Csor.00g076640 (gene) Silver-seed gourd (wild; sororia) v1

Overview
NameCsor.00g076640
Typegene
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. sororia (Silver-seed gourd (wild; sororia) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationCsor_Chr01: 10958571 .. 10961266 (+)
RNA-Seq ExpressionCsor.00g076640
SyntenyCsor.00g076640
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: CDSinitialstart_codonpolypeptideintroninternalterminalstop_codon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGAGGATGGTTATGAAAACATATGGTTCTGAAGGCAATGAAGCTAGAAATTTGGTGGTGGGCTTCAGGGAGATGGGGGTGTGAGCGTGTGTGGCTCTTTCCCAGCCTATCGATTAACGCTCGAGGAGATAAGGCTCTCGTATTTTGGATTTCCATCCACAGTTTCTTCCGTTCTCTTCCTTTGGTTTAGACTATAAAAATTTGCTTTTACCCTCTTGTTTTGTGTTCTTATTGGGACGTAATAATTTATAGGTTAAAGAGTTTCAAATTAGAGATTTAATTTATGACGTAAGAATCTTCGTTCCGGTAATGGAACGGGGAATTTTAACTAAATGGGACGGGGACTATCGCCGTTAAATGTGACTATCGCCGTTAATTTTTGTCCATGAGATTAGACAAATATCTTGTTTGATTCTCGGGATAAACGACTTATTCTCAATCTAACTCGGTTAGCTCCCTTTTGCTTCTGATGGTGGGTTAACTTTAACCGTCCAAGTTCACTGCTACCTTTGCTTTTGCTAGTAGTATTGTCTGGTTTGGGTAAATGACTTATTCTTAGTCAACTAGGTTAATTTCCTCTGCTTTTGATGGTGGGCCAACGGTAACAACCCAAACCTACTGCTGCCAGATATTGTTCGCTTTAGGTAAACAATTTATTCTTATTCAACTCATTAACTTCCTCTGCTTTCTATTGTGGGCCAATTGCCACTGCTAGTAGATATTGTTAACTTTAGTCGGTTACCTTACGGTTTTAAACACGTCTGATATCGTCGTCAACCTTACGGTTTTAAACGCGTCTAGTATGAAGAAGTTTTCACACTCTTATAAATAAAAGTCAAGTAATGTCTCTCCAACTAGCTATACTCTCGTCACAGAGTCATTCAAGGATAGATCCGATGGTTTTGGAAAGCTTATTTAATCACTTGAATTTTTTTAATTTTATATATATATATATATAAAAGTAAGTTAATTTAATATAATAATAAACCTTTTCAAGCATAGAGGTTATTTATTTATTTATTTTTGTCGAGAGTATATGTCGGCCATGCTCAGCTTTAGCTATGCTTACCACGTTTTTTTAATCTATTTTTTTTTAATTTTTTTTTGTGCATGACGTTTTTTCCGATTCAATATATTGTTTTTCCGATTCAATATATTGTTTATAAAGTTTCAGTTTAGTTGTTTGTATTTTATTTTTTATTTAATTATTAGTAATTATTGAAGGACTATTTTTGAATTTTTAAAATAAAATTTAAAAATAATAATCTAATTTTAAAATTTAAAAAATATATAAAAGTAATAATGAACCAATTAATGAAATTTATTTAATAAAAAAAGGGATATTAATTAATGTGGCGGGTTTATAGGTGGGAAATTTTCCTGCCCGATTCAACGACGGGCGGGGCAGGTAAAGGCGTCGGTTGCACGTGTGAGAGTACAGTTACACACGTGTGAGTCTACTTCCTTCTGATTGGCTGAAACAGTGACCCATTCTCAAATCCCAAGCATTTTTTCTTCAACATTCCACTCTCACTCTTTCACTCATTCTCTCTTTCTCTCTCTCATCACTCAGAAACGGACAGGAATCTTTCAACTTTCACAAGCTCACGGCGATTTTTGGTTTTTCTTAACGTCACATCCACCGATTCATCCACATTTTCCGTTTCCTGGATCTTGGATCGGTTTGCAGGTTCGAATGTCTGTTCTTATTGCCATTTTTAGTTCTAATTTTACCCAAATTTGTTGTGCTACTTGGATTCGTATTGTGTATCTGCAATCATTCGTTGATTTTCAATTATCTGGCTGTTCTTTTTGTTTTTTTTTTCTTTTACGAGTTATTAAATGTGTAATTTATGTGTTTTTAATGTGATTCGTGAGATCATTTCACTTCGATTTGACTATAATAGATGCTCGATTTGAAATTAAAATTAATTTGAGCTGAAATTGTTGCTACTTCTGTTGCTTCAAGTTCAAGTAGTTTCTGTTGAAAATTATAGTATTTCTACTGTTTTTATGCTGCTCGGCTCTTTGGAATATAACTACATGAATTGCATGAACTGGGGAATATTGATCGAGTGAAGTTCATTCCTGTGAAAAATCGAGTAATATGCTATAGCTTTTGCTTTAATGGTGACGGTTGTTGAATTTATCATGGACTTTTCTTTTATAAATATATATAGTTATCTCTTTACTTTTGTGGCATATCCACAGAGAACGGTAGAATGAAAAAGCTTCTGGCCCACCGGATCATTTGTGTGTTAAAATTTTGCTGAACTTGGAGGTTTATCGTTCTAAATCCCATCGGTTTAGTTTATTATGCCGCCGTATTTTTACGACACCTCAGCAACATAATGTCAGATTAGATCATGGGCCAGCATTTTGTCAAATGTGTTAGGAAAATAATATGTACCGATTACTCTTTCTAGTCTGAATGTTCTTGGGGTCATATGATATATAGTATAGTATGCCATGGTTTGTGGGTTGGTGTGAAGTGGAGTAATTTAAAACTGCTAGCAAAATCTGTGACGTTGAGAATTTTGTACAGAGTTATTGCATTTTTGTACCGTCATCTGTTATGAGATTAGCATCTTCCTGCCAAGAGTAAGCAGCTTCTTCTATGCCAGGTGTTGTTTTCCTTGCGGCAGCTCTTTGTTACCAGATTACATTATGTTAAAGAAAACCATTCCAGCCTTTGA

mRNA sequence

ATGAGGATGGTTATGAAAACATATGGTTCTGAAGGCAATGAAGCTAGAAATTTGGTGGTGGGCTTCAGGGAGATGGGGAAACGGACAGGAATCTTTCAACTTTCACAAGCTCACGGCGATTTTTGGTTTTTCTTAACGTCACATCCACCGATTCATCCACATTTTCCGTTTCCTGGATCTTGGATCGGTTTGCAGGTGTTGTTTTCCTTGCGGCAGCTCTTTGTTACCAGATTACATTATGTTAAAGAAAACCATTCCAGCCTTTGA

Coding sequence (CDS)

ATGAGGATGGTTATGAAAACATATGGTTCTGAAGGCAATGAAGCTAGAAATTTGGTGGTGGGCTTCAGGGAGATGGGGAAACGGACAGGAATCTTTCAACTTTCACAAGCTCACGGCGATTTTTGGTTTTTCTTAACGTCACATCCACCGATTCATCCACATTTTCCGTTTCCTGGATCTTGGATCGGTTTGCAGGTGTTGTTTTCCTTGCGGCAGCTCTTTGTTACCAGATTACATTATGTTAAAGAAAACCATTCCAGCCTTTGA

Protein sequence

MRMVMKTYGSEGNEARNLVVGFREMGKRTGIFQLSQAHGDFWFFLTSHPPIHPHFPFPGSWIGLQVLFSLRQLFVTRLHYVKENHSSL
Homology
[Close]
BLAST of Csor.00g076640 vs. NCBI nr
Match: KAG6608009.1 (hypothetical protein SDJN03_01351, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia])

HSP 1 Score: 189 bits (479), Expect = 1.60e-60
Identity = 88/88 (100.00%), Postives = 88/88 (100.00%), Query Frame = 0 

Query: 1  MRMVMKTYGSEGNEARNLVVGFREMGKRTGIFQLSQAHGDFWFFLTSHPPIHPHFPFPGS 60
          MRMVMKTYGSEGNEARNLVVGFREMGKRTGIFQLSQAHGDFWFFLTSHPPIHPHFPFPGS
Sbjct: 1  MRMVMKTYGSEGNEARNLVVGFREMGKRTGIFQLSQAHGDFWFFLTSHPPIHPHFPFPGS 60

Query: 61 WIGLQVLFSLRQLFVTRLHYVKENHSSL 88
          WIGLQVLFSLRQLFVTRLHYVKENHSSL
Sbjct: 61 WIGLQVLFSLRQLFVTRLHYVKENHSSL 88

The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Csor.00g076640 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Csor.00g076640 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
KAG6608009.11.60e-60100.00hypothetical protein SDJN03_01351, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sorori... [more]
BLAST of Csor.00g076640 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Csor.00g076640 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Csor.00g076640.m01Csor.00g076640.m01mRNA