HG10001548 (gene) Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: CDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGAGTTTAACGGCTTTATTATTCGAAGCTATGAAGAGAGTCGATTATCAGATAAAGTTCAAGTTATGGATCTTGAACGACGATGTGAAATTGGTCAATCAAAACGTGTGTTTCTCTTTACTGACACTTTAGATGACCCTATTTGTAGGATACGTAACAGTCCCATGTATAAAATGTTGGTAATTTGATTTGATTTGATTTAATTAATTGTGTTTTTTTATGTTGCTTAATTAATTATTAATTTGTGAATTAATTTTTTTTTTTTTTTTGTATTATTTAGGTTGCTGAGTGGAACAAGGAAGTGGTTGGTGTTATTCAAGGCTCTATAAAAGCGGTTTTTTTTACTGCTCATAAACCACCGACCGGTTTGGTGGTTAAAATGGGCTACATTCTTGGCCTGAGAGTGGCGCCGCGGTATCGCCGTCGTGGGATTGGCTCCGGCCTCGTCCGCCGTTTGGAAGATTGGTTCGTTTCTAATGATGTTGATTACTGTTGCATGGCCACTGAGAAAGATAATCACGCCTCTCTTAATCTCTTCATCAATAATTTGAGGTATTTTTCATTTTTAATTATTTTTATTTTCTAATTCTCATTTTTTAAGTTAATAATTTCGAGTTCGGAGAGTCGAAGATCGAACCATAATCTTTAAAATGTTAATTAGTATCATTTACCTAATGTGTTATATATACTCGGATTAGCTATTAATTCTATCTTAAAATGTAGTTTTTGTCGAGTATATATTTTGAGAACTATCAAATTTGTATGTAATTAGTTTTTTTTTTTTTTTAATTACAAACTAAACACATGATAATATTATTATTTGGTGGAATCTTTTTGTTTTTTTTAGCGAGATTTATTAGATATAAAATTAAAAATTTTAAGGGTCAAATCAAACTATTTCGAGAATGATTCTTGAAATGGTTACAATCATTTTTTAAAATAAATTCATTTAAAAAAGTAGTTAATTAATGTTTAACTTTACACTTTTAAACATGATTTACGTATGATTTTGAATGATCAAATTCATGTTTAACTCAAAGTGGTTTGAAATATGAAAAAAAAGACTCTTATACTCGTAACTTGAGTTAATTAGCAAGATCTTCATATGCAACTCAACTGTAAAATTCGAAAGTTTAGGGGCATATTAGAAATTTATTGAAACATTTTTTCTCCCAACAGGTACATAAAGTTTAGAACAGGAAGAATCCTAGTAAACCCAGTAAGAAATCATCCATACAATATCAATTCATCAGAAATCAACATTCAAAAGCTAAAAATAGAAGAAGCAGAAGCAATATACAAAAAACACATGGCTTCAACAGAGTTCTTCCCCAAAGACATAAAAAACATATTGAAAAACAAGTTGAGTTTAGGGACATGGGTGGCAAATTTCAAACAACGACGGTTATCGTCGACAGTCGCCGGAGGAAACGAGCAGATTACGGCGAGTAGTTGGGCCATTGTAAGTCTATGGAACAGTGGGGAAGTTTTCAAGCTAAGGCTAGGAAAAGCACCATTTCCATGGCTTATTTACACAAAGAGTTTAAAAATGATGGATAAAATTTTGCCTTGCTTTAAAGTGATTTTGGTGCCTAATTATTTCAAGCCATTTGGGTTCTATTTTGTTTATGGATTGCACCATGAAGGCCCTTTTTCTGAGAGATTGGTTGGAGCTTTGTGCAAATTTGTGCACAATATGGCTTTGAACAATTCAAAGGATCATAATTGTAAAGCTATTGTTACTGAGATTAGTGGTGATGAAGATGATGATGAGCTGAAAATGAAGATTCCCCATTGGAAATTGCTATCATGTTATGAAGATTTTTGGTGCATAAAGTCCTTGAAAAGTAAGAGAAATAATAATAATATTATTATTAGTAATGATAATGATAATGAGCATCATATATTGGAATGGAAAAATACCCCACCTATTAGAACTCTCTTTGTAGACCCAAGAGAGGTATAAAAGAATAAAAGAAAAAATAGGTTTAACCCTTTCTCAACACGTCTCAATCTAATTATTGTTCGTACTTGAGAGCAGAATGAAGAAAGTAGCTAGAAGAAAAGTTATTATAAAGAAGAAGAAGAAGATGACGACGACTTCTGAACTGAAATAGTTATGTTGTAAAATTTTGTCTTTTTCTGTACGTGGGTGTTTCTGAATTTAACTAGAGTCTATTCGTACTATTGTATTCATGACTAAATATGAATGAAAAGAAATATCAACGTCGTTTTCTATTAATAGTATGTACTATTGCTTTCGAAACCCTAATAATTAATAATCAAACGTTAATGTTAATTCTTTTAATGTTGATTGGGAATGTCTAGATTTTGCATCTTATGATTCCCTTTTTGTTTACGTGTCAGTGAAGAGAAAAATCTTTAGGCATTCTTAATTTAGATGTCGCGCGCCCATTCTTTAGCTTTATAAAGATTCAAAGTTAAAAAGCAATGAGAGGAGAGACATTATTTAGGGAATATTCTCATCACATGTGCTATATGCGAAGGCAAATAATAAGATTGAAAAGTAGGAAGATATATATATAAATAGATATTAGGTTAAATATTAAGTGTTGAGCTTAAAAAAGGTGAGAATTTGGAATTATTAGGGTTTAAAGGAAGGGCAGATAGGGGAAGGGCAAAGGGCAAAGAGGGGAGAAATTTGAGAACAAAATAAAAAGAGAGGAGATTTTTGGAATATATTATTATTAGGGCTTTTAAAAAACAAAGCCATGAATGAGTTAGGCCAAAATTTTATTCCTCCTAAAATGGAAATATGTCTTTGCAATTTATGGAGAATGTGAAGTTGATTTGAAGTGTTTATTTGTTTATGAAATTTTGGTGGTTAATTAATTATTCACATATATAAGTTTTCCATTTTTTGTGTTAATTTTTCAAATGGCTGCTGTTTCACTTCCAACTTTGTGTTTTTCACATTCTTTGAAAACAAACTTTTCTTCCCTCTTGGACCACTTGAAAGAGAATTCATTCTTGTGAGAAAAATGTATTTGGATTATATTAACGATGTTCACGAGACGAAGCGGGAATGAGAACGGGGACCTCTTTTTCATTTCTCATCCCATCCTTTTAAATTTTACAGATGTGTTAGGGGTGATATTAGATCGTATCTGAGTTATTCCATCTCATGTATCTTATTATGAAGTGATCTCTCGAATTTTTTCAAAGTAGGATTCATCAACATGCCCCGCGAGATATGGGTGTACATGGGTCAGGTTGGGTTGGATAGGGTTAAATGTGTTTTTTTGGATTAAGCTGAAAATTCAGATGGGTTGGGTTGACAACCAAAAAGACTCAAATAAAGTCTCTAACCCAACCCAACCCTACCCTTAAAATTCAAGTTGGATTGGGTTGTCAAGTTATAACTTTTTTTTTTTTTTTAATTTAAAACGTAAATATATCAACAACATATAATGATTAATAACTAAAATCTCATAAAATTCAAATATTAAATATCAAATATCTATGCTATTTATTAATTATTACAAACTTTAAACAAAGACAAATATCATGATAATTCTAAAAGAAAAATATTAAAGTAATTCACAAATTCATCCATTCAGAGTAATCAAACAATTATAAAAATAATTATGCAAAATATCAGCCAAAATAATCAATAAATTTTAAGTCTAATAAAAGAAAATACTACATTATTATATTGAAAACAAGATTTAAACAAAGATTTGCATGTTTTGAAACAACTCCAACATCATACCCAAAGTGTGAAGCACTACTTAATTTCCATTGTTTCTTCCATATTGTAATTCTTAACGACGTTATTTTGTGTAGACAATACATTTGTTAACAATGTAGCAACGTCATTATACGTAGAGAATATATTTGCTTTATTTACACTGCCAATCTTATAATGGTCAGCGTTTATGAATATATTGTTGGTTGTACTTTAGAAGTGAAGAATAAAAATCACAAATTATTCTTATTATTGCTAAGCCTTATTATAATTCCTGTACATATTCAAACTATTAATTAATACTTACTTATTATTGCAAAATTTAAGTTGACCCCTAATACAACCAGTCAAATGTTGTAGTGTTGATTTCGAGATTTTACTTGAGTCATCTCAAGTTAAGATATTGATCATGTTTTTCTTCACCTCCCATCGTATACTATAAAACGGATTAGAACAACGATTTTACCTTTAAAAGTAAGAAAAACGCTTATGTTGATGAAAATGCATGGATGATCAAATAAAAAAAAGGAGACTAACCAAAAATAATAGAAGATAATATTTTTTTTAAAAAAAAAAAAAAAAAACATGTCACATACCTTTGTATTGCATGTTAGGGTAATTTGTAGCTTTGTTTTGTGTGGACCAAAACAGTAAAAATTAAGATTTGAAGATTAAACAATGGTTTGAACAAACAAAAAATTATTTTATAAATTTTATGTCGATAATAATTGAATTTTAAAATTGATTTTTATGTCCGTAAATCGAGGAGAGAAAACATGGAAGTTAACAAAATCTACGGTTTAAAAATAAAACATCTAATTGGAAATATAACTTAAAAATAAAAAGTCAAAAATCACTTTTAAAATTTTAAAAATTTTAAAAATAACCTTATAACTTTAAAAAAAAAAAAGAGTTCTAATAGTTTTACATAAAAATTATTAGTGTTTTGGGTCAAAAATGCTTTAAAATTTTTAAAAGTTTCAACATTTTCTTTAAACTTAAAAAAGAATTAAATTTTAAAAAAATACCTATAAGTATACAAACAGAAGTAGTAAATATTCTCTTACTTCTCTATTTTTCTCTTTTTTTTCTCTTTTTTTTTTCTTCCATCTCTTCTTCAATACTCTACTACTTCCCTTTTTGTTAATTATTTGACATTCGTTTATATCAAATAAATAAATAAAATGTTCACTTCAATTGAAGGTATACTGTAGACTATAAAGAGAAGAAAAAGAATAATGGAAATACTCAGAGATCTTAAGACTTAAATATTTTGACAAGATT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BLAST of HG10001548 vs. NCBI nr
Match: XP_038901728.1 (pentatricopeptide repeat-containing protein At2g30100, chloroplastic [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 994.2 bits (2569), Expect = 7.5e-286 Identity = 494/506 (97.63%), Postives = 501/506 (99.01%), Query Frame = 0
BLAST of HG10001548 vs. NCBI nr
Match: XP_022944005.1 (pentatricopeptide repeat-containing protein At2g30100, chloroplastic [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 935.6 bits (2417), Expect = 3.2e-268 Identity = 467/506 (92.29%), Postives = 489/506 (96.64%), Query Frame = 0
BLAST of HG10001548 vs. NCBI nr
Match: KAG7010495.1 (Pentatricopeptide repeat-containing protein, chloroplastic [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]) HSP 1 Score: 934.5 bits (2414), Expect = 7.0e-268 Identity = 466/506 (92.09%), Postives = 489/506 (96.64%), Query Frame = 0
BLAST of HG10001548 vs. NCBI nr
Match: XP_023512972.1 (pentatricopeptide repeat-containing protein At2g30100, chloroplastic [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 932.9 bits (2410), Expect = 2.0e-267 Identity = 466/506 (92.09%), Postives = 488/506 (96.44%), Query Frame = 0
BLAST of HG10001548 vs. NCBI nr
Match: KAG6570645.1 (Pentatricopeptide repeat-containing protein, chloroplastic, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 932.6 bits (2409), Expect = 2.7e-267 Identity = 465/506 (91.90%), Postives = 488/506 (96.44%), Query Frame = 0
BLAST of HG10001548 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q0WNN7 (Pentatricopeptide repeat-containing protein At2g30100, chloroplastic OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At2g30100 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 603.6 bits (1555), Expect = 3.7e-171 Identity = 308/489 (62.99%), Postives = 380/489 (77.71%), Query Frame = 0
BLAST of HG10001548 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O64815 (Probable N-acetyltransferase HLS1-like OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At2g23060 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 319.7 bits (818), Expect = 1.1e-85 Identity = 180/432 (41.67%), Postives = 256/432 (59.26%), Query Frame = 0
BLAST of HG10001548 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q42381 (Probable N-acetyltransferase HLS1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=HLS1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 310.5 bits (794), Expect = 6.5e-83 Identity = 177/425 (41.65%), Postives = 253/425 (59.53%), Query Frame = 0
BLAST of HG10001548 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q0WVV0 (Pentatricopeptide repeat-containing protein At1g10910, chloroplastic OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At1g10910 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 56.2 bits (134), Expect = 2.2e-06 Identity = 46/215 (21.40%), Postives = 89/215 (41.40%), Query Frame = 0
BLAST of HG10001548 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1FYE9 (pentatricopeptide repeat-containing protein At2g30100, chloroplastic OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111448564 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 935.6 bits (2417), Expect = 1.5e-268 Identity = 467/506 (92.29%), Postives = 489/506 (96.64%), Query Frame = 0
BLAST of HG10001548 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1JH85 (pentatricopeptide repeat-containing protein At2g30100, chloroplastic OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111484464 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 928.7 bits (2399), Expect = 1.9e-266 Identity = 463/505 (91.68%), Postives = 489/505 (96.83%), Query Frame = 0
BLAST of HG10001548 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0KC35 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_6G182120 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 921.8 bits (2381), Expect = 2.3e-264 Identity = 464/506 (91.70%), Postives = 481/506 (95.06%), Query Frame = 0
BLAST of HG10001548 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CNE0 (pentatricopeptide repeat-containing protein At2g30100, chloroplastic OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103502924 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 921.8 bits (2381), Expect = 2.3e-264 Identity = 465/506 (91.90%), Postives = 480/506 (94.86%), Query Frame = 0
BLAST of HG10001548 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1D3T2 (pentatricopeptide repeat-containing protein At2g30100, chloroplastic OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111017036 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 904.8 bits (2337), Expect = 2.9e-259 Identity = 455/507 (89.74%), Postives = 478/507 (94.28%), Query Frame = 0
BLAST of HG10001548 vs. TAIR 10
Match: AT2G30100.1 (pentatricopeptide (PPR) repeat-containing protein ) HSP 1 Score: 603.6 bits (1555), Expect = 2.6e-172 Identity = 308/489 (62.99%), Postives = 380/489 (77.71%), Query Frame = 0
BLAST of HG10001548 vs. TAIR 10
Match: AT2G30090.1 (Acyl-CoA N-acyltransferases (NAT) superfamily protein ) HSP 1 Score: 355.9 bits (912), Expect = 9.6e-98 Identity = 193/407 (47.42%), Postives = 258/407 (63.39%), Query Frame = 0
BLAST of HG10001548 vs. TAIR 10
Match: AT2G23060.1 (Acyl-CoA N-acyltransferases (NAT) superfamily protein ) HSP 1 Score: 319.7 bits (818), Expect = 7.6e-87 Identity = 180/432 (41.67%), Postives = 256/432 (59.26%), Query Frame = 0
BLAST of HG10001548 vs. TAIR 10
Match: AT4G37580.1 (Acyl-CoA N-acyltransferases (NAT) superfamily protein ) HSP 1 Score: 310.5 bits (794), Expect = 4.6e-84 Identity = 177/425 (41.65%), Postives = 253/425 (59.53%), Query Frame = 0
BLAST of HG10001548 vs. TAIR 10
Match: AT5G67430.1 (Acyl-CoA N-acyltransferases (NAT) superfamily protein ) HSP 1 Score: 280.8 bits (717), Expect = 3.9e-75 Identity = 166/416 (39.90%), Postives = 233/416 (56.01%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1
Date Performed: 2022-08-01
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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