HG10003396 (gene) Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: CDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGTTGAGTTCTATACACACGACGAAATTGAAACATATCCAAGAATCCAACAAAATGACTACTTTGATCCCATAGTATTGAAGGAAATAAAGAAACCAACAAAAGAAATCCAACGTTCATTGGAAAAAATGACTCAACATATTGGTCATTTATCAATTCATTTGCAAGAGTTCAAGAATGGATTGATTTCATATACAGAAGAAAACACAAAGGAATCACAGTTGGAAACTTTTCAATTAGAAAATCTTGAAGATAAAATTGGAAAAAATCTTGTTGAGATCCATGTAGTTAATGGAGGTGATTGGGACAAAAATCATGAGAACGAAGTAGAAGAAGAAGAAGAAAAAGAAGAATTTACAGATGTTAATTTGGAAATTATTTTAAGTGAAGAAAAATTCAACGAAGAAGATGGAATAGAGGTATCGAACATTGAGCAAGAATCGAGCAAGAACAATGACACATTGATTGCGTTTGAAATGGATCACCAAACTGTCGAAGAACTTGAAGCGAATGATAAAGAAGACGTGATTCTCGAACAATTCTCTTTGGAAGGTGGTTTCTTAGTGATTGGTCCTTTGAATACGGTTTTGAATGACCTTGAAGGAAACATCTTTTTTGGGTTTATGGCCAATGGAGAAGTTCATCTTTTGGTGGCAATATTGGAATTTTTGTCTCAAATTTATCACTTTGATCATAATATTTTTGTTCAAAATGTAGGAGGTTGGTTTGGTCATACTCCATTGAACAAGTTTATTTCATACCTTGTTTGCTTCATAATTTTTTCTTTTTAAAACTCGAGACGAGTTTTCTTTTTGGAGGGGTAGAATGATGTAAGAAGAATAGAGATTAATTGGGTAATTAGTTAATATTCTAGGTTAATTCCCTTTGATTAAAAAAAAAAAGAATTCTCTCCAAGAATCAATATTGTGGATCTTTATTAGAATGAATAATGTCTTTGATACAAGAGGGGAAGGTTCCTATTTATAGAGCTTTATTACAAGTGGGGGTAAAAAGGGAATTAACCTAGAATATTAACTAATTACCCAATTAACCCCTATTCTTCTTACATCAGAATTTACCCAAAGAATCAACAAAGGTCCATCCAACGTCCTTCGAACTCCATAAGAATTTGATAAATTCATTATCAAAAGAATCCCTCTTACTTTCATGAATTAAAACCAAATCCGGATTAAACTTCTTAAAACATCTTTTAAGAGCTAATCTCTTAGATGGATCTCCTAGCCCTCTTGTGTTCCTTGAGATAATTTTTATAGTGGACTAATTAGCTAAAAAAAAAAGAGAAAAAGGTAAAATCTTCTTTACACCACATAATGCAGATTTTTCCCAGTTTATCTTCTGCTCGGAGCACCATTCATAAATTTCTACAATTTTTCTTAAATTCTCAAGCATCCTATCTTCATACTTGCAAAAAATCAAAGTATCATCTGCATATTGAAGTAGGGAAATATGCACACTATCTTTTCCCACTATAAAACCTTCAAATTTTCTTTTTTCATGCAATCTTTTAATCCAAGAACTTAGTACTTCACTAACTATGAGAAATAGAAATGGTGATAATGGGTCTCCTTTCCTTATACCTCTTGTAGCATGTATTCTCTCTCTTGGTCTTCCATTTATAAAAATTGAGAATGTGTAGCTTGAGCTTTCATTATGAATAAGACCCAACAAGTGGAAATGAATATTAATTGAGGAGAAAACAACAATGGCAGGAGTTTGAACGCAGGACCTCCTGAACCAACCTTCTCTGATACCATATTAGATAACATGGGGTTCCAACCAATTGACAATGAGAGAAGTAACCCATCTATCTTTTAAAGAGTGTGAGATACCTTGGTTTTTCCAATGTGGGATACTCAACAAGGCCTATTAGCCTAATCACTAGTGTTTATAAAATCAGGTCCTAGCCAATCTTTTAAAAAACGTGCTCCTGTCGACGATTTTTGAGTTGCATGGAGCTTTTATGACTGGAGGACATATCGTTGACCAGGCTTTGATTGCCAACAAAGCTATTGGGGCCTTAGGGATATAGGTAGACAAAGAAAGAAGGGATAAGATTCAGTACCAATGTGGATTTAATTTTTCTAGAACCTTCTTTATTGAATTATTGTTTTGATTCTAAGGAAGTTCAACAATCTTTGTATGGTCTTTCTCTCTCTCCTCAATTTAATGAGGTTTCAAAATCGAAGTTTATGGAAGCACAATGGTCTCTGGAATTTTTTCCCAAGGCTGTTGAATAGAATTTAGATCCTTTCAAGAGGTATGTTCTGGCTTTTCCGTTGTGTTGTATTCAGAAAAATGTTAATCAACCTTCTTCAATGATTATAGAAGATACTTATGATTCATTAGGGGGGAATTGTGTATATGCTCAAGTTCCTATATTCTCTAAGGATAAATTTCATCTTAGTTCATCAAAGAGTCATCGTTTTTCAAATGTTTTCAGAAAATTGACTCTTTCTAATCCATGTTCAAAGACTCAGTTTGTGAGAGGTATTTATTGTCATTCTATTTCTAAGGATCTCTTTTGCTCCATTGATTCTTAAGAGGATTCAGTTGTTAGTGTGAATAGTGAAGAATGAAATTTTGTTTCAAAGGGATGAGGAAATTGTGTCCAAGATCCAAGGATGAGTGCTTCTCCTTTGACACCATCTAACATACCAACCAGAATATCTTCAATTTTAGAAGTTTGTGGTCTTCAATTGTGTAAAGTGGGATGACGACCTTACTTGAATATGATCTGTTCTATAGGTTGTACAACTATATCCTTTAGTTCTAAAAATTGTGTAAAGTGGGATGAATGCAAACTTTTGTGTAACGACCCGACTTCCTAGGACTTGTTCTAGGTCATTACTCCATGCATACATACACCTCAAAATGACACTTTTCATATATTTAACTAAAATCAAAGAAATTTATAGAATAAATAACTTCATTAAATTTAAATAATTAAAAATCTTGAATCGGGGCACCAAAAAAAAATTATAAAAACCAAAACTGTGAACTTTGCATAAAACGTCTAACGATGCAAAACCAAAATTTTGAATTTAAACATCAAGACTGGAATAGAAACATAAAAACGTGAGTGGAAGCATTGATTGGTCCCAATGGCATGGTCACGGATTCTTCATGTCATTTATGTCTGTCCTTGCCTTTACCTGAAAGTTGTAACATAAGAAAGAGTGAGTATCAAAATACTTAGTAAGTGACCCCATTATCGGGATCGCATGCATTTTGATACTATTCTGGGTGAACATCTAAGTAGATAACCTGGCCGCTTAGTCACTCATGTCTAGTGGCCTGATGACGCACCGTCAAACATGGGAGTGAACCTATCGATTCACGGTATCGTAATATGGGACGTGGCGAGGGTAAGACACCGTTACCTGACTAACATGTAGTTCGTACGTATATGTATTTAATAAAGAGTCTCACAACAATAGTCTTAAACTGTAAAATATCATAAGTGCGCATGTTCCATGAATCATAACGATCAACCAAAATTCTATTATTAAATTTGGTAACATGAACCGGGCGTCTGGCACGAAGGCAAGCCGATAATAATGTCACGTACCTCAAAATTAAGTCCAATTCACCACCAATTTATCTTCTTCCTTGCTTTGAGTAACCTTGAGCCACCCTAAACATAAATTAAAATTAACTTAAATATTCAAGCTTAAACCAACCAAAATGCTTACACTGACGATCTCCAAAAGCTTACCCAAAACGAGATTTGAACCAAGATTGAGCCCAAACTTTTCTCAACAACCCAAACCTAACACAAGATCAACGTTAGAGAATTAATCCAATTTTCCGGCAGTAAATCAAAAACCCAATGGAGCCCAAAATCCCAAAAACTTACTGAACTCCAACAAAACAAACTTTAAACCGGATGGGCAGCGGTTTCGTCACCCTCCAACTTCGAGTCTAAAGCCCAACCACAATGGGTATCAAGGAATTGCAAGAAAACTCACTAATACTCGAAAAATATCACCCAGTTTTACAGGTTCTGTTCAGCAGCGATTACGGACAAACCATATCTCAAAACAACGATCCAACCGTTCAGAATGATACCCTATGTGTCCCGAACAGGCTGACAAAATTTCAATACGATCCGACGGTTGGAACTCCGGCAAATGACAATTTTCCGAGAGCTGTCGCTGAAAAACCAAACTGCACTGCTCTCTTTCTCCTTCTCCCTTTTTTTGGTGTATTTTTCTCCTTCTCTACCTTATTAGGTCACCTAATAATATATATATATATACAATCCCAAACCCTAATTCCTTAATAAATAAGGTATACATATATATATATTAAATTTCTTTTCCCTCCATCAATTCGACTAAACAAATTAAATCTCCCAAATTAAAATTCAATCTTCACCAATTAAATTTAAACCCAAATCTTTTATCCCGTTTAATTTAAATTGAATTATCTTCTCAAAATAATCCAATTAAGTCTAAAAAATTCAAAATAACACCCAAATAATTTAAGATAATTAAATTAAAATTACCTAAAATTTTGGATTGTCACATTTTGATTTTAGTCTTTTCTCTTATTAATCACTTTGGAGTTCACGTTGAGTTTTTTGCTTATTTCATCCTTGGCATTAGTAGCAAAATTTCTTTTTGGCAAGTTTCATGGATAATCAATTTTACTCTGGTATCCAACTGTCCTCGGCTTTTCAGAATTTCTTCTTTGCCATTGGCTCGGTTTTAGACCTTTGAAATGAAGCTCTACGTCCAAGGAATATCACTTTCCAAAGGTTTTTGAAGGATGATGAAATCAACATCTAATGCGTTCTTTGAATGCATTTTTTTCAAGCATTATTGGTAGGAATTGCTTTTCTTTTTTTTTTTTTTAAAAAAAAAAATTCAGTGGGTGTTCAATAATCTATTCAAGGAGTACATCCTTCAACTTCTGGTTGGCCCCTCTTTGATATCTAAGTCTCAGTTATTATGGTCCACTGCAGTTAAAG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ATGGTTGAGTTCTATACACACGACGAAATTGAAACATATCCAAGAATCCAACAAAATGACTACTTTGATCCCATAGTATTGAAGGAAATAAAGAAACCAACAAAAGAAATCCAACGTTCATTGGAAAAAATGACTCAACATATTGGTCATTTATCAATTCATTTGCAAGAGTTCAAGAATGGATTGATTTCATATACAGAAGAAAACACAAAGGAATCACAGTTGGAAACTTTTCAATTAGAAAATCTTGAAGATAAAATTGGAAAAAATCTTGTTGAGATCCATGTAGTTAATGGAGGTGATTGGGACAAAAATCATGAGAACGAAGTAGAAGAAGAAGAAGAAAAAGAAGAATTTACAGATGTTAATTTGGAAATTATTTTAAGTGAAGAAAAATTCAACGAAGAAGATGGAATAGAGGTATCGAACATTGAGCAAGAATCGAGCAAGAACAATGACACATTGATTGCGTTTGAAATGGATCACCAAACTGTCGAAGAACTTGAAGCGAATGATAAAGAAGACGTGATTCTCGAACAATTCTCTTTGGAAGGTGGTTTCTTAGTGATTGGTCCTTTGAATACGTTATTTGAAGCACAAGAGAGGATGAAGCAACAAGCCACCATTGAGAAGTTATCTTTGCCATCAAATGTCAGTTATAGAATAGTGCGCTCATACTTGCAACATTATGGTTATGAGGATACGCTCAGTGCATTTGATATGGCTTGCAAAAGCACTGTTCCTCCTATCTATATAGCTCAGGAAAATGGCTTTGATGAGCAGGATATTGTTTATGCTCTCAACCAGAGAAAGACTTTAAGGCAGCTTATCAGGAAGGGGGAGATTGATGCTGCACTTGGAAAGCTTAGTGAGTGGTATCCACAGATTGTTCAGGATGAAAAATCAGCTACTTGCTTTCTCCTTCATTGTCAAAAGTTCATTGAATTAGTCAGGGTTGGAGCGCTAGAGGAGGCTGTTAAATATGGAAGGAATCAATTGGGAAAGTTCTATGGTCTGCCTGGGTTTCAGGATCTAGTTCAGGACTCTGTTGCTTTGTTGGCATATGAACGACCACAAGAGTCCCCTGTTGGTTATCTTCTTGAGGATACACAGCGTGAAATTGTAGCTGACACGGTGAATGCCATGGTTTTATCAACTAATCCCAATGTGAAAAATTTACAAGGTTGTTTGCATCCATATCTTGAACGGTTGTTGAGGCAGCTGACTGCTTGCTGCTTGGTGATTCGTAGAGATGTCTACACTTCAAGACTGTGGAGCTTGCAACTGACGTCAACAGCCGGCAGACCTAAGCGACGGCGACGGGATCCTCCACAGCATGCTCGCGACGACGACCCCTCCGACTGGCGTCGATCGGTGACATTGGACCCACGGAGCGCGACGACGACGAGACACGAGCTGACGGTAGCCGACGATCGGAGAACGAAGTCTGGTGCCGCAATCGGCGAGAACTCACACGAAGAAGAAGAAGAAGTTTTTTTAATGGGGCATTATTATTATTATTATTATTATTAG MVEFYTHDEIETYPRIQQNDYFDPIVLKEIKKPTKEIQRSLEKMTQHIGHLSIHLQEFKNGLISYTEENTKESQLETFQLENLEDKIGKNLVEIHVVNGGDWDKNHENEVEEEEEKEEFTDVNLEIILSEEKFNEEDGIEVSNIEQESSKNNDTLIAFEMDHQTVEELEANDKEDVILEQFSLEGGFLVIGPLNTLFEAQERMKQQATIEKLSLPSNVSYRIVRSYLQHYGYEDTLSAFDMACKSTVPPIYIAQENGFDEQDIVYALNQRKTLRQLIRKGEIDAALGKLSEWYPQIVQDEKSATCFLLHCQKFIELVRVGALEEAVKYGRNQLGKFYGLPGFQDLVQDSVALLAYERPQESPVGYLLEDTQREIVADTVNAMVLSTNPNVKNLQGCLHPYLERLLRQLTACCLVIRRDVYTSRLWSLQLTSTAGRPKRRRRDPPQHARDDDPSDWRRSVTLDPRSATTTRHELTVADDRRTKSGAAIGENSHEEEEEVFLMGHYYYYYYY Homology
BLAST of HG10003396 vs. NCBI nr
Match: XP_008459671.1 (PREDICTED: ran-binding protein 10 isoform X1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 434.9 bits (1117), Expect = 9.7e-118 Identity = 231/288 (80.21%), Postives = 243/288 (84.38%), Query Frame = 0
BLAST of HG10003396 vs. NCBI nr
Match: XP_011656119.1 (ran-binding protein M homolog [Cucumis sativus] >KGN52712.1 hypothetical protein Csa_007848 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 434.9 bits (1117), Expect = 9.7e-118 Identity = 231/288 (80.21%), Postives = 244/288 (84.72%), Query Frame = 0
BLAST of HG10003396 vs. NCBI nr
Match: XP_038889904.1 (ran-binding protein M homolog [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 430.3 bits (1105), Expect = 2.4e-116 Identity = 227/288 (78.82%), Postives = 244/288 (84.72%), Query Frame = 0
BLAST of HG10003396 vs. NCBI nr
Match: KAG7037148.1 (Ran-binding proteins 9/10-like protein, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]) HSP 1 Score: 427.6 bits (1098), Expect = 1.6e-115 Identity = 210/221 (95.02%), Postives = 216/221 (97.74%), Query Frame = 0
BLAST of HG10003396 vs. NCBI nr
Match: KAG6607489.1 (Ran-binding protein M-like protein, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 427.6 bits (1098), Expect = 1.6e-115 Identity = 210/221 (95.02%), Postives = 216/221 (97.74%), Query Frame = 0
BLAST of HG10003396 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: F4HYD7 (Ran-binding protein M homolog OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=RANBPM PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 298.1 bits (762), Expect = 1.9e-79 Identity = 144/219 (65.75%), Postives = 172/219 (78.54%), Query Frame = 0
BLAST of HG10003396 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: A7SWD3 (Glucose-induced degradation protein 8 homolog OS=Nematostella vectensis OX=45351 GN=v1g247787 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 78.2 bits (191), Expect = 3.0e-13 Identity = 55/202 (27.23%), Postives = 98/202 (48.51%), Query Frame = 0
BLAST of HG10003396 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q6PC55 (Glucose-induced degradation protein 8-A homolog OS=Danio rerio OX=7955 GN=gid8a PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 72.0 bits (175), Expect = 2.2e-11 Identity = 48/166 (28.92%), Postives = 89/166 (53.61%), Query Frame = 0
BLAST of HG10003396 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: E7FGY2 (Glucose-induced degradation protein 8-B homolog OS=Danio rerio OX=7955 GN=gid8b PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 71.6 bits (174), Expect = 2.8e-11 Identity = 48/166 (28.92%), Postives = 88/166 (53.01%), Query Frame = 0
BLAST of HG10003396 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9NWU2 (Glucose-induced degradation protein 8 homolog OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GID8 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 71.2 bits (173), Expect = 3.7e-11 Identity = 49/166 (29.52%), Postives = 86/166 (51.81%), Query Frame = 0
BLAST of HG10003396 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0KW89 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_5G651700 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 434.9 bits (1117), Expect = 4.7e-118 Identity = 231/288 (80.21%), Postives = 244/288 (84.72%), Query Frame = 0
BLAST of HG10003396 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CB75 (ran-binding protein 10 isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103498719 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 434.9 bits (1117), Expect = 4.7e-118 Identity = 231/288 (80.21%), Postives = 243/288 (84.38%), Query Frame = 0
BLAST of HG10003396 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DLW3 (ran-binding protein 10 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111022376 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 426.8 bits (1096), Expect = 1.3e-115 Identity = 227/288 (78.82%), Postives = 242/288 (84.03%), Query Frame = 0
BLAST of HG10003396 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1GB42 (ran-binding protein M homolog OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111452559 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 425.2 bits (1092), Expect = 3.7e-115 Identity = 209/221 (94.57%), Postives = 215/221 (97.29%), Query Frame = 0
BLAST of HG10003396 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1KBP0 (ran-binding protein M homolog OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111492850 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 424.9 bits (1091), Expect = 4.9e-115 Identity = 208/221 (94.12%), Postives = 216/221 (97.74%), Query Frame = 0
BLAST of HG10003396 vs. TAIR 10
Match: AT1G35470.2 (SPla/RYanodine receptor (SPRY) domain-containing protein ) HSP 1 Score: 298.1 bits (762), Expect = 1.3e-80 Identity = 144/219 (65.75%), Postives = 172/219 (78.54%), Query Frame = 0
BLAST of HG10003396 vs. TAIR 10
Match: AT1G35470.1 (SPla/RYanodine receptor (SPRY) domain-containing protein ) HSP 1 Score: 289.7 bits (740), Expect = 4.7e-78 Identity = 142/219 (64.84%), Postives = 170/219 (77.63%), Query Frame = 0
BLAST of HG10003396 vs. TAIR 10
Match: AT4G09340.1 (SPla/RYanodine receptor (SPRY) domain-containing protein ) HSP 1 Score: 288.5 bits (737), Expect = 1.0e-77 Identity = 145/220 (65.91%), Postives = 173/220 (78.64%), Query Frame = 0
BLAST of HG10003396 vs. TAIR 10
Match: AT4G09200.1 (SPla/RYanodine receptor (SPRY) domain-containing protein ) HSP 1 Score: 159.1 bits (401), Expect = 9.6e-39 Identity = 95/223 (42.60%), Postives = 132/223 (59.19%), Query Frame = 0
BLAST of HG10003396 vs. TAIR 10
Match: AT4G09310.1 (SPla/RYanodine receptor (SPRY) domain-containing protein ) HSP 1 Score: 159.1 bits (401), Expect = 9.6e-39 Identity = 95/223 (42.60%), Postives = 132/223 (59.19%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1
Date Performed: 2022-08-01
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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