CsaV3_7G018390 (gene) Cucumber (Chinese Long) v3

Overview
NameCsaV3_7G018390
Typegene
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. Chinese Long (Cucumber (Chinese Long) v3)
DescriptionUnknown protein
Locationchr7: 8280215 .. 8284394 (+)
RNA-Seq ExpressionCsaV3_7G018390
SyntenyCsaV3_7G018390
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGACCCACTTGTATGGCTGCTCGGACAACCCCTTCACAAGCAAATTTCCCTTTGTCGCTCGCCCTTTCCATTGTCGATTGAGGTTGCCTATTAGTGATAAAAATAGATACTACATCCGTTTGGTAGTGTTTGAGCCGAACACGGTAGAGAAGGAGGTGAGTTTTTCTTTATAGTTTTCCATTGTTGATGATGAGGTCCCCACTTTTTTCTTTTTTTTTTGATTCATTATCATTATTTTACCAACATATATTTTTTTAATTGGTGTGAATTTGTATTTTGCTATTTTTTTCATGTTTGATTTAGCTGTCTATATTCTATTTGCCCACTCATAGCTTAGCCATTACTTCTAGTATGTGTATGTTGTGAATATTTGTGCACTTTCCATTGCAGTATACTTCAATATATTTTTTCCCTAGCTAGCCTTCGATGTTTCATTCCCTTCATCTATGTAAATACACACCATGTGCATTGTGTGGCAGGTATACTGCATTTAACTTTGACAAAATTTTCTAGTTATCTAACTTTTCTTTTTCCATATGTTATGTGTTGGCTTTTCCATTATCATCAGTCTATGCTCAAATTTGGTTGTTTAGGGGTCTTCAATGCATCATTACTTCTTACATTTCCCAGCCATATATACTTGTTATGCCATTATGCCTTATGTGTGTTTTCTCCTCGGTTCATCTTCATAGAAACTCTTGATTACTCAATTCTTTGGTATGTATATGCATAAATGTGGTTTGTGTTCCATTGTGTGTTTGGTCTTCACAATCTACTTATGTACTTGTCATTGATTGAAGTTGTGATCCATGTTAGGCCACTTGTTGTTTATTTACATGCATTTTCATGTCACCAATTCCATACTACCCGCCTTTTTCCATTATTGTTCTCCATTCCAATAACTTTTATTTCTCCACATTTTCGACTATTGCATATTTGAAGCCCTTGGTCCATTGTTTATGTTCATTTTCATGCCTTTCATAGCACCACATTTGCTACTACTATATTTTTTAGCATTTTTTCCATATTTTTTGTTCATGTGTACGTCTTTCTTATCATCTAGCATTGCATATTGCATATGTGGTGCTATGAAATGTCTTCACATTTGTTCCACTCCATGAAATTCGATTTCAAATTTTGTGCACCTTTTTTTTCCTCCATCCACCAAGTACGTAGGAATATGTATTAAAATAATGTGTTTTTCCAAACTTATTAGATAAATAATGCTGATTGGAAACTAATTACAAAAATAATGCAGTTTTGGAAGAGAGAAGGTCGAGCATTGAACTTTGACCTTTATTTAAAAAAAAAGGAAGGGGGTGAGTTTTGAGTCTTCAAGACTTGCCCTAATTAAATATATATATATATATTCGAGTCATTTTGCGCAATAGCAGGAAAAACATGTATGGTCAAATCACTTCTTTCCCATGAAGCTTTTCTGTGGGTAGGTTGAGTATTTAAAGCTCCACTTAATTATATATATATATTTATATTATGGCCATTATGCGTAACGACAAGAAGAGTAGACATTCATGCATGGTCAAATCGTTTTTTTCTTGTGAAGAAGGGCGAGTACTCTCTCTTCTCTTTTATATCCTTCCTCTTCATTCTCATCTTACCTCTTGGCCATTCTTCTCCCATTCAGATCATCTTTCACAAAATACTCTCAGCTCTTCTTCTTTAATTCCCATCTTTCACAAATCCTCTCATCCTTCAAATTACCTCTCAATTTTCCTTCCCATTTTCCCTCCAATCCCCATCATATTTTCATCCTTAATATTTAAATCAGGACGTTGGCTGCTCCTCGTTGCAATCAGTCTCAATAGCTTGGCAACTCAACTGGAGAATTGAAAAATGATTAAGAGAGTCGAGTTGTTACATTTTTACCTTTTATTCTTATTTTATTATGATTTTTTGTTTTTTTTATTTGATTCATATCGAGTGTTCGTATTTTTTTATTGGTACATTTTTTAAATATGTCATCATGCATTTTACACACACTCACAAGTCCTCTACTCAGGCTACAACTTTATAGTATTAGGATTGAGGAATGAGTAGTGTTAACCTTCAAGAGATTTCGACTTCCGTGTAGGCACAAGAAAAATGTTCGTTCAGATTAATTCTTTTGTTATTTCTTAAATTAACATTAGAACAAGTTTGAGGGTCTTTCCCTTCTAGAAGTTTAGATGATACAAGACCGTAACATTTTCTATTTGGCATATTTTATCTAAAAGTCAAACGGTCAAAATTATTATTGTTTTTTTTTAAACAAAGTTACATGTTTCTAAAATTTGAAATCATACCATATTTCCTTTATTTTTTTAAAAAAAAGGGGTTAAATCACAATATTTTTTACATTATTTTTTTTAAGGAAAGTTTGATTTTAGTTATTATTTATCTTAGTTTCCTTGAAATTGGTTCTTTGGCTTCGATCATATATAGTTAGGGTAGTATTTACCTTGTAGAAGCACGTGAAAACGGTAACATCCCAAAACTATTAAGATAATTTTTAATTTTATTTTGTTGAAATTGGGTATTAATTGAGATTTGATGTTAGATGAGTTAAGTATTTAAGGAAGAATTGTTAATTATTTGAGAGTTTTGGTTATTAGTTGTTAATTATGCAATTAATTTTCGAAAGAGAAAAAAAAAAATATTTAAGGATAATATAATTATTAAAATGTTATATCGTGATTTTGGTGGAATAAAAAGAGGAAAAGTTGTTTTAATGGGTAATTAAGGTGGAGTGAGCTTTATTTCGAAACGTAAAAAGTGAAAGAAAAATTAATTAAAAGATATAATAATGATATTTATTATTATCATTATTAATAATATTATCATTATTAAATAAGCCTTCTCTCGTTTTACGTGCATCATCTTCTCCACCACATTGATTCTCCTTCACCATTCAACCTTAGTCGCCGCCGCATTGTGCGTCAGGTCACCACCGTTGCGCAATCATCGTCGGGGACACAACTCGCAGCCAGTCATCACTCGTTAGTCGAGATCTACTCGTTGGTTGCCAAATCGAGCATCTCTCATTGTCTTCATAATCACTTGAAACCGGCTGCCCCTCCTTCGTCGAAATTGTCGTCGGCCGTAACCCTCTCCTCCGTCGAAACCATCATGGGTCGTAGCCTCCACTTGCACAGTGTCGCTGGCCATCGTTGCGCTTGACGGTCAAGGACGCAAGCCGAGCTGGTCTTCTTTTCGCAAGCCATACGTCCAAGTTGCGTTAGTCTGAGTCGCGTGATCCACGATCTCTTGCACGAGTCGTCTTTGTTTTTCTGAGCCGCGCGCCCGAGCCGACTACCCTGCCGAGCTGTTCCCTGTTTTAGAGTCACTTTTAGTGAGTTTTGCTTAGTATTGATTGAGTTTGCTACCCCCATTAATTACTTATTTTGTCCCAAATGAATTAAGTTATGGATTTAAGTGGATCTATGTTTGCTTGAAGGATAAGTATAATCGAAGGAATTGAGGCTGTGAATTTTTTCATTTAAGGTTATGTTGGATTCAACTTTAATCTTGGGGTAAGTTTGGATAAGCTTGGTTGCTTAGTTAAACAATAGGGTGATGATTGACAAAAAAATTTAATTTTAATTTTGTTTGTGTTTAGAACTGAGTCTTGGAAGGAGTTGACTGGCAACCAACAAATTATTATCTTTAGCAAATCTCCAGGTAAGAGATTTTCCTATTAGACCCCATTTAGCAAATCTCCAGATATTGGATTTTCCTATTAGACCCCATTTTGGAAGCTGCATGTATGTTTTGTATTATTCAGTAGTGTAGCTAAGGGTGATAAAATATGACTATTTGACATGCCCTTATAAAGGGTTCGTTCGATAATCAGATTATAACTAATGTAAGTACGATTGAGGCATACCATGATTAAATATGTTATGTTTGAGTTATGTTTAATCGAGTTATGATAATGATGTTATGATTTATATGTATAGGCTATAGTGTTATGTTAAGTCTATCTGTTAGAGTCGTACCATATGGGCATCCCTCGGGATCACCACCTATGAATGCTTGTGTGGCTAGTTTTGATGTATGATTTGATGAGATCACTTACAGCCTGACTCTCCTTTAGGGTGATTCAGTCAGATTCATTGAGAGCCGAGATGTGTCTCTACGGGACCACTGGATATCGGGCATTCGAGAGCACAATAGTAAGAG

mRNA sequence

ATGACCCACTTGTATGGCTGCTCGGACAACCCCTTCACAAGCAAATTTCCCTTTGTCGCTCGCCCTTTCCATTGTCGATTGAGGTTGCCTATTAGTGATAAAAATAGATACTACATCCGTTTGGTAGTGTTTGAGCCGAACACGGTAGAGAAGGAGGGTGATTCAGTCAGATTCATTGAGAGCCGAGATGTGTCTCTACGGGACCACTGGATATCGGGCATTCGAGAGCACAATAGTAAGAG

Coding sequence (CDS)

ATGACCCACTTGTATGGCTGCTCGGACAACCCCTTCACAAGCAAATTTCCCTTTGTCGCTCGCCCTTTCCATTGTCGATTGAGGTTGCCTATTAGTGATAAAAATAGATACTACATCCGTTTGGTAGTGTTTGAGCCGAACACGGTAGAGAAGGAGGGTGATTCAGTCAGATTCATTGAGAGCCGAGATGTGTCTCTACGGGACCACTGGATATCGGGCATTCGAGAGCACAATAGTAAGAG

Protein sequence

MTHLYGCSDNPFTSKFPFVARPFHCRLRLPISDKNRYYIRLVVFEPNTVEKEGDSVRFIESRDVSLRDHWISGIREHNSKX
Homology
[Close]
BLAST of CsaV3_7G018390 vs. NCBI nr
Match: KAE8645969.1 (hypothetical protein Csa_015496, partial [Cucumis sativus])

HSP 1 Score: 174.5 bits (441), Expect = 3.8e-40
Identity = 80/80 (100.00%), Postives = 80/80 (100.00%), Query Frame = 0 

Query: 1  MTHLYGCSDNPFTSKFPFVARPFHCRLRLPISDKNRYYIRLVVFEPNTVEKEGDSVRFIE 60
          MTHLYGCSDNPFTSKFPFVARPFHCRLRLPISDKNRYYIRLVVFEPNTVEKEGDSVRFIE
Sbjct: 1  MTHLYGCSDNPFTSKFPFVARPFHCRLRLPISDKNRYYIRLVVFEPNTVEKEGDSVRFIE 60

Query: 61 SRDVSLRDHWISGIREHNSK 81
          SRDVSLRDHWISGIREHNSK
Sbjct: 61 SRDVSLRDHWISGIREHNSK 80

[Close]
BLAST of CsaV3_7G018390 vs. NCBI nr
Match: XP_031744530.1 (uncharacterized protein LOC101207447 [Cucumis sativus])

HSP 1 Score: 174.5 bits (441), Expect = 3.8e-40
Identity = 80/80 (100.00%), Postives = 80/80 (100.00%), Query Frame = 0 

Query: 1  MTHLYGCSDNPFTSKFPFVARPFHCRLRLPISDKNRYYIRLVVFEPNTVEKEGDSVRFIE 60
          MTHLYGCSDNPFTSKFPFVARPFHCRLRLPISDKNRYYIRLVVFEPNTVEKEGDSVRFIE
Sbjct: 1  MTHLYGCSDNPFTSKFPFVARPFHCRLRLPISDKNRYYIRLVVFEPNTVEKEGDSVRFIE 60

Query: 61 SRDVSLRDHWISGIREHNSK 81
          SRDVSLRDHWISGIREHNSK
Sbjct: 61 SRDVSLRDHWISGIREHNSK 80

The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of CsaV3_7G018390 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
KAE8645969.13.8e-40100.00hypothetical protein Csa_015496, partial [Cucumis sativus][more]
XP_031744530.13.8e-40100.00uncharacterized protein LOC101207447 [Cucumis sativus][more]
BLAST of CsaV3_7G018390 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of CsaV3_7G018390 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of CsaV3_7G018390 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
CsaV3_7G018390.1CsaV3_7G018390.1mRNA