Sequences
The following sequences are available for this feature:
Gene sequence (with intron)
Legend: exonpolypeptideCDS
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CTCCAAAGTTATTATCCACGTCGACGAAACGCGCCACCGCCGTTTGAGCTGCTGTCTAATCCCGTCGTTGTCCGATCGATCTATTTATTAGCAAAAGGGCAAATGGGACATTTCGTACGTTCGTACCGATTACCTCTAAAACCTTCTAAAACCCTTCACTTCACAGTCTCTTCCACCGGAGATCGATCGAGATGTCGGGTTTCGGCTTTGGATCTTCCACCTCTCAATCTTCTTCTCCATTTTCCTCAACCACTGGTTTCTCCTTCGGATCCACCAACTTTTCCTTCGGATCATCCCCTTCCCCTTTATCTCTTTCATCTTCCTCCTCCTCCTCCTCAAACCCTACTTCCTCTTCCTCCCCATTTCCCAATCCAACGTCCAATCCTTCTTCTTCTTCCTTTGGCTTTGGCTCTTCCTCTTTCTCCACCTCTACTTCCTCTCCCTTCTCTTTCTCCCTCGCCTCCGCTTCCACCGGAGCATCTTCCTCTAGCGCCCCTTCTTCCGCAGCAACTTCAGCTTCGTCCTTGTTTGGGGTTTCTTCATCCTCAACTGGATTCAATTCTTTCGGATTCGGGGCTTCATCCTCGTCAGCAAACTCCTCTGCTTCCTTGTTTGGGGCTGCTTCCTCCTCCGGGACCTCATCCACCTCCTTGTTTGGGGCTGGGAGCTTACCTGCGCCTTCGTTTGGGGCTGCTCCCTCCTCTGGGAGCTCAGTTGCGCCTTCCTTTGGGGCTCTTTCCTCATCTGCCGGGACCTCATCTGCGCCCTTGTTTGGGGCTGCTCCATCTGCAGGGGCATCATCGGCTCCGTCCTTGTTTGGAGGGGCGTCTTCTGCAACTACTTCCAGTGCACCATTGTTTGGCACATCTGCATCCGCTGCAAGTTCGGGATCAGGGTTGTTTGGCGCTTCTGCCGCCGCTTCCGGTTCTGGTGTTTCTCTGTTTGGGACACCAGCTACATCTTCAGGCAGTACAGGTTCAGGTTTGTTTGGGTCTAGTCCCTTTGGTGCATCTTCTTCAGGCACTTTATCTTCGGCTTCCACTTCAAACTTGTTTGCGTCATCTTTGTCCACTTCTCCATTCCAGAGCACCCTTTCTTCGAGTTCTTCCCAAAATTTGACTTCTTCTTCACCGTTTGTGGCTTCTCCTTCTGGGTTTTCATTTCCGACCGGTTCTTTGTCTAAAACTACTAGTATTACCAATGTATCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTCTTACACTAGCCTCTACTAGTTCCTCGAGCTTCTCATTCGGAACACCTGCTTCGTCGTCATCTCAATCTTCTTTCGGATTTAGTATTAACAATGCAGCATCGACGGGAGGGTCGTCTGCTCCGAGCACTACAGCTACGAAGCCTACTTCTTTATCGTTATCAAATTCTGTGGCACCTTTGTTCTCTACGGTTACTACCACCAGTGCTTCTACTCCAGCTGCCAATAGCACAACTCAGCCATTCTTCTCCGTGCCAGCTTTTAGTTCGAGTTCTTCAGCTGCTACTACCTTGTCCATAGCAGCATCTTCCGCTCCCTCGGCTGCTTCGTCGGGTGCTGTGAGTTCATTTACTGGTTTTGGTGTCACAAGCTCGGCTTCTTCATCAAGTGCAATTGGTTCCTTATCGTTGCCGACCAAAACATCAACTGCTGCTTCATCATCTCAAGCGCCAGCCTCTTTCGGTAAGTTCTTTACTTTCTTTGTTTTACTTCGTGATATTTGGTTTATAATATTGGCTGTTCGAAATAAGTTTTGTGAGTCATGTTGTTAAGTGGGTTTTTACTTCTTGAGGGGCATATCAAGGATCCCATGTTGGAAAGGTCAATGGAGCTTACACTTCTTTTAACATAGAGGATTTACTTCTTATTCTCAATTGGTTTTGAGATGGAACCTCACGTTAGGTTTTTTGGCTGTATTGGTGTAACCAAGTACTCCTTTCAGAATGTTGCTACATTATGTCAATATACCTAGTGTATTTTGTCTAACTTTTGTTTAATCTTTGCAGGTTTCCCTTCTTTGGCATCCGCTTCTACGGCTGCTACCACCACATCCGGTTTCAGTGCTTCAAGTCAGAGTCAGACTTCATCAGCTCTTGTTGTAGCAAGCAGTAGTAGGTATGTATGTGATTGAGTTGCTTTCCTAGTAATGTATGTGTGTGTTTATATAGAAGCTCTCTTAACTCATTCCACTATACATTAGTACCTGCATGGATTGGTTATTATTCAATGGTTTATATTCATCATTTGCTTTATTCTTCATTTATGCAGTGGTACAACTTCAACTGTTAGTGCAACAGTTTCTTCTACACCAAAATTACCATCTGAGATAACAGGGAAGACTGTCGAAGAGGTATTTCTTTTTTCATGATCGGAGATTTGCACAGTTCATTTGAGTTGCCTTTTTTCAGACAATTACCAATGTTTTTGTTCCAAAATTTATTATTGGGTTTAGAAAAGGAATCAACATGTGCCTCACTAACAAAAATCTAATCTCCTCCGCTCATATAAGTTTGGTGGATGCCCCTTCAAAAAAAGGAAAAAAAGATGGTATGGGAGGCTTTATAAGAGTCTTTTACTAGAATTTATGGCAAGAAAGAAATAGAAGATTTTTCCAAGATAAAGAAATTCCTTTCTTTAGATTTTCTGATGCAATGGTTAATATGATTGACTTGGTGTAAATGTTCCCCCTTGTTTCACCTAGCTTGACCATGCTTCTTTCCCTACTTTTATAATTCCATACCATTGATGAAGTGTTGTTTTTTTCTTTCTAATTCTACTTTTAAAATGTGCCTCATTACTAGGGACAATTAATGTTCCAGAATTAGTAATGCAGAAAATAAATTGATGACTTAATTACACATCTAGTATTGAAAATGTCATAGAAAACTTTTGGTGTCATTGATTCATCCAATAAAGTATTTTTCTTTCAACTTAAGTTGACTTCAATTAATAATTTCAAAATATTCTTGCAAATTGTCTTTGTGTTCATTGTTCATGGAATCATCATAAACATCCCTCCAACGTTGTTTAGTCTTTTTTTTTTATTCTTTTTTGGTAATTAAATTGTTTGAAATGTATGCTTCTTGCTTTTTTCTTCATTTTCTTTATAGATCATAAAGGAATGGAATGCAGAGCTCCAAGAGCGTACTGGAAAGTTTCGAAAGCAGGCCAATGCTATTGCTGAGTGGGATAGGAGGATTATGCAAAATCGTGATATTCTTCTTAGACTTGAGGTGTTATGCCACTTAATATCAAAAATTTTAAATCTTCAATGAGATATGAAATTTAATTTGCTATTATGTCTGTTCTAACAAAATATGTGCAAATGATTATAAGAAAGGATAATTCTAGTTAATGAATTTTTGGACCATCTGATTCTTGTACTATTCACCTGTATCTTTCATTGGATCCTAATTTACACGAGATGAACTCTGAGCATATTTGTTAGGAAATCTTTAATTTAAGTGTTCACATCCCTTTATTTTTTCTTCCCTGCGTGTTTTGGACAGTGCTCAGTTCAATTTTACCTTAATGTTTTGTCTCCCAACTGATTATAATTTTTGTTATTTCAACGGTCATTTAAAGAATTGAAAAGCTGCAACAGAGAAACTAACCAAAGGGGCTAATGGAAAGTAGGCTTACTCAGCAGAAATGAGGAAAGGGAAATAATTACGAGTCTTTTTTCACAGGAACGACCACCCTGAAAGTAACCTAAACTACTAGATAAAAAGAATGTCACACTCACCATCTCTCTTTTTGATTTCCTTTTATCTATTTATTTATTTATATTTATATTTTTCTTGGAACTACTTTTTTTAGGTTTTTTGTTTTTTGTTTTTTGTAAAAAAACAAAAAGAATATTTTTCGAAATCTTCAATGTGAAAGGAGGCATCAAAGTACACACTGGATCTTGAGTGGCATATTTTGTTTTATTTGTTGGAATTTGTGTTGCATATTGGTGCTTTGGTTTGTTTTCCTACTAGTCCTCTTTACTTGATGAACTAGTGAGAATTCTTCATTAGGATGGCCTTCAAAGGGATTTTCTTTTTGATTATTTTTGCTGTTGTGTTTTTCTAATCTTCAGGCTGCAGTCTTTTACTGAGTTCTTAATTGGTTGTATTTGTATTTGTTTTGTTTTTGTTTCATTGTACTTTGAGCATTAGTCTCTTTTTATTTTATTGATGAAAAGTGTTGTTTTCTTTTTGGGAAAAAAGTACAGACTGGACTCATTTTATCTTAATGATTCACTTAATTTTTTTCTTTATATCTTCATTGATCAAATGGGTTATCTTGAACTATTATTATGTATTTATTTTTATTTAAAAGTTGTCTCTTTTCTTCTTAGTGAGACATTTATTGATAAGGTGAAATATTCGGAAGAATGTTGAAACCCATTCTGGAAAGAGGGTTCTCTCTATCTAAATGTCAAAAAGGAATAATGAGAAAGATAGATTGCTCTAATGCATTTATTTTGAATTTAGATTGAGGTTGCAAAGGTGGTTGAGACCCAAGCTGAGTTGGAGAAGAAATTGGAGTTGATCGAAACTCACCAACAAGAGGTATTCACCTGCGGCCTTGTTTGTCTTTTCCCTTCAATATTTGCTTTTAGGTAGACACTTTACCTATGGTCTTGTGTTCTTAAAGTAGGATCTTTGGAGGGGTAGAAAGATATTGGAAGGAACTTTGGAAGTTCATTAGATTCAAATTTTAATCCAAAAATCGTTAGTGGGGGTGGTGGGTCATTTTAGTAAGAATTCTTTTTGAGGATTTGGGAGAGAATAGCTCTCTTGAATGCCTGATGTATTGTAACTTATTTTGATATTGCAATATGCATTTCTATTTTTTAATGTGTTTTGTGTTGTTCTTGAGTGTTCATGTTTGGTGGTAACATAACACTTTATTCCTCATGCCTTTGCATCCTTGAAGGAACAGTTATTAACCAAATCAATCACCTTGCAGATCATTAGACAAATTCACGGTTTAGGGACTAAAGATACTGAAGTTCAAGCATTGCACTGTCATAATTTAGGAGTATAGTGTCTACCTTGTTATACTAAACTTTAGAGACTAAATTACAACTTCCTTGGAAGTCCAATGACCAAATGTGAGTTCTAACCTAGAATAGCTGAAGTGAGCATAGATAGCTGTAGAAAGGCGAGTGCTAGAGGTTCTTATGACCTCATGTCTCAACTCAAATATTGGGAAAGTAGCACCTACCGTTGACTTTTCTTATTTTTCGGTTTTGTTTTATTAACAAAGCGTGCTTTAAGATGGCAAGTTTGCTTAATTGGAAGTGAGTTCACAACTTGAGAATTATTGAGAAATTTTTAATTGCACATATTCTCATGTATGTTTAATAAACCCATTGAATTTGTCTATATTCAATTATCAGGTTGATAAGGCATTGGTAAGCGTGGAAGAAGATGCTGAGCGCATTTACAAGGATGAACGTGGTTTACTTCTTGATGACGAGGCTGCATCTACAAGGGATGCAATGTGAGTGGTAGATTTTACTTTAATTGCATGTTGTAGGGTACAATCTTTTATATTTAAGATATTCTTTTTTGTTTTATCTTTATGTTTTTTGTAACAAGAAACTGATGGAAGCCAATTTGGTATGAATTCACTACTATTTTATTGATGATAGAATAGGAATAATTCCTGATTACAATATAGAAACCCTCTTCTGCTCCTCTCTCTCAAGGAAGAACAGAAAACCAATTCTCAAAATAAACCTAACTCCCTTTCCCACCAACAACTCCTTTTATTTATACTAACAACAAATTTACTAACTCTTACCTTTACTAACCCTCACGTGCTATTCATGTGCACGTTATATTTCTTTTTACTCCTGCTGTACTGATGCAATATTGGAGATCTATCAGAAACTTATCATTGAGAAAGTAAAAAGAGACTAATGCTTGAAAACTACAAACTATACATGAGGAGTTTATTAAATGTGACTGTTGTTTGGATCTGAAAAGTTGGTACTCAATTCATAAATTGATAAGATCTTGCTAGCGATGATGGTTTAACACTAGTCTTTGGAACTTGGTGCTGGGCACGCAGATTTGTTTGTTTTTTTTTAGTCTATTTGGCTAGTTATCTTCTTTAGATCTTTCATGCTTGATGGGGAAAGAAGCTCAAGTGAAATGTATCTATTTGAATTTAGATGGAGGAACACTGTGAGGAAAATAAGATGACATTTTTTCGTGAAGGGGAATGTTTTTACATAGAACACCTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGTCTATTTGGCTAGTTATCTTCTTTAGATCTTTCATGCTTGATGGGGAAAGAAGCTCAAGCGAAATGTATCTGTTTGAATTTAGATGGAGGAACACTATGAGGAAAATAAGATGACGTTTTTCGTGAAGGGGAATGTTTTTACATAGAAGCAATAGTTTTAAGCAATTTTCAACTTATTGGATAATGCTTTGAGCTTCCTCATAGTTAAACTTAACTGAGTAACAGAAACTCAAATGGAGGGATGATAATAGAACACCTTTCTAATAGGTCTACAAAATAGTAGATCTTCACCTTTCTGATAGAACCCACTTCTTTTGGATATTCTTAGAAAAGTGTAGTAATAAAAGGACGACGCCTTTAAACTTCTAGTGGGTCCTCCCTTGAAGCCTTTCTCCCAAATTTTATGGTCCAATGCAGTTAAAGCTATTCTTTCTCTCCGAAATTTAGTTTGAAAAGAACCAACACGTTTTTTCAAGGCAAGTCTCTAGCATGGTCCGATTGTTTTGATCTTGCATCTATACACTTTGGGGGGATTAACTAAAGGTGTATACACTGAAAGTAGAAGATCAATTGGGCTGTAAATCCTACAAATCTTTCACCTGGGGAACTCAATAATTTTTTAAAAAAATTTTATGGCTGAATTAGAAAGTAGATTAATTTTCCGTCGTTGTACCAAAGGTTCAATTTTCTCTCTTGTTTTCAATCTAATGACGTTGCAGGTATGAGCAAGCTGAATATATAGAGCGGGAATTAGAGCAGATGACAGAACAGATCAAATCAATTATCCAGACCCTAAATGCGAACCAGGTAAAGGAAAACAGTCAAATATATTTGCCTTGGATTTTCCTCTACGTGGTAATAGATAAATCATACATCTACTTATTTATTTTTATCTAGGGAGGTGAACTTGATGTGATTGATGGGATGACACCGCTAGATGCTGTTGTTCGAATTTTAAACAATCAATTAAGTTCATTAATGTGGATCGATGAAAAGGTTAGTGCTGCTTGTATACATAGCTTATCCATTTGTAAAACCTCTTTAAACCATGACCGTAGTAAAATAGATTTCTAAGCATAAAAATATTTCATTATTCTCTATGTTATTAGACCTTCATCAGACTGCAATTCTCCGACTGAAATCTTTAAATTCATTTCTGAGATACAAAAGTATTTTTTGGTTTATCTTAGGACTGTGGAATCAATGATTAGAAGAACCATAATAAGTTCTCATAAATTGTCGAGCAATTTTTTATACACTTATTGGCATTATCAACTATCAACGGATGTGTATGATTAATTTATGATGTATGTGATAAAGCAATGTTTTAAAAGGCTACACCTGGAGACTTGCCTCGAGGCAAGGCTCCAACTTTTGGCTCCAAGACTTACACATCCTTTGAACCACAAGAGAAGAGGCTTACAATTTTGTGAAAATACATTGAGGCTAAAAAATGTTTATGGCTGATGTAATGATTAGAAGTAGTAATTTGTCTCATTCTTCAAAAATGTAAAAGTTTAAGTTGTGACAATATAAAAATTGATATTCTTACAAGCCAAGAGAATGAGCAAGTAATTTTCCGATGATCTACAAGACATGGTTGAAGGAGAACAGCTTTTGTATGGTTTAGCTTTTGATTGATCTTTTGTGGAATTCTTTAATAATTCAGGAAACCATTTAAGTGGATGGTTCTTAGTTTTATTTTTTGAGATACATAGGAAATTTATGATAGAGCTCGGTCATATCTCTCTGAAAACAGACCTAGCATAGCTTACCATGAAAAAATGCCTTTAAATCATAATTTTTTTTGTTCTCATTACTGCATTGAGCTCTAACATTAAGCTTTGTCAGGCCGAAGAGTTTTCTTCACGTATTCAGAAGCTTGCTGCTACCGAGGGTCCGGCTGCAGATCGTGAATTGCTGGGTCAGAAGTTGTGGATGTCTTAAATTTTAAACTGGTTTTAGTTTTAGTTGTTGTGAAACTGCTGTTGGAATTAGTGTATAGAGGCCTTAACTCACATTTGTGGTTTATTTCTAGTTTCCTTCTTTCAATTGGCTGAACTGGAAATCTTTTTGCCCAAAAGGATGTATTCATTTTTTCTGTTTTTCTTTTGGAAAACATGAATACAGGGAGGGCAATCAAATTTTCGACCTTTTAGATGTGGGAGAGATATACTTTGATCGATAAACTAGGGTCAAACCTGAATTTGGTGCATAATACTTTAGTTGTCCATTCATGGATCATTTTCAAGAACCCTACCCCTTTCAGCTCTCTATTTATTCCTACATTCAAAAGGAGAAATTTCATTAAAATTCTAAATTGTTTTCCAATTAAATATGAATTTTGGAGCATAATATTT
Coding sequence (CDS)
ATGTCGGGTTTCGGCTTTGGATCTTCCACCTCTCAATCTTCTTCTCCATTTTCCTCAACCACTGGTTTCTCCTTCGGATCCACCAACTTTTCCTTCGGATCATCCCCTTCCCCTTTATCTCTTTCATCTTCCTCCTCCTCCTCCTCAAACCCTACTTCCTCTTCCTCCCCATTTCCCAATCCAACGTCCAATCCTTCTTCTTCTTCCTTTGGCTTTGGCTCTTCCTCTTTCTCCACCTCTACTTCCTCTCCCTTCTCTTTCTCCCTCGCCTCCGCTTCCACCGGAGCATCTTCCTCTAGCGCCCCTTCTTCCGCAGCAACTTCAGCTTCGTCCTTGTTTGGGGTTTCTTCATCCTCAACTGGATTCAATTCTTTCGGATTCGGGGCTTCATCCTCGTCAGCAAACTCCTCTGCTTCCTTGTTTGGGGCTGCTTCCTCCTCCGGGACCTCATCCACCTCCTTGTTTGGGGCTGGGAGCTTACCTGCGCCTTCGTTTGGGGCTGCTCCCTCCTCTGGGAGCTCAGTTGCGCCTTCCTTTGGGGCTCTTTCCTCATCTGCCGGGACCTCATCTGCGCCCTTGTTTGGGGCTGCTCCATCTGCAGGGGCATCATCGGCTCCGTCCTTGTTTGGAGGGGCGTCTTCTGCAACTACTTCCAGTGCACCATTGTTTGGCACATCTGCATCCGCTGCAAGTTCGGGATCAGGGTTGTTTGGCGCTTCTGCCGCCGCTTCCGGTTCTGGTGTTTCTCTGTTTGGGACACCAGCTACATCTTCAGGCAGTACAGGTTCAGGTTTGTTTGGGTCTAGTCCCTTTGGTGCATCTTCTTCAGGCACTTTATCTTCGGCTTCCACTTCAAACTTGTTTGCGTCATCTTTGTCCACTTCTCCATTCCAGAGCACCCTTTCTTCGAGTTCTTCCCAAAATTTGACTTCTTCTTCACCGTTTGTGGCTTCTCCTTCTGGGTTTTCATTTCCGACCGGTTCTTTGTCTAAAACTACTAGTATTACCAATGTATCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTCTTACACTAGCCTCTACTAGTTCCTCGAGCTTCTCATTCGGAACACCTGCTTCGTCGTCATCTCAATCTTCTTTCGGATTTAGTATTAACAATGCAGCATCGACGGGAGGGTCGTCTGCTCCGAGCACTACAGCTACGAAGCCTACTTCTTTATCGTTATCAAATTCTGTGGCACCTTTGTTCTCTACGGTTACTACCACCAGTGCTTCTACTCCAGCTGCCAATAGCACAACTCAGCCATTCTTCTCCGTGCCAGCTTTTAGTTCGAGTTCTTCAGCTGCTACTACCTTGTCCATAGCAGCATCTTCCGCTCCCTCGGCTGCTTCGTCGGGTGCTGTGAGTTCATTTACTGGTTTTGGTGTCACAAGCTCGGCTTCTTCATCAAGTGCAATTGGTTCCTTATCGTTGCCGACCAAAACATCAACTGCTGCTTCATCATCTCAAGCGCCAGCCTCTTTCGGTTTCCCTTCTTTGGCATCCGCTTCTACGGCTGCTACCACCACATCCGGTTTCAGTGCTTCAAGTCAGAGTCAGACTTCATCAGCTCTTGTTGTAGCAAGCAGTAGTAGTGGTACAACTTCAACTGTTAGTGCAACAGTTTCTTCTACACCAAAATTACCATCTGAGATAACAGGGAAGACTGTCGAAGAGATCATAAAGGAATGGAATGCAGAGCTCCAAGAGCGTACTGGAAAGTTTCGAAAGCAGGCCAATGCTATTGCTGAGTGGGATAGGAGGATTATGCAAAATCGTGATATTCTTCTTAGACTTGAGATTGAGGTTGCAAAGGTGGTTGAGACCCAAGCTGAGTTGGAGAAGAAATTGGAGTTGATCGAAACTCACCAACAAGAGGTTGATAAGGCATTGGTAAGCGTGGAAGAAGATGCTGAGCGCATTTACAAGGATGAACGTGGTTTACTTCTTGATGACGAGGCTGCATCTACAAGGGATGCAATGTATGAGCAAGCTGAATATATAGAGCGGGAATTAGAGCAGATGACAGAACAGATCAAATCAATTATCCAGACCCTAAATGCGAACCAGGGAGGTGAACTTGATGTGATTGATGGGATGACACCGCTAGATGCTGTTGTTCGAATTTTAAACAATCAATTAAGTTCATTAATGTGGATCGATGAAAAGGCCGAAGAGTTTTCTTCACGTATTCAGAAGCTTGCTGCTACCGAGGGTCCGGCTGCAGATCGTGAATTGCTGGGTCAGAAGTTGTGGATGTCTTAA
Protein sequence
MSGFGFGSSTSQSSSPFSSTTGFSFGSTNFSFGSSPSPLSLSSSSSSSSNPTSSSSPFPNPTSNPSSSSFGFGSSSFSTSTSSPFSFSLASASTGASSSSAPSSAATSASSLFGVSSSSTGFNSFGFGASSSSANSSASLFGAASSSGTSSTSLFGAGSLPAPSFGAAPSSGSSVAPSFGALSSSAGTSSAPLFGAAPSAGASSAPSLFGGASSATTSSAPLFGTSASAASSGSGLFGASAAASGSGVSLFGTPATSSGSTGSGLFGSSPFGASSSGTLSSASTSNLFASSLSTSPFQSTLSSSSSQNLTSSSPFVASPSGFSFPTGSLSKTTSITNVSSSSSSSLTLASTSSSSFSFGTPASSSSQSSFGFSINNAASTGGSSAPSTTATKPTSLSLSNSVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPFFSVPAFSSSSSAATTLSIAASSAPSAASSGAVSSFTGFGVTSSASSSSAIGSLSLPTKTSTAASSSQAPASFGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSALVVASSSSGTTSTVSATVSSTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKALVSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAATEGPAADRELLGQKLWMS
Homology
BLAST of Cucsat.G18283 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match:
Q8L7F7 (Nuclear pore complex protein NUP62 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=NUP62 PE=1 SV=1)
HSP 1 Score: 267.3 bits (682), Expect = 4.6e-70
Identity = 347/716 (48.46%), Postives = 442/716 (61.73%), Query Frame = 0
Query: 6 MSGFGFGSSTSQSSSPFSSTTGFSFGSTNFSFGSSPSPLSLSSSSSSSSNPTSSSSPFPN 65
MSGF FG S +S GFSFGS S + SSS+SS+++P S S N
Sbjct: 1 MSGFPFGQS--------NSVGGFSFGS---------SSATNSSSASSTTSPLSFSF---N 60
Query: 66 PTSNPSSSSFGFGSSSFSTSTSSPFSFSLASASTGASSSSAPS----SAATSASSLFGVS 125
+SNPSS+ FGFGSS ST SS + S G +SS PS S+A+S++ FG
Sbjct: 61 QSSNPSSTGFGFGSSVSSTPASS------TTPSFGFGASSTPSFGFGSSASSSTPSFGFG 120
Query: 126 SS-----STGFNSFGFGASSSSANSSASLFGAASSSGTSSTSLFGAGSLPAPSFGAAPSS 185
SS ++ SFGFG ++SS+ + SLFG S T++ S GS P FG SS
Sbjct: 121 SSASVTPASTTPSFGFGTAASSSAPAPSLFG----SSTTNASSAAPGSSP---FGFVTSS 180
Query: 186 GSSVA-PS---FGALSSSAGTSSAPLFGAAPSAGAS----SAPSLFGGASSATTSSAPLF 245
SS A PS FGA +SSA T S+ FGAAP++G++ S+PSLF SSA+ S++ LF
Sbjct: 181 ASSTATPSSSLFGAPASSAATPSSSPFGAAPASGSTPLFGSSPSLFSAPSSASASNSSLF 240
Query: 246 GTSASAASSGSGLFGA-------------SAAASGSGVSLFGTPATS---------SGST 305
G S+SAA+S S LFGA +++A GS S+FG +S SGS+
Sbjct: 241 GASSSAATSTSPLFGAPSSATGATPSFSVASSAPGSSSSIFGATGSSPSFSVASSASGSS 300
Query: 306 GS--GLFGSSPFGASSSGTLSSASTSNLFASS------LSTSPF-QSTLSSSSSQNLT-- 365
S G GSSPF SSS S+ ST +LFASS S SPF ST +SSS+ N +
Sbjct: 301 PSIFGATGSSPFFGSSS---SAGSTPSLFASSSSGATTSSPSPFGVSTFNSSSTSNTSNA 360
Query: 366 SSSPFVASPSGFSFPTGSLSKTTSITNVSSSSSSSLTLASTSSSSFSFGTPASSSSQSSF 425
S+SPF AS +GFSF + S TTS T S+ + ++SSSSFSFGT A+S
Sbjct: 361 SASPFSAS-TGFSFLKSTASSTTSSTTPSAPPQT-----ASSSSSFSFGTSANS------ 420
Query: 426 GFSINNAASTGGSSAPSTTATKPTSLSLSNSVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPFFSVP 485
GF++ STG S+AP++ S S +V + +T TTTS+STPAA T+ P S P
Sbjct: 421 GFNL----STGSSAAPAS--------STSGAVFSI-ATTTTTSSSTPAA--TSAPASSAP 480
Query: 486 AFSSSSSAATTLSIAASSAPSAASSGAVSSFTGFGVTSSASSSSAIGSLS--LPTKTSTA 545
A + + + S A ++ P ASS A S TGFG+ SS ++ + S + KTST
Sbjct: 481 ASTMAFPSFGVTSSATNTTP--ASSAATFSTTGFGLASSTPATGSTNSFTGFAVPKTSTP 540
Query: 546 ASSSQAPASFGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSALVVASSSSGTTSTVSATVSST 605
ASSSQ + P+ + + ++T+T+ + SS + T + LVV SSS TST A V+ +
Sbjct: 541 ASSSQPQTT--SPAFSFSLPSSTSTTAPATSSATTTQTTLVVPSSSG--TSTAVAPVAGS 600
Query: 606 PKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEIEVAK 665
PKLPSEITGKTVEEIIKEWN ELQERTG+FRKQANAIAEWD+RI+QNRD+LLRLEIEVAK
Sbjct: 601 PKLPSEITGKTVEEIIKEWNTELQERTGRFRKQANAIAEWDKRILQNRDVLLRLEIEVAK 647
Query: 666 VVETQAELEKKLELIETHQQEVDKALVSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAM 670
VVETQ+ LE++LELIETHQQEVDKAL S+EE+AERIY DER LLDDEAASTRDAM
Sbjct: 661 VVETQSSLERQLELIETHQQEVDKALQSMEEEAERIYNDERKSLLDDEAASTRDAM 647
BLAST of Cucsat.G18283 vs. NCBI nr
Match:
XP_031743587.1 (nuclear pore complex protein NUP62 [Cucumis sativus] >KGN46560.2 hypothetical protein Csa_005518 [Cucumis sativus])
HSP 1 Score: 1002 bits (2591), Expect = 0.0
Identity = 662/664 (99.70%), Postives = 662/664 (99.70%), Query Frame = 0
Query: 6 MSGFGFGSSTSQSSSPFSSTTGFSFGSTNFSFGSSPSPLSLSSSSSSSSNPTSSSSPFPN 65
MSGFGFGSSTSQSSSPFSSTTGFSFGSTNFSFGSSPSPLSLSSSSSSSSNPTSSSSPFPN
Sbjct: 1 MSGFGFGSSTSQSSSPFSSTTGFSFGSTNFSFGSSPSPLSLSSSSSSSSNPTSSSSPFPN 60
Query: 66 PTSNPSSSSFGFGSSSFSTSTSSPFSFSLASASTGASSSSAPSSAATSASSLFGVSSSST 125
PTSNPSSSSFGFGSSSFSTSTSSPFSFSLASASTGASSSSAPSSAATSASSLFGVSSSST
Sbjct: 61 PTSNPSSSSFGFGSSSFSTSTSSPFSFSLASASTGASSSSAPSSAATSASSLFGVSSSST 120
Query: 126 GFNSFGFGASSSSANSSASLFGAASSSGTSSTSLFGAGSLPAPSFGAAPSSGSSVAPSFG 185
GFNSFGFGASSSSANSSA LFGAASSSGTSSTSLFGAGSLPAPSFGAAPSSGSSVAPSFG
Sbjct: 121 GFNSFGFGASSSSANSSAPLFGAASSSGTSSTSLFGAGSLPAPSFGAAPSSGSSVAPSFG 180
Query: 186 ALSSSAGTSSAPLFGAAPSAGASSAPSLFGGASSATTSSAPLFGTSASAASSGSGLFGAS 245
ALSSSAGTSSAPLFGAAPSAGASSAPSLFGGASSATTSSAPLFGTSASAASSGSGLFGAS
Sbjct: 181 ALSSSAGTSSAPLFGAAPSAGASSAPSLFGGASSATTSSAPLFGTSASAASSGSGLFGAS 240
Query: 246 AAASGSGVSLFGTPATSSGSTGSGLFGSSPFGASSSGTLSSASTSNLFASSLSTSPFQST 305
AAASGSGVSLFGTPATSSGSTGSGLFGSSPFGASSSGTLSSASTSNLFASSLSTSPFQST
Sbjct: 241 AAASGSGVSLFGTPATSSGSTGSGLFGSSPFGASSSGTLSSASTSNLFASSLSTSPFQST 300
Query: 306 LSSSSSQNLTSSSPFVASPSGFSFPTGSLSKTTSITNVSSSSSSSLTLASTSSSSFSFGT 365
LSSSSSQNLTSSSPFVASPSGFSFPTGSLSKTTSITNVSSSSSSSLTLASTSSSSFSFGT
Sbjct: 301 LSSSSSQNLTSSSPFVASPSGFSFPTGSLSKTTSITNVSSSSSSSLTLASTSSSSFSFGT 360
Query: 366 PASSSSQSSFGFSINNAASTGGSSAPSTTATKPTSLSLSNSVAPLFSTVTTTSASTPAAN 425
PASSSSQSSFGFSINNAASTGGSSAPSTTATKPTSLSLSNSVAPLFSTVTTTSASTPAAN
Sbjct: 361 PASSSSQSSFGFSINNAASTGGSSAPSTTATKPTSLSLSNSVAPLFSTVTTTSASTPAAN 420
Query: 426 STTQPFFSVPAFSSSSSAATTLSIAASSAPSAASSGAVSSFTGFGVTSSASSSSAIGSLS 485
STTQP FSVPAFSSSSSAATTLSIAASSAPSAASSGAVSSFTGFGVTSSASSSSAIGSLS
Sbjct: 421 STTQPSFSVPAFSSSSSAATTLSIAASSAPSAASSGAVSSFTGFGVTSSASSSSAIGSLS 480
Query: 486 LPTKTSTAASSSQAPASFGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSALVVASSSSGTTST 545
LPTKTSTAASSSQAPASFGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSALVVASSSSGTTST
Sbjct: 481 LPTKTSTAASSSQAPASFGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSALVVASSSSGTTST 540
Query: 546 VSATVSSTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILL 605
VSATVSSTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILL
Sbjct: 541 VSATVSSTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILL 600
Query: 606 RLEIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKALVSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAAST 665
RLEIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKALVSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAAST
Sbjct: 601 RLEIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKALVSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAAST 660
Query: 666 RDAM 669
RDAM
Sbjct: 661 RDAM 664
BLAST of Cucsat.G18283 vs. NCBI nr
Match:
XP_008459731.1 (PREDICTED: nuclear pore complex protein NUP62 [Cucumis melo])
HSP 1 Score: 936 bits (2419), Expect = 0.0
Identity = 636/669 (95.07%), Postives = 645/669 (96.41%), Query Frame = 0
Query: 6 MSGFGFGSSTSQSSS--PFSSTTGFSFGSTNFSFGSSPSPLSLSSSSSSSSNPTSSSSPF 65
MSGFGFGSSTSQSSS PFSSTTGFSFGST FSFGSS SPLSLSSSSSSS NPTSSSSPF
Sbjct: 1 MSGFGFGSSTSQSSSSSPFSSTTGFSFGSTTFSFGSSASPLSLSSSSSSS-NPTSSSSPF 60
Query: 66 PNPTSNP--SSSSFGFGSSSFSTSTSSPFSFSLASASTGASSSSAPSSAATSASSLFGVS 125
PNPTSNP SSSSFGFGSSSFS+STSSPFSFSLASASTGASSSS PSS+A SASSLFGVS
Sbjct: 61 PNPTSNPPSSSSSFGFGSSSFSSSTSSPFSFSLASASTGASSSSVPSSSAPSASSLFGVS 120
Query: 126 SSSTGFNSFGFGASSSSANSSASLFGAASSSGTSSTSLFGAGSLPAPSFGAAPSSGSSVA 185
SSSTGFNSFGFGASSSSANSSA LFGAASSSGTSS SLFGAGS PAPSFGAAPSSGSSVA
Sbjct: 121 SSSTGFNSFGFGASSSSANSSAPLFGAASSSGTSSASLFGAGSSPAPSFGAAPSSGSSVA 180
Query: 186 PSFGALSSSAGTSSAPLFGAAPSAGASSAPSLFGGASSATTSSAPLFGTSASAASSGSGL 245
PSFGALSSSAGTSSAPLFGAAPSAGASSAPSLFGGASSATTSSAPLFGT+ASAASSGS L
Sbjct: 181 PSFGALSSSAGTSSAPLFGAAPSAGASSAPSLFGGASSATTSSAPLFGTAASAASSGSAL 240
Query: 246 FGASAAASGSGVSLFGTPATSSGSTGSGLFGSSPFGASSSGTLSSASTSNLFASSLSTSP 305
FGASA ASGSG SLFGT A SSGSTGSGLFGSSPFGASSSGT SS STSNLFASSLS+SP
Sbjct: 241 FGASAPASGSGASLFGTSAPSSGSTGSGLFGSSPFGASSSGTSSSVSTSNLFASSLSSSP 300
Query: 306 FQSTLSSSSSQNLTSSSPFVASPSGFSFPTGSLSKTTSITNV-SSSSSSSLTLASTSSSS 365
FQS+LSSSSSQNLTSSSPF ASPSGFSFPT +LSKTTSITNV SSSSSSSLTLASTSSSS
Sbjct: 301 FQSSLSSSSSQNLTSSSPFAASPSGFSFPTSTLSKTTSITNVPSSSSSSSLTLASTSSSS 360
Query: 366 FSFGTPASSSSQSSFGFSINNAASTGGSSAPSTTATKPTSLSLSNSVAPLFSTVTTTSAS 425
FSFGTPASSSSQSSFGFSINNAASTGGSSAPSTTATKPTSLSLSNSVAPLFSTVTTTSAS
Sbjct: 361 FSFGTPASSSSQSSFGFSINNAASTGGSSAPSTTATKPTSLSLSNSVAPLFSTVTTTSAS 420
Query: 426 TPAANSTTQPFFSVPAFSSSSSAATTLSIAASSAPSAASSGAVSSFTGFGVTSSASSSSA 485
TPAA+STTQP FSVPAFSSSSSAATTLSIAASSAPSAASSG VSSFTGFGVTSSASSSSA
Sbjct: 421 TPAASSTTQPSFSVPAFSSSSSAATTLSIAASSAPSAASSGTVSSFTGFGVTSSASSSSA 480
Query: 486 IGSLSLPTKTSTAASSSQAPASFGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSALVVASSSS 545
IGSLSLPTKTSTAASSSQAPASFGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSALVVASSSS
Sbjct: 481 IGSLSLPTKTSTAASSSQAPASFGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSALVVASSSS 540
Query: 546 GTTSTVSATVSSTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQN 605
GTTSTVSATVSSTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQN
Sbjct: 541 GTTSTVSATVSSTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQN 600
Query: 606 RDILLRLEIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKALVSVEEDAERIYKDERGLLLDD 665
RDILLRLEIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKAL+SVE+DAERIYKDERGLLLDD
Sbjct: 601 RDILLRLEIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKALLSVEDDAERIYKDERGLLLDD 660
Query: 666 EAASTRDAM 669
EAASTRDAM
Sbjct: 661 EAASTRDAM 668
BLAST of Cucsat.G18283 vs. NCBI nr
Match:
XP_038874708.1 (nuclear pore complex protein NUP62 [Benincasa hispida])
HSP 1 Score: 707 bits (1826), Expect = 3.47e-246
Identity = 535/681 (78.56%), Postives = 555/681 (81.50%), Query Frame = 0
Query: 6 MSGFGFGSSTSQ---SSSPFSSTTGFSFGSTN-FSFGSSPSPLSLSSSSSSSSNPTSSSS 65
MSG G GSS+SQ SSSPFSS+TGFSFGST+ FSFGSS +PLSLSSSSSS NPTSSSS
Sbjct: 1 MSGSGSGSSSSQWSSSSSPFSSSTGFSFGSTSAFSFGSSSTPLSLSSSSSS--NPTSSSS 60
Query: 66 PFPNPTSNP-SSSSFGFGSSSFSTSTSSPFSFSLASASTGASSSSAPSSAATSASSLFGV 125
PF N T NP SSSS GFGSSSF +S SSPFSFSL
Sbjct: 61 PFSNQTPNPASSSSSGFGSSSFPSSASSPFSFSLP------------------------- 120
Query: 126 SSSSTGFNSFGFGASSSSANSSASLFGAASSSGTSSTSLFGA----GSLPAPSFGAAPSS 185
LFG+A SSGTSS LFG+ GS PAPSFG A SS
Sbjct: 121 ------------------------LFGSAPSSGTSSAPLFGSASSSGSSPAPSFGPASSS 180
Query: 186 GSSVAPSFGALSSSAGTSSAPLFGAAPSAGASSAPSLFGGASSATTSSAPLFGT-SASAA 245
GSS+ PSFGAL SS G+SSAPLFGA PSAGAS APSLFGG SSATTSSAPLFGT SAS A
Sbjct: 181 GSSLVPSFGALPSS-GSSSAPLFGATPSAGAS-APSLFGGVSSATTSSAPLFGTTSASTA 240
Query: 246 SSGSGLFGASAAASGSGVSLFGTPATSSGSTGSGLFGSSPFGASSSGTLSSASTSNLFAS 305
S GS LFGAS AASGS SLFGT +T+SGS+GS LFGSSPFGASS S STSNLFAS
Sbjct: 241 SPGSALFGASVAASGSSSSLFGT-STTSGSSGSALFGSSPFGASS-----SLSTSNLFAS 300
Query: 306 S---LSTSPFQSTLSSSSSQNLTSSSPFVASPS----GFSFPTGSLSKTTSITNVSSSSS 365
S STSPFQ++ SSSSSQNL SSS F AS S GFSF T SLSKTTSIT SSSSS
Sbjct: 301 SSSSTSTSPFQNSFSSSSSQNLNSSSLFAASSSSSSSGFSFSTVSLSKTTSITTASSSSS 360
Query: 366 SSLTLASTSSSSFSFGTPASSSSQSSFGFSINNAASTGGSSAPSTTATKPTSLSLSNSVA 425
LT ASTSSSSFSFGTPASS+SQSSFGFSI+NAASTGGSSAPSTTATKPTSLSLS+SVA
Sbjct: 361 --LTTASTSSSSFSFGTPASSASQSSFGFSISNAASTGGSSAPSTTATKPTSLSLSSSVA 420
Query: 426 PLFSTVTTTSASTPAANSTTQPFFSVPAFSSSSSAATTLSIAASSAPSAASSGAVSSFTG 485
PLFSTVTTTS STPAANSTTQP FSVPAFSSSSSAATTLSIAASS PSA+SSGAVSSFTG
Sbjct: 421 PLFSTVTTTSGSTPAANSTTQPSFSVPAFSSSSSAATTLSIAASSVPSASSSGAVSSFTG 480
Query: 486 FGVTSSASSSSAIGSLSLPTKTSTAASSSQAPASFGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQ 545
FGVTS ASSSSAIGSLSLPTKTSTAASSSQAPASFGFPSL SA T ATTTSGFSASSQSQ
Sbjct: 481 FGVTSMASSSSAIGSLSLPTKTSTAASSSQAPASFGFPSLTSAPTPATTTSGFSASSQSQ 540
Query: 546 TSSALVVASSSSGTTSTVSATVSSTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQAN 605
TSS LVVASSSSGTTSTV+ATVSSTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQAN
Sbjct: 541 TSSTLVVASSSSGTTSTVNATVSSTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQAN 600
Query: 606 AIAEWDRRIMQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKALVSVEEDAER 665
AIAEWDRRIMQNRDILLRLEIEVAKVVE+QAELEKKLELIETHQQEVDKAL SVEEDAER
Sbjct: 601 AIAEWDRRIMQNRDILLRLEIEVAKVVESQAELEKKLELIETHQQEVDKALQSVEEDAER 620
Query: 666 IYKDERGLLLDDEAASTRDAM 669
IYKDERGLLLDDEAASTRDAM
Sbjct: 661 IYKDERGLLLDDEAASTRDAM 620
BLAST of Cucsat.G18283 vs. NCBI nr
Match:
XP_022959228.1 (nuclear pore complex protein NUP62 isoform X1 [Cucurbita moschata])
HSP 1 Score: 681 bits (1758), Expect = 3.71e-235
Identity = 528/704 (75.00%), Postives = 559/704 (79.40%), Query Frame = 0
Query: 6 MSGFGFGSSTSQ---SSSPFSSTTGFSFGSTN-FSFGSSPSPLSLSSSSSSSSNPTSSSS 65
MSGF FGSS+SQ SSSPFSSTTGFSFGST+ FSFGSSP LS SSSSSSNP+SSSS
Sbjct: 1 MSGFSFGSSSSQASSSSSPFSSTTGFSFGSTSAFSFGSSP----LSLSSSSSSNPSSSSS 60
Query: 66 PFPNPTSNPSSSS-FGFGSSSFSTSTSSPFSFSLASASTGASSSSAPSSAATSASSLFGV 125
F N TSNP SS+ FGF SSSF +S SSPFSFSL +ASTGASS S S SSLF
Sbjct: 61 AFSNQTSNPPSSTPFGFASSSFPSSASSPFSFSLPAASTGASSGS-------SGSSLFAA 120
Query: 126 SSSSTGFNSFGFGASSSSANSSASLFGAA--------------SSSGTSSTSLFGA---- 185
SSSS G +SFGFG SSSS SSA FGAA S+SGTS LFG+
Sbjct: 121 SSSSGGLSSFGFGVSSSSGGSSAPSFGAAPTSGSSPVPSFGAASASGTSFAPLFGSAPSS 180
Query: 186 GSLPAPSFGAAPSSGSSVAPSFGALSSS-------------AGTSSAPLFGAAPSAGASS 245
GS P PSFGAAP SGSSVAP FG+ SS AG+SS+P FGAAPSAG +S
Sbjct: 181 GSSPVPSFGAAPGSGSSVAPLFGSAPSSGSSPLPSFGAAPSAGSSSSPFFGAAPSAG-TS 240
Query: 246 APSLFGGASSA-TTSSAPLFGTSASAASSGSGLFGASAAASGSGVSLFGTPATSSGSTGS 305
APSLFGG SSA TTSSAPLFGTSA AS GS +FGAS AASGS SLF
Sbjct: 241 APSLFGGVSSAATTSSAPLFGTSAPTASPGSSIFGASTAASGSSSSLF------------ 300
Query: 306 GLFGSSPFGASSSGTLSSASTSNLF---ASSLSTSPFQSTLSSSSSQNLTSSSPFVASPS 365
GS+PF +SS S STSNLF +SS ST+PFQ++ SSSSSQNL+SSSPF AS S
Sbjct: 301 ---GSNPFASSS-----SVSTSNLFGSSSSSASTTPFQNSFSSSSSQNLSSSSPFAASSS 360
Query: 366 GFSFPTGSLSKTTSITNVSSSSSSSLTLASTSSSSFSFGTPASSSSQSSFGFSINNAAST 425
GFSF T SLSKTTSIT SSSSS LT ASTSSSSFSFGTPASS+SQSSFGFSI+NAAST
Sbjct: 361 GFSFSTTSLSKTTSITAASSSSS--LTSASTSSSSFSFGTPASSASQSSFGFSISNAAST 420
Query: 426 GGSSAPSTTATKPTSLSLSNSVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPFFSVPAFSSSSSAAT 485
GGSSAP TTA KPTSLS S SVAPLFSTVTTTSASTPAA ST QP FS+PAFS SSSAAT
Sbjct: 421 GGSSAPGTTAAKPTSLSFSTSVAPLFSTVTTTSASTPAATSTAQPSFSMPAFSLSSSAAT 480
Query: 486 TLSIAASSAPSAASSGAVSSFTGFGVTSSASSSSAIGSLSLPTKTSTAASSSQAPASFGF 545
TLSIAASS PS SSGA SSFTGFGVTS+A+SSSAI SLSLPTK+ TAASSSQAPASFGF
Sbjct: 481 TLSIAASSVPSTTSSGAASSFTGFGVTSTAASSSAIVSLSLPTKSLTAASSSQAPASFGF 540
Query: 546 PSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSALVVASSSSGTTSTVSATVSSTPKLPSEITGKTV 605
SLA ASTAATTTSG +ASSQSQTSS LV+ASSSSGTTSTVS TVS+TPKLPSEITGKTV
Sbjct: 541 SSLAPASTAATTTSGSNASSQSQTSSTLVIASSSSGTTSTVSTTVSATPKLPSEITGKTV 600
Query: 606 EEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELEKKL 665
EEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRI+QNRDILLRLEIEVAKVVETQ ELEKKL
Sbjct: 601 EEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRILQNRDILLRLEIEVAKVVETQTELEKKL 660
Query: 666 ELIETHQQEVDKALVSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAM 669
ELIETHQQEVDKAL SVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAM
Sbjct: 661 ELIETHQQEVDKALQSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAM 670
BLAST of Cucsat.G18283 vs. NCBI nr
Match:
XP_023548092.1 (nuclear pore complex protein NUP62 [Cucurbita pepo subsp. pepo])
HSP 1 Score: 681 bits (1757), Expect = 8.40e-235
Identity = 532/718 (74.09%), Postives = 562/718 (78.27%), Query Frame = 0
Query: 6 MSGFGFGSSTSQSSS---PFSSTTGFSFGSTN-FSFGSSPSPLSLSSSSSSSSNPTSSSS 65
MSGF FGSS+SQSSS PFSSTTGFSFGST+ FSFGSSP LS SSSSSSNP+SSSS
Sbjct: 1 MSGFSFGSSSSQSSSSSSPFSSTTGFSFGSTSAFSFGSSP----LSLSSSSSSNPSSSSS 60
Query: 66 PFPNPTSNPSSSS-FGFGSSSFSTSTSSPFSFSLASASTGASSSSAPSSAATSASSLFGV 125
F N TSNP SS+ FGF SS F +S SSPFSFSL +ASTG SS S S SSLF
Sbjct: 61 AFSNQTSNPPSSTPFGFASSPFPSSASSPFSFSLPAASTGVSSGS-------SGSSLFAA 120
Query: 126 SSSSTGFNSFGFGASSSSANSSASLFGAA--------------SSSGTSSTSLFGA---- 185
SSSS G +SFGFG SSSS SSA FGAA S+SGTS LFG+
Sbjct: 121 SSSSGGLSSFGFGVSSSSGGSSAPSFGAAPTSGSSPVPSFGAASASGTSFAPLFGSAPSS 180
Query: 186 GSLPAPSFGAAPSSGSSVAPSFGAL---------------------------SSSAGTSS 245
GS P PSFGAAP+SGSSVAP FG+ +SS+G+SS
Sbjct: 181 GSSPVPSFGAAPASGSSVAPLFGSAPSSGSSPLPSFGAAPSAGSSPLPSFGAASSSGSSS 240
Query: 246 APLFGAAPSAGASSAPSLFGGASSA-TTSSAPLFGTSASAASSGSGLFGASAAASGSGVS 305
+P FGAAPSAGAS APSLFGG SSA TTSSAPLFGTSA AS GS +FGASAAASGS S
Sbjct: 241 SPFFGAAPSAGAS-APSLFGGVSSAATTSSAPLFGTSAPTASPGSSIFGASAAASGSSSS 300
Query: 306 LFGTPATSSGSTGSGLFGSSPFGASSSGTLSSASTSNLF---ASSLSTSPFQSTLSSSSS 365
LF GSSPF +SS S STSNLF +SS STSPFQ++ SSSSS
Sbjct: 301 LF---------------GSSPFASSS-----SVSTSNLFGSSSSSASTSPFQNSFSSSSS 360
Query: 366 QNLTSSSPFVASPSGFSFPTGSLSKTTSITNVSSSSSSSLTLASTSSSSFSFGTPASSSS 425
QNL+SSSPF AS SGFSF T SLSKTTSIT SSSSS LT ASTSSSSFSFGTPASS+S
Sbjct: 361 QNLSSSSPFAASSSGFSFSTTSLSKTTSITAASSSSS--LTSASTSSSSFSFGTPASSAS 420
Query: 426 QSSFGFSINNAASTGGSSAPSTTATKPTSLSLSNSVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPF 485
QSSFGFSI+NAASTGGSSAP TTA KPTSLS S SVAPLFSTVTTTSASTPAA ST QP
Sbjct: 421 QSSFGFSISNAASTGGSSAPGTTAAKPTSLSFSTSVAPLFSTVTTTSASTPAATSTAQPS 480
Query: 486 FSVPAFSSSSSAATTLSIAASSAPSAASSGAVSSFTGFGVTSSASSSSAIGSLSLPTKTS 545
FS+PAFS SSSAATTLSIAASSAPS SSGA SSFTGFGVTS+A+SSSAI SLSLPTK+
Sbjct: 481 FSMPAFSLSSSAATTLSIAASSAPSTTSSGAASSFTGFGVTSTAASSSAIVSLSLPTKSL 540
Query: 546 TAASSSQAPASFGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSALVVASSSSGTTSTVSATVS 605
TAASSSQAPASFGF SLASAS AATTTSG +ASSQSQTSS LVVASSSSGTTSTVSATVS
Sbjct: 541 TAASSSQAPASFGFSSLASASAAATTTSGSNASSQSQTSSTLVVASSSSGTTSTVSATVS 600
Query: 606 STPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEIEV 665
+TPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRI+QNRDILLRLEIEV
Sbjct: 601 ATPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRILQNRDILLRLEIEV 660
Query: 666 AKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKALVSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAM 669
AKVVETQ ELEKKLELIETHQQEVDKAL SVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAM
Sbjct: 661 AKVVETQTELEKKLELIETHQQEVDKALQSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAM 684
BLAST of Cucsat.G18283 vs. ExPASy TrEMBL
Match:
A0A1S3CAD4 (nuclear pore complex protein NUP62 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103498773 PE=3 SV=1)
HSP 1 Score: 936 bits (2419), Expect = 0.0
Identity = 636/669 (95.07%), Postives = 645/669 (96.41%), Query Frame = 0
Query: 6 MSGFGFGSSTSQSSS--PFSSTTGFSFGSTNFSFGSSPSPLSLSSSSSSSSNPTSSSSPF 65
MSGFGFGSSTSQSSS PFSSTTGFSFGST FSFGSS SPLSLSSSSSSS NPTSSSSPF
Sbjct: 1 MSGFGFGSSTSQSSSSSPFSSTTGFSFGSTTFSFGSSASPLSLSSSSSSS-NPTSSSSPF 60
Query: 66 PNPTSNP--SSSSFGFGSSSFSTSTSSPFSFSLASASTGASSSSAPSSAATSASSLFGVS 125
PNPTSNP SSSSFGFGSSSFS+STSSPFSFSLASASTGASSSS PSS+A SASSLFGVS
Sbjct: 61 PNPTSNPPSSSSSFGFGSSSFSSSTSSPFSFSLASASTGASSSSVPSSSAPSASSLFGVS 120
Query: 126 SSSTGFNSFGFGASSSSANSSASLFGAASSSGTSSTSLFGAGSLPAPSFGAAPSSGSSVA 185
SSSTGFNSFGFGASSSSANSSA LFGAASSSGTSS SLFGAGS PAPSFGAAPSSGSSVA
Sbjct: 121 SSSTGFNSFGFGASSSSANSSAPLFGAASSSGTSSASLFGAGSSPAPSFGAAPSSGSSVA 180
Query: 186 PSFGALSSSAGTSSAPLFGAAPSAGASSAPSLFGGASSATTSSAPLFGTSASAASSGSGL 245
PSFGALSSSAGTSSAPLFGAAPSAGASSAPSLFGGASSATTSSAPLFGT+ASAASSGS L
Sbjct: 181 PSFGALSSSAGTSSAPLFGAAPSAGASSAPSLFGGASSATTSSAPLFGTAASAASSGSAL 240
Query: 246 FGASAAASGSGVSLFGTPATSSGSTGSGLFGSSPFGASSSGTLSSASTSNLFASSLSTSP 305
FGASA ASGSG SLFGT A SSGSTGSGLFGSSPFGASSSGT SS STSNLFASSLS+SP
Sbjct: 241 FGASAPASGSGASLFGTSAPSSGSTGSGLFGSSPFGASSSGTSSSVSTSNLFASSLSSSP 300
Query: 306 FQSTLSSSSSQNLTSSSPFVASPSGFSFPTGSLSKTTSITNV-SSSSSSSLTLASTSSSS 365
FQS+LSSSSSQNLTSSSPF ASPSGFSFPT +LSKTTSITNV SSSSSSSLTLASTSSSS
Sbjct: 301 FQSSLSSSSSQNLTSSSPFAASPSGFSFPTSTLSKTTSITNVPSSSSSSSLTLASTSSSS 360
Query: 366 FSFGTPASSSSQSSFGFSINNAASTGGSSAPSTTATKPTSLSLSNSVAPLFSTVTTTSAS 425
FSFGTPASSSSQSSFGFSINNAASTGGSSAPSTTATKPTSLSLSNSVAPLFSTVTTTSAS
Sbjct: 361 FSFGTPASSSSQSSFGFSINNAASTGGSSAPSTTATKPTSLSLSNSVAPLFSTVTTTSAS 420
Query: 426 TPAANSTTQPFFSVPAFSSSSSAATTLSIAASSAPSAASSGAVSSFTGFGVTSSASSSSA 485
TPAA+STTQP FSVPAFSSSSSAATTLSIAASSAPSAASSG VSSFTGFGVTSSASSSSA
Sbjct: 421 TPAASSTTQPSFSVPAFSSSSSAATTLSIAASSAPSAASSGTVSSFTGFGVTSSASSSSA 480
Query: 486 IGSLSLPTKTSTAASSSQAPASFGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSALVVASSSS 545
IGSLSLPTKTSTAASSSQAPASFGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSALVVASSSS
Sbjct: 481 IGSLSLPTKTSTAASSSQAPASFGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSALVVASSSS 540
Query: 546 GTTSTVSATVSSTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQN 605
GTTSTVSATVSSTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQN
Sbjct: 541 GTTSTVSATVSSTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQN 600
Query: 606 RDILLRLEIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKALVSVEEDAERIYKDERGLLLDD 665
RDILLRLEIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKAL+SVE+DAERIYKDERGLLLDD
Sbjct: 601 RDILLRLEIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKALLSVEDDAERIYKDERGLLLDD 660
Query: 666 EAASTRDAM 669
EAASTRDAM
Sbjct: 661 EAASTRDAM 668
BLAST of Cucsat.G18283 vs. ExPASy TrEMBL
Match:
A0A0A0KA27 (Nsp1_C domain-containing protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_6G108530 PE=3 SV=1)
HSP 1 Score: 899 bits (2324), Expect = 0.0
Identity = 645/824 (78.28%), Postives = 645/824 (78.28%), Query Frame = 0
Query: 6 MSGFGFGSSTSQSSSPFSSTTGFSFGSTNFSFGSSPSPLSLSSSSSSSSNPTSSSSPFPN 65
MSGFGFGSSTSQSSSPFSSTTGFSFGSTNFSFGSSPSPLSLSSSSSSSSNPTSSSSPFPN
Sbjct: 1 MSGFGFGSSTSQSSSPFSSTTGFSFGSTNFSFGSSPSPLSLSSSSSSSSNPTSSSSPFPN 60
Query: 66 PTSNPSSSSFGFGSSSFSTSTSSPFSFSLASASTGASSSSAPSSAATSASSLFGVSSSST 125
PTSNPSSSSFGFGSSSFSTSTSSPFSFSLASASTGASSSSAPSSAATSASSLFGVSSSST
Sbjct: 61 PTSNPSSSSFGFGSSSFSTSTSSPFSFSLASASTGASSSSAPSSAATSASSLFGVSSSST 120
Query: 126 GFNSFGFGASSSSANSSASLFGAASSSGTSSTSLFGAGSLPAPSFGAAPSSGSSVAPSFG 185
GFNSFGFGASSSSANSSA LFGAASSSGTSSTSLFGAGSLPAPSFGAAPSSGSSVAPSFG
Sbjct: 121 GFNSFGFGASSSSANSSAPLFGAASSSGTSSTSLFGAGSLPAPSFGAAPSSGSSVAPSFG 180
Query: 186 ALSSSAGTSSAPLFGAAPSAGASSAPSLFGGASSATTSSAPLFGTSASAASSGSGLFGAS 245
ALSSSAGTSSAPLFGAAPSAGASSAPSLFGGASSATTSSAPLFGTSASAASSGSGLFGAS
Sbjct: 181 ALSSSAGTSSAPLFGAAPSAGASSAPSLFGGASSATTSSAPLFGTSASAASSGSGLFGAS 240
Query: 246 AAASGSGVSLFGTPATSSGSTGSGLFGSSPFGASSSGTLSSASTSNLFASSLSTSPFQST 305
AAASGSGVSLFGTPATSSGSTGSGLFGSSPFGASSSGTLSSASTSNLFASSLSTSPFQST
Sbjct: 241 AAASGSGVSLFGTPATSSGSTGSGLFGSSPFGASSSGTLSSASTSNLFASSLSTSPFQST 300
Query: 306 LSSSSSQNLTSSSPFVASPSGFSFPTGSLSKTTSITNVSSSSSSS--------------- 365
LSSSSSQNLTSSSPFVASPSGFSFPTGSLSKTTSITNVSSSSSSS
Sbjct: 301 LSSSSSQNLTSSSPFVASPSGFSFPTGSLSKTTSITNVSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSS 360
Query: 366 ------------------------------------------------------------ 425
Sbjct: 361 SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSS 420
Query: 426 ------------------------------------------------------------ 485
Sbjct: 421 SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSS 480
Query: 486 -------------------------LTLASTSSSSFSFGTPASSSSQSSFGFSINNAAST 545
LTLASTSSSSFSFGTPASSSSQSSFGFSINNAAST
Sbjct: 481 SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSLTLASTSSSSFSFGTPASSSSQSSFGFSINNAAST 540
Query: 546 GGSSAPSTTATKPTSLSLSNSVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPFFSVPAFSSSSSAAT 605
GGSSAPSTTATKPTSLS ASTPAANSTTQP FSVPAFSSSSSAAT
Sbjct: 541 GGSSAPSTTATKPTSLS----------------ASTPAANSTTQPSFSVPAFSSSSSAAT 600
Query: 606 TLSIAASSAPSAASSGAVSSFTGFGVTSSASSSSAIGSLSLPTKTSTAASSSQAPASFGF 665
TLSIAASSAPSAASSGAVSSFTGFGVTSSASSSSAIGSLSLPTKTSTAASSSQAPASFGF
Sbjct: 601 TLSIAASSAPSAASSGAVSSFTGFGVTSSASSSSAIGSLSLPTKTSTAASSSQAPASFGF 660
Query: 666 PSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSALVVASSSSGTTSTVSATVSSTPKLPSEITGKTV 669
PSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSALVVASSSSGTTSTVSATVSSTPKLPSEITGKTV
Sbjct: 661 PSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSALVVASSSSGTTSTVSATVSSTPKLPSEITGKTV 720
BLAST of Cucsat.G18283 vs. ExPASy TrEMBL
Match:
A0A6J1H5C8 (nuclear pore complex protein NUP62 isoform X1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111460276 PE=3 SV=1)
HSP 1 Score: 681 bits (1758), Expect = 1.80e-235
Identity = 528/704 (75.00%), Postives = 559/704 (79.40%), Query Frame = 0
Query: 6 MSGFGFGSSTSQ---SSSPFSSTTGFSFGSTN-FSFGSSPSPLSLSSSSSSSSNPTSSSS 65
MSGF FGSS+SQ SSSPFSSTTGFSFGST+ FSFGSSP LS SSSSSSNP+SSSS
Sbjct: 1 MSGFSFGSSSSQASSSSSPFSSTTGFSFGSTSAFSFGSSP----LSLSSSSSSNPSSSSS 60
Query: 66 PFPNPTSNPSSSS-FGFGSSSFSTSTSSPFSFSLASASTGASSSSAPSSAATSASSLFGV 125
F N TSNP SS+ FGF SSSF +S SSPFSFSL +ASTGASS S S SSLF
Sbjct: 61 AFSNQTSNPPSSTPFGFASSSFPSSASSPFSFSLPAASTGASSGS-------SGSSLFAA 120
Query: 126 SSSSTGFNSFGFGASSSSANSSASLFGAA--------------SSSGTSSTSLFGA---- 185
SSSS G +SFGFG SSSS SSA FGAA S+SGTS LFG+
Sbjct: 121 SSSSGGLSSFGFGVSSSSGGSSAPSFGAAPTSGSSPVPSFGAASASGTSFAPLFGSAPSS 180
Query: 186 GSLPAPSFGAAPSSGSSVAPSFGALSSS-------------AGTSSAPLFGAAPSAGASS 245
GS P PSFGAAP SGSSVAP FG+ SS AG+SS+P FGAAPSAG +S
Sbjct: 181 GSSPVPSFGAAPGSGSSVAPLFGSAPSSGSSPLPSFGAAPSAGSSSSPFFGAAPSAG-TS 240
Query: 246 APSLFGGASSA-TTSSAPLFGTSASAASSGSGLFGASAAASGSGVSLFGTPATSSGSTGS 305
APSLFGG SSA TTSSAPLFGTSA AS GS +FGAS AASGS SLF
Sbjct: 241 APSLFGGVSSAATTSSAPLFGTSAPTASPGSSIFGASTAASGSSSSLF------------ 300
Query: 306 GLFGSSPFGASSSGTLSSASTSNLF---ASSLSTSPFQSTLSSSSSQNLTSSSPFVASPS 365
GS+PF +SS S STSNLF +SS ST+PFQ++ SSSSSQNL+SSSPF AS S
Sbjct: 301 ---GSNPFASSS-----SVSTSNLFGSSSSSASTTPFQNSFSSSSSQNLSSSSPFAASSS 360
Query: 366 GFSFPTGSLSKTTSITNVSSSSSSSLTLASTSSSSFSFGTPASSSSQSSFGFSINNAAST 425
GFSF T SLSKTTSIT SSSSS LT ASTSSSSFSFGTPASS+SQSSFGFSI+NAAST
Sbjct: 361 GFSFSTTSLSKTTSITAASSSSS--LTSASTSSSSFSFGTPASSASQSSFGFSISNAAST 420
Query: 426 GGSSAPSTTATKPTSLSLSNSVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPFFSVPAFSSSSSAAT 485
GGSSAP TTA KPTSLS S SVAPLFSTVTTTSASTPAA ST QP FS+PAFS SSSAAT
Sbjct: 421 GGSSAPGTTAAKPTSLSFSTSVAPLFSTVTTTSASTPAATSTAQPSFSMPAFSLSSSAAT 480
Query: 486 TLSIAASSAPSAASSGAVSSFTGFGVTSSASSSSAIGSLSLPTKTSTAASSSQAPASFGF 545
TLSIAASS PS SSGA SSFTGFGVTS+A+SSSAI SLSLPTK+ TAASSSQAPASFGF
Sbjct: 481 TLSIAASSVPSTTSSGAASSFTGFGVTSTAASSSAIVSLSLPTKSLTAASSSQAPASFGF 540
Query: 546 PSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSALVVASSSSGTTSTVSATVSSTPKLPSEITGKTV 605
SLA ASTAATTTSG +ASSQSQTSS LV+ASSSSGTTSTVS TVS+TPKLPSEITGKTV
Sbjct: 541 SSLAPASTAATTTSGSNASSQSQTSSTLVIASSSSGTTSTVSTTVSATPKLPSEITGKTV 600
Query: 606 EEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELEKKL 665
EEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRI+QNRDILLRLEIEVAKVVETQ ELEKKL
Sbjct: 601 EEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRILQNRDILLRLEIEVAKVVETQTELEKKL 660
Query: 666 ELIETHQQEVDKALVSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAM 669
ELIETHQQEVDKAL SVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAM
Sbjct: 661 ELIETHQQEVDKALQSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAM 670
BLAST of Cucsat.G18283 vs. ExPASy TrEMBL
Match:
A0A6J1L2D4 (nuclear pore complex protein NUP62 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111499220 PE=3 SV=1)
HSP 1 Score: 681 bits (1757), Expect = 4.81e-235
Identity = 529/718 (73.68%), Postives = 565/718 (78.69%), Query Frame = 0
Query: 6 MSGFGFGSSTSQSSS---PFSSTTGFSFGSTN-FSFGSSPSPLSLSSSSSSSSNPTSSSS 65
MSGF FGSS+SQSSS PFSSTTGFSFGST+ FSFGSSP LS SSSSSSNP+SSSS
Sbjct: 1 MSGFSFGSSSSQSSSSSSPFSSTTGFSFGSTSAFSFGSSP----LSLSSSSSSNPSSSSS 60
Query: 66 PFPNPTSNPSSSS-FGFGSSSFSTSTSSPFSFSLASASTGASSSSAPSSAATSASSLFGV 125
F N TSNP SS+ FGF SSSF +S SSPFSFSL +ASTGASS S S+LF
Sbjct: 61 AFSNQTSNPPSSTPFGFASSSFPSSASSPFSFSLPAASTGASS-------GISGSALFAA 120
Query: 126 SSSSTGFNSFGFGASSSSANSSASLFGAA--------------SSSGTSSTSLFGA---- 185
SSSS G +SFGFG SSSS SSA FGAA S+SGTS LFG+
Sbjct: 121 SSSSGGLSSFGFGVSSSSGGSSAPSFGAAPTSGSSPVPSFGAASASGTSFAPLFGSAPSS 180
Query: 186 GSLPAPSFGAAPSSGSSVAPSFGAL---------------------------SSSAGTSS 245
GS P PSFGAAP+SGSSVAP FG+ +SS+G+SS
Sbjct: 181 GSSPVPSFGAAPASGSSVAPLFGSAPSSGSSPLPSFGASPSAGSSPLPSFGAASSSGSSS 240
Query: 246 APLFGAAPSAGASSAPSLFGGASSA-TTSSAPLFGTSASAASSGSGLFGASAAASGSGVS 305
+P FGAAPS G +SAPSLFGG SSA TTSSAPLFGTSA AS GS +FGASAAASGS S
Sbjct: 241 SPFFGAAPSVG-TSAPSLFGGVSSAATTSSAPLFGTSAPTASPGSSIFGASAAASGSSSS 300
Query: 306 LFGTPATSSGSTGSGLFGSSPFGASSSGTLSSASTSNLF---ASSLSTSPFQSTLSSSSS 365
LF GS+ F +SSSGTLSS STSNLF +SS ST+PFQ++ SSSSS
Sbjct: 301 LF---------------GSNSFASSSSGTLSSVSTSNLFGSSSSSASTTPFQNSFSSSSS 360
Query: 366 QNLTSSSPFVASPSGFSFPTGSLSKTTSITNVSSSSSSSLTLASTSSSSFSFGTPASSSS 425
QNL+SSSPF AS SGFSF T SLSKTTSIT SSSSS LT ASTSSSSFSFGTPASS+S
Sbjct: 361 QNLSSSSPFAASSSGFSFSTTSLSKTTSITVASSSSS--LTSASTSSSSFSFGTPASSAS 420
Query: 426 QSSFGFSINNAASTGGSSAPSTTATKPTSLSLSNSVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPF 485
QSSFGF+I+NAAS GSSAP TTA KPTSLS S SVAPLFSTVTTTSASTPAA ST QP
Sbjct: 421 QSSFGFNISNAASLEGSSAPGTTAAKPTSLSFSTSVAPLFSTVTTTSASTPAATSTAQPS 480
Query: 486 FSVPAFSSSSSAATTLSIAASSAPSAASSGAVSSFTGFGVTSSASSSSAIGSLSLPTKTS 545
FS+PAFS SSSAATTLSIAASSAPSA SSGA SSFTGFG+TS+A+SSSAI SLSLPTK+
Sbjct: 481 FSMPAFSLSSSAATTLSIAASSAPSATSSGAASSFTGFGITSTAASSSAIVSLSLPTKSL 540
Query: 546 TAASSSQAPASFGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSALVVASSSSGTTSTVSATVS 605
TAASSSQAPASFGF SLASAS AATTTSG +ASSQSQTSS LVVASSSSGTTSTVSATVS
Sbjct: 541 TAASSSQAPASFGFSSLASASAAATTTSGSNASSQSQTSSTLVVASSSSGTTSTVSATVS 600
Query: 606 STPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEIEV 665
+TPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRI+QNRDILLRLEIEV
Sbjct: 601 ATPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRILQNRDILLRLEIEV 660
Query: 666 AKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKALVSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAM 669
AKVVETQ ELEKKLELIETHQQEVDKAL SVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAM
Sbjct: 661 AKVVETQTELEKKLELIETHQQEVDKALQSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAM 689
BLAST of Cucsat.G18283 vs. ExPASy TrEMBL
Match:
A0A6J1H7F5 (nuclear pore complex protein NUP62 isoform X2 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111460276 PE=3 SV=1)
HSP 1 Score: 624 bits (1610), Expect = 1.01e-214
Identity = 495/670 (73.88%), Postives = 526/670 (78.51%), Query Frame = 0
Query: 6 MSGFGFGSSTSQ---SSSPFSSTTGFSFGSTN-FSFGSSPSPLSLSSSSSSSSNPTSSSS 65
MSGF FGSS+SQ SSSPFSSTTGFSFGST+ FSFGSSP LS SSSSSSNP+SSSS
Sbjct: 1 MSGFSFGSSSSQASSSSSPFSSTTGFSFGSTSAFSFGSSP----LSLSSSSSSNPSSSSS 60
Query: 66 PFPNPTSNPSSSS-FGFGSSSFSTSTSSPFSFSLASASTGASSSSAPSSAATSASSLFGV 125
F N TSNP SS+ FGF SSSF +S SSPFSFSL +ASTGASS S S SSLF
Sbjct: 61 AFSNQTSNPPSSTPFGFASSSFPSSASSPFSFSLPAASTGASSGS-------SGSSLFAA 120
Query: 126 SSSSTGFNSFGFGASSSSANSSASLFGAA--------------SSSGTSSTSLFGA---- 185
SSSS G +SFGFG SSSS SSA FGAA S+SGTS LFG+
Sbjct: 121 SSSSGGLSSFGFGVSSSSGGSSAPSFGAAPTSGSSPVPSFGAASASGTSFAPLFGSAPSS 180
Query: 186 GSLPAPSFGAAPSSGSSVAPSFGALSSS-------------AGTSSAPLFGAAPSAGASS 245
GS P PSFGAAP SGSSVAP FG+ SS AG+SS+P FGAAPSAG +S
Sbjct: 181 GSSPVPSFGAAPGSGSSVAPLFGSAPSSGSSPLPSFGAAPSAGSSSSPFFGAAPSAG-TS 240
Query: 246 APSLFGGASSA-TTSSAPLFGTSASAASSGSGLFGASAAASGSGVSLFGTPATSSGSTGS 305
APSLFGG SSA TTSSAPLFGTSA AS GS +FGAS AASGS SLF
Sbjct: 241 APSLFGGVSSAATTSSAPLFGTSAPTASPGSSIFGASTAASGSSSSLF------------ 300
Query: 306 GLFGSSPFGASSSGTLSSASTSNLF---ASSLSTSPFQSTLSSSSSQNLTSSSPFVASPS 365
GS+PF +SS S STSNLF +SS ST+PFQ++ SSSSSQNL+SSSPF AS S
Sbjct: 301 ---GSNPFASSS-----SVSTSNLFGSSSSSASTTPFQNSFSSSSSQNLSSSSPFAASSS 360
Query: 366 GFSFPTGSLSKTTSITNVSSSSSSSLTLASTSSSSFSFGTPASSSSQSSFGFSINNAAST 425
GFSF T SLSKTTSIT SSSSS LT ASTSSSSFSFGTPASS+SQSSFGFSI+NAAST
Sbjct: 361 GFSFSTTSLSKTTSITAASSSSS--LTSASTSSSSFSFGTPASSASQSSFGFSISNAAST 420
Query: 426 GGSSAPSTTATKPTSLSLSNSVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPFFSVPAFSSSSSAAT 485
GGSSAP TTA KPTSLS S SVAPLFSTVTTTSASTPAA ST QP FS+PAFS SSSAAT
Sbjct: 421 GGSSAPGTTAAKPTSLSFSTSVAPLFSTVTTTSASTPAATSTAQPSFSMPAFSLSSSAAT 480
Query: 486 TLSIAASSAPSAASSGAVSSFTGFGVTSSASSSSAIGSLSLPTKTSTAASSSQAPASFGF 545
TLSIAASS PS SSGA SSFTGFGVTS+A+SSSAI SLSLPTK+ TAASSSQAPASFGF
Sbjct: 481 TLSIAASSVPSTTSSGAASSFTGFGVTSTAASSSAIVSLSLPTKSLTAASSSQAPASFGF 540
Query: 546 PSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSALVVASSSSGTTSTVSATVSSTPKLPSEITGKTV 605
SLA ASTAATTTSG +ASSQSQTSS LV+ASSSSGTTSTVS TVS+TPKLPSEITGKTV
Sbjct: 541 SSLAPASTAATTTSGSNASSQSQTSSTLVIASSSSGTTSTVSTTVSATPKLPSEITGKTV 600
Query: 606 EEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELEKKL 635
EEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRI+QNRDILLRLEIEVAKVVETQ ELEKKL
Sbjct: 601 EEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRILQNRDILLRLEIEVAKVVETQTELEKKL 636
The following BLAST results are available for this feature:
Match Name | E-value | Identity | Description | |
Q8L7F7 | 4.6e-70 | 48.46 | Nuclear pore complex protein NUP62 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=NUP62 PE=1... | [more] |
Match Name | E-value | Identity | Description | |
XP_031743587.1 | 0.0 | 99.70 | nuclear pore complex protein NUP62 [Cucumis sativus] >KGN46560.2 hypothetical pr... | [more] |
XP_008459731.1 | 0.0 | 95.07 | PREDICTED: nuclear pore complex protein NUP62 [Cucumis melo] | [more] |
XP_038874708.1 | 3.47e-246 | 78.56 | nuclear pore complex protein NUP62 [Benincasa hispida] | [more] |
XP_022959228.1 | 3.71e-235 | 75.00 | nuclear pore complex protein NUP62 isoform X1 [Cucurbita moschata] | [more] |
XP_023548092.1 | 8.40e-235 | 74.09 | nuclear pore complex protein NUP62 [Cucurbita pepo subsp. pepo] | [more] |
Match Name | E-value | Identity | Description | |
A0A1S3CAD4 | 0.0 | 95.07 | nuclear pore complex protein NUP62 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103498773 PE=3 ... | [more] |
A0A0A0KA27 | 0.0 | 78.28 | Nsp1_C domain-containing protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_6G108530 PE=3... | [more] |
A0A6J1H5C8 | 1.80e-235 | 75.00 | nuclear pore complex protein NUP62 isoform X1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=L... | [more] |
A0A6J1L2D4 | 4.81e-235 | 73.68 | nuclear pore complex protein NUP62 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111499220 P... | [more] |
A0A6J1H7F5 | 1.01e-214 | 73.88 | nuclear pore complex protein NUP62 isoform X2 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=L... | [more] |