Csor.00g134910 (gene) Silver-seed gourd (wild; sororia) v1

Overview
NameCsor.00g134910
Typegene
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. sororia (Silver-seed gourd (wild; sororia) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationCsor_Chr03: 2084876 .. 2087959 (-)
RNA-Seq ExpressionCsor.00g134910
SyntenyCsor.00g134910
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideCDSinitialstart_codonintroninternalterminalstop_codon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGAATGCAACAACCTACGCTTTTTTCACTATCTTAGGTAAACCTAGAAAAAATTCCATGACATAACCTTTGAATCCATTGAACCTTTATGGGGAGGTTTGAACATATCCTTTAACCGCTCTCCACCTGACCTATCAACTTGATGAACTTAACTAATCTGGGATTCACTCACGGTGCATCAGCAATTTAGTGTAAAATCCAAATTAAGGACGAGACAAACAATCTCATGTTCCTTTGATAAATATGAGGTGGGATGCTAACCTTTTGATATTACCTTAAAACTTTACTAACCTTCATATCTCATTAAACACATCTTTATACTAAAGCTGACGCCAACCGGTTCCTAAACTTCATAAAACTACTCTCACATTCTCATTGTAACTATGAGTTATGCTTGTGTGAATTGACTAAGTCAAACTCGAAACATTTGAAAAAACCTTTGAACTTACAGCTTTAGGTCTCTAAACAACGGTAGACCAATTACAAAATATTATTTTTTAACATTTAAACTCAAAGATTTCCCCTCTTAACGTCCATATTGAAACTCAGAGGAAAAAGATTAAATATTAAATATTAAATAAATATATCAATTATTTAAAAAAATTTAAATGACTTATCAGATATAAAGAAATGACTTATTAGATATAAAATTAAAAAATTTAAATTTTTTAAATTTAATTTTTTTTTGTCTTGTAAATAGGTAAATTTTTAAAGATAAAGTAAAAATTAAATTGACCAACTCTCAAGGTAACTTTTAATTTTATTAACTTACCGTAATAAATTCTGTGACAAAAAATTGTTACTTCCCTTCTTTAGTAATTAATGATTAGGAAAAAAATAAAAAAGGAAGTTCAGAAACGGACGCTATCTGTAAGTCAAAACCCTATCGCAATTGCAAAATCGGTTATTTATTTATTAAATTAATAAAAATACTCTTAAATTTTGTCAAAACTGTACCAGATATGTTGACTGTCAGACTACGCAGTCAACATTCATTCACACTCATCTACTGCCAAAGTCTACCGCAAGCAGATACTATCCTCCGCCATCAATACTAATCCATATTCCATTGGTTAGGGAGAGATTTCCACACTCATCCACTCCTTTGAGACTTAAAATACATTTGTTAGGGAGAAGTTTCCACACTATTATAAAAAATGTTTCTGCCTTCAATTGACGTGAGACCTCACAATCCAGACTCTTGGGTGCCACCGTACATGATCGTACATGGCTCGGTGTCTAGTTATGACTATAAGTTTGAATTTTGTAAAAAAATTTAAGGGTAATAAAAATTTAAAACTTTAAAGAGGTATTATTATTTTTTTTTTTTGAAAGTTTATGTTACTATTAAATTTTTTAATAGGTTTTTTTTTTTATAATATATATTTGAATTAAAAAAAAAAGTATTTTTAGTAATTTAATCTTTATAATTTGTTGGAAGGACGTTCTGTTCAGTGCAATCGACGTTTTCCCTTCTGCTTCATCCTTACTCAAAGCCCACAAAACAGGAGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGAAAAGAAGTACGAACGTCGCTAATCGCCTCCAACCCTTTGCGCCAGATTTGGTGGGGGGCGATCCAGCGGATTCTAAAAGGCTTGCATTTTGTCGACTTAATTCCTTCAAATCGAAACAGTCGCACCCATTGAATCTTTCGCTGTAAGTCTCTTCGGATCTGATCCAACCCCATTAGTCTGTTTTTGTTAATTTCTCTTCGCTTGTGAATTTTTAAGTCGTACGTGATGAGGTTTCTTAAAGTTTTGAGTTGGGTGTAGATCTGTGATGCTTAGTTCTTCATATTTTGTTATGGGTATTGCTGGATCGAAGGCTTTATTTAGTTTTTACCTCTAAATTTTGTTAATCTTGATGAAGATAATGCCTCGGTTGAGTTTTGCTAGTCGCCGTGCAATCCGAGATCAGTCAACCATATGGATTAGTTGTGCTTAGATAGGAAAATTAGGATTGAGTGAGTTTTTGAAAGTGTTTTTGAGAGCTCTGTTTATATTTCTGTGGAAGACTTGTAGTAGAATGATAATTTGTTCTTCAGATCTGCTGCCGGTCGTCCTCTTCTGAGCTGAGCCCCAATTTCATGCCCCAGCTCACGAATCTGGGGCATTTCTTCTTCAAATCCCATAGTTCTTTCCTTGTTCTTTTGGACATTCTTCTTCAGACGCCAAATTTCTTAAGTCATGTCTCAGAGGCAAGAGCTTACTCCCTCCTATATCTATCAGTCACGTTTCAAAGCTTCCCCAATCTCTATTTCTAGCTTGTGCTCTGTTTTTTGTTTGATTTTTTTTTTTTTTCACTTGTACCAAAACTCGCTTGGATATGCGTAAGGCCTTTGTAATATCATTGATTCGTAACGTTTGAAATACAAAAAACAGTAGGGAATGAGAGTAATAGATATTATGTAAGATATTATTCACTCAATTGAAACTAAAAATCAAAGAAAAAAGAGGGTGTATTTGCTTTCTTTGCTGATCAATAATTAGTTCATGTTTGAGGCTGGCCTCTAAGTCGGGTCGTTAGTTTGATCGTCATAAAGAGAAACATTGGTAAAACCATACTTGAGTTCTTTGAGTTATATTTGTGTGCATTTAGATTTTTATGTGCTGTAATCCAGTTTATGCATAGTATTGTCACTATCATTTTGTTTTATTATCTCTTATTTTGATATAAGGTGGAAGATGTTTATGATTATATTACTTGAAACAAACAGGTTTTGTATGATTGTTGGAGTTCTAACTTGTACGAGATATTTGTTTATAGTTTTAAATTTGTGAAAATTGAAGTGAATGAGGGTCAACCCTCAAAGTAATATCTTGCTAGTTTTTTTGTGTATTGGAAACAAAGCCAACGACCCAACCGAACCTGCAAATATAGATTGTTTGGGCTAGGTTATAAAAAAAATCAATCAAACCTAATCTAACCCACGAACATCCTTTTAAGTGTATGGTTCAAGAACTCACCGGTGTTGGGGAGAGATTTCATCCGTTGCTTTCTTAGGATCTCTCATATATGTGCGTAAGTTCATAATTTCAGGTTATTGACAAAGATTTAG

mRNA sequence

ATGAATGCAACAACCTACGCTTTTTTCACTATCTTAGACTACGCAGTCAACATTCATTCACACTCATCTACTGCCAAAGTCTACCGCAAGCAGATACTATCCTCCGCCATCAATACTAATCCATATTCCATTGATTTGGTGGGGGGCGATCCAGCGGATTCTAAAAGGCTTGCATTTTGTCGACTTAATTCCTTCAAATCGAAACAGTCGCACCCATTGAATCTTTCGCTGTTATTGACAAAGATTTAG

Coding sequence (CDS)

ATGAATGCAACAACCTACGCTTTTTTCACTATCTTAGACTACGCAGTCAACATTCATTCACACTCATCTACTGCCAAAGTCTACCGCAAGCAGATACTATCCTCCGCCATCAATACTAATCCATATTCCATTGATTTGGTGGGGGGCGATCCAGCGGATTCTAAAAGGCTTGCATTTTGTCGACTTAATTCCTTCAAATCGAAACAGTCGCACCCATTGAATCTTTCGCTGTTATTGACAAAGATTTAG

Protein sequence

MNATTYAFFTILDYAVNIHSHSSTAKVYRKQILSSAINTNPYSIDLVGGDPADSKRLAFCRLNSFKSKQSHPLNLSLLLTKI
Homology
[Close]
BLAST of Csor.00g134910 vs. NCBI nr
Match: KAG6603317.1 (hypothetical protein SDJN03_03926, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia])

HSP 1 Score: 161 bits (408), Expect = 7.10e-50
Identity = 82/82 (100.00%), Postives = 82/82 (100.00%), Query Frame = 0 

Query: 1  MNATTYAFFTILDYAVNIHSHSSTAKVYRKQILSSAINTNPYSIDLVGGDPADSKRLAFC 60
          MNATTYAFFTILDYAVNIHSHSSTAKVYRKQILSSAINTNPYSIDLVGGDPADSKRLAFC
Sbjct: 1  MNATTYAFFTILDYAVNIHSHSSTAKVYRKQILSSAINTNPYSIDLVGGDPADSKRLAFC 60

Query: 61 RLNSFKSKQSHPLNLSLLLTKI 82
          RLNSFKSKQSHPLNLSLLLTKI
Sbjct: 61 RLNSFKSKQSHPLNLSLLLTKI 82

The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Csor.00g134910 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Csor.00g134910 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
KAG6603317.17.10e-50100.00hypothetical protein SDJN03_03926, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sorori... [more]
BLAST of Csor.00g134910 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Csor.00g134910 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Csor.00g134910.m01Csor.00g134910.m01mRNA