CsGy5G009290 (gene) Cucumber (Gy14) v2.1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: five_prime_UTRexonCDSpolypeptidethree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATTCATTCTAAATGAGTGCTTTCGGCATGTGAAGTAAACCTCCCTAAAATGAAAATTGGTCCTCTATTCTATTTACGTAATTAACAAAAAAAAAAGAAAAGAAAAAAGAAAGAAAAAAGGAAAAAAAAGGAAAAAAAAGGAAAAAAAAGGGAAAAACACTTTTACGTGAACTCTTTCGCACAGTATACGCCGAACGGCGGTCGTTCCTTTCGTCTTCTTCTTCTTCATTTCTAACAGTCTTCACCGCCGGAAAATTCTCTCAACTTCTCCCTTACAGCATGAAGCGCGTCTTCGAAGAAATTTCCGACGAAGAGTGGTCCAATCACTCCTTCAAGCCCTCTCGCGTCTTCACAAAACCACAGACTGAACCTTCGATCCCTCCTCCGATTGAATCTTTCGCATACCGACCCCACCAGCTCTATATTTCCGACGAGAGTAGCGACGATTGTGTCGTAGTCATGGAAAGTTCCAAAAATTATGAGGAAAATTTGGAGGACGAGGATGTCGAGGTTGAGGGAGTGAAATCCACCACGGCAGTGAGTCGTGGCCGTCGGTTTGTGGTTGATGACGAAGATGATGAAAGTGAGAGGGAATTGACTGAGGTTTGTGATGTAAAGTCGACGAGCGAGGAGGAGCTGGAGGAGGGTAGGGAGGATGACGATGATGTCGTCGGTAAGGCTTTGCAGAAGTGTGCAAAATTATCTGCCGAGTTGAAGAGAGAGCTGTACGGCTCTTCGGTTTCTGCCTCTGAACGATATTCAGAAGTGGAGTCTTCTTCCGTTAGGATAGTCACCCAGGTACATCTCAGAGTTCAATCTGAATTGGAGCGCTTTTATTTCCTCAGCATAATTATGGATTGATGTTGAATGGTCTTCTTGCTCGGTTTTGTTTTGTCCCTTAACAGATTTAATAGTTTTTGTTTAATAAGTGGATGCCATAAATCAACATCTAACCCTTTTATGATCCGTTAAATGTGTATATTGTTTGTTCTTTTTGTAAAACGAACCTCACAAGGAGAAATGAAAAAAATGAACAAGAACAAAGCCCGTACAATTGAGCCAAAGACTTTGCAGGATAGAGCTTCAATTGTTGCCATTTTTTTTTTGTTTGGTATGAAATAATTTTATTAATGTTGTGAAATTTACAAAAAAAAAAAGAAAAAGAAAAAAAAGAGGAGAATCTTCTTAGAGATGACAAGAGGTTTCCAATTTGTTTAAAGGGAAGCATAGGTATAAGACTTAAAGGAAGTTGGCACTGTACACCAGGATATAGCAAGATAAATTACCTGATCATAAGACCTATTGCAAGCATGTTTCTTATAGTAGACAGAATTCTTTTATTTCTTTTCATCTAAAAGGTCCCAAAAGAAAGACATAAAAATGTGCAACCACAACAATGCCTCATCCTTCTTTAGAAGGTGGCCAGAGAGGATGGTGAAGCGAAGGGTCTTCATGTCAATAGGGAGGGTCATCCCTCTTGACGATCTTCAACCTTTTACTCCAATTTTTCTGGTTTGGAGATTAATATGGCGAAGTGCCAACTCTTGGGGTAAATTGTCATTTGAACACAACTTGGGGTAAATTATCATTTGAACAAGGTGGGTAGGTGCGTTGATATGGTTGGATGTGAGGTGGGGTCCTTCCTTTATCTTGTCTTGGTCTTCCCGCTGGTCATAGCTTAAAATGTCTAAAGTCTTGGGATCCTGTGGTGAGTAAGAGTAAGATTTGAAAGAAGTTGGCACTTTGGAAGGGGGTTTTTGTCTCTTGAAAAGAGGCAGGATCCTGATCTAGTATTTCTATGTTTTGAGTTGGATTCCAACCTACTTCCTATCTCTCTTCAGGATTTGGTGTCAGTTTGTAAACTTTAGAGAAGATCAGGAGTGATTTCCTTCAAAATGATGGTGGAGGAGAGGAAAGGGGCACACTTAATAAATTTGTGCTGTCCTCTTTTGAGTTGATCCTTTATCTCTCTTTCTTTTCCTAATTATAAGTGAAGTCCTTGTGCTTTTGTTTCTCGAATTCATGAGAATGGAGTTTTTGAAGGTCTCATGGTGGAAAAAGATAAAATTCACGTCTCAATTTCGCAAGAAACAACTCTTGTGGTTGGATGATCCACTTTTATTCTGCAAGTATAATGAAGCTATGTTGGATATTCTGATCCAAACTATTAGGTTCTTTGAATGGTGCTCCGGACTCAAGGTAAAGGAACAAATCATTCTTCTGTGGTGTTAATGTTGATGATAAATTTATGCTTTCTACCTTCTCCATCTCCAAGCTGAAATGTAAAGCTGAAAAGCTACTGTTTTTGTATTTGGGTTTCACTTTCGGTGAGATATCCAAAGCAACTATCTTTTTCGTGGCTAATTATAGATAAAGTTTATAAAAAGCTAGACAGATGGGGTGGGGGCAGTATATTCGCAGGAGGTTGATTAACTTTGAGTAATGCAGTTTTGGCAAATTTACCTGCCCATTATATGCCAATGTTCCTAATGCCCAGTTTGGTGATCTCAGAAATGGAAAGAACTATTTGCTCATTCTTATGGGAAGTTTAAAAAGGGAGTAAACTGGAACATCTTGTGAATTAGGATTCCACTTCAAAGTCTTTACAGGGTGGAGGTATCGACTTGGGAAACTTGGAAAACAGGAACTTGGCTTTATTAAACATATGGAGTTGGAGATTTATTAGGAAACCTGATGCACTTTGGTGCAAAGTAATAAAGAGCATTCATGGTGTTACTTGTTAGCACCTTTCAGTGACATACATTAGGAAAGTATGGTTTGAGTTTGAGAAGCCCATGTTTTAGGATTTCAAGATTTGGAGTAAATTCTACTATCTAGTTAGGAAATGGGGGGAATATTTACTTGTTGCTTGATGTTCGGAGTCTTGATTCTTCATTCGAACTGCATTTCCCTCAACTATTTGATATAGCTTCATTCCCAAATGGTAATATATTTGATAATTGAGATTTAGAAACTTGTTCAAGTAACTTTCTTTTCCAAAGCAACTAAATGATAAAGAAATTTTAAAATTTACAACAGTTGAGGAGGAGCAATTTGGCTGACAAGCATTAATCTCAATCACCTCTTTTCTATTCTGGGTGATGACCATTGGATTCTTCAAGGAAATTTACTGTTAAGTGCTAACTCCTCATCCAACCACTTGATTACCTCGTCCCCTTTAAGAAAAGGAGATTGATTAGGCTTTGTGGAAATCTAAGAGCCCTGAGCTTATTAATATTTTGGTGTGAATAATTATTTTTGGAATCCTGAATTGTTCTACTACTTTGCAACATAAGCTTCAGGTGCACTAACTTTTGCCTTCTATTTGTACATTATGTATGGTGAACTGTGAAGATTTACAACAAATCTTGGTTGGCCCCATATTATCTTCAATGTCAAATATTACTGTTCAATATAGTCAAGGGGACCCACTCTCCCCTTTCTTATTTCTTCTGGTAAGTGAAGTTTTGAGTTCTTTGATTGCAAGACTACACGAAAAGGGGCTGTATTAAGGATTTTGGGTTGGAAAAGAAAAGGTGTATGTCTCTATTCTCCAATTCGCTGATGACACCTTAATTTTCTGCAAGTTTGATGATGAAAATGCTTGATAATCTTGTGCACCAGAAAATAAATTGGGAAAGATTTGCTGTACGTGGCATTAATGTTGATGATGGGAAACTTCTCTCAGTGGCAGCAAGGCTAAATTGTAAGGTGGAGCACCTTCCACTTGTGTATCTAGGCCTACCCTTGGGTGGCTGTCTGAAGGAGGTGGAGTTTTGGCAACCGGTTATTGATAAATTACAACGCAAGCTGGACAAGTGGAGAAGATACAATCTTTCTCGAGGAGGAAGAGCTACCCTTTGCAAATCAGTTCTCTCTAACCTTCCTATTTATTACATGTCTTCCTCCAGGTAAGGTTTTATCAAAGATAGAACAAGTTCTGAGGAACTTCTTTAAGGAAGGGAACAAAGGTGGAAAAATTAATCATCTCTCTTTGGCTTCTCCGCTTGACATGGCTCTAAAGAAGGCTTTTTGGAGGACGAGAAGTCCTAGACGAGTTAATATTCTGGTATGGATTATAATAGTTGGTCACTTAAATTGCTCCTCGGTCTTACAAAGAAAGTATCCTTCCCATTGTGTGTCTTCAAGTATTTGCGCACTGTGCAAAGGAGAAGAGAAAGACATTCAGCACATCCTCTTTGAGTGCGGTTATGCTCAAAACTGTTGGTTTGCATTATTTTAAATTTTTTGGCATCAGCTGGGTTTTTGGAAAAACAGCCGCGAGCAATGTTTTTCAGATTTTGGTGGGGCCAAAGCTTAAAAAGAATCAATAAATCCTGTGGATTAATGGGATGAAAGCTGTGTTGACTTATTGTGGTTTGAAAGAAACCAGAGGGTCTTCCATGATAAGGAAACTCCTTGGTTACTAGATTTGAAGCAGCTCGATTGAACGCATCCCTTTGGACCTCTCTCTCCGAGGCTTTTGCTGATTATTCAAGTCAAGATATTAGTTTAAACTGAAGTGTTCTCGTTTCCATGAATCGCGGATGATACCTTAGTTTGCTTGGTTTTTCAGTTTTAAGAAAACTTAAAGGTTGAAGAAGTGAAAACTTGAAGGTTGAAGAAGTGAGTGAGTTTCAGATTATTAAGGGGCTTTAGTCACACAGGAAAGAAAGGGTTGTAATCAACCAAAGTTAGTGGTTGTTGGCTCCTATTGGAAATTTTTGAGTTAATTCATTCCTCCGAGTTAAAGCTGTAATAATTCTATGGTATTACAGAAGTCTTAGTCGAAAATCGTTAATCTAATTTGGAAAATGGCTTTTGGTCACTGCTTGTCTTCTTCAATCTGCACTTTTGCTTTGCTGCTAGTGACTCTTCACACAACCTAGTTTTGATTGCTTATTGTCAACTTGTTTGCATCGTTTTCAGAATTTTGTGTTTGGGAAGATCCTAGAGATTTATTTTCGAGCAAGCTTCTCAGCGTAAGACCTCGAT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ATTCATTCTAAATGAGTGCTTTCGGCATGTGAAGTAAACCTCCCTAAAATGAAAATTGGTCCTCTATTCTATTTACGTAATTAACAAAAAAAAAAGAAAAGAAAAAAGAAAGAAAAAAGGAAAAAAAAGGAAAAAAAAGGAAAAAAAAGGGAAAAACACTTTTACGTGAACTCTTTCGCACAGTATACGCCGAACGGCGGTCGTTCCTTTCGTCTTCTTCTTCTTCATTTCTAACAGTCTTCACCGCCGGAAAATTCTCTCAACTTCTCCCTTACAGCATGAAGCGCGTCTTCGAAGAAATTTCCGACGAAGAGTGGTCCAATCACTCCTTCAAGCCCTCTCGCGTCTTCACAAAACCACAGACTGAACCTTCGATCCCTCCTCCGATTGAATCTTTCGCATACCGACCCCACCAGCTCTATATTTCCGACGAGAGTAGCGACGATTGTGTCGTAGTCATGGAAAGTTCCAAAAATTATGAGGAAAATTTGGAGGACGAGGATGTCGAGGTTGAGGGAGTGAAATCCACCACGGCAGTGAGTCGTGGCCGTCGGTTTGTGGTTGATGACGAAGATGATGAAAGTGAGAGGGAATTGACTGAGGTTTGTGATGTAAAGTCGACGAGCGAGGAGGAGCTGGAGGAGGGTAGGGAGGATGACGATGATGTCGTCGGTAAGGCTTTGCAGAAGTGTGCAAAATTATCTGCCGAGTTGAAGAGAGAGCTGTACGGCTCTTCGGTTTCTGCCTCTGAACGATATTCAGAAGTGGAGTCTTCTTCCGTTAGGATAGTCACCCAGGATGATATTAATGCGGCTTGCAAGGCTGAAGATTCTGATTTTGAGCCTGTTCTCAAGCCATATCAGCTGGTTGGCGTGAACTTTCTTCTTCTTTTGTATCAGAAGGGAGTTGGTGGAGCTATACTTGCAGATGAGATGGGTCTGGGGAAGACAATACAAGCTATAACATACCTTGTGATGTTGAAATATTTGAACAATGATTCGGGGCCTCACCTAATTGTATGCCCTGCATCTGTTCTGGAGAATTGGGAAAGAGAACTCAAAAAGTGGTGCCCATCCTTTTCTGTACTCCACTATCATGGGGCCGCCCGGTCGGCATATGCTAAGGAATTGAATTCTCTGGCTAAGTCAGGGTTGCCTCCTCCGTTTAATGTTCTTCTTGTTTGTTATTCTCTCTTTGAAAGACACAGTTCCCAGCAAAAAGATGAACGTAAAATCCTGAAACGCTGGCAATGGAGTTGTGTTCTTATGGATGAGGCTCATGCCTTGAAAGATAGAAACAGCTATCGGTGGAAAAATTTAATGTCTCTTGCACGTAATGCAAAGCAACGATTAATGTTGACAGGGACACCGCTTCAAAATGATTTGCATGAGCTGTGGTCACTGTTGGAGTTTATGATGCCCAATCTCTTCGCTACTGAGGATGTGGACTTGAAAAAACTATTAACAGCTGAGAATAATTCATTGATTAATCATATGAAATTCATTTTGGGTCCATTTATTTTGAGACGGTTAAAATCTGATGTTATGCAGCAACTTGTTCCAAAGATACAGCAGGTTCGGTATGTTGCAATGGAAAAACAACAAGAAGATGCCTACAAGGATGCTATTGATGATTATCGAAATGCTTCTCGCGGCCGCGTTGGTAGAAATGGCAATACTAATTCAGATAACATATACAATATTCTTCCCCGTCGTCAGATATCTAATTATTTTGTTCAGTTCCGCAAGATTGCTAATCATCCTTTACTAGTACGGCGCATTTACAAAGACGAGGATGTTACCCGTTTTGCTAAAAAGTTACACCCTTTAGGTGCATTTGGATTCGAGTGTACCGTGGAAAGGGTAGCTGAGGAACTTAAAAGTTATAATGATTTTTCCATTCACCGGTTATTACTTTCTTATGGCATTACTGACAGAAAGGGAGTTCTATCAGATAACGAAGTGCTACTTTCGGCGAAGTGTCGGGAATTAGCACAACTACTTCCTTCACTGAAGCGAGATGGACATCGAGTTCTTATTTTCAGTCAATGGACTTCAATGCTTGACATCCTAGAATGGACATTGGATGTGATTGGGTTTACTTATAGACGACTAGATGGAAGTACGCAGGTAGCAGAAAGACAGACGATAGTTGACACTTTCAATAATGACACGTCTATATTTGCATGCTTGCTTTCTACTAGAGCAGGGGGACAGGGGTTGAACTTAACTGGGGCCGACACTGTTGTCATTCACGACATGGATTTCAATCCACAGATTGACCGCCAAGCAGAAGATCGTTGTCATCGAATTGGCCAAACCAAACCTGTCACTATATACAGGTTGGTGACGAAGGGAACGGTGGATGAAAATGTCTATGAGATAGCAAAACGGAAGTTAGTCCTTGATGCTGCAGTTCTGGAGTCGGGTATAGAGATGGATAACGAGAGGGAGTCATCTGAGAAGACCATGGGGGAGATATTATCAGCAATTCTTCTTGGTTAGAGATTTTGTTACTGACTATAACCCAAAGTCCAGATTCATATTCTCAGTGCTCGCTTCTCATTCATTATGGTCGTAACCTTATATAGATGTAACATTTTGTTAACGCCTCATTGGTGCACAAAGCAATAGAGCTATCAAAAGTGTTAGTTTGTGCAGTATTAAATAGATGTAACATCACTAATGGCAACTAGGTTATACACATGTTATATATAGGAGATGGTACTTTTATAAAAGCAGAGGTTATTTTATTTTCATTTGATGTTTACGGACTTTTCAATTTGTAAGGATAAGGATGTAAAATACTCAAATGGATTAAATACCATTTTGGTTCAGTAGTTTTGGACTTTGTTCTATATTAGACCTTATACTCTGTAATTATGATAAATATCAACAGTGTTTCAATTCAC ATGAAGCGCGTCTTCGAAGAAATTTCCGACGAAGAGTGGTCCAATCACTCCTTCAAGCCCTCTCGCGTCTTCACAAAACCACAGACTGAACCTTCGATCCCTCCTCCGATTGAATCTTTCGCATACCGACCCCACCAGCTCTATATTTCCGACGAGAGTAGCGACGATTGTGTCGTAGTCATGGAAAGTTCCAAAAATTATGAGGAAAATTTGGAGGACGAGGATGTCGAGGTTGAGGGAGTGAAATCCACCACGGCAGTGAGTCGTGGCCGTCGGTTTGTGGTTGATGACGAAGATGATGAAAGTGAGAGGGAATTGACTGAGGTTTGTGATGTAAAGTCGACGAGCGAGGAGGAGCTGGAGGAGGGTAGGGAGGATGACGATGATGTCGTCGGTAAGGCTTTGCAGAAGTGTGCAAAATTATCTGCCGAGTTGAAGAGAGAGCTGTACGGCTCTTCGGTTTCTGCCTCTGAACGATATTCAGAAGTGGAGTCTTCTTCCGTTAGGATAGTCACCCAGGATGATATTAATGCGGCTTGCAAGGCTGAAGATTCTGATTTTGAGCCTGTTCTCAAGCCATATCAGCTGGTTGGCGTGAACTTTCTTCTTCTTTTGTATCAGAAGGGAGTTGGTGGAGCTATACTTGCAGATGAGATGGGTCTGGGGAAGACAATACAAGCTATAACATACCTTGTGATGTTGAAATATTTGAACAATGATTCGGGGCCTCACCTAATTGTATGCCCTGCATCTGTTCTGGAGAATTGGGAAAGAGAACTCAAAAAGTGGTGCCCATCCTTTTCTGTACTCCACTATCATGGGGCCGCCCGGTCGGCATATGCTAAGGAATTGAATTCTCTGGCTAAGTCAGGGTTGCCTCCTCCGTTTAATGTTCTTCTTGTTTGTTATTCTCTCTTTGAAAGACACAGTTCCCAGCAAAAAGATGAACGTAAAATCCTGAAACGCTGGCAATGGAGTTGTGTTCTTATGGATGAGGCTCATGCCTTGAAAGATAGAAACAGCTATCGGTGGAAAAATTTAATGTCTCTTGCACGTAATGCAAAGCAACGATTAATGTTGACAGGGACACCGCTTCAAAATGATTTGCATGAGCTGTGGTCACTGTTGGAGTTTATGATGCCCAATCTCTTCGCTACTGAGGATGTGGACTTGAAAAAACTATTAACAGCTGAGAATAATTCATTGATTAATCATATGAAATTCATTTTGGGTCCATTTATTTTGAGACGGTTAAAATCTGATGTTATGCAGCAACTTGTTCCAAAGATACAGCAGGTTCGGTATGTTGCAATGGAAAAACAACAAGAAGATGCCTACAAGGATGCTATTGATGATTATCGAAATGCTTCTCGCGGCCGCGTTGGTAGAAATGGCAATACTAATTCAGATAACATATACAATATTCTTCCCCGTCGTCAGATATCTAATTATTTTGTTCAGTTCCGCAAGATTGCTAATCATCCTTTACTAGTACGGCGCATTTACAAAGACGAGGATGTTACCCGTTTTGCTAAAAAGTTACACCCTTTAGGTGCATTTGGATTCGAGTGTACCGTGGAAAGGGTAGCTGAGGAACTTAAAAGTTATAATGATTTTTCCATTCACCGGTTATTACTTTCTTATGGCATTACTGACAGAAAGGGAGTTCTATCAGATAACGAAGTGCTACTTTCGGCGAAGTGTCGGGAATTAGCACAACTACTTCCTTCACTGAAGCGAGATGGACATCGAGTTCTTATTTTCAGTCAATGGACTTCAATGCTTGACATCCTAGAATGGACATTGGATGTGATTGGGTTTACTTATAGACGACTAGATGGAAGTACGCAGGTAGCAGAAAGACAGACGATAGTTGACACTTTCAATAATGACACGTCTATATTTGCATGCTTGCTTTCTACTAGAGCAGGGGGACAGGGGTTGAACTTAACTGGGGCCGACACTGTTGTCATTCACGACATGGATTTCAATCCACAGATTGACCGCCAAGCAGAAGATCGTTGTCATCGAATTGGCCAAACCAAACCTGTCACTATATACAGGTTGGTGACGAAGGGAACGGTGGATGAAAATGTCTATGAGATAGCAAAACGGAAGTTAGTCCTTGATGCTGCAGTTCTGGAGTCGGGTATAGAGATGGATAACGAGAGGGAGTCATCTGAGAAGACCATGGGGGAGATATTATCAGCAATTCTTCTTGGTTAG MKRVFEEISDEEWSNHSFKPSRVFTKPQTEPSIPPPIESFAYRPHQLYISDESSDDCVVVMESSKNYEENLEDEDVEVEGVKSTTAVSRGRRFVVDDEDDESERELTEVCDVKSTSEEELEEGREDDDDVVGKALQKCAKLSAELKRELYGSSVSASERYSEVESSSVRIVTQDDINAACKAEDSDFEPVLKPYQLVGVNFLLLLYQKGVGGAILADEMGLGKTIQAITYLVMLKYLNNDSGPHLIVCPASVLENWERELKKWCPSFSVLHYHGAARSAYAKELNSLAKSGLPPPFNVLLVCYSLFERHSSQQKDERKILKRWQWSCVLMDEAHALKDRNSYRWKNLMSLARNAKQRLMLTGTPLQNDLHELWSLLEFMMPNLFATEDVDLKKLLTAENNSLINHMKFILGPFILRRLKSDVMQQLVPKIQQVRYVAMEKQQEDAYKDAIDDYRNASRGRVGRNGNTNSDNIYNILPRRQISNYFVQFRKIANHPLLVRRIYKDEDVTRFAKKLHPLGAFGFECTVERVAEELKSYNDFSIHRLLLSYGITDRKGVLSDNEVLLSAKCRELAQLLPSLKRDGHRVLIFSQWTSMLDILEWTLDVIGFTYRRLDGSTQVAERQTIVDTFNNDTSIFACLLSTRAGGQGLNLTGADTVVIHDMDFNPQIDRQAEDRCHRIGQTKPVTIYRLVTKGTVDENVYEIAKRKLVLDAAVLESGIEMDNERESSEKTMGEILSAILLG* Homology
BLAST of CsGy5G009290 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9ZUL5 (Protein CHROMATIN REMODELING 19 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=ETL1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 1059.3 bits (2738), Expect = 2.0e-308 Identity = 540/770 (70.13%), Postives = 635/770 (82.47%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy5G009290 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: E7F1C4 (SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1B OS=Danio rerio OX=7955 GN=smarcad1b PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 384.0 bits (985), Expect = 3.8e-105 Identity = 258/691 (37.34%), Postives = 390/691 (56.44%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy5G009290 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9VL72 (SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1 homolog OS=Drosophila melanogaster OX=7227 GN=Etl1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 378.6 bits (971), Expect = 1.6e-103 Identity = 225/534 (42.13%), Postives = 318/534 (59.55%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy5G009290 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9H4L7 (SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SMARCAD1 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 368.6 bits (945), Expect = 1.6e-100 Identity = 214/543 (39.41%), Postives = 324/543 (59.67%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy5G009290 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q04692 (SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1 OS=Mus musculus OX=10090 GN=Smarcad1 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 367.1 bits (941), Expect = 4.8e-100 Identity = 217/561 (38.68%), Postives = 331/561 (59.00%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy5G009290 vs. NCBI nr
Match: XP_004140399.1 (protein CHROMATIN REMODELING 19 [Cucumis sativus] >XP_031741288.1 protein CHROMATIN REMODELING 19-like [Cucumis sativus] >KAE8648070.1 hypothetical protein Csa_018841 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1452 bits (3759), Expect = 0.0 Identity = 741/741 (100.00%), Postives = 741/741 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy5G009290 vs. NCBI nr
Match: XP_008460215.1 (PREDICTED: protein CHROMATIN REMODELING 19 isoform X1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1409 bits (3647), Expect = 0.0 Identity = 719/741 (97.03%), Postives = 729/741 (98.38%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy5G009290 vs. NCBI nr
Match: XP_038877196.1 (protein CHROMATIN REMODELING 19 isoform X2 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1397 bits (3615), Expect = 0.0 Identity = 710/741 (95.82%), Postives = 726/741 (97.98%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy5G009290 vs. NCBI nr
Match: XP_038877194.1 (protein CHROMATIN REMODELING 19 isoform X1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1389 bits (3595), Expect = 0.0 Identity = 710/750 (94.67%), Postives = 726/750 (96.80%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy5G009290 vs. NCBI nr
Match: XP_022943065.1 (protein CHROMATIN REMODELING 19 [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 1352 bits (3500), Expect = 0.0 Identity = 687/744 (92.34%), Postives = 717/744 (96.37%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy5G009290 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CC04 (protein CHROMATIN REMODELING 19 isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103499098 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1409 bits (3647), Expect = 0.0 Identity = 719/741 (97.03%), Postives = 729/741 (98.38%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy5G009290 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1FXC0 (protein CHROMATIN REMODELING 19 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111447914 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1352 bits (3500), Expect = 0.0 Identity = 687/744 (92.34%), Postives = 717/744 (96.37%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy5G009290 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1JU99 (protein CHROMATIN REMODELING 19 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111487952 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1348 bits (3488), Expect = 0.0 Identity = 685/745 (91.95%), Postives = 715/745 (95.97%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy5G009290 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CC36 (protein CHROMATIN REMODELING 19 isoform X2 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103499098 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1319 bits (3413), Expect = 0.0 Identity = 669/688 (97.24%), Postives = 677/688 (98.40%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy5G009290 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DYN8 (protein CHROMATIN REMODELING 19 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111024255 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1306 bits (3381), Expect = 0.0 Identity = 673/749 (89.85%), Postives = 701/749 (93.59%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy5G009290 vs. TAIR 10
Match: AT2G02090.1 (SNF2 domain-containing protein / helicase domain-containing protein ) HSP 1 Score: 1059.3 bits (2738), Expect = 1.4e-309 Identity = 540/770 (70.13%), Postives = 635/770 (82.47%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy5G009290 vs. TAIR 10
Match: AT5G19310.1 (Homeotic gene regulator ) HSP 1 Score: 293.9 bits (751), Expect = 3.6e-79 Identity = 202/567 (35.63%), Postives = 288/567 (50.79%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy5G009290 vs. TAIR 10
Match: AT3G06400.1 (chromatin-remodeling protein 11 ) HSP 1 Score: 292.7 bits (748), Expect = 8.1e-79 Identity = 229/744 (30.78%), Postives = 358/744 (48.12%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy5G009290 vs. TAIR 10
Match: AT3G06400.3 (chromatin-remodeling protein 11 ) HSP 1 Score: 292.7 bits (748), Expect = 8.1e-79 Identity = 229/744 (30.78%), Postives = 358/744 (48.12%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy5G009290 vs. TAIR 10
Match: AT3G06400.2 (chromatin-remodeling protein 11 ) HSP 1 Score: 292.7 bits (748), Expect = 8.1e-79 Identity = 229/744 (30.78%), Postives = 358/744 (48.12%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucumber (Gy14) v2.1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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