CsaV3_3G033830 (gene) Cucumber (Chinese Long) v3

Overview
NameCsaV3_3G033830
Typegene
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. Chinese Long (Cucumber (Chinese Long) v3)
DescriptionUnknown protein
Locationchr3: 28940710 .. 28945094 (+)
RNA-Seq ExpressionCsaV3_3G033830
SyntenyCsaV3_3G033830
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGAAGGCCAGAACTAGAAGGTTCAAAACTAGGTATGATTTTTTTGTATATCGCTAAAAGAGGATTGCATAATAGTAGAAATGTAAACTGACTTGGTGGACTCTAATTCTACCACCGACGTCGTGTAACACAATTGTGTCATAATTTAAATAGAGACATTGTATCATCTGTGTAATCGTTTTGGAACTGCATCTATGGCATTGCTATGTATATCCTTCGTGTTAGGTGATGCAAAAGATTGGTAAAAAAGTTCTTGAAAATTTGTTCTTTAATGTTTTGATAACGTTGCTAATTTTTAAGTCATCTTATAGTTGGTTGTTTATGAGGTTGAAATTTTGCCCTAGATACATATTCCTTCCCTCGAAAAACTATTTTGGTTATAGAAGCACTTGTTTATGTTATTTATAATACCTCACATAGAAAGTAGAGTCAAACTTTGCATGATATAACCGTTTGCTTTTGTGAAAATGTGTAAATGATAGATGTTGGGAACTTAAGATGTTCGACATCTTTGGATAACTATGTTTATTTTGTATAAACATTGTTTTTCAGGTATTTGGTTAACTCTAATTGGTTCGTAGGTTTTTTACTCTAATTGGGTAAAGCCATCAAGTTAATTCTCAATAAAGTTGTTGTCATCTTCATGTTTCATACTAAAGATCCCACAAACTGGTGCAAACACCACGAAAGGTAATTGAAGAATCCATCTTTATGTTATAGATGAAACGTCTGTACAAAGGGTAGCACATGACTACGGCTAGAGAAGCAGAAAGCAAGGCTGTGAATACAGACGTTTCAGTTCTACTTGGACCTTCCTCTTGCCAAGAACTCTTGTACCCTTGTACACACCAAATTATTGTTAAGGAACCAAATATTTATTTGAATATAACACAAAAAGAACCAATGGCAAAAGTTCTTTAATTTAAAACATGAAGTCGAATCCCACGCTTCCATCCAAAACTTGTATATATTTACTTTTCTTTCTAGGTTGTCTATAGTCTTCCATGTGTGGTATTTCCAATTTCATTTCTATAGTCAAACGTTCTTTTTCCTATACCCATATCCACAACAATTCACATCATACCTCAAATAAAAACTTAATTCAATAGGCAAGAAAGAGGTTTTATTTCGTTCGTTACGTTTCTTTTTCACTTCGTCTGTTTAGGCTATCTTCTTCTTGTTGCCTAAGTTTTCACTTTAGTTTGTCTTCCCCAGTGTCCTTTGCACTTAGTACAATACTCGTGGATTTTGACCTTCAAGTCTCATATGTTATCATTAAAAAAGAGTGTCTTTTTTATGTCTTTCTTCAGGCCAACGTTTTTTTCCATGTCCAAAGCAAATGTTCCTATTCCATAAATTAAAACTTAATCCAATAGGCTAATCTAACCTAATGACTTCACATATGATATTTTGATTCATTTGATATTCTTTTTATAGAAAAAAATGGCCCCATTCTTTCTATAATAGTTATAATTATTTTGAATATTTAATAAACATATTTTTGCAATCTTGGACAACGTCACAATGCCAAGTTTTCTCTTCTCTTTGGTTAGAGGAAAAGAAAGGCATTCCATAGGCCATATCTTATAGAGAGAGGCTATGAATGTCATTTTCACACTCCAAAAACTGACATTTTCAAAGCTAAAAACAGAGAAATTAAGTGAAAGGAGGCCCCATTTCCCAAAGCTATAGTCATTGGGAAATTACAAAACAATGCCTATTTTTCTTCACTGTGAATTTCGAGCCATTTGACTTTAGGTATGATGGTTGTCCTTGCTTTTGTACTTCTTTTGAAAATTGGTGATTGTTATTTGTCCACAATTTACGAATTTAATTAGTTGGGTTTGTGAAACACTGTCGTTTTGAAAGTAACTCTGGCACAATTGCGTGTAAGTATGTTAATTAAAGTATTCAAAAATTATTCAACTATAGTCCTAATGTTTGGAGATAGACATAATTGATACTTGAAAAATTTAGAGAAAACATCTTATTTTATTATACAAATGTTTTAATTTTTTAATTATTATCTTAGATCGTCTTTTAAGACAATTTTAACTTTCATATAATTGTTTCTAAAAATAAAGAATCTAAAACGTAACTTCCTTTAATTATTAACAATTAAATTTATTATATCACTGTAACTTCTTTAATTATTAATTTATATATATTTGAATTTATTAATGTAATATTTATTAACTTTGCAATATTTAGATAAATTTTAGAACTTATGTAGTAATAATATTTTTAATTGTTTTTTAGTATAATTATTTTCAAATTTAATGTTCAAGTAAAAAGTTTTTTTAAGCTATCATCAATTTCGGCATCCATTTTCAAATTTGATTTTTGTTCTTTCTTCTTCTTCTCTCTCTTTCCTGATTTTGAATTTGTTAGTGTTTCGTTCATTTGTTGAAACTTATATTATTTATTCTTTTCTTTCTAAATATATTTTTTTTTTCTAAAAAAACTGTTCTTTCTTCTTTCATTTCGTAGCATGAATTTCGGTAATGTTCAATATATCATACACGGATTATATATTTATTGTGTTCTTTTTTTTCTTCACACATATGGTACTGAATAATACATTTATGTTATGTATTATGTTTCATCAATACTAGTGCTTATATATTTTTTTAGCTCTGTAATCTTTTCTTATTGAATTTATATACCACTGCATACACATATTAATATTTTTTTAATTATTATATATATACTACTGCATAATACATATGATTTGTTATATATATACTACTTCATATATTTAGTAATATATAAATCATGTCAATAATACGTATTCAGTGACAAATATAAGTTCGTTGTTTTATTTCAGACATAAGTTCATTATTTCATCACATATTCTTTTCATGTTTGAATTTCAATACCTTCTTATATACTACTGAAAATTTTCGATAACACATAAATCTTAGTTAAAGTCCTAATAATGTATGATAAGATTTCAATACCTTTTTATATACTACCGCATATATTCAGTAATATATAAATTGTAGTTGAATTTCATTATATATCACTGCATACACATGTGAGGTTATATACATGCGTATATATACAATAACATGTATTTAGTGACATATATAGTTTTGTATCATTTTCTTTTAATTTTTTCTCTCTATTCTATCAGTATTTTCTTTTATTTCTACTTATATACTACTGTAGAATACGTTTATGTTATGTGTTTTGTTACAAATATACTACTGCATATATTCAATAATACATAAATTGAAGTTGTCATTTTTCCATCGAAGGTAAAATGTTTAGTGGGTCAATTAAAAAAGATTAGATTTTCTTTTAAAATAGAGTCTAAGAGATGCATTAAATGTCGTCGTTGTAGATATGTTGGCCATAACTAAACGAGATGCAAGTTTTCCTTGTCGAACAAACTAAGTTATTTTAGACTTTTAATTGAAATATTCATATTTTAGTTTTTAATTCAATTATTCTATTTTCGTATTTTTTTATAAATTTCCATCTACTATGTATATAATCACATATATATGTGGGTTGTGGTTGCTTGTCTATTGTTGTCTTTCTTTTTAATATACTACTTCTCTATTCCACTCTTGAATTCTTTGAGTACTATTATTCAAATTACACAAAATTATCACATTTAGAAACCTTGAAACTAAACTTAAACTTAAATCTAAGGATGGAAATGGTATTTTACCTAAAAAGTTATTAGTCCATTCAAATATAATTGAATATCTAAATCATTAATTACCATTTAAAGAAAAAACAAATAGTTCTAGTAGCCTCCAACAAACAAAATCATACAACCATAAAACAAAAATTTAAAACTTGAGATCTCATTTTTGTAATTGTTTAATGTTTGAAAATGAAAGTTCCTTCCTCTATAATTTTTCTCTAATTGAAGCTTGATTTTTTGAATAAATTGATTAAAGGAAAAAAAAAAAAAAGAACTTTAGGAAAAAAAAAACATATTTGTGGATTTATAATAATAAAACTAATTTTATCTCATAACCCTAACTCTTCCATAATCCCAATATTTCTTCATTACATTTGAATTTAAACAATTTTTAGATGTTTAATTCAATGGAAACGAAGCTTAATTGTAAAAACACAACAAACCAAATTAACAAATTCTCATATGAGATAAAGAAAAGAAAACAGAAATAGAGAAGTACTTTTGGTTTCTTTATCAGGAACGAATATCTTTTTATTGTCATTAAAATTTGTATTGTTTCGGGTGGGACCCGTTGTTTTCATCTCCAATAACGCCACGTCATGCTCGAATCTTCGCACGAAAAGATATAACAAATAAATAAATAAAATTGTAAAAAAGTTACTTAAGTGTGGGGTCCGCTTCATATACGGATGAGAATGAGTCGTGCATGCTTGCCGCGTTTCACTAA

mRNA sequence

ATGAAGGCCAGAACTAGAAGGTTCAAAACTAGGTATTTGGTTAACTCTAATTGGTTCGTAGCCATCAAGTTAATTCTCAATAAAGTTGTTGTCATCTTCATGTTTCATACTAAAGATCCCACAAACTGGTGCAAACACCACGAAAGTTACTTAAGTGTGGGGTCCGCTTCATATACGGATGAGAATGAGTCGTGCATGCTTGCCGCGTTTCACTAA

Coding sequence (CDS)

ATGAAGGCCAGAACTAGAAGGTTCAAAACTAGGTATTTGGTTAACTCTAATTGGTTCGTAGCCATCAAGTTAATTCTCAATAAAGTTGTTGTCATCTTCATGTTTCATACTAAAGATCCCACAAACTGGTGCAAACACCACGAAAGTTACTTAAGTGTGGGGTCCGCTTCATATACGGATGAGAATGAGTCGTGCATGCTTGCCGCGTTTCACTAA

Protein sequence

MKARTRRFKTRYLVNSNWFVAIKLILNKVVVIFMFHTKDPTNWCKHHESYLSVGSASYTDENESCMLAAFH*
Homology
[Close]
BLAST of CsaV3_3G033830 vs. NCBI nr
Match: KGN59026.2 (hypothetical protein Csa_001757 [Cucumis sativus])

HSP 1 Score: 151.8 bits (382), Expect = 2.3e-33
Identity = 71/71 (100.00%), Postives = 71/71 (100.00%), Query Frame = 0 

Query: 1  MKARTRRFKTRYLVNSNWFVAIKLILNKVVVIFMFHTKDPTNWCKHHESYLSVGSASYTD 60
          MKARTRRFKTRYLVNSNWFVAIKLILNKVVVIFMFHTKDPTNWCKHHESYLSVGSASYTD
Sbjct: 1  MKARTRRFKTRYLVNSNWFVAIKLILNKVVVIFMFHTKDPTNWCKHHESYLSVGSASYTD 60

Query: 61 ENESCMLAAFH 72
          ENESCMLAAFH
Sbjct: 61 ENESCMLAAFH 71

The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of CsaV3_3G033830 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
KGN59026.22.3e-33100.00hypothetical protein Csa_001757 [Cucumis sativus][more]
BLAST of CsaV3_3G033830 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of CsaV3_3G033830 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of CsaV3_3G033830 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
CsaV3_3G033830.1CsaV3_3G033830.1mRNA