Cp4.1LG13g04140 (gene) Cucurbita pepo (MU‐CU‐16) v4.1

Overview


Name	Cp4.1LG13g04140
Type	gene
Organism	Cucurbita pepo (Cucurbita pepo (MU‐CU‐16) v4.1)
Description	extensin-1-like
Location	Cp4.1LG13: 6344843 .. 6346435 (+)
RNA-Seq Expression	Cp4.1LG13g04140
Synteny	Cp4.1LG13g04140

Sequences

The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: five_prime_UTRexonCDSpolypeptidethree_prime_UTR

Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.

GATGGGAAAAATGGGATCTTCATGGGCTCCTCTCCTTTTTGGTGCCTTTCTTGCTATCCTTTCACTAAACTTGCCATCTACCACGAGTGCTAATTATGTCTATGCCTCGCCTCCCCCGCCCCCGAAGAAGGTATACTACCCGCCTCCTGTATACCATTCTCCACCACCTCCCAAGAAGTCTTACTATCCACCTCCGGTTTATCACTCTCCGCCACCACCTAAGGTGTACTACCCACCTCCTTTTTATCACTCTCCTCCACCTCCTAAGAAGGTGTATTACCCACCTCCGGTGAAATCGCCGCCACCACCGAAGGTGTACTACCCACCTCCTGTTTACCATTCTCCACCTCCACCTAAGGTGTATTATCCACCTCCTGTCTACCACTCTCCGCCACCTCCTAAGAAGGTGTATTACCCACCTCCTGTTTACCACTCTCCACCACCGCCTAAGAAGGTGTACTATCCACCTCCTGTTTACCACTCTCCTCCACCACCTAAGAAGGTGTATTACCCACCTCCAGTCTACCATTCTCCACCACCACCTAAGAAGGTATACTACCCACCTCCCGTGTATCATTCTCCTCCACCACCGAAGAAGGTATACTACCCACCTCCCGTTTATCATTCTCCCCCACCACCAAAGAAGGTATACTACCCACCACCAGTCTACTCTCCTCCACCACCTAAGAAGGTATACTACCCACCACCAGTCTACTCTCCTCCACCACCTAAGAAGGTATACTACCCACCACCCGTCTACTCTCCTCCACCACCAAAGAAGGTTTACTACCCACCTCCCGTGTACCATTCTCCACCACCACCGAAGAAGGTATACTACCCACCTCCAGTGTACCATTCTCCACCACCACCAAAGAAGGTATACTACCCACCACCCGTCTACTCACCACCACCACCTAAGAAGGTATACTACCCACCTCCCGTCTACTCTCCACCACCACCGAAGAAGGTATACTACCCACCACCCGTCTACTCACCACCACCACCTAAGAAGGTATACTACCCACCACCAGTATACCACTCTCCACCGCCACCAGTGTACCACTCTCCACCACCACCCGTCTATTACTACTCATCACCACCACCTCCACACTACTAGGAATTAAACGCTCTTTATACCAAGGTAATTTACCCACCAAATCTCATTGTCTTTTTTCCACGTAAATAACACAAAATTAAAACATGTTACTTTCAATCCACATAGAAACGTCACAATAAAACTTTTGTTGCCCTACCACTAAATTTTGGACTGTTCTTCATTTATTAATTTATTCATTTGTTTTATTTGGTGCAGGAAGACGAGATGAGAATATATTATTAAGATGTGGAAGTCAAAATAAGAGTGTTCGTTGAAATATTTGAAGAACAGTGTGAATTTTAGTTTGGTGTTTCTATTTTATCGCAAATATCATAATTAATGGAGTTTTTTTTTTAATTAATGTATTTCCTTCTAAGACATATTCCCATGTTGTCTTTGTCTCTACCTTATTTTTCTCAAACCACACCTTATTATGCTTTCTTTTATGTTTACATATCTCAATAAATGCATTCCAACTTTTCTCATCCCAAACTTCC

mRNA sequence

GATGGGAAAAATGGGATCTTCATGGGCTCCTCTCCTTTTTGGTGCCTTTCTTGCTATCCTTTCACTAAACTTGCCATCTACCACGAGTGCTAATTATGTCTATGCCTCGCCTCCCCCGCCCCCGAAGAAGGTATACTACCCGCCTCCTGTATACCATTCTCCACCACCTCCCAAGAAGTCTTACTATCCACCTCCGGTTTATCACTCTCCGCCACCACCTAAGGTGTACTACCCACCTCCTTTTTATCACTCTCCTCCACCTCCTAAGAAGGTGTATTACCCACCTCCGGTGAAATCGCCGCCACCACCGAAGGTGTACTACCCACCTCCTGTTTACCATTCTCCACCTCCACCTAAGGTGTATTATCCACCTCCTGTCTACCACTCTCCGCCACCTCCTAAGAAGGTGTATTACCCACCTCCTGTTTACCACTCTCCACCACCGCCTAAGAAGGTGTACTATCCACCTCCTGTTTACCACTCTCCTCCACCACCTAAGAAGGTGTATTACCCACCTCCAGTCTACCATTCTCCACCACCACCTAAGAAGGTATACTACCCACCTCCCGTGTATCATTCTCCTCCACCACCGAAGAAGGTATACTACCCACCTCCCGTTTATCATTCTCCCCCACCACCAAAGAAGGTATACTACCCACCACCAGTCTACTCTCCTCCACCACCTAAGAAGGTATACTACCCACCACCAGTCTACTCTCCTCCACCACCTAAGAAGGTATACTACCCACCACCCGTCTACTCTCCTCCACCACCAAAGAAGGTTTACTACCCACCTCCCGTGTACCATTCTCCACCACCACCGAAGAAGGTATACTACCCACCTCCAGTGTACCATTCTCCACCACCACCAAAGAAGGTATACTACCCACCACCCGTCTACTCACCACCACCACCTAAGAAGGTATACTACCCACCTCCCGTCTACTCTCCACCACCACCGAAGAAGGTATACTACCCACCACCCGTCTACTCACCACCACCACCTAAGAAGGTATACTACCCACCACCAGTATACCACTCTCCACCGCCACCAGTGTACCACTCTCCACCACCACCCGAAGACGAGATGAGAATATATTATTAAGATGTGGAAGTCAAAATAAGAGTGTTCGTTGAAATATTTGAAGAACAGTGTGAATTTTAGTTTGGTGTTTCTATTTTATCGCAAATATCATAATTAATGGAGTTTTTTTTTTAATTAATGTATTTCCTTCTAAGACATATTCCCATGTTGTCTTTGTCTCTACCTTATTTTTCTCAAACCACACCTTATTATGCTTTCTTTTATGTTTACATATCTCAATAAATGCATTCCAACTTTTCTCATCCCAAACTTCC

Coding sequence (CDS)

ATGGGAAAAATGGGATCTTCATGGGCTCCTCTCCTTTTTGGTGCCTTTCTTGCTATCCTTTCACTAAACTTGCCATCTACCACGAGTGCTAATTATGTCTATGCCTCGCCTCCCCCGCCCCCGAAGAAGGTATACTACCCGCCTCCTGTATACCATTCTCCACCACCTCCCAAGAAGTCTTACTATCCACCTCCGGTTTATCACTCTCCGCCACCACCTAAGGTGTACTACCCACCTCCTTTTTATCACTCTCCTCCACCTCCTAAGAAGGTGTATTACCCACCTCCGGTGAAATCGCCGCCACCACCGAAGGTGTACTACCCACCTCCTGTTTACCATTCTCCACCTCCACCTAAGGTGTATTATCCACCTCCTGTCTACCACTCTCCGCCACCTCCTAAGAAGGTGTATTACCCACCTCCTGTTTACCACTCTCCACCACCGCCTAAGAAGGTGTACTATCCACCTCCTGTTTACCACTCTCCTCCACCACCTAAGAAGGTGTATTACCCACCTCCAGTCTACCATTCTCCACCACCACCTAAGAAGGTATACTACCCACCTCCCGTGTATCATTCTCCTCCACCACCGAAGAAGGTATACTACCCACCTCCCGTTTATCATTCTCCCCCACCACCAAAGAAGGTATACTACCCACCACCAGTCTACTCTCCTCCACCACCTAAGAAGGTATACTACCCACCACCAGTCTACTCTCCTCCACCACCTAAGAAGGTATACTACCCACCACCCGTCTACTCTCCTCCACCACCAAAGAAGGTTTACTACCCACCTCCCGTGTACCATTCTCCACCACCACCGAAGAAGGTATACTACCCACCTCCAGTGTACCATTCTCCACCACCACCAAAGAAGGTATACTACCCACCACCCGTCTACTCACCACCACCACCTAAGAAGGTATACTACCCACCTCCCGTCTACTCTCCACCACCACCGAAGAAGGTATACTACCCACCACCCGTCTACTCACCACCACCACCTAAGAAGGTATACTACCCACCACCAGTATACCACTCTCCACCGCCACCAGTGTACCACTCTCCACCACCACCCGAAGACGAGATGAGAATATATTATTAA

Protein sequence

MGKMGSSWAPLLFGAFLAILSLNLPSTTSANYVYASPPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKSYYPPPVYHSPPPPKVYYPPPFYHSPPPPKKVYYPPPVKSPPPPKVYYPPPVYHSPPPPKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPVYHSPPPPEDEMRIYY

Homology

[Close]

BLAST of Cp4.1LG13g04140 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9FS16 (Extensin-3 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=EXT3 PE=1 SV=3)

HSP 1 Score: 309.3 bits (791), Expect = 5.8e-83
Identity = 259/425 (60.94%), Postives = 270/425 (63.53%), Query Frame = 0


Query: 4   MGSSWAPLLFGAFLAILSLNLPSTTSANYVYASPPP------PPKKVYYPPPVYHSPPPP 63
           MGS  A L+    +  +SL   S ++ANY Y+SPPP      PP K Y PPPVYHSPPPP
Sbjct: 1   MGSPMASLVATLLVLTISLTFVSQSTANYFYSSPPPPVKHYTPPVKHYSPPPVYHSPPPP 60

Query: 64  K------------KSYYPPPVYHSPPPPKVYY-------------PPPFYHSPPPPKKVY 123
           K            K Y PPPVYHSPPPPK +Y             PPP YHSPPPPKK Y
Sbjct: 61  KKHYEYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHY 120

Query: 124 YPPPVKSPPPP-KVYYPPPVYHSPPPPKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKK 183
                KSPPPP K Y PPPVYHSPPPPK +Y   VY SPPPP K Y PPPVYHSPPPPKK
Sbjct: 121 V---YKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHY---VYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKK 180

Query: 184 VYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPP 243
            Y    VY SPPPP K Y PPPVYHSPPPPKK Y    VY SPPPP K Y PPPVYHSPP
Sbjct: 181 HY----VYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHY----VYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPP 240

Query: 244 PPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVY 303
           PPKK Y    VY SPPPP K Y PPPVY SPPPPKK Y    VY SPPPP K Y PPPVY
Sbjct: 241 PPKKHY----VYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHY----VYKSPPPPVKHYSPPPVY 300

Query: 304 HSPPPPKKVYY------------PPPVYHSPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVY 363
           HSPPPPKK Y             PPPVYHSPPPPKK Y    VY SPPPP K Y PPPVY
Sbjct: 301 HSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHY----VYKSPPPPVKHYSPPPVY 360

[Close]

BLAST of Cp4.1LG13g04140 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q38913 (Extensin-1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=EXT1 PE=2 SV=2)

HSP 1 Score: 288.9 bits (738), Expect = 8.1e-77
Identity = 238/357 (66.67%), Postives = 243/357 (68.07%), Query Frame = 0


Query: 15  AFLAI-LSLNLPSTTSANYVYASPPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKSYYPPPVYHSPPPP 74
           +FL +  SL   S T+ANY Y+SPPPP K  Y PPPVY SPPPP K Y PPPVY SPPPP
Sbjct: 3   SFLVLAFSLAFVSQTTANYFYSSPPPPVKH-YSPPPVYKSPPPPVKHYSPPPVYKSPPPP 62

Query: 75  -KVYYPPPFYHSPPPPKKVYYPPPVKSPPPPKVYYPPPVYHSPPPP-KVYYPPPVYHSPP 134
            K Y PPP Y SPPPP K Y PPPV   P      PPPVY SPPPP K Y PPPVY SPP
Sbjct: 63  VKHYSPPPVYKSPPPPVKYYSPPPVYKSP------PPPVYKSPPPPVKHYSPPPVYKSPP 122

Query: 135 PPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVY 194
           PP K Y PPPVY SPPPP K Y PPPVY SPPPP K Y PPPVY SPPPP K Y PPPVY
Sbjct: 123 PPVKHYSPPPVYKSPPPPVKHYSPPPVYKSPPPPVKHYSPPPVYKSPPPPVKYYSPPPVY 182

Query: 195 HSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYP 254
            SPPPP K Y PPPVY SPPPP K Y PPPVY SPPPP K Y PPPVY SPPPP K Y P
Sbjct: 183 KSPPPPVKHYSPPPVYKSPPPPVKYYSPPPVYKSPPPPVKHYSPPPVYKSPPPPVKYYSP 242

Query: 255 PPVYSPPPPKKVYYPPP-VYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKV 314
           PPVY  PPP   Y PPP VYHSPPPP     PP VYHSPPPP     PP VY  PPP   
Sbjct: 243 PPVYKSPPPPVHYSPPPVVYHSPPPPVHYSPPPVVYHSPPPPVHYSPPPVVYHSPPPPVH 302

Query: 315 YYPPP-VYSPPPPKKVYYPPPV--YSPPPPKKVY---YPPPVYHSPPPPVYHSPPPP 360
           Y PPP VY  PPP   Y PPPV  +SPPPPKK Y    PPP  H  PP VYHSPPPP
Sbjct: 303 YSPPPVVYHSPPPPVHYSPPPVVYHSPPPPKKHYEYKSPPPPVHYSPPTVYHSPPPP 352

[Close]

BLAST of Cp4.1LG13g04140 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O65375 (Leucine-rich repeat extensin-like protein 1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=LRX1 PE=1 SV=1)

HSP 1 Score: 166.8 bits (421), Expect = 4.7e-40
Identity = 189/339 (55.75%), Postives = 197/339 (58.11%), Query Frame = 0


Query: 32  YVYASPPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKSYYPPPV-YHSPPPPKVYYPPPFYHSPPPPKK 91
           YVY+SPPPPP     P    +SPPPP  S   P V  +SPPPP      P   + PPP  
Sbjct: 402 YVYSSPPPPPSSKMSPTVRAYSPPPPPSSKMSPSVRAYSPPPPPYSKMSPSVRAYPPP-- 461

Query: 92  VYYPPPVKSPPPPKVYYPPP---VYHSPPPPKVYYPPPVYHSPPPPKKVYY--PPPVYHS 151
              PPP  SPPPP VY  PP   VY SPPP     PP VY SPPPP  VY   PPP  +S
Sbjct: 462 ---PPPSPSPPPPYVYSSPPPPYVYSSPPP-----PPYVYSSPPPPPYVYSSPPPPYVYS 521

Query: 152 PPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPP 211
            PPP  VY  PP    PPPP     PPP   S PPP  VYY  PV  SPPPP  VYY PP
Sbjct: 522 SPPPPYVYSSPP----PPPPSP---PPPCPESSPPPPVVYY-APVTQSPPPPSPVYY-PP 581

Query: 212 VYHSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPP 271
           V  SPPPP  VYYPP   SPPPP  VYYPP  YSPPPP  VYYP    SPPPP  +YY P
Sbjct: 582 VTQSPPPPSPVYYPPVTNSPPPPSPVYYPPVTYSPPPPSPVYYPQVTPSPPPPSPLYY-P 641

Query: 272 PVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYY 331
           PV  SPPPP  VYY PPV  SPPPP  VYYPP   SPPPP  VYYP    SPPPP + YY
Sbjct: 642 PVTPSPPPPSPVYY-PPVTPSPPPPSPVYYPPVTPSPPPPSPVYYPSETQSPPPPTEYYY 701

Query: 332 PPPVYSPPPPK--KVYYPP---PVYHSPPPPVYHSPPPP 360
            P   SPPP K  K  +PP   P Y  PP   Y S PPP
Sbjct: 702 SPS-QSPPPTKACKEGHPPQATPSYEPPPEYSYSSSPPP 718

[Close]

BLAST of Cp4.1LG13g04140 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9T0K5 (Leucine-rich repeat extensin-like protein 3 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=LRX3 PE=1 SV=1)

HSP 1 Score: 142.1 bits (357), Expect = 1.2e-32
Identity = 186/356 (52.25%), Postives = 203/356 (57.02%), Query Frame = 0


Query: 38  PPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKSYYPPPVYHSPPPPKVYYPPPFYHSPPPPKKVYYPPPV 97
           PPPP  ++  PP   SPPPP     PPPVY  PPPP    PPP  +SPPPP     PPPV
Sbjct: 410 PPPPAPIFSTPPTLTSPPPPSP---PPPVYSPPPPPP---PPPPVYSPPPPPPPPPPPPV 469

Query: 98  KSPPPPKVYYPPPVYHSPPPPKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYY--P 157
            SPPPP    PPP    PPPP VY PPP   SPPPP    Y PP    PPPP  VY   P
Sbjct: 470 YSPPPP----PPP---PPPPPPVYSPPP--PSPPPPPPPVYSPPPPPPPPPPPPVYSPPP 529

Query: 158 PPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYY--PPPVYHSPPPP 217
           PPVY SPPPP     P PVY + PPP   + PPP   SPPPP+  YY  PPP + SPPP 
Sbjct: 530 PPVYSSPPPPPSP-APTPVYCTRPPPPPPHSPPPPQFSPPPPEPYYYSSPPPPHSSPPP- 589

Query: 218 KKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPP--PVYSPPPPKKVYYPPP----- 277
              + PPP +SPPPP   Y  P    PPPP  V  PP  PVYSPPPP     PPP     
Sbjct: 590 ---HSPPPPHSPPPPIYPYLSP----PPPPTPVSSPPPTPVYSPPPPPPCIEPPPPPPCI 649

Query: 278 VYHSPPPPKKVYY----PPPVYHSPPPPKKVYY-----PPPV-YSPPPPKKVYY----PP 337
            Y  PPPP  V+Y    PPPVY+S PPP  VYY     PPPV YS PPP +V+Y    P 
Sbjct: 650 EYSPPPPPPVVHYSSPPPPPVYYSSPPPPPVYYSSPPPPPPVHYSSPPPPEVHYHSPPPS 709

Query: 338 PVY--SPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPP---VYHSPPPPVYH-SPPPPEDE 363
           PV+  SPPPP      P   SPPP   V++ PP   V+HSPPPPV H SPPPP  E
Sbjct: 710 PVHYSSPPPPPSA---PCEESPPPAPVVHHSPPPPMVHHSPPPPVIHQSPPPPSPE 738

[Close]

BLAST of Cp4.1LG13g04140 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9M1G9 (Extensin-2 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=EXT2 PE=2 SV=1)

HSP 1 Score: 134.4 bits (337), Expect = 2.6e-30
Identity = 210/399 (52.63%), Postives = 219/399 (54.89%), Query Frame = 0


Query: 32  YVYASPPPP-----PKKVYYPPP---VYHSPPPPKKSYYPPPVYHSPPPPKVY-YPPPFY 91
           YVY+SPPPP     PK  Y  PP   VY SPPPP  S  P   Y SPPPP VY  PPP Y
Sbjct: 325 YVYSSPPPPYYSPSPKVDYKSPPPPYVYSSPPPPTYSPSPKVDYKSPPPPYVYSSPPPPY 384

Query: 92  HSPPPPKKVYYPPP--VKSPPPPKVYYPPP--VYHSPPPPKVY-YPPPVYHSPPPPKKVY 151
           +SP P  +   PPP  V S PPP  Y P P   Y SPPPP VY  PPP Y+SP P  KVY
Sbjct: 385 YSPSPKVEYKSPPPPYVYSSPPPPTYSPSPKVYYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSP--KVY 444

Query: 152 Y----PPPVYHSPPPP-----KKVYY----PPPVYHSPPPP-----KKVYY----PPPVY 211
           Y    PP VY SPPPP      KVYY    PP VY SPPPP      KVYY    PP VY
Sbjct: 445 YKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVYYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVYYKSPPPPYVY 504

Query: 212 HSPPPP-----KKVYY----PPPVYHSPPPP-----KKVYY----PPPVYHSPPPPKKVY 271
            SPPPP      KVYY    PP VY SPPPP      KV+Y    PP VY SPPPP    
Sbjct: 505 SSPPPPYYSPSPKVYYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVHYKSPPPPYVYSSPPPPYYSP 564

Query: 272 YPPPVYSPPPPKKVYY--PPPVYSPPPPKKVYY----PPPVYSPPPPKKVYYPPPVYHSP 331
            P   Y  PPP  VY   PPP YSP P  KVYY    PP VYS PPP      P VY+  
Sbjct: 565 SPKVHYKSPPPPYVYNSPPPPYYSPSP--KVYYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVYYKS 624

Query: 332 PPPKKVY-YPPPVYHSPPPPKKVYY---PPPVYSPPPPKKVYYPPP----VYSPPPPKKV 360
           PPP  VY  PPP Y+SP P  KVYY   PPP YSP P  KVYY  P    V   PPP   
Sbjct: 625 PPPPYVYSSPPPPYYSPSP--KVYYKSPPPPYYSPSP--KVYYKSPPHPHVCVCPPPPPC 684

[Close]

BLAST of Cp4.1LG13g04140 vs. NCBI nr
Match: XP_023551298.1 (extensin-1-like [Cucurbita pepo subsp. pepo])

HSP 1 Score: 667 bits (1721), Expect = 1.37e-240
Identity = 361/367 (98.37%), Postives = 362/367 (98.64%), Query Frame = 0


Query: 1   MGKMGSSWAPLLFGAFLAILSLNLPSTTSANYVYASPPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKS 60
           MGKMGSSWAPLLFGAFLAILSLNLPSTTSANYVYASPPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKS
Sbjct: 1   MGKMGSSWAPLLFGAFLAILSLNLPSTTSANYVYASPPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKS 60

Query: 61  YYPPPVYHSPPPPKVYYPPPFYHSPPPPKKVYYPPPVKSPPPPKVYYPPPVYHSPPPPKV 120
           YYPPPVYHSPPPPKVYYPPPFYHSPPPPKKVYYPPPVKSPPPPKVYYPPPVYHSPPPPKV
Sbjct: 61  YYPPPVYHSPPPPKVYYPPPFYHSPPPPKKVYYPPPVKSPPPPKVYYPPPVYHSPPPPKV 120

Query: 121 YYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPP 180
           YYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPP
Sbjct: 121 YYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPP 180

Query: 181 PKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSP 240
           PKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSP
Sbjct: 181 PKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSP 240

Query: 241 PPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVY 300
           PPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVY
Sbjct: 241 PPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVY 300

Query: 301 SPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPVYHSPPPPE 360
           SPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPVYHSPPPP 
Sbjct: 301 SPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPVYHSPPPP- 360

Query: 361 DEMRIYY 367
               +YY
Sbjct: 361 ----VYY 362

[Close]

BLAST of Cp4.1LG13g04140 vs. NCBI nr
Match: XP_022939251.1 (extensin-1-like [Cucurbita moschata])

HSP 1 Score: 621 bits (1601), Expect = 5.29e-222
Identity = 358/388 (92.27%), Postives = 359/388 (92.53%), Query Frame = 0


Query: 1   MGKMGSSWAPLLFGAFLAILSLNLPSTTSANYVYASPPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKS 60
           MGKMGSSWAPLLFGAFLAILSLNLPSTTSANYVYASPPPP KKVYYPPPVYHSPPPPKKS
Sbjct: 1   MGKMGSSWAPLLFGAFLAILSLNLPSTTSANYVYASPPPP-KKVYYPPPVYHSPPPPKKS 60

Query: 61  YYPPPVYHSPPPPKVYYPPPFYHSPPPPKKVYYPPPVKSPPPP-KVYYPPPVYHSPPPPK 120
           YYPPPVYHSPPPPKVYYPPP YHSPPPPKKVYYPPPVKSPPPP KVYYPPPVYHSPPPPK
Sbjct: 61  YYPPPVYHSPPPPKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVKSPPPPPKVYYPPPVYHSPPPPK 120

Query: 121 -VYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSP 180
            VYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSP
Sbjct: 121 KVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSP 180

Query: 181 PPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVY 240
           PPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVY SPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVY
Sbjct: 181 PPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVY 240

Query: 241 -SPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYP 300
            SPPPPKKVYYPPPVY SPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYP
Sbjct: 241 HSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYP 300

Query: 301 PPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVY-----------------SPPPPKKVY 360
           PPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVY                 SPPPPKKVY
Sbjct: 301 PPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPKKVY 360

Query: 361 YPPPVYHSPPPPVYHSPPPPEDEMRIYY 367
           YPPPVYHSPPPPVYHSPPPP     +YY
Sbjct: 361 YPPPVYHSPPPPVYHSPPPP-----VYY 381

[Close]

BLAST of Cp4.1LG13g04140 vs. NCBI nr
Match: KAG6578896.1 (hypothetical protein SDJN03_23344, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia])

HSP 1 Score: 608 bits (1569), Expect = 4.69e-216
Identity = 352/407 (86.49%), Postives = 354/407 (86.98%), Query Frame = 0


Query: 4   MGSSWAPLLFGAFLAILSLNLPSTTSANYVYASPPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKSYYP 63
           MGSSWAPL+FGAFLAILSLNLPSTTSANYVYASPPPP KKVYYPPPVYHSPPPPKKSYYP
Sbjct: 1   MGSSWAPLIFGAFLAILSLNLPSTTSANYVYASPPPP-KKVYYPPPVYHSPPPPKKSYYP 60

Query: 64  PPVYHSPPPPKVYYPPPFYHSPPPPKKVYYPPPVKSPPPP-KVYYPPPVYHSPPPPK-VY 123
           PPVYHSPPPPKVYYPPP YHSPPPPKKVYYPPPVKSPPPP KVYYPPPVYHSPPPPK VY
Sbjct: 61  PPVYHSPPPPKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVKSPPPPPKVYYPPPVYHSPPPPKKVY 120

Query: 124 YPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPP 183
           YPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPP
Sbjct: 121 YPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPP 180

Query: 184 KKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPP 243
           KKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPP+YSPP
Sbjct: 181 KKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPIYSPP 240

Query: 244 PPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVYHSPPPP-KKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPV 303
           PPKKVYYPPPVY SPPPPKKVYYPPPVYHSPPPP KKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPV
Sbjct: 241 PPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPV 300

Query: 304 YSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVY----------------------------- 359
           YSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVY                             
Sbjct: 301 YSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPKKVYYPP 360

[Close]

BLAST of Cp4.1LG13g04140 vs. NCBI nr
Match: KAG7016424.1 (hypothetical protein SDJN02_21533, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma])

HSP 1 Score: 578 bits (1491), Expect = 6.10e-204
Identity = 358/476 (75.21%), Postives = 358/476 (75.21%), Query Frame = 0


Query: 4   MGSSWAPLLFGAFLAILSLNLPSTTSANYVYASPPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKSYYP 63
           MGSS APLLFGAFLAILSLNLPSTTSANYVYASPPPP KKVYYPPPVYHSPPPPKKSYYP
Sbjct: 1   MGSSRAPLLFGAFLAILSLNLPSTTSANYVYASPPPP-KKVYYPPPVYHSPPPPKKSYYP 60

Query: 64  PPVYHSPPPPKVYYPPPFYHSPPPPKKVYYPPPVKSPPPP-KVYYPPPVYHSPPPPK-VY 123
           PPVYHSP PPKVYYPPP YHSPPP KKVYYPPPVKSPPPP KVYYPPPVYHSPPPPK VY
Sbjct: 61  PPVYHSPSPPKVYYPPPVYHSPPP-KKVYYPPPVKSPPPPPKVYYPPPVYHSPPPPKKVY 120

Query: 124 YPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPP 183
           YPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPP
Sbjct: 121 YPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPP 180

Query: 184 KKVYYPPPVY----------------------------------------------HSPP 243
           KKVYYPPPVY                                              HSPP
Sbjct: 181 KKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPP 240

Query: 244 PPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYS 303
           PPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVY SPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYS
Sbjct: 241 PPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYS 300

Query: 304 PPPPKKVYYPPPVYHSPPPP--------KKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPK 363
           PPPPKKVYYPPPVYHSPPPP        KKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPK
Sbjct: 301 PPPPKKVYYPPPVYHSPPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPK 360

Query: 364 KVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVY-------------------------------SPPPP 367
           KVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVY                               SPPPP
Sbjct: 361 KVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKIYYPPPVYSPPPP 420

[Close]

BLAST of Cp4.1LG13g04140 vs. NCBI nr
Match: XP_031743672.1 (LOW QUALITY PROTEIN: extensin-3-like [Cucumis sativus])

HSP 1 Score: 565 bits (1455), Expect = 1.38e-199
Identity = 338/384 (88.02%), Postives = 344/384 (89.58%), Query Frame = 0


Query: 1   MGKMGSSWAPLLFGAFLAILSLNLPSTTSANYVYASPPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKS 60
           MGKMGSS AP+LF AF+A+LSL LPSTT+ANY+YASPPPP KKVYYPPPVYHSPPPPKKS
Sbjct: 1   MGKMGSSMAPILFAAFVALLSLTLPSTTNANYIYASPPPP-KKVYYPPPVYHSPPPPKKS 60

Query: 61  YYPPPVYHSPPPPK-VYYPPPFYHSPPPPKKVYYPPPV-KSPPPPK-VYYPPPVYHSPPP 120
           YYPPPVYHSPPPPK VYYPPP Y SPPPPKKVYYPPPV KSPPPPK VYYPPPVY SPPP
Sbjct: 61  YYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVYKSPPPPKKVYYPPPVYKSPPP 120

Query: 121 PK-VYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYH 180
           PK VYYPPPVY SPPPPKKVYYPPPVY SPPPPKKVYYPPPVY SPPPPKKVYYPPPVY 
Sbjct: 121 PKKVYYPPPVYKSPPPPKKVYYPPPVYKSPPPPKKVYYPPPVYKSPPPPKKVYYPPPVYK 180

Query: 181 SPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPP 240
           SPPPPKKVYYPPPVY SPPPPKKVYYPPPVY SPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPP
Sbjct: 181 SPPPPKKVYYPPPVYKSPPPPKKVYYPPPVYKSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPP 240

Query: 241 VYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVY--------------HSPPPPKKVYYPPP 300
           VYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVY              +SPPPPKKVYYPPP
Sbjct: 241 VYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPP 300

Query: 301 VYHSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPP 359
           VY SPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPP
Sbjct: 301 VY-SPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPP 360

[Close]

BLAST of Cp4.1LG13g04140 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1FFE0 (extensin-1-like OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111445224 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 621 bits (1601), Expect = 2.56e-222
Identity = 358/388 (92.27%), Postives = 359/388 (92.53%), Query Frame = 0


Query: 1   MGKMGSSWAPLLFGAFLAILSLNLPSTTSANYVYASPPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKS 60
           MGKMGSSWAPLLFGAFLAILSLNLPSTTSANYVYASPPPP KKVYYPPPVYHSPPPPKKS
Sbjct: 1   MGKMGSSWAPLLFGAFLAILSLNLPSTTSANYVYASPPPP-KKVYYPPPVYHSPPPPKKS 60

Query: 61  YYPPPVYHSPPPPKVYYPPPFYHSPPPPKKVYYPPPVKSPPPP-KVYYPPPVYHSPPPPK 120
           YYPPPVYHSPPPPKVYYPPP YHSPPPPKKVYYPPPVKSPPPP KVYYPPPVYHSPPPPK
Sbjct: 61  YYPPPVYHSPPPPKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVKSPPPPPKVYYPPPVYHSPPPPK 120

Query: 121 -VYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSP 180
            VYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSP
Sbjct: 121 KVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSP 180

Query: 181 PPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVY 240
           PPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVY SPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVY
Sbjct: 181 PPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVY 240

Query: 241 -SPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYP 300
            SPPPPKKVYYPPPVY SPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYP
Sbjct: 241 HSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYP 300

Query: 301 PPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVY-----------------SPPPPKKVY 360
           PPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVY                 SPPPPKKVY
Sbjct: 301 PPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPKKVY 360

Query: 361 YPPPVYHSPPPPVYHSPPPPEDEMRIYY 367
           YPPPVYHSPPPPVYHSPPPP     +YY
Sbjct: 361 YPPPVYHSPPPPVYHSPPPP-----VYY 381

[Close]

BLAST of Cp4.1LG13g04140 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1JZT6 (extensin-1-like OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111489763 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 556 bits (1433), Expect = 1.80e-197
Identity = 328/371 (88.41%), Postives = 329/371 (88.68%), Query Frame = 0


Query: 1   MGKMGSSWAPLLFGAFLAILSLNLPSTTSANYVYASPPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKS 60
           MGKMGSSWAPLLFGAFLAILSLNLPSTT ANYVYASPPPP KKVYYPPPVYHSPPPPKKS
Sbjct: 1   MGKMGSSWAPLLFGAFLAILSLNLPSTTHANYVYASPPPP-KKVYYPPPVYHSPPPPKKS 60

Query: 61  YYPPPVYHSPPPPKVYYPPPFYHSPPPPKKVYYPPPVKSPPPPKVYYPPPVYHSPPPPKV 120
           YYPPPVY               HSPPPPKKVYYPPPVKSPPPPK              KV
Sbjct: 61  YYPPPVY---------------HSPPPPKKVYYPPPVKSPPPPK--------------KV 120

Query: 121 YYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPP 180
           YYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPV  SPPP
Sbjct: 121 YYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPV-KSPPP 180

Query: 181 PKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVY- 240
           PKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVY SPPPPKKVYYPPPVY 
Sbjct: 181 PKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYH 240

Query: 241 SPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPP 300
           SPPPPKKVYYPPPVY SPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPP
Sbjct: 241 SPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPP 300

Query: 301 PVY-SPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPVYHSP 360
           PVY SPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPVYHSP
Sbjct: 301 PVYHSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPVYHSP 335

Query: 361 PPPEDEMRIYY 367
           PPP     +YY
Sbjct: 361 PPP-----VYY 335

[Close]

BLAST of Cp4.1LG13g04140 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0K8S7 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_6G058200 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 550 bits (1416), Expect = 3.10e-194
Identity = 337/371 (90.84%), Postives = 342/371 (92.18%), Query Frame = 0


Query: 1   MGKMGSSWAPLLFGAFLAILSLNLPSTTSANYVYASPPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKS 60
           MGKMGSS AP+LF AF+A+LSL LPSTT+ANY+YASPPPP KKVYYPPPVYHSPPPPKKS
Sbjct: 1   MGKMGSSMAPILFAAFVALLSLTLPSTTNANYIYASPPPP-KKVYYPPPVYHSPPPPKKS 60

Query: 61  YYPPPVYHSPPPPK-VYYPPPFYHSPPPPKKVYYPPPV-KSPPPPK-VYYPPPVYHSPPP 120
           YYPPPVYHSPPPPK VYYPPP Y SPPPPKKVYYPPPV KSPPPPK VYYPPPVY SPPP
Sbjct: 61  YYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVYKSPPPPKKVYYPPPVYKSPPP 120

Query: 121 PK-VYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYH 180
           PK VYYPPPVY SPPPPKKVYYPPPVY SPPPPKKVYYPPPVY SPPPPKKVYYPPPVY 
Sbjct: 121 PKKVYYPPPVYKSPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVYKSPPPPKKVYYPPPVY- 180

Query: 181 SPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPP 240
           SPPPPKKVYYPPPVY SPPPPKKVYYPPPVY  PPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPP
Sbjct: 181 SPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVY-PPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPP 240

Query: 241 VYSPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYY 300
           VYSPPPPKKVYYPPPVY SPPPPKKVYYPPPVY SPPPPKKVYYPPPVY  PPPPKKVYY
Sbjct: 241 VYSPPPPKKVYYPPPVYKSPPPPKKVYYPPPVYKSPPPPKKVYYPPPVY-PPPPPKKVYY 300

Query: 301 PPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVY-------HSP 359
           PPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVY       HSP
Sbjct: 301 PPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPVYHSP 360

[Close]

BLAST of Cp4.1LG13g04140 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3DG54 (Extensin-1-like isoform X2 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold1163G00010 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 546 bits (1407), Expect = 8.09e-193
Identity = 332/363 (91.46%), Postives = 337/363 (92.84%), Query Frame = 0


Query: 4   MGSSWAPLLFGAFLAILSLNLPSTTSANYVYASPPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKSYYP 63
           MGSS AP LF AF+A+LSL LPS+ +ANY+YASPPPP KKVYYPPPVYHSPPPPKK YYP
Sbjct: 1   MGSSMAPHLFAAFVALLSLTLPSSANANYIYASPPPP-KKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYP 60

Query: 64  PPVYHSPPPPK-VYYPPPFYHSPPPPKKVYYPPPV-KSPPPPK-VYYPPPVYHSPPPPK- 123
           PPVY SPPPPK VYYPPP Y SPPPPKKVYYPPPV KSPPPPK VYYPPPVY SPPPPK 
Sbjct: 61  PPVYKSPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVYKSPPPPKKVYYPPPVYKSPPPPKK 120

Query: 124 VYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPP 183
           VYYPPPVY SPPPPKKVYYPPPVY SPPPPKKVYYPPPVY SPPPPKKVYYPPPVY SPP
Sbjct: 121 VYYPPPVYKSPPPPKKVYYPPPVYKSPPPPKKVYYPPPVYKSPPPPKKVYYPPPVYKSPP 180

Query: 184 PPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVY 243
           PPKKVYYPPPVY SPPPPKKVYYPPPVY SPPPPKKVYYPPPVY SPPPPKKVYYPPPVY
Sbjct: 181 PPKKVYYPPPVYKSPPPPKKVYYPPPVYKSPPPPKKVYYPPPVYKSPPPPKKVYYPPPVY 240

Query: 244 -SPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYP 303
            SPPPPKKVYYPPPVY SPPPPKKVYYPPPVY SPPPPKKVYYPPPVY SPPPPKKVYYP
Sbjct: 241 KSPPPPKKVYYPPPVYKSPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYP 300

Query: 304 PPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPVYHSP 359
           PPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPVYHSP
Sbjct: 301 PPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPVYHSP 359

[Close]

BLAST of Cp4.1LG13g04140 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1JMV9 (extensin-1-like OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111487278 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 495 bits (1275), Expect = 7.53e-174
Identity = 298/355 (83.94%), Postives = 302/355 (85.07%), Query Frame = 0


Query: 1   MGKMGSSWAPLLFGAFLAILSLNLPSTTSANYVYASPPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKS 60
           MGKMGSS APLLF AF+A+LSL+ PSTT ANYVYASPPPP KKV YPPPVYHSPPPPKK 
Sbjct: 1   MGKMGSSMAPLLFTAFVALLSLSFPSTTHANYVYASPPPP-KKVDYPPPVYHSPPPPKKV 60

Query: 61  YYPPPVYHSPPPPKVYYPPPFYHSPPPPKKVYYPPPVKSPPPPKVYYPPPVYHSPPPPK- 120
           YYPPPVY  PPP KVYYPPP YHSPPPPKKVYYPPPV              YHSPPPPK 
Sbjct: 61  YYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPV--------------YHSPPPPKK 120

Query: 121 VYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPP 180
           VYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPP
Sbjct: 121 VYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPP 180

Query: 181 PPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVY 240
           PPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVY SPPPPKKVYYPPPVY
Sbjct: 181 PPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVY 240

Query: 241 SPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPP 300
           SPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYY PPVY                 SPPPPKKVYYPPP
Sbjct: 241 SPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYSPPVY-----------------SPPPPKKVYYPPP 300

Query: 301 VYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPVY 353
           VYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPV+SPPPP  VYY    Y SPPPP Y
Sbjct: 301 VYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVHSPPPP--VYY----YSSPPPPHY 317

[Close]

BLAST of Cp4.1LG13g04140 vs. TAIR 10
Match: AT1G21310.1 (extensin 3 )

HSP 1 Score: 309.3 bits (791), Expect = 4.1e-84
Identity = 259/425 (60.94%), Postives = 270/425 (63.53%), Query Frame = 0


Query: 4   MGSSWAPLLFGAFLAILSLNLPSTTSANYVYASPPP------PPKKVYYPPPVYHSPPPP 63
           MGS  A L+    +  +SL   S ++ANY Y+SPPP      PP K Y PPPVYHSPPPP
Sbjct: 1   MGSPMASLVATLLVLTISLTFVSQSTANYFYSSPPPPVKHYTPPVKHYSPPPVYHSPPPP 60

Query: 64  K------------KSYYPPPVYHSPPPPKVYY-------------PPPFYHSPPPPKKVY 123
           K            K Y PPPVYHSPPPPK +Y             PPP YHSPPPPKK Y
Sbjct: 61  KKHYEYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHY 120

Query: 124 YPPPVKSPPPP-KVYYPPPVYHSPPPPKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKK 183
                KSPPPP K Y PPPVYHSPPPPK +Y   VY SPPPP K Y PPPVYHSPPPPKK
Sbjct: 121 V---YKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHY---VYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKK 180

Query: 184 VYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPP 243
            Y    VY SPPPP K Y PPPVYHSPPPPKK Y    VY SPPPP K Y PPPVYHSPP
Sbjct: 181 HY----VYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHY----VYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPP 240

Query: 244 PPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVY 303
           PPKK Y    VY SPPPP K Y PPPVY SPPPPKK Y    VY SPPPP K Y PPPVY
Sbjct: 241 PPKKHY----VYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHY----VYKSPPPPVKHYSPPPVY 300

Query: 304 HSPPPPKKVYY------------PPPVYHSPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVY 363
           HSPPPPKK Y             PPPVYHSPPPPKK Y    VY SPPPP K Y PPPVY
Sbjct: 301 HSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHY----VYKSPPPPVKHYSPPPVY 360

[Close]

BLAST of Cp4.1LG13g04140 vs. TAIR 10
Match: AT1G26240.1 (Proline-rich extensin-like family protein )

HSP 1 Score: 169.5 bits (428), Expect = 5.1e-42
Identity = 235/443 (53.05%), Postives = 242/443 (54.63%), Query Frame = 0


Query: 6   SSWAPLLFGAFLAILSLNLPSTTSANYVYASPPPPPKKVYYPPP-VYHSPPPPKKSYYPP 65
           + W  LL    L I   ++ + TSA Y Y SPP PP  VY PP  +Y SPPPP   Y  P
Sbjct: 5   NGWPSLL---MLVIALYSVSAHTSAQYTY-SPPSPPSYVYKPPTHIYSSPPPPPYVYSSP 64

Query: 66  P----VYHSPPPPKVYY----PPPF-YHSPPPPKKVYYPPP-----VKSPPPPKVYY--- 125
           P    +Y SPPPP   Y    PPP+ Y SPPPP  VY  PP      KSPPPP   Y   
Sbjct: 65  PPPPYIYKSPPPPPYVYSSPPPPPYIYKSPPPPPYVYSSPPPPPYIYKSPPPPPYVYSSP 124

Query: 126 --PPPVYHSPPPPKVYY-----PPPVYHSPPPPKKVYYPPP----VYHSPPPPKKVYYPP 185
             PP VY SPPPP   Y     PP VY SPPPP  VY  PP    VY SPPPP  VY  P
Sbjct: 125 PPPPYVYKSPPPPPYVYNSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSP 184

Query: 186 P----VYHSPPPPKKVYYPPP----VYHSPPPPKKVYYPPP----VYHSPPPPKKVYYPP 245
           P    VY SPPPP  VY  PP    VY SPPPP  VY  PP    VY SPPPP  VY  P
Sbjct: 185 PPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSP 244

Query: 246 P----VYHSPPPPKKVYY--PPPVY---SPPPPKKVYY--PPPVY---SPPPPKKVYY-- 305
           P    VY SPPPP  VY   PPP Y   SPPPP  VY   PPP Y   SPPPP  VY   
Sbjct: 245 PPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSP 304

Query: 306 PPPVY---SPPPPKKVYYPPP----VYHSPPPPKKVYYPPP----VYHSPPPPKKVYYPP 360
           PPP Y   SPPPP  VY  PP    VY SPPPP  VY  PP    VY SPPPP  VY  P
Sbjct: 305 PPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYNSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSP 364

[Close]

BLAST of Cp4.1LG13g04140 vs. TAIR 10
Match: AT1G12040.1 (leucine-rich repeat/extensin 1 )

HSP 1 Score: 166.8 bits (421), Expect = 3.3e-41
Identity = 189/339 (55.75%), Postives = 197/339 (58.11%), Query Frame = 0


Query: 32  YVYASPPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKSYYPPPV-YHSPPPPKVYYPPPFYHSPPPPKK 91
           YVY+SPPPPP     P    +SPPPP  S   P V  +SPPPP      P   + PPP  
Sbjct: 402 YVYSSPPPPPSSKMSPTVRAYSPPPPPSSKMSPSVRAYSPPPPPYSKMSPSVRAYPPP-- 461

Query: 92  VYYPPPVKSPPPPKVYYPPP---VYHSPPPPKVYYPPPVYHSPPPPKKVYY--PPPVYHS 151
              PPP  SPPPP VY  PP   VY SPPP     PP VY SPPPP  VY   PPP  +S
Sbjct: 462 ---PPPSPSPPPPYVYSSPPPPYVYSSPPP-----PPYVYSSPPPPPYVYSSPPPPYVYS 521

Query: 152 PPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPP 211
            PPP  VY  PP    PPPP     PPP   S PPP  VYY  PV  SPPPP  VYY PP
Sbjct: 522 SPPPPYVYSSPP----PPPPSP---PPPCPESSPPPPVVYY-APVTQSPPPPSPVYY-PP 581

Query: 212 VYHSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPP 271
           V  SPPPP  VYYPP   SPPPP  VYYPP  YSPPPP  VYYP    SPPPP  +YY P
Sbjct: 582 VTQSPPPPSPVYYPPVTNSPPPPSPVYYPPVTYSPPPPSPVYYPQVTPSPPPPSPLYY-P 641

Query: 272 PVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYY 331
           PV  SPPPP  VYY PPV  SPPPP  VYYPP   SPPPP  VYYP    SPPPP + YY
Sbjct: 642 PVTPSPPPPSPVYY-PPVTPSPPPPSPVYYPPVTPSPPPPSPVYYPSETQSPPPPTEYYY 701

Query: 332 PPPVYSPPPPK--KVYYPP---PVYHSPPPPVYHSPPPP 360
            P   SPPP K  K  +PP   P Y  PP   Y S PPP
Sbjct: 702 SPS-QSPPPTKACKEGHPPQATPSYEPPPEYSYSSSPPP 718

[Close]

BLAST of Cp4.1LG13g04140 vs. TAIR 10
Match: AT1G26250.1 (Proline-rich extensin-like family protein )

HSP 1 Score: 166.0 bits (419), Expect = 5.7e-41
Identity = 222/406 (54.68%), Postives = 226/406 (55.67%), Query Frame = 0


Query: 32  YVYASPPP-------PPKKVYYPPP-VYHSPPPPKKSYYPPP----VYHSPPPPKVYY-- 91
           YVY SPPP       PP  VY PPP +Y SPPPP   Y  PP    VY+SPPPP   Y  
Sbjct: 40  YVYNSPPPYVYNSPSPPPYVYKPPPYIYSSPPPPPYVYSSPPPPPYVYNSPPPPPYVYSS 99

Query: 92  --PPPF-YHSPPPPKKVYYPPPVKSPPPPKVYYPPP----VYHSPPPPKVYY-----PPP 151
             PPP+ Y SPPPP  VY  P    PPPP VY  PP    VY SPPPP   Y     PP 
Sbjct: 100 PPPPPYVYKSPPPPPYVYSSP----PPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYSSPPPPPY 159

Query: 152 VYHSPPPPKKVYYPPP----VYHSPPPPKKVYYPPP----VYHSPPPPKKVYYPPP---- 211
           VY SPPPP  VY PPP    VY SPPPP  VY  PP    VY SPPPP  VY  PP    
Sbjct: 160 VYKSPPPPPYVYSPPPPPPYVYQSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPY 219

Query: 212 VYHSPPPPKKVYYPPP----VYHSPPPPKKVYYPPP----VYHSPPPPKKVYY--PPPVY 271
           VY SPPPP  VY  PP    VY SPPPP  VY  PP    VY SPPPP  VY   PPP Y
Sbjct: 220 VYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPY 279

Query: 272 ---SPPPPKKVYY--PPPVY---SPPPPKKVYY--PPPVY---SPPPPKKVYYPPP---- 331
              SPPPP  VY   PPP Y   SPPPP  VY   PPP Y   SPPPP  VY  PP    
Sbjct: 280 VYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYSSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYTSPPPPPY 339

Query: 332 VYHSPPPPKKV--YYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPV---YSPPPPKKVYYPPPV---YSPP 360
           VY SPPPP  V  Y PPP  +   PP  VY PPP    YSPPP   VY PPP    YSPP
Sbjct: 340 VYKSPPPPPYVDSYSPPPAPYVYKPPPYVYKPPPYVYNYSPPPAPYVYKPPPYVYSYSPP 399

[Close]

BLAST of Cp4.1LG13g04140 vs. TAIR 10
Match: AT2G24980.1 (Proline-rich extensin-like family protein )

HSP 1 Score: 146.4 bits (368), Expect = 4.6e-35
Identity = 217/399 (54.39%), Postives = 223/399 (55.89%), Query Frame = 0


Query: 32  YVYASPPP----PPKKVYY----PPPVYHSPPPPKKSYYPPPVYHSPPPPKVY-YPPPFY 91
           YVY+SPPP    P  KVYY    PP VY SPPPP  S  P   Y SPPPP VY  PPP Y
Sbjct: 177 YVYSSPPPPYYSPSPKVYYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVYYKSPPPPYVYSSPPPPY 236

Query: 92  HSPPPPKKVYYPPPVKSPPPPKVY-YPPPVYHSPPPPKVYY----PPPVYHSPPPPKKVY 151
           +SP P  KVYY    KSPPPP VY  PPP Y+S P PKVYY    PP VY SPPPP    
Sbjct: 237 YSPSP--KVYY----KSPPPPYVYSSPPPPYYS-PSPKVYYKSPPPPYVYSSPPPPYYSP 296

Query: 152 YPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYY----PPPVYHSPPPP-----KKVYY-- 211
            P   Y SPPPP     PPP Y+SP P  KVYY    PP VY SPPPP      KVYY  
Sbjct: 297 SPKVYYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSP--KVYYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVYYKS 356

Query: 212 --PPPVYHSPPPP-----KKVYY----PPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYY-- 271
             PP VY SPPPP      KVYY    PP VY SPPPP     P   Y  PPP  VY   
Sbjct: 357 PPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVYYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVYYKSPPPPYVYNSP 416

Query: 272 PPPVYSPPPPKKVYY--PPPVY---SPPPP-----KKVYY----PPPVYHSPPPPKKVYY 331
           PPP YSP P  KVYY  PPP Y   SPPPP      KVYY    PP VY SPPPP   YY
Sbjct: 417 PPPYYSPSP--KVYYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVYYKSPPPPYVYSSPPPP---YY 476

Query: 332 --PPPVYHSPPPPKKVYY--PPPVYSPPPPKKVYY--PPP--VYSPPPPKKVYYPPPVY- 368
              P VY+  PPP  VY   PPP YSP P  KVYY  PPP  VYS PPP      P VY 
Sbjct: 477 SPSPKVYYKSPPPSYVYSSPPPPYYSPSP--KVYYKSPPPSYVYSSPPPPYYSPSPKVYY 536

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of Cp4.1LG13g04140 vs. ExPASy Swiss-Prot


Match Name	E-value	Identity	Description
Q9FS16	5.8e-83	60.94	Extensin-3 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=EXT3 PE=1 SV=3	[more]
Q38913	8.1e-77	66.67	Extensin-1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=EXT1 PE=2 SV=2	[more]
O65375	4.7e-40	55.75	Leucine-rich repeat extensin-like protein 1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=L...	[more]
Q9T0K5	1.2e-32	52.25	Leucine-rich repeat extensin-like protein 3 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=L...	[more]
Q9M1G9	2.6e-30	52.63	Extensin-2 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=EXT2 PE=2 SV=1	[more]

BLAST of Cp4.1LG13g04140 vs. NCBI nr


Match Name	E-value	Identity	Description
XP_023551298.1	1.37e-240	98.37	extensin-1-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]	[more]
XP_022939251.1	5.29e-222	92.27	extensin-1-like [Cucurbita moschata]	[more]
KAG6578896.1	4.69e-216	86.49	hypothetical protein SDJN03_23344, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sorori...	[more]
KAG7016424.1	6.10e-204	75.21	hypothetical protein SDJN02_21533, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyro...	[more]
XP_031743672.1	1.38e-199	88.02	LOW QUALITY PROTEIN: extensin-3-like [Cucumis sativus]	[more]

BLAST of Cp4.1LG13g04140 vs. ExPASy TrEMBL


Match Name	E-value	Identity	Description
A0A6J1FFE0	2.56e-222	92.27	extensin-1-like OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111445224 PE=4 SV=1	[more]
A0A6J1JZT6	1.80e-197	88.41	extensin-1-like OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111489763 PE=4 SV=1	[more]
A0A0A0K8S7	3.10e-194	90.84	Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_6G058200 PE=4 SV=1	[more]
A0A5D3DG54	8.09e-193	91.46	Extensin-1-like isoform X2 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaff...	[more]
A0A6J1JMV9	7.53e-174	83.94	extensin-1-like OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111487278 PE=4 SV=1	[more]

BLAST of Cp4.1LG13g04140 vs. TAIR 10


Match Name	E-value	Identity	Description
AT1G21310.1	4.1e-84	60.94	extensin 3	[more]
AT1G26240.1	5.1e-42	53.05	Proline-rich extensin-like family protein	[more]
AT1G12040.1	3.3e-41	55.75	leucine-rich repeat/extensin 1	[more]
AT1G26250.1	5.7e-41	54.68	Proline-rich extensin-like family protein	[more]
AT2G24980.1	4.6e-35	54.39	Proline-rich extensin-like family protein	[more]

InterPro

Analysis Name: InterPro Annotations of Cucurbita pepo (Zucchini) v1
Date Performed: 2021-10-25

Position :

Zoom :

x 1


IPR Term	IPR Description	Source	Source Term	Source Description	Alignment
None	No IPR available	PANTHER	PTHR32093:SF146	POLLEN-SPECIFIC LEUCINE-RICH REPEAT EXTENSIN-LIKE PROTEIN 3	coord: 139..276 coord: 33..167
None	No IPR available	PANTHER	PTHR32093	LEUCINE-RICH REPEAT EXTENSIN-LIKE PROTEIN 3-RELATED	coord: 139..276 coord: 33..167

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:


Feature Name	Unique Name	Type
Cp4.1LG13g04140.1	Cp4.1LG13g04140.1	mRNA

GO Annotation

GO Assignments

This gene is annotated with the following GO terms.

Category	Term Accession	Term Name
molecular_function	GO:0005199	structural constituent of cell wall