
Cp4.1LG07g07320 (gene) Cucurbita pepo (MU‐CU‐16) v4.1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptidethree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.AAGCCCACAGTAGTGTTCTGTAGACTCTTGAGAGTTCAGAGCTTGGGTGAAGAAGACGAGAGTGAGTTGAGTTTTGCTTCTTCATTCTTCAAAGCTTCGAATCTCCACCATTTTTTGTTCTCCTTCTTGGAGGAGGAAGCTGCCTCAGAAATGGATTCCGTGTTCGTTAGAGCCTATCGAAGTCATATTACGCTTGCCACAGGTATGCCGTTTTTTTTTCTCTTCAAATCCAAGTGGTTTGAGGCTGTTTCAGTTTAGTTTAACCTTAGATTTCTCCATTGGATGTTTAGCTTCTTGTTTTAAGCTTGTTTCTGCTTGTTGATTGGTGCATTTTTGTTATCGAGCCTGTTTTTTATTTTTTATGCTTTGTTTTCATTTGCGCTTGGAGAGAAACTCGATGATGTTCTCGCGATACTCTTAGTATTTCTTGATTGAAGCTGATTCGAGTTTGTTTTGTTTGATTTGCTGGTTCTGATCGATAGGTGGAATTGGAAACGGCTGGATGAATCGTGACGTCAACAATGTTTCGCTTCCAAGTACGACCAATTTGTCTTTGAATATTATTTTCTTTGCTTTTATCGCTTTCGTTTCTCGGCTTTTCTGTTATCCTTTAATTCGTCAGTGCCACACGCAGCTTCCTTGTCATTTTTGCTTGATTTTTCTGATTTCATGTTTGGTAGCGCAATTGACAATAGACTTTGTTGTTGATTGTTCAAGTTGGATGAATTGAACCAGCGGAAGAGATTATCCGGGCGGCGGGCATCCAAGGGGCTATTTGAGAGTTGAATTTTAAATTTAACAACGATTTAAAAAAGAAAAAAAGTTAAGAACAATAATTTCAATCGTATAGCAACTTCAGTCTTAGCCAGATCCTGAGTCGTAATTTTATAAAATTTACTTTGGAAACTATTATATAAAATAACCTGCAAAGTGCCTATTGGTCTTATAAGTCTGAAGGCTGAGAAATTATTCAAGGCGGCATAAGCGTCGGTGTCAATTAAATCTCTGGAAAATGCGTTTTGCTCTCAGAAAATTCATTTTAAAACGAAAATTTGAAATTTCAATTCTGGGAATTACTGCTTTTGTTTATTATGGTTTTTTACTTTTCTTTTTGCTAGGTTGAGAATATTTCTATGCGAAATATGATAATAATATGTAACTTAACGAATAATTTTATATATTTTTACTCATATTTCGACAAATCTTAGCAATAAAGGTTCACTTCAAGAACATAATAGAAAGAACGAATCATTTAACTTATAAGAATCTTCTTATTATATTTTTCACAGCTACTAGTGTTATTTGATATCATTGGAAACCCAGGACTTTTTTTTGATAATATAGATGTAGAATATTCATTAACTATCAATTGTTATCTTAGTACTTGTGCAGTCTCATTGAATCTTCCTCCAGTCAAGGTTTCATTTTCTAAAAAACAATTAGAATTCCTAATTTATTTATTTATTCGTTTCTTTTTGTTAGCCTTATTGTGTGGTTATGTACTTCTTTAATCTATGTTGGGGGGCGTTCTATAACTTCTTTGTCTTTGGTTGGAGTTATCTTACCTCTTAACTATTTTTCTTTTAATATCAGTTATTAAAGAAATTTTAAAATCTTAGATCTTCTAGTTATTGTAGATTTTCACCTTTTTCTTAGAAGATGAGATATTTACCCTTATTTGACTGGTAGCTCTGAAGAGGAAATATGAATAACTGAACATTACGAATGTCCTTGAATAAGAAATTCTATCTTTGATCTTCCAAATTTTGGAGAACGTTGCACCCGAACTACCAAATATCATTATCTGGTGTGATTGACACAAGTAGGGCACGTTTGGTAGTGTATGTCTGCATGTTGGGCCATTGAAAAGAGTGCTTGGATGCGAGATGTTGGCCTTTTGTCAATGACTGGTGGCCCATGACATGCCGTAATTTTGTTGCAAGTCCCTTACCGAAAATGAAACTAGAGAAAAGTGGAGGATGTGAGAGACAAAAATAGGAAAGATGATATATCATTGAATGCCCACGTGAGTAATGTCTGTATGTATATTTTATATAGTCTGTGTCATAATAGTGGGAAGATTCGAATCAATTTTAAGGAAATATCTTCACGTTTACAGAGTGGATTTTATAAATACTGAGATCAGAGACCTTCAGGATCTGCAAACAGATTCTTGTAGTAGCCACTGAATCTGAGACATTATTCTCCCATACTTGAGTAAAGCGCACTCCAAATGGGCTTGTTTTCTTCCCAATTAACGCCCACGTGGCTTGGGCAGTGTAGCATGCCAAGGATTTATTGAGAATTAATCTTTCCAACTCTTTTCTAGACTCTGACTTAATAGAGTAAGAATCTATTAGTCCTTGAATCTGCCATTCTTTCACCCATTTTAGGCCAAGTGAAGTTACCATTCACCATGATGGGGTCGTTGACAAAGATCAATTGATTGAATTTTCTCCTACTCTTTGTAATTCTATTAGTGAAGTCTCTCAGCCATCCATCAGACAACATTGAAGTCATCAGCCACACACCACCTTGCTTGGCAAAGACCCACTTAGTCATAAAGCCTTTTCCAATACTTCTTAAAGAAAATATCACAAACATAAACCAACCTTTAGTCTACCCCCCTAGTCAACATTGAAGTCATCAGCCACACACCACCTTGCTTGGCAAAGACCCACTTAGTCATAAAGCCTTTTCCAATACTTCTTAAAGAAAATATCACAAACATAAACCAACCTTTAGTCTACCCCCCTAGTCAACATTGAAGTCATCAGCCACACACCACCTTGCTTGGCAAAGACCCACTTAGTCATAAAGCCTTTTCCAATACTTCTTAAAGAAAATATCACAAACATAAACCAACCTTTAGTCTACCCCCCTAGTCAACATTGAAGTCATCAGCCACACACCACCTTGCTTGGCAAAGACCCACTTAGTCATAAAGCCTTTTCCAATACTTCTTAAAGAAAATATCACAAACATAAACCAACCTTTAGTCTACCCCCCTAGAGAACATTTCTCTTTGAATTAGCAAGTATCTTCTTCCCCTTCTCCACCACAGGTTCCCAAAAGGAAAGAGAATTTCTGTTATGGCAAGGAGAGTCCTAAGTAAGATGAAGGGAAAAAGCCAATCTCGCAACCCATCAGGCAATCTTGCTTAGAGTATCCTCAACAAGCAAGGAGAGAAAAGGGGAAGAGGATCATCCTGTCTCAAGCCTCTCACGACATGAATCCTCTCCTTGGGTCTACCATTAATGAGAATAGAATATATAACCGTTTTGAGTCCTGCATCTGCACCCAAAACTTTTCTTTTCAAAAAATTCCTGTTCACATGGTCATAGACCTTCTCAAAATCGATTGAACATGACTCCCACTTGACCACAACTTTGATACTTCTCGTTAACCTCGTTAGCAATGAGAGCCGAATCAAGAATTTGATTTACCTCAATAAAAGTACCTTGGGCCTTACAGATCGTAGAAGAAAGCTAGAGCTTTGGCAATGATCTAATAACACTCGTAACCAGACTAATGGGTCTGAAATCCTTAACCCTATTTACCCTTCTTCTTTAGGGATGAGGCAAACAAAGGTTTCATTCAAGGAGTTACCCAAGAGACTTCTTTCAAAAGAATCCTTAAACACCCGCTCCAAGTCCTCTTTTAAACCCTTCTAATTATCCTTAATAAAGGTCATGAAGAAAACCGTTGATATTTGCATCCTAGCTTGAGGTGGAGTGTCGTTGTGGATGATCCCTTGCTAGCTGGCTTATTCTTTAAATAGTTTTTTCCTCTCTTTTTCCAGCGCATTTGCATCTCTCTCTTTTTTTATATGTTTATTTATTTTTTATTATTTATTACTTATTATATTTTTTCTAACTTTCCTCTTATGTTTTCTTCTTCCTGGTTTTCCCCTTCCTACTGGACTGTATAATTGTATTTTTTTAACTAGTTGTTTTACCACTGTATTCATGAGCTCAATCAAATGAATAGAAAGTATTTTCCCATCCCATCTTCACTGAAGGAACTATTTATGTCTCTCGGTGAGCATTCTAAGTTAAGATGGATTGCTTCCAAAACCTAGTAGTTCTAGCTGTTTCATAGTCTGGGGTGAAGTTCTTTGTACACAATTCTCATTGCTAGGCAGAGAAGTTTTTCGTAATCCACCTTGGGTGGTTGGCAGGCCGCCCTTCCTTTCCTTTTTGCATCATTTTATTCCATCATTGAAATTTTGTTTCTTCGTCTCCTTCTTCAAGTCATGGATTGAGTATCTCATTTGGAGCAGCTCTTATCTCAACACTTGGAAATCAGGTTAGAGGTGACACTATCATGTCCTTTTGGTTGCATGGTGGTCCCTTTTACTAAAAAGTTCTTGATGGTCTCAACATTTTAGTAATAAAGAAAGAATAGTAGAATTGCTCGGTGTGAGCTATTCTTTGACTTATTAGGAAAGAGGATTTTTGAAAACAAAGATGACTTCGGTGAATTCTTTTTGTAGAAGAGGATAGTGTTCTTGGTGGTGTTCAAACCACTAAAGATTATTGTATATCTCTTGGTTGCAATTATGGCTCTTATGCTTTCTGGTCTGAAAACATAGCATAATTGTTTAAAAGGATAGAGGCAGAGAATGCTTGCTCATAAATTCCCATGTCACAATTGAAGGTCCCAGGCCTGGTGCACTGAAGAATTTTAAATGGCACTGTTGCGCAAAATTTGAATCTGAATCACATCAACTAGGGCAAAGACATACCTTCTATCAGAAGAAAGACAACATAATTCAAGTTAGAAAAGCAGCCTCTAATCAGCCTTTCGAATCTGATTCTGAAGTTTTAAGTTCCAAAAACTTTGATGGCTCTGTAAAGAGTTTCTTGGATGCTTTCTACAGGTTCTCACGGCCACACACAGTTATTGGTACAGTTACGTTTTAAAACTCATGTCCTTTTAGGCCAATAACTTATTCTTTCCTTCCATTCTTTCTGAGATATTCATCTTCAGCT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KPTVVFCRLLRVQSLGEEDESELSFASSFFKASNLHHFLFSFLEEEAASEMDSVFVRAYRSHITLATGGIGNGWMNRDVNNVSLPSPRPGALKNFKWHCCAKFESESHQLGQRHTFYQKKDNIIQVRKAASNQPFESDSEVLSSKNFDGSVKSFLDAFYRFSRPHTVIGTALSIVSVSLLAVEKLSDLSPLFLTGVLEAIVAALFMNIYIVGLNQLFDIEIDKINKPYLPLASGEYSFGTGVAIVSTFSILSFWLGWVVRSWPLFWALFVSFILGTAYSIDLPLLRWKRFAVVAAMCILAVRAVIVQLAFFLHMQTHVFQRPPVFSRSLIFATAFMSFFSVVIALFKDIPDIEGDKIFGIRSFTVRLGQERVFWGCISLLEVAYGVAVLVGVASSSPWSKLLTVLGHVILASILWIRAKSVDLKSKAAITSFYMFIWKLFYAEYLLIPFVR Homology
BLAST of Cp4.1LG07g07320 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8VWJ1 (Homogentisate phytyltransferase 1, chloroplastic OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=HPT1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 471.5 bits (1212), Expect = 1.1e-131 Identity = 245/341 (71.85%), Postives = 286/341 (83.87%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG07g07320 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: B7FA90 (Probable homogentisate phytyltransferase 1, chloroplastic OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=HPT1 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 465.3 bits (1196), Expect = 7.8e-130 Identity = 246/322 (76.40%), Postives = 279/322 (86.65%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG07g07320 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q0DAK7 (Homogentisate geranylgeranyltransferase, chloroplastic OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=HGGT PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 338.2 bits (866), Expect = 1.4e-91 Identity = 179/297 (60.27%), Postives = 224/297 (75.42%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG07g07320 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: B1B5P4 (Naringenin 8-dimethylallyltransferase 2, chloroplastic OS=Sophora flavescens OX=49840 GN=N8DT-2 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 337.8 bits (865), Expect = 1.9e-91 Identity = 188/367 (51.23%), Postives = 236/367 (64.31%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG07g07320 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q7XB14 (Homogentisate geranylgeranyltransferase OS=Hordeum vulgare OX=4513 GN=HGGT PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 336.7 bits (862), Expect = 4.2e-91 Identity = 186/341 (54.55%), Postives = 244/341 (71.55%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG07g07320 vs. NCBI nr
Match: XP_023537912.1 (homogentisate phytyltransferase 1, chloroplastic-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 775 bits (2002), Expect = 1.85e-281 Identity = 401/401 (100.00%), Postives = 401/401 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG07g07320 vs. NCBI nr
Match: XP_022969658.1 (homogentisate phytyltransferase 1, chloroplastic-like [Cucurbita maxima] >XP_022969660.1 homogentisate phytyltransferase 1, chloroplastic-like [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 766 bits (1979), Expect = 5.90e-278 Identity = 397/401 (99.00%), Postives = 398/401 (99.25%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG07g07320 vs. NCBI nr
Match: KAG6586087.1 (Homogentisate phytyltransferase 1, chloroplastic, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 764 bits (1974), Expect = 3.41e-277 Identity = 396/401 (98.75%), Postives = 397/401 (99.00%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG07g07320 vs. NCBI nr
Match: XP_022938199.1 (homogentisate phytyltransferase 1, chloroplastic-like [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 764 bits (1972), Expect = 6.88e-277 Identity = 396/401 (98.75%), Postives = 397/401 (99.00%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG07g07320 vs. NCBI nr
Match: XP_038889438.1 (homogentisate phytyltransferase 1, chloroplastic isoform X3 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 691 bits (1783), Expect = 5.46e-248 Identity = 363/408 (88.97%), Postives = 375/408 (91.91%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG07g07320 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1I0J5 (homogentisate phytyltransferase 1, chloroplastic-like OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111468615 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 766 bits (1979), Expect = 2.86e-278 Identity = 397/401 (99.00%), Postives = 398/401 (99.25%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG07g07320 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1FDD5 (homogentisate phytyltransferase 1, chloroplastic-like OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111444351 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 764 bits (1972), Expect = 3.33e-277 Identity = 396/401 (98.75%), Postives = 397/401 (99.00%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG07g07320 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0LKA3 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_2G059830 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 690 bits (1781), Expect = 5.54e-248 Identity = 364/409 (89.00%), Postives = 378/409 (92.42%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG07g07320 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BRS9 (homogentisate phytyltransferase 1, chloroplastic isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103492819 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 679 bits (1751), Expect = 2.04e-243 Identity = 357/409 (87.29%), Postives = 375/409 (91.69%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG07g07320 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1K9K8 (homogentisate phytyltransferase 1, chloroplastic-like isoform X1 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111492342 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 666 bits (1719), Expect = 1.31e-238 Identity = 357/408 (87.50%), Postives = 371/408 (90.93%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG07g07320 vs. TAIR 10
Match: AT2G18950.1 (homogentisate phytyltransferase 1 ) HSP 1 Score: 471.5 bits (1212), Expect = 7.7e-133 Identity = 245/341 (71.85%), Postives = 286/341 (83.87%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG07g07320 vs. TAIR 10
Match: AT3G11945.1 (homogentisate prenyltransferase ) HSP 1 Score: 154.8 bits (390), Expect = 1.6e-37 Identity = 122/344 (35.47%), Postives = 178/344 (51.74%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG07g07320 vs. TAIR 10
Match: AT3G11945.2 (homogentisate prenyltransferase ) HSP 1 Score: 154.1 bits (388), Expect = 2.7e-37 Identity = 118/321 (36.76%), Postives = 172/321 (53.58%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG07g07320 vs. TAIR 10
Match: AT3G51820.1 (UbiA prenyltransferase family protein ) HSP 1 Score: 48.5 bits (114), Expect = 1.6e-05 Identity = 53/209 (25.36%), Postives = 85/209 (40.67%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucurbita pepo (Zucchini) v1
Date Performed: 2021-10-25 Position : 0 Zoom : x 1
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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