Cp4.1LG15g02110 (gene) Cucurbita pepo (MU‐CU‐16) v4.1

Overview
NameCp4.1LG15g02110
Typegene
OrganismCucurbita pepo (Cucurbita pepo (MU‐CU‐16) v4.1)
Descriptionhornerin-like isoform X3
LocationCp4.1LG15: 1757491 .. 1759618 (+)
RNA-Seq ExpressionCp4.1LG15g02110
SyntenyCp4.1LG15g02110
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATTTGTTCTGCAGCGAGACGATTGTCAAGTTCTAATGAAGGATATGGTTCTTCAAGTGGTCATGGTTATAGTAGCTATGCTTCTGTAGGAGAATATGGTGTTGAAAAGTATGGCAATGGATATGGAAAAGATGGTTCATATGGAGGAAAATACGGGGAATATAATGGAGGAAAGTACGGGGGATATGACGGGGGAAAACACGAGAGATATGATGGTGGAAACTACGGGGGATACAGCGGAGGTAGACACGAAGGATACGATGAAGAAAATTATGGAGGATACGACGGAGGTAAACACGAGGAATACGGCGGATGTAAACACAAGGGATACGATGGAGGAAACTATGGGGGATACGACTTCAGTAAACACGAGGAATACGACAAAGATAAACACGAGGGATACGATGGAGGAAACTATAGGGGATATGACGGAGGTAAGCATGAGGAATACGGTAGAGGTAAACATGAGGGGTACGATGGAGGAAACTATGGGGGATATGGTGGAGGTAAGCATGATGAATATGATAGAGGTAAACACGAGGAATACGAAAGAGGTAAACATGAGGAATATGAAGGAGGAAACTACGGGGGATACGGCGGAGGCAAGCATGAGGCATACGGCGGAGGTAAACACGAGGAATACGGCAAAGATAAACACGAGGGATACAATGGAGGGAACTATGGGGGATACGGCGGAGGTAAACACGAGGAATACGACAAAGATAAACACGATGGATACGATGGAGGAAAGTATGGGGGATACAGCGGAGGTAAACACGAGGAATACGACAAAGATAAACACGAGGGATACGATGGAGGAAACTATGGGGGATACGGCTTCAGTAAACACGAGGAATACGACAAAGATAAACACGAGGGATATGATGGAGGGAACTATGGGGGATACAGTGNTACATATGCAAATGGCTTCTCATAAACTTTCTTCTCTTGTGTTCTTTCTGTTGTTTGGAATAGGAATTTGTTCTGCAGCGAGACGATTGTCAAGTTCTAATGAAGGATATGGTTCTTCAAGTGGTCATGGTTATAGTAGCTATGCTTCTGTAGGAGAATATGGTGTTGAAAAGTATGGCAATGGATATGGAAAAGATGGTTCATATGGAGGAAAATACGGGGAATATAATGGAGGAAAGTACGGGGGATATGACGGGGGAAAACACGAGAGATATGATGGTGGAAACTACGGGGGATACAGCGGAGGTAGACACGAAGGATACGATGAAGAAAATTATGGAGGATACGACGGAGGTAAACACGAGGAATACGGCGGATGTAAACACAAGGGATACGATGGAGGAAACTATGGGGGATACGACTTCAGTAAACACGAGGAATACGACAAAGATAAACACGAGGGATACGATGGAGGAAACTATAGGGGATATGACGGAGGTAAGCATGAGGAATACGGTAGAGGTAAACATGAGGGGTACGATGGAGGAAACTATGGGGGATATGGTGGAGGTAAGCATGATGAATATGATAGAGGTAAACACGAGGAATACGAAAGAGGTAAACATGAGGAATATGAAGGAGGAAACTACGGGGGATACGGCGGAGGCAAGCATGAGGCATACGGCGGAGGTAAACACGAGGAATACGGCAAAGATAAACACGAGGGATACAATGGAGGGAACTATGGGGGATACGGAGGAGGTAAACACGAGGAATACGACAAAGATAAATACGAGGGATACGATGGAGGAAAGTATGGGGGATACAGTGGAAGTAAACACGAGGAATACGACAAAGATAAACACAAGGGATACGATGGAGAAAACTATGGGGGATACAGCGGAGGTAAACACGAGGAATACGACAAAGATAAACACGATGGATACGATGGAGGAAAGTATGGGGAATACAGTGGAAGTAAACACGAGGAATACGACAAAGATAAACACGAGGGATACGATGGAGGAAAGTATGGGGGATACAGTGGAAGTAAACACGAGGAATACGACAAAGATAAATACGATGGATATGATGGAAGAAACTATGGGGGATACGACCAAGGTAAGCATGAGAAATACGGCGAAGGTAAACACGAGGAATACAGTGGAGGAAACTACAGGGGATACGGTGGAAGTAAACACGAGGGATATGCACCC

mRNA sequence

ATTTGTTCTGCAGCGAGACGATTGTCAAGTTCTAATGAAGGATATGGTTCTTCAAGTGGTCATGGTTATAGTAGCTATGCTTCTGTAGGAGAATATGGTGTTGAAAAGTATGGCAATGGATATGGAAAAGATGGTTCATATGGAGGAAAATACGGGGAATATAATGGAGGAAAGTACGGGGGATATGACGGGGGAAAACACGAGAGATATGATGGTGGAAACTACGGGGGATACAGCGGAGGTAGACACGAAGGATACGATGAAGAAAATTATGGAGGATACGACGGAGGTAAACACGAGGAATACGGCGGATGTAAACACAAGGGATACGATGGAGGAAACTATGGGGGATACGACTTCAGTAAACACGAGGAATACGACAAAGATAAACACGAGGGATACGATGGAGGAAACTATAGGGGATATGACGGAGGTAAGCATGAGGAATACGGTAGAGGTAAACATGAGGGGTACGATGGAGGAAACTATGGGGGATATGGTGGAGGTAAGCATGATGAATATGATAGAGGTAAACACGAGGAATACGAAAGAGGTAAACATGAGGAATATGAAGGAGGAAACTACGGGGGATACGGCGGAGGCAAGCATGAGGCATACGGCGGAGGTAAACACGAGGAATACGGCAAAGATAAACACGAGGGATACAATGGAGGGAACTATGGGGGATACGGCGGAGGTAAACACGAGGAATACGACAAAGATAAACACGATGGATACGATGGAGGAAAGTATGGGGGATACAGCGGAGGTAAACACGAGGAATACGACAAAGATAAACACGAGGGATACGATGGAGGAAACTATGGGGGATACGGCTTCAGTAAACACGAGGAATACGACAAAGATAAACACGAGGGATATGATGGAGGGAACTATGGGGGATACAGAATTTGTTCTGCAGCGAGACGATTGTCAAGTTCTAATGAAGGATATGGTTCTTCAAGTGGTCATGGTTATAGTAGCTATGCTTCTGTAGGAGAATATGGTGTTGAAAAGTATGGCAATGGATATGGAAAAGATGGTTCATATGGAGGAAAATACGGGGAATATAATGGAGGAAAGTACGGGGGATATGACGGGGGAAAACACGAGAGATATGATGGTGGAAACTACGGGGGATACAGCGGAGGTAGACACGAAGGATACGATGAAGAAAATTATGGAGGATACGACGGAGGTAAACACGAGGAATACGAAAGAGGTAAACATGAGGAATATGAAGGAGGAAACTACGGGGGATACGGCGGAGGCAAGCATGAGGCATACGGCGGAGGTAAACACGAGGAATACGGCAAAGATAAACACGAGGGATACAATGGAGGGAACTATGGGGGATACGGAGGAGGTAAACACGAGGAATACGACAAAGATAAATACGAGGGATACGATGGAGGAAAGTATGGGGGATACAGTGGAAGTAAACACGAGGAATACGACAAAGATAAACACAAGGGATACGATGGAGAAAACTATGGGGGATACAGCGGAGGTAAACACGAGGAATACGACAAAGATAAACACGATGGATACGATGGAGGAAAGTATGGGGAATACAGTGGAAGTAAACACGAGGAATACGACAAAGATAAACACGAGGGATACGATGGAGGAAAGTATGGGGGATACAGTGGAAGTAAACACGAGGAATACGACAAAGATAAATACGATGGATATGATGGAAGAAACTATGGGGGATACGACCAAGGTAAGCATGAGAAATACGGCGAAGGTAAACACGAGGAATACAGTGGAGGAAACTACAGGGGATACGGTGGAAGTAAACACGAGGGATATGCACCC

Coding sequence (CDS)

ATTTGTTCTGCAGCGAGACGATTGTCAAGTTCTAATGAAGGATATGGTTCTTCAAGTGGTCATGGTTATAGTAGCTATGCTTCTGTAGGAGAATATGGTGTTGAAAAGTATGGCAATGGATATGGAAAAGATGGTTCATATGGAGGAAAATACGGGGAATATAATGGAGGAAAGTACGGGGGATATGACGGGGGAAAACACGAGAGATATGATGGTGGAAACTACGGGGGATACAGCGGAGGTAGACACGAAGGATACGATGAAGAAAATTATGGAGGATACGACGGAGGTAAACACGAGGAATACGGCGGATGTAAACACAAGGGATACGATGGAGGAAACTATGGGGGATACGACTTCAGTAAACACGAGGAATACGACAAAGATAAACACGAGGGATACGATGGAGGAAACTATAGGGGATATGACGGAGGTAAGCATGAGGAATACGGTAGAGGTAAACATGAGGGGTACGATGGAGGAAACTATGGGGGATATGGTGGAGGTAAGCATGATGAATATGATAGAGGTAAACACGAGGAATACGAAAGAGGTAAACATGAGGAATATGAAGGAGGAAACTACGGGGGATACGGCGGAGGCAAGCATGAGGCATACGGCGGAGGTAAACACGAGGAATACGGCAAAGATAAACACGAGGGATACAATGGAGGGAACTATGGGGGATACGGCGGAGGTAAACACGAGGAATACGACAAAGATAAACACGATGGATACGATGGAGGAAAGTATGGGGGATACAGCGGAGGTAAACACGAGGAATACGACAAAGATAAACACGAGGGATACGATGGAGGAAACTATGGGGGATACGGCTTCAGTAAACACGAGGAATACGACAAAGATAAACACGAGGGATATGATGGAGGGAACTATGGGGGATACAGAATTTGTTCTGCAGCGAGACGATTGTCAAGTTCTAATGAAGGATATGGTTCTTCAAGTGGTCATGGTTATAGTAGCTATGCTTCTGTAGGAGAATATGGTGTTGAAAAGTATGGCAATGGATATGGAAAAGATGGTTCATATGGAGGAAAATACGGGGAATATAATGGAGGAAAGTACGGGGGATATGACGGGGGAAAACACGAGAGATATGATGGTGGAAACTACGGGGGATACAGCGGAGGTAGACACGAAGGATACGATGAAGAAAATTATGGAGGATACGACGGAGGTAAACACGAGGAATACGAAAGAGGTAAACATGAGGAATATGAAGGAGGAAACTACGGGGGATACGGCGGAGGCAAGCATGAGGCATACGGCGGAGGTAAACACGAGGAATACGGCAAAGATAAACACGAGGGATACAATGGAGGGAACTATGGGGGATACGGAGGAGGTAAACACGAGGAATACGACAAAGATAAATACGAGGGATACGATGGAGGAAAGTATGGGGGATACAGTGGAAGTAAACACGAGGAATACGACAAAGATAAACACAAGGGATACGATGGAGAAAACTATGGGGGATACAGCGGAGGTAAACACGAGGAATACGACAAAGATAAACACGATGGATACGATGGAGGAAAGTATGGGGAATACAGTGGAAGTAAACACGAGGAATACGACAAAGATAAACACGAGGGATACGATGGAGGAAAGTATGGGGGATACAGTGGAAGTAAACACGAGGAATACGACAAAGATAAATACGATGGATATGATGGAAGAAACTATGGGGGATACGACCAAGGTAAGCATGAGAAATACGGCGAAGGTAAACACGAGGAATACAGTGGAGGAAACTACAGGGGATACGGTGGAAGTAAACACGAGGGATATGCACCC

Protein sequence

ICSAARRLSSSNEGYGSSSGHGYSSYASVGEYGVEKYGNGYGKDGSYGGKYGEYNGGKYGGYDGGKHERYDGGNYGGYSGGRHEGYDEENYGGYDGGKHEEYGGCKHKGYDGGNYGGYDFSKHEEYDKDKHEGYDGGNYRGYDGGKHEEYGRGKHEGYDGGNYGGYGGGKHDEYDRGKHEEYERGKHEEYEGGNYGGYGGGKHEAYGGGKHEEYGKDKHEGYNGGNYGGYGGGKHEEYDKDKHDGYDGGKYGGYSGGKHEEYDKDKHEGYDGGNYGGYGFSKHEEYDKDKHEGYDGGNYGGYRICSAARRLSSSNEGYGSSSGHGYSSYASVGEYGVEKYGNGYGKDGSYGGKYGEYNGGKYGGYDGGKHERYDGGNYGGYSGGRHEGYDEENYGGYDGGKHEEYERGKHEEYEGGNYGGYGGGKHEAYGGGKHEEYGKDKHEGYNGGNYGGYGGGKHEEYDKDKYEGYDGGKYGGYSGSKHEEYDKDKHKGYDGENYGGYSGGKHEEYDKDKHDGYDGGKYGEYSGSKHEEYDKDKHEGYDGGKYGGYSGSKHEEYDKDKYDGYDGRNYGGYDQGKHEKYGEGKHEEYSGGNYRGYGGSKHEGYAP
Homology
BLAST of Cp4.1LG15g02110 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q6RHW0 (Keratin, type I cytoskeletal 9 OS=Mus musculus OX=10090 GN=Krt9 PE=1 SV=3)

HSP 1 Score: 65.5 bits (158), Expect = 2.4e-09
Identity = 117/329 (35.56%), Postives = 137/329 (41.64%), Query Frame = 0

Query: 137 GNYRGYDGGKHEEYGRGKHEGYDGGNYGGYGGGKHDEYDRGKHEEYERGKHEEYEGGNYG 196
           G  + ++     + G G  +G   G+ G YGGG    Y  G    Y  G    Y GG+ G
Sbjct: 438 GGQQDFESSGAGQIGFGSGKGRQRGSGGSYGGGSGGSYGGGSGGSYGGGSGGSYGGGSGG 497

Query: 197 GYGGGKHEAYGGGKHEEYGKDKHEGYNGGNYGGYGGGKHEEYDKDKHDGYDGGKYGGYSG 256
            YGGG      GG H       H G +GG+YGG  GG         H G  GG YGG SG
Sbjct: 498 SYGGG-----SGGSHGGKSGGSHGGGSGGSYGGESGG--------SHGGGSGGSYGGGSG 557

Query: 257 GKHEEYDKDKHEGYDGGNYGGYGFSKHEEYDKDKHEGYDGGNYGGYRICSAARRLSSSNE 316
           G         H G  GG YGG   S           G  GG+YGG          S  + 
Sbjct: 558 G--------SHGGKSGGGYGGGSSS----------GGGSGGSYGGG---------SGGSH 617

Query: 317 GYGSSSGHGYSSYASVGEYGVEKYGNGYGKDGSYGGKYGEYNGGKYGGYDGGKHERYDGG 376
           G GS   +G  S  S G      YG G    G  GG YG  +GG +GG  GG +    GG
Sbjct: 618 GGGSGGSYGGGSGGSHGGKSGGGYGGGSSSGGGSGGSYGGGSGGSHGGKSGGSYGGGSGG 677

Query: 377 NYGGYSGGRHEGYDEENY------GGYDGGKHEEYERGKHEEYEGGNYGG---YGGGKHE 436
           +YGG SGG H G     Y      GG  GG +     G H    GG+YGG    GGG   
Sbjct: 678 SYGGGSGGSHGGKSGGGYGGGSSSGGGSGGSYGGGSGGSHGGKSGGSYGGGSSSGGGSGG 716

Query: 437 AYGGGKHEEYGKDKHEGYNGGNYGGYGGG 457
           +YGGG           G  GG+ G YGGG
Sbjct: 738 SYGGG----------SGSGGGSGGSYGGG 716


HSP 2 Score: 46.6 bits (109), Expect = 1.2e-03
Identity = 72/204 (35.29%), Postives = 85/204 (41.67%), Query Frame = 0

Query: 408 GKHEEYEGGNYGGYGGGKHEAYGGGKHEEYGKDKHEGYNGGNYGGYGGGKHEEYDKDKYE 467
           G  +  + G+ G YGGG   +YGGG    YG      Y GG+ G YGGG         + 
Sbjct: 454 GSGKGRQRGSGGSYGGGSGGSYGGGSGGSYGGGSGGSYGGGSGGSYGGG-----SGGSHG 513

Query: 468 GYDGGKYGGYSGSKHEEYDKDKHKGYDGENYGGYSGGKHEEYDKDKHDGYDGG-KYGEYS 527
           G  GG +GG SG  +       H G  G +YGG SGG H         GY GG   G  S
Sbjct: 514 GKSGGSHGGGSGGSYGGESGGSHGGGSGGSYGGGSGGSH---GGKSGGGYGGGSSSGGGS 573

Query: 528 GSKHEEYDKDKHEGYDGGKYGGYSGSKHEEYDKDKY------DGYDGRNYGGYDQGKHEK 587
           G  +       H G  GG YGG SG  H       Y       G  G +YGG   G H  
Sbjct: 574 GGSYGGGSGGSHGGGSGGSYGGGSGGSHGGKSGGGYGGGSSSGGGSGGSYGGGSGGSHGG 633

Query: 588 YGEGKHEEYSGGNYRGYGGSKHEG 605
              G +   SGG+Y G  G  H G
Sbjct: 634 KSGGSYGGGSGGSYGGGSGGSHGG 649

BLAST of Cp4.1LG15g02110 vs. NCBI nr
Match: XP_023554142.1 (RNA-binding motif protein, X-linked-like-3 [Cucurbita pepo subsp. pepo])

HSP 1 Score: 1023 bits (2644), Expect = 0.0
Identity = 544/607 (89.62%), Postives = 556/607 (91.60%), Query Frame = 0

Query: 1   ICSAARRLSSSNEGYGSSSGHGYSSYASVGEYGVEKYGNGYGKDGSYGGKYGEYNGGKYG 60
           ICSAARRLSSSNEGYGSSSGHGYSSYASVGEYGVEKYGNGYGKDGSYGGKYGEYNGGKYG
Sbjct: 21  ICSAARRLSSSNEGYGSSSGHGYSSYASVGEYGVEKYGNGYGKDGSYGGKYGEYNGGKYG 80

Query: 61  GYDGGKHERYDGGNYGGYSGGRHEGYDEENYGGYDGGKHEEYGGCKHKGYDGGNYGGYDF 120
           GYDGGKHERYDGGNYGGYSGGRHEGYDEENYGGYDGGKHEEYGGCKHKGYDGGNYGGYDF
Sbjct: 81  GYDGGKHERYDGGNYGGYSGGRHEGYDEENYGGYDGGKHEEYGGCKHKGYDGGNYGGYDF 140

Query: 121 SKHEEYDKDKHEGYDGGNYRGYDGGKHEEYGRGKHEGYDGGNYGGYGGGKHDEYDRGKHE 180
           SKHEEYDKDKHEGYDGGNYRGYDGGKHEEYGRGKHEGYDGGNYGGYGGGKHDEYDRGKHE
Sbjct: 141 SKHEEYDKDKHEGYDGGNYRGYDGGKHEEYGRGKHEGYDGGNYGGYGGGKHDEYDRGKHE 200

Query: 181 EYERGKHEEYEGGNYGGYGGGKHEAYGGGKHEEYGKDKHEGYNGGNYGGYGGGKHEEYDK 240
           EYERGKHEEYEGGNYGGYGGGKHEAYGGGKHEEYGKDKHEGYNGGNYGGYGGGKHEEYDK
Sbjct: 201 EYERGKHEEYEGGNYGGYGGGKHEAYGGGKHEEYGKDKHEGYNGGNYGGYGGGKHEEYDK 260

Query: 241 DKHDGYDGGKYGGYSGGKHEEYDKDKHEGYDGGNYGGYGFSKHEEYDKDKHEGYDGGNYG 300
           DKHDGYDGGKYGGYSGGKHEEYDKDKHEGYDGGNYGGYGFSKHEEYDKDKHEGYDGGNYG
Sbjct: 261 DKHDGYDGGKYGGYSGGKHEEYDKDKHEGYDGGNYGGYGFSKHEEYDKDKHEGYDGGNYG 320

Query: 301 GYRICSAARRLSSSNEGYGSSSGHGYSSYASVGEYGVEKYGNGYGKDGSYGGKYGEYNGG 360
           GY            ++GY   +  GY  ++   EY  +K+      +G  GG Y  Y+GG
Sbjct: 321 GYSGGKHEEYGGCKHKGYDGGNYGGYD-FSKHEEYDKDKH------EGYDGGNYRGYDGG 380

Query: 361 KYGGYDGGKHERYDGGNYGGYSGGRHEGYDEENYGGYDGGKHEEYERGKHEEYEGGNYGG 420
           K+  Y  GKHE YDGGNYGGY GG+H+ YD         GKHEEYERGKHEEYEGGNYGG
Sbjct: 381 KHEEYGRGKHEGYDGGNYGGYGGGKHDEYDR--------GKHEEYERGKHEEYEGGNYGG 440

Query: 421 YGGGKHEAYGGGKHEEYGKDKHEGYNGGNYGGYGGGKHEEYDKDKYEGYDGGKYGGYSGS 480
           YGGGKHEAYGGGKHEEYGKDKHEGYNGGNYGGYGGGKHEEYDKDKYEGYDGGKYGGYSGS
Sbjct: 441 YGGGKHEAYGGGKHEEYGKDKHEGYNGGNYGGYGGGKHEEYDKDKYEGYDGGKYGGYSGS 500

Query: 481 KHEEYDKDKHKGYDGENYGGYSGGKHEEYDKDKHDGYDGGKYGEYSGSKHEEYDKDKHEG 540
           KHEEYDKDKHKGYDGENYGGYSGGKHEEYDKDKHDGYDGGKYGEYSGSKHEEYDKDKHEG
Sbjct: 501 KHEEYDKDKHKGYDGENYGGYSGGKHEEYDKDKHDGYDGGKYGEYSGSKHEEYDKDKHEG 560

Query: 541 YDGGKYGGYSGSKHEEYDKDKYDGYDGRNYGGYDQGKHEKYGEGKHEEYSGGNYRGYGGS 600
           YDGGKYGGYSGSKHEEYDKDKYDGYDGRNYGGYDQGKHEKYGEGKHEEYSGGNYRGYGGS
Sbjct: 561 YDGGKYGGYSGSKHEEYDKDKYDGYDGRNYGGYDQGKHEKYGEGKHEEYSGGNYRGYGGS 612

Query: 601 KHEGYAP 607
           KHEGYAP
Sbjct: 621 KHEGYAP 612

BLAST of Cp4.1LG15g02110 vs. NCBI nr
Match: KAG6571661.1 (Endo-1,4-beta-xylanase B, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia])

HSP 1 Score: 845 bits (2182), Expect = 3.99e-302
Identity = 478/655 (72.98%), Postives = 515/655 (78.63%), Query Frame = 0

Query: 1   ICSAARRLSSSNEGYGSSSGHGYSSYASVGEYGVEKYGNGYGKDGSYGGKYGEYNGGKYG 60
           ICSAARRLSSS  GYGSSSGHGYSSYASVGEYGVE YGNGYGKDG+YGGKYGEYNGGKYG
Sbjct: 7   ICSAARRLSSSYGGYGSSSGHGYSSYASVGEYGVENYGNGYGKDGAYGGKYGEYNGGKYG 66

Query: 61  GYDGGKHERYDGGNYGGYSGGRHEGYDEENYGGYDGGKHEEYGGCKHKGYDGGNYGGYDF 120
            YDGGKHERYD GNYGGYSGGRHEGYD ENYGGY GGKHEEYGG KHKGYDGGNYGGY F
Sbjct: 67  RYDGGKHERYDSGNYGGYSGGRHEGYDGENYGGYGGGKHEEYGGGKHKGYDGGNYGGYSF 126

Query: 121 SKHEEYDKDKHEGYDGGNYRGYDGGKHEEYGRGKHE--------GYDGGNYGGYGGGKHD 180
            KHEEYDKDKHEGY+GGNY GY GGK+EEY RGKHE        GYDGGNYGGYGGG+HD
Sbjct: 127 GKHEEYDKDKHEGYNGGNYGGYGGGKYEEYDRGKHEEYDKDKYGGYDGGNYGGYGGGRHD 186

Query: 181 EYDRGKHEEYERGKHEEYEGGNYGGYGGGKHEAYGGGKHEEYGKDKHEGYNGGNYGGYGG 240
           EYDRGKHEEY++GKHE Y+GGNYGGY GGKHE Y  GKHEEY KDKHEGY+GGNY GY G
Sbjct: 187 EYDRGKHEEYDKGKHEGYDGGNYGGYDGGKHEEYNRGKHEEYDKDKHEGYDGGNYRGYDG 246

Query: 241 GKHEEYDKDKHDGYDGGKYGGYSGGKHEEYD--------KDKHEGYDGGNYGGYGFSKHE 300
           GKHEEY + KH+GYDGG YGGY GGKH+EYD        KDKH+GYDGGNYGGY   KHE
Sbjct: 247 GKHEEYGRGKHEGYDGGNYGGYGGGKHDEYDRGKHEEYNKDKHDGYDGGNYGGYSGGKHE 306

Query: 301 EYDKDKHEGYDGGNYGGYRICSAARRLSSSNEGYGSSSGHGYSSYASVGEYGVEKYGNGY 360
           EYDKDKH+GYDGG YGGY            +EGY   +  GYS      EY  +K+    
Sbjct: 307 EYDKDKHDGYDGGKYGGYSGGKHEEYDKDKHEGYDGGNYGGYSGGKHE-EYDKDKH---- 366

Query: 361 GKDGSYGGKYGEYNGGKYGGYDGGKHERYDGGNYGGYSGGRHE--------GYDEENYGG 420
             +G  GGKYG Y GGK+  YD  KH+ YDGGNYG YSGG+HE        GYD   YGG
Sbjct: 367 --EGYDGGKYGGYGGGKHEEYDKDKHDGYDGGNYGRYSGGKHEEYDKDKHDGYDGGKYGG 426

Query: 421 YDGGKHEEYERGKHEEYEGGNYGGYGGGKHE----------------AYGGGKHEEYGKD 480
           Y+GGKHEEY++ KHE Y+GGNYGGY GGKHE                 YGGGKHEEY KD
Sbjct: 427 YNGGKHEEYDKDKHEGYDGGNYGGYSGGKHEEYDKDKHEGYDGGKYGGYGGGKHEEYDKD 486

Query: 481 KHEGYNGGNYGGYGGGKHEEYDKDKYEGYDGGKYGGYSGSKHEEYDKDKHKGYDGENYGG 540
           KH+GY+GGNYGGY GGKHEEYDKDK++GYDGGKYGGY+G KHEEYDKDKH+GYDG  YGG
Sbjct: 487 KHDGYDGGNYGGYSGGKHEEYDKDKHDGYDGGKYGGYNGGKHEEYDKDKHEGYDGGKYGG 546

Query: 541 YSGGKHEEYDKDKHDGYDGGKYGEYSGSKHEEYDKDKHEGYDGGKYGGYSGSKHEEYDKD 600
           YSG KHEEYDKDKHDGYDGGKYG Y+G KHEEYDKDKHEGYDGGKYGGYSGSKHEEYDKD
Sbjct: 547 YSGSKHEEYDKDKHDGYDGGKYGGYNGGKHEEYDKDKHEGYDGGKYGGYSGSKHEEYDKD 606

Query: 601 KYDGYDGRNYGGYDQGKHEKYGEGKHEEYSGGNYRGY--------GGSKHEGYAP 607
           KY+GYDG NYGGY++GKHE+Y + KHE Y G NYRGY        G SKHEGYAP
Sbjct: 607 KYEGYDGGNYGGYNKGKHEEYDKDKHEGYDGENYRGYDQGKHEEYGESKHEGYAP 654

BLAST of Cp4.1LG15g02110 vs. NCBI nr
Match: XP_022963700.1 (RNA-binding motif protein, X-linked-like-3 isoform X1 [Cucurbita moschata])

HSP 1 Score: 788 bits (2035), Expect = 1.24e-274
Identity = 471/713 (66.06%), Postives = 501/713 (70.27%), Query Frame = 0

Query: 1   ICSAARRLSSSNEGYGSSSGHGYSSYASVGEYGVEKYGNGYGKDGSYGGKYGEYNGGKYG 60
           ICSAARRLSSS EGYGSSSGHGYSSYASVGEYGVE YGNGYGKDG+YGGKYGEYNGGKYG
Sbjct: 21  ICSAARRLSSSYEGYGSSSGHGYSSYASVGEYGVENYGNGYGKDGAYGGKYGEYNGGKYG 80

Query: 61  GYDGGKHERYDGGNYGGYSGGRHEGYDEENYGGYDGGKHEEYGGCKHKGYDGGNYGGYDF 120
           GYDGGKHERYD GNYGGYSGGRHEGYD ENYGGY GGKHEEYGG KHKGYDGGNYGGY F
Sbjct: 81  GYDGGKHERYDSGNYGGYSGGRHEGYDGENYGGYGGGKHEEYGGGKHKGYDGGNYGGYGF 140

Query: 121 SKHEEYDKDKHEGYDGGNY----------------------------------------- 180
            KHEEYDKDKHEGY+GGNY                                         
Sbjct: 141 GKHEEYDKDKHEGYNGGNYGGYGGGKYEEYDRGNYGGFGGGRHEEYDRGKHEEYDKGKHE 200

Query: 181 ---------------RGYDGGKHEEYGRGKHEGYDGGNYGGYGGGKHDEYDRGKHEEYER 240
                          RGYDGGKHEEYGRGKHEGYDGGNYGGYGGGKHDEYDRGKHEEY++
Sbjct: 201 EYDKDKHEGYDRGNYRGYDGGKHEEYGRGKHEGYDGGNYGGYGGGKHDEYDRGKHEEYDK 260

Query: 241 GKHEEYEGGNYGGYGGGKHEAYGGG--------KHEEYGKDKHEGYNGGNYGGYGGG--- 300
           GKHE YEGGNYGGYGGGKHE Y GG        KHEEY KDKHEGYNGGNYGGY GG   
Sbjct: 261 GKHEGYEGGNYGGYGGGKHEEYSGGNYGGYDGGKHEEYDKDKHEGYNGGNYGGYDGGNYG 320

Query: 301 -----KHEEYDKDKHDGYDGGKYGGYSGGKHEEYDKDKHEGYDGGNYGGYGFSKHEEYDK 360
                KHEEYDKDKH+GYDGG YGGYSGGKHEEYDKDKHEGYDGG YGGYG SKHEEYDK
Sbjct: 321 GYDGSKHEEYDKDKHEGYDGGNYGGYSGGKHEEYDKDKHEGYDGGKYGGYGGSKHEEYDK 380

Query: 361 DKHEGYDGGNYGGYRICSAARRLSSSNEGYGSSSGHGYSSYASVGEYGVEKYGNGYGKDG 420
           DKHEGYDGGNYGGY         S  N G  S S H         EY  +K+      +G
Sbjct: 381 DKHEGYDGGNYGGY---------SGGNYGGYSRSKHE--------EYDKDKH------EG 440

Query: 421 SYGGKYGEYNGGKYGGYDGGKHERYDGGNYGGYSGGRHEGYDEEN--------YGGYDGG 480
             GG YG Y+GGK+  Y+  KH+ YDGG YGGYSGG+HE YD++         YGGY GG
Sbjct: 441 YDGGNYGGYSGGKHEEYNKDKHDGYDGGKYGGYSGGKHEEYDKDKHEVYDGGKYGGYSGG 500

Query: 481 KHEEYERGKHEEYEGGNYGGYGGGKHEAYGGGKHEEYGKDKHEGYNGGNYGGYGGGKHEE 540
           KHEEYE+ KHE Y+GGNYGGY GGK+        EEY KDKHEGY+GGNYGGY GGKHEE
Sbjct: 501 KHEEYEKDKHEGYDGGNYGGYNGGKY--------EEYDKDKHEGYDGGNYGGYSGGKHEE 560

Query: 541 YDKDKYEGYDGGKYGGYSGSKHEEYDKDKHKGYDGENYGGYSGGKHEEYDKDKHDGYDG- 600
           YDKDK+EGYDGGKYGGY GSKHEEYDKDKH+GYDG NYGGY   KHEEYD+ KH+GYDG 
Sbjct: 561 YDKDKHEGYDGGKYGGYGGSKHEEYDKDKHEGYDGGNYGGYRS-KHEEYDRGKHEGYDGV 620

Query: 601 ---------------------------GKYGEYSGSKHEEYDKDKHEGYDGGKYGGYSGS 605
                                      GK+ +Y G KHEEY +DKH+GYDGG YGGY G 
Sbjct: 621 NHGGYGGGNYGGYGGGKHEEYGRGYYGGKHEQYDGGKHEEYGRDKHKGYDGGNYGGYDGG 680

BLAST of Cp4.1LG15g02110 vs. NCBI nr
Match: XP_022963703.1 (hornerin-like isoform X3 [Cucurbita moschata])

HSP 1 Score: 785 bits (2026), Expect = 1.30e-273
Identity = 465/697 (66.71%), Postives = 495/697 (71.02%), Query Frame = 0

Query: 1   ICSAARRLSSSNEGYGSSSGHGYSSYASVGEYGVEKYGNGYGKDGSYGGKYGEYNGGKYG 60
           ICSAARRLSSS EGYGSSSGHGYSSYASVGEYGVE YGNGYGKDG+YGGKYGEYNGGKYG
Sbjct: 21  ICSAARRLSSSYEGYGSSSGHGYSSYASVGEYGVENYGNGYGKDGAYGGKYGEYNGGKYG 80

Query: 61  GYDGGKHERYDGGNYGGYSGGRHEGYDEENYGGYDGGKHEEYGGCKHKGYDGGNYGGYDF 120
           GYDGGKHERYD GNYGGYSGGRHEGYD ENYGGY GGKHEEYGG KHKGYDGGNYGGY F
Sbjct: 81  GYDGGKHERYDSGNYGGYSGGRHEGYDGENYGGYGGGKHEEYGGGKHKGYDGGNYGGYGF 140

Query: 121 SKHEEYDKDKHEGYDGGNY----------------------------------------- 180
            KHEEYDKDKHEGY+GGNY                                         
Sbjct: 141 GKHEEYDKDKHEGYNGGNYGGYGGGKYEEYDRGNYGGFGGGRHEEYDRGKHEEYDKGKHE 200

Query: 181 ---------------RGYDGGKHEEYGRGKHEGYDGGNYGGYGGGKHDEYDRGKHEEYER 240
                          RGYDGGKHEEYGRGKHEGYDGGNYGGYGGGKHDEYDRGKHEEY++
Sbjct: 201 EYDKDKHEGYDRGNYRGYDGGKHEEYGRGKHEGYDGGNYGGYGGGKHDEYDRGKHEEYDK 260

Query: 241 GKHEEYEGGNYGGYGGGKHEAYGGGKHEEYGKDKHEGYNGGNYGGYGGGKHEEYDKDKHD 300
           GKHE YEGGNYGGYGGGKH        EEY KDKHEGYNGGNYGGY GGKHEEYDKDKH+
Sbjct: 261 GKHEGYEGGNYGGYGGGKH--------EEYDKDKHEGYNGGNYGGYDGGKHEEYDKDKHE 320

Query: 301 GYDGGKYGGYSGGKHEEYDKDKHEGYDGGNYGGYGFSKHEEYDKDKHEGYDGGNYGGYRI 360
           GYDGG YGGYSGGKHEEYDKDKHEGYDGG YGGYG SKHEEYDKDKHEGYDGGNYGGY  
Sbjct: 321 GYDGGNYGGYSGGKHEEYDKDKHEGYDGGKYGGYGGSKHEEYDKDKHEGYDGGNYGGY-- 380

Query: 361 CSAARRLSSSNEGYGSSSGHGYSSYASVGEYGVEKYGNGYGKDGSYGGKYGEYNGGKYGG 420
                  S  N G  S S H         EY  +K+      +G  GG YG Y+GGK+  
Sbjct: 381 -------SGGNYGGYSRSKHE--------EYDKDKH------EGYDGGNYGGYSGGKHEE 440

Query: 421 YDGGKHERYDGGNYGGYSGGRHEGYDEEN--------YGGYDGGKHEEYERGKHEEYEGG 480
           Y+  KH+ YDGG YGGYSGG+HE YD++         YGGY GGKHEEYE+ KHE Y+GG
Sbjct: 441 YNKDKHDGYDGGKYGGYSGGKHEEYDKDKHEVYDGGKYGGYSGGKHEEYEKDKHEGYDGG 500

Query: 481 NYGGYGGGKHEAYGGGKHEEYGKDKHEGYNGGNYGGYGGGKHEEYDKDKYEGYDGGKYGG 540
           NYGGY GGK+        EEY KDKHEGY+GGNYGGY GGKHEEYDKDK+EGYDGGKYGG
Sbjct: 501 NYGGYNGGKY--------EEYDKDKHEGYDGGNYGGYSGGKHEEYDKDKHEGYDGGKYGG 560

Query: 541 YSGSKHEEYDKDKHKGYDGENYGGYSGGKHEEYDKDKHDGYDG----------------- 600
           Y GSKHEEYDKDKH+GYDG NYGGY   KHEEYD+ KH+GYDG                 
Sbjct: 561 YGGSKHEEYDKDKHEGYDGGNYGGYRS-KHEEYDRGKHEGYDGVNHGGYGGGNYGGYGGG 620

Query: 601 -----------GKYGEYSGSKHEEYDKDKHEGYDGGKYGGYSGSKHEEYDKDKYDGYDGR 605
                      GK+ +Y G KHEEY +DKH+GYDGG YGGY G KHEEY    Y GYDG 
Sbjct: 621 KHEEYGRGYYGGKHEQYDGGKHEEYGRDKHKGYDGGNYGGYDGGKHEEYSGGNYGGYDGG 677

BLAST of Cp4.1LG15g02110 vs. NCBI nr
Match: XP_022963704.1 (RNA-binding motif protein, X-linked-like-3 isoform X4 [Cucurbita moschata])

HSP 1 Score: 775 bits (2001), Expect = 6.05e-270
Identity = 463/693 (66.81%), Postives = 493/693 (71.14%), Query Frame = 0

Query: 1   ICSAARRLSSSNEGYGSSSGHGYSSYASVGEYGVEKYGNGYGKDGSYGGKYGEYNGGKYG 60
           ICSAARRLSSS EGYGSSSGHGYSSYASVGEYGVE YGNGYGKDG+YGGKYGEYNGGKYG
Sbjct: 21  ICSAARRLSSSYEGYGSSSGHGYSSYASVGEYGVENYGNGYGKDGAYGGKYGEYNGGKYG 80

Query: 61  GYDGGKHERYDGGNYGGYSGGRHEGYDEENYGGYDGGKHEEYGGCKHKGYDGGNYGGYDF 120
           GYDGGKHERYD GNYGGYSGGRHEGYD ENYGGY GGKHEEYGG KHKGYDGGNYGGY F
Sbjct: 81  GYDGGKHERYDSGNYGGYSGGRHEGYDGENYGGYGGGKHEEYGGGKHKGYDGGNYGGYGF 140

Query: 121 SKHEEYDKDKHEGYDGGNY----------------------------------------- 180
            KHEEYDKDKHEGY+GGNY                                         
Sbjct: 141 GKHEEYDKDKHEGYNGGNYGGYGGGKYEEYDRGNYGGFGGGRHEEYDRGKHEEYDKGKHE 200

Query: 181 ---------------RGYDGGKHEEYGRGKHEGYDGGNYGGYGGGKHDEYDRGKHEEYER 240
                          RGYDGGKHEEYGRGKHEGYDGGNYGGYGGGKHDEYDRGKHEEY++
Sbjct: 201 EYDKDKHEGYDRGNYRGYDGGKHEEYGRGKHEGYDGGNYGGYGGGKHDEYDRGKHEEYDK 260

Query: 241 GKHEEYEGGNYGGYGGGKHEAYGGG--------KHEEYGKDKHEGYNGGNYGGYGGGKHE 300
           GKHE YEGGNYGGYGGGKHE Y GG        KHEEY KDKHEGY+GGNYGGY GGKHE
Sbjct: 261 GKHEGYEGGNYGGYGGGKHEEYSGGNYGGYDGGKHEEYDKDKHEGYDGGNYGGYSGGKHE 320

Query: 301 EYDKDKHDGYDGGKYGGYSGGKHEEYDKDKHEGYDGGNYGGY------GFS--KHEEYDK 360
           EYDKDKH+GYDGGKYGGY G KHEEYDKDKHEGYDGGNYGGY      G+S  KHEEYDK
Sbjct: 321 EYDKDKHEGYDGGKYGGYGGSKHEEYDKDKHEGYDGGNYGGYSGGNYGGYSRSKHEEYDK 380

Query: 361 DKHEGYDGGNYGGYRICSAARRLSSSNEGYGSSSGHGYSSYASVGEYGVEKYGNGYGKDG 420
           DKHEGYDGGNYGGY   S  +                        EY  +K+      DG
Sbjct: 381 DKHEGYDGGNYGGY---SGGKHE----------------------EYNKDKH------DG 440

Query: 421 SYGGKYGEYNGGKYGGYDGGKHERYDGGNYGGYSGGRHE--------GYDEENYGGYDGG 480
             GGKYG Y+GGK+  YD  KHE YDGG YGGYSGG+HE        GYD  NYGGY+GG
Sbjct: 441 YDGGKYGGYSGGKHEEYDKDKHEVYDGGKYGGYSGGKHEEYEKDKHEGYDGGNYGGYNGG 500

Query: 481 KHEEYERGKHEEYEGGNYGGYGGGKHEAYGGGKHEEYGKDKHEGYNGGNYGGYGGGKHEE 540
           K+EEY++ KHE Y+GGNYGGY GGKH        EEY KDKHEGY+GG YGGYGG KHEE
Sbjct: 501 KYEEYDKDKHEGYDGGNYGGYSGGKH--------EEYDKDKHEGYDGGKYGGYGGSKHEE 560

Query: 541 YDKDKYEGYDGGKYGGYSGSKHEEYDKDKHKGYDGEN--------YGGYSGGKHEEYDKD 600
           YDKDK+EGYDGG YGGY  SKHEEYD+ KH+GYDG N        YGGY GGKHEEY + 
Sbjct: 561 YDKDKHEGYDGGNYGGYR-SKHEEYDRGKHEGYDGVNHGGYGGGNYGGYGGGKHEEYGR- 620

Query: 601 KHDGYDGGKYGEYSGSKHEEYDKDKHEGYDGGKYGGYSGSKHEEYDKDKYDGYDGRNYGG 605
              GY GGK+ +Y G KHEEY +DKH+GYDGG YGGY G KHEEY    Y GYDG  + G
Sbjct: 621 ---GYYGGKHEQYDGGKHEEYGRDKHKGYDGGNYGGYDGGKHEEYSGGNYGGYDGGKHEG 669

BLAST of Cp4.1LG15g02110 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1HIR4 (RNA-binding motif protein, X-linked-like-3 isoform X1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111463951 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 788 bits (2035), Expect = 5.99e-275
Identity = 471/713 (66.06%), Postives = 501/713 (70.27%), Query Frame = 0

Query: 1   ICSAARRLSSSNEGYGSSSGHGYSSYASVGEYGVEKYGNGYGKDGSYGGKYGEYNGGKYG 60
           ICSAARRLSSS EGYGSSSGHGYSSYASVGEYGVE YGNGYGKDG+YGGKYGEYNGGKYG
Sbjct: 21  ICSAARRLSSSYEGYGSSSGHGYSSYASVGEYGVENYGNGYGKDGAYGGKYGEYNGGKYG 80

Query: 61  GYDGGKHERYDGGNYGGYSGGRHEGYDEENYGGYDGGKHEEYGGCKHKGYDGGNYGGYDF 120
           GYDGGKHERYD GNYGGYSGGRHEGYD ENYGGY GGKHEEYGG KHKGYDGGNYGGY F
Sbjct: 81  GYDGGKHERYDSGNYGGYSGGRHEGYDGENYGGYGGGKHEEYGGGKHKGYDGGNYGGYGF 140

Query: 121 SKHEEYDKDKHEGYDGGNY----------------------------------------- 180
            KHEEYDKDKHEGY+GGNY                                         
Sbjct: 141 GKHEEYDKDKHEGYNGGNYGGYGGGKYEEYDRGNYGGFGGGRHEEYDRGKHEEYDKGKHE 200

Query: 181 ---------------RGYDGGKHEEYGRGKHEGYDGGNYGGYGGGKHDEYDRGKHEEYER 240
                          RGYDGGKHEEYGRGKHEGYDGGNYGGYGGGKHDEYDRGKHEEY++
Sbjct: 201 EYDKDKHEGYDRGNYRGYDGGKHEEYGRGKHEGYDGGNYGGYGGGKHDEYDRGKHEEYDK 260

Query: 241 GKHEEYEGGNYGGYGGGKHEAYGGG--------KHEEYGKDKHEGYNGGNYGGYGGG--- 300
           GKHE YEGGNYGGYGGGKHE Y GG        KHEEY KDKHEGYNGGNYGGY GG   
Sbjct: 261 GKHEGYEGGNYGGYGGGKHEEYSGGNYGGYDGGKHEEYDKDKHEGYNGGNYGGYDGGNYG 320

Query: 301 -----KHEEYDKDKHDGYDGGKYGGYSGGKHEEYDKDKHEGYDGGNYGGYGFSKHEEYDK 360
                KHEEYDKDKH+GYDGG YGGYSGGKHEEYDKDKHEGYDGG YGGYG SKHEEYDK
Sbjct: 321 GYDGSKHEEYDKDKHEGYDGGNYGGYSGGKHEEYDKDKHEGYDGGKYGGYGGSKHEEYDK 380

Query: 361 DKHEGYDGGNYGGYRICSAARRLSSSNEGYGSSSGHGYSSYASVGEYGVEKYGNGYGKDG 420
           DKHEGYDGGNYGGY         S  N G  S S H         EY  +K+      +G
Sbjct: 381 DKHEGYDGGNYGGY---------SGGNYGGYSRSKHE--------EYDKDKH------EG 440

Query: 421 SYGGKYGEYNGGKYGGYDGGKHERYDGGNYGGYSGGRHEGYDEEN--------YGGYDGG 480
             GG YG Y+GGK+  Y+  KH+ YDGG YGGYSGG+HE YD++         YGGY GG
Sbjct: 441 YDGGNYGGYSGGKHEEYNKDKHDGYDGGKYGGYSGGKHEEYDKDKHEVYDGGKYGGYSGG 500

Query: 481 KHEEYERGKHEEYEGGNYGGYGGGKHEAYGGGKHEEYGKDKHEGYNGGNYGGYGGGKHEE 540
           KHEEYE+ KHE Y+GGNYGGY GGK+        EEY KDKHEGY+GGNYGGY GGKHEE
Sbjct: 501 KHEEYEKDKHEGYDGGNYGGYNGGKY--------EEYDKDKHEGYDGGNYGGYSGGKHEE 560

Query: 541 YDKDKYEGYDGGKYGGYSGSKHEEYDKDKHKGYDGENYGGYSGGKHEEYDKDKHDGYDG- 600
           YDKDK+EGYDGGKYGGY GSKHEEYDKDKH+GYDG NYGGY   KHEEYD+ KH+GYDG 
Sbjct: 561 YDKDKHEGYDGGKYGGYGGSKHEEYDKDKHEGYDGGNYGGYRS-KHEEYDRGKHEGYDGV 620

Query: 601 ---------------------------GKYGEYSGSKHEEYDKDKHEGYDGGKYGGYSGS 605
                                      GK+ +Y G KHEEY +DKH+GYDGG YGGY G 
Sbjct: 621 NHGGYGGGNYGGYGGGKHEEYGRGYYGGKHEQYDGGKHEEYGRDKHKGYDGGNYGGYDGG 680

BLAST of Cp4.1LG15g02110 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1HIP3 (hornerin-like isoform X3 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111463951 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 785 bits (2026), Expect = 6.30e-274
Identity = 465/697 (66.71%), Postives = 495/697 (71.02%), Query Frame = 0

Query: 1   ICSAARRLSSSNEGYGSSSGHGYSSYASVGEYGVEKYGNGYGKDGSYGGKYGEYNGGKYG 60
           ICSAARRLSSS EGYGSSSGHGYSSYASVGEYGVE YGNGYGKDG+YGGKYGEYNGGKYG
Sbjct: 21  ICSAARRLSSSYEGYGSSSGHGYSSYASVGEYGVENYGNGYGKDGAYGGKYGEYNGGKYG 80

Query: 61  GYDGGKHERYDGGNYGGYSGGRHEGYDEENYGGYDGGKHEEYGGCKHKGYDGGNYGGYDF 120
           GYDGGKHERYD GNYGGYSGGRHEGYD ENYGGY GGKHEEYGG KHKGYDGGNYGGY F
Sbjct: 81  GYDGGKHERYDSGNYGGYSGGRHEGYDGENYGGYGGGKHEEYGGGKHKGYDGGNYGGYGF 140

Query: 121 SKHEEYDKDKHEGYDGGNY----------------------------------------- 180
            KHEEYDKDKHEGY+GGNY                                         
Sbjct: 141 GKHEEYDKDKHEGYNGGNYGGYGGGKYEEYDRGNYGGFGGGRHEEYDRGKHEEYDKGKHE 200

Query: 181 ---------------RGYDGGKHEEYGRGKHEGYDGGNYGGYGGGKHDEYDRGKHEEYER 240
                          RGYDGGKHEEYGRGKHEGYDGGNYGGYGGGKHDEYDRGKHEEY++
Sbjct: 201 EYDKDKHEGYDRGNYRGYDGGKHEEYGRGKHEGYDGGNYGGYGGGKHDEYDRGKHEEYDK 260

Query: 241 GKHEEYEGGNYGGYGGGKHEAYGGGKHEEYGKDKHEGYNGGNYGGYGGGKHEEYDKDKHD 300
           GKHE YEGGNYGGYGGGKH        EEY KDKHEGYNGGNYGGY GGKHEEYDKDKH+
Sbjct: 261 GKHEGYEGGNYGGYGGGKH--------EEYDKDKHEGYNGGNYGGYDGGKHEEYDKDKHE 320

Query: 301 GYDGGKYGGYSGGKHEEYDKDKHEGYDGGNYGGYGFSKHEEYDKDKHEGYDGGNYGGYRI 360
           GYDGG YGGYSGGKHEEYDKDKHEGYDGG YGGYG SKHEEYDKDKHEGYDGGNYGGY  
Sbjct: 321 GYDGGNYGGYSGGKHEEYDKDKHEGYDGGKYGGYGGSKHEEYDKDKHEGYDGGNYGGY-- 380

Query: 361 CSAARRLSSSNEGYGSSSGHGYSSYASVGEYGVEKYGNGYGKDGSYGGKYGEYNGGKYGG 420
                  S  N G  S S H         EY  +K+      +G  GG YG Y+GGK+  
Sbjct: 381 -------SGGNYGGYSRSKHE--------EYDKDKH------EGYDGGNYGGYSGGKHEE 440

Query: 421 YDGGKHERYDGGNYGGYSGGRHEGYDEEN--------YGGYDGGKHEEYERGKHEEYEGG 480
           Y+  KH+ YDGG YGGYSGG+HE YD++         YGGY GGKHEEYE+ KHE Y+GG
Sbjct: 441 YNKDKHDGYDGGKYGGYSGGKHEEYDKDKHEVYDGGKYGGYSGGKHEEYEKDKHEGYDGG 500

Query: 481 NYGGYGGGKHEAYGGGKHEEYGKDKHEGYNGGNYGGYGGGKHEEYDKDKYEGYDGGKYGG 540
           NYGGY GGK+        EEY KDKHEGY+GGNYGGY GGKHEEYDKDK+EGYDGGKYGG
Sbjct: 501 NYGGYNGGKY--------EEYDKDKHEGYDGGNYGGYSGGKHEEYDKDKHEGYDGGKYGG 560

Query: 541 YSGSKHEEYDKDKHKGYDGENYGGYSGGKHEEYDKDKHDGYDG----------------- 600
           Y GSKHEEYDKDKH+GYDG NYGGY   KHEEYD+ KH+GYDG                 
Sbjct: 561 YGGSKHEEYDKDKHEGYDGGNYGGYRS-KHEEYDRGKHEGYDGVNHGGYGGGNYGGYGGG 620

Query: 601 -----------GKYGEYSGSKHEEYDKDKHEGYDGGKYGGYSGSKHEEYDKDKYDGYDGR 605
                      GK+ +Y G KHEEY +DKH+GYDGG YGGY G KHEEY    Y GYDG 
Sbjct: 621 KHEEYGRGYYGGKHEQYDGGKHEEYGRDKHKGYDGGNYGGYDGGKHEEYSGGNYGGYDGG 677

BLAST of Cp4.1LG15g02110 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1HKZ7 (RNA-binding motif protein, X-linked-like-3 isoform X4 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111463951 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 775 bits (2001), Expect = 2.93e-270
Identity = 463/693 (66.81%), Postives = 493/693 (71.14%), Query Frame = 0

Query: 1   ICSAARRLSSSNEGYGSSSGHGYSSYASVGEYGVEKYGNGYGKDGSYGGKYGEYNGGKYG 60
           ICSAARRLSSS EGYGSSSGHGYSSYASVGEYGVE YGNGYGKDG+YGGKYGEYNGGKYG
Sbjct: 21  ICSAARRLSSSYEGYGSSSGHGYSSYASVGEYGVENYGNGYGKDGAYGGKYGEYNGGKYG 80

Query: 61  GYDGGKHERYDGGNYGGYSGGRHEGYDEENYGGYDGGKHEEYGGCKHKGYDGGNYGGYDF 120
           GYDGGKHERYD GNYGGYSGGRHEGYD ENYGGY GGKHEEYGG KHKGYDGGNYGGY F
Sbjct: 81  GYDGGKHERYDSGNYGGYSGGRHEGYDGENYGGYGGGKHEEYGGGKHKGYDGGNYGGYGF 140

Query: 121 SKHEEYDKDKHEGYDGGNY----------------------------------------- 180
            KHEEYDKDKHEGY+GGNY                                         
Sbjct: 141 GKHEEYDKDKHEGYNGGNYGGYGGGKYEEYDRGNYGGFGGGRHEEYDRGKHEEYDKGKHE 200

Query: 181 ---------------RGYDGGKHEEYGRGKHEGYDGGNYGGYGGGKHDEYDRGKHEEYER 240
                          RGYDGGKHEEYGRGKHEGYDGGNYGGYGGGKHDEYDRGKHEEY++
Sbjct: 201 EYDKDKHEGYDRGNYRGYDGGKHEEYGRGKHEGYDGGNYGGYGGGKHDEYDRGKHEEYDK 260

Query: 241 GKHEEYEGGNYGGYGGGKHEAYGGG--------KHEEYGKDKHEGYNGGNYGGYGGGKHE 300
           GKHE YEGGNYGGYGGGKHE Y GG        KHEEY KDKHEGY+GGNYGGY GGKHE
Sbjct: 261 GKHEGYEGGNYGGYGGGKHEEYSGGNYGGYDGGKHEEYDKDKHEGYDGGNYGGYSGGKHE 320

Query: 301 EYDKDKHDGYDGGKYGGYSGGKHEEYDKDKHEGYDGGNYGGY------GFS--KHEEYDK 360
           EYDKDKH+GYDGGKYGGY G KHEEYDKDKHEGYDGGNYGGY      G+S  KHEEYDK
Sbjct: 321 EYDKDKHEGYDGGKYGGYGGSKHEEYDKDKHEGYDGGNYGGYSGGNYGGYSRSKHEEYDK 380

Query: 361 DKHEGYDGGNYGGYRICSAARRLSSSNEGYGSSSGHGYSSYASVGEYGVEKYGNGYGKDG 420
           DKHEGYDGGNYGGY   S  +                        EY  +K+      DG
Sbjct: 381 DKHEGYDGGNYGGY---SGGKHE----------------------EYNKDKH------DG 440

Query: 421 SYGGKYGEYNGGKYGGYDGGKHERYDGGNYGGYSGGRHE--------GYDEENYGGYDGG 480
             GGKYG Y+GGK+  YD  KHE YDGG YGGYSGG+HE        GYD  NYGGY+GG
Sbjct: 441 YDGGKYGGYSGGKHEEYDKDKHEVYDGGKYGGYSGGKHEEYEKDKHEGYDGGNYGGYNGG 500

Query: 481 KHEEYERGKHEEYEGGNYGGYGGGKHEAYGGGKHEEYGKDKHEGYNGGNYGGYGGGKHEE 540
           K+EEY++ KHE Y+GGNYGGY GGKH        EEY KDKHEGY+GG YGGYGG KHEE
Sbjct: 501 KYEEYDKDKHEGYDGGNYGGYSGGKH--------EEYDKDKHEGYDGGKYGGYGGSKHEE 560

Query: 541 YDKDKYEGYDGGKYGGYSGSKHEEYDKDKHKGYDGEN--------YGGYSGGKHEEYDKD 600
           YDKDK+EGYDGG YGGY  SKHEEYD+ KH+GYDG N        YGGY GGKHEEY + 
Sbjct: 561 YDKDKHEGYDGGNYGGYR-SKHEEYDRGKHEGYDGVNHGGYGGGNYGGYGGGKHEEYGR- 620

Query: 601 KHDGYDGGKYGEYSGSKHEEYDKDKHEGYDGGKYGGYSGSKHEEYDKDKYDGYDGRNYGG 605
              GY GGK+ +Y G KHEEY +DKH+GYDGG YGGY G KHEEY    Y GYDG  + G
Sbjct: 621 ---GYYGGKHEQYDGGKHEEYGRDKHKGYDGGNYGGYDGGKHEEYSGGNYGGYDGGKHEG 669

BLAST of Cp4.1LG15g02110 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1HIR9 (TATA-binding protein-associated factor 2N-like isoform X5 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111463951 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 775 bits (2000), Expect = 3.19e-270
Identity = 460/685 (67.15%), Postives = 491/685 (71.68%), Query Frame = 0

Query: 1   ICSAARRLSSSNEGYGSSSGHGYSSYASVGEYGVEKYGNGYGKDGSYGGKYGEYNGGKYG 60
           ICSAARRLSSS EGYGSSSGHGYSSYASVGEYGVE YGNGYGKDG+YGGKYGEYNGGKYG
Sbjct: 21  ICSAARRLSSSYEGYGSSSGHGYSSYASVGEYGVENYGNGYGKDGAYGGKYGEYNGGKYG 80

Query: 61  GYDGGKHERYDGGNYGGYSGGRHEGYDEENYGGYDGGKHEEYGGCKHKGYDGGNYGGYDF 120
           GYDGGKHERYD GNYGGYSGGRHEGYD ENYGGY GGKHEEYGG KHKGYDGGNYGGY F
Sbjct: 81  GYDGGKHERYDSGNYGGYSGGRHEGYDGENYGGYGGGKHEEYGGGKHKGYDGGNYGGYGF 140

Query: 121 SKHEEYDKDKHEGYDGGNY----------------------------------------- 180
            KHEEYDKDKHEGY+GGNY                                         
Sbjct: 141 GKHEEYDKDKHEGYNGGNYGGYGGGKYEEYDRGNYGGFGGGRHEEYDRGKHEEYDKGKHE 200

Query: 181 ---------------RGYDGGKHEEYGRGKHEGYDGGNYGGYGGGKHDEYDRGKHEEYER 240
                          RGYDGGKHEEYGRGKHEGYDGGNYGGYGGGKHDEYDRGKHEEY++
Sbjct: 201 EYDKDKHEGYDRGNYRGYDGGKHEEYGRGKHEGYDGGNYGGYGGGKHDEYDRGKHEEYDK 260

Query: 241 GKHEEYEGGNYGGYGGGKHEAYGGGKHEEYGKDKHEGYNGGNYGGYGGGKHEEYDKDKHD 300
           GKHE YEGGNYGGYGGGK+  Y  GKHEEY KDKHEGY+GGNYGGY GGKHEEYDKDKH+
Sbjct: 261 GKHEGYEGGNYGGYGGGKYGGYSRGKHEEYDKDKHEGYDGGNYGGYSGGKHEEYDKDKHE 320

Query: 301 GYDGGKYGGYSGGKHEEYDKDKHEGYDGGNYGGY------GFS--KHEEYDKDKHEGYDG 360
           GYDGGKYGGY G KHEEYDKDKHEGYDGGNYGGY      G+S  KHEEYDKDKHEGYDG
Sbjct: 321 GYDGGKYGGYGGSKHEEYDKDKHEGYDGGNYGGYSGGNYGGYSRSKHEEYDKDKHEGYDG 380

Query: 361 GNYGGYRICSAARRLSSSNEGYGSSSGHGYSSYASVGEYGVEKYGNGYGKDGSYGGKYGE 420
           GNYGGY   S  +                        EY  +K+      DG  GGKYG 
Sbjct: 381 GNYGGY---SGGKHE----------------------EYNKDKH------DGYDGGKYGG 440

Query: 421 YNGGKYGGYDGGKHERYDGGNYGGYSGGRHE--------GYDEENYGGYDGGKHEEYERG 480
           Y+GGK+  YD  KHE YDGG YGGYSGG+HE        GYD  NYGGY+GGK+EEY++ 
Sbjct: 441 YSGGKHEEYDKDKHEVYDGGKYGGYSGGKHEEYEKDKHEGYDGGNYGGYNGGKYEEYDKD 500

Query: 481 KHEEYEGGNYGGYGGGKHEAYGGGKHEEYGKDKHEGYNGGNYGGYGGGKHEEYDKDKYEG 540
           KHE Y+GGNYGGY GGKH        EEY KDKHEGY+GG YGGYGG KHEEYDKDK+EG
Sbjct: 501 KHEGYDGGNYGGYSGGKH--------EEYDKDKHEGYDGGKYGGYGGSKHEEYDKDKHEG 560

Query: 541 YDGGKYGGYSGSKHEEYDKDKHKGYDGEN--------YGGYSGGKHEEYDKDKHDGYDGG 600
           YDGG YGGY  SKHEEYD+ KH+GYDG N        YGGY GGKHEEY +    GY GG
Sbjct: 561 YDGGNYGGYR-SKHEEYDRGKHEGYDGVNHGGYGGGNYGGYGGGKHEEYGR----GYYGG 620

Query: 601 KYGEYSGSKHEEYDKDKHEGYDGGKYGGYSGSKHEEYDKDKYDGYDGRNYGGYDQGKHEK 605
           K+ +Y G KHEEY +DKH+GYDGG YGGY G KHEEY    Y GYDG  + GYD G +  
Sbjct: 621 KHEQYDGGKHEEYGRDKHKGYDGGNYGGYDGGKHEEYSGGNYGGYDGGKHEGYDGGNYGG 661

BLAST of Cp4.1LG15g02110 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1HGT5 (TATA-binding protein-associated factor 2N-like isoform X6 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111463951 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 773 bits (1996), Expect = 1.29e-269
Identity = 459/685 (67.01%), Postives = 490/685 (71.53%), Query Frame = 0

Query: 1   ICSAARRLSSSNEGYGSSSGHGYSSYASVGEYGVEKYGNGYGKDGSYGGKYGEYNGGKYG 60
           ICSAARRLSSS EGYGSSSGHGYSSYASVGEYGVE YGNGYGKDG+YGGKYGEYNGGKYG
Sbjct: 21  ICSAARRLSSSYEGYGSSSGHGYSSYASVGEYGVENYGNGYGKDGAYGGKYGEYNGGKYG 80

Query: 61  GYDGGKHERYDGGNYGGYSGGRHEGYDEENYGGYDGGKHEEYGGCKHKGYDGGNYGGYDF 120
           GYDGGKHERYD GNYGGYSGGRHEGYD ENYGGY GGKHEEYGG KHKGYDGGNYGGY F
Sbjct: 81  GYDGGKHERYDSGNYGGYSGGRHEGYDGENYGGYGGGKHEEYGGGKHKGYDGGNYGGYGF 140

Query: 121 SKHEEYDKDKHEGYDGGNY----------------------------------------- 180
            KHEEYDKDKHEGY+GGNY                                         
Sbjct: 141 GKHEEYDKDKHEGYNGGNYGGYGGGKYEEYDRGNYGGFGGGRHEEYDRGKHEEYDKGKHE 200

Query: 181 ---------------RGYDGGKHEEYGRGKHEGYDGGNYGGYGGGKHDEYDRGKHEEYER 240
                          RGYDGGKHEEYGRGKHEGYDGGNYGGYGGGKHDEYDRGKHEEY++
Sbjct: 201 EYDKDKHEGYDRGNYRGYDGGKHEEYGRGKHEGYDGGNYGGYGGGKHDEYDRGKHEEYDK 260

Query: 241 GKHEEYEGGNYGGYGGGKHEAYGGGKHEEYGKDKHEGYNGGNYGGYGGGKHEEYDKDKHD 300
           GKHE YEGGNYGGYGGG +  Y G KHEEY KDKHEGY+GGNYGGY GGKHEEYDKDKH+
Sbjct: 261 GKHEGYEGGNYGGYGGGNYGGYDGSKHEEYDKDKHEGYDGGNYGGYSGGKHEEYDKDKHE 320

Query: 301 GYDGGKYGGYSGGKHEEYDKDKHEGYDGGNYGGY------GFS--KHEEYDKDKHEGYDG 360
           GYDGGKYGGY G KHEEYDKDKHEGYDGGNYGGY      G+S  KHEEYDKDKHEGYDG
Sbjct: 321 GYDGGKYGGYGGSKHEEYDKDKHEGYDGGNYGGYSGGNYGGYSRSKHEEYDKDKHEGYDG 380

Query: 361 GNYGGYRICSAARRLSSSNEGYGSSSGHGYSSYASVGEYGVEKYGNGYGKDGSYGGKYGE 420
           GNYGGY   S  +                        EY  +K+      DG  GGKYG 
Sbjct: 381 GNYGGY---SGGKHE----------------------EYNKDKH------DGYDGGKYGG 440

Query: 421 YNGGKYGGYDGGKHERYDGGNYGGYSGGRHE--------GYDEENYGGYDGGKHEEYERG 480
           Y+GGK+  YD  KHE YDGG YGGYSGG+HE        GYD  NYGGY+GGK+EEY++ 
Sbjct: 441 YSGGKHEEYDKDKHEVYDGGKYGGYSGGKHEEYEKDKHEGYDGGNYGGYNGGKYEEYDKD 500

Query: 481 KHEEYEGGNYGGYGGGKHEAYGGGKHEEYGKDKHEGYNGGNYGGYGGGKHEEYDKDKYEG 540
           KHE Y+GGNYGGY GGKH        EEY KDKHEGY+GG YGGYGG KHEEYDKDK+EG
Sbjct: 501 KHEGYDGGNYGGYSGGKH--------EEYDKDKHEGYDGGKYGGYGGSKHEEYDKDKHEG 560

Query: 541 YDGGKYGGYSGSKHEEYDKDKHKGYDGEN--------YGGYSGGKHEEYDKDKHDGYDGG 600
           YDGG YGGY  SKHEEYD+ KH+GYDG N        YGGY GGKHEEY +    GY GG
Sbjct: 561 YDGGNYGGYR-SKHEEYDRGKHEGYDGVNHGGYGGGNYGGYGGGKHEEYGR----GYYGG 620

Query: 601 KYGEYSGSKHEEYDKDKHEGYDGGKYGGYSGSKHEEYDKDKYDGYDGRNYGGYDQGKHEK 605
           K+ +Y G KHEEY +DKH+GYDGG YGGY G KHEEY    Y GYDG  + GYD G +  
Sbjct: 621 KHEQYDGGKHEEYGRDKHKGYDGGNYGGYDGGKHEEYSGGNYGGYDGGKHEGYDGGNYGG 661

BLAST of Cp4.1LG15g02110 vs. TAIR 10
Match: AT3G07030.1 (Alba DNA/RNA-binding protein )

HSP 1 Score: 89.7 bits (221), Expect = 8.5e-18
Identity = 75/178 (42.13%), Postives = 104/178 (58.43%), Query Frame = 0

Query: 102 YGGCKHKGYDGGNYGGYDFSKHEEYDKDKHEGYDGGNYRGYDGGKHEEYGRGKHEGYDGG 161
           YGG +  GY GG   GY   +++ Y + +++ Y GG   GY GG+ + YG G+++GY GG
Sbjct: 219 YGGGRDGGYGGGRDDGYGERRNDGYGERRNDRYGGGRDDGYGGGRDDGYGGGRNDGY-GG 278

Query: 162 NYGGYGGGKHDEYDRGKHEEYERGKHEEYEGGNYGGYGGGKHEAYGGGKHEEYGKDKHEG 221
             GG+ GG+      G+ E Y  G+      G YGG  GG+ + YGGG+ + YG  + +G
Sbjct: 279 RRGGFRGGR----GGGRDEGYGGGR------GGYGGRSGGQGDGYGGGRGDGYGGGRGDG 338

Query: 222 YNGGNYGGYGGGKHEEYDKDKHDGYDGGKYGGYSGGKHEEYDKDKHEGYDGGNYGGYG 280
           Y GG   GYGGG+ + YD  + DGY GG+Y GY GGK + Y   +  GY GG  GGYG
Sbjct: 339 YGGGRGDGYGGGRVDRYDGGRRDGYGGGRYDGYGGGKSDGYGGGR-GGYRGGR-GGYG 383

The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Q6RHW02.4e-0935.56Keratin, type I cytoskeletal 9 OS=Mus musculus OX=10090 GN=Krt9 PE=1 SV=3[more]
Match NameE-valueIdentityDescription
XP_023554142.10.089.62RNA-binding motif protein, X-linked-like-3 [Cucurbita pepo subsp. pepo][more]
KAG6571661.13.99e-30272.98Endo-1,4-beta-xylanase B, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia][more]
XP_022963700.11.24e-27466.06RNA-binding motif protein, X-linked-like-3 isoform X1 [Cucurbita moschata][more]
XP_022963703.11.30e-27366.71hornerin-like isoform X3 [Cucurbita moschata][more]
XP_022963704.16.05e-27066.81RNA-binding motif protein, X-linked-like-3 isoform X4 [Cucurbita moschata][more]
Match NameE-valueIdentityDescription
A0A6J1HIR45.99e-27566.06RNA-binding motif protein, X-linked-like-3 isoform X1 OS=Cucurbita moschata OX=3... [more]
A0A6J1HIP36.30e-27466.71hornerin-like isoform X3 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111463951 PE=4 SV=1[more]
A0A6J1HKZ72.93e-27066.81RNA-binding motif protein, X-linked-like-3 isoform X4 OS=Cucurbita moschata OX=3... [more]
A0A6J1HIR93.19e-27067.15TATA-binding protein-associated factor 2N-like isoform X5 OS=Cucurbita moschata ... [more]
A0A6J1HGT51.29e-26967.01TATA-binding protein-associated factor 2N-like isoform X6 OS=Cucurbita moschata ... [more]
Match NameE-valueIdentityDescription
AT3G07030.18.5e-1842.13Alba DNA/RNA-binding protein [more]
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucurbita pepo (Zucchini) v1
Date Performed: 2021-10-25
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 474..607
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 169..191
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 477..590
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 1..22
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 169..198

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Cp4.1LG15g02110.1Cp4.1LG15g02110.1mRNA