Cp4.1LG06g07620 (gene) Cucurbita pepo (MU‐CU‐16) v4.1

Overview


Name	Cp4.1LG06g07620
Type	gene
Organism	Cucurbita pepo (Cucurbita pepo (MU‐CU‐16) v4.1)
Description	extensin-3-like isoform X1
Location	Cp4.1LG06: 6094169 .. 6095839 (+)
RNA-Seq Expression	Cp4.1LG06g07620
Synteny	Cp4.1LG06g07620

Sequences

The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide

Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.

ATGGGGAAATCTAGGTCTTCGATGGCCTATCTCGTGGCCACGATCTTGGTGGCGACTCTAAGTTTGCCATCGGTGTTTGCTGCTGATTATGTCTATTCGTCTCCGCCGCCTCCTTACTATTCATACAATTCACCTCCTCCTCCTGTTTATCATTCTCCTCCACCACCGAAAGTGAAGTATGAATATAAATCACCACCACCACCTCCTGTTTACTATTCTCCTCCACCGCCTGTTTATCACTCTCCACCACCTCCGGTTTACCATTCTCCTCCACCTCCCGTTTACCATTCTCCTCCACCACCTGTGTATCACTCTCCACCGCCTCCGGTTTACTATTCTCCTCCACCACCTGTTTATCACTCTCCACCGCCTCCAGTTTACTATTCTCCTCCACCACCTAAGAAGGACTATGAATACAAATCTCCACCACCACCAAAGATGGATTATGAATACAAGTCTCCACCACCTCCTAAGAAGGACTACGAGTACAAGTCTCCTCCACCACCCAAGAAGGATTACGAGTACAAGTCCCCTCCACCACCAAAGAAGGACTACGAGTACAAGTCTCCCCCACCACCGAAGAAGGATTATGAGTACAAGTCCCCTCCACCACCAAAGAAGGACTACGAGTACAAGTCTCCCCCACCACCGAAGAAGGATTATGAGTACAAGTCCCCTCCACCACCAAAGAAGGACTACGAGTACAAGTCTCCCCCACCACCGAAGAAGGATTATGAGTACAAGTCCCCTCCACCACCAAAGAAGGACTACGAGTACAAGTCTCCCCCACCACCGAAGAAGGATTATGAGTACAAGTCCCCTCCACCACCAAAGAAGGACTACGAGTACAAGTCTCCCCCACCACCGAAGAAGGATTATGAGTACAAGTCCCCTCCACCACCAAAGAAGGACTACGAGTACAAGTCTCCCCCACCACCCAAGAAGGATTATGAGTACAAGTCCCCTCCACCTCCCAAGAAGGACTATGAGTACAAGTCTCCCCCACCTCCCAAGAAGGATTACGAGTACAAGTCTCCACCACCTCCCAAGAAGGATTACGAGTACAAGTCTCCACCACCACCAAAGAAGGACTACGAGTACAAGTCCCCTCCACCACCCAAGAAGGATTACGAGTACAAGTCCCCTCCACCACCCAAGAAGGATTACGAGTACAAGTCCCCTCCACCACCGAAGAAGGGTTACGAGTACAAGTCTCCCCCACCACCCAAGAAGGATTATGAGTACAAGTCCCCTCCACCTCCCAAGAAGGACTATGAGTACAAGTCTCCCCCACCTCCCAAGAAGGATTACGAGTACAAGTCCCCTCCACCACCCAAAAAGGACTACGAGTACAAGTCTCCACCACCACCCAAGAAGGATTACGAGTATAAGTCTCCTCCACCACCCAAGAAGGATTACGAGTACAAGTCCCCTCCACCACCAAAGAAGGACTACGAGTACAAATCTCCCCCACCACCCAAGAAGGATTACGAGTACAAGTCCCCTCCACCACCCAAGAAGGACTACGAGTACAAGTCTCCTCCACCACCAAAGAAGGACTATGAATACAAATCTCCGCCACCACCCAAGAAAGACTACGAGTACAAGTCTCCACCACCTCCCAAGAACGACTACATTTATGCCTCACCACCACCTCCATACCACTACTAG

mRNA sequence

ATGGGGAAATCTAGGTCTTCGATGGCCTATCTCGTGGCCACGATCTTGGTGGCGACTCTAAGTTTGCCATCGGTGTTTGCTGCTGATTATGTCTATTCGTCTCCGCCGCCTCCTTACTATTCATACAATTCACCTCCTCCTCCTGTTTATCATTCTCCTCCACCACCGAAAGTGAAGTATGAATATAAATCACCACCACCACCTCCTGTTTACTATTCTCCTCCACCGCCTGTTTATCACTCTCCACCACCTCCGGTTTACCATTCTCCTCCACCTCCCGTTTACCATTCTCCTCCACCACCTGTGTATCACTCTCCACCGCCTCCGGTTTACTATTCTCCTCCACCACCTGTTTATCACTCTCCACCGCCTCCAGTTTACTATTCTCCTCCACCACCTAAGAAGGACTATGAATACAAATCTCCACCACCACCAAAGATGGATTATGAATACAAGTCTCCACCACCTCCTAAGAAGGACTACGAGTACAAGTCTCCTCCACCACCCAAGAAGGATTACGAGTACAAGTCCCCTCCACCACCAAAGAAGGACTACGAGTACAAGTCTCCCCCACCACCGAAGAAGGATTATGAGTACAAGTCCCCTCCACCACCAAAGAAGGACTACGAGTACAAGTCTCCCCCACCACCGAAGAAGGATTATGAGTACAAGTCCCCTCCACCACCAAAGAAGGACTACGAGTACAAGTCTCCCCCACCACCGAAGAAGGATTATGAGTACAAGTCCCCTCCACCACCAAAGAAGGACTACGAGTACAAGTCTCCCCCACCACCGAAGAAGGATTATGAGTACAAGTCCCCTCCACCACCAAAGAAGGACTACGAGTACAAGTCTCCCCCACCACCGAAGAAGGATTATGAGTACAAGTCCCCTCCACCACCAAAGAAGGACTACGAGTACAAGTCTCCCCCACCACCCAAGAAGGATTATGAGTACAAGTCCCCTCCACCTCCCAAGAAGGACTATGAGTACAAGTCTCCCCCACCTCCCAAGAAGGATTACGAGTACAAGTCTCCACCACCTCCCAAGAAGGATTACGAGTACAAGTCTCCACCACCACCAAAGAAGGACTACGAGTACAAGTCCCCTCCACCACCCAAGAAGGATTACGAGTACAAGTCCCCTCCACCACCCAAGAAGGATTACGAGTACAAGTCCCCTCCACCACCGAAGAAGGGTTACGAGTACAAGTCTCCCCCACCACCCAAGAAGGATTATGAGTACAAGTCCCCTCCACCTCCCAAGAAGGACTATGAGTACAAGTCTCCCCCACCTCCCAAGAAGGATTACGAGTACAAGTCCCCTCCACCACCCAAAAAGGACTACGAGTACAAGTCTCCACCACCACCCAAGAAGGATTACGAGTATAAGTCTCCTCCACCACCCAAGAAGGATTACGAGTACAAGTCCCCTCCACCACCAAAGAAGGACTACGAGTACAAATCTCCCCCACCACCCAAGAAGGATTACGAGTACAAGTCCCCTCCACCACCCAAGAAGGACTACGAGTACAAGTCTCCTCCACCACCAAAGAAGGACTATGAATACAAATCTCCGCCACCACCCAAGAAAGACTACGAGTACAAGTCTCCACCACCTCCCAAGAACGACTACATTTATGCCTCACCACCACCTCCATACCACTACTAG

Coding sequence (CDS)

ATGGGGAAATCTAGGTCTTCGATGGCCTATCTCGTGGCCACGATCTTGGTGGCGACTCTAAGTTTGCCATCGGTGTTTGCTGCTGATTATGTCTATTCGTCTCCGCCGCCTCCTTACTATTCATACAATTCACCTCCTCCTCCTGTTTATCATTCTCCTCCACCACCGAAAGTGAAGTATGAATATAAATCACCACCACCACCTCCTGTTTACTATTCTCCTCCACCGCCTGTTTATCACTCTCCACCACCTCCGGTTTACCATTCTCCTCCACCTCCCGTTTACCATTCTCCTCCACCACCTGTGTATCACTCTCCACCGCCTCCGGTTTACTATTCTCCTCCACCACCTGTTTATCACTCTCCACCGCCTCCAGTTTACTATTCTCCTCCACCACCTAAGAAGGACTATGAATACAAATCTCCACCACCACCAAAGATGGATTATGAATACAAGTCTCCACCACCTCCTAAGAAGGACTACGAGTACAAGTCTCCTCCACCACCCAAGAAGGATTACGAGTACAAGTCCCCTCCACCACCAAAGAAGGACTACGAGTACAAGTCTCCCCCACCACCGAAGAAGGATTATGAGTACAAGTCCCCTCCACCACCAAAGAAGGACTACGAGTACAAGTCTCCCCCACCACCGAAGAAGGATTATGAGTACAAGTCCCCTCCACCACCAAAGAAGGACTACGAGTACAAGTCTCCCCCACCACCGAAGAAGGATTATGAGTACAAGTCCCCTCCACCACCAAAGAAGGACTACGAGTACAAGTCTCCCCCACCACCGAAGAAGGATTATGAGTACAAGTCCCCTCCACCACCAAAGAAGGACTACGAGTACAAGTCTCCCCCACCACCGAAGAAGGATTATGAGTACAAGTCCCCTCCACCACCAAAGAAGGACTACGAGTACAAGTCTCCCCCACCACCCAAGAAGGATTATGAGTACAAGTCCCCTCCACCTCCCAAGAAGGACTATGAGTACAAGTCTCCCCCACCTCCCAAGAAGGATTACGAGTACAAGTCTCCACCACCTCCCAAGAAGGATTACGAGTACAAGTCTCCACCACCACCAAAGAAGGACTACGAGTACAAGTCCCCTCCACCACCCAAGAAGGATTACGAGTACAAGTCCCCTCCACCACCCAAGAAGGATTACGAGTACAAGTCCCCTCCACCACCGAAGAAGGGTTACGAGTACAAGTCTCCCCCACCACCCAAGAAGGATTATGAGTACAAGTCCCCTCCACCTCCCAAGAAGGACTATGAGTACAAGTCTCCCCCACCTCCCAAGAAGGATTACGAGTACAAGTCCCCTCCACCACCCAAAAAGGACTACGAGTACAAGTCTCCACCACCACCCAAGAAGGATTACGAGTATAAGTCTCCTCCACCACCCAAGAAGGATTACGAGTACAAGTCCCCTCCACCACCAAAGAAGGACTACGAGTACAAATCTCCCCCACCACCCAAGAAGGATTACGAGTACAAGTCCCCTCCACCACCCAAGAAGGACTACGAGTACAAGTCTCCTCCACCACCAAAGAAGGACTATGAATACAAATCTCCGCCACCACCCAAGAAAGACTACGAGTACAAGTCTCCACCACCTCCCAAGAACGACTACATTTATGCCTCACCACCACCTCCATACCACTACTAG

Protein sequence

MGKSRSSMAYLVATILVATLSLPSVFAADYVYSSPPPPYYSYNSPPPPVYHSPPPPKVKYEYKSPPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPKKDYEYKSPPPPKMDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKGYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKNDYIYASPPPPYHY

Homology

[Close]

BLAST of Cp4.1LG06g07620 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9FS16 (Extensin-3 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=EXT3 PE=1 SV=3)

HSP 1 Score: 371.7 bits (953), Expect = 1.4e-101
Identity = 297/471 (63.06%), Postives = 304/471 (64.54%), Query Frame = 0


Query: 6   SSMAYLVATILVATLSLP--SVFAADYVYSSPPPPYYSYNSP-----PPPVYHSPPPPKV 65
           S MA LVAT+LV T+SL   S   A+Y YSSPPPP   Y  P     PPPVYHSPPPPK 
Sbjct: 3   SPMASLVATLLVLTISLTFVSQSTANYFYSSPPPPVKHYTPPVKHYSPPPVYHSPPPPKK 62

Query: 66  KYEYKSPPPPPVYYSPPPPVYHSPPPP----VYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPP----V 125
            YEYKSPPPP  +YS PPPVYHSPPPP    VY SPPPPV H  PPPVYHSPPPP    V
Sbjct: 63  HYEYKSPPPPVKHYS-PPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYV 122

Query: 126 YYSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPKKDYEYKSPPPPKMDYE----YKSPPPPKKDYEYKSP 185
           Y SPPPPV H  PPPVY+SPPPPKK Y YKSPPPP   Y     Y SPPPPKK Y YKSP
Sbjct: 123 YKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYVYKSP 182

Query: 186 PPPKKDYE----YKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYE----YKSPPPPKKDYEYKSPPPPK 245
           PPP K Y     Y SPPPPKK Y YKSPPPP K Y     Y SPPPPKK Y YKSPPPP 
Sbjct: 183 PPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPV 242

Query: 246 KDYE----YKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSP 305
           K Y     Y SPPPPKK Y YKSPPPP K Y   SPPP      Y SPPPPKK Y YKSP
Sbjct: 243 KHYSPPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHY---SPPP-----VYHSPPPPKKHYVYKSP 302

Query: 306 PPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSP 365
           PPP K Y   SPPP      Y SPPPPKK Y YKSPPPP K Y   SPPP      Y SP
Sbjct: 303 PPPVKHY---SPPP-----VYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHY---SPPP-----VYHSP 362

Query: 366 PPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSP 425
           PPPKK Y YKSPPPP K Y   SPPP      Y SPPPPKK Y YKSPPPP K Y   SP
Sbjct: 363 PPPKKHYVYKSPPPPVKHY---SPPP-----VYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHY---SP 422

Query: 426 PPPKKGYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPP 446
           PP      Y SPPPPK+ Y YKSPPPP   +      PP   Y YKSPPPP
Sbjct: 423 PP-----VYHSPPPPKEKYVYKSPPPPPVHHY----SPPHHPYLYKSPPPP 428

[Close]

BLAST of Cp4.1LG06g07620 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9M1G9 (Extensin-2 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=EXT2 PE=2 SV=1)

HSP 1 Score: 310.1 bits (793), Expect = 5.2e-83
Identity = 324/615 (52.68%), Postives = 337/615 (54.80%), Query Frame = 0


Query: 30  YVYSSPPPPYYS------YNSPPPP-VYHSPPP----PKVKYEYKSPPPPPVYYSPPPPV 89
           YVYSSPPPP YS      Y SPPPP VY SPPP    P  K +YKSPPPP VY SPPPP 
Sbjct: 75  YVYSSPPPPTYSPSPKVDYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVDYKSPPPPYVYNSPPPPY 134

Query: 90  --------YHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPV-YHSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPV-YY 149
                   Y SPPPP  +S PPP Y+SP P V Y SPPPP  YS PPP Y+SP P V Y 
Sbjct: 135 YSPSPKVDYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVEYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVDYK 194

Query: 150 SPPPPKKDYEYKSPPP----PKMDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP----PKKDYEYKSPPP 209
           SPPPP   Y Y SPPP    P    EYKSPPPP   Y Y SPPP    P    +YKSPPP
Sbjct: 195 SPPPP---YVYSSPPPPYYSPSPKVEYKSPPPP---YVYSSPPPPYYSPSPKVDYKSPPP 254

Query: 210 PKKDYEYKSPPP----PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP----PKKDYEYKSPPPPKKD 269
           P   Y Y SPPP    P    +YKSPPPP   Y Y SPPP    P    +YKSPPPP   
Sbjct: 255 P---YVYSSPPPPYYSPSPKVDYKSPPPP---YVYSSPPPPYYSPSPKVDYKSPPPP--- 314

Query: 270 YEYKSPPP----PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP----PKKDYEYKSPPPPKKDYEYK 329
           Y Y SPPP    P    +YKSPPPP   Y Y SPPP    P    +YKSPPPP   Y Y 
Sbjct: 315 YVYSSPPPPYYSPSPKVDYKSPPPP---YVYSSPPPPYYSPSPKVDYKSPPPP---YVYS 374

Query: 330 SPPP----PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP----PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP 389
           SPPP    P    +YKSPPPP   Y Y SPPP    P    EYKSPPPP   Y Y SPPP
Sbjct: 375 SPPPPTYSPSPKVDYKSPPPP---YVYSSPPPPYYSPSPKVEYKSPPPP---YVYSSPPP 434

Query: 390 ----PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP----PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP---- 449
               P     YKSPPPP   Y Y SPPP    P     YKSPPPP   Y Y SPPP    
Sbjct: 435 PTYSPSPKVYYKSPPPP---YVYSSPPPPYYSPSPKVYYKSPPPP---YVYSSPPPPYYS 494

Query: 450 PKKDYEYKSPPPPKKGYEYKSPPP----PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP----PKKD 509
           P     YKSPPPP   Y Y SPPP    P     YKSPPPP   Y Y SPPP    P   
Sbjct: 495 PSPKVYYKSPPPP---YVYSSPPPPYYSPSPKVYYKSPPPP---YVYSSPPPPYYSPSPK 554

Query: 510 YEYKSPPPPKKDYEYKSPPP----PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP----PKKDYEYK 556
             YKSPPPP   Y Y SPPP    P     YKSPPPP   Y Y SPPP    P     YK
Sbjct: 555 VYYKSPPPP---YVYSSPPPPYYSPSPKVHYKSPPPP---YVYSSPPPPYYSPSPKVHYK 614

[Close]

BLAST of Cp4.1LG06g07620 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q38913 (Extensin-1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=EXT1 PE=2 SV=2)

HSP 1 Score: 226.5 bits (576), Expect = 7.5e-58
Identity = 234/434 (53.92%), Postives = 246/434 (56.68%), Query Frame = 0


Query: 15  ILVATLSLPSVFAADYVYSSPPPPYYSYNSPPPPVYHSPPPPKVKYEYKSPPPPPVYYSP 74
           +L  +L+  S   A+Y YSSPPPP   Y+  PPPVY SPPPP   Y      PPPVY SP
Sbjct: 6   VLAFSLAFVSQTTANYFYSSPPPPVKHYS--PPPVYKSPPPPVKHYS-----PPPVYKSP 65

Query: 75  PPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPK 134
           PPPV H  PPPVY SPPPPV +  PPPVY SPPPPVY SPPPPV H  PPPVY SPPPP 
Sbjct: 66  PPPVKHYSPPPVYKSPPPPVKYYSPPPVYKSPPPPVYKSPPPPVKHYSPPPVYKSPPPPV 125

Query: 135 KDYEYKSPPPPKMDYEYKSPPPPKKDYE----YKSPPPPKKDYE----YKSPPPPKKDYE 194
           K Y   SPPP      YKSPPPP K Y     YKSPPPP K Y     YKSPPPP K Y 
Sbjct: 126 KHY---SPPP-----VYKSPPPPVKHYSPPPVYKSPPPPVKHYSPPPVYKSPPPPVKYYS 185

Query: 195 ----YKSPPPPKKDYE----YKSPPPPKKDYE----YKSPPPPKKDYE----YKSPPPPK 254
               YKSPPPP K Y     YKSPPPP K Y     YKSPPPP K Y     YKSPPPP 
Sbjct: 186 PPPVYKSPPPPVKHYSPPPVYKSPPPPVKYYSPPPVYKSPPPPVKHYSPPPVYKSPPPPV 245

Query: 255 KDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPK 314
           K   Y SPPP      YKSPPPP     + SPPP      Y SPPPP     + SPPP  
Sbjct: 246 K---YYSPPP-----VYKSPPPP----VHYSPPP----VVYHSPPPP----VHYSPPP-- 305

Query: 315 KDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPK 374
               Y SPPPP     + SPPP      Y SPPPP     + SPPP      Y SPPPP 
Sbjct: 306 --VVYHSPPPP----VHYSPPP----VVYHSPPPP----VHYSPPP----VVYHSPPPP- 365

Query: 375 KDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPP---KKDYEYKSPPPPKKGYEYKSPP 422
               + SPPP      Y SPPPPKK YEYKSPPPP        Y SPPPP   Y      
Sbjct: 366 ---VHYSPPP----VVYHSPPPPKKHYEYKSPPPPVHYSPPTVYHSPPPPVHHYS----- 371

[Close]

BLAST of Cp4.1LG06g07620 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P06599 (Extensin OS=Daucus carota OX=4039 PE=2 SV=1)

HSP 1 Score: 195.3 bits (495), Expect = 1.9e-48
Identity = 188/370 (50.81%), Postives = 213/370 (57.57%), Query Frame = 0


Query: 6   SSMAYLVATILV--ATLSLPSVFAADYVYSSPPPPYYSYNSPPPPVYHSPPPPKVKYEYK 65
           S M+ L+ ++LV   +L+L S   A Y YSSPPPP +S    PPP  HSPPPP   Y Y+
Sbjct: 8   SKMSSLIVSLLVVLVSLNLASETTAKYTYSSPPPPEHS----PPPPEHSPPPP---YHYE 67

Query: 66  SPPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPVYHSPP 125
           SPPPP           HSPPPP       PVY       Y SPPPP+ +SPPPP +   P
Sbjct: 68  SPPPPK----------HSPPPPT------PVYK------YKSPPPPM-HSPPPPYHFESP 127

Query: 126 PPVYYSPPPPKKDYEYKSPPPPKMDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKK 185
           PP  +SPPPP   Y+YKSPPPP      K  P P   Y+YKSPPPP   Y+YKSPPPPK 
Sbjct: 128 PPPKHSPPPPTPVYKYKSPPPP------KHSPAPVHHYKYKSPPPPTPVYKYKSPPPPKH 187

Query: 186 DYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKK 245
                  P P+  Y+YKSPPPPK    +   P     Y+YKSPPPP   Y+YKSPPPP  
Sbjct: 188 S------PAPEHHYKYKSPPPPK----HFPAPEHHYKYKYKSPPPPTPVYKYKSPPPPTP 247

Query: 246 DYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKK 305
            Y+YKSPPPPK        P P   Y+YKSPPPP     YKSPPPP+      SPPPP  
Sbjct: 248 VYKYKSPPPPKHS------PAPVHHYKYKSPPPPTP--VYKSPPPPE-----HSPPPPTP 303

Query: 306 DYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKK 365
            Y+YKSPPPP       SPPPP   Y+YKSPPPP       SPPPP       SPPPPK 
Sbjct: 308 VYKYKSPPPP-----MHSPPPPTPVYKYKSPPPP-----MHSPPPP-----VYSPPPPKH 303

Query: 366 DYEYKSPPPP 374
            Y Y SPPPP
Sbjct: 368 HYSYTSPPPP 303

[Close]

BLAST of Cp4.1LG06g07620 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9T0K5 (Leucine-rich repeat extensin-like protein 3 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=LRX3 PE=1 SV=1)

HSP 1 Score: 139.8 bits (351), Expect = 9.3e-32
Identity = 215/455 (47.25%), Postives = 228/455 (50.11%), Query Frame = 0


Query: 21  SLPS------VFAADYVYSSPPPPYYSYNSPPPPVYHSPPPPKVKYEYKSPPPPPVYYSP 80
           SLPS      +F+     +SPPPP     SPPPPVY  PPPP        PPPPPV YSP
Sbjct: 406 SLPSPPPPAPIFSTPPTLTSPPPP-----SPPPPVYSPPPPP--------PPPPPV-YSP 465

Query: 81  PPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPK 140
           PPP    PPPP    PPPPVY  PPPP    PPPPV YSPPPP    PPPPV YSPPPP 
Sbjct: 466 PPP----PPPP----PPPPVYSPPPPPPPPPPPPPV-YSPPPPSPPPPPPPV-YSPPPP- 525

Query: 141 KDYEYKSPPPPKMDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPK 200
                  PPPP        PPPP     Y  PPPP     Y SPPPP         P P 
Sbjct: 526 -------PPPP--------PPPP----VYSPPPPP----VYSSPPPPPS-------PAPT 585

Query: 201 KDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPK 260
             Y  + PPPP       SPPPP+      SPPPP + Y Y SPPPP       SPPPP 
Sbjct: 586 PVYCTRPPPPPP-----HSPPPPQ-----FSPPPP-EPYYYSSPPPPHSSPPPHSPPPP- 645

Query: 261 KDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPK 320
                 SPPPP   Y Y SPPPP       S PPP   Y   SPPPP    E   PPPP 
Sbjct: 646 -----HSPPPP--IYPYLSPPPPPTPV---SSPPPTPVY---SPPPPPPCIE---PPPPP 705

Query: 321 KDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPK 380
              EY SPPPP     Y SPPPP     Y SPPPP   Y    PPPP     Y SPPPP 
Sbjct: 706 PCIEY-SPPPPPPVVHYSSPPPP--PVYYSSPPPPPVYYSSPPPPPP---VHYSSPPPP- 757

Query: 381 KDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKGYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPK 440
            +  Y SPPP      Y SPPPP      +SPPP      + SPPPP     + SPPPP 
Sbjct: 766 -EVHYHSPPP--SPVHYSSPPPPPSAPCEESPPP--APVVHHSPPPP---MVHHSPPPP- 757

Query: 441 KDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPP 470
               ++SPPPP  +YE   P PP     Y SPPPP
Sbjct: 826 --VIHQSPPPPSPEYE--GPLPPVIGVSYASPPPP 757

[Close]

BLAST of Cp4.1LG06g07620 vs. NCBI nr
Match: XP_023535223.1 (extensin-3-like [Cucurbita pepo subsp. pepo])

HSP 1 Score: 1047 bits (2708), Expect = 0.0
Identity = 556/556 (100.00%), Postives = 556/556 (100.00%), Query Frame = 0


Query: 1   MGKSRSSMAYLVATILVATLSLPSVFAADYVYSSPPPPYYSYNSPPPPVYHSPPPPKVKY 60
           MGKSRSSMAYLVATILVATLSLPSVFAADYVYSSPPPPYYSYNSPPPPVYHSPPPPKVKY
Sbjct: 1   MGKSRSSMAYLVATILVATLSLPSVFAADYVYSSPPPPYYSYNSPPPPVYHSPPPPKVKY 60

Query: 61  EYKSPPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPVYH 120
           EYKSPPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPVYH
Sbjct: 61  EYKSPPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPVYH 120

Query: 121 SPPPPVYYSPPPPKKDYEYKSPPPPKMDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP 180
           SPPPPVYYSPPPPKKDYEYKSPPPPKMDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP
Sbjct: 121 SPPPPVYYSPPPPKKDYEYKSPPPPKMDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP 180

Query: 181 PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP 240
           PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP
Sbjct: 181 PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP 240

Query: 241 PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP 300
           PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP
Sbjct: 241 PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP 300

Query: 301 PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP 360
           PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP
Sbjct: 301 PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP 360

Query: 361 PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKGYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP 420
           PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKGYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP
Sbjct: 361 PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKGYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP 420

Query: 421 PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP 480
           PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP
Sbjct: 421 PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP 480

Query: 481 PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP 540
           PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP
Sbjct: 481 PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP 540

Query: 541 PKNDYIYASPPPPYHY 556
           PKNDYIYASPPPPYHY
Sbjct: 541 PKNDYIYASPPPPYHY 556

[Close]

BLAST of Cp4.1LG06g07620 vs. NCBI nr
Match: XP_022936362.1 (extensin-3-like isoform X1 [Cucurbita moschata])

HSP 1 Score: 994 bits (2569), Expect = 0.0
Identity = 536/553 (96.93%), Postives = 538/553 (97.29%), Query Frame = 0


Query: 1   MGKSRSSMAYLVATILVATLSLPSVFAADYVYSSPPPPYYSYNSPPPPVYHSPPPPKVKY 60
           MGKSRSSMAYLVATILVATLS+PSVFAADYVYSSPPPPYYSYNSPPPP        KVKY
Sbjct: 1   MGKSRSSMAYLVATILVATLSMPSVFAADYVYSSPPPPYYSYNSPPPP--------KVKY 60

Query: 61  EYKSPPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPVYH 120
           EYKSP PPPVYYSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVY SPPPPVYYSPPPPVYH
Sbjct: 61  EYKSP-PPPVYYSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYQSPPPPVYYSPPPPVYH 120

Query: 121 SPPPPVYYSPPPPKKDYEYKSPPPPKMDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP 180
           SPPPPVYYSPPPPKKDYEYKSPPPPKMDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP
Sbjct: 121 SPPPPVYYSPPPPKKDYEYKSPPPPKMDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP 180

Query: 181 PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP 240
           PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP
Sbjct: 181 PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP 240

Query: 241 PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP 300
           PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP
Sbjct: 241 PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP 300

Query: 301 PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP 360
           PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP
Sbjct: 301 PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP 360

Query: 361 PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKGYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP 420
           PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKK YEYKSPPPPKKDYEYKSPPP
Sbjct: 361 PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP 420

Query: 421 PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP 480
           PKKDYEYKSPPPPKK YEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP
Sbjct: 421 PKKDYEYKSPPPPKKGYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP 480

Query: 481 PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP 540
           PKKDY+YKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP
Sbjct: 481 PKKDYKYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP 540

Query: 541 PKNDYIYASPPPP 553
           PK DY Y SPPPP
Sbjct: 541 PKKDYEYKSPPPP 544

[Close]

BLAST of Cp4.1LG06g07620 vs. NCBI nr
Match: XP_022976064.1 (extensin-3-like isoform X1 [Cucurbita maxima])

HSP 1 Score: 988 bits (2553), Expect = 0.0
Identity = 531/553 (96.02%), Postives = 535/553 (96.75%), Query Frame = 0


Query: 1   MGKSRSSMAYLVATILVATLSLPSVFAADYVYSSPPPPYYSYNSPPPPVYHSPPPPKVKY 60
           MGKSRSSMAYL+AT+LVATLSLPSVFA DYVYSSPPPPYY+YNSP PPVYHSPPPPKVKY
Sbjct: 1   MGKSRSSMAYLLATVLVATLSLPSVFAVDYVYSSPPPPYYAYNSPSPPVYHSPPPPKVKY 60

Query: 61  EYKSPPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPVYH 120
           EY SP PPPVYYSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYH        SPPPPVYH
Sbjct: 61  EYMSP-PPPVYYSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYH--------SPPPPVYH 120

Query: 121 SPPPPVYYSPPPPKKDYEYKSPPPPKMDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP 180
           SPPPPVYYSPPPPKKDYEYKSPPPPKMDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP
Sbjct: 121 SPPPPVYYSPPPPKKDYEYKSPPPPKMDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP 180

Query: 181 PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP 240
           PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP
Sbjct: 181 PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP 240

Query: 241 PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP 300
           PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP
Sbjct: 241 PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP 300

Query: 301 PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP 360
           PKKDYEYKSP PPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDY+YKSPPPPKKDYEYKSPPP
Sbjct: 301 PKKDYEYKSPSPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYKYKSPPPPKKDYEYKSPPP 360

Query: 361 PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKGYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP 420
           PKK YEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKK YEYKSPPPPKKDYEYKSPPP
Sbjct: 361 PKKGYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP 420

Query: 421 PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP 480
           PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP
Sbjct: 421 PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP 480

Query: 481 PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP 540
           PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP
Sbjct: 481 PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP 540

Query: 541 PKNDYIYASPPPP 553
           PK DY Y SPPPP
Sbjct: 541 PKKDYEYKSPPPP 544

[Close]

BLAST of Cp4.1LG06g07620 vs. NCBI nr
Match: KAG6592186.1 (Extensin-3, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia])

HSP 1 Score: 985 bits (2546), Expect = 0.0
Identity = 533/553 (96.38%), Postives = 535/553 (96.75%), Query Frame = 0


Query: 1   MGKSRSSMAYLVATILVATLSLPSVFAADYVYSSPPPPYYSYNSPPPPVYHSPPPPKVKY 60
           MGKSRSSMAYLVATILVATLSLP VFAADYVYSSPPPPYYSYNSPPPP        KVKY
Sbjct: 1   MGKSRSSMAYLVATILVATLSLPLVFAADYVYSSPPPPYYSYNSPPPP--------KVKY 60

Query: 61  EYKSPPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPVYH 120
           EYKSP PPPVYYSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVY SPPPPVYYSPPPPVYH
Sbjct: 61  EYKSP-PPPVYYSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYQSPPPPVYYSPPPPVYH 120

Query: 121 SPPPPVYYSPPPPKKDYEYKSPPPPKMDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP 180
           SPPP VYYSPPPPKKDYEYKSPPPPKMDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP
Sbjct: 121 SPPPQVYYSPPPPKKDYEYKSPPPPKMDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP 180

Query: 181 PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP 240
           PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP
Sbjct: 181 PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP 240

Query: 241 PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP 300
           PKKDYEYKSPPPPKKDY+YKSPPPPKKDYEYKSPPPPKK YEYKSPPPPKKDYEYKSPPP
Sbjct: 241 PKKDYEYKSPPPPKKDYKYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKGYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP 300

Query: 301 PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP 360
           PKK YEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP
Sbjct: 301 PKKGYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP 360

Query: 361 PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKGYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP 420
           PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKGYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP
Sbjct: 361 PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKGYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP 420

Query: 421 PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP 480
           PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKK YEYKSPPPPKKDYEYKSPPP
Sbjct: 421 PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKGYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP 480

Query: 481 PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP 540
           PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDY+YKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP
Sbjct: 481 PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYKYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP 540

Query: 541 PKNDYIYASPPPP 553
           PK DY Y SPPPP
Sbjct: 541 PKKDYEYKSPPPP 544

[Close]

BLAST of Cp4.1LG06g07620 vs. NCBI nr
Match: XP_022976065.1 (extensin-3-like isoform X2 [Cucurbita maxima])

HSP 1 Score: 968 bits (2502), Expect = 0.0
Identity = 531/565 (93.98%), Postives = 536/565 (94.87%), Query Frame = 0


Query: 1   MGKSRSSMAYLVATILVATLSLPSVFAADYVYSSPPPPYYSYNSPPPPVYHSPPPPKVKY 60
           MGKSRSSMAYL+AT+LVATLSLPSVFA DYVYSSPPPPYY+YNSP PPVYHSPPPPKVKY
Sbjct: 1   MGKSRSSMAYLLATVLVATLSLPSVFAVDYVYSSPPPPYYAYNSPSPPVYHSPPPPKVKY 60

Query: 61  EYKSPPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPV----YYSPPP 120
           EY SP PPPVYYSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVY+SPPPP     Y SPPP
Sbjct: 61  EYMSP-PPPVYYSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPKKDYEYKSPPP 120

Query: 121 PV----YHSPPPPV----YYSPPPPKKDYEYKSPPPPKMDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP 180
           P     Y SPPPP     Y SPPPPKKDYEYKSPPPPK DYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP
Sbjct: 121 PKMDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP 180

Query: 181 PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP 240
           PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP
Sbjct: 181 PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP 240

Query: 241 PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP 300
           PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSP PPKKDYEYKSPPP
Sbjct: 241 PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPSPPKKDYEYKSPPP 300

Query: 301 PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP 360
           PKKDYEYKSPPPPKKDY+YKSPPPPKKDYEYKSPPPPKK YEYKSPPPPKKDYEYKSPPP
Sbjct: 301 PKKDYEYKSPPPPKKDYKYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKGYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP 360

Query: 361 PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKGYEYKSPPP 420
           PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKK YEYKSPPP
Sbjct: 361 PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP 420

Query: 421 PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP 480
           PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP
Sbjct: 421 PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP 480

Query: 481 PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP 540
           PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP
Sbjct: 481 PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP 540

Query: 541 PKKDYEYKSPPPPKNDYIYASPPPP 553
           PKKDYEYKSPPPPK DY Y SPPPP
Sbjct: 541 PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPP 564

[Close]

BLAST of Cp4.1LG06g07620 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1F886 (extensin-3-like isoform X1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111443006 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 994 bits (2569), Expect = 0.0
Identity = 536/553 (96.93%), Postives = 538/553 (97.29%), Query Frame = 0


Query: 1   MGKSRSSMAYLVATILVATLSLPSVFAADYVYSSPPPPYYSYNSPPPPVYHSPPPPKVKY 60
           MGKSRSSMAYLVATILVATLS+PSVFAADYVYSSPPPPYYSYNSPPPP        KVKY
Sbjct: 1   MGKSRSSMAYLVATILVATLSMPSVFAADYVYSSPPPPYYSYNSPPPP--------KVKY 60

Query: 61  EYKSPPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPVYH 120
           EYKSP PPPVYYSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVY SPPPPVYYSPPPPVYH
Sbjct: 61  EYKSP-PPPVYYSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYQSPPPPVYYSPPPPVYH 120

Query: 121 SPPPPVYYSPPPPKKDYEYKSPPPPKMDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP 180
           SPPPPVYYSPPPPKKDYEYKSPPPPKMDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP
Sbjct: 121 SPPPPVYYSPPPPKKDYEYKSPPPPKMDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP 180

Query: 181 PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP 240
           PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP
Sbjct: 181 PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP 240

Query: 241 PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP 300
           PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP
Sbjct: 241 PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP 300

Query: 301 PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP 360
           PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP
Sbjct: 301 PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP 360

Query: 361 PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKGYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP 420
           PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKK YEYKSPPPPKKDYEYKSPPP
Sbjct: 361 PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP 420

Query: 421 PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP 480
           PKKDYEYKSPPPPKK YEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP
Sbjct: 421 PKKDYEYKSPPPPKKGYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP 480

Query: 481 PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP 540
           PKKDY+YKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP
Sbjct: 481 PKKDYKYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP 540

Query: 541 PKNDYIYASPPPP 553
           PK DY Y SPPPP
Sbjct: 541 PKKDYEYKSPPPP 544

[Close]

BLAST of Cp4.1LG06g07620 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1IMG6 (extensin-3-like isoform X1 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111476579 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 988 bits (2553), Expect = 0.0
Identity = 531/553 (96.02%), Postives = 535/553 (96.75%), Query Frame = 0


Query: 1   MGKSRSSMAYLVATILVATLSLPSVFAADYVYSSPPPPYYSYNSPPPPVYHSPPPPKVKY 60
           MGKSRSSMAYL+AT+LVATLSLPSVFA DYVYSSPPPPYY+YNSP PPVYHSPPPPKVKY
Sbjct: 1   MGKSRSSMAYLLATVLVATLSLPSVFAVDYVYSSPPPPYYAYNSPSPPVYHSPPPPKVKY 60

Query: 61  EYKSPPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPVYH 120
           EY SP PPPVYYSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYH        SPPPPVYH
Sbjct: 61  EYMSP-PPPVYYSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYH--------SPPPPVYH 120

Query: 121 SPPPPVYYSPPPPKKDYEYKSPPPPKMDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP 180
           SPPPPVYYSPPPPKKDYEYKSPPPPKMDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP
Sbjct: 121 SPPPPVYYSPPPPKKDYEYKSPPPPKMDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP 180

Query: 181 PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP 240
           PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP
Sbjct: 181 PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP 240

Query: 241 PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP 300
           PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP
Sbjct: 241 PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP 300

Query: 301 PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP 360
           PKKDYEYKSP PPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDY+YKSPPPPKKDYEYKSPPP
Sbjct: 301 PKKDYEYKSPSPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYKYKSPPPPKKDYEYKSPPP 360

Query: 361 PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKGYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP 420
           PKK YEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKK YEYKSPPPPKKDYEYKSPPP
Sbjct: 361 PKKGYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP 420

Query: 421 PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP 480
           PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP
Sbjct: 421 PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP 480

Query: 481 PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP 540
           PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP
Sbjct: 481 PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP 540

Query: 541 PKNDYIYASPPPP 553
           PK DY Y SPPPP
Sbjct: 541 PKKDYEYKSPPPP 544

[Close]

BLAST of Cp4.1LG06g07620 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1IIH0 (extensin-3-like isoform X2 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111476579 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 968 bits (2502), Expect = 0.0
Identity = 531/565 (93.98%), Postives = 536/565 (94.87%), Query Frame = 0


Query: 1   MGKSRSSMAYLVATILVATLSLPSVFAADYVYSSPPPPYYSYNSPPPPVYHSPPPPKVKY 60
           MGKSRSSMAYL+AT+LVATLSLPSVFA DYVYSSPPPPYY+YNSP PPVYHSPPPPKVKY
Sbjct: 1   MGKSRSSMAYLLATVLVATLSLPSVFAVDYVYSSPPPPYYAYNSPSPPVYHSPPPPKVKY 60

Query: 61  EYKSPPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPV----YYSPPP 120
           EY SP PPPVYYSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVY+SPPPP     Y SPPP
Sbjct: 61  EYMSP-PPPVYYSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPKKDYEYKSPPP 120

Query: 121 PV----YHSPPPPV----YYSPPPPKKDYEYKSPPPPKMDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP 180
           P     Y SPPPP     Y SPPPPKKDYEYKSPPPPK DYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP
Sbjct: 121 PKMDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP 180

Query: 181 PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP 240
           PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP
Sbjct: 181 PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP 240

Query: 241 PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP 300
           PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSP PPKKDYEYKSPPP
Sbjct: 241 PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPSPPKKDYEYKSPPP 300

Query: 301 PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP 360
           PKKDYEYKSPPPPKKDY+YKSPPPPKKDYEYKSPPPPKK YEYKSPPPPKKDYEYKSPPP
Sbjct: 301 PKKDYEYKSPPPPKKDYKYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKGYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP 360

Query: 361 PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKGYEYKSPPP 420
           PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKK YEYKSPPP
Sbjct: 361 PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP 420

Query: 421 PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP 480
           PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP
Sbjct: 421 PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP 480

Query: 481 PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP 540
           PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP
Sbjct: 481 PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP 540

Query: 541 PKKDYEYKSPPPPKNDYIYASPPPP 553
           PKKDYEYKSPPPPK DY Y SPPPP
Sbjct: 541 PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPP 564

[Close]

BLAST of Cp4.1LG06g07620 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1FD20 (extensin-3-like isoform X2 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111443006 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 922 bits (2383), Expect = 0.0
Identity = 520/586 (88.74%), Postives = 524/586 (89.42%), Query Frame = 0


Query: 1   MGKSRSSMAYLVATILVATLSLPSVFAADYVYSSPPPPYYSYNSP----------PPPVY 60
           MGKSRSSMAYLVATILVATLS+PSVFAADYVYSSPPPPYYSYNSP          PPPVY
Sbjct: 1   MGKSRSSMAYLVATILVATLSMPSVFAADYVYSSPPPPYYSYNSPSPPPPVYHSPPPPVY 60

Query: 61  HSPPPPKVKYEYKSPPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPV----YHSPPPPV---- 120
           +SPPPPK  YEYKSPPPP + Y              Y SPPPP     Y SPPPP     
Sbjct: 61  YSPPPPKKDYEYKSPPPPKMDYE-------------YKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYE 120

Query: 121 YHSPPPPV----YYSPPPPV----YHSPPPPV----YYSPPPPKKDYEYKSPPPPKMDYE 180
           Y SPPPP     Y SPPPP     Y SPPPP     Y SPPPPKKDYEYKSPPPPK DYE
Sbjct: 121 YKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYE 180

Query: 181 YKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYE 240
           YKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYE
Sbjct: 181 YKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYE 240

Query: 241 YKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYE 300
           YKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYE
Sbjct: 241 YKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYE 300

Query: 301 YKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYE 360
           YKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYE
Sbjct: 301 YKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYE 360

Query: 361 YKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYE 420
           YKSPPPPKKDYEYKSPPPPKK YEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYE
Sbjct: 361 YKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKGYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYE 420

Query: 421 YKSPPPPKKGYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYE 480
           YKSPPPPKK Y+YKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYE
Sbjct: 421 YKSPPPPKKDYKYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYE 480

Query: 481 YKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYE 540
           YKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYE
Sbjct: 481 YKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYE 540

Query: 541 YKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKNDYIYASPPPPYHY 556
           YKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKNDYIYASPPPPYHY
Sbjct: 541 YKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKNDYIYASPPPPYHY 573

[Close]

BLAST of Cp4.1LG06g07620 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1CRA7 (extensin-1 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111013522 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 534 bits (1375), Expect = 7.40e-185
Identity = 337/422 (79.86%), Postives = 345/422 (81.75%), Query Frame = 0


Query: 1   MGKSRSSMAYLVATILVATLSLPSVFAADYVYSSPPPPYYSYNSPPPPVYHSPPPPKVKY 60
           MGK RSSMAYLVA ILVATLSLPSV A DYVYSSPPPPYY+YNSPPP +Y+SPPP     
Sbjct: 1   MGKPRSSMAYLVAAILVATLSLPSVMATDYVYSSPPPPYYAYNSPPPHIYYSPPP----- 60

Query: 61  EYKSPPPPPVYYSPPPPVYH--SPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYY--SPPP 120
            Y SP PPP YYSPPPP Y   SPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVY+SPPP  Y   SPPP
Sbjct: 61  VYHSP-PPPAYYSPPPPKYEYKSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPAKYEYKSPPP 120

Query: 121 PVYHSPPPPVYYSPPPPKKDYEYKSPPPPKMDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYK 180
           PVY+SPPPPVYYSPPPP     YKSPPPPK DYEYKSPPPP     Y SPPPP     Y 
Sbjct: 121 PVYYSPPPPVYYSPPPPV----YKSPPPPKKDYEYKSPPPPV----YHSPPPPV----YY 180

Query: 181 SPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYK 240
           SPPPP     Y SPPPP     Y SPPPP     YKSPPPPK DYEYKSPPPPKKDYEYK
Sbjct: 181 SPPPPV----YYSPPPPM----YHSPPPPV----YKSPPPPKNDYEYKSPPPPKKDYEYK 240

Query: 241 SPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYK 300
           SPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPP PKK YEYKSPPPPKKDYEYK
Sbjct: 241 SPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPLPKKVYEYKSPPPPKKDYEYK 300

Query: 301 SPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYK 360
           SPPPPKKDYEYKSPPPPK DYEYKSPPPPK DYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPP KDY+YK
Sbjct: 301 SPPPPKKDYEYKSPPPPK-DYEYKSPPPPKNDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPMKDYDYK 360

Query: 361 SPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKG-----YEYKSPPPPKK 413
           SPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPK +Y+YKSPPPP K      Y Y SPPPP  
Sbjct: 361 SPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPK-EYKYKSPPPPVKMPSPPYYIYASPPPPPY 390

[Close]

BLAST of Cp4.1LG06g07620 vs. TAIR 10
Match: AT1G21310.1 (extensin 3 )

HSP 1 Score: 371.7 bits (953), Expect = 1.0e-102
Identity = 297/471 (63.06%), Postives = 304/471 (64.54%), Query Frame = 0


Query: 6   SSMAYLVATILVATLSLP--SVFAADYVYSSPPPPYYSYNSP-----PPPVYHSPPPPKV 65
           S MA LVAT+LV T+SL   S   A+Y YSSPPPP   Y  P     PPPVYHSPPPPK 
Sbjct: 3   SPMASLVATLLVLTISLTFVSQSTANYFYSSPPPPVKHYTPPVKHYSPPPVYHSPPPPKK 62

Query: 66  KYEYKSPPPPPVYYSPPPPVYHSPPPP----VYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPP----V 125
            YEYKSPPPP  +YS PPPVYHSPPPP    VY SPPPPV H  PPPVYHSPPPP    V
Sbjct: 63  HYEYKSPPPPVKHYS-PPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYV 122

Query: 126 YYSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPKKDYEYKSPPPPKMDYE----YKSPPPPKKDYEYKSP 185
           Y SPPPPV H  PPPVY+SPPPPKK Y YKSPPPP   Y     Y SPPPPKK Y YKSP
Sbjct: 123 YKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYVYKSP 182

Query: 186 PPPKKDYE----YKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYE----YKSPPPPKKDYEYKSPPPPK 245
           PPP K Y     Y SPPPPKK Y YKSPPPP K Y     Y SPPPPKK Y YKSPPPP 
Sbjct: 183 PPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPV 242

Query: 246 KDYE----YKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSP 305
           K Y     Y SPPPPKK Y YKSPPPP K Y   SPPP      Y SPPPPKK Y YKSP
Sbjct: 243 KHYSPPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHY---SPPP-----VYHSPPPPKKHYVYKSP 302

Query: 306 PPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSP 365
           PPP K Y   SPPP      Y SPPPPKK Y YKSPPPP K Y   SPPP      Y SP
Sbjct: 303 PPPVKHY---SPPP-----VYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHY---SPPP-----VYHSP 362

Query: 366 PPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSP 425
           PPPKK Y YKSPPPP K Y   SPPP      Y SPPPPKK Y YKSPPPP K Y   SP
Sbjct: 363 PPPKKHYVYKSPPPPVKHY---SPPP-----VYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHY---SP 422

Query: 426 PPPKKGYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPP 446
           PP      Y SPPPPK+ Y YKSPPPP   +      PP   Y YKSPPPP
Sbjct: 423 PP-----VYHSPPPPKEKYVYKSPPPPPVHHY----SPPHHPYLYKSPPPP 428

[Close]

BLAST of Cp4.1LG06g07620 vs. TAIR 10
Match: AT1G26240.1 (Proline-rich extensin-like family protein )

HSP 1 Score: 349.7 bits (896), Expect = 4.2e-96
Identity = 327/546 (59.89%), Postives = 338/546 (61.90%), Query Frame = 0


Query: 15  ILVATLSLPSVFAADYVYSSPPPPYYSYNSPPPPVYHSPPPPKVKYEYKSPPPPPVYYSP 74
           +++A  S+ +  +A Y YS P PP Y Y  PP  +Y SPPPP   Y Y SPPPPP  Y  
Sbjct: 13  LVIALYSVSAHTSAQYTYSPPSPPSYVY-KPPTHIYSSPPPP--PYVYSSPPPPPYIYKS 72

Query: 75  PPPVYHSPPPPVYHSPPPP--VYHSPPPP--VYHSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPVYYSP 134
           PP     PPP VY SPPPP  +Y SPPPP  VY SPPPP Y    PP    PPP VY SP
Sbjct: 73  PP-----PPPYVYSSPPPPPYIYKSPPPPPYVYSSPPPPPYIYKSPP----PPPYVYSSP 132

Query: 135 PPPKKDYEYKSPPPPKMDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSP 194
           PPP   Y YKSPPPP   Y Y SPPPP   Y YKSPPPP   Y Y SPPPP   Y YKSP
Sbjct: 133 PPP--PYVYKSPPPP--PYVYNSPPPP--PYVYKSPPPP--PYVYSSPPPP--PYVYKSP 192

Query: 195 PPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSP 254
           PPP   Y Y SPPPP   Y YKSPPPP   Y Y SPPPP   Y YKSPPPP   Y Y SP
Sbjct: 193 PPP--PYVYSSPPPP--PYVYKSPPPP--PYVYSSPPPP--PYVYKSPPPP--PYVYSSP 252

Query: 255 PPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSP 314
           PPP   Y YKSPPPP   Y Y SPPPP   Y YKSPPPP   Y Y SPPPP   Y YKSP
Sbjct: 253 PPP--PYVYKSPPPP--PYVYSSPPPP--PYVYKSPPPP--PYVYSSPPPP--PYVYKSP 312

Query: 315 PPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSP 374
           PPP   Y Y SPPPP   Y YKSPPPP   Y Y SPPPP   Y YKSPPPP   Y Y SP
Sbjct: 313 PPP--PYVYSSPPPP--PYVYKSPPPP--PYVYSSPPPP--PYVYKSPPPP--PYVYSSP 372

Query: 375 PPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKGYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSP 434
           PPP   Y YKSPPPP   Y Y SPPPP   Y YKSPPPP   Y Y SPPP    Y YKSP
Sbjct: 373 PPP--PYVYKSPPPP--PYVYNSPPPPP--YVYKSPPPP--PYVYSSPPP--SPYVYKSP 432

Query: 435 PPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSP 494
           PPP   Y Y SPPPP   Y YKSPPPP   Y Y SPPPP   Y YKSPPPP   Y Y SP
Sbjct: 433 PPP--PYVYSSPPPP--PYVYKSPPPP--PYVYSSPPPP--PYVYKSPPPP--PYVYSSP 478

Query: 495 PPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKN-DYIYAS 554
           PPP   Y YKSPPPP   Y Y SPPPP   Y YKSP PP   Y YKSPPPP +  Y Y+S
Sbjct: 493 PPP--PYVYKSPPPP--PYVYSSPPPP--PYVYKSPSPP--PYVYKSPPPPPSYSYSYSS 478

Query: 555 PPPPYH 556
           PPPP +
Sbjct: 553 PPPPIY 478

[Close]

BLAST of Cp4.1LG06g07620 vs. TAIR 10
Match: AT3G54580.1 (Proline-rich extensin-like family protein )

HSP 1 Score: 318.9 bits (816), Expect = 7.9e-87
Identity = 327/607 (53.87%), Postives = 336/607 (55.35%), Query Frame = 0


Query: 30  YVYSSPPPPYYS------YNSPPPP-VYHSPPP----PKVKYEYKSPPPPPVYYSPPPPV 89
           YVYSSPPPP YS      Y SPPPP VY SPPP    P  K EYKSPPPP VY SPPPP 
Sbjct: 100 YVYSSPPPPTYSPSPKVEYKSPPPPYVYSSPPPPTYSPSPKVEYKSPPPPYVYSSPPPPT 159

Query: 90  YHSPPPPVYHSPPPP-VYHSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPKKDY 149
           Y   P   Y SPPPP VY SPPPP Y   P   Y SPPPP  +S PPP YYSP P     
Sbjct: 160 YSPSPKVEYKSPPPPYVYSSPPPPTYSPSPKVEYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSP---KV 219

Query: 150 EYKSPPPPKMDYEYKSPPP----PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP----PKKDYEYKS 209
           EYKSPPPP   Y Y SPPP    P    +YKSPPPP   Y Y SPPP    P    EYKS
Sbjct: 220 EYKSPPPP---YVYSSPPPPTYSPSPKVDYKSPPPP---YVYSSPPPPYYSPSPKVEYKS 279

Query: 210 PPPPKKDYEYKSPPP----PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP----PKKDYEYKSPPPP 269
           PPPP   Y Y SPPP    P    +YKSPPPP   Y Y SPPP    P    +YKSPPPP
Sbjct: 280 PPPP---YVYSSPPPPTYSPSPKVDYKSPPPP---YVYSSPPPPYYSPSPKVDYKSPPPP 339

Query: 270 KKDYEYKSPPP----PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP----PKKDYEYKSPPPPKKDY 329
              Y Y SPPP    P    EYKSPPPP   Y Y SPPP    P    EYKSPPPP   Y
Sbjct: 340 ---YVYSSPPPPTYSPSPKVEYKSPPPP---YVYSSPPPPTYSPSPKVEYKSPPPP---Y 399

Query: 330 EYKSPPP----PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP----PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKS 389
            Y SPPP    P    EYKSPPPP   Y Y SPPP    P    EYKSPPPP   Y Y S
Sbjct: 400 VYSSPPPPTYSPSPKVEYKSPPPP---YVYSSPPPPTYSPSPKVEYKSPPPP---YVYSS 459

Query: 390 PPP----PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP----PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPP 449
           PPP    P    EYKSPPPP   Y Y SPPP    P    +YKSPPPP   Y Y SPPPP
Sbjct: 460 PPPPYYSPSPKVEYKSPPPP---YVYSSPPPPTYSPSPKVDYKSPPPP---YVYSSPPPP 519

Query: 450 -----KKGYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP----PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP---- 509
                 K Y YKSPPPP   Y Y SPPP    P     YKSPPPP   Y Y SPPP    
Sbjct: 520 YYSPSPKVY-YKSPPPP---YVYSSPPPPYYSPSPKVYYKSPPPP---YVYSSPPPPYYS 579

Query: 510 PKKDYEYKSPPP----PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP----PKKDYEYKSPPPPKKD 556
           P     YKSPPP    P     YKSPPPP   Y Y SPPP    P     YKSPPPP   
Sbjct: 580 PSPKVYYKSPPPPYYSPSPKVYYKSPPPP---YVYSSPPPPYYSPSPKVYYKSPPPP--- 639

[Close]

BLAST of Cp4.1LG06g07620 vs. TAIR 10
Match: AT4G08410.1 (Proline-rich extensin-like family protein )

HSP 1 Score: 302.8 bits (774), Expect = 5.9e-82
Identity = 315/615 (51.22%), Postives = 334/615 (54.31%), Query Frame = 0


Query: 30  YVYSSPPPPYYS------YNS-PPPPVYHSPPP----PKVKYEYKSPPPPPVYYSPPPPV 89
           YVYSSPPPPYYS      Y S PPP VY SPPP    P  K  YKSPPPP VY SPPPP 
Sbjct: 105 YVYSSPPPPYYSPSPKVDYKSLPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVNYKSPPPPYVYSSPPPPY 164

Query: 90  YHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPV-YYSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPKKDY 149
           Y   P   Y SPPPP  +S PPP Y+SP P V Y SPPPP  +S PPP YYSP P     
Sbjct: 165 YSPSPKGDYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVDYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPTP---KV 224

Query: 150 EYKSPPPPKMDYEYKSPPP----PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP----PKKDYEYKS 209
           +YKSPPPP   Y Y SPPP    P    +YKSPPPP   Y Y SPPP    P     YKS
Sbjct: 225 DYKSPPPP---YVYSSPPPPYYSPSPKVDYKSPPPP---YVYSSPPPPYYSPSPKVNYKS 284

Query: 210 PPPPKKDYEYKSPPP----PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP----PKKDYEYKSPPPP 269
           PPPP   Y Y SPPP    P    +YKSPPPP   Y Y SPPP    P     YKSPPPP
Sbjct: 285 PPPP---YVYGSPPPPYYSPSPKVDYKSPPPP---YVYSSPPPPYYSPSPKVNYKSPPPP 344

Query: 270 KKDYEYKSPPP----PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP----PKKDYEYKSPPPPKKDY 329
              Y Y SPPP    P    +YKSPPPP   Y Y SPPP    P    +YKSPPPP   Y
Sbjct: 345 ---YVYGSPPPPYYSPSPKVDYKSPPPP---YVYSSPPPPYYSPSPKVDYKSPPPP---Y 404

Query: 330 EYKSPPP----PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP----PKKDYEYKSPPP--------- 389
            Y S PP    P    +YKSPPPP   Y Y SPPP    P    +YKSPPP         
Sbjct: 405 VYSSTPPPYYSPSPKVDYKSPPPP---YVYSSPPPPYYSPSPKVDYKSPPPPYIYSSTPL 464

Query: 390 ----PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP----PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP---- 449
               P    +YKSPPPP   Y Y SPPP    P    +YK PPPP   Y Y SPPP    
Sbjct: 465 PYYSPSPKVDYKSPPPP---YVYSSPPPPYYSPSPKVDYKPPPPP---YVYSSPPPPYYS 524

Query: 450 PKKDYEYKSPPPPKKGYEYKSPPP----PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP----PKKD 509
           P    +YKSPPPP   Y Y  PPP    P    +YKSPPPP   Y Y SPPP    P   
Sbjct: 525 PSPKVDYKSPPPP---YVYSFPPPPYYSPSPKVDYKSPPPP---YVYSSPPPPYYSPSPK 584

Query: 510 YEYKSPPPPKKDYEYKSPPP----PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP----PKKDYEYK 556
             YKSPPPP   Y Y SPPP    P    EYKSPPPP   Y Y SPPP    P    +YK
Sbjct: 585 VNYKSPPPP---YVYSSPPPPYYSPSPKVEYKSPPPP---YIYSSPPPPYYAPSPKVDYK 644

[Close]

BLAST of Cp4.1LG06g07620 vs. TAIR 10
Match: AT3G54590.1 (hydroxyproline-rich glycoprotein )

HSP 1 Score: 295.0 bits (754), Expect = 1.2e-79
Identity = 323/608 (53.12%), Postives = 335/608 (55.10%), Query Frame = 0


Query: 30  YVYSSPPPPY-----YSYNSPPPP-VYHSPPP----PKVKYEYKSPPPPPVYYSPPPPVY 89
           YV SSPPP Y       Y SPPPP VY SPPP    P  K +YKSPPPP VY SPPPP Y
Sbjct: 57  YVDSSPPPTYTPAPEVEYKSPPPPYVYSSPPPPTYSPSPKVDYKSPPPPYVYSSPPPP-Y 116

Query: 90  HSPPPPV-YHSPPPP-VYHSPPPPVYHSPPPPV-YYSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPKKD 149
           +SP P V Y SPPPP VY+SPPPP Y+SP P V Y SPPPP  +S PPP YYSP P    
Sbjct: 117 YSPSPKVDYKSPPPPYVYNSPPPP-YYSPSPKVDYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSP---K 176

Query: 150 YEYKSPPPPKMDYEYKSPPP----PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP----PKKDYEYK 209
            EYKSPPPP   Y Y SPPP    P    +YKSPPPP   Y Y SPPP    P    +YK
Sbjct: 177 VEYKSPPPP---YVYSSPPPPYYSPSPKVDYKSPPPP---YVYSSPPPPYYSPSPKVDYK 236

Query: 210 SPPPPKKDYEYKSPPP----PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP----PKKDYEYKSPPP 269
           SPPPP   Y Y SPPP    P    +YKSPPPP   Y Y SPPP    P    +YKSPPP
Sbjct: 237 SPPPP---YVYSSPPPPYYSPSPKVDYKSPPPP---YVYSSPPPPYYSPSPKVDYKSPPP 296

Query: 270 PKKDYEYKSPPP----PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP----PKKDYEYKSPPPPKKD 329
           P   Y Y SPPP    P    +YKSPPPP   Y Y SPPP    P    +YKSPPPP   
Sbjct: 297 P---YVYSSPPPPYYSPSPKVDYKSPPPP---YVYSSPPPPTYSPSPKVDYKSPPPP--- 356

Query: 330 YEYKSPPP----PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP----PKKDYEYKSPPPPKKDYEYK 389
           Y Y SPPP    P    EYKSPPPP   Y Y SPPP    P     YKSPPPP   Y Y 
Sbjct: 357 YVYSSPPPPYYSPSPKVEYKSPPPP---YVYSSPPPPTYSPSPKVYYKSPPPP---YVYS 416

Query: 390 SPPP----PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP----PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP 449
           SPPP    P     YKSPPPP   Y Y SPPP    P     YKSPPPP   Y Y SPPP
Sbjct: 417 SPPPPYYSPSPKVYYKSPPPP---YVYSSPPPPYYSPSPKVYYKSPPPP---YVYSSPPP 476

Query: 450 P-----KKGYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP----PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP--- 509
           P      K Y YKSPPPP   Y Y SPPP    P     YKSPPPP   Y Y SPPP   
Sbjct: 477 PYYSPSPKVY-YKSPPPP---YVYSSPPPPYYSPSPKVYYKSPPPP---YVYSSPPPPYY 536

Query: 510 -PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP----PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP----PKK 556
            P     YKSPPPP   Y Y SPPP    P     YKSPPPP   Y Y SPPP    P  
Sbjct: 537 SPSPKVHYKSPPPP---YVYSSPPPPYYSPSPKVHYKSPPPP---YVYNSPPPPYYSPSP 596

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of Cp4.1LG06g07620 vs. ExPASy Swiss-Prot


Match Name	E-value	Identity	Description
Q9FS16	1.4e-101	63.06	Extensin-3 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=EXT3 PE=1 SV=3	[more]
Q9M1G9	5.2e-83	52.68	Extensin-2 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=EXT2 PE=2 SV=1	[more]
Q38913	7.5e-58	53.92	Extensin-1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=EXT1 PE=2 SV=2	[more]
P06599	1.9e-48	50.81	Extensin OS=Daucus carota OX=4039 PE=2 SV=1	[more]
Q9T0K5	9.3e-32	47.25	Leucine-rich repeat extensin-like protein 3 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=L...	[more]

BLAST of Cp4.1LG06g07620 vs. NCBI nr


Match Name	Identity	Description
XP_023535223.1	100.00	extensin-3-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]	[more]
XP_022936362.1	96.93	extensin-3-like isoform X1 [Cucurbita moschata]	[more]
XP_022976064.1	96.02	extensin-3-like isoform X1 [Cucurbita maxima]	[more]
KAG6592186.1	96.38	Extensin-3, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]	[more]
XP_022976065.1	93.98	extensin-3-like isoform X2 [Cucurbita maxima]	[more]

BLAST of Cp4.1LG06g07620 vs. ExPASy TrEMBL


Match Name	E-value	Identity	Description
A0A6J1F886	0.0	96.93	extensin-3-like isoform X1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111443006 PE=4 SV...	[more]
A0A6J1IMG6	0.0	96.02	extensin-3-like isoform X1 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111476579 PE=4 SV=1	[more]
A0A6J1IIH0	0.0	93.98	extensin-3-like isoform X2 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111476579 PE=4 SV=1	[more]
A0A6J1FD20	0.0	88.74	extensin-3-like isoform X2 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111443006 PE=4 SV...	[more]
A0A6J1CRA7	7.40e-185	79.86	extensin-1 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111013522 PE=4 SV=1	[more]

BLAST of Cp4.1LG06g07620 vs. TAIR 10


Match Name	E-value	Identity	Description
AT1G21310.1	1.0e-102	63.06	extensin 3	[more]
AT1G26240.1	4.2e-96	59.89	Proline-rich extensin-like family protein	[more]
AT3G54580.1	7.9e-87	53.87	Proline-rich extensin-like family protein	[more]
AT4G08410.1	5.9e-82	51.22	Proline-rich extensin-like family protein	[more]
AT3G54590.1	1.2e-79	53.13	hydroxyproline-rich glycoprotein	[more]

InterPro

Analysis Name: InterPro Annotations of Cucurbita pepo (Zucchini) v1
Date Performed: 2021-10-25


IPR Term	IPR Description	Source	Source Term	Source Description	Alignment
None	No IPR available	PRINTS	PR01217	PRICHEXTENSN	coord: 35..47 score: 44.62 coord: 97..114 score: 38.89 coord: 56..77 score: 40.0 coord: 77..93 score: 40.0
None	No IPR available	MOBIDB_LITE	mobidb-lite	disorder_prediction	coord: 404..538
None	No IPR available	MOBIDB_LITE	mobidb-lite	disorder_prediction	coord: 134..556
None	No IPR available	MOBIDB_LITE	mobidb-lite	disorder_prediction	coord: 152..397
None	No IPR available	PANTHER	PTHR36586	PROLINE-RICH EXTENSIN-LIKE	coord: 87..193
None	No IPR available	PANTHER	PTHR36586:SF26	EXTENSIN-1	coord: 28..146
None	No IPR available	PANTHER	PTHR36586	PROLINE-RICH EXTENSIN-LIKE	coord: 28..146 coord: 122..218 coord: 245..397 coord: 473..556
None	No IPR available	PANTHER	PTHR36586:SF26	EXTENSIN-1	coord: 87..193
None	No IPR available	PANTHER	PTHR36586:SF26	EXTENSIN-1	coord: 245..397
None	No IPR available	PANTHER	PTHR36586	PROLINE-RICH EXTENSIN-LIKE	coord: 329..469
None	No IPR available	PANTHER	PTHR36586:SF26	EXTENSIN-1	coord: 329..469
None	No IPR available	PANTHER	PTHR36586:SF26	EXTENSIN-1	coord: 186..317 coord: 122..218 coord: 473..556
None	No IPR available	PANTHER	PTHR36586	PROLINE-RICH EXTENSIN-LIKE	coord: 186..317
IPR006706	Extensin domain	PFAM	PF04554	Extensin_2	coord: 289..337 e-value: 4.0E-7 score: 30.0 coord: 313..361 e-value: 4.4E-7 score: 29.9 coord: 193..241 e-value: 3.7E-7 score: 30.1 coord: 409..457 e-value: 4.5E-7 score: 29.9 coord: 433..481 e-value: 3.4E-7 score: 30.2 coord: 245..301 e-value: 7.9E-7 score: 29.1 coord: 29..68 e-value: 1.5E-5 score: 25.0 coord: 337..385 e-value: 3.7E-7 score: 30.1 coord: 269..325 e-value: 9.5E-7 score: 28.8 coord: 145..193 e-value: 4.3E-7 score: 29.9 coord: 457..505 e-value: 3.9E-7 score: 30.0 coord: 173..229 e-value: 4.7E-6 score: 26.6 coord: 473..529 e-value: 1.7E-7 score: 31.2 coord: 377..433 e-value: 9.5E-8 score: 32.0

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:


Feature Name	Unique Name	Type
Cp4.1LG06g07620.1	Cp4.1LG06g07620.1	mRNA

GO Annotation

GO Assignments

This gene is annotated with the following GO terms.

Category	Term Accession	Term Name
biological_process	GO:0009664	plant-type cell wall organization
molecular_function	GO:0005199	structural constituent of cell wall