CsaV3_4G014700 (gene) Cucumber (Chinese Long) v3
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonpolypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.GGGGAAAAAAAAAGTGTTTTTTAGAGAGAGAAAGAGAAGAACTTGAATTTTGTACATCTTTCTATCTCTCTCTATCCAGAAAAGCCACAAGAGAGAAAGAAGAAAATCCACAGACCCTTAAGCAGTGCAGTAAAAAGCTTCTCTTTTTCTCTATCTTTCTTTCTGTTTGTTATTATTGTTTTTTTTTTTCTTTTGGGGTGTTTATTTCCAAGGTTTTTGGATCTCTCCAAGATTAGGATTTTGGAGTACCCCTTTTGGGTAATATTATTTGGAGTGCAGAGGGATTTAGGTAGGGATATAAATGGGAAGAGGGAAGATAGTCATAAGAAGAATAGACAATTCAACAAGCAGGCAAGTGACCTTTTCAAAGAGGAGAAGTGGTTTATTGAAAAAGGCTAGAGAACTTTCAATCCTCTGCGATGCTGAAGTTGGTTTGATCATTTTTTCAAGCACTGGCAAACTCTATGATTATTCCAGTTCCAGGTCAGATCTCTTTCTCTCTCTCTATAATTCTCCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTATATATATATATATATATATCTTTTCATAATTTTATCAACTGGGTTTTCTTTCTTTTTTTGTTTTTTTTTCATACTATTATGATTTTCCATCCCAATATTATTGGATCGAATAATTAAGGTTAAAAGAAATCAAACGATTGTAATTAACAATCAGAGGTGAAACATATGTATGTATATGTCTGTATATATGTGGTAATATATATCTTATTATTCAATATAATAATAACTTTTATAATTAGTACAGCTTCATGCTTGTTGATGTATTATTTGAATCTTCTTCTAAAAAATATAATTAAAATATCGTATGGGTGTGATAAATTATTGATGAGTTTGTTCTGCAAATGTATGAGATTGTTCGTTTAATTAAGAGAGGAAGAAATAGGAGATTCTTTTTGGTGTTTTCAAGTCATGGGGGAAAATTTTCAAATATTATGGATTATTTCTGCATGTTATTTTTAAATTTTAATTTTTGCTTATTATTATCATTTTGCATGGGCATCTTTGATAATATTATGGATCCATTTTATCTTATGCTGTACTGTAGTTAAAATTTCTTATTGGTTTTTTTTTTTCTTTTTTATTTATAGAAAAAGTAAAATTATTATTGTTATTATTCTTAATTCTCTCTCTTTAGATCTTTTAAATTTGTACCTTTCTGAAACTTCCGAGGAAGTGAGTGGTGGATGATTGATTCTCTTTAAAACTAAGAACATGCATTCGCCTTTCTCTTTCTTTTATATTCATTCATTTTCTTTTCGCCCCTTCAAATTTATAAGTGTGTCTGCTTTTTTTAATGTATATATATATACATACATATAGGCTGAATGTTTTGTTGACATCTTTTCATTTTTTAGCTTTTTGAAACATTGCTAATTGATGTTTCATATTTAATTTCAATTGTACATCTTGATCTCACTTTATGAGAATTATTATGAATGTGATTCTAGATTATTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATTCTTTTTTCTTCCTACCATCTCTACTGTTTTTGTTTTTGTTATTAGGGTATATATGTGTGTGTATGTATTATTATTATAAAAAAAGATAGGGTATATGTTTGCAGCTTTCTCATGTTTCCCTTTCTATATGTATATGGATTTTCCAATATATTCCTTCTTTTATTCTCTATTTATTTTCTCATAATCCTTTTCTAAAGTTCTCCAAAATATATATACTACATTTTTCTTGTCAACTTTGATAGTGTTTTAACCTATTAGGAGTATTTTCTTCTCAGTTATACATTGTTTGCCATAGTAAACACGTGCACATTCTTTATTACCTTCCCACTTGGTTTTAGTTTCTCCATTTTTGCATTATTTGGTTGCTGTGTGTTTCTATTTCAACTTTTTTTCTGATTGGTTTTTCTTTTGATATAAATATGCGTTGAGTGAAAGAATCTAACCTATAATTTTGAAGTTTATAAACCATTATTTTATGCGTTAATGAAATAAAAAAGCTTTGGAGAATCTCTAACCAAAGTTTGGCAATGAGATATAAATGTAGGTTGAGTGAGAGAGTAGAAATATGTATTACACATTTTTTTTTAGTTCTAACAAAATATGAGAGTTGAAAAGTGTAACATATGTGGTTTAGATGATCACATTTGTAATATCATTTAGATTATGTAAGTTTATAATATAATTTTATTTATGTTTAGTACAAGAGTAAGTAAGTATGAAATTAAATTTAATATAATATAATTTAACAAATTCCAAACAAATAAATAAATATATACAAGCTAAAACTTATACCCACGAGTCTTAATTTTTACTTCAATATTATTAAGAATAACAAAATTAAAAATCAGTTGGAAAAAGGTTATTTACAAATTAAAGAAAACTCATATGGATGCTTATTCATGTGTGTTCTTTAACAATGAGTTTTCCAATTATATATTTAGAATTATAAGACTATTTCACAGTTTATCTTTTGCATACTATTTACTTTGCTTTTAAAATTAGATATATTGGCAAAAGTTAAAAGAAATATTTTCAAATATAACAAAATAAAACAAAATATCACTCTATCTAAGATCGACCGTAGATAAAGTTTGTCTACATTACGATAGACAAAAAATAAATAGTAGTCTATTTTGGTCAATTGTAGTATATCACATCACATATTGGTCATCATATTTTGTTATATGGGTAAATAATTTTGGAAAAATTTTCAATTAAAATCTTTTTTTAGAAAGGTGACTTTAACATGTTAATTTTTGTTATATGAAATTGAAGATTTTTATCCCTATTATAAATAGAAATTTTTGTTAATTTTATATGGGACTTTGATATAAATATATTTTCTAGTTACTCTTGTAGCTTCAAATATGTATACTTTTCGCATTTAACAATAAACAGAGAATATGATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAAATTAAGATCATAAAATATAATTGAATAATTAATACCCCCTTAAGAAAACTACTTTGGAAAGTTTCTACTCTTCCTCAACATCTAGTAAGTATAGAGGAAGGATGAAGAGTGAAATTCCTCTTATGAAAAAGAGTAAGAAATAAATTTAGATTCACATCAGTTGTGATTTGGTACGTTTACGTGAACAATTATATATATAATCCAAGAGAATTATTACATAGTTTAAAGAAATAATTGTTTTAGTTCTTCAACTTACATTTGTTTAACTCTATTTATTCAAGGATGAGATTAGTGATAATAGAGAGTTTTAATGACTGGACAGCTTTTAATTTTGATAAAATAAATTTTCTTAAAAAACACTGATAACATATCCACTTAAATTTTGTTTGGATAAAAAGTTGGAAATGCACTCTACCCCTTATTATAATCCAAAAGAATAATTAAAATGGAACTCTTTTAGAAAATGTCATTACAATTATAGTAAAGTGAGAAAATTTAAATGACAAATAGAGAGAAGCTTATCTAATACTTTGTTTATCAATGTAGGTTTAAGTTGTAAGACATGGCAACTAAGGCAGAGACTAGACAAGTTGTACTTTAATGTTCAATATATTTTTTTCAAACAAGAAGTAAAAAGTTTAATGAGATCAAAGGATTAAAGTGGTGTTCTAACCAAATTATATACATCACTTCTTATTTATACATAGAAACAATTTCGATGGTAATTTAGGAACCTAACAATTGTTTTAATATTGGAAAAGACCTTGCAAGACTATAGTGTTTGACCACCAAAACACTTTGACAATTAAGTCATTATTAACAATTTAGAGAGATAGAGAGTATAGAATTCAGTCCTTTTGATTATATAGTGAAATGGTTCTAGGATGGTCACTCTTGACTAATTAATCTTCTAGTTAATTAATTTAATAAATACTTAGTCTAGTTATTACAAATGGATCCAAGCAAAGGTGGTTGGTATATTTGATAAACACTCGTCACACGTCACACTCATCCATCAAGAGAAATCATAGTGTTAAGGTCCATTATTTTTCTCATGGTCAAACAAGGTTCCTGAAGTTTATGAAATCAACCTCTATCGCCTTCTTAGTTAACTCCTATACCAATCGTCTTCCTAACTCTTATGGACAACCAAGCGGATCTTTTGACTAGAGTTGATCTCTTCAGAGTATATGGTTCTTAGTCAAATAAAGCTACTCACAATAATGATCCATGGATCAGTCCTTATAACTACTGATTAATTGTTGTATATAGGTTTGAGGCATTATACTACTAGCCGCGTTGTAGTAGCCTATTGAATACTTCGAAGCAATCACAAGAAAAACGTAAAAATGTGATAGCCTCAACTAACAATACACGAGAAAGTTACAAAAAGGAAACCAAAGAAAAACATCAACCTCGATCCTTCACCGATGACCTATAAAAGCTTGAGAACTTCCTATGGTTTGTTGCCAACCAATTAGTTGCCACAGCAGCAGAAAATAGGAGCTGTACAAGGTCCAAAATGACCTTTAACTTGAAACAGCGAATCCACCCTAACTTCATAGCCAAAGATCCTCAACCACAGAGAGATACCAAACGTTTGCTAGAAACAAGACCACGGTTGGTAACTTACTTCCTTCCAAGCACACCTGCATAAAACAACAGAAATATGTTAGGTTAAAACTTTTTATTGTTCTTTGTATTTTTAATCTTAAAGACATAATAACTCGTATGAACTTTTTTACTTGAGATTCAAACCATAAACATTTACTCTATAATGTCGTTTGTATTCTAATAATAATCTTCTTACATGAGGAACTGTTATATGGAACATATGCATTCTCCAGCTAGATGCAATGCAACCATATATCTCGAAGAAAAATCGAGGACCATTGTAACTCACCGATAACTTCTAGCCAGTTCTACCTTTATTTTTGGAAAAGAATATGTCATATGATGCTTCATCGAAATAAGATC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ATGGGAAGAGGGAAGATAGTCATAAGAAGAATAGACAATTCAACAAGCAGGCAAGTGACCTTTTCAAAGAGGAGAAGTGGTTTATTGAAAAAGGCTAGAGAACTTTCAATCCTCTGCGATGCTGAAGTTGGTTTGATCATTTTTTCAAGCACTGGCAAACTCTATGATTATTCCAGTTCCAGCATAAGGTCGATTACCGATCGATACAACAAGATGAAAGAGGAGCAAAATCAGCTGATGAATTCTGTTTCAGAACTCCAGTTTTGGAAAAGAGAGGCAGCTGCTTTGAAGCAACAACTGCATTACTTGCAGGAATGTCACAGACAACTGATGGGTGAAGAGCTATCTGGCCTGAGTGTCAAAGATCTACAAAATCTAGAAAGCCAATTGGAAATGAGTTTGAAAGGCGTCCGTGTGAAGAAGGAAAAGACTTTAAGTGATGAAATTACTGAACTAAAACAGAAGGGGAACCATATGCATCAAGAAAATGTGGAACTCTACAAAAGATTAGATATGACTCGTAAGGAAAATGCAGAACTGCAAATGAAGTACCAGGCCTATGGACCAATGGAAATAGATAAAACAAGCAGTAGCTCTCAACAATTCACTATCACCAATAGATACAGTATGCCTGCTCTACAGCTAAGACAGCCACAACCGCAAAACAACGAAACACCAGGAATAAAGCTGGGATTGCAACTTCAATAA MGRGKIVIRRIDNSTSRQVTFSKRRSGLLKKARELSILCDAEVGLIIFSSTGKLYDYSSSSIRSITDRYNKMKEEQNQLMNSVSELQFWKREAAALKQQLHYLQECHRQLMGEELSGLSVKDLQNLESQLEMSLKGVRVKKEKTLSDEITELKQKGNHMHQENVELYKRLDMTRKENAELQMKYQAYGPMEIDKTSSSSQQFTITNRYSMPALQLRQPQPQNNETPGIKLGLQLQ* Homology
BLAST of CsaV3_4G014700 vs. NCBI nr
Match: XP_011653447.1 (MADS-box transcription factor 23 isoform X1 [Cucumis sativus] >KGN53991.2 hypothetical protein Csa_011815 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 444.9 bits (1143), Expect = 4.4e-121 Identity = 235/235 (100.00%), Postives = 235/235 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_4G014700 vs. NCBI nr
Match: XP_031740009.1 (MADS-box transcription factor 23 isoform X2 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 435.6 bits (1119), Expect = 2.6e-118 Identity = 233/235 (99.15%), Postives = 233/235 (99.15%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_4G014700 vs. NCBI nr
Match: XP_008454454.1 (PREDICTED: MADS-box transcription factor 23 isoform X3 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 429.5 bits (1103), Expect = 1.9e-116 Identity = 229/237 (96.62%), Postives = 232/237 (97.89%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_4G014700 vs. NCBI nr
Match: XP_008454452.1 (PREDICTED: MADS-box transcription factor 23 isoform X1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 423.3 bits (1087), Expect = 1.4e-114 Identity = 226/236 (95.76%), Postives = 229/236 (97.03%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_4G014700 vs. NCBI nr
Match: XP_008454453.1 (PREDICTED: MADS-box transcription factor 23 isoform X2 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 413.7 bits (1062), Expect = 1.1e-111 Identity = 224/236 (94.92%), Postives = 227/236 (96.19%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_4G014700 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q6EP49 (MADS-box transcription factor 27 OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=MADS27 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 263.1 bits (671), Expect = 3.1e-69 Identity = 142/238 (59.66%), Postives = 188/238 (78.99%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_4G014700 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9SI38 (MADS-box transcription factor ANR1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=ANR1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 255.4 bits (651), Expect = 6.4e-67 Identity = 147/235 (62.55%), Postives = 182/235 (77.45%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_4G014700 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9SZJ6 (Agamous-like MADS-box protein AGL21 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=AGL21 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 235.3 bits (599), Expect = 6.9e-61 Identity = 129/229 (56.33%), Postives = 177/229 (77.29%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_4G014700 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q6Z6W2 (MADS-box transcription factor 57 OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=MADS57 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 232.3 bits (591), Expect = 5.8e-60 Identity = 134/243 (55.14%), Postives = 182/243 (74.90%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_4G014700 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: A2RVQ5 (Agamous-like MADS-box protein AGL16 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=AGL16 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 227.6 bits (579), Expect = 1.4e-58 Identity = 127/226 (56.19%), Postives = 173/226 (76.55%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_4G014700 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BYM8 (MADS-box transcription factor 23 isoform X3 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103494854 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 429.5 bits (1103), Expect = 9.2e-117 Identity = 229/237 (96.62%), Postives = 232/237 (97.89%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_4G014700 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BY64 (MADS-box transcription factor 23 isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103494854 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 423.3 bits (1087), Expect = 6.6e-115 Identity = 226/236 (95.76%), Postives = 229/236 (97.03%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_4G014700 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BYR5 (MADS-box transcription factor 23 isoform X2 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103494854 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 413.7 bits (1062), Expect = 5.2e-112 Identity = 224/236 (94.92%), Postives = 227/236 (96.19%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_4G014700 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1FUQ5 (MADS-box transcription factor 23-like isoform X2 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111447042 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 398.7 bits (1023), Expect = 1.7e-107 Identity = 215/238 (90.34%), Postives = 227/238 (95.38%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_4G014700 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1JL93 (MADS-box transcription factor 23-like isoform X2 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111487792 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 397.1 bits (1019), Expect = 5.0e-107 Identity = 214/238 (89.92%), Postives = 227/238 (95.38%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_4G014700 vs. TAIR 10
Match: AT2G14210.1 (AGAMOUS-like 44 ) HSP 1 Score: 255.4 bits (651), Expect = 4.6e-68 Identity = 147/235 (62.55%), Postives = 182/235 (77.45%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_4G014700 vs. TAIR 10
Match: AT4G37940.1 (AGAMOUS-like 21 ) HSP 1 Score: 235.3 bits (599), Expect = 4.9e-62 Identity = 129/229 (56.33%), Postives = 177/229 (77.29%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_4G014700 vs. TAIR 10
Match: AT3G57230.1 (AGAMOUS-like 16 ) HSP 1 Score: 227.6 bits (579), Expect = 1.0e-59 Identity = 127/226 (56.19%), Postives = 173/226 (76.55%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_4G014700 vs. TAIR 10
Match: AT2G22630.1 (AGAMOUS-like 17 ) HSP 1 Score: 224.2 bits (570), Expect = 1.1e-58 Identity = 123/225 (54.67%), Postives = 168/225 (74.67%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_4G014700 vs. TAIR 10
Match: AT3G57230.2 (AGAMOUS-like 16 ) HSP 1 Score: 189.9 bits (481), Expect = 2.4e-48 Identity = 115/229 (50.22%), Postives = 161/229 (70.31%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucumber (Chinese Long) v3
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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