HG10010213 (gene) Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: CDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGCGTTCCGATTAGGAGCTTGTCCACGCGCCACCGTCGCCTCTCATTTTCCCCAACTCAATCACAACAACTTTCTCATTCGAGAGGTTGAGATTCAGCGGGTGAGAGGCGCGAGGAGACTGAGAATTAGGGTTTCGGATGGAGGAGAATCGTATCTCGGGATGTGGAAGAACGCGGTGGAGCGCCAGAGGAAATCTATTGAGTTTCAGAAAGTTATTGAGAATGCTGTTGGAAATGACGATCTCAATGGCGGTGATCGAAGTGCTGATCAGTTGGAGAAGAAGAGCGAGGAGTTCAGTAAGATTCTTCAGGTCCCGGCGGAGGAGAGGGATCGGATTCAGCGGATGCAGGTCATTCATCGAGCTGCTGCCGCCATTGCAGCTGCTCGTGCACTTATTGGTGAGACTGGAATGGTAGCTGTGGGAGACTCGAGTTCGCACGATTTGAATATTTCTCTGAATTTGAACAGTAGTAATAACGGTGGACTACTCGATCGTGAAGAAGGTATGATTAGCATTATTGAATCTTGAAGAAATTGATCTGTTTTGTTGACTATTAAAGCCCTAAAGTTTTAATAATATGAGTTGAGGTCGAGTTACATATTTATATAAATTATTGGCTCTTTCTTTACTGTATTTGACTTTCTTTCAAGTTGAGCTTTGAATATTACTAGTAGGTAACATATTTCCGTTTTGCTTGTTACCGAATGAATATACTTTCAGTCTGACCAGGCATATCTTCTCTGAGTTTATTGATTAATTAATGTAGATCCGTATCAATATCCTAATACAGGAAATAATGGCAGTGTCGACTAGCAAGACTAGAAAAGAATAAAGACCTAGTGTTATTGTGGTTCACTTACTAACTCTTTCTTTTTCTATATTTGTTAATTTCTTTATTGTTTATGATTCATCTAGCACTATCTGAATTTCAAAGTGAGAACACCCTGCTGCCTGAGTCTGAAACTTCACAAACTGGGACCCCTGGTCCAGATTTCTGGTCTTGGACGCCCCCTTCAGATAATGATGGGAATGGTAATGCTTTCAGTGAGTTGCGACCAATTGGGAAATCAGAGGCATATCCAATGTTATCCAATTTTGTTGAGGAGAAAGAGCCACCGGTTGGCTTTCTCTCAATTCCATTTCAGAGTGAAATCTCTGAAAGCGTCAAATCTCTTCTACCACCCTTTCAGTCATTGGTGGGTATTGAAAAATTAGAATCATCAGAAACCAGTACAGAGACACATTCCTTGGAAGAAGATGAAAATGTTGGGATAGAGTTTTCGGTACACGCAGCAGAAGCATCACAGGCACTTAGTAGTGTAGATAAGGAATCAACAAAGGGAATAGATCCAGATGGGTCACGATGGTGGAAGGAGACAGGAGTTGAGCAGAGACCAGATGGTGTGATTTGCACGTGGACACTAATGAGGGGAGTTAGTGCAGACCTAGCCACTGAGTGGCAGAACAAATATTGGGAAGCTGCTGATGAGTTTGGCTATAAGGAACTTGGTTCAGAGAAATCTGGTCGCGATGCCTATGGGAATGTTTGGCGTGAATATTGGAGAGAATCTATGCGGCAGGTCAGTTTGAATTTTTGTTGATTTGCTTGTTTCTATCACATTATCCTTGTAAAATATATGCTTTATGCAAACAGTTAAAGTCTCAATCGTTTGTTTTGCCATCTGCAGAAAGATCGATTTTGATTGCAATATATGTTTTATGCACTCACTTAATGGGCTGAATGGACAGTTCACATCCATCTTTGAAATTGAAGTGATACGCATATCACTCATTGGAGGTTGGGATAAGATGGAAATGCATCTATGAGTGTGTAATGTACTAAGTGTCAGTTGATATCAAGCAGATACTTTCGTGTCCTTCTCTCTGATATTTTTAAAGGATTTACTTATGTTTAGATGTCTGGAAATGACGTGAGATCCATCTCTATAGTGAATTGTGGAAATTACTTTATTTCTTCCTCCAATTCATTCTCTCAACACCCCGCAGCTAACATTTGGTTCCTAATTTCAATTGTTGCAGCAAGCAATCTTTTTTATGACCTTAACTGAACTAACTCTCTTTCAGGAGCAAGGCCTTGTTCACCTTGAAAAAATTGCAGACAAGTGGGGAAAAAATGGAAGTGGCACCGAGTGGCAAGAGAAATGGTGGGAATACTATAATACCTCTGGTCAAACTGAAAAAAATGCTCATAAATGGTGTAAAATTGATCCGTACACATATATTGATCCGGGTCATGCTCATATCTGGCATGAAAGGTATCGATTTTTTCAAATGTTAGATATTTTAATCAACTATTATTCTTGTTGTCCTCTTGACTTGGTCTTTATGATGCTTTCTCAATCCTCTGATTACCTTTTTCAAGATTTTGTACATTTACTTTGGTGACATGCTTCTCAAAAAATTGTCTATTTCGATCTGCTTTAGCATCTACCTTTCCTCTTGCAGTTGGGGTGAAAAGTATGATGGACAAGGTGGCAGCATTAAGTACACAGATAAGTGGGCTGAACGATATGAAGGTGATGGTTGGACGAAGTGGGGTGACAAATGGGATGAAAACTTTGATCCAAATGGTCATGGTGTCAAACAGGGGGAAACTTGGTGGGAAGGTAAACATGGAGAACGGTGGAACCGTACATGGGGTGAGGGCCACAATGGTTCGGGCTGGGTTCACAAGTATGGAAAGAGCAGCAGTGGGGAGCATTGGGACACACACGCTCAGCAGGAAACCTGGTATGAGAGATTCCCACACTTTGGCTTTTATCACTGCTTCAACAATTCAGTCCAGCTCCGGGAAGTTCAGAAACCATCTGAGACGGATTCGTAAGTCATCTTTCCTTACTGACAGGTGAATATAAAAGCTAGTAGAATAGCGCATTTTGAAGAATATAGAATGCTTTATGAGGTTTGATACCGTTTTCCTGGCATTGTACATGTAATAAAGAAAACTGCACAACATATTCCAAGTTTGCAGTGTTATTAGGAAACCTTTTAAGTGAATAAATTAGCTTTCTTTCTTTATTTTCTGAGATGCTATTAGAAAGCCGCAAATATTGAAAAGATCCCATACCCTGCATTATTCCCCTCCTCCACCACCACCTAAAGAAGCAAGAAAGCAACAACTGCACTTCCTCCTGTCTTTTCAATTAATTATATGTTTGCCGTATACAGAAGTAGAAGTACCATTAATTTGAGACTGCTGGGGACAATGCCATTTGTACATGAATTGTATGGTCATGGGTAGTGTTTTAAAAAGTCCTTCCAGGCGCGCGACCAGGCTCAAGGTATAAATCTGGTGCCTCGCTTTGAAAAGGCAAGCTCACAGAATAAGGCACGCCTCAAGTGCGTGCCTTTTGTGAAGCCACAAGGCCCAAAGCCGGGGCCTTGGGGCTTTTTCATTATTTTTAAAAACTAGTAATAAAATAGAGTTTTTTCTTCTTTGTTAACTAAAAAAATTGAATTTACGAAGTCTACATACAAAATGTATTGTGTTCATGGGTCTTTTTTTTCATATTTCCACTTCAACTATTATTTTTTTCTTTATGTAGTACTTTATATTTAGTGCGCTTCACAAATAAAAGTCCGTGTTTTTTTTGCGCCTTGTGCTAAAGTCTAGAAGACCATTGTGCTTTATTGTGCTTGAACTTTAAAAAACACTGGCCATAAGAGTCATCACAAGTGCAATTGGAATCTAAAATTTTATTGTTATATTAAAATCAAAGTTTATTTAGACTAGACGCGTGTATGATTTAGACTGTCCAGGCTGTGGTTGTGATTACTTATGCTGGAGTATTGACTTATTGTTCAAATGAGAGCTCTCACATCCTAAGTTCAACCTTGAAACTTTCTTCCTAAGTTTCTATTTTTGAACAGTAGACTTTGGACCTGATTAGTTTACCATTTTAAGTCTAAATTGGCAATTTCCTCCCTTCTCTTCTAGTACGGTGAAAGTACGGTTCATTAAGAATATGAAAGGTACAAACCATCAATAAAAAAAGTCATGGTTATAATGAGAATTTAGTGTAAAAGTAGGGCCCATTTCAAAATAATTTGTAAAAATCGAGTTCTCCCAAAATTATTTGTAAAATTAGAGGTAATTTTTTGTCTTTATTAGATTCAGTAACTAGCTAGAATTCTCTCTTTTAAAGAGACTGAATTGACTTTGTGGTCAATTGATAAGCGTCAACATGGCAGATTGGATGGCTAAATATATTTTTGAAAAATATCTAAATCTAATTTATATTCTAAAAAGGTCTAAATGAAAAATATTTAATTAAATTACACGATAATTAATAAAAAATGTGGACAAATATGCCCTTACCGTCAATCGAAAATAGTTATACTAAATTATAGATTCTATTAAAAAAAAATCCAAACAACTAATTTTAGTAACTATAACAAATGAAAAAAAAAACACAAAATCTAAATAACTAAATCTAAAAAAAATAATACATTTAAAATACCATAGGAATTTACTAAATCAGGCTAAAAATGTAAATATTTAAAAATTCAAGATTTAAATTCAGTGAATGTGGTTGTAGAGACAATGACAACAAAGTGATCTTATTTAGAATGTCCAAAAAATCTTCTTCCATCAAAACCAAAATCCCTCCTCCATGGTCGCCCCACCATTTGAGATTCCAATTTCACCATTCCCATCATCAATCTACAATGAACGACCTAAAACTCTCCATCACATTAAAATCGGATTTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATAGGCATGCAAATTTGAGTATGGTGTAATTGGAGGGAAAAATTGAAATAAAATAAAAATGGCTACACTAAATTAGATATTTTTCAAAACCACCTCCCCGATTTAAATATATCCTAAAATGGGGGAGGGGGATTGTGGACTCAAACGAATTTTAGTGTGCGAAATTATTTAAGGAAAAAAAAACTCTTGGACTCAAATGGCGTTGCTGTGCCGATCTGGTGTCGGAAGGGTTGAATGAA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Homology
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Match: KAA0057460.1 (uncharacterized protein E6C27_scaffold280G003400 [Cucumis melo var. makuwa] >TYK30158.1 uncharacterized protein E5676_scaffold216G001440 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 1050.4 bits (2715), Expect = 1.4e-302 Identity = 508/583 (87.14%), Postives = 535/583 (91.77%), Query Frame = 0
BLAST of HG10010213 vs. NCBI nr
Match: XP_023006712.1 (uncharacterized protein LOC111499367 [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 1040.0 bits (2688), Expect = 1.9e-299 Identity = 506/581 (87.09%), Postives = 528/581 (90.88%), Query Frame = 0
BLAST of HG10010213 vs. NCBI nr
Match: XP_023548665.1 (uncharacterized protein LOC111807253 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 1037.7 bits (2682), Expect = 9.4e-299 Identity = 505/581 (86.92%), Postives = 527/581 (90.71%), Query Frame = 0
BLAST of HG10010213 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O23320 (Calmodulin-like protein 8 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=CML8 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 166.0 bits (419), Expect = 3.2e-39 Identity = 87/129 (67.44%), Postives = 110/129 (85.27%), Query Frame = 0
BLAST of HG10010213 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9LIK5 (Calmodulin-like protein 11 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=CML11 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 164.9 bits (416), Expect = 7.1e-39 Identity = 86/129 (66.67%), Postives = 109/129 (84.50%), Query Frame = 0
BLAST of HG10010213 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P04464 (Calmodulin OS=Triticum aestivum OX=4565 PE=1 SV=3) HSP 1 Score: 161.0 bits (406), Expect = 1.0e-37 Identity = 85/129 (65.89%), Postives = 107/129 (82.95%), Query Frame = 0
BLAST of HG10010213 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P0DH95 (Calmodulin-1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=CAM1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 160.6 bits (405), Expect = 1.3e-37 Identity = 85/129 (65.89%), Postives = 107/129 (82.95%), Query Frame = 0
BLAST of HG10010213 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P0DH96 (Calmodulin-4 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=CAM4 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 160.6 bits (405), Expect = 1.3e-37 Identity = 85/129 (65.89%), Postives = 107/129 (82.95%), Query Frame = 0
BLAST of HG10010213 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7UQT1 (Uncharacterized protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold216G001440 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1050.4 bits (2715), Expect = 6.8e-303 Identity = 508/583 (87.14%), Postives = 535/583 (91.77%), Query Frame = 0
BLAST of HG10010213 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BMD1 (uncharacterized protein LOC103491223 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103491223 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1050.4 bits (2715), Expect = 6.8e-303 Identity = 508/583 (87.14%), Postives = 535/583 (91.77%), Query Frame = 0
BLAST of HG10010213 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1KWK6 (uncharacterized protein LOC111499367 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111499367 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1040.0 bits (2688), Expect = 9.2e-300 Identity = 506/581 (87.09%), Postives = 528/581 (90.88%), Query Frame = 0
BLAST of HG10010213 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1H328 (uncharacterized protein LOC111460038 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111460038 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1030.8 bits (2664), Expect = 5.6e-297 Identity = 500/581 (86.06%), Postives = 525/581 (90.36%), Query Frame = 0
BLAST of HG10010213 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0LNS6 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_2G215500 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1023.8 bits (2646), Expect = 6.8e-295 Identity = 496/583 (85.08%), Postives = 525/583 (90.05%), Query Frame = 0
BLAST of HG10010213 vs. TAIR 10
Match: AT3G55760.1 (unknown protein; LOCATED IN: chloroplast stroma, chloroplast; EXPRESSED IN: 16 plant structures; EXPRESSED DURING: 10 growth stages; BEST Arabidopsis thaliana protein match is: unknown protein (TAIR:AT1G42430.2); Has 176 Blast hits to 125 proteins in 40 species: Archae - 0; Bacteria - 3; Metazoa - 19; Fungi - 9; Plants - 81; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 64 (source: NCBI BLink). ) HSP 1 Score: 646.7 bits (1667), Expect = 4.3e-185 Identity = 320/541 (59.15%), Postives = 395/541 (73.01%), Query Frame = 0
BLAST of HG10010213 vs. TAIR 10
Match: AT3G55760.2 (unknown protein; LOCATED IN: chloroplast; EXPRESSED IN: 16 plant structures; EXPRESSED DURING: 10 growth stages; BEST Arabidopsis thaliana protein match is: unknown protein (TAIR:AT1G42430.2); Has 176 Blast hits to 125 proteins in 40 species: Archae - 0; Bacteria - 3; Metazoa - 19; Fungi - 9; Plants - 81; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 64 (source: NCBI BLink). ) HSP 1 Score: 646.7 bits (1667), Expect = 4.3e-185 Identity = 320/541 (59.15%), Postives = 395/541 (73.01%), Query Frame = 0
BLAST of HG10010213 vs. TAIR 10
Match: AT3G55760.3 (unknown protein; EXPRESSED IN: 16 plant structures; EXPRESSED DURING: 10 growth stages; BEST Arabidopsis thaliana protein match is: unknown protein (TAIR:AT1G42430.2). ) HSP 1 Score: 646.7 bits (1667), Expect = 4.3e-185 Identity = 320/541 (59.15%), Postives = 395/541 (73.01%), Query Frame = 0
BLAST of HG10010213 vs. TAIR 10
Match: AT1G42430.1 (unknown protein; BEST Arabidopsis thaliana protein match is: unknown protein (TAIR:AT3G55760.3); Has 186 Blast hits to 143 proteins in 47 species: Archae - 0; Bacteria - 23; Metazoa - 14; Fungi - 6; Plants - 87; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 56 (source: NCBI BLink). ) HSP 1 Score: 235.7 bits (600), Expect = 2.3e-61 Identity = 120/265 (45.28%), Postives = 167/265 (63.02%), Query Frame = 0
BLAST of HG10010213 vs. TAIR 10
Match: AT1G42430.2 (unknown protein; FUNCTIONS IN: molecular_function unknown; INVOLVED IN: biological_process unknown; LOCATED IN: cellular_component unknown; BEST Arabidopsis thaliana protein match is: unknown protein (TAIR:AT3G55760.3). ) HSP 1 Score: 235.7 bits (600), Expect = 2.3e-61 Identity = 120/265 (45.28%), Postives = 167/265 (63.02%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1
Date Performed: 2022-08-01
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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