HG10006949 (gene) Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: CDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGATTGTCAGGACTCCTCCACCGAAGAAGCAACGATCCGATGTTACGTCTCTGCCCGATTCCTCATCGGCAGGTGCCTCAGATCTTCCGCTCGTTATCTATGAAGATCCTCTTCCCTTGGTGCCAGCAACGACACAACCAGGCTTGTCGCAAGAGCCCTCTGAGCACATGCTCTGCACTTACCAATGTCGCCAAATGGTTCGGAATATTACTTCCCTCTCATCTTCTCAAATCTATGTATTGTTATTGAGTGAAGTTCGTTAGTTATTCAAAATGTTTGATGTTTCTGAATTCTATTGGGAGGCGTACATGCGTAGATGTTAACCTGTCTAAACCCAATTAACTATTCTGTTTAGATAGTGGTTTGAACAAACTCTTGAGTATCATGGTTTTCTTTTAGCAGGTAGTCTGATAGCCATGCGTTTCTAAACCGTGTTGAGGAATAAGGTCACAAGAAAACTTCTAAAATAGGAGGTGTTCATCTTAAAGCCAGGCGAACTCCAAATAGATTGTCCATTTTGACATTTCCACCCATTGCGTATGTTAGCTAAGTTACATTTTAAATCAGCCCTCAAATTTGAGCAGATCATAAGATATTTTGGGTAAATTTAGAGGGAGGCAAACAGCTGCCTCTTTCCCGATAGTTGTTGAGGTTTTTATTTAGAATCTGATACTTTGTGGCATAGCTATCTCTAGCAAGTACAGTACTGTTCGGATTGGTTGGTCCAGTGCCTCTCCTTCTCTTGGTAGTAGTAGATCATATATCATTCATTATTCTTTTGGTAGTAAAGCCTAGATTCTCTAGCTTATTGCAACAAAGCCAACTAGGAAAGGCCTAGATTTTAAGATTTGGTATAAAGAAATTGAGGGGATGAGATAGTTAGATACTTTTGTAATTTTGGCAATTGTTGCATTTTGCAACATCTAATTGGACTTGGTGTTTTTTGAGCGATTTTTCCTCACGAAGCTAATTGTTTCTGATATCTCTCAGCTTTTAGCTATGGAGGACCTTTCTTCCTGGCTCTACTTGTACTTTGATCAATAGAATTGTTTGGTTTAGGTCATGTTAAAATTTGATTATTTCCCGGAAGACATCATAATGTTTATAATATCAGTTAAGTCCCTTTAAAGCATCAACACTAGAAGAAAAGAGGACAATTTATAATCCCACTATGTAGGCGACTCATAGTCATCAATTAATAAGTGTGGACTACCCAAGCTTGGTAAGTATGTTATTTGAGCTACTTTTTTTTTTGAAAGTGAAACATAACTTTTTATTGATTTAATTGAAAGTTACTAATGCTCAAAGTACAAAGACAAAAATAAGAAGACAAAAAGCAATCCATCTACCATAATGCATAAGAACTAAGCGGGAAAAACAAAGGCATTCCAATTTAAACATATATCTTGAATAGAGAAGTCTGCAAAAGACTTGGAGAATCCAACCTCAACCTTTTCTCAACATATTCAACATACTCTAGTTGTTTTATCCTCCATGGAGTAGTTGATATTGTACGATTTATGTCACCTTCTAGAAATCTATGCCATGTCAAAGTATGTTTGGCCACTTGCAATCCTTGTTACTTATTTCACAATATTTATTATTTTATTATATTTTAGAAATCAAATGTCTTTGTTCCTTGACACATTAAACTTTAGTTTTAGAACTCACATACGAACTTCACACAATAAGCTTTCCAACACTTTCATATTTTGTCCCATGAACTGTTAATCTTGTTTATTTTTCAGGTGAAGTCAGACTTCTTAGATGCATTAAGCAATGCGGAGAAGCAAGTTCATGATTATGAATTGAAGTTGGGCGTGCTAACTGAGAACCTCTCCAAAATTGGTGAGAAGTCACTGGTCAGCATATAAGTTTATCTTAATTGCTGGAAGATGAAGTCTACGTAGTTCTATATTTTTAAAGAGAGTCAGAGACTAATGCTCAAAGATACGAACTTCCAAAAAGGGAGGATTAAAAAAGAAAGTGAAAAATACTTGGGAAATATAAAATCAACCTAATTTAAACAAATATCTTGTATGGAAAAAATCATTAAAGAGCTTGGAATATACCATCATGGGTTGGCCTAGTGGTAGTGAGAACTTTAAAAAAAAGGCCAAAGGGTTAAGGGGACAGGAGTTCAATCTATGGTGGCCACCTACCTAGGATTTAATATCCTACAGGTTTCCTTGACACCTAAATGTTGTAGGGTCAGACAGGTTGTCCCGTGAGATTAGTTGAGGTGCGTGTAAGGTGGCCTGAACACTCACAGATATAAAAAAAATAAAAAATAAAGAGCTTGGAATAAAAACTCATAGTTTTGCTGCCTCAAAAGGATCTAGCCAATGCCTACTATTGCTTTGCTTTCAAAAGATGATTACAGTTCAACTAAAATCTTGAAATAATAGCTTTTAACTGCATTAACTCATAACAAATGAAGCCGTGGAGGAAAACCTGGACGAATGAGCAATTGAAGTGTGTTCATGGAATCATTTGAGAAGAAGTGAATGAGCAAAGACTACTACATTATGGAAGTAAGAAACTGTTGTGTACTAATTAAGTTTTTCTGCATTTGGTTCAACAATGCAATGTTTTTTGTTGAAGATATTAAGAGAAAGTTGGTGATTCCTCTTTTGATCTCTTATTTGCATTGGTTTGAAGATTCCTTGGTTGAATTGTTGCAACTCACTGTGCATTTTCAAATTTTTAAGCAAGATAGAGATGATTTTGGTACAACTCGGTTGTCGAAACGTTGGTTAAAAGGCAAAGATGAAGAAGAGTGCAAAGAAATCTTCTCAGTTGATGAAGAAAGAAGAAGTCCTTTAATCATAGCCATTCCCGAATCCTTTGAGAAAGCAATGACTGATCACAACTATGCTTAGAAGGCAAAGGATCATGGAGATTGTTGATGATCTTCAAACAAATTTGAGAAAGAACTAAAGAGACAAGCAAAGACCCTTTTTTTTTAGTTAGAATCATGAGAGAATTTGTTATTACCCGGAAAAAATGACTCTTCAACTTCTTTTTTCCGAATATAGTGAAGGGGAAGAGTTCTAATTAAATGATAAGCTTTTGCATTAATGGGAGCTCATTGATTACTAGTTGGAATAAATCCTTCAACATTAAAATCCTTGACAATGTTTGGACTTCCACTGTTTACCCCATTGGCTATGGCGATGTTTGAACTTCCACTAATTACACTCTCTTAAAAGTCACCAATTAAATTTATTTTTATTGAAATGTGTATTAATTCACTGGGGATAGCAACTGAGGCTGCTTTAACTCCTTTAGTGGGTGGCTAACTGAATTTCAGGCTGAAATCTCATTCTGTTGTCTCCAAACAAACCACTTCTTTGTTCACACTAGAAACTTTTGACGAATGCAAAGCTTGCATTAAACCATCTTCTTCAATCGAAGCCTGCTTTGAAGGAGAATTTTCTGGAAATATTATGCTCTTTTTTTTTTTTTTTAAACATAGAACTGACTATCTTTTTTTGTGGAGAACGAACAAGGAAATTTCCTTCTAGATTTCCAATTGATCCAAAAGGATTCCTTGAAATAGATGGAATTGTGGGAATAGATTCATAAAAATCAACTTCAGAACTCTAGAGCTTCTTTTACTTTATGCCTTATTTTCTTTTGGTACTTTTGGAGTTTATACCTTTCAACGAAAATGTCTTTCCATTCACTTAACAAAAAGTTTCGTATCTTGTCAAAGAACAAATGATTCACAAAAATCAACTTCAGAACTTTGGATTTGAGGATCAATGCCTTCATCTTCCATAGCTTTCTTAAAACGAAGTAGATCAATTGGATTTGAAAAGTCACATAGGGGGTGTTTGGTTCACCAACATGAGTTGGGTTGAGTTGGTAAAATTACCAACTCAATGTTTGGCCCACCAACTTTAAATGTTGGTGGAGTTGAGTTGGTTATTTTTACCAACTCACTCTAACTCACCCCAACTCTCCCTTCCTTCAATGTTTTCGATGACTTCACCCGTCGATCATCGTTGGTGACTACTGCTGCCACACTCCGGCGACCAACTTCAACTACCACCTTCGAGCGGCCAACTCTGGCGACCAACTCCGAGCATTGACAACCACCTCCAACGACCAACTCTGGTGAAGACCACCTTTGATGATCAACTTGGGTGACATCCACCTTTCACGCCAACACCATCATTCACCTCAAAAGACCACCTCTAATGATCAGCTTTGGCGACGACCACCTCCGACGACTAACTTTGATGATCACCTTGGACGACCAACTCCGATGACCACCTTCGTGCGACCAACTCTGGAAACCACCTCCGACGACAAACTCTGGCGAAAACCACCTCCAATGATCAACTCTGGTGACAACCACCTCTGACGACCAACGTTGACATTCACCTCAGTCTATTAATTCTCTTGGGAAAATGGAAAGAATAGGACGATTTCCATCATCCCGCAACATAGTTGAGATGTCCAGGTGCACCCGCTGATCCATTTTTTATTTGTTTTTCCATTTTTTGAGTATCTATTTGTATTTTGAGCATTAGTCTCATTTCATTATCTTAATGAAGAGGCTTGTTTCTTGTTTAAAAAAAATAAAATAAAATAATAGATTGACCTAAATTACTTTTGGCAAGTTTGATCAGTGTTTGATTAGCAAGGAGGGTTAATGAACACTTTGGTCTTGAATCGAGATTCCAAAATCATAGCAATCTTCTTCCAGTCATCTAGTCATTGTACACAAATAATCTTGATATCACCCATAGCTCATTGAAATCCTTATAGTACATTTCATGTTTTTTCTGGATCCAATAAGAATATTGAGAATTAGAGGAGGCAACTATCTTCTCAATGAAAATAGAGGACCGAAGGCTTTGCTTTTCCTTCAAATTTGGGTCAACCAAAACAGGGAAATGAGGACTTTGTTTTTCTCTCAAAACTTTTGCATAACTTTTGTCATTACTTTTCATTACCAAATATACTGACAGAGAAGAAGATT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BLAST of HG10006949 vs. NCBI nr
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BLAST of HG10006949 vs. NCBI nr
Match: KAG6601670.1 (Mitotic spindle checkpoint protein MAD1, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia] >KAG7032439.1 Mitotic spindle checkpoint protein MAD1 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]) HSP 1 Score: 1256.5 bits (3250), Expect = 0.0e+00 Identity = 685/727 (94.22%), Postives = 702/727 (96.56%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006949 vs. NCBI nr
Match: XP_008460594.1 (PREDICTED: mitotic spindle checkpoint protein MAD1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1255.0 bits (3246), Expect = 0.0e+00 Identity = 683/727 (93.95%), Postives = 705/727 (96.97%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006949 vs. NCBI nr
Match: XP_004142360.1 (mitotic spindle checkpoint protein MAD1 isoform X1 [Cucumis sativus] >KAE8648888.1 hypothetical protein Csa_008623 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1249.6 bits (3232), Expect = 0.0e+00 Identity = 681/727 (93.67%), Postives = 702/727 (96.56%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006949 vs. NCBI nr
Match: XP_022933081.1 (mitotic spindle checkpoint protein MAD1 [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 1248.0 bits (3228), Expect = 0.0e+00 Identity = 678/727 (93.26%), Postives = 702/727 (96.56%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006949 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9LTY1 (Mitotic spindle checkpoint protein MAD1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=MAD1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 818.5 bits (2113), Expect = 5.9e-236 Identity = 459/727 (63.14%), Postives = 578/727 (79.50%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006949 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9Y6D9 (Mitotic spindle assembly checkpoint protein MAD1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MAD1L1 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 93.6 bits (231), Expect = 9.9e-18 Identity = 171/723 (23.65%), Postives = 329/723 (45.50%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006949 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q80YF0 (Mitotic spindle assembly checkpoint protein MAD1 OS=Cricetulus griseus OX=10029 GN=MAD1L1 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 81.6 bits (200), Expect = 3.9e-14 Identity = 153/686 (22.30%), Postives = 307/686 (44.75%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006949 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9WTX8 (Mitotic spindle assembly checkpoint protein MAD1 OS=Mus musculus OX=10090 GN=Mad1l1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 81.6 bits (200), Expect = 3.9e-14 Identity = 147/705 (20.85%), Postives = 321/705 (45.53%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006949 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q86RN8 (Paramyosin OS=Rhipicephalus microplus OX=6941 GN=PRM PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 51.6 bits (122), Expect = 4.3e-05 Identity = 126/601 (20.97%), Postives = 262/601 (43.59%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006949 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CCD1 (mitotic spindle checkpoint protein MAD1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103499375 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1255.0 bits (3246), Expect = 0.0e+00 Identity = 683/727 (93.95%), Postives = 705/727 (96.97%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006949 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1EY58 (mitotic spindle checkpoint protein MAD1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111439783 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1248.0 bits (3228), Expect = 0.0e+00 Identity = 678/727 (93.26%), Postives = 702/727 (96.56%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006949 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1KBD3 (mitotic spindle checkpoint protein MAD1 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111492363 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1245.3 bits (3221), Expect = 0.0e+00 Identity = 679/727 (93.40%), Postives = 697/727 (95.87%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006949 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0KV95 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_5G630750 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1198.0 bits (3098), Expect = 0.0e+00 Identity = 653/699 (93.42%), Postives = 674/699 (96.42%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006949 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DLL9 (mitotic spindle checkpoint protein MAD1 isoform X1 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111022291 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1162.1 bits (3005), Expect = 0.0e+00 Identity = 630/727 (86.66%), Postives = 679/727 (93.40%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006949 vs. TAIR 10
Match: AT5G49880.1 (mitotic checkpoint family protein ) HSP 1 Score: 818.5 bits (2113), Expect = 4.2e-237 Identity = 459/727 (63.14%), Postives = 578/727 (79.50%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1
Date Performed: 2022-08-01
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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