HG10005220 (gene) Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1

Overview
NameHG10005220
Typegene
OrganismLagenaria siceraria cv. Hangzhou Gourd (Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1)
Descriptionprotodermal factor 1-like isoform X1
LocationChr07: 594394 .. 596301 (-)
RNA-Seq ExpressionHG10005220
SyntenyHG10005220
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGGAAAGAAGAGTAGCTTCTCTCCTTTTATGGACTCTCATCGTTGGGTTGGTTTCTCAAAACATGGCCATCGCTTTGACGTCTGCAAGCAACGAAGATCAGAAAACTTATTACAGTCCAGACCCACATGCAGGAAGCCCTCCCTCAGGTTTCTCTATGACCCACGACATATACACACACATTCCCTCGCATTCCACAGTTCCAAAATATTTTTATAGTGTTGAGATATTCCTGACCACTTACCCACATTGAAATTTGCAAATCTATATCTTTTAAGTAGATGGAAGGTTCTAAACTACGTGGTGGTGTAAAAAAGTGGCAAGAACTATTCAAATCAGTGACAAATAATGTTTATCTTTTTTTTTTTACTCATCCAGTATTTTCCTCTTTGTAGGTTCACAAGGGAGGCCACCTTATGGAACTCCACCACCACCTCGTGGTTCGGGAGGAAGCCATGGAGGAAAACCACCCTCTCATGGACATGGTGGTAAGAAACATAACCCAAAACCAGGGAAATGCGGAAACCCACCACACACTCCTACTCCGTCGAAACCTCCTTCTGGTGGTGGTGGATACTACAACCCTCCTACACATGATCCAACCCCATCAACTCCATCGAAGCCTCCTTCCGGTGGTGGACACCACAACCCTCCTACATATAATCCAACCCCATCCAATCCTCCCTCTGGTGGTGGTGGGTACTACAGCCCTCCGACTCATGATCCCACTCCAACCCCATCAACTCCTTCGAATCCTCCTTCTGGTGGTGGTGGATACTACAGCCCTCCATCTTACGATCCCACTCCAACTCCATCTACTCCAACTCCATCTACTCCAACTCCATCAACTCCATCTACTCCATCGACTCCAACTCCGTCAACTCCTTCGGGCGGTGGATACTACAGCCCTCCATCTTACGATCCCACTCCTACTCCATCTACCCCAACTCCATCAACTCCATCTACTCCAACTCCATCAACTCCGACCCCGTCAACTCCATCTACTCCTTCAGGTGGTGGATACTACAGCCCTCCAACTTATGATCCCACTCCAACCCCAACGACTCCATCGACTCCTTCGACTCCTTCGGGTGGTGGTGGATACAATAGCCCTCCAACTTACGATCCTACTCCAACCCCATCAACTCCGTCAACTCCTTCAGGTGGTGGTGGATATTATAGCCCTCCAACTTATGATCCTACCCCATCAACTCCTCCATCAGGCGGTAGTGGATACAATAGCCCTCCAACTTTTGATCCGACACCATCAACTCCTCCATCAGGCGGTAGTGGATACAATAGCCCTCCAACTTTTGATCCGACACCAGCAACTCCATCAACTCCTCCTTCAGGTGGTAATGGGTACTACAACCCTCCAACTTCTGGTACACCATTCTACGGAACCCCCCCAACCACATCAGCACCTCCCTTTGTTCCTGATCCCAATTCTCCCTTCACTGGCACATGCAAGTAAGTAATACAATTGTATGCAATACTTTTTCCAATGTAAGTGAAAGAAAGAGCATCCCTTCACATTTCGAATACTGATAATGACCTTCTATCATCGTGTATTTTCAGCTATTGGAGGACGCACCCAGGAATAATATGGGGATTGTTAGGCTGGTGGGGAACAATGGGCAGTGCTTTTGGTATAACAAACGCTCCAGGCTTCGGAGCTACTCTCAGCTTACCACAAGCACTCTCAAACACACGAACTGATGGCCTAGGAGCACTTTACCGAGAAGGAGCGGCTGCTTTCCTAAACTCCATGGTGAACATCAGGTACCCCTTCACAACCAATCAAGTCCGTGACAGTTTTGTATCGGCACTAAGCTCAAACAAAGCAGCAGCAGCACAGGCCCAGGTTTTCCAGATGGCCAACGAAGGTAGATTCAAGCCTAGAACCTGA

mRNA sequence

ATGGAAAGAAGAGTAGCTTCTCTCCTTTTATGGACTCTCATCGTTGGGTTGGTTTCTCAAAACATGGCCATCGCTTTGACGTCTGCAAGCAACGAAGATCAGAAAACTTATTACAGTCCAGACCCACATGCAGGAAGCCCTCCCTCAGGTTCACAAGGGAGGCCACCTTATGGAACTCCACCACCACCTCGTGGTTCGGGAGGAAGCCATGGAGGAAAACCACCCTCTCATGGACATGGTGGTAAGAAACATAACCCAAAACCAGGGAAATGCGGAAACCCACCACACACTCCTACTCCGTCGAAACCTCCTTCTGGTGGTGGTGGATACTACAACCCTCCTACACATGATCCAACCCCATCAACTCCATCGAAGCCTCCTTCCGGTGGTGGACACCACAACCCTCCTACATATAATCCAACCCCATCCAATCCTCCCTCTGGTGGTGGTGGGTACTACAGCCCTCCGACTCATGATCCCACTCCAACCCCATCAACTCCTTCGAATCCTCCTTCTGGTGGTGGTGGATACTACAGCCCTCCATCTTACGATCCCACTCCAACTCCATCTACTCCAACTCCATCTACTCCAACTCCATCAACTCCATCTACTCCATCGACTCCAACTCCGTCAACTCCTTCGGGCGGTGGATACTACAGCCCTCCATCTTACGATCCCACTCCTACTCCATCTACCCCAACTCCATCAACTCCATCTACTCCAACTCCATCAACTCCGACCCCGTCAACTCCATCTACTCCTTCAGGTGGTGGATACTACAGCCCTCCAACTTATGATCCCACTCCAACCCCAACGACTCCATCGACTCCTTCGACTCCTTCGGGTGGTGGTGGATACAATAGCCCTCCAACTTACGATCCTACTCCAACCCCATCAACTCCGTCAACTCCTTCAGGTGGTGGTGGATATTATAGCCCTCCAACTTATGATCCTACCCCATCAACTCCTCCATCAGGCGGTAGTGGATACAATAGCCCTCCAACTTTTGATCCGACACCATCAACTCCTCCATCAGGCGGTAGTGGATACAATAGCCCTCCAACTTTTGATCCGACACCAGCAACTCCATCAACTCCTCCTTCAGGTGGTAATGGGTACTACAACCCTCCAACTTCTGGTACACCATTCTACGGAACCCCCCCAACCACATCAGCACCTCCCTTTGTTCCTGATCCCAATTCTCCCTTCACTGGCACATGCAACTATTGGAGGACGCACCCAGGAATAATATGGGGATTGTTAGGCTGGTGGGGAACAATGGGCAGTGCTTTTGGTATAACAAACGCTCCAGGCTTCGGAGCTACTCTCAGCTTACCACAAGCACTCTCAAACACACGAACTGATGGCCTAGGAGCACTTTACCGAGAAGGAGCGGCTGCTTTCCTAAACTCCATGGTGAACATCAGGTACCCCTTCACAACCAATCAAGTCCGTGACAGTTTTGTATCGGCACTAAGCTCAAACAAAGCAGCAGCAGCACAGGCCCAGGTTTTCCAGATGGCCAACGAAGGTAGATTCAAGCCTAGAACCTGA

Coding sequence (CDS)

ATGGAAAGAAGAGTAGCTTCTCTCCTTTTATGGACTCTCATCGTTGGGTTGGTTTCTCAAAACATGGCCATCGCTTTGACGTCTGCAAGCAACGAAGATCAGAAAACTTATTACAGTCCAGACCCACATGCAGGAAGCCCTCCCTCAGGTTCACAAGGGAGGCCACCTTATGGAACTCCACCACCACCTCGTGGTTCGGGAGGAAGCCATGGAGGAAAACCACCCTCTCATGGACATGGTGGTAAGAAACATAACCCAAAACCAGGGAAATGCGGAAACCCACCACACACTCCTACTCCGTCGAAACCTCCTTCTGGTGGTGGTGGATACTACAACCCTCCTACACATGATCCAACCCCATCAACTCCATCGAAGCCTCCTTCCGGTGGTGGACACCACAACCCTCCTACATATAATCCAACCCCATCCAATCCTCCCTCTGGTGGTGGTGGGTACTACAGCCCTCCGACTCATGATCCCACTCCAACCCCATCAACTCCTTCGAATCCTCCTTCTGGTGGTGGTGGATACTACAGCCCTCCATCTTACGATCCCACTCCAACTCCATCTACTCCAACTCCATCTACTCCAACTCCATCAACTCCATCTACTCCATCGACTCCAACTCCGTCAACTCCTTCGGGCGGTGGATACTACAGCCCTCCATCTTACGATCCCACTCCTACTCCATCTACCCCAACTCCATCAACTCCATCTACTCCAACTCCATCAACTCCGACCCCGTCAACTCCATCTACTCCTTCAGGTGGTGGATACTACAGCCCTCCAACTTATGATCCCACTCCAACCCCAACGACTCCATCGACTCCTTCGACTCCTTCGGGTGGTGGTGGATACAATAGCCCTCCAACTTACGATCCTACTCCAACCCCATCAACTCCGTCAACTCCTTCAGGTGGTGGTGGATATTATAGCCCTCCAACTTATGATCCTACCCCATCAACTCCTCCATCAGGCGGTAGTGGATACAATAGCCCTCCAACTTTTGATCCGACACCATCAACTCCTCCATCAGGCGGTAGTGGATACAATAGCCCTCCAACTTTTGATCCGACACCAGCAACTCCATCAACTCCTCCTTCAGGTGGTAATGGGTACTACAACCCTCCAACTTCTGGTACACCATTCTACGGAACCCCCCCAACCACATCAGCACCTCCCTTTGTTCCTGATCCCAATTCTCCCTTCACTGGCACATGCAACTATTGGAGGACGCACCCAGGAATAATATGGGGATTGTTAGGCTGGTGGGGAACAATGGGCAGTGCTTTTGGTATAACAAACGCTCCAGGCTTCGGAGCTACTCTCAGCTTACCACAAGCACTCTCAAACACACGAACTGATGGCCTAGGAGCACTTTACCGAGAAGGAGCGGCTGCTTTCCTAAACTCCATGGTGAACATCAGGTACCCCTTCACAACCAATCAAGTCCGTGACAGTTTTGTATCGGCACTAAGCTCAAACAAAGCAGCAGCAGCACAGGCCCAGGTTTTCCAGATGGCCAACGAAGGTAGATTCAAGCCTAGAACCTGA

Protein sequence

MERRVASLLLWTLIVGLVSQNMAIALTSASNEDQKTYYSPDPHAGSPPSGSQGRPPYGTPPPPRGSGGSHGGKPPSHGHGGKKHNPKPGKCGNPPHTPTPSKPPSGGGGYYNPPTHDPTPSTPSKPPSGGGHHNPPTYNPTPSNPPSGGGGYYSPPTHDPTPTPSTPSNPPSGGGGYYSPPSYDPTPTPSTPTPSTPTPSTPSTPSTPTPSTPSGGGYYSPPSYDPTPTPSTPTPSTPSTPTPSTPTPSTPSTPSGGGYYSPPTYDPTPTPTTPSTPSTPSGGGGYNSPPTYDPTPTPSTPSTPSGGGGYYSPPTYDPTPSTPPSGGSGYNSPPTFDPTPSTPPSGGSGYNSPPTFDPTPATPSTPPSGGNGYYNPPTSGTPFYGTPPTTSAPPFVPDPNSPFTGTCNYWRTHPGIIWGLLGWWGTMGSAFGITNAPGFGATLSLPQALSNTRTDGLGALYREGAAAFLNSMVNIRYPFTTNQVRDSFVSALSSNKAAAAQAQVFQMANEGRFKPRT
Homology
BLAST of HG10005220 vs. NCBI nr
Match: XP_038888912.1 (protodermal factor 1-like [Benincasa hispida])

HSP 1 Score: 850.5 bits (2196), Expect = 7.5e-243
Identity = 464/518 (89.58%), Postives = 472/518 (91.12%), Query Frame = 0

Query: 1   MERRVASLLLWTLIVGLVSQNMAIALTSASNEDQKTYYSPDPHAGSPPSGSQGRPPYGTP 60
           MERR+ASLLLWTLIVGLVSQN AI LTSASNEDQKTYY+PDPHAGSPPSGSQG PPYGT 
Sbjct: 4   MERRLASLLLWTLIVGLVSQNKAIPLTSASNEDQKTYYTPDPHAGSPPSGSQGSPPYGT- 63

Query: 61  PPPRGSGGSHGGKPPSHGHGGKKHNPKPGKCGNPPHTPTPSKPPSGGGGYYNPPTHDPTP 120
           PPPRGSGGSHGGKPPSHGHGGKKHNPKPGKCGNPPHTPTPSKPPSGGGGYYNPPTHDPTP
Sbjct: 64  PPPRGSGGSHGGKPPSHGHGGKKHNPKPGKCGNPPHTPTPSKPPSGGGGYYNPPTHDPTP 123

Query: 121 STPSKPPSG-GGHHNPPTYNPTPSNPPSGGGGYYSPPTHDPTPTPSTPSNPPSGGGGYYS 180
           STPSKPPSG GG+HNPPTYNPTPSNPPSGGGGYYSPPTHDPTPTP TPSNPPSGGGGYYS
Sbjct: 124 STPSKPPSGDGGYHNPPTYNPTPSNPPSGGGGYYSPPTHDPTPTPLTPSNPPSGGGGYYS 183

Query: 181 PPSYDPTPTPSTPTPSTPTPSTPSTPSTPTPSTPSGGGYYSPPSYDPTPTPSTPTPSTPS 240
           PPSYDPTPTPS  TPSTPTPSTPS     TPSTPSGGGYYSPPSYDPTP        TPS
Sbjct: 184 PPSYDPTPTPS--TPSTPTPSTPS-----TPSTPSGGGYYSPPSYDPTP--------TPS 243

Query: 241 TPTPSTPTPSTPSTPSGGGYYSPPTYDPTPTPTTPSTPSTPSGGGGYNSPPTYDPTPTPS 300
           TPTPSTPTPSTPSTPSGGGYYSPPT DPTP   TPSTPSTPSGGGGY SPPTYDPTPTPS
Sbjct: 244 TPTPSTPTPSTPSTPSGGGYYSPPTNDPTP---TPSTPSTPSGGGGYYSPPTYDPTPTPS 303

Query: 301 TPSTPSGGGGYYSPPTYDPTPSTPPSGGSGYNSPPTFDPTPSTPPSGGSGYNSPPTFDPT 360
           TPSTPSGGGGYYSPPTYDPTPS                 TPSTPPSGGSGY+SPPTFDPT
Sbjct: 304 TPSTPSGGGGYYSPPTYDPTPS-----------------TPSTPPSGGSGYSSPPTFDPT 363

Query: 361 PATPSTPPSGGNGYYNPPTSGTPFYGTPPTTSAPPFVPDPNSPFTGTCNYWRTHPGIIWG 420
           P+ P+TPPSGG+GYYNPPTSGTPFYGTPP TSAPPFVPDPNSPFTGTCNYWRTHPGIIWG
Sbjct: 364 PSIPTTPPSGGSGYYNPPTSGTPFYGTPPITSAPPFVPDPNSPFTGTCNYWRTHPGIIWG 423

Query: 421 LLGWWGTMGSAFGITNAPGFGATLSLPQALSNTRTDGLGALYREGAAAFLNSMVNIRYPF 480
           LLGWWGTMGSAFGITNAPGFGATLS+PQALSNTRTDGLGALYREGAAAFLNSMVN RYPF
Sbjct: 424 LLGWWGTMGSAFGITNAPGFGATLSIPQALSNTRTDGLGALYREGAAAFLNSMVNNRYPF 483

Query: 481 TTNQVRDSFVSALSSNKAAAAQAQVFQMANEGRFKPRT 518
           TTNQVRDSFVSALSSNKAAAAQAQVFQMANEGRFKPRT
Sbjct: 484 TTNQVRDSFVSALSSNKAAAAQAQVFQMANEGRFKPRT 485

BLAST of HG10005220 vs. NCBI nr
Match: XP_011657562.2 (protodermal factor 1 isoform X1 [Cucumis sativus])

HSP 1 Score: 749.2 bits (1933), Expect = 2.4e-212
Identity = 434/548 (79.20%), Postives = 455/548 (83.03%), Query Frame = 0

Query: 1   MERRVASLLLWTLIVGLVSQNMAIALTSASNEDQKTYYSPDPHAGSPPSGSQGRPPYGTP 60
           MER++ASLLLWTLI+GLVSQN+AI LTSA NEDQKTYY+PDPHAGSPP+ S G PPYG+ 
Sbjct: 1   MERKLASLLLWTLILGLVSQNIAIPLTSAGNEDQKTYYTPDPHAGSPPTDSHGNPPYGS- 60

Query: 61  PPPRGSGGSHGGKPPSHGHGGKKHNPKPGKCGNPPHTPTPSKPPSGGGGYYNPPTHDPTP 120
           PPP GSGGSHGGKPPSHGHGGKKH PKPG CGNPP+TPTPSK          PPTHDPTP
Sbjct: 61  PPPHGSGGSHGGKPPSHGHGGKKHKPKPGNCGNPPYTPTPSK----------PPTHDPTP 120

Query: 121 STPSKPPSGGGHHNPPTYNPTPSNPPSGGGGYYSPPTHDPTPTPSTPSNPPSGGGGYYSP 180
           STPSKPPSGGG H+         NPP+GGGGY SPP+HDPTPTPSTP+     GGGYYSP
Sbjct: 121 STPSKPPSGGGGHH---------NPPTGGGGYNSPPSHDPTPTPSTPTPSTPSGGGYYSP 180

Query: 181 PSYDPTPTPSTPTPSTP-TPS--------------TPSTPSTPTPSTPSGGGYYSPPSYD 240
           PS DPTPTPSTPTPSTP TPS              TPSTP+  TPSTPSGGGYYSPPS+D
Sbjct: 181 PSNDPTPTPSTPTPSTPSTPSGGGYYSPPSHDPTPTPSTPTPSTPSTPSGGGYYSPPSHD 240

Query: 241 PTPTPSTPTPSTPS---------------TPTPSTPTPSTPSTPSGGGYYSPPTYDPTPT 300
           PTPTPSTPTPSTPS               TPTPSTPTPSTPSTPSGGGYYSPPTYD  PT
Sbjct: 241 PTPTPSTPTPSTPSTPSGGGYYSPPTNDPTPTPSTPTPSTPSTPSGGGYYSPPTYD--PT 300

Query: 301 PTTPSTPSTPSGGGGYNSPPTYDPTPTPSTPSTPSGGGGYYSPPTYDPTPS-TPPSGGSG 360
           PT+PSTPSTPSGGGGY+SPPTYDPTP   TPSTPSGGGGY SPPTYDPTP+ + PSGG G
Sbjct: 301 PTSPSTPSTPSGGGGYSSPPTYDPTP---TPSTPSGGGGYSSPPTYDPTPTPSTPSGGGG 360

Query: 361 YNSPPTFDPTPSTPPSGGSGYNSPPTFDPTPATPSTPPSGGNGYYNPPTSGTPFYGTPPT 420
           Y SPPT+DPTPSTPPSGG GYNSPPTFDP   TPSTPPSG          GTPFYGTPPT
Sbjct: 361 YYSPPTYDPTPSTPPSGGGGYNSPPTFDP---TPSTPPSG----------GTPFYGTPPT 420

Query: 421 TSAPPFVPDPNSPFTGTCNYWRTHPGIIWGLLGWWGTMGSAFGITNAPGFGATLSLPQAL 480
           TSAPPFVPDPNSPFTGTCNYWRTHPGIIWGLLGWWGTMGSAFGITNAPGFGATLSLPQAL
Sbjct: 421 TSAPPFVPDPNSPFTGTCNYWRTHPGIIWGLLGWWGTMGSAFGITNAPGFGATLSLPQAL 480

Query: 481 SNTRTDGLGALYREGAAAFLNSMVNIRYPFTTNQVRDSFVSALSSNKAAAAQAQVFQMAN 518
           SNTRTDGLG+LYREGAAAFLNSMVN RYPFTTNQVR+SFVSALSSNKAAAAQAQVFQMAN
Sbjct: 481 SNTRTDGLGSLYREGAAAFLNSMVNNRYPFTTNQVRESFVSALSSNKAAAAQAQVFQMAN 510

BLAST of HG10005220 vs. NCBI nr
Match: KAG6589294.1 (Protodermal factor 1, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia])

HSP 1 Score: 745.7 bits (1924), Expect = 2.6e-211
Identity = 431/557 (77.38%), Postives = 455/557 (81.69%), Query Frame = 0

Query: 1   MERRVASLLLWTLIVGLVSQNMAIALTSASNEDQKTYYSPDPHAGSPPSGSQ-GRPPYGT 60
           M   +ASLLLWTL VGLVS +MAI LTS S+EDQKTYY+PDPHAGSPPSGS  G PPYGT
Sbjct: 1   MGTTLASLLLWTLFVGLVSGDMAIPLTSTSDEDQKTYYTPDPHAGSPPSGSSPGSPPYGT 60

Query: 61  PPPPRGSGGSHGGKPPSHGHGGKKHNPKPGKCGNPPHTPTPSKPPSGGGGYYNPPTHDPT 120
            PPP GSGGSHGGKPPSHGHGGKK +PKPG CGNPPHTPTPSKPPSGGGG++  P ++PT
Sbjct: 61  TPPPDGSGGSHGGKPPSHGHGGKKRSPKPGNCGNPPHTPTPSKPPSGGGGHHKSPKYNPT 120

Query: 121 PSTPSKPPSGGGHHNPPTYNPTPSNPPSGGGGYYSPPTHDPTPTPSTPSNPP--SGGGGY 180
           PS                    PS PPS GGGYYSPP+HDPTPTPSTP +PP   GGGGY
Sbjct: 121 PS-------------------IPSTPPSDGGGYYSPPSHDPTPTPSTPLSPPPSGGGGGY 180

Query: 181 YSPPSYDPTPTPSTP-TPSTP-------TPSTPSTPSTPTPSTPSGGGYYSPPSYDPTPT 240
           YSPPSYDPTPTPSTP TPS P       TPSTPSTPSTPTPS PSGGGYYSPP+YDPTPT
Sbjct: 181 YSPPSYDPTPTPSTPSTPSNPPPDGGGSTPSTPSTPSTPTPSAPSGGGYYSPPTYDPTPT 240

Query: 241 PSTP-TPSTPSTPTPSTPTPSTPSTPS-GGGYYSPPTYDPTPTPTTPS--TPSTPSGG-- 300
           PSTP TPSTPSTPTPSTP+  TPS PS GGGYYSPPT DPTPTP+TPS  TPSTPSGG  
Sbjct: 241 PSTPSTPSTPSTPTPSTPSTPTPSAPSGGGGYYSPPTSDPTPTPSTPSTPTPSTPSGGGY 300

Query: 301 ------------------------GGYNSPPTYDPTPTPSTPSTPSGGGGYYSPPTYDPT 360
                                   GGYNSPPT+DPTP   TPSTPSGGGGYYSPPTYDPT
Sbjct: 301 YSPPTDNPTTPSTPSTPTPSTPSDGGYNSPPTFDPTP---TPSTPSGGGGYYSPPTYDPT 360

Query: 361 PSTPPSGGSGYNSPPTFDPTPSTPPSGGSGYNSPPTFDPTPATPSTPPSGGNGYYNPPTS 420
           PSTPPSGGSGY SPPT+DPTPSTPPSGGSGYNSPP++DP    PSTPPSGGNG+YNPPTS
Sbjct: 361 PSTPPSGGSGYYSPPTYDPTPSTPPSGGSGYNSPPSYDP---NPSTPPSGGNGFYNPPTS 420

Query: 421 GTPFYGTPPTTSAPPFVPDPNSPFTGTCNYWRTHPGIIWGLLGWWGTMGSAFGITNAPGF 480
           GTPFYGTPPTTSAPPFVPDPNSPFTGTCNYW THPG IWGLLGWWGTMGS FGIT +PGF
Sbjct: 421 GTPFYGTPPTTSAPPFVPDPNSPFTGTCNYWSTHPGAIWGLLGWWGTMGSVFGITGSPGF 480

Query: 481 GATLSLPQALSNTRTDGLGALYREGAAAFLNSMVNIRYPFTTNQVRDSFVSALSSNKAAA 517
           GATLSLPQALSNTRTDGLG+LYREGAAAFLNS+VN RYPFTTN+VR SFV ALSSNKAAA
Sbjct: 481 GATLSLPQALSNTRTDGLGSLYREGAAAFLNSLVNNRYPFTTNEVRQSFVWALSSNKAAA 532

BLAST of HG10005220 vs. NCBI nr
Match: KAE8647347.1 (hypothetical protein Csa_003649 [Cucumis sativus])

HSP 1 Score: 741.9 bits (1914), Expect = 3.8e-210
Identity = 424/533 (79.55%), Postives = 444/533 (83.30%), Query Frame = 0

Query: 1   MERRVASLLLWTLIVGLVSQNMAIALTSASNEDQKTYYSPDPHAGSPPSGSQGRPPYGTP 60
           MER++ASLLLWTLI+GLVSQN+AI LTSA NEDQKTYY+PDPHAGSPP+ S G PPYG+ 
Sbjct: 1   MERKLASLLLWTLILGLVSQNIAIPLTSAGNEDQKTYYTPDPHAGSPPTDSHGNPPYGS- 60

Query: 61  PPPRGSGGSHGGKPPSHGHGGKKHNPKPGKCGNPPHTPTPSKPPSGGGGYYNPPTHDPTP 120
           PPP GSGGSHGGKPPSHGHGGKKH PKPG CGNPP+TPTPSK          PPTHDPTP
Sbjct: 61  PPPHGSGGSHGGKPPSHGHGGKKHKPKPGNCGNPPYTPTPSK----------PPTHDPTP 120

Query: 121 STPSKPPSGGGHHNPPTYNPTPSNPPSGGGGYYSPPTHDPTPTPSTPSNPPSGGGGYYSP 180
           STPSKPPSGGG H+         NPP+GGGGY SPP+HDPTPTPSTP+     GGGYYSP
Sbjct: 121 STPSKPPSGGGGHH---------NPPTGGGGYNSPPSHDPTPTPSTPTPSTPSGGGYYSP 180

Query: 181 PSYDPTPTPSTPTPSTPTPSTPSTPSTPTPSTPSGGGYYSPPSYDPTPTPSTPTPSTPS- 240
           PS DPTPTPSTPTPS             TPSTPSGGGYYSPPS+DPTPTPSTPTPSTPS 
Sbjct: 181 PSNDPTPTPSTPTPS-------------TPSTPSGGGYYSPPSHDPTPTPSTPTPSTPST 240

Query: 241 --------------TPTPSTPTPSTPSTPSGGGYYSPPTYDPTPTPTTPSTPSTPSGGGG 300
                         TPTPSTPTPSTPSTPSGGGYYSPPTYD  PTPT+PSTPSTPSGGGG
Sbjct: 241 PSGGGYYSPPTNDPTPTPSTPTPSTPSTPSGGGYYSPPTYD--PTPTSPSTPSTPSGGGG 300

Query: 301 YNSPPTYDPTPTPSTPSTPSGGGGYYSPPTYDPTPS-TPPSGGSGYNSPPTFDPTPSTPP 360
           Y+SPPTYDPTP   TPSTPSGGGGY SPPTYDPTP+ + PSGG GY SPPT+DPTPSTPP
Sbjct: 301 YSSPPTYDPTP---TPSTPSGGGGYSSPPTYDPTPTPSTPSGGGGYYSPPTYDPTPSTPP 360

Query: 361 SGGSGYNSPPTFDPTPATPSTPPSGGNGYYNPPTSGTPFYGTPPTTSAPPFVPDPNSPFT 420
           SGG GYNSPPTFDP   TPSTPPSG          GTPFYGTPPTTSAPPFVPDPNSPFT
Sbjct: 361 SGGGGYNSPPTFDP---TPSTPPSG----------GTPFYGTPPTTSAPPFVPDPNSPFT 420

Query: 421 GTCNYWRTHPGIIWGLLGWWGTMGSAFGITNAPGFGATLSLPQALSNTRTDGLGALYREG 480
           GTCNYWRTHPGIIWGLLGWWGTMGSAFGITNAPGFGATLSLPQALSNTRTDGLG+LYREG
Sbjct: 421 GTCNYWRTHPGIIWGLLGWWGTMGSAFGITNAPGFGATLSLPQALSNTRTDGLGSLYREG 480

Query: 481 AAAFLNSMVNIRYPFTTNQVRDSFVSALSSNKAAAAQAQVFQMANEGRFKPRT 518
           AAAFLNSMVN RYPFTTNQVR+SFVSALSSNKAAAAQAQVFQMANEGRFKPRT
Sbjct: 481 AAAFLNSMVNNRYPFTTNQVRESFVSALSSNKAAAAQAQVFQMANEGRFKPRT 482

BLAST of HG10005220 vs. NCBI nr
Match: XP_031743089.1 (protodermal factor 1 isoform X2 [Cucumis sativus])

HSP 1 Score: 740.0 bits (1909), Expect = 1.4e-209
Identity = 427/536 (79.66%), Postives = 446/536 (83.21%), Query Frame = 0

Query: 1   MERRVASLLLWTLIVGLVSQNMAIALTSASNEDQKTYYSPDPHAGSPPSGSQGRPPYGTP 60
           MER++ASLLLWTLI+GLVSQN+AI LTSA NEDQKTYY+PDPHAGSPP+ S G PPYG+ 
Sbjct: 1   MERKLASLLLWTLILGLVSQNIAIPLTSAGNEDQKTYYTPDPHAGSPPTDSHGNPPYGS- 60

Query: 61  PPPRGSGGSHGGKPPSHGHGGKKHNPKPGKCGNPPHTPTPSKPPSGGGGYYNPPTHDPTP 120
           PPP GSGGSHGGKPPSHGHGGKKH PKPG CGNPP+TPTPSK          PPTHDPTP
Sbjct: 61  PPPHGSGGSHGGKPPSHGHGGKKHKPKPGNCGNPPYTPTPSK----------PPTHDPTP 120

Query: 121 STPSKPPSGGGHHNPPTYNPTPSNPPSGGGGYYSPPTHDPTPTPSTPSNPPSGGGGYYSP 180
           STPSKPPSGGG H+         NPP+GGGGY SPP+HDPTPTPSTP+     GGGYYSP
Sbjct: 121 STPSKPPSGGGGHH---------NPPTGGGGYNSPPSHDPTPTPSTPTPSTPSGGGYYSP 180

Query: 181 PSYDPTPTPSTPTPSTPTPSTPSTPSTPTPSTPSGGGYYSPPSYDPTPTPSTPTPSTPS- 240
           PS DPTPTPSTPTPS             TPSTPSGGGYYSPPS+DPTPTPSTPTPSTPS 
Sbjct: 181 PSNDPTPTPSTPTPS-------------TPSTPSGGGYYSPPSHDPTPTPSTPTPSTPST 240

Query: 241 --------------TPTPSTPTPSTPSTPSGGGYYSPPTYDPTPTPT--TPSTPSTPSGG 300
                         TPTPSTPTPSTPSTPSGGGYYSPPT DPTPTP+  TPSTPSTPS G
Sbjct: 241 PSGGGYYSPPSHDPTPTPSTPTPSTPSTPSGGGYYSPPTNDPTPTPSTPTPSTPSTPS-G 300

Query: 301 GGYNSPPTYDPTPT-PSTPSTPSGGGGYYSPPTYDPTPS-TPPSGGSGYNSPPTFDPTPS 360
           GGY SPPTYDPTPT PSTPSTPSGGGGY SPPTYDPTP+ + PSGG GY SPPT+DPTPS
Sbjct: 301 GGYYSPPTYDPTPTSPSTPSTPSGGGGYSSPPTYDPTPTPSTPSGGGGYYSPPTYDPTPS 360

Query: 361 TPPSGGSGYNSPPTFDPTPATPSTPPSGGNGYYNPPTSGTPFYGTPPTTSAPPFVPDPNS 420
           TPPSGG GYNSPPTFDP   TPSTPPSG          GTPFYGTPPTTSAPPFVPDPNS
Sbjct: 361 TPPSGGGGYNSPPTFDP---TPSTPPSG----------GTPFYGTPPTTSAPPFVPDPNS 420

Query: 421 PFTGTCNYWRTHPGIIWGLLGWWGTMGSAFGITNAPGFGATLSLPQALSNTRTDGLGALY 480
           PFTGTCNYWRTHPGIIWGLLGWWGTMGSAFGITNAPGFGATLSLPQALSNTRTDGLG+LY
Sbjct: 421 PFTGTCNYWRTHPGIIWGLLGWWGTMGSAFGITNAPGFGATLSLPQALSNTRTDGLGSLY 480

Query: 481 REGAAAFLNSMVNIRYPFTTNQVRDSFVSALSSNKAAAAQAQVFQMANEGRFKPRT 518
           REGAAAFLNSMVN RYPFTTNQVR+SFVSALSSNKAAAAQAQVFQMANEGRFKPRT
Sbjct: 481 REGAAAFLNSMVNNRYPFTTNQVRESFVSALSSNKAAAAQAQVFQMANEGRFKPRT 489

BLAST of HG10005220 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9S728 (Protodermal factor 1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=PDF1 PE=2 SV=1)

HSP 1 Score: 193.0 bits (489), Expect = 8.6e-48
Identity = 159/317 (50.16%), Postives = 188/317 (59.31%), Query Frame = 0

Query: 212 TPSGGGYYSPPSYDPTPT-----PSTPTPSTPSTPTPSTPTPSTPSTPSGGGYYSPPTYD 271
           +P  G + +PPS+ P  +     P  P+PSTPS P+P + TP TPSTPS           
Sbjct: 39  SPPSGSHGTPPSHTPPSSNCGSPPYDPSPSTPSHPSPPSHTP-TPSTPS----------- 98

Query: 272 PTPTPTTPS---TPSTPSGGGGYNSPPTYDPTPTPSTPSTPSGGGGYYSPPTYDPTPSTP 331
            TPTP TPS   TP TP    G  SPP++    TPS PSTPS            PTPS P
Sbjct: 99  HTPTPHTPSHTPTPHTPPCNCG--SPPSH--PSTPSHPSTPS-----------HPTPSHP 158

Query: 332 PSGGSGYNSPPTFDPTPSTPPSGGSGYNSPPTFDPTPATPSTPPSGGNGYYNPPTSGTPF 391
           PSGG  Y+SPP   P   TPPS        P  D     P TP  GG    +PP   TP 
Sbjct: 159 PSGGY-YSSPPPRTPVVVTPPS--------PIVD-----PGTPIIGG----SPP---TPI 218

Query: 392 YGTPPTTSAPPFVPDPNSPFTGTCNYWRTHPGIIWGLLGWWGTMGSAFGI----TNAPGF 451
               P T   PF+P P  P TGTC+YWR HP +IWGLLGWWGT+G AFG     ++ PGF
Sbjct: 219 --IDPGTPGTPFIPAPFPPITGTCDYWRNHPTLIWGLLGWWGTVGGAFGTVSIPSSIPGF 278

Query: 452 GATLSLPQALSNTRTDGLGALYREGAAAFLNSMVNIRYPFTTNQVRDSFVSALSSNKAAA 511
              ++L QALSNTR+D +GALYREG A++LNSMVN ++PFTT QVRD FV+ LSSNKAA 
Sbjct: 279 DPHMNLLQALSNTRSDPIGALYREGTASWLNSMVNHKFPFTTPQVRDHFVAGLSSNKAAT 305

Query: 512 AQAQVFQMANEGRFKPR 517
            QA  F++ANEGR KPR
Sbjct: 339 KQAHTFKLANEGRLKPR 305

BLAST of HG10005220 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9SN46 (Leucine-rich repeat extensin-like protein 5 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=LRX5 PE=2 SV=2)

HSP 1 Score: 68.2 bits (165), Expect = 3.2e-10
Identity = 149/361 (41.27%), Postives = 174/361 (48.20%), Query Frame = 0

Query: 88  PGKCGNPPHTPTPSKPPSGGGGYYNPPTHDPT-PSTPS---KPPSGGGHHNPPTYNPTPS 147
           PG+C      P       G G    PP   P+ P+TPS    PPS     +PP   P+P 
Sbjct: 381 PGQCAAFSSLPPVDCGSFGCGRSTRPPVVVPSPPTTPSPGGSPPSPSISPSPPITVPSPP 440

Query: 148 NPPSGGGGYYSPPTHDPTPTPSTPSNPPSGGGGYYSPPSYDPTPT-----PSTPTPSTPT 207
             PS GG   SPP+  P+  PS PS  PS G    SPP+   TPT     PS+PT  TP 
Sbjct: 441 TTPSPGG---SPPS--PSIVPSPPSTTPSPG----SPPTSPTTPTPGGSPPSSPTTPTPG 500

Query: 208 PSTPSTPSTPT--------PSTPSGGGYYSPPSYDPTP------TPSTPT-------PS- 267
            S PS+P+TPT        P+TPS GG    PS  P+P       PSTPT       PS 
Sbjct: 501 GSPPSSPTTPTPGGSPPSSPTTPSPGGSPPSPSISPSPPITVPSPPSTPTSPGSPPSPSS 560

Query: 268 -TPSTPTPSTPTPSTPSTPSGGGYYSPPTYDPTPTPTTPSTPSTPSG--GGGYNSPPTYD 327
            TPS+P PS PTPSTP TP   G  SPP   P+P  T PS PS+PS        SPP   
Sbjct: 561 PTPSSPIPSPPTPSTPPTPISPGQNSPPII-PSPPFTGPSPPSSPSPPLPPVIPSPPIVG 620

Query: 328 PTPTPSTPSTPSGGGGYYSPPTYDPTPST---PPSGGSGYN-------SPPTFDPTPSTP 387
           PTP+   PSTP+     YSP    P PST   PP   +GY+        PPTF P+PS P
Sbjct: 621 PTPSSPPPSTPT---PVYSP----PPPSTGYPPPPPFTGYSPPSPPPPPPPTFSPSPSIP 680

Query: 388 PSGGSGYNSPPTFDPTPATPSTPPSGGNGYYNPPTS-----GTPFYGTPPTTSAPPFVPD 400
           P        P T+ P P  P  PP     YY P  S      +P YGTPP  S  P++P 
Sbjct: 681 PP------PPQTYSPFPPPPPPPP---QTYYPPQPSPSQPPQSPIYGTPP-PSPIPYLPS 714

BLAST of HG10005220 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P14918 (Extensin OS=Zea mays OX=4577 GN=HRGP PE=2 SV=1)

HSP 1 Score: 65.1 bits (157), Expect = 2.7e-09
Identity = 116/293 (39.59%), Postives = 146/293 (49.83%), Query Frame = 0

Query: 85  NPKPGKCGNPPHTPTPS-KPPSGGGGYYNPPTHDPTPS--TPS-KPPSGGGHHNPPTYNP 144
           +PKP      P T TPS KPP+       PPT  PTP   TPS KPP+      PPTY P
Sbjct: 24  SPKPPTPKPTPPTYTPSPKPPAS-----KPPTPKPTPPTYTPSPKPPT--PKPTPPTYTP 83

Query: 145 TPSNPPSGGGGYYSPPTHDPTPTPSTPS-NPPSGGGGYYSPPSYDPTPTPSTPTPSTPTP 204
           +P  P +       PPT  PTP   TPS  PP+      +PP+Y P+P P    P TP P
Sbjct: 84  SPKPPAT------KPPTPKPTPPTYTPSPKPPTPKP---TPPTYTPSPKPPATKPPTPKP 143

Query: 205 STPSTPSTPTPSTPSGGGYYSPPSYDPTPTPSTPTPSTPS-TPTPSTPTPSTPSTPSGGG 264
           + P+   +P P TP      +PP+Y P+P P TP P+ P+ TP+P  PT  TP       
Sbjct: 144 TPPTYTPSPKPPTPKP----TPPTYTPSPKPPTPKPTPPTYTPSPKPPTHPTPKP----- 203

Query: 265 YYSPPTYDPTPTPTTPSTPSTPSGGGGYNSPPTYDPTPTPSTPSTPSGGGGYYSPPTYDP 324
             +PPTY P+P P TP             +PPTY P+P P TP          +PPTY P
Sbjct: 204 --TPPTYTPSPKPPTPKP-----------TPPTYTPSPKPPTPKP--------TPPTYTP 263

Query: 325 TPSTPPS-GGSGYNSPPTFDPTPSTPPSGGSGYNSPPTFDPTPA---TPSTPP 368
           +P  P +   +   +PPT+ PTP  P +       PPT+ PTP    TPS PP
Sbjct: 264 SPKPPATKPPTPKPTPPTYTPTPKPPAT------KPPTYTPTPPVSHTPSPPP 264

BLAST of HG10005220 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0KGQ1 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_6G423360 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 750.4 bits (1936), Expect = 5.1e-213
Identity = 440/554 (79.42%), Postives = 462/554 (83.39%), Query Frame = 0

Query: 1   MERRVASLLLWTLIVGLVSQNMAIALTSASNEDQKTYYSPDPHAGSPPSGSQGRPPYGTP 60
           MER++ASLLLWTLI+GLVSQN+AI LTSA NEDQKTYY+PDPHAGSPP+ S G PPYG+ 
Sbjct: 1   MERKLASLLLWTLILGLVSQNIAIPLTSAGNEDQKTYYTPDPHAGSPPTDSHGNPPYGS- 60

Query: 61  PPPRGSGGSHGGKPPSHGHGGKKHNPKPGKCGNPPHTPTPSKPPSGGGGYYNPPTHDPTP 120
           PPP GSGGSHGGKPPSHGHGGKKH PKPG CGNPP+TPTPSK          PPTHDPTP
Sbjct: 61  PPPHGSGGSHGGKPPSHGHGGKKHKPKPGNCGNPPYTPTPSK----------PPTHDPTP 120

Query: 121 STPSKPPSGGGHHNPPTYNPTPSNPPSGGGGYYSPPTHDPTPTPSTPS-NPPS--GGGGY 180
           STPSKPPSGGG H+         NPP+GGGGY SPP+HDPTPTPSTP+ + PS   GGGY
Sbjct: 121 STPSKPPSGGGGHH---------NPPTGGGGYNSPPSHDPTPTPSTPTPSTPSTPSGGGY 180

Query: 181 YSPPSYDPTPTPSTPTPSTP-TPS--------------TPSTPSTPTPSTPSGGGYYSPP 240
           YSPP+YDPTPTPSTPTPSTP TPS              TPSTP+  TPSTPSGGGYYSPP
Sbjct: 181 YSPPTYDPTPTPSTPTPSTPSTPSGGGYYSPPTYDPTPTPSTPTPSTPSTPSGGGYYSPP 240

Query: 241 SYDPTPTPSTPTPSTPS---------------TPTPSTPTPSTPSTPSGGGYYSPPTYDP 300
           +YDPTPTPSTPTPSTPS               TPTPSTPTPSTPSTPSGGGYYSPPTYDP
Sbjct: 241 TYDPTPTPSTPTPSTPSTPSGGGYYSPPTYDPTPTPSTPTPSTPSTPSGGGYYSPPTYDP 300

Query: 301 TPTPT--TPSTPSTPSGGGGYNSPPTYDPTPT-PSTPSTPSGGGGYYSPPTYDPTPS-TP 360
           TPTP+  TPSTPSTPS GGGY SPPTYDPTPT PSTPSTPSGGGGY SPPTYDPTP+ + 
Sbjct: 301 TPTPSTPTPSTPSTPS-GGGYYSPPTYDPTPTSPSTPSTPSGGGGYSSPPTYDPTPTPST 360

Query: 361 PSGGSGYNSPPTFDPTPSTPPSGGSGYNSPPTFDPTPATPSTPPSGGNGYYNPPTSGTPF 420
           PSGG GY SPPT+DPTPSTPPSGG GYNSPPTFDP   TPSTPPSG          GTPF
Sbjct: 361 PSGGGGYYSPPTYDPTPSTPPSGGGGYNSPPTFDP---TPSTPPSG----------GTPF 420

Query: 421 YGTPPTTSAPPFVPDPNSPFTGTCNYWRTHPGIIWGLLGWWGTMGSAFGITNAPGFGATL 480
           YGTPPTTSAPPFVPDPNSPFTGTCNYWRTHPGIIWGLLGWWGTMGSAFGITNAPGFGATL
Sbjct: 421 YGTPPTTSAPPFVPDPNSPFTGTCNYWRTHPGIIWGLLGWWGTMGSAFGITNAPGFGATL 480

Query: 481 SLPQALSNTRTDGLGALYREGAAAFLNSMVNIRYPFTTNQVRDSFVSALSSNKAAAAQAQ 518
           SLPQALSNTRTDGLG+LYREGAAAFLNSMVN RYPFTTNQVR+SFVSALSSNKAAAAQAQ
Sbjct: 481 SLPQALSNTRTDGLGSLYREGAAAFLNSMVNNRYPFTTNQVRESFVSALSSNKAAAAQAQ 520

BLAST of HG10005220 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1JPJ4 (leucine-rich repeat extensin-like protein 5 isoform X2 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111486335 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 731.5 bits (1887), Expect = 2.5e-207
Identity = 431/569 (75.75%), Postives = 465/569 (81.72%), Query Frame = 0

Query: 1   MERRVASLLLWTLIVGLVSQNMAIALTSASNEDQKTYYSPDPHAGSPPSGSQ-GRPPYGT 60
           M   +ASLLLWTL VGLVS +MAI LTS S+EDQKTYY+PDPHAGSPPSGS  G PPYGT
Sbjct: 4   MGTTLASLLLWTLFVGLVSGDMAIPLTSTSDEDQKTYYTPDPHAGSPPSGSSPGSPPYGT 63

Query: 61  PPPPRGSGGSHGGKPPSHGHGGKKHNPKPGKCGNPPHTPTPSKPPSGGGGYYNPPTHDPT 120
            PPP GSGGSHGGKPPSHGHGGKK +PKPG CGNPPHTPTPSKPPSGGGG++  P H+PT
Sbjct: 64  TPPPDGSGGSHGGKPPSHGHGGKKRSPKPGNCGNPPHTPTPSKPPSGGGGHHKSPKHNPT 123

Query: 121 PSTPSKPPS-GGGHHNPPTYNP-----TPSNPPS--GGGGYYSPPTHDPTPTPSTPSNP- 180
           PS PS PPS GGG+++PP+++P     TPS+PPS  GGGGYYSPPT+DPTPTPSTPS P 
Sbjct: 124 PSIPSTPPSDGGGYYSPPSHDPTPTPSTPSSPPSDGGGGGYYSPPTYDPTPTPSTPSTPS 183

Query: 181 --------------PSGGGGYYSPPSYDPTP---TPSTPTPSTPTPSTPSTPSTPTPSTP 240
                         PSGGGGYYSPP+YDPTP   TPSTPTPSTP+  TPSTPSTPTPS P
Sbjct: 184 TPTPSTPSTPTPSAPSGGGGYYSPPTYDPTPTPSTPSTPTPSTPSTPTPSTPSTPTPSAP 243

Query: 241 S-GGGYYSPPSYDPTPTPSTPTPSTPSTPTPSTPTPSTPSTPSGGGYYSPPTYDPTPTPT 300
           S GGGYYSPP+YDPTPTPSTPTPSTPSTPTPS P+        GGGYYSPPTYDPTPTP+
Sbjct: 244 SGGGGYYSPPTYDPTPTPSTPTPSTPSTPTPSAPS-------GGGGYYSPPTYDPTPTPS 303

Query: 301 TPS----------TPSTPS-------GGGGYNSPPTYDPTPTPSTPSTPS----GGGGYY 360
           TPS          TPSTPS        GGGY SPPT DPT TPSTPSTP+      GGY 
Sbjct: 304 TPSTPTPSTPSTPTPSTPSTPTPSTPSGGGYYSPPTDDPT-TPSTPSTPTPSTPSDGGYN 363

Query: 361 SPPTYDPTPS-TPPSGGSGYNSPPTFDP---TPSTPPSGGSGYNSPPTFDPTPATPSTPP 420
           SPPTYDPTP+ + PSGG GY SPPT+DP   TPSTPPSGGSGY+SPP++DP    PSTPP
Sbjct: 364 SPPTYDPTPTPSTPSGGGGYYSPPTYDPTPSTPSTPPSGGSGYDSPPSYDP---NPSTPP 423

Query: 421 SGGNGYYNPPTSGTPFYGTPPTTSAPPFVPDPNSPFTGTCNYWRTHPGIIWGLLGWWGTM 480
           SGGNGYYNPPTSGTPFYGTPPTTSAPPFVPDPN+PFTGTCNYW THPG IWGLLGWWGTM
Sbjct: 424 SGGNGYYNPPTSGTPFYGTPPTTSAPPFVPDPNTPFTGTCNYWSTHPGAIWGLLGWWGTM 483

Query: 481 GSAFGITNAPGFGATLSLPQALSNTRTDGLGALYREGAAAFLNSMVNIRYPFTTNQVRDS 517
           GS FGIT +PGFGATLSLPQALSNTRTDGLG+LYREGAAAFLNSMVN RYPFTT++VR S
Sbjct: 484 GSVFGITGSPGFGATLSLPQALSNTRTDGLGSLYREGAAAFLNSMVNNRYPFTTDEVRQS 543

BLAST of HG10005220 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1JNN6 (protodermal factor 1-like isoform X3 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111486335 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 724.5 bits (1869), Expect = 3.0e-205
Identity = 427/562 (75.98%), Postives = 457/562 (81.32%), Query Frame = 0

Query: 1   MERRVASLLLWTLIVGLVSQNMAIALTSASNEDQKTYYSPDPHAGSPPSGSQ-GRPPYGT 60
           M   +ASLLLWTL VGLVS +MAI LTS S+EDQKTYY+PDPHAGSPPSGS  G PPYGT
Sbjct: 4   MGTTLASLLLWTLFVGLVSGDMAIPLTSTSDEDQKTYYTPDPHAGSPPSGSSPGSPPYGT 63

Query: 61  PPPPRGSGGSHGGKPPSHGHGGKKHNPKPGKCGNPPHTPTPSKPPSGGGGYYNPPTHDPT 120
            PPP GSGGSHGGKPPSHGHGGKK +PKPG CGNPPHTPTPSKPPSGGGG++  P H+PT
Sbjct: 64  TPPPDGSGGSHGGKPPSHGHGGKKRSPKPGNCGNPPHTPTPSKPPSGGGGHHKSPKHNPT 123

Query: 121 PSTPSKPPS-GGGHHNPPTYNP-----TPSNPPS---------------GGGGYYSPPTH 180
           PS PS PPS GGG+++PP+++P     TPS+PPS                GGGYYSPPT+
Sbjct: 124 PSIPSTPPSDGGGYYSPPSHDPTPTPSTPSSPPSDGGGSTPSTPTPSAPSGGGYYSPPTY 183

Query: 181 DPTPTPSTPSNP---------------PSGGGGYYSPPSYDPTP---TPSTPTPSTPTPS 240
           DPTPTPSTPS P               PSGGGGYYSPP+YDPTP   TPSTPTPSTP+  
Sbjct: 184 DPTPTPSTPSTPSTPTPSTPSTPTPSAPSGGGGYYSPPTYDPTPTPSTPSTPTPSTPSTP 243

Query: 241 TPSTPSTPTPSTPS-GGGYYSPPSYDPTP---TPSTPTPSTPSTPTPSTPTPSTPSTPSG 300
           TPSTPSTPTPS PS GGGYYSPP+YDPTP   TPSTPTPSTPSTPTPSTP+  TPSTPSG
Sbjct: 244 TPSTPSTPTPSAPSGGGGYYSPPTYDPTPTPSTPSTPTPSTPSTPTPSTPSTPTPSTPSG 303

Query: 301 GGYYSPPTYDPTPTPTTPS--TPSTPSGGGGYNSPPTYDPTPTPSTPSTPSGGGGYYSPP 360
           GGYYSPPT DPT TP+TPS  TPSTPS  GGYNSPPTYDPTP   TPSTPSGGGGYYSPP
Sbjct: 304 GGYYSPPTDDPT-TPSTPSTPTPSTPS-DGGYNSPPTYDPTP---TPSTPSGGGGYYSPP 363

Query: 361 TYDPTPSTPPSGGSGYNSPPTFDPTPSTPPSGGSGYNSPPTFDPTPATPSTPPSGGNGYY 420
           TYDPTPS                 TPSTPPSGGSGY+SPP++DP    PSTPPSGGNGYY
Sbjct: 364 TYDPTPS-----------------TPSTPPSGGSGYDSPPSYDP---NPSTPPSGGNGYY 423

Query: 421 NPPTSGTPFYGTPPTTSAPPFVPDPNSPFTGTCNYWRTHPGIIWGLLGWWGTMGSAFGIT 480
           NPPTSGTPFYGTPPTTSAPPFVPDPN+PFTGTCNYW THPG IWGLLGWWGTMGS FGIT
Sbjct: 424 NPPTSGTPFYGTPPTTSAPPFVPDPNTPFTGTCNYWSTHPGAIWGLLGWWGTMGSVFGIT 483

Query: 481 NAPGFGATLSLPQALSNTRTDGLGALYREGAAAFLNSMVNIRYPFTTNQVRDSFVSALSS 517
            +PGFGATLSLPQALSNTRTDGLG+LYREGAAAFLNSMVN RYPFTT++VR SFVSALSS
Sbjct: 484 GSPGFGATLSLPQALSNTRTDGLGSLYREGAAAFLNSMVNNRYPFTTDEVRQSFVSALSS 540

BLAST of HG10005220 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1JF43 (protodermal factor 1-like isoform X1 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111486335 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 724.2 bits (1868), Expect = 3.9e-205
Identity = 430/582 (73.88%), Postives = 464/582 (79.73%), Query Frame = 0

Query: 1   MERRVASLLLWTLIVGLVSQNMAIALTSASNEDQKTYYSPDPHAGSPPSGSQ-GRPPYGT 60
           M   +ASLLLWTL VGLVS +MAI LTS S+EDQKTYY+PDPHAGSPPSGS  G PPYGT
Sbjct: 4   MGTTLASLLLWTLFVGLVSGDMAIPLTSTSDEDQKTYYTPDPHAGSPPSGSSPGSPPYGT 63

Query: 61  PPPPRGSGGSHGGKPPSHGHGGKKHNPKPGKCGNPPHTPTPSKPPSGGGGYYNPPTHDPT 120
            PPP GSGGSHGGKPPSHGHGGKK +PKPG CGNPPHTPTPSKPPSGGGG++  P H+PT
Sbjct: 64  TPPPDGSGGSHGGKPPSHGHGGKKRSPKPGNCGNPPHTPTPSKPPSGGGGHHKSPKHNPT 123

Query: 121 PSTPSKPPS-GGGHHNPPTYNP-----TPSNPPS---------------GGGGYYSPPTH 180
           PS PS PPS GGG+++PP+++P     TPS+PPS                GGGYYSPPT+
Sbjct: 124 PSIPSTPPSDGGGYYSPPSHDPTPTPSTPSSPPSDGGGSTPSTPTPSAPSGGGYYSPPTY 183

Query: 181 DPTPTPSTPSNP---------------PSGGGGYYSPPSYDPTP---TPSTPTPSTPTPS 240
           DPTPTPSTPS P               PSGGGGYYSPP+YDPTP   TPSTPTPSTP+  
Sbjct: 184 DPTPTPSTPSTPSTPTPSTPSTPTPSAPSGGGGYYSPPTYDPTPTPSTPSTPTPSTPSTP 243

Query: 241 TPSTPSTPTPSTPS-GGGYYSPPSYDPTPTPSTPTPSTPSTPTPSTPTPSTPSTPSGGGY 300
           TPSTPSTPTPS PS GGGYYSPP+YDPTPTPSTPTPSTPSTPTPS P+        GGGY
Sbjct: 244 TPSTPSTPTPSAPSGGGGYYSPPTYDPTPTPSTPTPSTPSTPTPSAPS-------GGGGY 303

Query: 301 YSPPTYDPTPTPTTPS----------TPSTPS-------GGGGYNSPPTYDPTPTPSTPS 360
           YSPPTYDPTPTP+TPS          TPSTPS        GGGY SPPT DPT TPSTPS
Sbjct: 304 YSPPTYDPTPTPSTPSTPTPSTPSTPTPSTPSTPTPSTPSGGGYYSPPTDDPT-TPSTPS 363

Query: 361 TPS----GGGGYYSPPTYDPTPS-TPPSGGSGYNSPPTFDP---TPSTPPSGGSGYNSPP 420
           TP+      GGY SPPTYDPTP+ + PSGG GY SPPT+DP   TPSTPPSGGSGY+SPP
Sbjct: 364 TPTPSTPSDGGYNSPPTYDPTPTPSTPSGGGGYYSPPTYDPTPSTPSTPPSGGSGYDSPP 423

Query: 421 TFDPTPATPSTPPSGGNGYYNPPTSGTPFYGTPPTTSAPPFVPDPNSPFTGTCNYWRTHP 480
           ++DP    PSTPPSGGNGYYNPPTSGTPFYGTPPTTSAPPFVPDPN+PFTGTCNYW THP
Sbjct: 424 SYDP---NPSTPPSGGNGYYNPPTSGTPFYGTPPTTSAPPFVPDPNTPFTGTCNYWSTHP 483

Query: 481 GIIWGLLGWWGTMGSAFGITNAPGFGATLSLPQALSNTRTDGLGALYREGAAAFLNSMVN 517
           G IWGLLGWWGTMGS FGIT +PGFGATLSLPQALSNTRTDGLG+LYREGAAAFLNSMVN
Sbjct: 484 GAIWGLLGWWGTMGSVFGITGSPGFGATLSLPQALSNTRTDGLGSLYREGAAAFLNSMVN 543

BLAST of HG10005220 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1EW12 (protodermal factor 1-like isoform X5 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111437076 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 699.5 bits (1804), Expect = 1.0e-197
Identity = 406/526 (77.19%), Postives = 432/526 (82.13%), Query Frame = 0

Query: 1   MERRVASLLLWTLIVGLVSQNMAIALTSASNEDQKTYYSPDPHAGSPPSGSQ-GRPPYGT 60
           M   +A LLLWTL VGLVS +MAI LTS S+EDQKTYY+PDPHAGSPPSGS  G PPYGT
Sbjct: 4   MGTTLAFLLLWTLFVGLVSGDMAIPLTSTSDEDQKTYYTPDPHAGSPPSGSSPGSPPYGT 63

Query: 61  PPPPRGSGGSHGGKPPSHGHGGKKHNPKPGKCGNPPHTPTPSKPPSGGGGYYNPPTHDPT 120
            PPP GSGGSHGGKPP+HGHGGKK +PKPG CGNPPHTPTPSKPPSGGGG++  P ++PT
Sbjct: 64  TPPPDGSGGSHGGKPPTHGHGGKKRSPKPGNCGNPPHTPTPSKPPSGGGGHHKSPKYNPT 123

Query: 121 PSTPSKPPSGGGHHNPPTYNPTPSNPPSGGGGYYSPPTHDPTPTPSTPSNPP---SGGGG 180
           PS                    PS PPS GGGYYSPP+HDPTPTPSTP +PP    GGGG
Sbjct: 124 PS-------------------IPSTPPSDGGGYYSPPSHDPTPTPSTPLSPPPSGGGGGG 183

Query: 181 YYSPPSYDPTPTPSTPTPSTPTP----STPSTPSTPTPSTPSGGGYYSPPSYDPTPTPST 240
           YYSPPSYDPTPTPS  TPS P P    STPSTPSTPTPS PSGGGYYSPP+YDPTPTPS 
Sbjct: 184 YYSPPSYDPTPTPS--TPSNPPPDGGGSTPSTPSTPTPSAPSGGGYYSPPTYDPTPTPS- 243

Query: 241 PTPSTPSTPTPSTPTPSTPSTPSGGGYYSPPTYDPTPTPTTPS--TPSTPSGGGGYNSPP 300
            TPSTPSTPTPSTP+  TPSTPSGGGYYSPPT +PT TP+TPS  TPSTPS  GGYNSPP
Sbjct: 244 -TPSTPSTPTPSTPSTPTPSTPSGGGYYSPPTDNPT-TPSTPSTPTPSTPS-DGGYNSPP 303

Query: 301 TYDPTPTPSTPSTPSGGGGYYSPPTYDPTPSTPPSGGSGYNSPPTFDPTPSTPPSGGSGY 360
           TYDPTP   TPSTPSGGGGYYSPPTYDPTPS                 TPSTPPSGGSGY
Sbjct: 304 TYDPTP---TPSTPSGGGGYYSPPTYDPTPS-----------------TPSTPPSGGSGY 363

Query: 361 NSPPTFDPTPATPSTPPSGGNGYYNPPTSGTPFYGTPPTTSAPPFVPDPNSPFTGTCNYW 420
           +SPP++DP    PSTPPSGGNG+YNPPTSGTPFYGTPPTTSAPPFVPDPNSPFTGTCNYW
Sbjct: 364 DSPPSYDP---NPSTPPSGGNGFYNPPTSGTPFYGTPPTTSAPPFVPDPNSPFTGTCNYW 423

Query: 421 RTHPGIIWGLLGWWGTMGSAFGITNAPGFGATLSLPQALSNTRTDGLGALYREGAAAFLN 480
            THPG IWGLLGWWGTMGS FGIT +PGFGATLSLPQALSNTRTDGLG+LYREGAAAFLN
Sbjct: 424 STHPGAIWGLLGWWGTMGSVFGITGSPGFGATLSLPQALSNTRTDGLGSLYREGAAAFLN 481

Query: 481 SMVNIRYPFTTNQVRDSFVSALSSNKAAAAQAQVFQMANEGRFKPR 517
           S+VN RYPFTTN+VR SFVSALSSN+AAAAQA+VFQMANEGRFKPR
Sbjct: 484 SLVNNRYPFTTNEVRQSFVSALSSNRAAAAQARVFQMANEGRFKPR 481

BLAST of HG10005220 vs. TAIR 10
Match: AT2G42840.1 (protodermal factor 1 )

HSP 1 Score: 193.0 bits (489), Expect = 6.1e-49
Identity = 159/317 (50.16%), Postives = 188/317 (59.31%), Query Frame = 0

Query: 212 TPSGGGYYSPPSYDPTPT-----PSTPTPSTPSTPTPSTPTPSTPSTPSGGGYYSPPTYD 271
           +P  G + +PPS+ P  +     P  P+PSTPS P+P + TP TPSTPS           
Sbjct: 39  SPPSGSHGTPPSHTPPSSNCGSPPYDPSPSTPSHPSPPSHTP-TPSTPS----------- 98

Query: 272 PTPTPTTPS---TPSTPSGGGGYNSPPTYDPTPTPSTPSTPSGGGGYYSPPTYDPTPSTP 331
            TPTP TPS   TP TP    G  SPP++    TPS PSTPS            PTPS P
Sbjct: 99  HTPTPHTPSHTPTPHTPPCNCG--SPPSH--PSTPSHPSTPS-----------HPTPSHP 158

Query: 332 PSGGSGYNSPPTFDPTPSTPPSGGSGYNSPPTFDPTPATPSTPPSGGNGYYNPPTSGTPF 391
           PSGG  Y+SPP   P   TPPS        P  D     P TP  GG    +PP   TP 
Sbjct: 159 PSGGY-YSSPPPRTPVVVTPPS--------PIVD-----PGTPIIGG----SPP---TPI 218

Query: 392 YGTPPTTSAPPFVPDPNSPFTGTCNYWRTHPGIIWGLLGWWGTMGSAFGI----TNAPGF 451
               P T   PF+P P  P TGTC+YWR HP +IWGLLGWWGT+G AFG     ++ PGF
Sbjct: 219 --IDPGTPGTPFIPAPFPPITGTCDYWRNHPTLIWGLLGWWGTVGGAFGTVSIPSSIPGF 278

Query: 452 GATLSLPQALSNTRTDGLGALYREGAAAFLNSMVNIRYPFTTNQVRDSFVSALSSNKAAA 511
              ++L QALSNTR+D +GALYREG A++LNSMVN ++PFTT QVRD FV+ LSSNKAA 
Sbjct: 279 DPHMNLLQALSNTRSDPIGALYREGTASWLNSMVNHKFPFTTPQVRDHFVAGLSSNKAAT 305

Query: 512 AQAQVFQMANEGRFKPR 517
            QA  F++ANEGR KPR
Sbjct: 339 KQAHTFKLANEGRLKPR 305

BLAST of HG10005220 vs. TAIR 10
Match: AT4G18670.1 (Leucine-rich repeat (LRR) family protein )

HSP 1 Score: 68.2 bits (165), Expect = 2.3e-11
Identity = 149/361 (41.27%), Postives = 174/361 (48.20%), Query Frame = 0

Query: 88  PGKCGNPPHTPTPSKPPSGGGGYYNPPTHDPT-PSTPS---KPPSGGGHHNPPTYNPTPS 147
           PG+C      P       G G    PP   P+ P+TPS    PPS     +PP   P+P 
Sbjct: 381 PGQCAAFSSLPPVDCGSFGCGRSTRPPVVVPSPPTTPSPGGSPPSPSISPSPPITVPSPP 440

Query: 148 NPPSGGGGYYSPPTHDPTPTPSTPSNPPSGGGGYYSPPSYDPTPT-----PSTPTPSTPT 207
             PS GG   SPP+  P+  PS PS  PS G    SPP+   TPT     PS+PT  TP 
Sbjct: 441 TTPSPGG---SPPS--PSIVPSPPSTTPSPG----SPPTSPTTPTPGGSPPSSPTTPTPG 500

Query: 208 PSTPSTPSTPT--------PSTPSGGGYYSPPSYDPTP------TPSTPT-------PS- 267
            S PS+P+TPT        P+TPS GG    PS  P+P       PSTPT       PS 
Sbjct: 501 GSPPSSPTTPTPGGSPPSSPTTPSPGGSPPSPSISPSPPITVPSPPSTPTSPGSPPSPSS 560

Query: 268 -TPSTPTPSTPTPSTPSTPSGGGYYSPPTYDPTPTPTTPSTPSTPSG--GGGYNSPPTYD 327
            TPS+P PS PTPSTP TP   G  SPP   P+P  T PS PS+PS        SPP   
Sbjct: 561 PTPSSPIPSPPTPSTPPTPISPGQNSPPII-PSPPFTGPSPPSSPSPPLPPVIPSPPIVG 620

Query: 328 PTPTPSTPSTPSGGGGYYSPPTYDPTPST---PPSGGSGYN-------SPPTFDPTPSTP 387
           PTP+   PSTP+     YSP    P PST   PP   +GY+        PPTF P+PS P
Sbjct: 621 PTPSSPPPSTPT---PVYSP----PPPSTGYPPPPPFTGYSPPSPPPPPPPTFSPSPSIP 680

Query: 388 PSGGSGYNSPPTFDPTPATPSTPPSGGNGYYNPPTS-----GTPFYGTPPTTSAPPFVPD 400
           P        P T+ P P  P  PP     YY P  S      +P YGTPP  S  P++P 
Sbjct: 681 PP------PPQTYSPFPPPPPPPP---QTYYPPQPSPSQPPQSPIYGTPP-PSPIPYLPS 714

BLAST of HG10005220 vs. TAIR 10
Match: AT3G19430.1 (late embryogenesis abundant protein-related / LEA protein-related )

HSP 1 Score: 55.1 bits (131), Expect = 2.0e-07
Identity = 104/231 (45.02%), Postives = 114/231 (49.35%), Query Frame = 0

Query: 135 PPTYNPTPSNPPSGG--GGYYS----PPTHDPTPTPSTPSNPPSGGGGYYSPPSYDPTPT 194
           PP+         SGG  GGY      PP   P PTPS PS  P       SPP   PTPT
Sbjct: 53  PPSPGDDGGGDDSGGDDGGYTPPAPVPPVSPPPPTPSVPSPTPP-----VSPP--PPTPT 112

Query: 195 PSTPTPSTPTPSTPSTPSTPTPSTPSGGGYYSPPSYDPTPTPSTPTPSTPSTPTPSTPTP 254
           PS P   +PTP     P TPTPS PS     SPP   PTPTPS P+P+ P +P P TPTP
Sbjct: 113 PSVP---SPTPPVSPPPPTPTPSVPSPTPPVSPP--PPTPTPSVPSPTPPVSPPPPTPTP 172

Query: 255 STPS-TPSGGGYYSPPTYDPTPTPTTPSTPSTPSGGGGYNSPPTYDPTPTPSTPSTPSGG 314
           S PS TP       P   DP P+P  P +P  P+      SPP  D TPTP TPS P   
Sbjct: 173 SVPSPTP-------PVPTDPMPSPPPPVSPPPPTPTPSVPSPP--DVTPTPPTPSVP--- 232

Query: 315 GGYYSPPTYDPTPSTP--PSGGSGYNSPPTFDPTPSTP-PSGGSGYNSPPT 356
               SPP   PTP TP  PS      +PPT    PS P PSG   Y  PP+
Sbjct: 233 ----SPPDVTPTPPTPSVPSPPDVTPTPPT---PPSVPTPSGSPPYVPPPS 252

The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
XP_038888912.17.5e-24389.58protodermal factor 1-like [Benincasa hispida][more]
XP_011657562.22.4e-21279.20protodermal factor 1 isoform X1 [Cucumis sativus][more]
KAG6589294.12.6e-21177.38Protodermal factor 1, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia][more]
KAE8647347.13.8e-21079.55hypothetical protein Csa_003649 [Cucumis sativus][more]
XP_031743089.11.4e-20979.66protodermal factor 1 isoform X2 [Cucumis sativus][more]
Match NameE-valueIdentityDescription
Q9S7288.6e-4850.16Protodermal factor 1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=PDF1 PE=2 SV=1[more]
Q9SN463.2e-1041.27Leucine-rich repeat extensin-like protein 5 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=L... [more]
P149182.7e-0939.59Extensin OS=Zea mays OX=4577 GN=HRGP PE=2 SV=1[more]
Match NameE-valueIdentityDescription
A0A0A0KGQ15.1e-21379.42Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_6G423360 PE=4 SV=1[more]
A0A6J1JPJ42.5e-20775.75leucine-rich repeat extensin-like protein 5 isoform X2 OS=Cucurbita maxima OX=36... [more]
A0A6J1JNN63.0e-20575.98protodermal factor 1-like isoform X3 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111486335... [more]
A0A6J1JF433.9e-20573.88protodermal factor 1-like isoform X1 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111486335... [more]
A0A6J1EW121.0e-19777.19protodermal factor 1-like isoform X5 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC1114370... [more]
Match NameE-valueIdentityDescription
AT2G42840.16.1e-4950.16protodermal factor 1 [more]
AT4G18670.12.3e-1141.27Leucine-rich repeat (LRR) family protein [more]
AT3G19430.12.0e-0745.02late embryogenesis abundant protein-related / LEA protein-related [more]
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1
Date Performed: 2022-08-01
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availablePRINTSPR01217PRICHEXTENSNcoord: 114..130
score: 40.0
coord: 132..149
score: 40.0
coord: 47..63
score: 32.94
coord: 160..185
score: 33.85
coord: 82..103
score: 31.82
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 182..209
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 32..398
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 366..380
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 381..398
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 223..250
NoneNo IPR availablePANTHERPTHR33210:SF18PROTODERMAL FACTOR 1coord: 1..137
NoneNo IPR availablePANTHERPTHR33210:SF18PROTODERMAL FACTOR 1coord: 245..516
IPR039923Protodermal factor 1PANTHERPTHR33210PROTODERMAL FACTOR 1coord: 245..516
IPR039923Protodermal factor 1PANTHERPTHR33210PROTODERMAL FACTOR 1coord: 1..137

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
HG10005220.1HG10005220.1mRNA