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Cp4.1LG05g10370 (gene) Cucurbita pepo (MU‐CU‐16) v4.1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: five_prime_UTRexonCDSpolypeptidethree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.TAATTCAGTGGGAGAGGGAGTGAGAGAAAAGGTAAAATGGGGAGGGGACCTGAATTACATAATAAACCATGGCGACGAGCGTCGTGTAATTCACTCACTCGGAAGCTCGCAGGCGGAGGAGCCGACTTGGATTTGATCCATACACAACGCCATGGATTTGATCCATACACAACGCCATGGATTTGATCCATACACAACGCCATGGATTTGATCGATCGATGGATTGCTTCAGGTTCAAAACAGTGGGTTCGTTCGAGCTAAAGTTCAGGCTAAGCTGAATTCGACTTCCTCCTGTCTCCTTTTTCCCTTCGCTTTCATCTTAATTTCCCTTTAATTTATTCGAAGAAATCATCAAAACCGCATCACTATATTATGAATCATTGCGGGACAGATAGAGAATTGGGATTGAAGTTATATGTCATCTCTCTTTTGTTCCCACTGCGTTAGGGTTTTATATTCATTTTGCTTTTGGGGTTCACACGATATTCGTACGTCATACCTTCTTCTCTCACTGATTGAGTTGTTTTAATGTCCGAAAGAGGAGGTGTCACTCCTACGACCCAATTCTGCGGCTGAATTTATCACTAATTTGAGATACCAAGAGCTATTCTGGTTCGGATCATTCATTTTTCGGTTGGTTTGAGCTGAGTTTGAGCTAGGGGTTGAAGATGAAAAATGGTTTCGACGGGAGATCATTGGCTGAAAAATTCTCTGACTTGGCCGTCAGTGCTGCACCAGCAGAGCAATCTAACTCCCACTCATCCAACAATCACAGTAACAACAATGATAGCAACTTGTTCCAGGTACTGAAAGCTGTTGAAGCAGCCGAGGCTACCATCAAGCAACAGGTGCAATGAATTTTCCTTTGCCCCCNATATTCCGTCTCTCAACATCAAACGAATGCTACTCGTCTGTTAATTTCATCACTAAATTTAGTATTGTATTCACTTCACTTTTGCGCGATTCTAAGATCTCTAACTCCATGGTTGTTTCCTTCACGTTTTCTTTCTAAAACCCTTTTCATGTTTTCGATGTTGTGCATAATGCATACCATCAATTGAGCAGTATTTTTTCCATTGAGAATGTTGTAAGAATATAGAGATACTAGCTGCAGGAATCCAATCTTTCTCTTTATCCAAAATCTGCTTTCTCAACGCTTGGGATTATAGGCTACCGCAATCTAATATGGGTTCATAAAACTACCTTCTCTTTCGATTTTTATATGATCATAACCGTTATTGCTGGTTTTATAGTTGATGCTGTTGTTTTTTTTCCTCATTTTGTTAAGGAGGATAATCTGGGGTATGATTCGATTAGAAAGTTTCTAAAGGAAAAAAAGTGTGTATACCATTGAAGCGTCTTATAGTTCAATGACTTCAACTGTTGTGAGTTGAAACGAAATGTCAATTGATGAAGCAGCTTTATTCTACATGAAACGTAGAAGCTTAAGCCGCTATCTATCCTGGGTAGCATGGGTAGCATACCTGTGTTTCAACTTTATCAAGTCGTATAAACATAAGCATTGTTTGTTTGGTGAGACAAAGAAACTTGGCAATTAGACATCATTGATGATATTTGAGAATGGTGTCAACAGATTAGTGCGTGTAATTTGTATAATGGTACATCCTTCTTCTCAGGTGGAGTCCCCGAAACATATTTCTCTATCCGAATTCTTGTTTGAGTTACTGATGATGTAATTTTCAACTTGCATTTTTTTAGTACTGGTTAAAAGCCAGTAGTTTAAGCATTCTTTCATATACCGGTGTATGTGCTATTACCCACATCAGCAACTGCACCTGGTTGTTCCTTCTCCTCGTTTGCATTTTTATTGACCCATTACTGTGTGTTTTACATAGCATGAGTATTTGACTCAGTTACAGCTTAGATTTCATTATTTAAAGTTACATGCTGACATGAGTGAATTTAAATACCTTAGGTGGAGGAAAATAACCGACTGAGGATTGAACTTCAGAAAAAGATCCAGAAACTTGAGAAATATGTAAGTACTATAAATTGAATTTAATACAAAATCTAAGTGTTTCATTAATGTTCTGAAATGTGGGTTTTGTGTTTTTTTCCAAGCATTTAGTTTCTTGGATGCAGTTGATTGTGGTTGAATTTTGCTCACTTCTCTAATTATTTTCATATCTTGCATTCAGTTCAGTAGGAGTATGTTTATCAGTTTGGAAGAAATTTGACCTCGTTGTGGATTTTTCTATTCATTTTTTCATTGAAATGTGGCAGAAGGTTGATGAACCTTTGGCTCAAAGGCTTCATTCCACAAACCAATGGATTGAGAATGACCATCAAGGATCTAATGGGGAGCATCAATCAGATATTTCAGGTGATAGTGAAGGACATAGGTTTAAGAAGAACATTTCTATTGTTGATTCACAGGGTGCGCTAGTTGTCCATCAAGATGTTTTGCAAAAGGATGAAGTTTCCATGCGGGTTGATACAGAATCTCGCTTTGAGAACAGCAAGTCGGACAGGATGGTGAATGCTCTTCCTGGTGTTCAGCCACCGGTTGACAATGCTGGTTGCTCACAATTCTCTTCACCATCTACAACATCTTTCTCTGCTAGCAGGCAAGTAAAATGATGTGATTCATCCTTGGCCAATTATGTTATTAGTTTAAATAAAACATAGCATATGAAAACTATTTCATGACTGTTAGGTTTGCAGTGGATGGAGAATATGATCCACAGATTAAGTTTTCTGGACATGGCATGATGCCAAAGGCTGAAGCAAATATTCCCAACAGTCTCTGGAAACAGGCATGTCTTAGTTCTAGTCCTTTGTTTCATATATTTACAAGGAAGCCCTTTAACCTATGTTTCATATTTAGGATCTTGTTGTTAAAGTCCAGGAACATGAAGATGAAATTGTGCTGTTACGCAAGCATCTTGCTGATTATTCTGTCAAGGTAAAATGAATCATATGGACTATCTTAGCCCATTGTAAATATTTTCATATATTTACAAAATTCACATTTTATGGGGATGCCCCTTTGTCAGTCCCTTTGGGCCCTTTGGTTGGATGCTTTTAATTTATACTGGGTTTGGAATCATGATTGTTTCACTAGAATTGAGGAGGTTCTTCTGGGTTTGCCTTTTCGTGATAAAGATAGTTCTGTGGCATGCAAGTTTCAAGTTTCTTTGCGATCTTGTGGGAGGTTTGGATTGATAGGAATAATGGAATTTTTAGGGAGAGTGAGAGGTCTTATGATGAGGTTTGAGAGTTGGTGAAGTTAAATACCTCCTTGTGGGTATCGATCACTTGACCTTTTTGTAATTATAAGGACTTGATTTAATTTGGTTGGATTGGAATCCCTTTGGTAGCTTTTGGGAATTTTCTTGGTTGACTTTTTTTTGTATGCCTTGTATTTGCTTTGTTTCTTACCAACATTTTTTTTTTATTTTTTTATTGTTATATCAATTTTTTTTAGGATTTCTTTTACTTGGAGACGCTGATGATTCTTATTGTAATAGGAAGCACAAATACGAAATGAAAAATATGTTCTGGAAAAACGTATTGCCTATATGCGTTTGGTAAGCAGGGTTTTGATTTGTATTCATTGTCTATTACATTCCCTGAATTTTCTACTTTTATCATTTCCTTCGATTCCATTCTCATTGGTGTTTTGCTGTTGGGCTTCTTTTCCTTTTTGGTTTCCTTCTATTAGGCCTTTGATCAACAACAACAAGAGCTTGTTGATGCTGCTTCTAAAGCTCTCTCCTATAGACAAGACATAATTGAGGAAAATATCCGTCTTACATATGCGTTGCAGGTTCCTTCCTTGCTTTGGCATTTCTGACGTGGCTTCTGGTCTTTCAGAATGCTTAATTTTGTTGCCATTAACTTGTTTGATAACAATTTAGTATCCGTTAAGATACCCCATTGTATTTCTTTTCTAATATTATCTGTAATAGACTCCATGGCTCTCATCTGGTTGTATCAGGAAGCTCAACAAGAGAGAACCACCTTTGTATCATCTTTGCTGTCTCTTCTTGCAGAATATTCACTGCAACCTCCTGTTCCTGATGCTCAATCCATCGTCAGCAATGTCAAGGTGAGCCTTTAAATCTGTGGATTTTGAACGAATCACTTTACTTTATTTGAGGGCCAGGGCTAGGATAGGAACTAGATAACTAGATTTTGAAATTGTATTGAGATTAGAGATGAGAAATTGTAGTTAGATAATTTGAGGTAATTTCTACAAACAATACTTTGCCGTCTTTGAGGGTTAGAAATAGAGCTTTCATTAAGAGAAGATGAATGTGTTAAAGTGTTGATATAATTAAATTTATTCTAACCCATCAACTTAAACTTTTTGATTGATTGATGATTTAACATGATTTATGAGCAAGAGGTCCTAAGTTTGAACCCCTGCATTGTCATTTCCTCGCCCAATTAATATTGATTTTCACTTGTTGGGCTTTCTATAAATTTTCAAGCCCACAAGTGAGTGAGAGTGTTGGAGTATTCATATCATTAAATTTACTATTATCCACCAACTTAAAATTTTGGTTTGAATGGTGATTTAATGTGGTATTTGAGCCAAGCTCTAGACTTTAGCCATGTTGGTAAAATCCTCATGTGGGGAACAAAGAATTTGTGAGCCTCAAAGACAGTCATAGTACATACTTGTGGTTGAGCTCTGTTGGACTAGCGACGTGCTCAAAAGAAAATGAGTTGGCTTGAATTAGAGCTAGACATATAGATGACTATTTGAGGAGAGACTCGATGGTGTACTTTATGCAAGAGAAGGATTTTTAGGAATGCGACCAAAGTCTGACATTGGCTAGGTAAGGGAAACAACATAGGTATAGAAGTGAAAACTATCTTTGTTAGACTGAGGCCTTTTTGGGTGAAACCAAAAACAAAACCATTTGGATGAAACCAAAGGTAAAGCCACTAGAGTGAAACCAAAAGTAAAATCACGAGGGTTTATGCCTAAAATAGACGATACCATACCATTGTGGGAATAGGTG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ATGAAAAATGGTTTCGACGGGAGATCATTGGCTGAAAAATTCTCTGACTTGGCCGTCAGTGCTGCACCAGCAGAGCAATCTAACTCCCACTCATCCAACAATCACAGTAACAACAATGATAGCAACTTGTTCCAGGTACTGAAAGCTGTTGAAGCAGCCGAGGCTACCATCAAGCAACAGGTGGAGGAAAATAACCGACTGAGGATTGAACTTCAGAAAAAGATCCAGAAACTTGAGAAATATAAGGTTGATGAACCTTTGGCTCAAAGGCTTCATTCCACAAACCAATGGATTGAGAATGACCATCAAGGATCTAATGGGGAGCATCAATCAGATATTTCAGGTGATAGTGAAGGACATAGGTTTAAGAAGAACATTTCTATTGTTGATTCACAGGGTGCGCTAGTTGTCCATCAAGATGTTTTGCAAAAGGATGAAGTTTCCATGCGGGTTGATACAGAATCTCGCTTTGAGAACAGCAAGTCGGACAGGATGGTGAATGCTCTTCCTGGTGTTCAGCCACCGGTTGACAATGCTGGTTGCTCACAATTCTCTTCACCATCTACAACATCTTTCTCTGCTAGCAGGCAAGATCTTGTTGTTAAAGTCCAGGAACATGAAGATGAAATTGTGCTGTTACGCAAGCATCTTGCTGATTATTCTGTCAAGGCCTTTGATCAACAACAACAAGAGCTTGTTGATGCTGCTTCTAAAGCTCTCTCCTATAGACAAGACATAATTGAGGAAAATATCCGTCTTACATATGCGTTGCAGGAAGCTCAACAAGAGAGAACCACCTTTGTATCATCTTTGCTGTCTCTTCTTGCAGAATATTCACTGCAACCTCCTGTTCCTGATGCTCAATCCATCGTCAGCAATGTCAAGATTCTATTCAAGCACTTGCAGGAGAAGCTTCTTCTCACTGAGACAAAATTGAAGGAGTCACAGTATCAATTAACACCTTGGCGCTCTGATGCAAGCCACTCAAGTTTTGCACCACAGTCACCCTTCCATTCTGTTGGTGCAACCTTAACCGCTTCAACTAAAAATGGGCTTGAGTTGGTTCCTCAACCTTCTTATTGGAACGGGAATATCCCAGTTTCTTCTTCTGATGCTCAGACCACAGCTGATTGGGATCTACCCAGTCATCATCAGATTGGTTTAGATGTTGCAAAAAAGTTGGAACCAGATGATTTGGGGAGGTATTCACATCAAGCAAGCAGGTGA MKNGFDGRSLAEKFSDLAVSAAPAEQSNSHSSNNHSNNNDSNLFQVLKAVEAAEATIKQQVEENNRLRIELQKKIQKLEKYKVDEPLAQRLHSTNQWIENDHQGSNGEHQSDISGDSEGHRFKKNISIVDSQGALVVHQDVLQKDEVSMRVDTESRFENSKSDRMVNALPGVQPPVDNAGCSQFSSPSTTSFSASRQDLVVKVQEHEDEIVLLRKHLADYSVKAFDQQQQELVDAASKALSYRQDIIEENIRLTYALQEAQQERTTFVSSLLSLLAEYSLQPPVPDAQSIVSNVKILFKHLQEKLLLTETKLKESQYQLTPWRSDASHSSFAPQSPFHSVGATLTASTKNGLELVPQPSYWNGNIPVSSSDAQTTADWDLPSHHQIGLDVAKKLEPDDLGRYSHQASR Homology
BLAST of Cp4.1LG05g10370 vs. NCBI nr
Match: XP_023533546.1 (uncharacterized protein LOC111795384 isoform X6 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 755 bits (1950), Expect = 2.32e-268 Identity = 407/459 (88.67%), Postives = 407/459 (88.67%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG05g10370 vs. NCBI nr
Match: XP_023533545.1 (uncharacterized protein LOC111795384 isoform X5 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 755 bits (1950), Expect = 2.94e-268 Identity = 407/459 (88.67%), Postives = 407/459 (88.67%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG05g10370 vs. NCBI nr
Match: XP_023533544.1 (uncharacterized protein LOC111795384 isoform X4 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 755 bits (1950), Expect = 3.15e-268 Identity = 407/459 (88.67%), Postives = 407/459 (88.67%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG05g10370 vs. NCBI nr
Match: XP_023533541.1 (uncharacterized protein LOC111795384 isoform X1 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 755 bits (1950), Expect = 6.46e-268 Identity = 407/459 (88.67%), Postives = 407/459 (88.67%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG05g10370 vs. NCBI nr
Match: XP_022947425.1 (uncharacterized protein LOC111451285 isoform X6 [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 749 bits (1933), Expect = 8.82e-266 Identity = 404/459 (88.02%), Postives = 404/459 (88.02%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG05g10370 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1G6V0 (uncharacterized protein LOC111451285 isoform X6 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111451285 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 749 bits (1933), Expect = 4.27e-266 Identity = 404/459 (88.02%), Postives = 404/459 (88.02%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG05g10370 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1G6S3 (uncharacterized protein LOC111451285 isoform X5 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111451285 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 749 bits (1933), Expect = 5.07e-266 Identity = 404/459 (88.02%), Postives = 404/459 (88.02%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG05g10370 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1G6J5 (uncharacterized protein LOC111451285 isoform X4 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111451285 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 749 bits (1933), Expect = 5.43e-266 Identity = 404/459 (88.02%), Postives = 404/459 (88.02%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG05g10370 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1G6J0 (uncharacterized protein LOC111451285 isoform X1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111451285 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 749 bits (1933), Expect = 1.04e-265 Identity = 404/459 (88.02%), Postives = 404/459 (88.02%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG05g10370 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1L258 (uncharacterized protein LOC111499721 isoform X6 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111499721 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 743 bits (1919), Expect = 3.53e-264 Identity = 402/459 (87.58%), Postives = 403/459 (87.80%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG05g10370 vs. TAIR 10
Match: AT5G23490.1 (unknown protein; BEST Arabidopsis thaliana protein match is: unknown protein (TAIR:AT5G08440.1); Has 202 Blast hits to 197 proteins in 48 species: Archae - 0; Bacteria - 13; Metazoa - 25; Fungi - 9; Plants - 109; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 46 (source: NCBI BLink). ) HSP 1 Score: 260.4 bits (664), Expect = 2.4e-69 Identity = 200/453 (44.15%), Postives = 244/453 (53.86%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG05g10370 vs. TAIR 10
Match: AT5G08440.1 (unknown protein; FUNCTIONS IN: molecular_function unknown; INVOLVED IN: biological_process unknown; LOCATED IN: plasma membrane; EXPRESSED IN: 21 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; BEST Arabidopsis thaliana protein match is: unknown protein (TAIR:AT5G23490.1); Has 141 Blast hits to 139 proteins in 35 species: Archae - 0; Bacteria - 9; Metazoa - 21; Fungi - 6; Plants - 94; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 11 (source: NCBI BLink). ) HSP 1 Score: 250.4 bits (638), Expect = 2.5e-66 Identity = 189/404 (46.78%), Postives = 233/404 (57.67%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG05g10370 vs. TAIR 10
Match: AT5G08440.2 (unknown protein; FUNCTIONS IN: molecular_function unknown; INVOLVED IN: biological_process unknown; EXPRESSED IN: 21 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; BEST Arabidopsis thaliana protein match is: unknown protein (TAIR:AT5G23490.1). ) HSP 1 Score: 208.8 bits (530), Expect = 8.5e-54 Identity = 182/450 (40.44%), Postives = 223/450 (49.56%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG05g10370 vs. TAIR 10
Match: AT3G03560.1 (unknown protein; LOCATED IN: plasma membrane; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; BEST Arabidopsis thaliana protein match is: unknown protein (TAIR:AT5G23490.1); Has 157 Blast hits to 146 proteins in 38 species: Archae - 3; Bacteria - 14; Metazoa - 8; Fungi - 0; Plants - 120; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 12 (source: NCBI BLink). ) HSP 1 Score: 60.5 bits (145), Expect = 3.7e-09 Identity = 44/136 (32.35%), Postives = 70/136 (51.47%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucurbita pepo (Zucchini) v1
Date Performed: 2021-10-25 Position : 0 Zoom : x 1
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
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