HG10003632 (gene) Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1

Overview


Name	HG10003632
Type	gene
Organism	Lagenaria siceraria cv. Hangzhou Gourd (Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1)
Description	Unknown protein
Location	Chr08: 4579641 .. 4585176 (-)
RNA-Seq Expression	HG10003632
Synteny	HG10003632

Sequences

The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideCDS

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ATGAGTGGATTTTCACACAATAGTCAGCTAGTCTATTCGTCGGTGTTTCGTTCACGTGGAAAGAGGTTGCAGCTGGCATTCATTGAAGTTCGTAGCAGATTCTGGTCTATTGTAGCCGTCGTTCGTCACAGCCGAGGTCAATCGTACCCACATCTGTCGTCGCAGCCAGCGTCTGTGTTTGCAGCCGAGGTCTATTGCCGTCACCTTCGTGGGTGTAGCTTTGTGGTTGAGATTTTTGTGGGTGTGGGGAAAGTTGGAATATGGAGAGATGAGAGAAGAAGGGTTTTTGGGTGATTAAAATTATTTATTTTTTAGTGGGGGAAAAAAGTTAAAGTTGTAAAATAAATGGGGGGAAAGAAGGAGGGAAACCAAAAGTGGCTAGAATTTTCCCTTTTTTAAAAAATATTATATATTTAGTGACACTTTAAGAAGTTGCTAAAAGTATTTAATTTTTAGTGGCGCTGGTGGATATGTTGCTAATTCTTTTAGTAACGTTGATTTAAGATTCATTGTTAATAGTGATCTTTTTGTGACATAATTTTAAAATGTTGTTATAAATTGACTTTTAGTGACAAAAATTACATGCGCGGCTAAAAATTTGTCACTAAATAATCAATTTCTAGTAGTGGTAGAGTCAACAATGCAACCTTGTTTTGTGTTTCGCCAGACTACAACCCCTCCGTTAAGATTGAATACTGATCCTAATGTGAATTTCCTAGAATCCCTTTCAATATGAAAATCAGAATCAATGTATCTTATAAGGATCAAATCCTTAGAACCATACACAAGCATGTAATACTTATTCTCCGAAGATACTTGAGGATGGTCTTAACTGTGATCCAGTGATCAAATCCTAGATTGGACTGATATCTACTGACTATCCCAACTGCATAGCAAATGTCGTGCCTTGTACACAACATGACATACATTAGCTAGGTTGCCCACAACTGATGCATAGGGAATCTGTCTCATTTCCTCAACCCCTTGAGGAGTCTTAGGACACTATTCCTTAGATAATACAATTTCATGCTTGAAGGGTAATAAACCCTCTTGGAATTGTGCATCGAATACCTAGCAAGTATCTTGTCCATGTACGATGCCCGAGTCAAGACTAGCATTTTGTTCTTACGATACCTTATGATTTAGATCCCTTGAACAAACTGCGCCTCACCCAAATCTTTCATTTGGAATTGGGCAGCTAACCATTTCTTTACATCTTTCAGTAGACCTACATCATTCCAATGAGTAGGATATCATCCACATACAACACTAAGAAAGCTACTGAACTGTTGATGCTTTTCTTGTAGACACAAGGTTCATTAACATTCTAGTCAAAACCATAAGACTTGATCGCAGTATCAAATCTTTATATTCCAAGATCGAGATGCCTGTTTCAATTCATAAATGGACCGATTAAGCTTATAAACCGTTTGCTCTTGACCTTATTCAATGAATTCTTCTGGTTGCTTCATGTAAATGGTCTTTTCAAGATTACCATTCAAAAAAGCAATCTTGACATCTATTTGCCATATTTCATAGCCATAATATGTGGCAATGGACAAGAGAGTCTGGATAAGGTAACATGTGAGAAAGTTTCTTCATAGTCCACTCCCTCAACCTGGGTATAACCATTTGCCACCAGTTTAGCCTTAAAGGTCTGCTTCTTTCCATCTACACCATTTTTTTCTCTTGTAGATCTATTTGCAACCTATAGGTTTTACCCCATCATGTTGATCTACAAGATCCCAGACAGAATTGAAGTACATTAACTCCATTTCTAGATTCATAGCTTTAAACCATTCATCATTGTCTATATCATTCATTGTCTGGTTTGAAAGAGATACAAACATGCATGCACAGTGGATTAGATCTAATTGCACTCTAACTTACCCAATTTTAAGGATTAAAATGCATAAAATTGAGGAAAATAAGAGTTTTGAGAAAAACAACCTTTGTAGTTCAAAATTCTTCCTTAATCCTTGATGATTCTGATCACACGAATAGTTTGTGGACCACCACAAGAATTTTCTCCACTAATCTCTGACCTTAGAATGGATGGTGGGATCCAAATTTGTGGTGAATTTGAAGGAAATTTAGAGTTTGAGAGTGTATGTATTCTTAGGAGTTTTAAAACTAAATTAACACTTAATTCAGCAAAACATCAACCTCAATCTCAGCAACAAACACTCTTATTTATAGAGGATTAACATGCATTAGGACTAATACACTCTTGATAACAAATTGAAGAGAATTGAGTGGAATTAGTGTCAAATAGTTGGAAAAACACCAAACTCTCAACCATGCTAGTGGGATTTTCCAACTTTTCCTTTTAAAATTCAATTTAAATTGATTTTTCCAAATTAAATTAAATTTTGAATTTTAATTTAACAAAATAAATTTAACTAAATTTTAAAAATAAAATTAAATAATTAATTTTATATAAAATTAATTTTAAATAATTAAATAATATTAATTTAATATCAAATATTAAAATAATATTATATTCACACCAATTCCGACTTATTCGAAAAACTAATTTTTTGAATATGAATCCCAATTCATATATTCAATATTTAAATCATATTTAAAAATCTCCAACTCTTTTTATCGTTTATTTCAAAATTAAACGATTAAACGTTTAAAGTATCGAATATAAATAACGTTTACTCCCTAATTTGATTTTGAACGATTTAAAATTTTTCACCACACTATTCTTAGGTTTAGTCCATTATGAGCTAGCAGAGGGACCTAATGGACCTACAGATCATGAGCTCCAACGATATGAGATTAACCGACCAAACTCTTTAACCTAGTTAACCAACATTTGTTAACTAACGGGACACTCCACTAAAGCCCGTAGCTACACTCTCCTCACTGTAGATATATTTTCGTCCACTTGATATAACTATAATTAGTAAGTTGATCCTTCACAGGTTGTTTCTAATTACAACTCGGTTAAAGTCCCTTGTTCAAGTCCCGAAGTCATCACTTAAGAGAACAACCTATTTACTATCCCTAAAAGCGGGTATGAGTGAATTTCGTCTTGTAGGACTATGTCCCTAGCCAGCTACCCGGTCTTACCCCTAAAATGGGAGGCTTGTTGAGTCGGAAAACTCGGGCCGCTCTCGCCCATGTAGATTTAAGGATAATCCCGAATAAATAGGAGTTCATAGTTAGTTCAAGATTAAGATCGAGTTACCTAAACGAATGACATTATATTACTTACGCCATATAAAAAAAATATTTAGATCCATGGTTCAGATTCTTCAGAGATCTTTAGATCCTTTATTGAAGGTGGCTAATATATAAAATATTTCGCACTTGTTCCGAGCTGGGTTTTTTCGGTATATTCCAAGGGAGTGGAATCTTTCAGCTCATTCGTTGGCTCATGAGGGTTTTATGGGTTTGAGATTATTGCACCTCAATTCTTTTCCTGTTGAGCTTGAGGCTCTTTATTCTAGGTGACTTCTCTTTTCTTTCCAGCTTGTTAGCCAAGTCGTGTTTTTGTTTTGTTTTGATGTTCTTTTTATTTTTTTATTTTTAAAAAAACTTTACTTACCCTGGATTAAAAGGAGCAAAAACTATTTGGTTTTGTTCTGAAACTATTAGTTTGCAACATAGGTTCTGAGCTCTAATTTCTTGAGTGTTGTGTCTAGCATATATAAGAAACGTGTCAATAAATATGTACTATGAAACTTCCTTTGAAACAACAAAGTATAAGTGCAAGTACCTATAAAAGATTAAAAGTCAATAAACGAGTATCTATAAAAGATTAGAGTACCTAAACGAATGACATTATATTACATACGCCATATAAACCACCAATATCAAAGACTTAACTTCTTGCATGCTACAGAAGTCAATAATTTTTTCTCGCAAGACATAACTCTTTCTGTTGAAACCAAACAGCTCAACAGGTAGTTGGAAAGAAATGTCAAACTCTTTGGCCACTACCTTTTCAGGAAACCTAAGTACTGACTTTAAAGGTAGTGGCAAATTATTGATTGTTGACTCACTAACAACCTCTTTTTCCTTAGCAATTCTCACTGATGCTTTCTCCTAATGCAACAAAGTGAATATAATGTAACGATATGAAAGTCATTAATGCAACAATATCAAATTCATAATGCAACAAAGTTAACCAATAATGCAACAAATTGAGCAAACTTAACTAATTACCTTTAAAGTTTGTTCTTTTTTGCTCCCATTCTTGATATTCTCATCATGATCATTCAAAATGATCACATCTATGTCTAACTTTTGAATTGTACAACTTGACAAATGTAGACAACTTGGTGAATTTTTTGCATCATTCATATAATGGTTTTTCAGCGTCATTAAGCAAGTTCTCAAATTCAGTTGGGTCTTTTGAATATTCCTCATGAGCAACTTCAACCATTTCTCTTATATTTCCAACATCGTTCTCTTCATACATATGGGTGTCAAACTTAGAAAATTTCCCACATAAGGATGAGTTTGTAGTTCTTCACCATGTCAAACCAAATTTTATAACTTTAATCGATTCCATTGACATATAAATGATCTCTAATACCATTGCGACTTTGGTTTTCACAATCCACACATTTCAAACAAGAACAATGAATAAATGCATTATTTGTATTAGAAAATCCAAAATTGATGAAGTTTTCTACACGCAAGTCATAATCTTTGGATAATCTACTCTTGTGCATCTATGACTTATTCATAATTGTAAATCTAGTTAAAAAAGATGATGAATAATGATTAACTTTTGATAAAATTATATCCTTTATATTTGAAAAGAATGGCTACCCTTTTGAATTTGATCATCCATGAAAGGCCAATGAATATAAAAGTTCTACCCTTTATATTAAAAAAATGTTAATATATAAAATTACACAATGTAAGGATACAAAAATAACTACAATACATAGCTTAAACAATTTAGACAACAATAACATGAATTAGAAAAACATGCGCAAACAAAGAGTGCTTAGAAAGAATATTTTAATTATCTAAAACAACCTTAAACCTTAACTTGAGCACTCCAATTTAGATCTGAACTACAAACATAGAGTTTTTAAGGGTTATGACCAACTTACAATATTTTGAAGGGTTTAGAAAGTGTCTAATAATTATTTACCACGTAAATCTTTACCCAAAAGAGGTAATCGATTCAAAATTGATCTATTTGATATGTTATATTCAACAAAATGTAAATGTAGATAATTAAGAGATGTGAAAAAAAATTAACAATGGAAATTTTTTAATAAGGCACCCATAGTGTTACCAAAGAACGAGGGAACAAATTTAGAGAGTAAATACAAAAATTAAGCCAACCCAAACAAATTTATAGAGAGTGAATGGAAAGGTCAAATACTTGGTAGAAAGGAAATCGGCGGCGACAAAACCCAGAGTGCAGTGTGAAGAAACTCTGGCGATGGAAACCAGCGATGTCAAGGAATCGGGCCGCAAGCAAGGGATCGACGAAACAGAAACAACGCCGACCGGTAGACAGCAACCAATCGACGAGCAAGAGGGAGAACTAGAGGCGTGA

mRNA sequence

ATGAGTGGATTTTCACACAATAGTCAGCTAGTCTATTCGTCGGTGTTTCGTTCACGTGGAAAGAGGTTGCAGCTGGCATTCATTGAAAGAGTGAATGGAAAGGTCAAATACTTGGTAGAAAGGAAATCGGCGGCGACAAAACCCAGAGTGCAGTGTGAAGAAACTCTGGCGATGGAAACCAGCGATGTCAAGGAATCGGGCCGCAAGCAAGGGATCGACGAAACAGAAACAACGCCGACCGGTAGACAGCAACCAATCGACGAGCAAGAGGGAGAACTAGAGGCGTGA

Coding sequence (CDS)

ATGAGTGGATTTTCACACAATAGTCAGCTAGTCTATTCGTCGGTGTTTCGTTCACGTGGAAAGAGGTTGCAGCTGGCATTCATTGAAAGAGTGAATGGAAAGGTCAAATACTTGGTAGAAAGGAAATCGGCGGCGACAAAACCCAGAGTGCAGTGTGAAGAAACTCTGGCGATGGAAACCAGCGATGTCAAGGAATCGGGCCGCAAGCAAGGGATCGACGAAACAGAAACAACGCCGACCGGTAGACAGCAACCAATCGACGAGCAAGAGGGAGAACTAGAGGCGTGA

Protein sequence

MSGFSHNSQLVYSSVFRSRGKRLQLAFIERVNGKVKYLVERKSAATKPRVQCEETLAMETSDVKESGRKQGIDETETTPTGRQQPIDEQEGELEA

Homology

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of HG10003632 vs.


Match Name	E-value	Identity	Description

BLAST of HG10003632 vs.


Match Name	E-value	Identity	Description

BLAST of HG10003632 vs.


Match Name	E-value	Identity	Description

BLAST of HG10003632 vs.


Match Name	E-value	Identity	Description

InterPro

Analysis Name: InterPro Annotations of Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1
Date Performed: 2022-08-01


IPR Term	IPR Description	Source	Source Term	Source Description	Alignment
None	No IPR available	MOBIDB_LITE	mobidb-lite	disorder_prediction	coord: 57..95
None	No IPR available	MOBIDB_LITE	mobidb-lite	disorder_prediction	coord: 58..72

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:


Feature Name	Unique Name	Type
HG10003632.1	HG10003632.1	mRNA