Cp4.1LG11g06450 (gene) Cucurbita pepo (MU‐CU‐16) v4.1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTNTTTCAATCAGGGTTTAAGGAAATTCGTGTCTGATTTGGAAGATCATTTTGTGATTGGAGAAAAGTCGAGTTTAGAAGCTGGCGCTATTGGACCACTGAGTGCATTTGGACCCATAAATAGCTACTGAAATCTACCCACGTAGCGGACTGCATCATTCTAATCAGGCAGGGCTCCCTCTTCTTTCCATTTGTTGAAGGAGGAGGAGGAAGAAGAAAAAATCGAAGATGTTTAAGTTCTTGAAGGGAGTGGTGGGTGGATCTGGGACTGGGCTCAAAGATCTACCCTACAACATCGGCGATCCGTACCCATCAGCCTGGGGCTCATGGACTCACTTTCGGGGTACCTCCAAGGTATGTTTTAACCGTCAAGTAGTCGCTTGGGTAATGAACATGATCTAACTTTGGCATTGCGGATTGCTGAATTGTGGTTTGTATAATTCTAAGTGATTTGTACTGCATTTTAGAATTGACGAGCCTTGATCCTGTAGTTGGGAAATTGCCCATCCTTTACTTAGTTGGCTTCTTACATGTTTTGGTCGGTGGTGTGTGGCAGCCAATTTATGGGGTGAATTTGAATTGCTTTACATTTGACAACTTTGAGTTTGTTGTGTTTTGGCTTTTACTGCCCAACTTTTCCCACCTTTGTTCCTTTCGAAGTAAGGAAATGAACTCTCAAAAATTTTGTACGTTGAGATGAAACAATGCTAGCATTACCTAATGTTACAAAGCTCTTCTTCTTCTTCTTCCCTTTTTTCTTCATGTTTGGTAACTGAAACACGTTAGTTAATTACAAAGTGCCCTATAATTATTTCCTATACTATAATTACTTCCTATATAAGAAATTTTTAAATAAGACGGTCTTGGTAAAATAATGACCTACTGTTGGTGGTGGATAGCTTCTATCAGATCCGAACATTAAGCCTTTTAGAGAAGGGAGTGGATAGTGGGTATGAACTTATTTGAATAGAATTTGTTCTATAGGTTATACAATTGTGTCTTTTAAGTTCTAAAAGTTATAAGAAGAAAGTAATGAGTTCTTATGGAGGTTCTCATATTTTTGTGACAACGCGGAGATTTTCAAGTAGTAGCTTTAGGATTGTTGAGGTCAGACAAATTTGAAACCATGTGAACGATTGCTTGTTGGGCATTGTCTAAGCTCTAGATGTGTTCTTCCATTCGGGCAACAAAGCCCGTCAGCTATCTCTATGCTCGAAGCCACCAGCAGTTGTGGCTCTGTCTTCTAGGACTTCGACCCTAGTCATTAATTCGTGGATAGGCATTGCCTCAAGGCGACCTGCCATCTCATCAATGCTGTCGGCTTTAGTGGCAATCTCATTCATGCGAGAATCCAAAAGCCCCATTCGATCAAGAACTTCACTCATGCAGAGTAATTGATCTTCGATTCCAGCTAATCGGTTAGCTTGAGATTTGCCCAATTGTTTTGCAGCGGACATGGTTGTGTACTACTTTTCAATGACCCGACTCGGCTTTGATACCACTTGTCACAATCCCACTCTTGCAGTAGTGGGACAACGATTGTGCAACACTTGTTCTAACCCAGTGAACAAGTCAGCCGTGAGAAATTTGGACTTCGCGGCCAACGTTGGCGTATACTCGAACCTTGAGTCACGTTTGAGATAAATGTTTCGGAAAACGTGAGCGAGGAAATATGTTGAAAACAATTTGAAAGAAAGCAATATTATAGCTAAAAGCGTTTAGGCAACAACAACGACTTTGATAGCATATAACCCGGGTAGCAGGAAGAGACAACTAGTCATATCCCCCTATAGTACATTTTATGGCATTTTAGCTCTGACAGGTGTAGACATGATTTTGGTGAATGGTCATACACCCCCATATTGACACAACATGAAATAGTAAAGACCTATCTAAGATGAAAGTATGTAAAAGGGGTTTAGAACAGGCATATGGCCATGGACAACACGTCCTAGACAAGCATGACCGGAACATCTGACATGTGGTCATAGACAACATGCCTTGGACAAGCATGACCGTGACACATGACAACCTCCAACCATGCTTGCTATCAAGTTAGATGTGAGCCAATAGCTGCTTGGGAACTACAAACCTGCTTTTCTTAGGATTGGGAGCAGGGAGTTTTTGCTGAGTTTCAATGAGAAATCTTGAGGAAGTTTCATGATAAAAAGGTAGAAAAGAACAATCTTTGGGGTAAGGTGCTTATTTTTAATTTTATGGTGGTCAAAGAGGGTTAACTTTTTAGATTTTGGGCTTACATTTGCTTCCATGCATATTGAATGGGGAACTTTTTAGTCTTTTTTTTAGTTAGAGGATTTCTTATCCTTTTGCTTGCAATTATTCGTTTTATATCAATTTTTTGTCCAAAAAGAGATTTGCTGTATTCTCATATTCTCCTCTCTAATAGGCATTCATTCTATAAATATTAGAGATCGTTTGGTACCTGGTTTATATGACATCTATAGAGATTATATTTGTATCTACTTTTGCCTTTTTTTCCCCCTTTTGTTCAATTGAAAGCTCTTGCTTGTGGTGTATGTTGGACGTTTTCCTTGTCAAGCAGTTAGCTGCTAAATCTGGTTGTTGCATATAGGATTTCAGTCCCTGAAGTCTAGATTACAGAAATGTTTGGGCTTCTATGTTCGCCTTTTATATTTTATGTATATTTTATGTCAGCTCTATAATCTTCTGACATTACTATAAACTTCTAAAATTTTTGTATTAGGTGAAATTGATGTTAGAATTGTTTCACTTTCAGGATGATGGATCTCCAGTCTCTATATTTTCGCTTTCAGGGAGTAATGCACAGGATGGACATTTGGCTGCAGGTCGCAACGGTGTGAAACGGCTGCGAACTGTAAGCTGCCAACGACTATTGTTATGGATCTTATGCATACAAATGAGATAATTTTTGGGTTTTTTTTTTTTAATTTTTTATTTTTATGAAAAGCTAAGCTTGTATTGAAATCAAAGAAAAGAATACAAGGGGAATTAAAAAACCCACCCCCAAGAGGAACTCAATTAACACAAATGAGATTATTTTGTGTGTATTCATAATTTTGACTACTGTCGTGCCATTTCAACTCTAGTTTGTGTGGATTTTGATGTATTTTTAATTGATAATGTATTCTATACCAAAAATGACATGCGATTTATATTCTGAGGATTGATAACTTTTCTTGGTTAATCCATTAAATCTACTATGCATTTTTTCTAGACTATCTGTCGGCATATTGATATTCCATTGACATTAATAATCTTATCTACAATTTTATTCAGGTTAGGCATCCAAATATTTTATCCTTTCTTCACAGTACTGAGGCTGAAACTACTGACGGTTCTGCTTCCAAGGTTACGATTTATATGGTTACAGAGCCTGTTATGCCATTGTCTGAAAAGATCAAGGAATTGGGTTTAGAAGGTACCCAAAGGTATAAGCCAAATCCAACCAGAAGCTTTTTTCCAATTTTGGTTTTTGCATTTTTTGTTATTGCTGGTTACATGTTTTTTAGTACTGTCGTGTCATTCATTTTTCAGAAATACATTGTTTTATGTAACATGATAATGAAAGAGCCAAAGAGTTTTGTCTCGTGCTTCTAAAATGATCTGCCATTAATTTTATGCACTGGTAACGGATGCATTATATAGTTGTAGACTTATAAGAAGTTTAAAATGTGAAAAAGATGGGCATTTTTCATATCATGAATTACATCATTTGCGGAAATGTTTTTTCTATTTGTCATCATCAAAATGAGATTGCCTAATTCTTGCTCAAGGAGCCCTCTGAGATCTCTATTGGAGGATGGGAAGTCTTGGGGCATGTTTGAAAGTGATTTTAGAAGTGGTGATCTTAGTGAAAACGATTTGTTTATAAGTAGTTTATTAAAGGTGTTTTTATATAATCATTTAAACGATCAGTTTTACACTTTTGAAGACAACTTTCATTGCATGAAAAATGATTTTTAATGATTAAATCAATGATTGATTGATGACATGTTTGACAGTCATTTTGAACATGACAAAAGTGATCTTAACCATTTCAAAATCACTCCCAAGCATGCCTGTCATTTCACTCTCTCCTCACCTCCTCCCTCCCCCGCTCGTTTGTCTCCCTCCAAATCTGGAACTTTTGGGATTTGAAAAAAGTTCTAGATTTGAAACTTTCGAATCTCAAAGGAGGGAGGCAAATTTTTTGTATAAAATTTCTAGATGTAACAGAAGTTTCATATCTGTAACTTTTAGATTTATAAGGAGAAAGGCCAATGAGAGGAATGTGAGGAGTAAAGAGAGGCGATAGTGGCGTGGTGGTTGACAGATGTTGGCAACACAGCTCTTGGAGTACTTCGGCAATGTTGTGGTAGTAATAGTTGGCATAGTGTGATGGTTGGTATCAGTGGCAGACAGTGAACACCAGACGAAAAAAAGGAGAGGGAGAAAAGAGAAGGAAGGAGAAAGGGAGGGAGGGAGGGGAAGAGAGAGAAAATGCTTCTTTTAGAAAAAAAGAAAAATGCTAATTCAGCTTCAAAATTATAAAAATAGTGTCTAGTTAGCTCAATATTAATAACAAATGCTGAGTCAGCCCTACATAAATAACAGTTGAGAGGATGTTAATAATTGAGACTAGAATGAAGATTATCCCAAACTTCAGAGGTAAGAATGTTGAGTTTGAAAACAAGGAAAGGGCCTATGTGAACTTCTTTGATAATCTTCTATACCTTGCTCTATCTTGATGTAAATTGAATTCTCTCTTTTGTTATTATAGCTTCTTTTTTTGTTTTTGTTTTTGTTTTTTTTCTCGAATGGAAGTTTATTGTAGCTCATTTGGATTGGTGTCTTTCTTTCACCCTCTCCCCACCCCTTTTTTTTTAAAATAAATTTCATATATAAATGAAGTTCTTTCNAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAAAAAAGAAAAATGGTGAGCTCGAAACCTTAGGAAC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BLAST of Cp4.1LG11g06450 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q96KG9 (N-terminal kinase-like protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SCYL1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 369.0 bits (946), Expect = 1.3e-100 Identity = 265/781 (33.93%), Postives = 397/781 (50.83%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG11g06450 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q28FH2 (N-terminal kinase-like protein OS=Xenopus tropicalis OX=8364 GN=scyl1 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 368.2 bits (944), Expect = 2.2e-100 Identity = 251/748 (33.56%), Postives = 392/748 (52.41%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG11g06450 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: A6QLH6 (N-terminal kinase-like protein OS=Bos taurus OX=9913 GN=SCYL1 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 363.2 bits (931), Expect = 7.1e-99 Identity = 250/707 (35.36%), Postives = 371/707 (52.48%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG11g06450 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q5M9F8 (N-terminal kinase-like protein OS=Rattus norvegicus OX=10116 GN=Scyl1 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 359.8 bits (922), Expect = 7.8e-98 Identity = 234/669 (34.98%), Postives = 349/669 (52.17%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG11g06450 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q561M0 (N-terminal kinase-like protein OS=Xenopus laevis OX=8355 GN=scyl1 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 358.6 bits (919), Expect = 1.7e-97 Identity = 261/829 (31.48%), Postives = 413/829 (49.82%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG11g06450 vs. NCBI nr
Match: XP_023546802.1 (N-terminal kinase-like protein [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 1442 bits (3732), Expect = 0.0 Identity = 760/793 (95.84%), Postives = 760/793 (95.84%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG11g06450 vs. NCBI nr
Match: XP_022929570.1 (N-terminal kinase-like protein [Cucurbita moschata] >XP_022929571.1 N-terminal kinase-like protein [Cucurbita moschata] >XP_022929572.1 N-terminal kinase-like protein [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 1441 bits (3729), Expect = 0.0 Identity = 759/793 (95.71%), Postives = 760/793 (95.84%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG11g06450 vs. NCBI nr
Match: XP_022996654.1 (N-terminal kinase-like protein [Cucurbita maxima] >XP_022996655.1 N-terminal kinase-like protein [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 1439 bits (3725), Expect = 0.0 Identity = 758/793 (95.59%), Postives = 759/793 (95.71%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG11g06450 vs. NCBI nr
Match: KAG7029885.1 (putative inactive serine/threonine-protein kinase scy1 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]) HSP 1 Score: 1437 bits (3720), Expect = 0.0 Identity = 757/793 (95.46%), Postives = 759/793 (95.71%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG11g06450 vs. NCBI nr
Match: KAG6598930.1 (putative inactive serine/threonine-protein kinase scy1, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 1433 bits (3710), Expect = 0.0 Identity = 755/791 (95.45%), Postives = 757/791 (95.70%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG11g06450 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1EUR3 (N-terminal kinase-like protein OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111436120 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1441 bits (3729), Expect = 0.0 Identity = 759/793 (95.71%), Postives = 760/793 (95.84%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG11g06450 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1K7E5 (N-terminal kinase-like protein OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111491833 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1439 bits (3725), Expect = 0.0 Identity = 758/793 (95.59%), Postives = 759/793 (95.71%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG11g06450 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CBP3 (probable inactive serine/threonine-protein kinase scy1 isoform X2 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103499151 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1379 bits (3568), Expect = 0.0 Identity = 725/794 (91.31%), Postives = 743/794 (93.58%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG11g06450 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CCL0 (probable inactive serine/threonine-protein kinase scy1 isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103499151 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1372 bits (3550), Expect = 0.0 Identity = 724/797 (90.84%), Postives = 742/797 (93.10%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG11g06450 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1FHG6 (probable inactive serine/threonine-protein kinase scy1 isoform X2 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111444185 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1339 bits (3465), Expect = 0.0 Identity = 708/798 (88.72%), Postives = 734/798 (91.98%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG11g06450 vs. TAIR 10
Match: AT2G40730.1 (Protein kinase family protein with ARM repeat domain ) HSP 1 Score: 1128.6 bits (2918), Expect = 0.0e+00 Identity = 605/798 (75.81%), Postives = 668/798 (83.71%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucurbita pepo (Zucchini) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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