
HG10006343 (gene) Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGAGACTAAAGCGACGAATTCGAAGGCGGTGGTGACGGACCAGACGAGTTCGTCGACGATCGGAATGTTGAGAAGGCCGCGAGGCCAGCGGCGGAACCAGGCGGAGCTCCAGTTCCATGAGAAAAGCGAGGAGAGGACGTCGGTCCACCGGAATATGGAGGATCTGAGGGAAAATTCGAATTCCATCCAACGGAATGCCGATCTCGGTGACCTGCCCGCCATTGTTGCTCTTTCGCCTTCCTGTAACTCTGGCGAGATTATAGAGAGAGAGACTATGTGGGCGGGGGACCGGGCTTATAAAACTTGGATACAGTGGGAATTATTAGGTGTGGCCGCGTATAGATAGAAATTTTTGCTCCCTATCTCGCTTGTAGAAGTTTCAAGAAATCGCTTTTTGTAGTAGTTTTTAGTTTTTAGATATTAACTTTAATTTTTTATTTAATTATATTTATGTTGAAAACTTTTACTTAATTTAAAAATTAAATGGTTACCAAACAAAGTTTAAAATTACCAAACAAAGTTTAAAATATGATTTTGGTTGTCTGTTTTAAAATTTATTCAATTTTAGTTTTTGTAATTTTAAATATTGAGTTTTAGTTTCTATAGTAATCAATTTTAAAACAAAAATTAGTTGTTTTTTTTAACATTATTACTATAAATTATGAAACACATCCATAATAGTATTTTAACCCATTAAGTGATTCACTTATCACAAAAAGAAAAAAAAGTACACATTAATTGGTATTAGATTGTGCTTTTTTTTTTCTTTTAATAAATTATGGGAATGAGAAATCAAACTTCTTCCTTTAAAAGAGATAATACATCTCAATTATCGTCGAGTTAAGCTTAATATGATTTCATATTGCTTTCTTCATTAATGATGTTTTTGTTTTTTTTTTTAATATTTCGTTAGGCGTTTTCATAGCGTGATGAAAATAGCTACTAGCTTCGTATATCTACGTCGACTTCATGGACTTATAAAACATAATGTAAATTTCAACGTCAACAAAACTTAACCATTTCTCAAACTAAATATAGTTCAACAGGTTTGTACCTTTAACCAAATTGTCGTGAGTTTGAATCTCTATACTCACACGTCCTAAAACGTAATTTGTGATTTAATCTTATTGTTATTATTTTTAGTCCTTAAATTTTTAAATTTGTATCTATTTGATTTTTAAACTTTCAAATTTGTCTAATATGTTTATAAACTTTCAATATAACATACTTGTAATAAGTCCTTAAATTTCCATGTTGTATCTAATATATTTTTCAATTTTTAATTTTGTATTAGACCAATTCAATATTTTTTAAAATTAATAAATTTACTCAACGTGAAAATTAAAATATTATAGTTTTATTAGACAAAAAATTAAAATTTAGATCTAATAATTTAAAAAAAATTAAGTTTAAGAATGTATCTGTCGTTTAAATACAAAATTTGAGAGTAAACACAACGATTGAACTTATAATTTAACATGATAATAAAAAAATCAAAATAACATAATCAAACTTTTCTTCTTTATCGAAGAGGCTAAAGACATAACATATGTTTTGTGAAATATTTTGTTTTCACGTTCGTCTATCTCACAATGTTTTGACGCACACTCTTGTATTAAAGGCTTCGAACAAGCGAAATTCTCTTACATTATTCTCTCCTTATGGTTTGTTTTGCGCATGTCCCGTGATGTAATTTTTTCAAGCTTCTTATATTGTTTTTCTCATAAAAATAATAATAATAAATAATAGAAAAATTATTATAAATAAAAAAATATCAAATTATTTATAAAATATAGAATTTTTTTACTATCTATCAGCAATAGACTTCTATCGATAGTAAAATTTTTCTATATTTGTAAATAATTTAGATCATTTTTTTATATTTAAAAACAGTCTCGGTAATAACAATAAAATTAAACACTCCAATTATTTTTAAAAGAAAAAAACAGTTACGGCACTTGCTTTACACGCGCTGGACGAGGAGGTGGGGCTGCAGACTTATCCGAGAGTATGGCAACGCTGGCGGCGGTGATTGCCTAATACAGAGAAACTCGGGCCCGCGTTGAGCTGGAATCCAATGTGGTGGCTCACGCCAAACACTATTCTGTAAGATAAATCTGAGCCGTAAATCCTAGGTCAATTATGGAGAAAAAGAGATTGAGGTTTGATGTACGGTTGTGATGAAGGGTTCAAAAAGTGTAGGGTGGGGAGGGACGTTGACGGATTGCTAATTCCAATATTTTAGAAGGGTGTTTGGTTACGGTGCTTCTAATTTAAATAATTGGAGGGAAAAACTTTGAAACTCAGGATTATTTTGTCTTGTAGTGTAATTTTGAAATTGCAATCTTAGTACTCTCAATCAACGTATAAGGTGCGTTTAGAATATATTTTTAAGTATTTAATTTAGAAAATAAGTTATTTTGAAAAAAATTAAAATGTTTGGTAACCACTCAAAATAGATTTTGTAGTGTATTTTGAATAATTTGATCAAAAGAGTTTAAATAAAAATGATTTTTTCGAAAAACATTTTTTAAGTCAATCCAAACGGACCTAAGGATGATGTTGACAACAATGTCAAGTATTATTTTCATGAAAATATTGATCAAATTGATCCAATAATGATGTTGATGGATATTTTTTAAAATAGATTATAAAATTTAAAATCTTTAATAAATTGTTTAAATTAGTAAATAAGTATTTTATGTTTTTTAAACAATATGAAATGTTTATTACTTATATTATAATAGAAAATTTTTATAGATAGAAAAAATGACAAACTATTTACAGAAAATAGCAAAAAAAAAATACTGATAGACATTGATAGACTTCTATCAGCGTCTATCACAACTATATAAAAATTTTACTATTTTGTGTAAATAGTTTTCCTCATTTTTCTATTTTTAAAAACTCCCCTATTATAATCTCGTTGGTGACATTTTAGTGATTATTTTTTCGTATGCGCTCAGTTTATTATTTTTGGAAAAATTTATCTTCTTAGTCTCTAAATTTTAAACGTGCATTTGGTCGTTGAATTTTTAAAATGTGTCTTTTTAGTCTTGGAGTTTATAAGAAGAGTTGTTTTCAAATATAGAAAAATGGCCAAACTATTTAGAAATATAGAAAAATTTTACTGTCTATCAGCGATAGACTATAATAGAATTCTATCGCTCCAGTGATAGACAACGATAGAAGTCTATTGTTCAAACGATAGAATTCTATCATGGTCTATTGCTGATAGACGGTAAAAATTTTATATATTTTCAAATAGTTTGATATTTTTTTGTTTTTCTTATAAAAATGAGTTAAAAGGTTTTTGAAGATTTTTCTATTTAAAACTATTTTTTTTAATCTAATTCTTTTAAATAATAAAAAAAAATATTACTTTTAAGGACATTTTAAATTTATTCTTAAATATAGGGACTGAACTAGAAAAAAGTAAAATTTATATTATTTTGGAAAAATCTTTTCCAAACCGAAGAGGCAAATATAAGTATAACTAGAAACATCACAAGATCAACAATTGTTGAAAAAACGAATTATAAAATTTTAAATGGATGACGATTTCAAGAAAAAAAAACTTACCGTAAATAATATTATTTCATAAAAGAGAATTTATCATAAACAAAATGTATTGATCAAAATATAATTTATTACGGGTAATTTTAGATCGAAGGACATAATTGACATAAAATAAAAATAGAAGCAACAAAATGGAGAGAATAACAAAGTTTGGGCCAAAGACACTAGTCCGTATCAAAGCCCAATTAATGTACTCGGCCAAAGTCGAGATCGAGCCTAGCAAAATAGCTAATGGGGCATGTCCCGACCCAAAGCATCACCTTAGGACCAAAATAGGCATAAGGGAAGATGCTCGACCTCAGGCAAGGCTGGGACCGACCCTAACCAAACGCGAAATAGGGTATGCCCCTCAATTTGGTAAGTTGTATGATTATCCTAAACTGACTCTGAAACCCTATTTGAACAATCTATGTCAATCACCTCTATAGATACATTATTATAATTTTGTATAAAGTAACTTGAATATATCCTATTCTCAAACTTCTTAGTTTCTACACTCTTGCACTCTCTAACTTAAACATTGGAGTGTGTGTGCAAACACCACACTTGTATGCAAATTTTCTCTTTGGCAGGTCACATTCTTCTCTCCTTCAAACAAACTCACTGTTGGTGTCACGTGAAGGTCAGATGCATTTCCTCTATTCAGATTTTGGCATCAACATAATTGGTTAGTAATCATGGACTAAAATTAAATGAATAACTAACTCGAATTGCAAAGTTTATGGTATTGTAAGGGATCAAAAGTACATTGGAAAGTTGCCCTTTTTTAAAATGAATTGGCCAAGGGAGGTGGCAAATTTGGATAACCTTATTACTGGTTTTCTTAATAATCTAGATGGTGAGTCTATGAAGGGGTTTCTAGTAATGATGTGTGTCTTTTGGAATAGAAAGAATAAGGAGATTGTGTATCAGGTGGGCTTGAAAAACTGATCTTGGCAGAAACACTTGGGAGTAGGAGTGTTGGATTATACTACTCATTTTTGAGAAATGAAATTTCGATACTATATAATCCCAACATTTTCTTTCCAAGTTTTTGCAGATAGACTCCTCTACAAAGCGGTTTGATAAGACGAATACAAATGTGTCAATTAGTTTAAAAGATAGAGAAAATGCAACAATTTAGCCATGAAATGGCACGTTGGACTTTGAAGATGAAACAAATTTGTGATTCTAACAGAAGATGTACATGAGGATCTAATAAAATTTTATGTAAGTGAAATTAACAAAAGAATTATTGAAACTGGAGGAGATCAAGTTGAAGACTAATTTGGTTAAATGACCCTTGAGGCTCATTTTATTTTCTTTGTGGTGTTGTTGTAAAAAAAAAATCATTTGTGTCTCACACTTTAGAATTTGTTTCATTTTCATCTTTTAATATATACATATATATTGAGGGTTCTTTTCTAAGCTTTC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METKATNSKAVVTDQTSSSTIGMLRRPRGQRRNQAELQFHEKSEERTSVHRNMEDLRENSNSIQRNADLGDLPAIVALSPSCIREDARPQARLGPTLTKREIGAVPVSSKVSTNPSSIHQSIHQIANQKTAHFAHSKAKAARPTAQSQSQSQTQTQTHQLQPLKSPPDALCSSFQPPHFSSNTCFLIQQQPTSPPAMSLRPTTRTDVRKKSYKTGVDADEARRRREDNLVEIRKNKREDNLLKKRREGLLLHSQQLLDAAQNAAVSEKRLESIPVLVQGVWSADTAGQLEATTQFRKLLSIERSPPIDEVIKAGVVPKFVEFLGRHDLPQLQFEAAWALTNIASGTSEHTRVVIDHGAVPIFVNLLSSGSDDVREQAVWALGNVAGDSPSCRDLVLSHGALVPLLGQLNEHSKLSMLRNATWTLSNFCRGKPPTPFDQVKPALPVLRQLIHLNDEEVLTDACWALSYLSDGPNEKIQAVIEAGVCPRLVELLLHQSPSVLVPALRTVGNIVTGDDAQTQFVIDNQVLPNLYQLLTQNHKKSIKKEACWTISNITAGNRAQIQAVIEANIILPLVHLLQHAEFDIKKEAGWAISNATSGGSHQQIQFLVTQGCIKPLCDLLTCPDPRIVTVCLEGLDNILKVGEADKDMGMNGGINIYAQAIDECEGLDKIENLQSHDNNEIYEKAVKMLERYWAEEDEEQEQNPQQNGDVNQHGFAFGANQPNVPPGGFKFG Homology
BLAST of HG10006343 vs. NCBI nr
Match: XP_008453295.1 (PREDICTED: importin subunit alpha-4 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1062.4 bits (2746), Expect = 1.8e-306 Identity = 531/536 (99.07%), Postives = 532/536 (99.25%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006343 vs. NCBI nr
Match: XP_038890641.1 (importin subunit alpha-4 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1061.6 bits (2744), Expect = 3.0e-306 Identity = 532/536 (99.25%), Postives = 533/536 (99.44%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006343 vs. NCBI nr
Match: XP_004144743.1 (importin subunit alpha-4 [Cucumis sativus] >KGN61011.1 hypothetical protein Csa_021139 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1057.7 bits (2734), Expect = 4.4e-305 Identity = 531/537 (98.88%), Postives = 532/537 (99.07%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006343 vs. NCBI nr
Match: KAA0048080.1 (importin subunit alpha-4 [Cucumis melo var. makuwa] >TYJ96457.1 importin subunit alpha-4 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 1057.4 bits (2733), Expect = 5.7e-305 Identity = 531/538 (98.70%), Postives = 532/538 (98.88%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006343 vs. NCBI nr
Match: XP_022937803.1 (importin subunit alpha-4-like [Cucurbita moschata] >KAG6586208.1 Importin subunit alpha-4, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 1043.9 bits (2698), Expect = 6.6e-301 Identity = 519/536 (96.83%), Postives = 528/536 (98.51%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006343 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O80480 (Importin subunit alpha-4 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=IMPA4 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 873.2 bits (2255), Expect = 2.0e-252 Identity = 440/540 (81.48%), Postives = 488/540 (90.37%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006343 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q96321 (Importin subunit alpha-1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=IMPA1 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 784.6 bits (2025), Expect = 9.4e-226 Identity = 397/535 (74.21%), Postives = 453/535 (84.67%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006343 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O22478 (Importin subunit alpha OS=Solanum lycopersicum OX=4081 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 777.7 bits (2007), Expect = 1.2e-223 Identity = 396/537 (73.74%), Postives = 447/537 (83.24%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006343 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9SLX0 (Importin subunit alpha-1b OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=Os05g0155601 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 773.9 bits (1997), Expect = 1.7e-222 Identity = 396/539 (73.47%), Postives = 448/539 (83.12%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006343 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: F4JL11 (Importin subunit alpha-2 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=IMPA2 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 771.9 bits (1992), Expect = 6.3e-222 Identity = 396/540 (73.33%), Postives = 447/540 (82.78%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006343 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BVB8 (Importin subunit alpha OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103494054 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1062.4 bits (2746), Expect = 8.7e-307 Identity = 531/536 (99.07%), Postives = 532/536 (99.25%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006343 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0LM44 (Importin subunit alpha OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_2G034640 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1057.7 bits (2734), Expect = 2.1e-305 Identity = 531/537 (98.88%), Postives = 532/537 (99.07%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006343 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3BBG2 (Importin subunit alpha OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold546G00980 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1057.4 bits (2733), Expect = 2.8e-305 Identity = 531/538 (98.70%), Postives = 532/538 (98.88%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006343 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1FH16 (Importin subunit alpha OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111444088 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1043.9 bits (2698), Expect = 3.2e-301 Identity = 519/536 (96.83%), Postives = 528/536 (98.51%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006343 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1HPD0 (Importin subunit alpha OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111465499 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1042.7 bits (2695), Expect = 7.1e-301 Identity = 519/536 (96.83%), Postives = 528/536 (98.51%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006343 vs. TAIR 10
Match: AT1G09270.1 (importin alpha isoform 4 ) HSP 1 Score: 873.2 bits (2255), Expect = 1.4e-253 Identity = 440/540 (81.48%), Postives = 488/540 (90.37%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006343 vs. TAIR 10
Match: AT1G09270.2 (importin alpha isoform 4 ) HSP 1 Score: 873.2 bits (2255), Expect = 1.4e-253 Identity = 440/540 (81.48%), Postives = 488/540 (90.37%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006343 vs. TAIR 10
Match: AT3G06720.1 (importin alpha isoform 1 ) HSP 1 Score: 784.6 bits (2025), Expect = 6.7e-227 Identity = 397/535 (74.21%), Postives = 453/535 (84.67%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006343 vs. TAIR 10
Match: AT3G06720.2 (importin alpha isoform 1 ) HSP 1 Score: 784.6 bits (2025), Expect = 6.7e-227 Identity = 397/535 (74.21%), Postives = 453/535 (84.67%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006343 vs. TAIR 10
Match: AT4G16143.1 (importin alpha isoform 2 ) HSP 1 Score: 771.9 bits (1992), Expect = 4.5e-223 Identity = 396/540 (73.33%), Postives = 447/540 (82.78%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1
Date Performed: 2022-08-01 Position : 0 Zoom : x 1
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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