGTACAAGATATAGAGGGCCTTCTTGTCCTTCTTTCTTCTCTCCTTTAGCCCATCACTTTGCGCTTGATTAGCTCTAGTTTCCGCCTCTTGAAAACCATTTTGGACAATCTCCCACATGTCTTGTGCTCCTAGTAATACTTTTATCTTGATACTCCAACTGTCATAGTTGAGCTTGGTAAGCATTGGTATTTGAAGTGAACTCATCCTGTTACGTCCCAAATTTTCGTGTGTTAATAAAGTAATTGTTTGGTTTTATTTGGGTTTGAATTGGATTTATGTTGGGAGAATTGAGGTATTTTGGAAGAAAGAGAGTTAAAGAAATTATAAAAACATATGTTTATATATTATGATTTATTATTATATATATATTATTATAATATATTTATATTTGGGTTGCCTTGTACTGCGTGCAAGGTAAAAAAATCCTTTTCTTTTCTTCTTCTTCATCGAGCGCTGCAGCCCCCGTTCTTCGTCTACTTCTCGTGAGCGCCGCCGACAACCTCCCTCGCGATTTACTCGCCGCCGCTCAGACCTCACCTTGCGCCGCCGTTCGATCGCCGTCCGCGCGTCGTCCAGAAGCCAAGCCGAGAAGCCGCTGCGTTCACCGTCGCTCATTCTCGCCGCTGCTCGTTTTGGTTCACCGTCACCAGATTCGCGCTCGTCGCCGTCTGTCAGCTGCTCGCCATCAGTCGTCCGCCAGTCGCCGCTCGTCGCTGCCGCTCCCGCCGCATGCTGCCGTCGATCGGATCTGGCTGTTCACTCTGCTGCCAGTGCCGGAGTCGCTTGGACAGTCGCGTCGTTGGATTTGGGGTAAGGTTGTGGTTTCTTTTGGATTCCTAAAGTTTTAAATTGTACCCATCAAGTCTTGGCTTCAACACATTATTATTAATTTCGTTGGATATTAAGCGGTAACCATTTGTGGGTTTGATTGGAGCTCGGAACGGGTTTGGATCATAACGCTTGTTGGATAAATATGTGATTACTTGAACTTAATTGTCGTTTTGGCATTTCGCTTTCATTATTAATTGAAAAGGTTGGGTTATGTTTTAGGGTTGGAGTTTTGGTGCACAAGGTTTTTGGCCGCGATTGTTTCCTGTTTAGTTCGAGGTAAGTGGTTCTATTGCTGGGCTGACCTTCAGGTCAGGCCTTAGCCTGTCACAGTACTGTATTACCTTGTCGTAACTTAACATGCATGTTTAGGACCTCTCTGGCTACTGAAAATTTACTAATTATGTATGTGTGTATGTGTGACCGAATCTCGTGACTAGTAATTATGTATGTATGTATGATTGAATCCGATGCCAGATGCCCGTTTCGTCCCATGCTATATAATGTGAATCGTCAGGTTCACCTTCAGTTTTGACGGTGTGCCATCAGGCCACTAGACAAGCGTGGACCGACGGGTTCACCCCCATGTTCGATAGTATGGGTCGTCAGGCTCACCCTTCAGTATTGACGGCGTGCCCTCAGGCCGCTAGGCATGGTGACGGGACAGCCTGCCTATGTACACAAAGATCCCAGCAATGGGATTACTTACTGAGTTTTATACTCACTCCTTTCATTTTATGAATTTCAATTAAAGGCAGAAACAGACTGGCGGGCGACATGAAGAATCCGTGACCGGGCCAAGTAGGGATACGTTGAGGCTTCCACGTTTCGTTTGTTCATGTTTTTCTTAGATGGGTTGTTCAGTTTTGAACCGGTGGTTTTATTCTTTTTATTTATTTTTCGTTAATTATCTTGATTTAATTTGTTGGTTAGGGGTACCCCGATCAAGATTTAATTTTATTATTTTTTTATATAAAGGATTTTGAATTATTTATTTATTTAATTATTGATCTAATTTCTTAGTTAAATACTTTTTTTAACAAGAGGTTGAGCCTTTGTTTTGTGTCATCAATCTAAGTCTTTGAGATGTGGTAATGTGCTAGTAGAAGTGTCAGGAGTTGGGGCGTTACAGTTGGTATCAGAGCCTAAGTCTTAGGTTTTGTAGACTGACTTACAATGTAAGTCCAGGTTGTCTCATTTGGCCATAACGGGTTCTTCGTCGCCGCCAGGTATGTTTAAATAAAATTCATAATCAAAGTATAAATGTATAAGTATGTTTGGGTGTGTGCATGCGAGACTATACTTGTTTGATTGTTGTGTAGGCTGGCCTCCTTTTCTTTATGATGCAGTGTTTGCTAAGAAGTCTTACAGGTGGTTGTTAGGTGATGGCGCCAAAAGACAAGGGGAAGAAAAAGGTCAGAGTCATACAGCAAGACCCCGTGGGCCCGGACCCCCCAGCGCCGAAGGACCCTTGCCGCCTAGAGACCCTTCTAGGTCAGGGTGGCAGCAGACCCGAACCAGGGGCCGAACGGAGGGTACGAATGTGCCTACAGGCACCCCGGTCGAATTTTCAGCTATGGCGGCAGCGATAGGGGAAGTGTTGCTAGGGAAGATGAAAGAGATGATGGATGAGCAACTGGCCCAGTTCGCCCAGTCCCAGCAGGTACCCGTCCAACCAGCTCAAGCACCACAGGGTCAGGCCCAACAATAGAATGTGCAGGACCTATCTGTTGAAGCTAAACATCTAAGAGATTTCAGGAAGTATAACCCTCGCACCTTCGATGGGTCATTGAAGGATCCTACAAAGGCGAAAATGTGGTTGTCAACGATTGAGAAAATTTTTCGTGATATGAAGTGTCGAGAGGATCAGAAACTTCAATGCGCCGTGTTCATGTTCACAGAAAATGCAGAAATTTGGTGGCGCTCAGCAGAGAAGACGATAGACACGAATGAAGGGCTTGCATCCTGGGAGCAATTCAAGGAGTGTTTCTACGAAAAGTACTTTTCGACCCACACCCGGCACAGTAAACAAGCAGAGTTCTTGAGTTTGAGGCAAGGAACCATGATGGTAGAGGAGTACGAGCAGGAATTCGACAAGTTGTCCCATTTTGCCCCAAAACTTGTGGCCACCGAAAAGGACAGGACAAAAATGTTTATTCAAGGCTTGAGGAGCGGAATACGAGGGTTGGTGCACGCGATAGAGCCTCAAACTTTCGCCCTAGCGCTTCGTGCCACCGTAAAGATCGACGCGGATGCCAGGGACGAAAGTGAGTATAAAAAGTTGGAAGCTGGGATTTCCGTGGGGTAGAAGAGGAAAGCGCCTGAGCTAATACAGAGGGATCAGTCTTCAGACAGACCCTTACGACACTATTGGCAGCAAGCTTCAGAGGCAGGCTGGGTAGAGAGGAGTCGACCGGTGTGTGGCACTTGTGGAAGGCGACATTGGGGACGATGCCTGGCTGGCTTTGGAGTTTGTTTTCACTGCAGAGAGGAGGGACATTCACTTGACAGATGCTCTAACAGAAACAGGTCGAGTAGTAGAAGCCAATCTACCGGTTTTAGTCAGAGGGGTTCGAGCGCCCCACAGCAGCAGCAGCAAGGCCGAGTGTTCACTACAACTCGGCGAGAGGCATACAAATCTAATTCAGTGGTGACAGGTACACTCCCTATCTTGGGGTATTATGCTTTAGCTCTATTTGATTCAGACTCGTCGCATTCTTTCATTTCATCTTTGTTTGTGAGGCGGGCCATGTTAGAACTAGAACCTCTGCATTATGTGTTATCAGTTTCGACTCCGTCAGGAGAACTTGTGTTAGCTAGTGAG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mRNA sequence

ATGCTAAAAATTATGGCAGGACAATACAGTGCTGTGAAGGCTGAGGCTTGGCCTGAAGGTCAGCCCAACAATAGAACCCCTTATCTGAAACAGACAGGTAAGTCTGTGGACCGGAGTAGTGCTCATGATCGGATCGAGCGGACAAGTCCAGTTGGTGATGATCATCGGGTTGGTGATGATTGCCATAACGTCGACCCCATGACAGTTGTAGCTGACGAAGCCTCGAGTGTTCACGAGCAGATGGACGAGGTATGA

Coding sequence (CDS)

ATGCTAAAAATTATGGCAGGACAATACAGTGCTGTGAAGGCTGAGGCTTGGCCTGAAGGTCAGCCCAACAATAGAACCCCTTATCTGAAACAGACAGGTAAGTCTGTGGACCGGAGTAGTGCTCATGATCGGATCGAGCGGACAAGTCCAGTTGGTGATGATCATCGGGTTGGTGATGATTGCCATAACGTCGACCCCATGACAGTTGTAGCTGACGAAGCCTCGAGTGTTCACGAGCAGATGGACGAGGTATGA

Protein sequence

MLKIMAGQYSAVKAEAWPEGQPNNRTPYLKQTGKSVDRSSAHDRIERTSPVGDDHRVGDDCHNVDPMTVVADEASSVHEQMDEV

Homology

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of HG10011667 vs.


Match Name	E-value	Identity	Description

BLAST of HG10011667 vs.


Match Name	E-value	Identity	Description

BLAST of HG10011667 vs.


Match Name	E-value	Identity	Description

BLAST of HG10011667 vs.


Match Name	E-value	Identity	Description

InterPro

Analysis Name: InterPro Annotations of Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1
Date Performed: 2022-08-01

Position :

Zoom :

x 1


IPR Term	IPR Description	Source	Source Term	Source Description	Alignment
None	No IPR available	MOBIDB_LITE	mobidb-lite	disorder_prediction	coord: 36..62
None	No IPR available	MOBIDB_LITE	mobidb-lite	disorder_prediction	coord: 17..63

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:


Feature Name	Unique Name	Type
HG10011667.1	HG10011667.1	mRNA