
CsaV3_7G019860 (gene) Cucumber (Chinese Long) v3
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGACATTGATAAGACGATCAAAGTGAAAAAATCCTCCTTAGTTGGCAAGTCTGCCATACCAACCAAGAGATTTGATCCAAGTAAGATTTACAAGGAGGATAGAAGTGGGATGCTCCTATTAGATGCCAATTCGGAGAGGAGGTAACTGCCATTTGTACTTCACATTTGGTTTTGATGCCCTCACCCTTAAAAAATGAATTAAGGAATGACAACAGTTATAAACTTCCCTAAAGTGCACGCTTGCATGTTTGGTAAAGTGGATTTGTTTCTAAAATATTCTTTCTTTTAACCTAGGTTAATGGACATGATGAAAAATGTTGCATCGTCAATTACTTTGGAAGACGTAATTAAGAAGCACAAAGTCCCATCTACTCATGCATATTCTTTAAAACATGTAGTGGACAAGACAATTAAGATGGGGAAGTTGGAAGGGTCAGTTGTGGTAAGAAAATTATTAACTTTTGTATCCTTAAAGTGATCTCGTGGTTTCTTATCCCTTAATGGTCTACTGTTTTGGTTGTTAGGCTGTTCGAGCTGCTCTGCGCAAGCTTGAGGAAGGATGTTGCATTGAGGATGCAGAAGCTGTTTGTGAGCCTGAAGTTCTTAACCACATATTTAAGTGGAAGGTGCTTACAATTTCTTATTGCACTGTTCTAAAGAAATTTCTTAGGCTTTTATTTGCTCAGCTGCTTTGACGAAATTTTTGACAAAGCATGGTCTTATACTGACTAATATTTTGTGTTTTCGAAGTTTTGAACTATTTTGTGCTTTCATCTTAGACATTCGGCCCCTGCTCTCTATTTTCCTGTTTACATCTTTTTCCTTATGCTGAATCATTTGGTGGCAGATGCCTTTTCTCGTTTTAGTAGCTCTAGGATATTGTTGGGATTCTGTCATTTGTTGTTTGATAGAGAAGCAACTGACATAGTGGCTCTTGTATCCTCGAACGAGACATTTGATATTAATACGAAGGAGAAGGATTGTTTCTCTTTTGGAGCTTGAATCCTTCTAAAAGTATTTCTTGTAGTTCCCTCTTTTGGAGCTTTTGTGAAAATTTTAAGAATGTAGTTCCCTCTTTTAGAGATTTTGTAAAATTTTTCTAGAAGACTTAGCACTTCTGTTTGTGGTAAGTCAATCATGGAAGACTTCTACAGATATTTCTTTTAAAAAGGAGACAGCCTCTTTATTAATATTAATATAATAATAATGAGACAAAAGCTCATAATACAAAAGAATTATACAATGAGCATGTAAGCATGGATCGGGGGTGCACCTGGACATCTCAACTAGGTTGACACCCCCTTAACACCCTCATCATATCCAACCAAGCTAAAACCCGTAACAAAGGAGTAATGGCTAAAGGCAAAACAAACACAAAAGAAGTACAGGGAAATACAAATACAAATACAAGACTAAACATCCTTCTAAATAAAAGGCGACCAAAAACTTGCACCAAGACAAACTCGAGATCATAGGAGGAAGAACACTATGAGGAGGCTGAAAAGAGGAAGACTTTTACAGATTAGATTGGTTTTTAGAAAGATGATCCTTTTTGTAGGGCTGCTTTTTCACATTCTGTATTGGTGGGCAGAAAAAAGACTTCAATCATATCTTTTTGAATCATGACTTTGTTTGGTTAGTTTGGAGTTGTTTCTATGAGGTGTTTGACTTTCCTTTTGCTAGACACATGCTGTGTTTTAGAAAGCCTCCTAGGCGCATGCATAGTGCCTCGCCTTGCACACAAGTGCATCAGATGTGGTGCTTTCAGTGAAGCCCTACGGCCCAAAGTCCTAGGCATTGGGGTTTTTTTTTCATTATTTTAAAAAAGTAATTATTAGGGTTTTTTCCTTCCATATTAATTATAAATAATAAAATTTGCTTGGCCTAAATGGAATATTTTTTTTCCTATGGTTACTTTTATATTCCCAATTCAATTATCCTCTTTTTTATCTTGTATTTTTATATTATCTTGTATTATATATAGAGAGACTGCACCTTAAAAAAAAAACCCACATTTTTTTTCCGCCTTGCACTTAAGCCCTAAAAGACTATTGTGCTTTATTATGCCTTGAGCATTGAAAAACATTAGACACAGAGATCACGGAGATGATTGAGGAGTTTCTTCTTCATCTGTCCTCTAGGTTGTAATTTATTTGACTGGAGTTTCTTTCTTTAATTGGATTCACTTGTGTGAGCTTTGATTTTTTTGGTCTTTCCTTATATAATTATTTTTTTTCTCAATGTAAGTCTTGTTCTTTTTTCTTGGTCTTCAATGAATTTTTGTGTATTTGAATTAAATGTGTTAGCATCGTTGAATTCTTTGTTTTCTTTGAACAATCACTTTTAACTGACTTTGTGAATTCCTTTACTGTAGAACAAACTCAGAGTATATCTTGCACCATTTCTGTATGGCATGCGCTACTCCTCCTTTGGTCGTCATTTTACAAAAGTTGAGAAACTTGTGGAGGTATACTTGTTTTTGCAGCAATGTTTTTCTTCGATTTAAGAGTACTTTGGTTGTCTTATCTTTTTAATTATGGAAGCATGGTCATGATATGTTATACTGGGTACTTCAAGGAACTTGTTTGGTGACAACAAGATTGTATTGGGGGCAAAGTATCAAAAATCCATTGTCGAAGCATGATGTGTACTACTGCACATCGGGACTCCCAACGATAAGCCAGAATTCAAGTAGTACAACCTTAATTGAACTTGGAGATTTAAGACATATGAGAAATCCAAACTTCTCTCTTTTATGTACGTTCATTAAATAAACATAAAACTGCTCTAAGTTCTCTCTCTCCTCCTCTCTCTCTCCCCTCCCTCCACCCCACTCCTTCCGATCTCCCCTCTCCGACAGCCAGGTTTTTTAAGCAGTCCTCTCTGTTAAGTCTCAGAGATCACCATGGAGGTGGTTAGCTGGAAAATTGACCAGTCACACTATTGCATTTGACATGAAGGAGATTGTTGCTTCATTGAAGATGTAGAAGCCGGCAGAAGCATCTCTCTATCCGTTTGCCAACTTAGATGGATCTGGTCAGCATTAACTGATCTTATCATTTTCCGGTAGGTTGACACTTCAGGAAATTTGGGGATGTCGACAAAGGCAGATTGAGAATTTCAAAGTTTCAAGCTAAGTTGGAATGGATACTGAGCTGTGATCATTGGCCATATTCAGGGGGCTCTTCAATATCAGAGTGTGCTTAGGTAGTGAGAAGCAAGACTGGAAGTTGTTTTGCTCAATGCTAGATAAGTTTGTCGAAAAACTGGATTATGCTAGATGGTTTTCTAATAATTCCCTCAAGATTCCTCCTTCGAATTTGAATAGGAAACTAAGTTATGTTGAATTGGCAAAATCAAGTCTTTCCAGTTCCCCTGTTCCAAGACCTATATTTAAGGTAATTGACCAGACTCCTAGTAAAAAAAGCAAGGCTCAAAAGTTAGTCCATCTTCCCCCTTCAAAACAGAAGGATTTGCTGATTAAGAATCTTGAAGTTGTGAAAGTCAATTTTGAAAATTTATGGACTATAACAAAGTTATTTGCCTCAGATGACTGGAAACTGATCCGTAAGGTTGGAAGCTTTTTTCCAATAAAATATTGTTACAAATCCTTTATACGATGAGAATGCCCTCATTAGCATTGACCAAGGATCAATTTTAGATCTCATCCATGAGGAAGGAAAATGGCAAGCCTGGGGGAATTTTCTCAAATTTGAAAGCTGGTTTAAATTTAAACACAGCCGGCCACTCGTCCAAAAAGGGAATGGCGGTTGGCTAAAAATTAAAAACTTCCCTGGGATTATTGGTGTAGGAGTACCTTTGAGGTCATTGGGGATCATTTTGGAGGTCTCTTAGATATAGCCTCCGAAACTAAATTTAATTAATGTTAGTGAAGTTCGGATTCAAGTTAAGAAGAATTCTTGTGGTTTTGCCATCCACGATTGAAGTCACTGATCTAAGGAGGGGAAATATATATCTTCATTTTGGAGATTATGAATTCCTAAACCATAATATTCCCCTCAGAGCTGAAGAGTCCTCTTTTAATCTTTAAATGAAAGGAATAAAGGAAAAGGGGCCCACTTCAATAAATCTTTGAGTTATAACGATTTTAGCCCAAGAATTTCGGAGGACCTTAGCAAATTTATTGCAAAAAAGCGTTACAAAATGTTTCTGTTTTTAATATTCCAGTAGCCAAAGAGTCCTCTTTTGAGTCTTTAAATGAAAGGAATAAAAGAATAGGGGCCCACTTCAATAAATCTTTGAGTTATAACGAATTTAGCCCAAGCATTTTGGAGGAAAACCCATCAGACTTATTGCAAAAAAACGTTACAAAACGTCTGATTCTTTTCTTTTTGTTCGAACAGGGGCCAACTTTCTTCAAAAGTGGGTATTTTCAATCGTTCCAAGTGTGCCAAAGACAGCAAGTCCTCACATATTCCAAAATTTTTTAAGCACTATATCCGCAAGCAAACCTCGTGTGGGCTGCCTTGCTAAAATCTGAATTAAATGGGGTTTGTGACCTTAAAATCCCCCCTTTGGACTGTTTTCGGAATAACACCATCAAGCATTCAGTTTCTGCCAATAACCCAGATCTTTTGGAAGTTTACAGCTTTAAAATCCAGGTCCCTGAGAGTTTTTACAGGTCAGTAAATAGCACTTCTCCTTCAAAGTGTCTCAACATTTCAAATTCCTCCACCTCCACTGCAAAAACATCTTGTCAGCAAGGCTCCCCATGCAAAGCTGAATTAACTCCTAAAGACCAGCCGAAAATTTTCTCACCTATCAGTGTTAGTAGTGAAGAATAAGTTGCTCTTAGTGAAGTTGACCCTAAATTAGATTAAAAAATTGAAGGGCGGACTTAAATGTTTTGTTTAATGAGGAGGGTTTTCTCACAAATAATTTTCCTCCAGATTTGCCTAAAGAGTTGATGTCAATAGTCAGTGATTGTGGAATTATTGTGGTCTAATTTAGAAGTGCAGCCATCCCTATCCT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Match: XP_031745059.1 (LOW QUALITY PROTEIN: protein ENHANCED DOWNY MILDEW 2-like [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 370.2 bits (949), Expect = 1.1e-98 Identity = 183/183 (100.00%), Postives = 183/183 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_7G019860 vs. NCBI nr
Match: KAE8645949.1 (hypothetical protein Csa_018221 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 370.2 bits (949), Expect = 1.1e-98 Identity = 183/183 (100.00%), Postives = 183/183 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_7G019860 vs. NCBI nr
Match: TYK08109.1 (protein ENHANCED DOWNY MILDEW 2 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 360.5 bits (924), Expect = 8.5e-96 Identity = 181/184 (98.37%), Postives = 182/184 (98.91%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_7G019860 vs. NCBI nr
Match: KAA0048147.1 (protein ENHANCED DOWNY MILDEW 2 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 360.5 bits (924), Expect = 8.5e-96 Identity = 181/184 (98.37%), Postives = 182/184 (98.91%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_7G019860 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: F4K3G5 (Protein ENHANCED DOWNY MILDEW 2 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=EDM2 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 192.6 bits (488), Expect = 4.0e-48 Identity = 95/153 (62.09%), Postives = 119/153 (77.78%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_7G019860 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7U1N2 (Protein ENHANCED DOWNY MILDEW 2 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold63G00430 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 360.5 bits (924), Expect = 4.1e-96 Identity = 181/184 (98.37%), Postives = 182/184 (98.91%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_7G019860 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3CCR5 (Protein ENHANCED DOWNY MILDEW 2 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold265G002750 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 360.5 bits (924), Expect = 4.1e-96 Identity = 181/184 (98.37%), Postives = 182/184 (98.91%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_7G019860 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BHF3 (LOW QUALITY PROTEIN: protein ENHANCED DOWNY MILDEW 2 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103490112 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 360.5 bits (924), Expect = 4.1e-96 Identity = 181/184 (98.37%), Postives = 182/184 (98.91%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_7G019860 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1ITQ9 (protein ENHANCED DOWNY MILDEW 2 isoform X1 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111480505 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 300.1 bits (767), Expect = 6.6e-78 Identity = 157/200 (78.50%), Postives = 169/200 (84.50%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_7G019860 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1IWB7 (protein ENHANCED DOWNY MILDEW 2 isoform X2 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111480505 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 300.1 bits (767), Expect = 6.6e-78 Identity = 157/200 (78.50%), Postives = 169/200 (84.50%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_7G019860 vs. TAIR 10
Match: AT5G55390.1 (ENHANCED DOWNY MILDEW 2 ) HSP 1 Score: 192.6 bits (488), Expect = 2.9e-49 Identity = 95/153 (62.09%), Postives = 119/153 (77.78%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_7G019860 vs. TAIR 10
Match: AT5G55390.2 (ENHANCED DOWNY MILDEW 2 ) HSP 1 Score: 192.6 bits (488), Expect = 2.9e-49 Identity = 95/153 (62.09%), Postives = 119/153 (77.78%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_7G019860 vs. TAIR 10
Match: AT5G48090.1 (EDM2-like protein1 ) HSP 1 Score: 122.9 bits (307), Expect = 2.8e-28 Identity = 63/138 (45.65%), Postives = 87/138 (63.04%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_7G019860 vs. TAIR 10
Match: AT5G48090.2 (EDM2-like protein1 ) HSP 1 Score: 122.9 bits (307), Expect = 2.8e-28 Identity = 63/138 (45.65%), Postives = 87/138 (63.04%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucumber (Chinese Long) v3
Date Performed: 2021-10-25 Position : 0 Zoom : x 1
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
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