HG10005951 (gene) Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1

Overview


Name	HG10005951
Type	gene
Organism	Lagenaria siceraria cv. Hangzhou Gourd (Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1)
Description	Unknown protein
Location	Chr07: 9594628 .. 9599623 (+)
RNA-Seq Expression	HG10005951
Synteny	HG10005951

Sequences

The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: CDSpolypeptide

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ATGGTGCATACTCATCATGGTACTCAAACCTCTGGCAAGGCAATGGTTCGCACCAAGCAAAGAGTCAATCAGAAGCGCAATGTTAGTCTAGATGTTTCTCTTCCTAGGGTAAACATCTTCGAAGGGTCTAGTGATGTTCCTTCCTCTTCTATCAAGCGTCCTCGCACCGATCTGAATCGTCTAGAAACTCTCTCGGACTCTATCGCACACCCTACCTTGGTGCATGGAGCTAATGTTGATCCATGGAGATCAATTGAGGTAAGCCCTTCGGCTATGGTTCTCTAGGATGGTATTGTTGTGACAAATATTGTCAGAGTTTCCCTTGATGCAACCTTTGTCCATCCTTTACATCATGAAACTGCCCTCTGTGGCCGTGCATGTTGACACTAGTACTGATGCTCCCCTGATGGCCTCTGATTTGCCCACCGCTGTTAAGCAAGCTGATGAAGGAATGTCGTCTAAGAAAGTGTAGTCTCCTCCTGTAGTACTTGGTAATTTGAGTGCTCATCCTGAAAAAGCTGAGGTTGTTGATGCTACTCACTCTTCTATTTCTAAAAATGTAAATTTTGATCCTGTTGTTGCTATAAATGTTGTTGATTCTACTTCTACTTATGGTATTTTTGTTCTTAATAATACTATCCTATAGTCTGGAAAGGATATTAGTCAGTTTGTTGTTGATAAGAGTGAACATGTTATGGCTGATGTTACTGACATCCTCCTTCAAATAGGGGGGATTCTGTCCCCAATGATGGTGTGAGTGACAATGTTGGGTCTGATGGTGCCCTTGATGCTGCTAAGAAAGATGTTGCTGCAAATGACTCCAACTCTGCCTCTCACAAAGCTTCTGGCCCCAAGTTTTCTGCTTATGTTCGTTCCTCTATGTCTGAATCCAGTTCCTCTAAAGCCACTATATAGGTTTAATCCGATGACAATATTGTGCTTGCTCAGTTTGGAACGAAAGGAAAGTTGCCTCCTTGCAGGGTTGTTCTGAGAGTGGTCCTTCTTTTAGGACAAGGTCCAAACACACCTCTTCAAAGAAGCCAATTGATGATTCTGAATCCGACTTTGATCCCTCTGAGCACTTCTCTGCTTCCAATTCTGAAGAAGATATTGTTGTTGTCAGAGGCAAATAATGCAAGAGAGTTGGCAGGTGCAAAATTCCTTCAAATGTACCTATTTTGCCCCTGATGGTGTGTCCTTCCACTGCGAGGAAAATGTTCAAAAGTGGAAATATGTGGTGCAGCGTAGAATTGCTGATAAAAATATTCTTTCTGACTAGACTAAGTCCTGCCTTGAAATAATGGATCTGATTCAGCGTTCTGGTCTATTGAACACTGTTGTGGATCTCGGTCCCTTTTACCCTCGGTTGATGAGGGATTGTCAATCTTCCTATCAACTTTAATAACCCCAGTTGTCCGAAATATTATCAGAAGGTTCACATTCGTGATACCTGTTTCACTATTTCTCCTGCTATTATCAATGCTTATCTTGGTCGTGCTAATTGCTCACCTCTTGGGGAGCCTCATCCTTCTACAAAGGAGCTTGTCTTGGAGCTTACTTGAGGCACTAGGTCTGTCTGGCCTCAGTCTGGTCAACTTTTTGCTTCCACTTTGAGTGTGAAATATGCCATTTTGTTTCACATTGGCATCGCAAATTAGTGTCCTTCAACACATGGTTCCAGCCTCTCTCCATCTCTTCCTAGCTTCCTTTATCAGATTGGTACTATGTCTTCATTCAACTTTTGTGTATTTGTGTATAATCAACTTCTCAGACATGTTGATTCTTCTTCGATGAAGCTTCCCATTTTTCCTCTGCGGTTGTTCTCTGGTCTTCTTCTGTCTTAGTGCCCCACGATTCTTGGCCCGGATGATGCTCCTAGCCCGGATCCCAAGATTCTCAACATCAGTTACAAGATCCTTCAGGGCTCTCATGTCCCTGACATTGTACACAACATTCGTCCCCCCAAGACTATTGATATTCCTTTCCTAGAGAATATGCAGGTTCCTGATGGTGGTCTTTTGATTCTTACTAAACTGAAGACTCAGATTCTTCATATTCTTGCTACTGAATCGCGTACTCTGAACACTGTCATTCGTGACTTATCTGACCGTCATACTAAAATTTTTTGGTTAATTCATCTTCTAACAGTGTCACTTCCAAGCTTTGATGGTGTTTCCACAAGTGCTCAGCCCCATGCTTCTGATTGATTTTCTTCTTGGCAAAAGGGGGAGAATGGGTTGTGTTGGGCCTGGGCCTGTTTTGTTGTTTCTGTTGTGTTGGTTTAATTATGATTTTTTTTCTTTGTTGTATGTTTACCTATAAAGAAAATCTTTGGCTAAAGGGGGAGCATGTTATTGTGTTGTGTTGGTAAATAATATTTTCTTTTATTTTGTTGAATATTATGTTGCTGACTTTAGGCATATTCGTGGGTGGATGTCTTTTGGATTTGATATTTTTCTTTCCTTATATGGTGCATATTTAGAGGTGCCTTGGTGTAGTGGCTGTGGGCTTTTTGGCCCTTAATCTCAAATTAATTAATTAATTAATGTTTTGATGATAACAAACCTGCTTTTACTTATTGACAACTTGAGCATTTTGAAGTACGCATTGTGTAGAGCTTGGAACAACGATTCCAACGTAATTTGAATCACTCAAATCGAAGTTCAAACGAAGAAGATATGGCCGAAACAAGCTTAACGGAAAAATACCAGATGTTGATGACATGGCAGCCAAATCATCAAAGTGGACCTACTAGAGGATGACAAGTGGAGCAATAGATAAGTGACACATGGAGCTTTTGATATTTGGATTGGTTTTTAAAAAGAAAATGATTTTAAAAAGAAAATAAATTTAATATTATTTTATATTTGTGTCTAACGACTAGTTTTGAACACATGGGACTTTTACTTTTTGTTGGATTTTAAAAGAAATGGTTTTAGAAAATGATATATATTATTAGATTTTTTTTTTTTTTTGTGTCTAATGGCTAGTTGATTCAAAAAGAAGAAAAATCTCTACCATTGATTTTTATTTTTCAAGATCTAATGGTCTAAATTTAATGTGGTTTCCAACAGCGTTCCTCCCTTTTTAAACACTTCATCTTCTCCAAATTTCTACAACAATTTCACATTATTTTTCAATCCTCCATAAAACAAAAAGTCACCATTGTTGCTCTCTCTCCAAGCTTCAATTTTATTCTTTTCATCTAATTCTTGAGAGGGATTTATTGTATTGGGAGGATTGATTTATTGAGTGCTTAAATTTGTAAATCTACTATTTGAGAGAGTTTTTCTCATCTTATTCTTCATTTCCAAATTCATTGTAAAGGTTGCTCTTGATCCCTAAAAAGAGTGGTTGTAACGGTTTGATCCTAAACCGTGGAAAGGATCGGGTTTGTTCTTGTGCCTGAAAAAGGAACGTTGTAACAGTTCGACTCTATGCCGTGGAAAGAGTCAAGTTCGTAGTGACATACCCAAAAGGAGCTTGGAAAGTGGATGTAGGCCGGTTGTACCAAACCACTATAAAATTTTCAGTGTGAATTTATCATTCTCTCTCCTATTTATTTTTGCAATTAATTTGTTATTATATTTTATTGCATGAAATTAATTGCAAAATTTATTCCTTAAAATTAATTGGTCATATTTGTTTACTTTGATTGGTAGTTCTTAAATTTACATATATTTACCAATCTTATTATTAAAATTAAATAGGGTGCTTAAAAGTATTAGTTTTAATTTCTTGGTTATTTTGGATTGAATTTATTTTCATAAAATTCTTATTTAAATTACTTATTAGCAAAAAAATTTATTAATTCGTTTAATTGGGCATATATTAGGAAAAAAATTTCATTAGCTTAAATAAACCCTATTCACCCCTCTAGGGTTGTCATACCGATCCTACCGTGGCTATATTATGTTTTTGGAAGGAAGCTGTAAACAGAGAAGCGAGTGTGCAAGAACGCGAACAAAAAGAAGAAAAATGTTGTACTCATTGTGATGAACACATATAAAGAAATCTATGTATGTATGTTGTTAGTGCATTTTGAACTACTAGTGCGAACTAGACAAAAGTTGTTGTGAGTTACTAGTTGAGGGTGAACTCAACTAGTAGGTGAAGAGAATGTTAAGTGATTGTAAGGTGCATCAGTTTCAGGGGGAGCCTGAGATTGCATACTCATCGTCAGTAGTATCAAAGTTAGATGGAGTCTAACTTGCTCGCTAGAATTCAGTTATATGGAAACTGAGTTATAAAGTCTTAGTCGAAGCGTACTTTGTAAAACTGAGATTTATTCTAGTGGATTTCTTTTCACCTAGGTGCTAAGCCTCTCAAACATAGGTGAGGATTCACTGAACTGGGTTAACATATATGTGTGTTATTTTTTTTTATTTGTCGTTTTTATTGTCTATCTCTTTGTTAGTGACATCTGGTCTGTCTAGTGATCTTAGTGAGTGGATATAATATTTCAATTAGATTGGGCCCTATTATGTGATCTAATTAATTAAAGCCTTAGATTCCTAATTGAGTATGGACTTAATGGGTAGAAGTCTATTCCTAGATTGATTAAGGTTTAATTAGAATCCTTATTGAACTAGTATATAAAAAGACCTTAGGGCTATGGTCCCCAATATACCAAAACAGTCTTTCTTGAATCCAATCTAGAGAGAGATCCCACTAAGGTCATTCACAATTTTGGATGAGGAAGAAAATAGTCATCTTAAAGCTATTATCATCTTGAAGTTATCATCAATCTCTCAATGGAATCCGGTATGTTAATTATTCTTGGCAATTTGGCATGAATGTTAATCTATTCCATAGTCGACTGCTGATGTTGATATATTGACAGCGTGGGTGCACGAATCATAGGTGACTACACGAATCACTTAACCGCCTTCTTGTCCTCATCAGTCTTGTCGACAATGGGTTTCAGTGGTCGAAGTGGGTCTCGCGGTCAATTGCTTTGGTGTGGGTCTGGCAGTACAGGCGTCCATTCCAGTAG

mRNA sequence

ATGGTGCATACTCATCATGGTACTCAAACCTCTGGCAAGGCAATGGTTCGCACCAAGCAAAGAGTCAATCAGAAGCGCAATGTTAGTCTAGATGTTTCTCTTCCTAGGGTAAACATCTTCGAAGGGTCTAGTGATGTTCCTTCCTCTTCTATCAAGCGTCCTCGCACCGATCTGAATCGTCTAGAAACTCTCTCGGACTCTATCGCACACCCTACCTTGGTGCATGGAGCTAATGTTGATCCATGGAGATCAATTGAGTGGTCGAAGTGGGTCTCGCGGTCAATTGCTTTGGTGTGGGTCTGGCAGTACAGGCGTCCATTCCAGTAG

Coding sequence (CDS)

ATGGTGCATACTCATCATGGTACTCAAACCTCTGGCAAGGCAATGGTTCGCACCAAGCAAAGAGTCAATCAGAAGCGCAATGTTAGTCTAGATGTTTCTCTTCCTAGGGTAAACATCTTCGAAGGGTCTAGTGATGTTCCTTCCTCTTCTATCAAGCGTCCTCGCACCGATCTGAATCGTCTAGAAACTCTCTCGGACTCTATCGCACACCCTACCTTGGTGCATGGAGCTAATGTTGATCCATGGAGATCAATTGAGTGGTCGAAGTGGGTCTCGCGGTCAATTGCTTTGGTGTGGGTCTGGCAGTACAGGCGTCCATTCCAGTAG

Protein sequence

MVHTHHGTQTSGKAMVRTKQRVNQKRNVSLDVSLPRVNIFEGSSDVPSSSIKRPRTDLNRLETLSDSIAHPTLVHGANVDPWRSIEWSKWVSRSIALVWVWQYRRPFQ

Homology

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of HG10005951 vs.


Match Name	E-value	Identity	Description

BLAST of HG10005951 vs.


Match Name	E-value	Identity	Description

BLAST of HG10005951 vs.


Match Name	E-value	Identity	Description

BLAST of HG10005951 vs.


Match Name	E-value	Identity	Description

InterPro

Analysis Name: InterPro Annotations of Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1
Date Performed: 2022-08-01

Position :

Zoom :

x 1


IPR Term	IPR Description	Source	Source Term	Source Description	Alignment
None	No IPR available	MOBIDB_LITE	mobidb-lite	disorder_prediction	coord: 1..22

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:


Feature Name	Unique Name	Type
HG10005951.1	HG10005951.1	mRNA