Csor.00g044080 (gene) Silver-seed gourd (wild; sororia) v1

Overview
NameCsor.00g044080
Typegene
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. sororia (Silver-seed gourd (wild; sororia) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationCsor_Chr18: 1581839 .. 1585882 (+)
RNA-Seq ExpressionCsor.00g044080
SyntenyCsor.00g044080
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: CDSinitialstart_codonpolypeptideintroninternalterminalstop_codon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGGGCATGAGAATTGAGGTCGAGTAAGAACTAAGAAAAGCTAAGAACCAAAAAGAAAACCACCACAGAACGTGTTCCATGGTTCCCTGAATTCAGAAAGTTAGAGGTGCCAAAAAGGGGGAAAAGTATTCTTTGACTTCAAACAGAACACAGATGAACAAATTGAGAACAGGGCACTTAAACTAATGAACCCAAGTCGAGTTGGGAATTAATTTACTTCACTATTGATATTTTTCAATTCACAGCACACAATTCCGCAACATTTCATTCAGGAATACATTCAGTTTCAGAACCCACAAACAGATTAAAATAAACAAGCCTCGAACTCAATTAAAGCGTTATCAGTGACATCCAAGCTGACGAATCCTCACCATTACATAACCCAAAAGTAAATAAATAACAAACTAATCACACATGCAAGGAAGCTGCCCGCAATAAATTTCATGTCTCTAAGCGTCTCAACGAAAGAAACAAGAAGCCCATGAATGAAAATGAGAGATTACAACAAATTTCAAACCTGGATATATAATAATCTAAAGTAGAGTAGTATCGATTCCTGGGTGCGTTAGCCGCGCTCGTTGAAAAAATTGAAACGCTTCGGAGGAGAGCGATACGCTACCGGTACACTCCGGTGTGAATGTGGCGGGGCCGCAGGCGCAGGGTTTAGGGTTATCGCCGCCAATAAATTAAGTGGTGCGCCTAAAGATGGCAACTTTTTCTAAGCGGCTCACAAAATTTTGATAAATATAATATTTTAGAATTTTAATAAATATAATATTTTAGAATTTTGATGCCTATAATATTTTAGATTGTAAATGTAACACTAAATTAGCAAATAAAATAAAATATAAAAAAATATTTAGTATTTTATTTTAAAAATATCCTTAAACTTTTAATACAATTCCAAAAATGCCCTTGAATTAAAAAAAAAAATACCCTCTTCCATTATATTTAAATAATAAGCATACAATTTTAAAAATAGTATTAATCTCTTATTATAAAAAAAAATAAAAAAAAATAATTTATTAATATCTCATAAACCATCTCTAAACTTTTTAACTATAGGATATTAACGGTAATTTTTTAAAATATTAAAAATATTTTTGAAGTTTTTTTTTAATTAAAAACATTAATAAAACTTTTAAACGCCAAGGTTATTTTAAAAATATTTTTAAAAATTAAAGATTATTTTTTAAAAAACAAATTATTAATGGTTTTAGTATTTTATTAAATTTTTTTTGAAGATATTTTTTAGACAATCGTATTTTTATTAATTTAGTCTTGAGTAAAGTAATAATTATTTAATTTATAATATAATTTTAAAACGGTAAGGATATGAATTAATATATCATAATTTAGTTCTAGAATATTAAAATCAATTTTAATATCTAAATGTATAATAAATGTTTGGATTTAAAAAATGATGATAAACAGAAAAAAAAAATGTTTACTTGCTTGAATAACAACAAAGAAACTAAGAAAAAAAAATATTTTTTGAAATAAAAAAAAGGTAAAACAATAATGGAAAATTATATTTGAAAATATTATATGGTTAATTGAAATTCTTGTCTAAATCACGTGACAATGACTATTTATTAAAATATTTGTTTATTTTGTCCCTTTCATATAATAAAATTAATGTACGGAATTACGTACCATATACTATAAATTGTATATATTAATTAAATTTCTAAATTTGTATTTATTCAATTCATAAATTTTAATAAAGGATTAATACTCGTTAAATTTTTAATATATTTTTTTTTTATCTAATTCACCTATTTTTAAAAATATTTAATTTTTTCAATTTTATGTTTGATAAATTCATAATTATTTGGTGTTAAAATTCTTATTTTTTATTTGAGTTTTATTAAAAATTATTAATAAATTATGATATATTTTTTTTAAACATATTAAACAACTATATAAATTTATTTACGTGTTTAAAAATTAAGAATTTCAATTAAAATTCATAAGTTTTAAAAAATTTCAATTAAAATTTATTAGACACAAATAAATAAACGAACTAATACTAATTTTATATTATTTCAAAATTAAGAATTGAATAGACATAAATAATTTTATAATTTAATAAAAAAAATAAAAGAGAACGGTAATAACCCTAACCCCGTACGTATAAGATGTCATTTTTGGATTTTATCTTAAAGCGCTTCCTATTAAAGTTTTAAAATGGTATCAAATCCCGACAATGAGCGATGTGCCTGGAAGGATGCTGGTCCCAAGGGGTGGATTGTGAGATCCATCTTAGTTAGAGCAAAAATTTCTCACTAGCATACGTGTTTTAAAATCATGAAGGTTAATGATGATACATAGTGAATCAAATATAGACAATATTTATCAGCAGTGTGTTTTGTTAGAAGAATAATTGTTTATATAATTAACCGTTCATGACAACTGGACAATAAAGACAAGTTATTATTATTACTTTTTATTTTTTTTTCTAAGACAAGATAAAGACGAGTTATTATTTTGATTTATTATTTATTTTTGTTTGTAATTGTCAAAAAATTCGATTATTATATAAAATAGGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGTCGAGGCTTCGAGCGTGGGAGGATAAAGTACAAAGGCGCACACTGTCGTGAACTCAGACCAGACCTTCTTGATTTGCAGACGAATTCAAATCTCACACTCCATTGTTGCTTTGGGATCTGCATGGTGAGTTCTTGAAACGATGTTTTTTTTGTTTTCCGGCACGGTGCTCGCGAGTGAAAATGTTAGCTCGATCTTTCTCGAAGCAAACTAATTATGCGTTCTCTTATTCTGATTTGTGATTCGATTTATGATGTCCGGTTCTTTAATCTGACATGCGATTCGATATTAGATATTGATATTTGATACATTTGTTGGGTCAATTCAGCTGGTTGATAGCTAGAGTTGAAGAATCGAGTCTATTTTATGTGCATTCCAGGCGGTTAAGGAAACGCCTGATGCTATGCAAACTAAGCTAGCGTTGGAAAACTTCGGTACTATCGTATTAGCCTACTGAATTGGGTTTCTGTTCAAGTTTTTCCTGATTCGTTATATAACCGAAGGCTTGTTAGGTCTAATAATCTATCGTTTTTCCGTATGTTACTGTTCTGGTCTTCTAAAGATTCGAATGGGCGTTATGAAATGTTGGGCTTTTCGTTCATGCATATTGTTGCTCATTTACCGATTGTAATTTATTACCGAGAAGAATCTTGTTGCCAGAGTTTTCCTATATGAATAAATTTCTTGGAGATAAATATACATTCTACTTGAGGGTCAGACTGCACGATGAAATGGAACCTCGTTCAGTAGCTAAAATATAGATTTCTCCGAAAATTTGGAGTTTCGGAGTTCAGTTATACCCTGAAAAGCACCTTATTAGCCTTGTTAGTGCTTGCTGAACACTTTGGTTTTCTATTATGTGTCTGCACTATTTAAACTGCGGAGCCATAAGCTCTATCCCTCTTAAGTTTCAGAACAAAACTCTTCATTTCATTCACCAAAACCCCAGCAGCCCTTGTGTTTTGGATGCTAGAGAAAGTTAACTATGTTCCTGAACGTTCCTCTAGCATTCTCCAGCCACTGCTCGTATACTATTGCAGTGCACCGACTATCACAACCATCATTGCCCAATGGAAACTAAGTTACTGACATATATATGATATGAAGATAGATTTCTTTATCTTCTCTATGTTATATTAGATATTGTATATATGTGCCATCATATACACATGCATTGTTGGTTATGTTATATCTGTATTTTATATTTATTTGTAACTAGAATTGTTCTTTCAATAAAGCTGTGTAAATCTAGGGCATGGCCTCCTGGAATGAATCGAGGAAGCTGAATTTTCATCTCCTCTATGCTGTCTGAAATTTGGTTATTCCACCATAAGTTTTTATGACTTTTGAATACATGAACCTCAGGTTTTCAGTTGAGGGCTGAGCTTTCCATTGTTGGGCAATATTACCATCTGCAAGATGATCAACTGAACCTGAAGCTATCTGTTACTTCAAGTGCATGCTTTGGTTGA

mRNA sequence

ATGGGCATGAGAATTGAGCCGCGCTCGTTGAAAAAATTGAAACGCTTCGGAGGAGAGCGATACGCTACCGGTACACTCCGGTGTGAATGTGGCGGGGCCGCAGGCGCAGGGTTTAGGGTTATCGCCGCCAATAAATTAAGTGACGAATTCAAATCTCACACTCCATTGTTGCTTTGGGATCTGCATGGTTTTCAGTTGAGGGCTGAGCTTTCCATTGTTGGGCAATATTACCATCTGCAAGATGATCAACTGAACCTGAAGCTATCTGTTACTTCAAGTGCATGCTTTGGTTGA

Coding sequence (CDS)

ATGGGCATGAGAATTGAGCCGCGCTCGTTGAAAAAATTGAAACGCTTCGGAGGAGAGCGATACGCTACCGGTACACTCCGGTGTGAATGTGGCGGGGCCGCAGGCGCAGGGTTTAGGGTTATCGCCGCCAATAAATTAAGTGACGAATTCAAATCTCACACTCCATTGTTGCTTTGGGATCTGCATGGTTTTCAGTTGAGGGCTGAGCTTTCCATTGTTGGGCAATATTACCATCTGCAAGATGATCAACTGAACCTGAAGCTATCTGTTACTTCAAGTGCATGCTTTGGTTGA

Protein sequence

MGMRIEPRSLKKLKRFGGERYATGTLRCECGGAAGAGFRVIAANKLSDEFKSHTPLLLWDLHGFQLRAELSIVGQYYHLQDDQLNLKLSVTSSACFG
Homology
[Close]
BLAST of Csor.00g044080 vs. NCBI nr
Match: KAG6573165.1 (hypothetical protein SDJN03_27052, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia])

HSP 1 Score: 200 bits (509), Expect = 8.12e-65
Identity = 97/97 (100.00%), Postives = 97/97 (100.00%), Query Frame = 0 

Query: 1  MGMRIEPRSLKKLKRFGGERYATGTLRCECGGAAGAGFRVIAANKLSDEFKSHTPLLLWD 60
          MGMRIEPRSLKKLKRFGGERYATGTLRCECGGAAGAGFRVIAANKLSDEFKSHTPLLLWD
Sbjct: 1  MGMRIEPRSLKKLKRFGGERYATGTLRCECGGAAGAGFRVIAANKLSDEFKSHTPLLLWD 60

Query: 61 LHGFQLRAELSIVGQYYHLQDDQLNLKLSVTSSACFG 97
          LHGFQLRAELSIVGQYYHLQDDQLNLKLSVTSSACFG
Sbjct: 61 LHGFQLRAELSIVGQYYHLQDDQLNLKLSVTSSACFG 97

[Close]
BLAST of Csor.00g044080 vs. NCBI nr
Match: KAG7012349.1 (hypothetical protein SDJN02_25101, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma])

HSP 1 Score: 75.9 bits (185), Expect = 1.20e-15
Identity = 36/41 (87.80%), Postives = 38/41 (92.68%), Query Frame = 0 

Query: 57 LLWDLHGFQLRAELSIVGQYYHLQDDQLNLKLSVTSSACFG 97
          L+ +  GFQLRAELSIVGQYYHLQDDQLNLKLSVTSSACFG
Sbjct: 41 LVLENFGFQLRAELSIVGQYYHLQDDQLNLKLSVTSSACFG 81

[Close]
BLAST of Csor.00g044080 vs. NCBI nr
Match: KAG6584191.1 (putative serine/threonine-protein kinase SIS8, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia])

HSP 1 Score: 48.5 bits (114), Expect = 7.20e-04
Identity = 23/37 (62.16%), Postives = 27/37 (72.97%), Query Frame = 0 

Query: 49 EFKSHTPLLLWDLHGFQLRAELSIVGQYYHLQDDQLN 85
          +FKSH+PLLLWDL  F    +L I GQ Y+LQDD LN
Sbjct: 45 KFKSHSPLLLWDLLVFSRVLKLYIGGQDYNLQDDYLN 81

The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Csor.00g044080 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Csor.00g044080 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
KAG6573165.18.12e-65100.00hypothetical protein SDJN03_27052, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sorori... [more]
KAG7012349.11.20e-1587.80hypothetical protein SDJN02_25101, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyro... [more]
KAG6584191.17.20e-0462.16putative serine/threonine-protein kinase SIS8, partial [Cucurbita argyrosperma s... [more]
BLAST of Csor.00g044080 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Csor.00g044080 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Csor.00g044080.m01Csor.00g044080.m01mRNA