HG10005978 (gene) Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1

Overview


Name	HG10005978
Type	gene
Organism	Lagenaria siceraria cv. Hangzhou Gourd (Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1)
Description	Late embryogenesis abundant protein (LEA) family protein
Location	Chr07: 10548939 .. 10570022 (-)
RNA-Seq Expression	HG10005978
Synteny	HG10005978

Sequences

The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideCDS

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CGATCGCCACACGTCCGGTCGCTGGTCATTGCTTTCCTCTCTCTCTATCTTTCTTTCTCTCTCTCTATCAATTGATTATTTATGGCAAATATGGAATAACAAATAATTAAAAATCAAGATTTGAAGTTTTTGCCATATTTACAAAATATCAAATATAGACATACCTACAAAATAGCATATTCAAATTTTTCACCTATTGCAATCTCCCTACTATTATGTTATATATGTATATTTGTGTGAAAGATAGTGCTTTTTAGTTTATGAATTTTTGAAAGAAGGGTTATCTAACATACGATGTAACTTGTTACACTACAAGAAAAAAGGTTTTCGTTGGTGCCAATATTGTTGACGCCTAAAAAGGCGTCGGCATAAATGGGCCATCCCGACGCCAGAATTTTATGCGTCGGGAGAAAGTACCTATCTCGATGCCTCAACATAAGCATCAGGATAGAAGAGGGCTACACCGAAGCCTTTATAGGTTGGCGTCGACATAGTGTCCATATCCCGACGCTCGACTATGGTGTCGGGATAGCGGGTCTTTCCCGACGCTTTTAGTGGCATCAGGAAAGACCCAATTAAAGGCCCTAGTTTTTTTTTTCCAATCCATCTCTTTCTACTCTCTCTCACAACGACTGCGACCCCCCCGCACAATTCTCTGCGATCCCCCCGCCCAATTGCATCTCTTTCACCTCTCTCTTTCTTTCACTGTCGGTCGTCGCGTTTAGCCCTCTTTCCCGTCGTTGCCCTCAGCCCACTCGCCTCCACTTCGCCACCGGTCACCTAATTCTCAGGCTGGTAAGATTTTTCACACCTTATTTTCTTCCTTTTAGCATTTATGTTTTTTTACTTGAAATTTCTTAAACTATGTTATATCAAATTTCTAAGTAGAGGAGGAGGATAGGTTTAGTTAGTTCAAATTTAGTTTTTTAGTTAATTTTTCTTTGAAATTTTTTGAAACCATGTATGTAAAAGTTATAAAAAATAAAGAAAATAATTTTATTTGTTTGAAGTTTGGATTGAGAGAAAACCTTGCTTGTTAGATTGAGAGAATTAAACTTGATTGTTAATGGTGCGTTGAGGATTGATGAGGTAAACTTAAGTTTCTAACTTTACAATGTTTATTTGTTTTAAATTAACAATATTTGATCTAAAAGAGGGGAATGATCTTATTTGGTTTAAATTTACAATCTTTGATCTAAAAGAGAGCAATGAGTTTCTTTACTTGTTTGTGTATGATATGGTTCTTATTCGTTTGTTTTGAAATAATTTGATTGTAATAGTTTAGTTTGTTTTGAGCTTAATGTGTTTAAATAAAGTATATAGTTCTTTAGTTTAGAATTTTGGTTTGTTTGCTTAAGTTTATTTGTTTTAAATTTAGCATTTGAGTTTGTTTGCTTTAGTTTATTTGTATTAAATTTTAATTAAGATCTAACATTAATTGTTCGATTGAGATCAAACTTGGGTTGTTCAAGGCTCTAAATTTAGGTTGTTAAAACTTTTATAAACAAAAAATGGGAATGAGTTTATTTGCTTTAAACTTAGGTATTCTCAATTTTGTTCCTTTATTTGAGCTATTTGGTCTCCACTTGCTTATGATTTAGTTTGTTTGAAGCTTGATGTTTTCAAAAAAATTATATAGATATGTTTGGTTTTAGTTTAGATTATGCAAACCTTTCAATACATGCCTTGAAAGAACCTAATACAAGTCAAAATTACTCTCAATGTTAAAATATAAGTTAAATATCCTAACTCATAAGTAAAGTCTAACTTTTTGTACAATTTTTATAGGCTTATAAATTTTGTGAATCAAGAGGGAGTTGAAAAGTATATCATTACGAATGAATAAAGATTGGATTAAATTTCGAGATAAATTTTTAACAGATTATAAGGAAGGAGTAGCTCAATTCCTTGAAGTAGCAAAGTCTCATGTTAATAACTCTTGAAAAACAAGATGTCCATGTAAACATTATATGAATACAATATGGGAATCATTAGACAGGGTAAAACGACATCTATTCACAAATGGAATGTCTCCTTCGTATAGTAAATGGGTCTATCATGGAGAACCGGTTACTTTATTGAGGGAATTTGAGTAGAGAACTCATTCAATAATACACAATGATGTATTACATAATACAAAGCTTAACGATGTGAATGAAGATAATGATATTTTGAATATTCTAAATGATCTACAAGTTTGAGCTGATGAAGTAGATTTAGATGAAGAAGATATTGAAAATGAGATGCCCACTAATGTCCAAGAAGGAGATAATTCAAACCTATTTGAGGATTTAATGGCTGACGCACGTAATCCGTTGTACCTAGGTTGTTCAAAATTTTCTTCATTGAATTTTTTAGTGCAGTTGATGCATATTAAAGTTCTTAACTGTTGGAGCAACAAGTCTTTTGATATATTGCTCGAATTGTTAAAGGACGCATTTCTAACCAAGGCAAGTATACCTAGTTTATTTTATGAAGCTAAGAGAAAGTTGTGTGATTTAGGGCTAGGCTATGACTCCATTCATGCTTGCAAATATGATTGCACATTATATTGGAAAGAAAATATTGATTGTCAACAATGAGTATGTGGTGAATCTCGATATAAAGTTAATGATGGAAAAGGTAAAAAGGTCCCACATAAGGTTTTACGTCATTTTCTATTAATACCGAGATTGAAACGATTGTTTGCATCAAAACATTTTGCATCTGAAATGAGGTGGCATAAAGATAAGTATATCCAAATAGATGATATGTCACGACATCCAGCTGATGGGGAAGGGTGGAAGAATTTTGATCATGAATTTCCTCGGTTTGGTTCAGACTCCCAAAATGTTCGTTTAGGGTTAGCTTCAGATGGGTTTAATCCGTTTGAAAATATGAGTACTTCATATAGTATGTGGCCTGTTGTGCTAATTCCTTATAATTTGCCACCATAAAAATGTATGAAAGAGACAAATTTCTTCATGTCTCTACTTATACCGGGGCCGAAATCTCCTGGAAAAGAAATCGACATTTATTTGCAACTATTGATAGAGGAGTTGAAAGAATTGTGGAATAATGGTGTTCGCACTTACGACTGTGTCAAAGGTGAATACTTTTAGTTACATGCTTGTTATGGACTATTAATGACTTTCCTATATATGGTGACTTATCGAGTTGGAGTACAAAAGGTTATCAAGCATGTCCCATATGTAAAGAAGATACATCATCACTTGGGATAAGAGGAAAATTTTCATGGGTCATTGACGCTATCTTCCAAAAAATCACAGTTGGCGTAAAAGTAAACAACATGATGGGAAGGTAAAACATAGACCTCCTCCAGTGTCAATGGATGGAGAGCAGGTCTTAGAACAAGTTAATCATTTAAGATTTTTTGTGCTTAGTAAGCATCCAACAAAGAAAGATAAGAAAAAGGAAACAAACTCTAAATTGGACAAAAAGAAGTATTTTTTTTCAACTTTCGTACTGGTCAAAACTTTTGTTACGACATAAATTGGATGTAATGCATATTGAAAAAAATATTTGCGACAATTTGGTTGGCACATTGTTAAACATAGTAGGAAAGATAAAAGACACGACAAATGCACAATTGGATTTAGAGGTTTTAAAGATTCGAAAAGAATTACATTTGCAACATATAGGGATAGAACTGTAAAGCCACATCCCACATATACGTTGACTACTAAAGAACGAGTTGAATTTTGTAAGTTCTTGAAATTAGTGAAATTTTTTGATGGTTTCATGTTAAATAGATCACGATTTGTAAGTGAGAAAGATGGAAAACTATGGGGATTAATTACCCACAACATTACAATAATTCCAAGGACAAACAGTAAAGCATAGATAAAAATGCTAAAAGACAGAACACAAGGTTTGAAAACCCAGTTCGGTGCAATACCACCTACGTTTGAGGGTATGTGCCCAGAAAGATAAATTCACTAAAATAAAATCAATTGATTATAACGTTGTATTTATCTGTAAGTAAATGACAAATACTTACCTGTAAATAGTCTGTTCGTGAAAGATCACTTGGGTTCCCTATAAGTGTGAGACTTCCTCTCAATAAAAACGATTATTTTTCCACCTTCAAATTTAAACCACTTCACATGAAAAATGTTTGAGGCCTGCTGAGATCCAAAACAAATAAAATTTAACCGCACTTTCGAGCTTGTAGTAAGTAGGAACAAGTCCTCTCCACAGGGAATGTATAAGGATTTAGCGTTGATCTTGCATTCATGGTCACAATAGGGGGGGTTTGAGAGTTTTGATTGCAAAGAATTTTAAATGACTTAAATGTAAAAGCGTAATTGAAACAGAGATTCGAGATGATTAAAAGCCTAGTATAGGAAATTTGGATTCCACCCGTTTACTTTGTTACTCATTGATAACTTGTAGAAATATAAGTTAATGTATCTCTTTTCTTAGAATAATGAAGAAAACTTAATGAATAATATATCATATTCGATTGAAATTGTTGTAAAAATATCTTTTTTGCGTCCAGCATATGCAAAAGCTTAAGAAATTTTAATATCATGTTTTAATCTGTGTAAACGCATGAATTTCAGGAAAAACATCGATCATTTGCAGCACACGTGAAAAAGGCATAGCATGGATGTGGAAAAGAAAAGTCTTGGAGTTTGAGTAAGCAATCAAGAACCTACGATGAACGCATATCAAGGGATGCGACGAACTTGAACCTGACGCGTGCCTTGGGATTTTTGACAACTGTATCAAGAGTTGAAAAAGGAATATTTGCCTCGATTCAGAACTAACCATGGGTGCAACATATTGCCATATCGACCAATACCCGGTCAGAGATGGCGGTAGGCAGATGCATGTTGTTCCATCTCCAGTGCGCCAGCAATGATAACATGACATTTGAAAGTACACCCTTTTGTGCTATAAATACTCAGCTTTGGAGACAAAAAAGTGTTAGACACATCTAGAGACCTCACGAAGAGAAGAACAATCATTCATCACTCCATCAGAAACATTCAGAAGGAAAACAGAAAGGCTCGAGAGAGACTTCGAGTCCATCATTCCACCACCATCCGTTCAGCACAATGAAGTAAGAACATCACATCCTCGCTGACAGAAAGCAGAAGACTGTAACTGCTAGCTTGGAATCTTCACCACTTTCATTTTTATTTTTATCACTTTCACTATTTCACCATCTTTCTAAACATATTTTGTACTGCTACATTCTATTTTCTAATATACACCTCATGCACTTTATCATCTTATTTACTCCCATTTTTACTTTAACTTCTACCATGAGTAGCTAAATCCTTTAAAGGTTGGGATAAATAAACCATCATTCTGACGAACGAAATTTAGGTCAAGATTCATTTTGTTTAGTGTGTGTTAAATCTTATGCTTGTTTCCATTTAGCCAATCGAAAGAAGTAGAAATAATTATGTGACAACCCAAATTTTCAAGTATTTTTTTAAATTTAATTATCTTAAAATATTTGGGTGTTAATTTGAGTTTTGGGGCTAAAATTGAATTACTGGGGGTGAGATATTTGAATTTAAATTAAGTGAAGATTTAAAAATTTGGATTTAATTCAATTAGTGAAAAAGTGAATTTAATTTGGAGATTTGAGATTTATTTTGGATAAATTATTGTGACTTTGAATTTAAAGTTGGTGGATTTAATTTTTTTTTAGGTAATTAAATTAGTTTGAGTTGATGAGAAGGATTTTGAGTCTGGTGTGATAGAAGAAAAAGATTAAATATATATATATATAGGTGCATCGGTAAGTGTGCTAGTAAAAGAAAAAAAATAAAGTGTGCGTCCGAAAACCAGCCCCTTGTCGTCATCCACGATCAGTGCCGCTACTGCCAACGTACTGTCGTACGTCCGTTGCCCAGTTTGACAGCCACCGTTCGCATAGGTCACGTCGTTGTCGCCAAAGTTTGCGTCCCAGATCCTGTTGTGCGCGTCTGCCGTGGGTTTTGTCTGCGCTGTTCGTGGGTTCGAAACACACTGCCACTTCTGCAGGTCCTCCCGTCAATCTTCCAGCGCTGGTCTGCACGCCTGCGATCGTCGCCGCTCTTTGGGTTCGCCGGAGTTCTTGTTTGA

mRNA sequence

ATGGCAAGCTCCACCCTCTTCAAAAGCTTTGGTGCTGCAATTACAAGAAGATCAACAATCTCCCACCCTACTCTCATTTTGGCTTCTAACCCTAAATTTATTCATGTCAGTGAAAAGACAATGAATGTGGCAGGAATGGTAAGTGCAAAAGCACATGAGGTTTCAGCAATGGCAAAGCAAGCAATGGAAGCAGCATGGGACACAGCAAAGGACACAACCCAAAGGGCAAAAGACACGTTGGTTGACACTGCCAATGACTCCAAGGAATTTGTCAAAGCAAATGCTAACCCTCTTTCCCGTCGTTGCCCTCAGCCCACTCGCCTCCACTTCGCCACCGGTCACCTAATTCTCAGGCTGCCCCTTGTCGTCATCCACGATCAGTGCCGCTACTGCCAACGTACTGTCGTACGTCCGTTGCCCAGTTTGACAGCCACCGTTCGCATAGGTCACGTCGTTGTCGCCAAAGTTTGCGTCCCAGATCCTGTTGTGCGCGTCTGCCGTGGGTTTTGTCTGCGCTGTTCGTGGGTTCGAAACACACTGCCACTTCTGCAGGTCCTCCCGTCAATCTTCCAGCGCTGGTCTGCACGCCTGCGATCGTCGCCGCTCTTTGGGTTCGCCGGAGTTCTTGTTTGA

Coding sequence (CDS)

ATGGCAAGCTCCACCCTCTTCAAAAGCTTTGGTGCTGCAATTACAAGAAGATCAACAATCTCCCACCCTACTCTCATTTTGGCTTCTAACCCTAAATTTATTCATGTCAGTGAAAAGACAATGAATGTGGCAGGAATGGTAAGTGCAAAAGCACATGAGGTTTCAGCAATGGCAAAGCAAGCAATGGAAGCAGCATGGGACACAGCAAAGGACACAACCCAAAGGGCAAAAGACACGTTGGTTGACACTGCCAATGACTCCAAGGAATTTGTCAAAGCAAATGCTAACCCTCTTTCCCGTCGTTGCCCTCAGCCCACTCGCCTCCACTTCGCCACCGGTCACCTAATTCTCAGGCTGCCCCTTGTCGTCATCCACGATCAGTGCCGCTACTGCCAACGTACTGTCGTACGTCCGTTGCCCAGTTTGACAGCCACCGTTCGCATAGGTCACGTCGTTGTCGCCAAAGTTTGCGTCCCAGATCCTGTTGTGCGCGTCTGCCGTGGGTTTTGTCTGCGCTGTTCGTGGGTTCGAAACACACTGCCACTTCTGCAGGTCCTCCCGTCAATCTTCCAGCGCTGGTCTGCACGCCTGCGATCGTCGCCGCTCTTTGGGTTCGCCGGAGTTCTTGTTTGA

Protein sequence

MASSTLFKSFGAAITRRSTISHPTLILASNPKFIHVSEKTMNVAGMVSAKAHEVSAMAKQAMEAAWDTAKDTTQRAKDTLVDTANDSKEFVKANANPLSRRCPQPTRLHFATGHLILRLPLVVIHDQCRYCQRTVVRPLPSLTATVRIGHVVVAKVCVPDPVVRVCRGFCLRCSWVRNTLPLLQVLPSIFQRWSARLRSSPLFGFAGVLV

Homology

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BLAST of HG10005978 vs. NCBI nr
Match: XP_038889268.1 (uncharacterized protein At4g13230-like [Benincasa hispida])

HSP 1 Score: 126.7 bits (317), Expect = 2.3e-25
Identity = 82/145 (56.55%), Postives = 90/145 (62.07%), Query Frame = 0


Query: 1   MASSTLFKS------FGAAITRRSTISHPTLILASNPKFI-------------------- 60
           MASSTLFK+      FGAAITRRST S+ TLILASNPKFI                    
Sbjct: 1   MASSTLFKNLPKFGHFGAAITRRSTTSNTTLILASNPKFIHTNLSQDGSEAKDAINPGAN 60

Query: 61  -------------------HVSEKTMNVAGMVSAKAHEVSAMAKQAMEAAWDTAKDTTQR 101
                              HVSEKT ++AGMVSAKAH VSA AKQAMEAAWD+AKDT QR
Sbjct: 61  EGMMPGENMMKDKAYSTAEHVSEKTKDMAGMVSAKAHAVSAKAKQAMEAAWDSAKDTAQR 120

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BLAST of HG10005978 vs. NCBI nr
Match: XP_022933143.1 (uncharacterized protein At4g13230 [Cucurbita moschata])

HSP 1 Score: 87.0 bits (214), Expect = 2.1e-13
Identity = 66/146 (45.21%), Postives = 80/146 (54.79%), Query Frame = 0


Query: 1   MASSTLFKS------FGA-AITRRSTISHPTLILASNPKFI------------------- 60
           M SSTLFKS      FGA AI RRS  S+ +L+ ASNPKFI                   
Sbjct: 1   MGSSTLFKSLPKFGHFGAPAIARRSPTSNTSLLFASNPKFIHTNPPQDGSEAKDAINPEA 60

Query: 61  --------------------HVSEKTMNVAGMVSAKAHEVSAMAKQAMEAAWDTAKDTTQ 101
                               HVSEKT ++AGM+SA+A EVSA AK+AMEA    AKD+  
Sbjct: 61  NEGMTPGEHMMQDKAYSTAEHVSEKTRDMAGMLSARAQEVSAKAKEAMEA----AKDSAH 120

[Close]

BLAST of HG10005978 vs. NCBI nr
Match: XP_023546410.1 (uncharacterized protein At4g13230 [Cucurbita pepo subsp. pepo])

HSP 1 Score: 84.0 bits (206), Expect = 1.7e-12
Identity = 65/146 (44.52%), Postives = 79/146 (54.11%), Query Frame = 0


Query: 1   MASSTLFKS------FGA-AITRRSTISHPTLILASNPKFI------------------- 60
           M SSTLFKS      FGA AI RRS  S+ +L+ ASNPK I                   
Sbjct: 1   MGSSTLFKSLPKFGHFGAPAIARRSPTSNTSLLFASNPKSIHTNPPQDGLEAKDAIKPEA 60

Query: 61  --------------------HVSEKTMNVAGMVSAKAHEVSAMAKQAMEAAWDTAKDTTQ 101
                               HVSEKT ++AGM+SA+A EVSA AK+AMEA    AKD+  
Sbjct: 61  NEGMTPGEHMMQDKAYSTAEHVSEKTRDMAGMLSARAQEVSAKAKEAMEA----AKDSAH 120

[Close]

BLAST of HG10005978 vs. NCBI nr
Match: KAG6598970.1 (hypothetical protein SDJN03_08748, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia])

HSP 1 Score: 81.6 bits (200), Expect = 8.6e-12
Identity = 64/146 (43.84%), Postives = 78/146 (53.42%), Query Frame = 0


Query: 1   MASSTLFKS------FGA-AITRRSTISHPTLILASNPKFI------------------- 60
           M S TLFKS      FGA AI RRS  S+ +L+ ASNPK I                   
Sbjct: 1   MGSYTLFKSLPKFGHFGAPAIARRSPTSNTSLLFASNPKSIHTNPPQDGSEAKDAINPEA 60

Query: 61  --------------------HVSEKTMNVAGMVSAKAHEVSAMAKQAMEAAWDTAKDTTQ 101
                               HVSEKT ++AGM+SA+A EVSA AK+AMEA    AKD+  
Sbjct: 61  NEGMTPGEHMMQDKAYSTAEHVSEKTRDMAGMLSARAQEVSAKAKEAMEA----AKDSAH 120

[Close]

BLAST of HG10005978 vs. NCBI nr
Match: XP_022973925.1 (uncharacterized protein At4g13230 [Cucurbita maxima])

HSP 1 Score: 81.6 bits (200), Expect = 8.6e-12
Identity = 65/146 (44.52%), Postives = 78/146 (53.42%), Query Frame = 0


Query: 1   MASSTLFKS------FGAA-ITRRSTISHPTLILASNPKFI------------------- 60
           M SSTLFKS      FGAA I  RS  S+ +L  ASNPKFI                   
Sbjct: 1   MGSSTLFKSLPKFGHFGAAVIAWRSPTSNTSLRFASNPKFIHTNPPQDGSEAKDAINPEA 60

Query: 61  --------------------HVSEKTMNVAGMVSAKAHEVSAMAKQAMEAAWDTAKDTTQ 101
                               HVSEKT ++AGM+SA+A EVSA AKQAMEA    AKD+  
Sbjct: 61  NEGMTSGEQMMQDKAYSTAEHVSEKTRDMAGMLSARAQEVSAKAKQAMEA----AKDSAH 120

[Close]

BLAST of HG10005978 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1F3W7 (uncharacterized protein At4g13230 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111439943 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 87.0 bits (214), Expect = 9.9e-14
Identity = 66/146 (45.21%), Postives = 80/146 (54.79%), Query Frame = 0


Query: 1   MASSTLFKS------FGA-AITRRSTISHPTLILASNPKFI------------------- 60
           M SSTLFKS      FGA AI RRS  S+ +L+ ASNPKFI                   
Sbjct: 1   MGSSTLFKSLPKFGHFGAPAIARRSPTSNTSLLFASNPKFIHTNPPQDGSEAKDAINPEA 60

Query: 61  --------------------HVSEKTMNVAGMVSAKAHEVSAMAKQAMEAAWDTAKDTTQ 101
                               HVSEKT ++AGM+SA+A EVSA AK+AMEA    AKD+  
Sbjct: 61  NEGMTPGEHMMQDKAYSTAEHVSEKTRDMAGMLSARAQEVSAKAKEAMEA----AKDSAH 120

[Close]

BLAST of HG10005978 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1ICL4 (uncharacterized protein At4g13230 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111472556 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 81.6 bits (200), Expect = 4.2e-12
Identity = 65/146 (44.52%), Postives = 78/146 (53.42%), Query Frame = 0


Query: 1   MASSTLFKS------FGAA-ITRRSTISHPTLILASNPKFI------------------- 60
           M SSTLFKS      FGAA I  RS  S+ +L  ASNPKFI                   
Sbjct: 1   MGSSTLFKSLPKFGHFGAAVIAWRSPTSNTSLRFASNPKFIHTNPPQDGSEAKDAINPEA 60

Query: 61  --------------------HVSEKTMNVAGMVSAKAHEVSAMAKQAMEAAWDTAKDTTQ 101
                               HVSEKT ++AGM+SA+A EVSA AKQAMEA    AKD+  
Sbjct: 61  NEGMTSGEQMMQDKAYSTAEHVSEKTRDMAGMLSARAQEVSAKAKQAMEA----AKDSAH 120

[Close]

BLAST of HG10005978 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1CSM2 (uncharacterized protein At4g13230-like OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111014202 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 72.8 bits (177), Expect = 1.9e-09
Identity = 58/149 (38.93%), Postives = 72/149 (48.32%), Query Frame = 0


Query: 1   MASSTLFKS------FGAAITRRSTISHPTLILASNPKFI-------------------- 60
           MAS TL K+       GAAI RRST S+P L+L SNPKF+                    
Sbjct: 1   MASFTLLKTLPKFCHLGAAIARRSTASNPILLLPSNPKFMHTGSPQDAINPGAPEAKDAI 60

Query: 61  -----------------------HVSEKTMNVAGMVSAKAHEVSAMAKQAMEAAWDTAKD 101
                                  HV EK  ++ GMV +   E+S  AKQ MEAAWD+A  
Sbjct: 61  NPGANEAMMPGESMMTEAYSTAQHVREKASDMGGMVXS---EISEKAKQTMEAAWDSA-- 120

[Close]

BLAST of HG10005978 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A2N9J0W5 (Uncharacterized protein OS=Fagus sylvatica OX=28930 GN=FSB_LOCUS58724 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 68.6 bits (166), Expect = 3.7e-08
Identity = 47/117 (40.17%), Postives = 64/117 (54.70%), Query Frame = 0


Query: 7   FKSFGAAITRRSTISHPTLILASNPKFIH----------------------------VSE 66
           F   GAAI RR+T  +P L +ASNP+ I                             V++
Sbjct: 13  FGHAGAAIARRNT-WNPRLFVASNPRLIQASSNPEASSVATDALKQGANDAKKTGDKVTQ 72

Query: 67  KTMNVAGMVSAKAHEVSAMAKQAMEAAWDTAKDTTQRAKDTLVDTANDSKEFVKANA 96
           KT ++AGM+SA A +V+  AKQ  + AW TAKDT Q+AKDT++  A +SKE +K NA
Sbjct: 73  KTKDMAGMMSATAQDVTEKAKQTTQEAWGTAKDTAQKAKDTVLGKAEESKECIKENA 128

[Close]

BLAST of HG10005978 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A067EI82 (Uncharacterized protein OS=Citrus sinensis OX=2711 GN=CISIN_1g036890mg PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 67.4 bits (163), Expect = 8.1e-08
Identity = 46/100 (46.00%), Postives = 62/100 (62.00%), Query Frame = 0


Query: 1   MASSTLFKSFGAAITRRSTISHPTLILASNPKFIHVSEKTMNVAGMVSAKAHEVSAMAKQ 60
           MASSTL K    AI RRS I +    LAS P++I +S+ T + AG VS  A ++   AKQ
Sbjct: 1   MASSTLSK---LAIARRS-IWNSKQFLASKPRYIQMSQITKDKAGKVSETAQDIGDKAKQ 60

Query: 61  AMEAAWDTAKDTTQRAKDTLVDTANDSKEFVKANANPLSR 101
            ++ AW +AKDT Q  KD L+  A+ SKE VK NA  +++
Sbjct: 61  TVQDAWGSAKDTAQNVKDNLLGKADKSKEAVKQNAEQVTK 96

[Close]

BLAST of HG10005978 vs. TAIR 10
Match: AT4G13230.1 (Late embryogenesis abundant protein (LEA) family protein )

HSP 1 Score: 42.0 bits (97), Expect = 7.0e-04
Identity = 24/65 (36.92%), Postives = 35/65 (53.85%), Query Frame = 0


Query: 36  VSEKTMNVAGMVSAKAHEVSAMAKQAMEAAWDTAKDTTQRAKDTLVDTANDSKEFVKANA 95
           V++K    A  +S  A  +   AK   E AWD  KDTT++ KDT+     ++KE +KA A
Sbjct: 48  VAKKADEGAQTISDAAGNLKDKAKNTAEEAWDKVKDTTEKIKDTVTGKTEETKESIKATA 107

Query: 96  NPLSR 101
             + R
Sbjct: 108 KTVER 112

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of HG10005978 vs. NCBI nr


Match Name	E-value	Identity	Description
XP_038889268.1	2.3e-25	56.55	uncharacterized protein At4g13230-like [Benincasa hispida]	[more]
XP_022933143.1	2.1e-13	45.21	uncharacterized protein At4g13230 [Cucurbita moschata]	[more]
XP_023546410.1	1.7e-12	44.52	uncharacterized protein At4g13230 [Cucurbita pepo subsp. pepo]	[more]
KAG6598970.1	8.6e-12	43.84	hypothetical protein SDJN03_08748, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sorori...	[more]
XP_022973925.1	8.6e-12	44.52	uncharacterized protein At4g13230 [Cucurbita maxima]	[more]

BLAST of HG10005978 vs. NCBI nr


Match Name	E-value	Identity	Description

BLAST of HG10005978 vs. ExPASy TrEMBL


Match Name	E-value	Identity	Description
A0A6J1F3W7	9.9e-14	45.21	uncharacterized protein At4g13230 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111439943 ...	[more]
A0A6J1ICL4	4.2e-12	44.52	uncharacterized protein At4g13230 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111472556 PE...	[more]
A0A6J1CSM2	1.9e-09	38.93	uncharacterized protein At4g13230-like OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC1110...	[more]
A0A2N9J0W5	3.7e-08	40.17	Uncharacterized protein OS=Fagus sylvatica OX=28930 GN=FSB_LOCUS58724 PE=4 SV=1	[more]
A0A067EI82	8.1e-08	46.00	Uncharacterized protein OS=Citrus sinensis OX=2711 GN=CISIN_1g036890mg PE=4 SV=1	[more]

BLAST of HG10005978 vs. TAIR 10


Match Name	E-value	Identity	Description
AT4G13230.1	7.0e-04	36.92	Late embryogenesis abundant protein (LEA) family protein	[more]

InterPro

Analysis Name: InterPro Annotations of Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1
Date Performed: 2022-08-01

Position :

Zoom :

x 1


IPR Term	IPR Description	Source	Source Term	Source Description	Alignment
None	No IPR available	PANTHER	PTHR47372:SF21	LATE EMBRYOGENESIS ABUNDANT PROTEIN, GROUP 3-LIKE	coord: 35..100
None	No IPR available	PANTHER	PTHR47372	DAUER UP-REGULATED-RELATED	coord: 35..100

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:


Feature Name	Unique Name	Type
HG10005978.1	HG10005978.1	mRNA