Cp4.1LG08g13200 (gene) Cucurbita pepo (MU‐CU‐16) v4.1

Overview


Name	Cp4.1LG08g13200
Type	gene
Organism	Cucurbita pepo (Cucurbita pepo (MU‐CU‐16) v4.1)
Description	Unknown protein
Location	Cp4.1LG08: 9481886 .. 9486637 (-)
RNA-Seq Expression	Cp4.1LG08g13200
Synteny	Cp4.1LG08g13200

Sequences

The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR

Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.

TGATTCTCTTACAGTTCTAAGTACAACTGGTTGGGGGTCAACCAAAATATGGTTTCTAGGTGAAATTTATAGACGTTATTGGTGCAGTTTGAGTAGTAACAGCGCGAGATCCCACATCGGTTGGAGAGGGGAACGAAGCATTCCTTATAAGGGTGTAGAAACCTCTCCCTAGTTAAGGGAAAGCCCAAAGAGGACAATATCTGCTAAGGAGGGCTTGGGTTGTTACAAATGGGATCAGAGCCAGACATTGGGTGGTGTGCCAGCGAGGACGCTGGCCTTTAAGGAGGGTGGATTATGAGATCCTACATCGGTTGGAGAGGGGAACAAAACATTTCTTATAAGGTGTGGAAACCTCTCTCTAGTAGACACGTAAAATCTTGAGGGGAAGCCCGAAAGAGATATTTGCTAGGGTGAGCTTGGACTATTACAAACCGTTTGAGTACAGTAGATATAGCTGAGGGTTGAGGGTCGAGTATCAAATATGATTGATTTTATCACCAACATGGGTTGTCCTAGAGATCAATAAGAGTCATATAAACAATAAAAGATTTAGGGAGAATGGTTTCTAAGTCATGATAGTTGATTTAATATCCGTACAAGTTAGCTTGGCAATTAAATGTAATATGGTCTAGTAGTTGTCATAGGAGAATAGTAGCGTGTTAGTTTATGAGTACGAGTCACGTGAGAAAGGGTTCCTTTATGTACCATCTTATCGAAATCTATAATCTGTAAGTATCTTCTTTATCTTCTTCGTGGGTGTGAGTGAAATGATGAACATTGAAAGGAAAACATGCTAACTGTGTAATACTGTAATAATTTTCTATTTGCATCAACAGTTTTGTTAATGTTCTTATTGGCATTACTGCTAGTTTATATGATCGAGTTCAAATTCTCATTTGGAATTGTTTTCATATATGAAATATGGACTCGTGAATGAAGCTGATTGGTTGAGTTTAAAGGACGTTCTTTTGTTGTATAAGAAATGTGGGGTAATGAGGATTTGAATCTCCGACCTAAAAGGAAGGAGTAAATGTCAATTGTCGCCGTGCGACGAACAAGTGACGAACTCTTATTATACTTGTTGATATCTTATTATTATCTTTAGTTTCTAATTTTTCTTTAATCACTCTTAGGTAATTTTATACTGATACTCAGGGATGTCATGATTTATTGAGGTTTACTGATGTTCCACTGTGTTCTTTTGCAAAAGAAATAAACAATTTTTAGTTCAACAATAGTAGAGTTCAAGATCGAATGTCGACTTGGAAATGGTAATATGCACTTTATCCATCAACGTACTATAAATTTATTAAATTTATTTTGACGATCAATTTTATGGGGAAATATTTAGTGAATTAATGTTTGAAATTTAAACTTGTTTTTGACCCATCTAGATGGTATAAGCTTGTGAAAATATTTTGTTGATGTGAGACGATAATTTTTTTAATGTATTTATAAAAATACTTTTATAGAGTAATTTACCATATATAACAAAGAAAAATATACGTTATTATTTAAATTTTTATATACTCAACGATGAATTATTGATCTTAAATGTTTGAACGTATTTTTTGAAATATAAAATTAATTTTAAAAGGTTTTTTTTTTCTTTTTTATTAATATAGCGAAATTAAGTTATTTAGCAAAATTAATATGAAGTAAGTAATATTAATTAATTTATAAAAAAATTGGGAGGCAAGCAACCCGATGGCGGTAGAATCGCAGGAAACCCAAAAGGAAATTTGATCGATCATCTCTGTTATCTCTGTTTGTCGATCATCTCTGTTATCTCTGTTTGTCGATCATCTCACGGAATGGCGAGCTTGGTTGAAGTTTCTTTCTAATGGATGCTGCCCGATTAAGGTAAATCAGTCATGTTTTCCCCCTTTTTTGCTTTTGGCTCAATTTTTCCCATCAATTTCTTCTAAAATATACCCTACCAATTCAGAAATTGGATTAGGATCTATTAGGAAGAGTTGATACCACGCTGGTGGCTTCGTACATTCATGGAGCTTTAATTTAACAAGATTATTGCGTGTTAGTGTAATGGAAAGTTTGACGTTTATCATTTCAATTTTTGTGGCCCTTCGTACATTCGTACCATTTTTGTTCGTTTAAGCTTTAATTCATCACACAATCCTCTGGCCTTCATTGTAGCTAATAGCTTATCAAACACGTCGTGCAGGTCGACACTGTCTGGCCTTCATTGTTTACGGCAGCAGTTTTGATATTCTTCTCAAATTTAACTCCTGGCTTCAAACACATCTCAGATTACAGTAGGTACCATCACATTCTCTCTGAAATCAAATATTGTGCTTCTGCTTGATGTTGTTGGTAACTGGTCGTTGTATCGATCGAGCAGCTGATCAGATCCTCTGTTTAGGAAGATCTTAGCACTTTTAAGGATAGAAATGTCTGATATTGTTGTCATCATCTTAGATAGATTGCACTTTTAAGGAGACTATATACAGAGTCAGTAGCATTATTACTTCACTCTAGCAAAGATTTGGAATAACTCAAATGAGTGTTGATTAACTGAAATAATAGTGAATATTATTCCCATGTTAGAGAAGATAAGAGCTCTGCAATTTTGATACGAGATTTGTTCATCTGTGATGATAAACTCGCTCAAGGAATCAAACTTTCTAAAATTGACCAATTTCAAGTGGGCGTAAGTGTGGACCAGTATGAATCAAATGACTCCAATAATTGTGAAGTGAACGTTACTGATGAGTAAAGTTACCTGGATCTATTGATTCAAAATGGTCCATTCTATACGACATTACCAGTTTGTGTGTGTCATCTTTGTGTGGGTCAATTGTTGTTGAGTTGGCTGTTGGCTTGTCCTTAGGTGCATCATTACCCGAGGTCAGAGCACTCCGTCTATTGTCATAGAAACAGTTCCTAGGAAAGATTGTGGTTCACAGGTATCCAATCAATTAATCCCCTTAGTCGGAAAAGTTTAAACAGAAATGAAAGGGTAGGGTGAGGGATAAGGAGGAAGCCCTAAACATCATGACTTGTCGTCTAATCGCTTTCAAGAGCTTTAAGATGAAAATTTCTTGGAAATTTATAGATTAATCAGCTCTTAGTTTTAAGTAGATAACACGTTATGTTCTCAACTAAAAAGTTAAAAGATATCAAATCTCGAGCCATACCCGAACTTATTTTTGCATAATGGAAATGGAAATAGAGAGTTTGGGAAATCTCCAAGGTCACACAATTGAAGAAGAATAACACTGAATTGACCAATCACTGTAATAGAAAATCCTTTTATCAATAAATGATTGGCTCACAAAATGTGAAGGAATCAAATTCAATTATTGTAGAACCCATAGAGCTTCAGATTGCTTTAATTTCTCAATAAATCTCATACCCATAATTGGCTGCGTCTCCAGCTGTGAATGCCTGCCCAATTCCCCTTTCAAGATTTTCTCATAAATTTTCCCCATCTTCTCTTAGTTTTAACCTTAAATTGATTAAGGATGGAGAAAGATATGCAGCTAATTATTGTTGTGGGGTTTGTATATTAATGAATTAGCTTAGACTTCTCCGATGGAAAACTGTTTTGTCCCGCTACATATCGTTGTCAGCCTCACGATTTTAAAACGTGTCTGCTAGGGAGAGACTTCCACACCCTTATAAAGAATGTTTCTCCCCTCTCCAATCGACGTGGGATCTCACAGTTGTCCTACACCATGATCTAGCTAATAAGTGATGAAGCTAACTTGTTAGTTTTAGTCAAATATGACGACTAAAAAGTGGGGATATGCTACCATTTTAGGCTCGATGTGCTGCCATGTTCGATACTCTTGTAAATCTACAGTGACCCAGATAAAATTACACGAACCCAAACCCAAACGACCCTGTTAAGATTTTGTAGAGTAATAAAGTTTTTACAACAAAAGAGAAGGGTTTTCTTAGGGTTATCTAACGAATAGGTCCTTCAAATCAGGACTCTATTCATTCAACTCTCGTTAAAATGTCCAAAATAGGCCATAAAGAGGTGGAAAACATAAGACCCCATTAATATTTCGTCTAGTTATAGAGCTTTCATTGCAATGGAGTAATGAGAGTGAGGGAAAATGAAAGGGGTAACTATCCACTTGGCCGGCAATGAGTCCTACCCTTTTGAAGGCAAAACAAGCTAGGCTAGCCAGAGCTAGAGATATCTATTTCAAATTATAACCACAAAACCAGAAAAGCAAAAGCTTTGTAACTTCGAGTTGGGGCTTCAACATTAAAACCAGTTAAGACACTTGTACTTTGGTAGGTAGATAGATACTTATCTAAGTTTTTGACACATTTTTTCATTAGATAGTATGTGAGTTTCTGTTCATCTTTGGCAGATTTCCTTTGCATCACCTAAAGGGCCCTACAGCACACACTGATATCAAAAGCAAGAGCAAAAAAAGGTCTCTCAAGTACGTTTTTCCCCTTAAGCTGTGTTTGGAGGAATTGAGCATTGCTAAAAAGATCCATAGAGAGAGAGAAAGAAAGAACGACACAGTAATAAGTACTGCTGAGTTTTAGTTTATGACATAACTTTTAGAATGGTAGAAGGACAAAAGCCTTACAGATTCATCAAAGCCAAAAAAAAAAAAAAAAAACACAGTTTTTTAGTCTCTTTAGGGGTTTCTGAGTGAAGTACCACAGAAACTCAGGTAAAGTTGTAAGAAATGTCATAAGATCAGCTCATGTTTGCTCTGCCAAAGAATTGAAAGGAAAGTAGATACCCAACTTCGAGAACTG

mRNA sequence

TGATTCTCTTACAGTTCTAAGTACAACTGGTTGGGGGTCAACCAAAATATGGTTTCTAGGTGAAATTTATAGACGTTATTGGTGCAGTTTGAGTAGTAACAGCGCGAGATCCCACATCGGTTGGAGAGGGGAACGAAGCATTCCTTATAAGGGTGTAGAAACCTCTCCCTAGTTAAGGGAAAGCCCAAAGAGGACAATATCTGCTAAGGAGGGCTTGGGTTGTTACAAATGGGATCAGAGCCAGACATTGGGTGGTGTGCCAGCGAGGACGCTGGCCTTTAAGGAGGGTGGATTATGAGATCCTACATCGGTTGGAGAGGGGAACAAAACATTTCTTATAAGGTGTGGAAACCTCTCTCTAGTAGACACGTAAAATCTTGAGGGGAAGCCCGAAAGAGATATTTGCTAGGGTGAGCTTGGACTATTACAAACCGTTTGAGTACAGTAGATATAGCTGAGGGTTGAGGGTCGAGTATCAAATATGATTGATTTTATCACCAACATGGGTTGTCCTAGAGATCAATAAGAGTCATATAAACAATAAAAGATTTAGGGAGAATGGTTTCTAAGTCATGATAGTTGATTTAATATCCGTACAAGTTAGCTTGGCAATTAAATGTAATATGGTCTAGTAGTTGTCATAGGAGAATAGTAGCGTGTTAGTTTATGAGTACGAGTCACGTGAGAAAGGGTTCCTTTATGTACCATCTTATCGAAATCTATAATCTGTAAGTATCTTCTTTATCTTCTTCGTGGGTGTGAGTGAAATGATGAACATTGAAAGGAAAACATGCTAACTGTGTAATACTGTAATAATTTTCTATTTGCATCAACAGTTTTGTTAATGTTCTTATTGGCATTACTGCTAGTTTATATGATCGAGTTCAAATTCTCATTTGGAATTGTTTTCATATATGAAATATGGACTCGTGAATGAAGCTGATTGGTTGAGTTTAAAGGACGTTCTTTTGTTGTATAAGAAATGTGGGGTAATGAGGATTTGAATCTCCGACCTAAAAGGAAGGAGTAAATGTCAATTGTCGCCGTGCGACGAACAAGTGACGAACTCTTATTATACTTGTTGATATCTTATTATTATCTTTAGTTTCTAATTTTTCTTTAATCACTCTTAGGTAATTTTATACTGATACTCAGGGATGTCATGATTTATTGAGGTTTACTGATGTTCCACTGTGTTCTTTTGCAAAAGAAATAAACAATTTTTAGTTCAACAATAGTAGAGTTCAAGATCGAATGTCGACTTGGAAATGGTAATATGCACTTTATCCATCAACGTACTATAAATTTATTAAATTTATTTTGACGATCAATTTTATGGGGAAATATTTAGTGAATTAATGTTTGAAATTTAAACTTGTTTTTGACCCATCTAGATGGTATAAGCTTGTGAAAATATTTTGTTGATGTGAGACGATAATTTTTTTAATGTATTTATAAAAATACTTTTATAGAGTAATTTACCATATATAACAAAGAAAAATATACGTTATTATTTAAATTTTTATATACTCAACGATGAATTATTGATCTTAAATGTTTGAACGTATTTTTTGAAATATAAAATTAATTTTAAAAGGTTTTTTTTTTCTTTTTTATTAATATAGCGAAATTAAGTTATTTAGCAAAATTAATATGAAGTAAGTAATATTAATTAATTTATAAAAAAATTGGGAGGCAAGCAACCCGATGGCGGTAGAATCGCAGGAAACCCAAAAGGAAATTTGATCGATCATCTCTGTTATCTCTGTTTGTCGATCATCTCTGTTATCTCTGTTTGTCGATCATCTCACGGAATGGCGAGCTTGGTTGAAGTTTCTTTCTAATGGATGCTGCCCGATTAAGATTTCCTTTGCATCACCTAAAGGGCCCTACAGCACACACTGATATCAAAAGCAAGAGCAAAAAAAGGTCTCTCAAGTACGTTTTTCCCCTTAAGCTGTGTTTGGAGGAATTGAGCATTGCTAAAAAGATCCATAGAGAGAGAGAAAGAAAGAACGACACAGTAATAAGTACTGCTGAGTTTTAGTTTATGACATAACTTTTAGAATGGTAGAAGGACAAAAGCCTTACAGATTCATCAAAGCCAAAAAAAAAAAAAAAAAACACAGTTTTTTAGTCTCTTTAGGGGTTTCTGAGTGAAGTACCACAGAAACTCAGGTAAAGTTGTAAGAAATGTCATAAGATCAGCTCATGTTTGCTCTGCCAAAGAATTGAAAGGAAAGTAGATACCCAACTTCGAGAACTG

Coding sequence (CDS)

ATGGATGCTGCCCGATTAAGATTTCCTTTGCATCACCTAAAGGGCCCTACAGCACACACTGATATCAAAAGCAAGAGCAAAAAAAGGTCTCTCAAGTACGTTTTTCCCCTTAAGCTGTGTTTGGAGGAATTGAGCATTGCTAAAAAGATCCATAGAGAGAGAGAAAGAAAGAACGACACAGTAATAAGTACTGCTGAGTTTTAG

Protein sequence

MDAARLRFPLHHLKGPTAHTDIKSKSKKRSLKYVFPLKLCLEELSIAKKIHRERERKNDTVISTAEF

Homology

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of Cp4.1LG08g13200 vs.


Match Name	E-value	Identity	Description

BLAST of Cp4.1LG08g13200 vs.


Match Name	E-value	Identity	Description

BLAST of Cp4.1LG08g13200 vs.


Match Name	E-value	Identity	Description

BLAST of Cp4.1LG08g13200 vs.


Match Name	E-value	Identity	Description

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:


Feature Name	Unique Name	Type
Cp4.1LG08g13200.1	Cp4.1LG08g13200.1	mRNA