CsaV3_1G044390 (gene) Cucumber (Chinese Long) v3

Overview
NameCsaV3_1G044390
Typegene
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. Chinese Long (Cucumber (Chinese Long) v3)
DescriptionUnknown protein
Locationchr1: 29730274 .. 29734984 (-)
RNA-Seq ExpressionCsaV3_1G044390
SyntenyCsaV3_1G044390
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGGAAAAACTAGGCCAAAGTAGAAGTTAAATGTTAAGTTCGGGGCATTTTGGTCATTTCTCATTATTATTATTAATTTCTTCTTCTTCTTTCCTTTCAGTGAGTTATTTAAAAGAAAAAACGAGGGATAAAAGGAGTTCGGGAAACTTCACGAGTGGCAAGCGCTCATCTCTTCTCTTGGAGCCATTTGTCATTACCTCGTTCTCTCTCGATCGCCGAACACTATTTTCACTTCCCTTGCACATTAACCGCAACACACGTCGGAACAACATCACACCCAGTCGTTATGCGTTGCATTTCTCTCTCACTCTTTCACACCGACTCCACCAGTCATTGTGCACCGCTCGCCTCGCCAGACTTGGTCGCTACTCCAGTTGCGGTTTTGATCTGTCGTTCTGTCCAAGTTCTTCAAATTTTGTTGCCAGTCCAGCTACTCTAACACCCAGTCACCATTCGTCACTATTTTGGAGCTGTATCGCCATTAGCCTTGCTCTTTTTTGACCATTTCACCTCAAATTTTAGATTAGGAGTAAGTTTCATTGTTTTACTTGGATTTTTTTTTTAGATTTTCGAATACCCATTAAAATTTTGATTGAATTACACATTACCCATAACGTTTTAATGCTAGATTTGAGTTTTAGAAGAGTTTGAGATGCTGCCCAGCCACTCAAAAGCTCGAATTTAGGCGTTTCGGCACCACTTGGGTAAGGTTCAAAGTTTTGGGGTTGACCTTGAGTACCCATCTAATCCTCGTGATAGTATTGGTGTAATCTGGGATGGTGTATGCTTGTTTGTGAATTTAGAAAGTGGTTAGGATGTTTTCCATTGAAGTTAAAGTTACTTTGCTAAGTTCTTGTTGAGGGTCAGAGTGATTTAAGTGTGTTTTCTTCAAGTTCACAAGTGGCTATTGAGTCTAAGTGTTAAGATTAAATTACCCATAGTACTCGGGTTCTAAAGATAAATGTTAGAGGTTGAAATTGAGTTTTTCTTTAACTTGGAGTATGCTTGGGTGTTTACTTCTATGAAGTTCGAATTATAAAATGAATTTTGGTGATTTTAGGAAGTGTTTGAGTTGTTTGACTCATAGTAATATATTGAGTATAAATCCCAAGCATCATCAATAATGGAGGTAAAAGTGTATCTATATAAAAGAATCGTTGAGTTTTGAACTAAGTTAGGTTTGAGTTAAGTATCTAGATTTCGAGCCCAAGGGTTCGTATGTGGAAAGTTTAGTCTAATCCTAAGCGCTTTGTAAATTCAAAGACCTTAGAAGCATCAAATATATTTTGGTGACCTTGTGAAGTATTTTACATATAGTTGTAGCATCATGTCTTATGAAGATAACTAAGAGACCTTGATCGTTGTTTCAAGCCAATTTATTGTGGGGAAAGCGTATAACCTCGGGGGATTGAGTTATTGATTGTGAGTGGCTCATTTTTAAGTTTTCTTTGAATTTGTACATGTCATTTTATGATATCACTTGAAAACTACCATGACTTAAACTTTTTATGACTATGTGTTTCATTTATACTTAAGCAATGTGTTTACACTCATCAAAATTTTAAGAATGTGTATGGCTTGAACTTTATAAAAACGTGATATAAAGTTTCTGATTGTACTTGTTTTTTTTAAATATGATTGATCGATATGTTTATGATGAACGAGAAGGTGATTTCCCTGAGGCTATGTGAATGTCTTTTCCATAGCACCACCTACGTTGTTAGGGGGTTCCGAAGCAAAAAGAGGTTGTGATCGGAGATCCAAGAACCTGAGCCTTGATGTGGATATGGATGGAGGATTGAGATATGGCTTCAAGCCTAATTTAACACTATGAGCGAATGTGTAGATTGTTACTGTGGTGGGTACTAAGTATGGATGAGCTCAGTTTGGCAGCGTGTGTTCTTGTGGATATGAATCACGTGTGAGCTATTCTCGATCGTTATTAATAAAGTGTTATTATTGTAATTTCAGTAAATGTTATTGATTATATTTTTAGTTTTGTCTAAATAAACCAAATCCAATAAACTAACATTCTAAGTTGTTTGGTAAGTCATGAACAATATGTAGAGACATAAAGTGATTAATGTTTGAGATCAGCTTAAAGGGTCTATAGTATAGGGATAATGTTAGGCACCTTATTCTAGTAACACTATGAATACAACTCACTTTTGTATTTGCTACAAACACAATGATTCAAAGTGTTTGTGAATGTGACATGCGAGTGAGGGTATCTTATATAATAAGTTTGCATGAGACCAAACCACAAAATAGTAACCACTAGATGTAACTTTGTTAACTAGTTAGGTTTCTATTTCATTAGGATGACCTAGGTAACTTAGTTTTAACCCTGAGTGTATTATGAACTCCCGTTAGTGAGGAATTGTCCTTTGATTTGTACGGGTGGGAGTGGCCAGATTGTGGACTCAATATGATTTTCATTTTGGAGACAAGATCGAGTGGAGAGTTGGAAACATAATCACACAAGATGGAATTCACTCATTTCCGACTATAGGGTAAGTAGATGAGTGTTCCCTTAAATGGTGTCTTCGAGACTTGAACAAAGGGTTCTACCCTCTCTATGACACGAGAGGAGTTTCTATTTATTAGTGGACCATAAACATGTTGTTCATTCGAGGAGCACTAGTATTTAAAGGATTAGAGGTAATCTCAGGATAAAATGGTAATTTTAGCTAGTTGGTGTTACAAACATTCTTGAAGGATTAACTTGATATTATAATGTAAGTAAAAATCTGGAGGTCATTTGTTTAAGTCCCGGAGACACCATTTAAGAGAACATTCATCTACTTACCCTAAAGTAGGGAAAAAGTGAATTTCATCTTGTGTAATTATGTTTTTAGCTCCCCACTCAGTCTTATCCTCAAAATGATAAGCTTATTGGGTCAGCGATCTGGCCACTTTCACTCATACAAATCAAAGGATAATCTCTCACGAACAAGAGCTTATAATACACTTAGGATGAAGACTAAGTTACCTAGCTCATCCTAATGAAACAGAAACCTAACTAGTTAACGGAGTTACATCTAGTAGTTACTATTTTGTGGTCTGGTCTTATGCAAACTCATTGCATAGGATACCCTCACTCGTATGTCAACTACACGAACGCGTTAGATCATTGCATTTGTATCAAATACAAAGTGAGTTGTATCCATAGTGTTATCAAGATAAGGTACTCAGCCTTATCCCTATAATGTAGACTGTTTAAGCTAATTTTGAACATTGATTCATGTATGTCTCTACATACTGTTTCAGATTCATCAAACAACTTAGGATGTTAGTTTATTGGATTTAGGTTATTAAGAAAAAACTAATAATATAATCAATAATATTTATTGAAATTACAACAATAACACTTTATTAACAACGATCAATGGATTATATTTACAGTCTACGAGTTTTAGGACATAAATTCCAACACTATTCTCATCACTTAGTCGGTGCATGTCGTCAACTACCCAAGAGGGCAAGTAGCAAGGACAAGACTAATGCACAAGGATGAGTTTGGCGATAAACTCCTCCTTGGTGAGAGGACTCACATTACTTGTATCCTGAAAGGTGAGCAAGTGTGGACATGTGGTGTCGAGAGGTTCCCGTTCTTAACGTGGGGCGCTATAAGTAGTATAAATGACCACTTCTAGAATTATATCACTTTGTTAAGTTAGTCACATGGATCCTGACAGGCAATCATGTAAAGGTGTTTAATGACTCTAAAAGGAGCACGCCTTAATCATAAGATAAATAAGTAAATATATTTCGCATCAACACTATCACATGGTCAATTATATAATAGTGCATAGACTTTCCTTCACCTTCGTATCACATACAAGTTAGTTCACACATTTATCTTGCATTCATTTCCACCCATTATAGGTTCTCTAGGCATATTTAAGTAATGTTATTTCCAGTTACTTTTAGATGTTAATTGTTTATTCTTTTATACCGCATAATTGAGAAGTAGATCATAAAACTAAGTTTTGATATCAATTCTCTCTGTTCAACCTTGGTTCAATTAGGAAAACATGTTTTACTTATACTTGGGCAAGCAGCAGGAAAGCTTATACGCGATACAAACTTAGTAATCATGATAAAGAGGAACATAGTGAGTACTTCGTATACAATGATCATGGCCAATGACTTAGGGCATAGAACTAATCATGCTTATATACATAGAAACCTAAGTCTTAACGCTTTCTCCTTATCGTGCAACATCCAGCTTTAGGTTTGTTGGTTTGTTGGTTTGACTGGTGGTTATGTGATGATGACGTTTCAACTAGTATTTCATTATTGATGCATATTTACACATGTTCTTTTTTAGCATGTTTTACAAGTTTTTACTTCTAAGAACTTGCCACTCACTGAATTTTTAGCTTACGTTTTCAATGTTTTCTACCCTCCAGCACCCCCACATCAGGTAGTGATCAAGGGCCAAACGTTGTAGACCTTCATTTTGTATGGATATAGTTAACTTTTGCATTGCATCATGAGGTAGTTAAATGTAACAAGAGTGACGCTAAGGACTTGTATTTTGAGAGATCCCTCATTAGACTAAAATTATTTTGTATGTAATATTTAGTTTGAATTTTAACTCTCCTTGAAACTTTGAAATTTTCCGGATGTGTGTGGTGAGACACTTGTTGTGTTGGGAGATCTAAAGTATCAATTTACATACATATAGAAGTTAAAAATCTCTTCC

mRNA sequence

ATGGAAAAACTAGGCCAAAGTAGAATGAGTTATTTAAAAGAAAAAACGAGGGATAAAAGGAGTTCGGGAAACTTCACGAGTGGCAAGCGCTCATCTCTTCTCTTGGAGCCATTTGTCATTACCTCGTTCTCTCTCGATCGCCGAACACTATTTTCACTTCCCTTGCACATTAACCGCAACACACGTCGGAACAACATCACACCCAGTCGTTATGCGTTGCATTTCTCTCTCACTCTTTCACACCGACTCCACCAGTCATTGTGCACCGCTCGCCTCGCCAGACTTGGTCGCTACTCCAGTTGCGGTTTTGATCTGTCGTTCTGTCCAAGTTCTTCAAATTTTGTTGCCAGTCCAGCTACTCTAACACCCAGTCACCATTCGTCACTATTTTGGAGCTGTATCGCCATTAGCCTTGCTCTTTTTTGA

Coding sequence (CDS)

ATGGAAAAACTAGGCCAAAGTAGAATGAGTTATTTAAAAGAAAAAACGAGGGATAAAAGGAGTTCGGGAAACTTCACGAGTGGCAAGCGCTCATCTCTTCTCTTGGAGCCATTTGTCATTACCTCGTTCTCTCTCGATCGCCGAACACTATTTTCACTTCCCTTGCACATTAACCGCAACACACGTCGGAACAACATCACACCCAGTCGTTATGCGTTGCATTTCTCTCTCACTCTTTCACACCGACTCCACCAGTCATTGTGCACCGCTCGCCTCGCCAGACTTGGTCGCTACTCCAGTTGCGGTTTTGATCTGTCGTTCTGTCCAAGTTCTTCAAATTTTGTTGCCAGTCCAGCTACTCTAACACCCAGTCACCATTCGTCACTATTTTGGAGCTGTATCGCCATTAGCCTTGCTCTTTTTTGA

Protein sequence

MEKLGQSRMSYLKEKTRDKRSSGNFTSGKRSSLLLEPFVITSFSLDRRTLFSLPLHINRNTRRNNITPSRYALHFSLTLSHRLHQSLCTARLARLGRYSSCGFDLSFCPSSSNFVASPATLTPSHHSSLFWSCIAISLALF*
Homology
[Close]
BLAST of CsaV3_1G044390 vs. NCBI nr
Match: KGN66656.1 (hypothetical protein Csa_007126 [Cucumis sativus])

HSP 1 Score: 275.4 bits (703), Expect = 2.7e-70
Identity = 141/141 (100.00%), Postives = 141/141 (100.00%), Query Frame = 0 

Query: 1   MEKLGQSRMSYLKEKTRDKRSSGNFTSGKRSSLLLEPFVITSFSLDRRTLFSLPLHINRN 60
           MEKLGQSRMSYLKEKTRDKRSSGNFTSGKRSSLLLEPFVITSFSLDRRTLFSLPLHINRN
Sbjct: 1   MEKLGQSRMSYLKEKTRDKRSSGNFTSGKRSSLLLEPFVITSFSLDRRTLFSLPLHINRN 60

Query: 61  TRRNNITPSRYALHFSLTLSHRLHQSLCTARLARLGRYSSCGFDLSFCPSSSNFVASPAT 120
           TRRNNITPSRYALHFSLTLSHRLHQSLCTARLARLGRYSSCGFDLSFCPSSSNFVASPAT
Sbjct: 61  TRRNNITPSRYALHFSLTLSHRLHQSLCTARLARLGRYSSCGFDLSFCPSSSNFVASPAT 120

Query: 121 LTPSHHSSLFWSCIAISLALF 142
           LTPSHHSSLFWSCIAISLALF
Sbjct: 121 LTPSHHSSLFWSCIAISLALF 141

[Close]
BLAST of CsaV3_1G044390 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0M357 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_1G654850 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 275.4 bits (703), Expect = 1.3e-70
Identity = 141/141 (100.00%), Postives = 141/141 (100.00%), Query Frame = 0 

Query: 1   MEKLGQSRMSYLKEKTRDKRSSGNFTSGKRSSLLLEPFVITSFSLDRRTLFSLPLHINRN 60
           MEKLGQSRMSYLKEKTRDKRSSGNFTSGKRSSLLLEPFVITSFSLDRRTLFSLPLHINRN
Sbjct: 1   MEKLGQSRMSYLKEKTRDKRSSGNFTSGKRSSLLLEPFVITSFSLDRRTLFSLPLHINRN 60

Query: 61  TRRNNITPSRYALHFSLTLSHRLHQSLCTARLARLGRYSSCGFDLSFCPSSSNFVASPAT 120
           TRRNNITPSRYALHFSLTLSHRLHQSLCTARLARLGRYSSCGFDLSFCPSSSNFVASPAT
Sbjct: 61  TRRNNITPSRYALHFSLTLSHRLHQSLCTARLARLGRYSSCGFDLSFCPSSSNFVASPAT 120

Query: 121 LTPSHHSSLFWSCIAISLALF 142
           LTPSHHSSLFWSCIAISLALF
Sbjct: 121 LTPSHHSSLFWSCIAISLALF 141

The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of CsaV3_1G044390 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
KGN66656.12.7e-70100.00hypothetical protein Csa_007126 [Cucumis sativus][more]
BLAST of CsaV3_1G044390 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of CsaV3_1G044390 vs. ExPASy TrEMBL
Match NameE-valueIdentityDescription
A0A0A0M3571.3e-70100.00Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_1G654850 PE=4 SV=1[more]
BLAST of CsaV3_1G044390 vs. ExPASy TrEMBL
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucumber (Chinese Long) v3
Date Performed: 2021-10-25
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 1..24
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 1..26

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
CsaV3_1G044390.1CsaV3_1G044390.1mRNA