Homology
BLAST of HG10005220 vs. NCBI nr
Match:
XP_038888912.1 (protodermal factor 1-like [Benincasa hispida])
HSP 1 Score: 850.5 bits (2196), Expect = 7.5e-243
Identity = 464/518 (89.58%), Postives = 472/518 (91.12%), Query Frame = 0
Query: 1 MERRVASLLLWTLIVGLVSQNMAIALTSASNEDQKTYYSPDPHAGSPPSGSQGRPPYGTP 60
MERR+ASLLLWTLIVGLVSQN AI LTSASNEDQKTYY+PDPHAGSPPSGSQG PPYGT
Sbjct: 4 MERRLASLLLWTLIVGLVSQNKAIPLTSASNEDQKTYYTPDPHAGSPPSGSQGSPPYGT- 63
Query: 61 PPPRGSGGSHGGKPPSHGHGGKKHNPKPGKCGNPPHTPTPSKPPSGGGGYYNPPTHDPTP 120
PPPRGSGGSHGGKPPSHGHGGKKHNPKPGKCGNPPHTPTPSKPPSGGGGYYNPPTHDPTP
Sbjct: 64 PPPRGSGGSHGGKPPSHGHGGKKHNPKPGKCGNPPHTPTPSKPPSGGGGYYNPPTHDPTP 123
Query: 121 STPSKPPSG-GGHHNPPTYNPTPSNPPSGGGGYYSPPTHDPTPTPSTPSNPPSGGGGYYS 180
STPSKPPSG GG+HNPPTYNPTPSNPPSGGGGYYSPPTHDPTPTP TPSNPPSGGGGYYS
Sbjct: 124 STPSKPPSGDGGYHNPPTYNPTPSNPPSGGGGYYSPPTHDPTPTPLTPSNPPSGGGGYYS 183
Query: 181 PPSYDPTPTPSTPTPSTPTPSTPSTPSTPTPSTPSGGGYYSPPSYDPTPTPSTPTPSTPS 240
PPSYDPTPTPS TPSTPTPSTPS TPSTPSGGGYYSPPSYDPTP TPS
Sbjct: 184 PPSYDPTPTPS--TPSTPTPSTPS-----TPSTPSGGGYYSPPSYDPTP--------TPS 243
Query: 241 TPTPSTPTPSTPSTPSGGGYYSPPTYDPTPTPTTPSTPSTPSGGGGYNSPPTYDPTPTPS 300
TPTPSTPTPSTPSTPSGGGYYSPPT DPTP TPSTPSTPSGGGGY SPPTYDPTPTPS
Sbjct: 244 TPTPSTPTPSTPSTPSGGGYYSPPTNDPTP---TPSTPSTPSGGGGYYSPPTYDPTPTPS 303
Query: 301 TPSTPSGGGGYYSPPTYDPTPSTPPSGGSGYNSPPTFDPTPSTPPSGGSGYNSPPTFDPT 360
TPSTPSGGGGYYSPPTYDPTPS TPSTPPSGGSGY+SPPTFDPT
Sbjct: 304 TPSTPSGGGGYYSPPTYDPTPS-----------------TPSTPPSGGSGYSSPPTFDPT 363
Query: 361 PATPSTPPSGGNGYYNPPTSGTPFYGTPPTTSAPPFVPDPNSPFTGTCNYWRTHPGIIWG 420
P+ P+TPPSGG+GYYNPPTSGTPFYGTPP TSAPPFVPDPNSPFTGTCNYWRTHPGIIWG
Sbjct: 364 PSIPTTPPSGGSGYYNPPTSGTPFYGTPPITSAPPFVPDPNSPFTGTCNYWRTHPGIIWG 423
Query: 421 LLGWWGTMGSAFGITNAPGFGATLSLPQALSNTRTDGLGALYREGAAAFLNSMVNIRYPF 480
LLGWWGTMGSAFGITNAPGFGATLS+PQALSNTRTDGLGALYREGAAAFLNSMVN RYPF
Sbjct: 424 LLGWWGTMGSAFGITNAPGFGATLSIPQALSNTRTDGLGALYREGAAAFLNSMVNNRYPF 483
Query: 481 TTNQVRDSFVSALSSNKAAAAQAQVFQMANEGRFKPRT 518
TTNQVRDSFVSALSSNKAAAAQAQVFQMANEGRFKPRT
Sbjct: 484 TTNQVRDSFVSALSSNKAAAAQAQVFQMANEGRFKPRT 485
BLAST of HG10005220 vs. NCBI nr
Match:
XP_011657562.2 (protodermal factor 1 isoform X1 [Cucumis sativus])
HSP 1 Score: 749.2 bits (1933), Expect = 2.4e-212
Identity = 434/548 (79.20%), Postives = 455/548 (83.03%), Query Frame = 0
Query: 1 MERRVASLLLWTLIVGLVSQNMAIALTSASNEDQKTYYSPDPHAGSPPSGSQGRPPYGTP 60
MER++ASLLLWTLI+GLVSQN+AI LTSA NEDQKTYY+PDPHAGSPP+ S G PPYG+
Sbjct: 1 MERKLASLLLWTLILGLVSQNIAIPLTSAGNEDQKTYYTPDPHAGSPPTDSHGNPPYGS- 60
Query: 61 PPPRGSGGSHGGKPPSHGHGGKKHNPKPGKCGNPPHTPTPSKPPSGGGGYYNPPTHDPTP 120
PPP GSGGSHGGKPPSHGHGGKKH PKPG CGNPP+TPTPSK PPTHDPTP
Sbjct: 61 PPPHGSGGSHGGKPPSHGHGGKKHKPKPGNCGNPPYTPTPSK----------PPTHDPTP 120
Query: 121 STPSKPPSGGGHHNPPTYNPTPSNPPSGGGGYYSPPTHDPTPTPSTPSNPPSGGGGYYSP 180
STPSKPPSGGG H+ NPP+GGGGY SPP+HDPTPTPSTP+ GGGYYSP
Sbjct: 121 STPSKPPSGGGGHH---------NPPTGGGGYNSPPSHDPTPTPSTPTPSTPSGGGYYSP 180
Query: 181 PSYDPTPTPSTPTPSTP-TPS--------------TPSTPSTPTPSTPSGGGYYSPPSYD 240
PS DPTPTPSTPTPSTP TPS TPSTP+ TPSTPSGGGYYSPPS+D
Sbjct: 181 PSNDPTPTPSTPTPSTPSTPSGGGYYSPPSHDPTPTPSTPTPSTPSTPSGGGYYSPPSHD 240
Query: 241 PTPTPSTPTPSTPS---------------TPTPSTPTPSTPSTPSGGGYYSPPTYDPTPT 300
PTPTPSTPTPSTPS TPTPSTPTPSTPSTPSGGGYYSPPTYD PT
Sbjct: 241 PTPTPSTPTPSTPSTPSGGGYYSPPTNDPTPTPSTPTPSTPSTPSGGGYYSPPTYD--PT 300
Query: 301 PTTPSTPSTPSGGGGYNSPPTYDPTPTPSTPSTPSGGGGYYSPPTYDPTPS-TPPSGGSG 360
PT+PSTPSTPSGGGGY+SPPTYDPTP TPSTPSGGGGY SPPTYDPTP+ + PSGG G
Sbjct: 301 PTSPSTPSTPSGGGGYSSPPTYDPTP---TPSTPSGGGGYSSPPTYDPTPTPSTPSGGGG 360
Query: 361 YNSPPTFDPTPSTPPSGGSGYNSPPTFDPTPATPSTPPSGGNGYYNPPTSGTPFYGTPPT 420
Y SPPT+DPTPSTPPSGG GYNSPPTFDP TPSTPPSG GTPFYGTPPT
Sbjct: 361 YYSPPTYDPTPSTPPSGGGGYNSPPTFDP---TPSTPPSG----------GTPFYGTPPT 420
Query: 421 TSAPPFVPDPNSPFTGTCNYWRTHPGIIWGLLGWWGTMGSAFGITNAPGFGATLSLPQAL 480
TSAPPFVPDPNSPFTGTCNYWRTHPGIIWGLLGWWGTMGSAFGITNAPGFGATLSLPQAL
Sbjct: 421 TSAPPFVPDPNSPFTGTCNYWRTHPGIIWGLLGWWGTMGSAFGITNAPGFGATLSLPQAL 480
Query: 481 SNTRTDGLGALYREGAAAFLNSMVNIRYPFTTNQVRDSFVSALSSNKAAAAQAQVFQMAN 518
SNTRTDGLG+LYREGAAAFLNSMVN RYPFTTNQVR+SFVSALSSNKAAAAQAQVFQMAN
Sbjct: 481 SNTRTDGLGSLYREGAAAFLNSMVNNRYPFTTNQVRESFVSALSSNKAAAAQAQVFQMAN 510
BLAST of HG10005220 vs. NCBI nr
Match:
KAG6589294.1 (Protodermal factor 1, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia])
HSP 1 Score: 745.7 bits (1924), Expect = 2.6e-211
Identity = 431/557 (77.38%), Postives = 455/557 (81.69%), Query Frame = 0
Query: 1 MERRVASLLLWTLIVGLVSQNMAIALTSASNEDQKTYYSPDPHAGSPPSGSQ-GRPPYGT 60
M +ASLLLWTL VGLVS +MAI LTS S+EDQKTYY+PDPHAGSPPSGS G PPYGT
Sbjct: 1 MGTTLASLLLWTLFVGLVSGDMAIPLTSTSDEDQKTYYTPDPHAGSPPSGSSPGSPPYGT 60
Query: 61 PPPPRGSGGSHGGKPPSHGHGGKKHNPKPGKCGNPPHTPTPSKPPSGGGGYYNPPTHDPT 120
PPP GSGGSHGGKPPSHGHGGKK +PKPG CGNPPHTPTPSKPPSGGGG++ P ++PT
Sbjct: 61 TPPPDGSGGSHGGKPPSHGHGGKKRSPKPGNCGNPPHTPTPSKPPSGGGGHHKSPKYNPT 120
Query: 121 PSTPSKPPSGGGHHNPPTYNPTPSNPPSGGGGYYSPPTHDPTPTPSTPSNPP--SGGGGY 180
PS PS PPS GGGYYSPP+HDPTPTPSTP +PP GGGGY
Sbjct: 121 PS-------------------IPSTPPSDGGGYYSPPSHDPTPTPSTPLSPPPSGGGGGY 180
Query: 181 YSPPSYDPTPTPSTP-TPSTP-------TPSTPSTPSTPTPSTPSGGGYYSPPSYDPTPT 240
YSPPSYDPTPTPSTP TPS P TPSTPSTPSTPTPS PSGGGYYSPP+YDPTPT
Sbjct: 181 YSPPSYDPTPTPSTPSTPSNPPPDGGGSTPSTPSTPSTPTPSAPSGGGYYSPPTYDPTPT 240
Query: 241 PSTP-TPSTPSTPTPSTPTPSTPSTPS-GGGYYSPPTYDPTPTPTTPS--TPSTPSGG-- 300
PSTP TPSTPSTPTPSTP+ TPS PS GGGYYSPPT DPTPTP+TPS TPSTPSGG
Sbjct: 241 PSTPSTPSTPSTPTPSTPSTPTPSAPSGGGGYYSPPTSDPTPTPSTPSTPTPSTPSGGGY 300
Query: 301 ------------------------GGYNSPPTYDPTPTPSTPSTPSGGGGYYSPPTYDPT 360
GGYNSPPT+DPTP TPSTPSGGGGYYSPPTYDPT
Sbjct: 301 YSPPTDNPTTPSTPSTPTPSTPSDGGYNSPPTFDPTP---TPSTPSGGGGYYSPPTYDPT 360
Query: 361 PSTPPSGGSGYNSPPTFDPTPSTPPSGGSGYNSPPTFDPTPATPSTPPSGGNGYYNPPTS 420
PSTPPSGGSGY SPPT+DPTPSTPPSGGSGYNSPP++DP PSTPPSGGNG+YNPPTS
Sbjct: 361 PSTPPSGGSGYYSPPTYDPTPSTPPSGGSGYNSPPSYDP---NPSTPPSGGNGFYNPPTS 420
Query: 421 GTPFYGTPPTTSAPPFVPDPNSPFTGTCNYWRTHPGIIWGLLGWWGTMGSAFGITNAPGF 480
GTPFYGTPPTTSAPPFVPDPNSPFTGTCNYW THPG IWGLLGWWGTMGS FGIT +PGF
Sbjct: 421 GTPFYGTPPTTSAPPFVPDPNSPFTGTCNYWSTHPGAIWGLLGWWGTMGSVFGITGSPGF 480
Query: 481 GATLSLPQALSNTRTDGLGALYREGAAAFLNSMVNIRYPFTTNQVRDSFVSALSSNKAAA 517
GATLSLPQALSNTRTDGLG+LYREGAAAFLNS+VN RYPFTTN+VR SFV ALSSNKAAA
Sbjct: 481 GATLSLPQALSNTRTDGLGSLYREGAAAFLNSLVNNRYPFTTNEVRQSFVWALSSNKAAA 532
BLAST of HG10005220 vs. NCBI nr
Match:
KAE8647347.1 (hypothetical protein Csa_003649 [Cucumis sativus])
HSP 1 Score: 741.9 bits (1914), Expect = 3.8e-210
Identity = 424/533 (79.55%), Postives = 444/533 (83.30%), Query Frame = 0
Query: 1 MERRVASLLLWTLIVGLVSQNMAIALTSASNEDQKTYYSPDPHAGSPPSGSQGRPPYGTP 60
MER++ASLLLWTLI+GLVSQN+AI LTSA NEDQKTYY+PDPHAGSPP+ S G PPYG+
Sbjct: 1 MERKLASLLLWTLILGLVSQNIAIPLTSAGNEDQKTYYTPDPHAGSPPTDSHGNPPYGS- 60
Query: 61 PPPRGSGGSHGGKPPSHGHGGKKHNPKPGKCGNPPHTPTPSKPPSGGGGYYNPPTHDPTP 120
PPP GSGGSHGGKPPSHGHGGKKH PKPG CGNPP+TPTPSK PPTHDPTP
Sbjct: 61 PPPHGSGGSHGGKPPSHGHGGKKHKPKPGNCGNPPYTPTPSK----------PPTHDPTP 120
Query: 121 STPSKPPSGGGHHNPPTYNPTPSNPPSGGGGYYSPPTHDPTPTPSTPSNPPSGGGGYYSP 180
STPSKPPSGGG H+ NPP+GGGGY SPP+HDPTPTPSTP+ GGGYYSP
Sbjct: 121 STPSKPPSGGGGHH---------NPPTGGGGYNSPPSHDPTPTPSTPTPSTPSGGGYYSP 180
Query: 181 PSYDPTPTPSTPTPSTPTPSTPSTPSTPTPSTPSGGGYYSPPSYDPTPTPSTPTPSTPS- 240
PS DPTPTPSTPTPS TPSTPSGGGYYSPPS+DPTPTPSTPTPSTPS
Sbjct: 181 PSNDPTPTPSTPTPS-------------TPSTPSGGGYYSPPSHDPTPTPSTPTPSTPST 240
Query: 241 --------------TPTPSTPTPSTPSTPSGGGYYSPPTYDPTPTPTTPSTPSTPSGGGG 300
TPTPSTPTPSTPSTPSGGGYYSPPTYD PTPT+PSTPSTPSGGGG
Sbjct: 241 PSGGGYYSPPTNDPTPTPSTPTPSTPSTPSGGGYYSPPTYD--PTPTSPSTPSTPSGGGG 300
Query: 301 YNSPPTYDPTPTPSTPSTPSGGGGYYSPPTYDPTPS-TPPSGGSGYNSPPTFDPTPSTPP 360
Y+SPPTYDPTP TPSTPSGGGGY SPPTYDPTP+ + PSGG GY SPPT+DPTPSTPP
Sbjct: 301 YSSPPTYDPTP---TPSTPSGGGGYSSPPTYDPTPTPSTPSGGGGYYSPPTYDPTPSTPP 360
Query: 361 SGGSGYNSPPTFDPTPATPSTPPSGGNGYYNPPTSGTPFYGTPPTTSAPPFVPDPNSPFT 420
SGG GYNSPPTFDP TPSTPPSG GTPFYGTPPTTSAPPFVPDPNSPFT
Sbjct: 361 SGGGGYNSPPTFDP---TPSTPPSG----------GTPFYGTPPTTSAPPFVPDPNSPFT 420
Query: 421 GTCNYWRTHPGIIWGLLGWWGTMGSAFGITNAPGFGATLSLPQALSNTRTDGLGALYREG 480
GTCNYWRTHPGIIWGLLGWWGTMGSAFGITNAPGFGATLSLPQALSNTRTDGLG+LYREG
Sbjct: 421 GTCNYWRTHPGIIWGLLGWWGTMGSAFGITNAPGFGATLSLPQALSNTRTDGLGSLYREG 480
Query: 481 AAAFLNSMVNIRYPFTTNQVRDSFVSALSSNKAAAAQAQVFQMANEGRFKPRT 518
AAAFLNSMVN RYPFTTNQVR+SFVSALSSNKAAAAQAQVFQMANEGRFKPRT
Sbjct: 481 AAAFLNSMVNNRYPFTTNQVRESFVSALSSNKAAAAQAQVFQMANEGRFKPRT 482
BLAST of HG10005220 vs. NCBI nr
Match:
XP_031743089.1 (protodermal factor 1 isoform X2 [Cucumis sativus])
HSP 1 Score: 740.0 bits (1909), Expect = 1.4e-209
Identity = 427/536 (79.66%), Postives = 446/536 (83.21%), Query Frame = 0
Query: 1 MERRVASLLLWTLIVGLVSQNMAIALTSASNEDQKTYYSPDPHAGSPPSGSQGRPPYGTP 60
MER++ASLLLWTLI+GLVSQN+AI LTSA NEDQKTYY+PDPHAGSPP+ S G PPYG+
Sbjct: 1 MERKLASLLLWTLILGLVSQNIAIPLTSAGNEDQKTYYTPDPHAGSPPTDSHGNPPYGS- 60
Query: 61 PPPRGSGGSHGGKPPSHGHGGKKHNPKPGKCGNPPHTPTPSKPPSGGGGYYNPPTHDPTP 120
PPP GSGGSHGGKPPSHGHGGKKH PKPG CGNPP+TPTPSK PPTHDPTP
Sbjct: 61 PPPHGSGGSHGGKPPSHGHGGKKHKPKPGNCGNPPYTPTPSK----------PPTHDPTP 120
Query: 121 STPSKPPSGGGHHNPPTYNPTPSNPPSGGGGYYSPPTHDPTPTPSTPSNPPSGGGGYYSP 180
STPSKPPSGGG H+ NPP+GGGGY SPP+HDPTPTPSTP+ GGGYYSP
Sbjct: 121 STPSKPPSGGGGHH---------NPPTGGGGYNSPPSHDPTPTPSTPTPSTPSGGGYYSP 180
Query: 181 PSYDPTPTPSTPTPSTPTPSTPSTPSTPTPSTPSGGGYYSPPSYDPTPTPSTPTPSTPS- 240
PS DPTPTPSTPTPS TPSTPSGGGYYSPPS+DPTPTPSTPTPSTPS
Sbjct: 181 PSNDPTPTPSTPTPS-------------TPSTPSGGGYYSPPSHDPTPTPSTPTPSTPST 240
Query: 241 --------------TPTPSTPTPSTPSTPSGGGYYSPPTYDPTPTPT--TPSTPSTPSGG 300
TPTPSTPTPSTPSTPSGGGYYSPPT DPTPTP+ TPSTPSTPS G
Sbjct: 241 PSGGGYYSPPSHDPTPTPSTPTPSTPSTPSGGGYYSPPTNDPTPTPSTPTPSTPSTPS-G 300
Query: 301 GGYNSPPTYDPTPT-PSTPSTPSGGGGYYSPPTYDPTPS-TPPSGGSGYNSPPTFDPTPS 360
GGY SPPTYDPTPT PSTPSTPSGGGGY SPPTYDPTP+ + PSGG GY SPPT+DPTPS
Sbjct: 301 GGYYSPPTYDPTPTSPSTPSTPSGGGGYSSPPTYDPTPTPSTPSGGGGYYSPPTYDPTPS 360
Query: 361 TPPSGGSGYNSPPTFDPTPATPSTPPSGGNGYYNPPTSGTPFYGTPPTTSAPPFVPDPNS 420
TPPSGG GYNSPPTFDP TPSTPPSG GTPFYGTPPTTSAPPFVPDPNS
Sbjct: 361 TPPSGGGGYNSPPTFDP---TPSTPPSG----------GTPFYGTPPTTSAPPFVPDPNS 420
Query: 421 PFTGTCNYWRTHPGIIWGLLGWWGTMGSAFGITNAPGFGATLSLPQALSNTRTDGLGALY 480
PFTGTCNYWRTHPGIIWGLLGWWGTMGSAFGITNAPGFGATLSLPQALSNTRTDGLG+LY
Sbjct: 421 PFTGTCNYWRTHPGIIWGLLGWWGTMGSAFGITNAPGFGATLSLPQALSNTRTDGLGSLY 480
Query: 481 REGAAAFLNSMVNIRYPFTTNQVRDSFVSALSSNKAAAAQAQVFQMANEGRFKPRT 518
REGAAAFLNSMVN RYPFTTNQVR+SFVSALSSNKAAAAQAQVFQMANEGRFKPRT
Sbjct: 481 REGAAAFLNSMVNNRYPFTTNQVRESFVSALSSNKAAAAQAQVFQMANEGRFKPRT 489
BLAST of HG10005220 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match:
Q9S728 (Protodermal factor 1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=PDF1 PE=2 SV=1)
HSP 1 Score: 193.0 bits (489), Expect = 8.6e-48
Identity = 159/317 (50.16%), Postives = 188/317 (59.31%), Query Frame = 0
Query: 212 TPSGGGYYSPPSYDPTPT-----PSTPTPSTPSTPTPSTPTPSTPSTPSGGGYYSPPTYD 271
+P G + +PPS+ P + P P+PSTPS P+P + TP TPSTPS
Sbjct: 39 SPPSGSHGTPPSHTPPSSNCGSPPYDPSPSTPSHPSPPSHTP-TPSTPS----------- 98
Query: 272 PTPTPTTPS---TPSTPSGGGGYNSPPTYDPTPTPSTPSTPSGGGGYYSPPTYDPTPSTP 331
TPTP TPS TP TP G SPP++ TPS PSTPS PTPS P
Sbjct: 99 HTPTPHTPSHTPTPHTPPCNCG--SPPSH--PSTPSHPSTPS-----------HPTPSHP 158
Query: 332 PSGGSGYNSPPTFDPTPSTPPSGGSGYNSPPTFDPTPATPSTPPSGGNGYYNPPTSGTPF 391
PSGG Y+SPP P TPPS P D P TP GG +PP TP
Sbjct: 159 PSGGY-YSSPPPRTPVVVTPPS--------PIVD-----PGTPIIGG----SPP---TPI 218
Query: 392 YGTPPTTSAPPFVPDPNSPFTGTCNYWRTHPGIIWGLLGWWGTMGSAFGI----TNAPGF 451
P T PF+P P P TGTC+YWR HP +IWGLLGWWGT+G AFG ++ PGF
Sbjct: 219 --IDPGTPGTPFIPAPFPPITGTCDYWRNHPTLIWGLLGWWGTVGGAFGTVSIPSSIPGF 278
Query: 452 GATLSLPQALSNTRTDGLGALYREGAAAFLNSMVNIRYPFTTNQVRDSFVSALSSNKAAA 511
++L QALSNTR+D +GALYREG A++LNSMVN ++PFTT QVRD FV+ LSSNKAA
Sbjct: 279 DPHMNLLQALSNTRSDPIGALYREGTASWLNSMVNHKFPFTTPQVRDHFVAGLSSNKAAT 305
Query: 512 AQAQVFQMANEGRFKPR 517
QA F++ANEGR KPR
Sbjct: 339 KQAHTFKLANEGRLKPR 305
BLAST of HG10005220 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match:
Q9SN46 (Leucine-rich repeat extensin-like protein 5 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=LRX5 PE=2 SV=2)
HSP 1 Score: 68.2 bits (165), Expect = 3.2e-10
Identity = 149/361 (41.27%), Postives = 174/361 (48.20%), Query Frame = 0
Query: 88 PGKCGNPPHTPTPSKPPSGGGGYYNPPTHDPT-PSTPS---KPPSGGGHHNPPTYNPTPS 147
PG+C P G G PP P+ P+TPS PPS +PP P+P
Sbjct: 381 PGQCAAFSSLPPVDCGSFGCGRSTRPPVVVPSPPTTPSPGGSPPSPSISPSPPITVPSPP 440
Query: 148 NPPSGGGGYYSPPTHDPTPTPSTPSNPPSGGGGYYSPPSYDPTPT-----PSTPTPSTPT 207
PS GG SPP+ P+ PS PS PS G SPP+ TPT PS+PT TP
Sbjct: 441 TTPSPGG---SPPS--PSIVPSPPSTTPSPG----SPPTSPTTPTPGGSPPSSPTTPTPG 500
Query: 208 PSTPSTPSTPT--------PSTPSGGGYYSPPSYDPTP------TPSTPT-------PS- 267
S PS+P+TPT P+TPS GG PS P+P PSTPT PS
Sbjct: 501 GSPPSSPTTPTPGGSPPSSPTTPSPGGSPPSPSISPSPPITVPSPPSTPTSPGSPPSPSS 560
Query: 268 -TPSTPTPSTPTPSTPSTPSGGGYYSPPTYDPTPTPTTPSTPSTPSG--GGGYNSPPTYD 327
TPS+P PS PTPSTP TP G SPP P+P T PS PS+PS SPP
Sbjct: 561 PTPSSPIPSPPTPSTPPTPISPGQNSPPII-PSPPFTGPSPPSSPSPPLPPVIPSPPIVG 620
Query: 328 PTPTPSTPSTPSGGGGYYSPPTYDPTPST---PPSGGSGYN-------SPPTFDPTPSTP 387
PTP+ PSTP+ YSP P PST PP +GY+ PPTF P+PS P
Sbjct: 621 PTPSSPPPSTPT---PVYSP----PPPSTGYPPPPPFTGYSPPSPPPPPPPTFSPSPSIP 680
Query: 388 PSGGSGYNSPPTFDPTPATPSTPPSGGNGYYNPPTS-----GTPFYGTPPTTSAPPFVPD 400
P P T+ P P P PP YY P S +P YGTPP S P++P
Sbjct: 681 PP------PPQTYSPFPPPPPPPP---QTYYPPQPSPSQPPQSPIYGTPP-PSPIPYLPS 714
BLAST of HG10005220 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match:
P14918 (Extensin OS=Zea mays OX=4577 GN=HRGP PE=2 SV=1)
HSP 1 Score: 65.1 bits (157), Expect = 2.7e-09
Identity = 116/293 (39.59%), Postives = 146/293 (49.83%), Query Frame = 0
Query: 85 NPKPGKCGNPPHTPTPS-KPPSGGGGYYNPPTHDPTPS--TPS-KPPSGGGHHNPPTYNP 144
+PKP P T TPS KPP+ PPT PTP TPS KPP+ PPTY P
Sbjct: 24 SPKPPTPKPTPPTYTPSPKPPAS-----KPPTPKPTPPTYTPSPKPPT--PKPTPPTYTP 83
Query: 145 TPSNPPSGGGGYYSPPTHDPTPTPSTPS-NPPSGGGGYYSPPSYDPTPTPSTPTPSTPTP 204
+P P + PPT PTP TPS PP+ +PP+Y P+P P P TP P
Sbjct: 84 SPKPPAT------KPPTPKPTPPTYTPSPKPPTPKP---TPPTYTPSPKPPATKPPTPKP 143
Query: 205 STPSTPSTPTPSTPSGGGYYSPPSYDPTPTPSTPTPSTPS-TPTPSTPTPSTPSTPSGGG 264
+ P+ +P P TP +PP+Y P+P P TP P+ P+ TP+P PT TP
Sbjct: 144 TPPTYTPSPKPPTPKP----TPPTYTPSPKPPTPKPTPPTYTPSPKPPTHPTPKP----- 203
Query: 265 YYSPPTYDPTPTPTTPSTPSTPSGGGGYNSPPTYDPTPTPSTPSTPSGGGGYYSPPTYDP 324
+PPTY P+P P TP +PPTY P+P P TP +PPTY P
Sbjct: 204 --TPPTYTPSPKPPTPKP-----------TPPTYTPSPKPPTPKP--------TPPTYTP 263
Query: 325 TPSTPPS-GGSGYNSPPTFDPTPSTPPSGGSGYNSPPTFDPTPA---TPSTPP 368
+P P + + +PPT+ PTP P + PPT+ PTP TPS PP
Sbjct: 264 SPKPPATKPPTPKPTPPTYTPTPKPPAT------KPPTYTPTPPVSHTPSPPP 264
BLAST of HG10005220 vs. ExPASy TrEMBL
Match:
A0A0A0KGQ1 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_6G423360 PE=4 SV=1)
HSP 1 Score: 750.4 bits (1936), Expect = 5.1e-213
Identity = 440/554 (79.42%), Postives = 462/554 (83.39%), Query Frame = 0
Query: 1 MERRVASLLLWTLIVGLVSQNMAIALTSASNEDQKTYYSPDPHAGSPPSGSQGRPPYGTP 60
MER++ASLLLWTLI+GLVSQN+AI LTSA NEDQKTYY+PDPHAGSPP+ S G PPYG+
Sbjct: 1 MERKLASLLLWTLILGLVSQNIAIPLTSAGNEDQKTYYTPDPHAGSPPTDSHGNPPYGS- 60
Query: 61 PPPRGSGGSHGGKPPSHGHGGKKHNPKPGKCGNPPHTPTPSKPPSGGGGYYNPPTHDPTP 120
PPP GSGGSHGGKPPSHGHGGKKH PKPG CGNPP+TPTPSK PPTHDPTP
Sbjct: 61 PPPHGSGGSHGGKPPSHGHGGKKHKPKPGNCGNPPYTPTPSK----------PPTHDPTP 120
Query: 121 STPSKPPSGGGHHNPPTYNPTPSNPPSGGGGYYSPPTHDPTPTPSTPS-NPPS--GGGGY 180
STPSKPPSGGG H+ NPP+GGGGY SPP+HDPTPTPSTP+ + PS GGGY
Sbjct: 121 STPSKPPSGGGGHH---------NPPTGGGGYNSPPSHDPTPTPSTPTPSTPSTPSGGGY 180
Query: 181 YSPPSYDPTPTPSTPTPSTP-TPS--------------TPSTPSTPTPSTPSGGGYYSPP 240
YSPP+YDPTPTPSTPTPSTP TPS TPSTP+ TPSTPSGGGYYSPP
Sbjct: 181 YSPPTYDPTPTPSTPTPSTPSTPSGGGYYSPPTYDPTPTPSTPTPSTPSTPSGGGYYSPP 240
Query: 241 SYDPTPTPSTPTPSTPS---------------TPTPSTPTPSTPSTPSGGGYYSPPTYDP 300
+YDPTPTPSTPTPSTPS TPTPSTPTPSTPSTPSGGGYYSPPTYDP
Sbjct: 241 TYDPTPTPSTPTPSTPSTPSGGGYYSPPTYDPTPTPSTPTPSTPSTPSGGGYYSPPTYDP 300
Query: 301 TPTPT--TPSTPSTPSGGGGYNSPPTYDPTPT-PSTPSTPSGGGGYYSPPTYDPTPS-TP 360
TPTP+ TPSTPSTPS GGGY SPPTYDPTPT PSTPSTPSGGGGY SPPTYDPTP+ +
Sbjct: 301 TPTPSTPTPSTPSTPS-GGGYYSPPTYDPTPTSPSTPSTPSGGGGYSSPPTYDPTPTPST 360
Query: 361 PSGGSGYNSPPTFDPTPSTPPSGGSGYNSPPTFDPTPATPSTPPSGGNGYYNPPTSGTPF 420
PSGG GY SPPT+DPTPSTPPSGG GYNSPPTFDP TPSTPPSG GTPF
Sbjct: 361 PSGGGGYYSPPTYDPTPSTPPSGGGGYNSPPTFDP---TPSTPPSG----------GTPF 420
Query: 421 YGTPPTTSAPPFVPDPNSPFTGTCNYWRTHPGIIWGLLGWWGTMGSAFGITNAPGFGATL 480
YGTPPTTSAPPFVPDPNSPFTGTCNYWRTHPGIIWGLLGWWGTMGSAFGITNAPGFGATL
Sbjct: 421 YGTPPTTSAPPFVPDPNSPFTGTCNYWRTHPGIIWGLLGWWGTMGSAFGITNAPGFGATL 480
Query: 481 SLPQALSNTRTDGLGALYREGAAAFLNSMVNIRYPFTTNQVRDSFVSALSSNKAAAAQAQ 518
SLPQALSNTRTDGLG+LYREGAAAFLNSMVN RYPFTTNQVR+SFVSALSSNKAAAAQAQ
Sbjct: 481 SLPQALSNTRTDGLGSLYREGAAAFLNSMVNNRYPFTTNQVRESFVSALSSNKAAAAQAQ 520
BLAST of HG10005220 vs. ExPASy TrEMBL
Match:
A0A6J1JPJ4 (leucine-rich repeat extensin-like protein 5 isoform X2 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111486335 PE=4 SV=1)
HSP 1 Score: 731.5 bits (1887), Expect = 2.5e-207
Identity = 431/569 (75.75%), Postives = 465/569 (81.72%), Query Frame = 0
Query: 1 MERRVASLLLWTLIVGLVSQNMAIALTSASNEDQKTYYSPDPHAGSPPSGSQ-GRPPYGT 60
M +ASLLLWTL VGLVS +MAI LTS S+EDQKTYY+PDPHAGSPPSGS G PPYGT
Sbjct: 4 MGTTLASLLLWTLFVGLVSGDMAIPLTSTSDEDQKTYYTPDPHAGSPPSGSSPGSPPYGT 63
Query: 61 PPPPRGSGGSHGGKPPSHGHGGKKHNPKPGKCGNPPHTPTPSKPPSGGGGYYNPPTHDPT 120
PPP GSGGSHGGKPPSHGHGGKK +PKPG CGNPPHTPTPSKPPSGGGG++ P H+PT
Sbjct: 64 TPPPDGSGGSHGGKPPSHGHGGKKRSPKPGNCGNPPHTPTPSKPPSGGGGHHKSPKHNPT 123
Query: 121 PSTPSKPPS-GGGHHNPPTYNP-----TPSNPPS--GGGGYYSPPTHDPTPTPSTPSNP- 180
PS PS PPS GGG+++PP+++P TPS+PPS GGGGYYSPPT+DPTPTPSTPS P
Sbjct: 124 PSIPSTPPSDGGGYYSPPSHDPTPTPSTPSSPPSDGGGGGYYSPPTYDPTPTPSTPSTPS 183
Query: 181 --------------PSGGGGYYSPPSYDPTP---TPSTPTPSTPTPSTPSTPSTPTPSTP 240
PSGGGGYYSPP+YDPTP TPSTPTPSTP+ TPSTPSTPTPS P
Sbjct: 184 TPTPSTPSTPTPSAPSGGGGYYSPPTYDPTPTPSTPSTPTPSTPSTPTPSTPSTPTPSAP 243
Query: 241 S-GGGYYSPPSYDPTPTPSTPTPSTPSTPTPSTPTPSTPSTPSGGGYYSPPTYDPTPTPT 300
S GGGYYSPP+YDPTPTPSTPTPSTPSTPTPS P+ GGGYYSPPTYDPTPTP+
Sbjct: 244 SGGGGYYSPPTYDPTPTPSTPTPSTPSTPTPSAPS-------GGGGYYSPPTYDPTPTPS 303
Query: 301 TPS----------TPSTPS-------GGGGYNSPPTYDPTPTPSTPSTPS----GGGGYY 360
TPS TPSTPS GGGY SPPT DPT TPSTPSTP+ GGY
Sbjct: 304 TPSTPTPSTPSTPTPSTPSTPTPSTPSGGGYYSPPTDDPT-TPSTPSTPTPSTPSDGGYN 363
Query: 361 SPPTYDPTPS-TPPSGGSGYNSPPTFDP---TPSTPPSGGSGYNSPPTFDPTPATPSTPP 420
SPPTYDPTP+ + PSGG GY SPPT+DP TPSTPPSGGSGY+SPP++DP PSTPP
Sbjct: 364 SPPTYDPTPTPSTPSGGGGYYSPPTYDPTPSTPSTPPSGGSGYDSPPSYDP---NPSTPP 423
Query: 421 SGGNGYYNPPTSGTPFYGTPPTTSAPPFVPDPNSPFTGTCNYWRTHPGIIWGLLGWWGTM 480
SGGNGYYNPPTSGTPFYGTPPTTSAPPFVPDPN+PFTGTCNYW THPG IWGLLGWWGTM
Sbjct: 424 SGGNGYYNPPTSGTPFYGTPPTTSAPPFVPDPNTPFTGTCNYWSTHPGAIWGLLGWWGTM 483
Query: 481 GSAFGITNAPGFGATLSLPQALSNTRTDGLGALYREGAAAFLNSMVNIRYPFTTNQVRDS 517
GS FGIT +PGFGATLSLPQALSNTRTDGLG+LYREGAAAFLNSMVN RYPFTT++VR S
Sbjct: 484 GSVFGITGSPGFGATLSLPQALSNTRTDGLGSLYREGAAAFLNSMVNNRYPFTTDEVRQS 543
BLAST of HG10005220 vs. ExPASy TrEMBL
Match:
A0A6J1JNN6 (protodermal factor 1-like isoform X3 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111486335 PE=4 SV=1)
HSP 1 Score: 724.5 bits (1869), Expect = 3.0e-205
Identity = 427/562 (75.98%), Postives = 457/562 (81.32%), Query Frame = 0
Query: 1 MERRVASLLLWTLIVGLVSQNMAIALTSASNEDQKTYYSPDPHAGSPPSGSQ-GRPPYGT 60
M +ASLLLWTL VGLVS +MAI LTS S+EDQKTYY+PDPHAGSPPSGS G PPYGT
Sbjct: 4 MGTTLASLLLWTLFVGLVSGDMAIPLTSTSDEDQKTYYTPDPHAGSPPSGSSPGSPPYGT 63
Query: 61 PPPPRGSGGSHGGKPPSHGHGGKKHNPKPGKCGNPPHTPTPSKPPSGGGGYYNPPTHDPT 120
PPP GSGGSHGGKPPSHGHGGKK +PKPG CGNPPHTPTPSKPPSGGGG++ P H+PT
Sbjct: 64 TPPPDGSGGSHGGKPPSHGHGGKKRSPKPGNCGNPPHTPTPSKPPSGGGGHHKSPKHNPT 123
Query: 121 PSTPSKPPS-GGGHHNPPTYNP-----TPSNPPS---------------GGGGYYSPPTH 180
PS PS PPS GGG+++PP+++P TPS+PPS GGGYYSPPT+
Sbjct: 124 PSIPSTPPSDGGGYYSPPSHDPTPTPSTPSSPPSDGGGSTPSTPTPSAPSGGGYYSPPTY 183
Query: 181 DPTPTPSTPSNP---------------PSGGGGYYSPPSYDPTP---TPSTPTPSTPTPS 240
DPTPTPSTPS P PSGGGGYYSPP+YDPTP TPSTPTPSTP+
Sbjct: 184 DPTPTPSTPSTPSTPTPSTPSTPTPSAPSGGGGYYSPPTYDPTPTPSTPSTPTPSTPSTP 243
Query: 241 TPSTPSTPTPSTPS-GGGYYSPPSYDPTP---TPSTPTPSTPSTPTPSTPTPSTPSTPSG 300
TPSTPSTPTPS PS GGGYYSPP+YDPTP TPSTPTPSTPSTPTPSTP+ TPSTPSG
Sbjct: 244 TPSTPSTPTPSAPSGGGGYYSPPTYDPTPTPSTPSTPTPSTPSTPTPSTPSTPTPSTPSG 303
Query: 301 GGYYSPPTYDPTPTPTTPS--TPSTPSGGGGYNSPPTYDPTPTPSTPSTPSGGGGYYSPP 360
GGYYSPPT DPT TP+TPS TPSTPS GGYNSPPTYDPTP TPSTPSGGGGYYSPP
Sbjct: 304 GGYYSPPTDDPT-TPSTPSTPTPSTPS-DGGYNSPPTYDPTP---TPSTPSGGGGYYSPP 363
Query: 361 TYDPTPSTPPSGGSGYNSPPTFDPTPSTPPSGGSGYNSPPTFDPTPATPSTPPSGGNGYY 420
TYDPTPS TPSTPPSGGSGY+SPP++DP PSTPPSGGNGYY
Sbjct: 364 TYDPTPS-----------------TPSTPPSGGSGYDSPPSYDP---NPSTPPSGGNGYY 423
Query: 421 NPPTSGTPFYGTPPTTSAPPFVPDPNSPFTGTCNYWRTHPGIIWGLLGWWGTMGSAFGIT 480
NPPTSGTPFYGTPPTTSAPPFVPDPN+PFTGTCNYW THPG IWGLLGWWGTMGS FGIT
Sbjct: 424 NPPTSGTPFYGTPPTTSAPPFVPDPNTPFTGTCNYWSTHPGAIWGLLGWWGTMGSVFGIT 483
Query: 481 NAPGFGATLSLPQALSNTRTDGLGALYREGAAAFLNSMVNIRYPFTTNQVRDSFVSALSS 517
+PGFGATLSLPQALSNTRTDGLG+LYREGAAAFLNSMVN RYPFTT++VR SFVSALSS
Sbjct: 484 GSPGFGATLSLPQALSNTRTDGLGSLYREGAAAFLNSMVNNRYPFTTDEVRQSFVSALSS 540
BLAST of HG10005220 vs. ExPASy TrEMBL
Match:
A0A6J1JF43 (protodermal factor 1-like isoform X1 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111486335 PE=4 SV=1)
HSP 1 Score: 724.2 bits (1868), Expect = 3.9e-205
Identity = 430/582 (73.88%), Postives = 464/582 (79.73%), Query Frame = 0
Query: 1 MERRVASLLLWTLIVGLVSQNMAIALTSASNEDQKTYYSPDPHAGSPPSGSQ-GRPPYGT 60
M +ASLLLWTL VGLVS +MAI LTS S+EDQKTYY+PDPHAGSPPSGS G PPYGT
Sbjct: 4 MGTTLASLLLWTLFVGLVSGDMAIPLTSTSDEDQKTYYTPDPHAGSPPSGSSPGSPPYGT 63
Query: 61 PPPPRGSGGSHGGKPPSHGHGGKKHNPKPGKCGNPPHTPTPSKPPSGGGGYYNPPTHDPT 120
PPP GSGGSHGGKPPSHGHGGKK +PKPG CGNPPHTPTPSKPPSGGGG++ P H+PT
Sbjct: 64 TPPPDGSGGSHGGKPPSHGHGGKKRSPKPGNCGNPPHTPTPSKPPSGGGGHHKSPKHNPT 123
Query: 121 PSTPSKPPS-GGGHHNPPTYNP-----TPSNPPS---------------GGGGYYSPPTH 180
PS PS PPS GGG+++PP+++P TPS+PPS GGGYYSPPT+
Sbjct: 124 PSIPSTPPSDGGGYYSPPSHDPTPTPSTPSSPPSDGGGSTPSTPTPSAPSGGGYYSPPTY 183
Query: 181 DPTPTPSTPSNP---------------PSGGGGYYSPPSYDPTP---TPSTPTPSTPTPS 240
DPTPTPSTPS P PSGGGGYYSPP+YDPTP TPSTPTPSTP+
Sbjct: 184 DPTPTPSTPSTPSTPTPSTPSTPTPSAPSGGGGYYSPPTYDPTPTPSTPSTPTPSTPSTP 243
Query: 241 TPSTPSTPTPSTPS-GGGYYSPPSYDPTPTPSTPTPSTPSTPTPSTPTPSTPSTPSGGGY 300
TPSTPSTPTPS PS GGGYYSPP+YDPTPTPSTPTPSTPSTPTPS P+ GGGY
Sbjct: 244 TPSTPSTPTPSAPSGGGGYYSPPTYDPTPTPSTPTPSTPSTPTPSAPS-------GGGGY 303
Query: 301 YSPPTYDPTPTPTTPS----------TPSTPS-------GGGGYNSPPTYDPTPTPSTPS 360
YSPPTYDPTPTP+TPS TPSTPS GGGY SPPT DPT TPSTPS
Sbjct: 304 YSPPTYDPTPTPSTPSTPTPSTPSTPTPSTPSTPTPSTPSGGGYYSPPTDDPT-TPSTPS 363
Query: 361 TPS----GGGGYYSPPTYDPTPS-TPPSGGSGYNSPPTFDP---TPSTPPSGGSGYNSPP 420
TP+ GGY SPPTYDPTP+ + PSGG GY SPPT+DP TPSTPPSGGSGY+SPP
Sbjct: 364 TPTPSTPSDGGYNSPPTYDPTPTPSTPSGGGGYYSPPTYDPTPSTPSTPPSGGSGYDSPP 423
Query: 421 TFDPTPATPSTPPSGGNGYYNPPTSGTPFYGTPPTTSAPPFVPDPNSPFTGTCNYWRTHP 480
++DP PSTPPSGGNGYYNPPTSGTPFYGTPPTTSAPPFVPDPN+PFTGTCNYW THP
Sbjct: 424 SYDP---NPSTPPSGGNGYYNPPTSGTPFYGTPPTTSAPPFVPDPNTPFTGTCNYWSTHP 483
Query: 481 GIIWGLLGWWGTMGSAFGITNAPGFGATLSLPQALSNTRTDGLGALYREGAAAFLNSMVN 517
G IWGLLGWWGTMGS FGIT +PGFGATLSLPQALSNTRTDGLG+LYREGAAAFLNSMVN
Sbjct: 484 GAIWGLLGWWGTMGSVFGITGSPGFGATLSLPQALSNTRTDGLGSLYREGAAAFLNSMVN 543
BLAST of HG10005220 vs. ExPASy TrEMBL
Match:
A0A6J1EW12 (protodermal factor 1-like isoform X5 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111437076 PE=4 SV=1)
HSP 1 Score: 699.5 bits (1804), Expect = 1.0e-197
Identity = 406/526 (77.19%), Postives = 432/526 (82.13%), Query Frame = 0
Query: 1 MERRVASLLLWTLIVGLVSQNMAIALTSASNEDQKTYYSPDPHAGSPPSGSQ-GRPPYGT 60
M +A LLLWTL VGLVS +MAI LTS S+EDQKTYY+PDPHAGSPPSGS G PPYGT
Sbjct: 4 MGTTLAFLLLWTLFVGLVSGDMAIPLTSTSDEDQKTYYTPDPHAGSPPSGSSPGSPPYGT 63
Query: 61 PPPPRGSGGSHGGKPPSHGHGGKKHNPKPGKCGNPPHTPTPSKPPSGGGGYYNPPTHDPT 120
PPP GSGGSHGGKPP+HGHGGKK +PKPG CGNPPHTPTPSKPPSGGGG++ P ++PT
Sbjct: 64 TPPPDGSGGSHGGKPPTHGHGGKKRSPKPGNCGNPPHTPTPSKPPSGGGGHHKSPKYNPT 123
Query: 121 PSTPSKPPSGGGHHNPPTYNPTPSNPPSGGGGYYSPPTHDPTPTPSTPSNPP---SGGGG 180
PS PS PPS GGGYYSPP+HDPTPTPSTP +PP GGGG
Sbjct: 124 PS-------------------IPSTPPSDGGGYYSPPSHDPTPTPSTPLSPPPSGGGGGG 183
Query: 181 YYSPPSYDPTPTPSTPTPSTPTP----STPSTPSTPTPSTPSGGGYYSPPSYDPTPTPST 240
YYSPPSYDPTPTPS TPS P P STPSTPSTPTPS PSGGGYYSPP+YDPTPTPS
Sbjct: 184 YYSPPSYDPTPTPS--TPSNPPPDGGGSTPSTPSTPTPSAPSGGGYYSPPTYDPTPTPS- 243
Query: 241 PTPSTPSTPTPSTPTPSTPSTPSGGGYYSPPTYDPTPTPTTPS--TPSTPSGGGGYNSPP 300
TPSTPSTPTPSTP+ TPSTPSGGGYYSPPT +PT TP+TPS TPSTPS GGYNSPP
Sbjct: 244 -TPSTPSTPTPSTPSTPTPSTPSGGGYYSPPTDNPT-TPSTPSTPTPSTPS-DGGYNSPP 303
Query: 301 TYDPTPTPSTPSTPSGGGGYYSPPTYDPTPSTPPSGGSGYNSPPTFDPTPSTPPSGGSGY 360
TYDPTP TPSTPSGGGGYYSPPTYDPTPS TPSTPPSGGSGY
Sbjct: 304 TYDPTP---TPSTPSGGGGYYSPPTYDPTPS-----------------TPSTPPSGGSGY 363
Query: 361 NSPPTFDPTPATPSTPPSGGNGYYNPPTSGTPFYGTPPTTSAPPFVPDPNSPFTGTCNYW 420
+SPP++DP PSTPPSGGNG+YNPPTSGTPFYGTPPTTSAPPFVPDPNSPFTGTCNYW
Sbjct: 364 DSPPSYDP---NPSTPPSGGNGFYNPPTSGTPFYGTPPTTSAPPFVPDPNSPFTGTCNYW 423
Query: 421 RTHPGIIWGLLGWWGTMGSAFGITNAPGFGATLSLPQALSNTRTDGLGALYREGAAAFLN 480
THPG IWGLLGWWGTMGS FGIT +PGFGATLSLPQALSNTRTDGLG+LYREGAAAFLN
Sbjct: 424 STHPGAIWGLLGWWGTMGSVFGITGSPGFGATLSLPQALSNTRTDGLGSLYREGAAAFLN 481
Query: 481 SMVNIRYPFTTNQVRDSFVSALSSNKAAAAQAQVFQMANEGRFKPR 517
S+VN RYPFTTN+VR SFVSALSSN+AAAAQA+VFQMANEGRFKPR
Sbjct: 484 SLVNNRYPFTTNEVRQSFVSALSSNRAAAAQARVFQMANEGRFKPR 481
BLAST of HG10005220 vs. TAIR 10
Match:
AT2G42840.1 (protodermal factor 1 )
HSP 1 Score: 193.0 bits (489), Expect = 6.1e-49
Identity = 159/317 (50.16%), Postives = 188/317 (59.31%), Query Frame = 0
Query: 212 TPSGGGYYSPPSYDPTPT-----PSTPTPSTPSTPTPSTPTPSTPSTPSGGGYYSPPTYD 271
+P G + +PPS+ P + P P+PSTPS P+P + TP TPSTPS
Sbjct: 39 SPPSGSHGTPPSHTPPSSNCGSPPYDPSPSTPSHPSPPSHTP-TPSTPS----------- 98
Query: 272 PTPTPTTPS---TPSTPSGGGGYNSPPTYDPTPTPSTPSTPSGGGGYYSPPTYDPTPSTP 331
TPTP TPS TP TP G SPP++ TPS PSTPS PTPS P
Sbjct: 99 HTPTPHTPSHTPTPHTPPCNCG--SPPSH--PSTPSHPSTPS-----------HPTPSHP 158
Query: 332 PSGGSGYNSPPTFDPTPSTPPSGGSGYNSPPTFDPTPATPSTPPSGGNGYYNPPTSGTPF 391
PSGG Y+SPP P TPPS P D P TP GG +PP TP
Sbjct: 159 PSGGY-YSSPPPRTPVVVTPPS--------PIVD-----PGTPIIGG----SPP---TPI 218
Query: 392 YGTPPTTSAPPFVPDPNSPFTGTCNYWRTHPGIIWGLLGWWGTMGSAFGI----TNAPGF 451
P T PF+P P P TGTC+YWR HP +IWGLLGWWGT+G AFG ++ PGF
Sbjct: 219 --IDPGTPGTPFIPAPFPPITGTCDYWRNHPTLIWGLLGWWGTVGGAFGTVSIPSSIPGF 278
Query: 452 GATLSLPQALSNTRTDGLGALYREGAAAFLNSMVNIRYPFTTNQVRDSFVSALSSNKAAA 511
++L QALSNTR+D +GALYREG A++LNSMVN ++PFTT QVRD FV+ LSSNKAA
Sbjct: 279 DPHMNLLQALSNTRSDPIGALYREGTASWLNSMVNHKFPFTTPQVRDHFVAGLSSNKAAT 305
Query: 512 AQAQVFQMANEGRFKPR 517
QA F++ANEGR KPR
Sbjct: 339 KQAHTFKLANEGRLKPR 305
BLAST of HG10005220 vs. TAIR 10
Match:
AT4G18670.1 (Leucine-rich repeat (LRR) family protein )
HSP 1 Score: 68.2 bits (165), Expect = 2.3e-11
Identity = 149/361 (41.27%), Postives = 174/361 (48.20%), Query Frame = 0
Query: 88 PGKCGNPPHTPTPSKPPSGGGGYYNPPTHDPT-PSTPS---KPPSGGGHHNPPTYNPTPS 147
PG+C P G G PP P+ P+TPS PPS +PP P+P
Sbjct: 381 PGQCAAFSSLPPVDCGSFGCGRSTRPPVVVPSPPTTPSPGGSPPSPSISPSPPITVPSPP 440
Query: 148 NPPSGGGGYYSPPTHDPTPTPSTPSNPPSGGGGYYSPPSYDPTPT-----PSTPTPSTPT 207
PS GG SPP+ P+ PS PS PS G SPP+ TPT PS+PT TP
Sbjct: 441 TTPSPGG---SPPS--PSIVPSPPSTTPSPG----SPPTSPTTPTPGGSPPSSPTTPTPG 500
Query: 208 PSTPSTPSTPT--------PSTPSGGGYYSPPSYDPTP------TPSTPT-------PS- 267
S PS+P+TPT P+TPS GG PS P+P PSTPT PS
Sbjct: 501 GSPPSSPTTPTPGGSPPSSPTTPSPGGSPPSPSISPSPPITVPSPPSTPTSPGSPPSPSS 560
Query: 268 -TPSTPTPSTPTPSTPSTPSGGGYYSPPTYDPTPTPTTPSTPSTPSG--GGGYNSPPTYD 327
TPS+P PS PTPSTP TP G SPP P+P T PS PS+PS SPP
Sbjct: 561 PTPSSPIPSPPTPSTPPTPISPGQNSPPII-PSPPFTGPSPPSSPSPPLPPVIPSPPIVG 620
Query: 328 PTPTPSTPSTPSGGGGYYSPPTYDPTPST---PPSGGSGYN-------SPPTFDPTPSTP 387
PTP+ PSTP+ YSP P PST PP +GY+ PPTF P+PS P
Sbjct: 621 PTPSSPPPSTPT---PVYSP----PPPSTGYPPPPPFTGYSPPSPPPPPPPTFSPSPSIP 680
Query: 388 PSGGSGYNSPPTFDPTPATPSTPPSGGNGYYNPPTS-----GTPFYGTPPTTSAPPFVPD 400
P P T+ P P P PP YY P S +P YGTPP S P++P
Sbjct: 681 PP------PPQTYSPFPPPPPPPP---QTYYPPQPSPSQPPQSPIYGTPP-PSPIPYLPS 714
BLAST of HG10005220 vs. TAIR 10
Match:
AT3G19430.1 (late embryogenesis abundant protein-related / LEA protein-related )
HSP 1 Score: 55.1 bits (131), Expect = 2.0e-07
Identity = 104/231 (45.02%), Postives = 114/231 (49.35%), Query Frame = 0
Query: 135 PPTYNPTPSNPPSGG--GGYYS----PPTHDPTPTPSTPSNPPSGGGGYYSPPSYDPTPT 194
PP+ SGG GGY PP P PTPS PS P SPP PTPT
Sbjct: 53 PPSPGDDGGGDDSGGDDGGYTPPAPVPPVSPPPPTPSVPSPTPP-----VSPP--PPTPT 112
Query: 195 PSTPTPSTPTPSTPSTPSTPTPSTPSGGGYYSPPSYDPTPTPSTPTPSTPSTPTPSTPTP 254
PS P +PTP P TPTPS PS SPP PTPTPS P+P+ P +P P TPTP
Sbjct: 113 PSVP---SPTPPVSPPPPTPTPSVPSPTPPVSPP--PPTPTPSVPSPTPPVSPPPPTPTP 172
Query: 255 STPS-TPSGGGYYSPPTYDPTPTPTTPSTPSTPSGGGGYNSPPTYDPTPTPSTPSTPSGG 314
S PS TP P DP P+P P +P P+ SPP D TPTP TPS P
Sbjct: 173 SVPSPTP-------PVPTDPMPSPPPPVSPPPPTPTPSVPSPP--DVTPTPPTPSVP--- 232
Query: 315 GGYYSPPTYDPTPSTP--PSGGSGYNSPPTFDPTPSTP-PSGGSGYNSPPT 356
SPP PTP TP PS +PPT PS P PSG Y PP+
Sbjct: 233 ----SPPDVTPTPPTPSVPSPPDVTPTPPT---PPSVPTPSGSPPYVPPPS 252
The following BLAST results are available for this feature:
Match Name | E-value | Identity | Description | |
Q9S728 | 8.6e-48 | 50.16 | Protodermal factor 1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=PDF1 PE=2 SV=1 | [more] |
Q9SN46 | 3.2e-10 | 41.27 | Leucine-rich repeat extensin-like protein 5 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=L... | [more] |
P14918 | 2.7e-09 | 39.59 | Extensin OS=Zea mays OX=4577 GN=HRGP PE=2 SV=1 | [more] |
Match Name | E-value | Identity | Description | |
A0A0A0KGQ1 | 5.1e-213 | 79.42 | Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_6G423360 PE=4 SV=1 | [more] |
A0A6J1JPJ4 | 2.5e-207 | 75.75 | leucine-rich repeat extensin-like protein 5 isoform X2 OS=Cucurbita maxima OX=36... | [more] |
A0A6J1JNN6 | 3.0e-205 | 75.98 | protodermal factor 1-like isoform X3 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111486335... | [more] |
A0A6J1JF43 | 3.9e-205 | 73.88 | protodermal factor 1-like isoform X1 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111486335... | [more] |
A0A6J1EW12 | 1.0e-197 | 77.19 | protodermal factor 1-like isoform X5 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC1114370... | [more] |