CmoCh18G006160 (gene) Cucurbita moschata (Rifu) v1

Overview
NameCmoCh18G006160
Typegene
OrganismCucurbita moschata (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationCmo_Chr18: 7566663 .. 7573956 (+)
RNA-Seq ExpressionCmoCh18G006160
SyntenyCmoCh18G006160
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptidethree_prime_UTR
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ATGTTGACGATGAGGTAAGTAACCACCTTGGACTTTTCTTAAGAAATACTTGTAGGAATCTCTTGAATTTTCATATGAACCCTAAAAAAAAGTACGACACAAGGATATATGAAAGAAAAACTCAATGAACCGTAAGTTAAGGCCCTGATCCGACCAAATTGCTCGGGATTTAAGGAACGTTAAGATAAACCACTAAATGAGCTTTTATGCTTATGAAATTTTAATGCTGAGCATAACATATCATATTAAGGTTATGTATGAAATTTGGTGGTCATTGGATAAGGATAAGTAGGTAAACCAAGAAACAGGGCAAAATGACCATAATGCCCTGAAGGATATCTACCTACGGTTCATGACCAAGATGACCTCAAAATGCTATGAAACTCTACTATAGTTCTTATTTTATGATTCTTAATGAGGTGGTATAATTTGAAAGCCATTGGAACTCGTTAAGTAGCAAAATCAAGAATTAGGGAAAAATTAACATAATGCCCCTAAGGAGGACTACCTACGGGTTAAGCCCTAAATGACCTTCCAACATTGTGAAATGTTGTATGAATCCTTACCTCAAGATGTTGTATAAGGTAATGAAGTTTGGGAGTCATTGGGAAACGTTAGATAGCAAAACCAAGATATGGGGAAAATGTACATCACGATCCACATGACTTTACCTCCTAGAATGACTAACGAGGTACCCATGAAATAAGAGATTCCCCATAGGTACCGTTGGTTGCTAAAAAGATTTTAAGTGCATAAGGTTACATTGGGCTATTCCTAAGAAGAACCTTTAAGTTCCAAGCTTGACCCAAGACGTTATGCATAAACCTAGGATCCCCAAGAATACAAGGAAACACCTAGGTTAATGCAGATGGTATGCTTAACAAGTTGCTAGGATCCATGCCCAGAGTAACCATTATCTCCCATCATGAAGTGTATCACGAGACCCCTATTCCTCTTTTGGTGAGATGCTCTGCTATATGTACCGATGCCATGATGAACTTATTATTTCCCTCACCTAAATGAGATGCCCTGCATCATGAATTTCCAGTAGGATGTCACGATTATGATAATGTCACCTATGCACTCATGGGGAGAAAACTAAGGGTTACTTTGAAAGAGTTTTCAGGACCAAAACACGATGTATGACATGACAACCTCTAAGAGTTAGTTCCTGAAAACGAAACAAGAAGTCATATCCTAGCTCAAGGTCTAAATATGCTCCAAATCACCAACCATGTCCTATAAGGTCTATTTTATATGACACGAGGATAAGCTCAAGATTTCAAGTTGGTTGGAGCAAGTTTGTAACATAAGCCAAGATGGAACTTAAGGAAACGCCTAAAGAAAACATGTCAATATTCAAGACTCTTCTAGAACCTTCTAAAAAATTCCCTAGGAATCTATCACCTTCTGAAATAACACACGCTAAGATGGGTTCATATGGTTACAAATACAAGTTACAACTTATGCCTCAAGGAATTAAGGACCTTAGAAACTTACAAGATTAAGAATCAAGAACAAGCTATACAACTCTCAAGATAAGGAGAATGCTAGGTACCACTAAAAAATAAGGGACCAAAGTCCCTAGACATGAAAATTCAAGAATGCTAGGCAATACTCTAAGCATGTCCAATTGTGGCCCATAACTCCCACCACACGGTGCTTTCTAAAGAGGCCTTTTTCCTCTTCTAGGTGGGATGCCCTGCACCGTGTTTCCTTTGCAAGATGTCATGTTTGGCCTCATTCCCCTCACCTAGATGAGATGCCCTGCGCCATGTTATGTTTTGCAGGATGCCATGTTCATGTATGCACCGATCACGCGACCTATATGGTCTATGGTAGATTAAGCAACCTTTATGGTCTATGCCATGTTCATGCATGCATCGATCACATGACCTTTATGGTCTATGCTAGGTTCATGCATGCATCAATCACGTGACCTTTATGGTCTATCATGGGGAGTAATCATATGGCCATCATGGAGCAAGAAGAGAGTAAGTTACTCTAGCCATGAATCAAGAACCTCTTAAGGCCTCCCACAGTACATCATGTTTATGACTTAGACTACGCTGCTTGGAACATATGAAGCCTTGAGCGTAGGTATTAAGACTGTGTCGCTTGGAACGCATGAAACTTCAGACACAGGATGACAAGTTTATGTCTAGTACCGTAAGTCCTAAGGGGAGTGTCTTAGAGAACGAATTAAGAAACATAACAAGAATTTACAACAAGAACAAAAACAAGAACATGAAAAGGAAAAGTGTGGTACCCTAGCATATCAAGGACATGATTAAGAGCCTACAAGTAGGCTGATTACTGAGTCTTGTACTCATTCCTTATTCTCCATTTTTTTAGGAAATAAGGGGCTGGTCGAGGTTGGGAGCGGACTCTAGAGCAGGTGCCATAGACAAACTTCATCTGTCGTCCTTCAACCCTTTTGTGTCGTCCCTTAACTTGTGTTTTAATTGTTGTGTTGTGTCTTAAAATACTTTGTATCATCTTTATTTTGATATAATGTTTGATATGTTTTAAGTTTTGGTTGTTTTATTTTGTTAAAAATTTTACCCGTCTTTTAGAGGCATCGAGTCAGCCCGGTCCTTACAGTTAAGGGGAATGAATCATTCCTTACATAAGGGGTGTCAATATGTCCGAGTCGTTAACGAGACAGATTTCAAAATTTGTTGGGCCATGCCTGCACGGTTCGAATCCTACTGTTGACAAATTTTTAACTTTATGTGAAATCCCACATTGGTTAAATAAGAAACTAATCATTCTATATAACAGGGTGTCAATATTTCTAAGTGGCTAAGGAGATAGAGTCGAAATCTGTTGGGCTATGCCTGCCTGTGTAGGTTTGGATCCTACAATTCTTTATATAAGGGTGTCAATATGGCTATTCTTTATATAAGGGTGTCAATATGTCCCAATGATAAATCTGTTGGGCTATGCATGCACAAGTTTGAATCCTGTTGCTATGTTCCTTATATAAGGAGTGTTAATATGTCCGAGTGGTTAAGGTGATAGACTTGAAATCCATTTATTTATGCCTACACAAGTTTGAATCCTGCTGTTGATGAATTATTTTATCAGGGGCGTCAATATGTCTGAGTGGTTAAAGAGACAAACTCAAAATCTGTTGGGCTATGCTTGCGTAGATTCAAATCCTGCTATTGACGTATTTTTTAGCTTTATTGTGAAAACACACATCGGGTTGAACAAGGAACGATGCAATTTTTAGCTTTAGGCTATGCAATTTTTAGTTTTATTATGAAATCTTACATCCTACATAATACTTATATAAGTAGAAGTGGGATACTGTTGTTGCCACAATTAGTAGTACCTGGGAAAATGAAGTTTGGGGTGTCAATATGTCCGAGTAGTTAAGGAGATAGACTCGAAATCTGTTGGGCTATGCCTACGTAGGTTTGAATCCTACTCTTGACATATTTTTAGCTTTATTGTGAAAACACACATCGGTTGAACAAGGAACCAAAGAACGAATCATTCTTTATATAAGGGTGTAAATGTCCAAATGGGTAAGGAGACAAACTCGAAATTTGGGCAATTTTTTTAGCTTTATTACTAAATCCCACATCCTACATAATACTTATATAAGTGGAAGTGGGATACTGTTGTTGCCACAATCGGTAGTACCTGAGAATTTGAGAAACTGAAGTTTGGGTGTCAATAAGTCCGAGTGGTTAAGGATAAGTATGAGCGGTCAAGGAGATAGACTCGAAATTTGTTGGGCTATGCCTGCATAGGTTGAAATCCTGCTATTGACGTATTTTTAATCTTATTGTGAAAACACCATTGGTTGAACAAGGAACGCATCATTCTTTATATAAGGGTGTCAATATGTCCGAATGGTTTAGGAGACAAACTCGAAATTTGGCTGCAATTTTTAACTTTATTATGAAATCCCACATCCTACATAATGCGAATCATTGTTTATATAAGGATGTCAATATGTTCGAATGGTTTAGGAGACAAACTCGAAATTTGGCTGCAATTTTAAGCTTTATTATGAAATCCCACATCCTACATAATACTTATATAAGTGGAATGGGATACTGTTGTTGCCACAATCAGTAGTACATGAGAATCGGACAAACTAAAGTTTGAGGTGTCAATATGTCCGAGTGGTTAAGGAGTGAATCCTGCTATTGACGCATTTTTAGCTTTATTGTGTTAAAACACACCTTAGTTGAATATGAAACATAAGGGTGTCAATATATCCAAAATGGTTTAGGAGACAAACTTGAAATTTGGCTGCAATTTTTTTTAGCTTTATTATGAAATCCCACATCCTACTTAATAACACTACAACAAAACTGTCTCTTATAACATTTGAATATTGCATTTTTTAAAAAAGGCATTTTCCTATTTATCTTTTATTTGAATTTTTTTATTCTATTGGTTTTCTCTCTTCTTCGTATTCTTTTCTACATTCTTCCATACTTTCTTTTTCTTTTCCCCCTTTCTCCCTTTCATTTTTCTCCGATTCCTTCCTTTCTCTTTTCCATCTGTTTGGTTTCTTCTTTTTCCTTTCTCTTCTCTACTCTCCGACAGAAAGTTTAGACAAGATTGTAAATGATGAAACCCCAATCTATTTGCCGAAGATGATGAGAAAGTTTTGAGTTCACGGTGGTTCAAAAAATTGAAGCCCTAAACTCTTTGCAGAAACCATTTGAAGGTGAGGGCCCCTTGTTATCGAAGGAACCCTGGTTTTTTATTCCCTCCTTCCTTCTTTATTATTTTTGCATTTACGTGATTTTAAAGTTTTGATTTTTCAGATAACACGTTGTGGCCTTTCTTGTTCAAATGTTCTGTCTTCGCTGAACTCCTTTCTTTTGCGTAACTCTAGTTTTTATTCATCTCTTACTCCAACATTTCTCCCTTTTTAATTTAATTTTTAGTTTACATTCCAACTCAACCATCTGGAGGGGTTGACTCTGTACCTAGAGTGTGTGGTTTCTCTTTGATTATTTTTATTTGAG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mRNA sequence

ATGTTGACGATGAGGTGGGATGCCCTGCACCGTGTTTCCTTTGCAAGATGTCATGTTTGGCCTCATTCCCCTCACCTAGATGAGATGCCCTGCGCCATGTTATGTTTTGCAGGATGCCATGTTCATGTATGCACCGATCACGCGACCTATATGGTCTATGGTAGATTAAGCAACCTTTATGGTCTATGCCATGTTCATGCATGCATCGATCACATGACCTTTATGGTCTATGCTAGAAACCATTTGAAGTTGGTTGAGATTTTACCTTCTTCTCTGGTCCTCTTCATTCTGAAAAAGCTGCCTCCCAAAGTGGAATTACGCATTGCATACAGAAGGAAGCGAAGAATTGGGAATGAAAAGGTGTGTCTAAAGATGAGGCCATGATAGCGGTCCCCAGATGTTGAAAATCATTGCAAAGTAGTGGAGAATATTTTATCTTGTATCGTTTGAATAACTTTATTTTAGGAAAGGAATGAATACTACTCTTGTGATGGAAATAGATTATGAAATATCAATTATGAATGGAAGTCATG

Coding sequence (CDS)

ATGTTGACGATGAGGTGGGATGCCCTGCACCGTGTTTCCTTTGCAAGATGTCATGTTTGGCCTCATTCCCCTCACCTAGATGAGATGCCCTGCGCCATGTTATGTTTTGCAGGATGCCATGTTCATGTATGCACCGATCACGCGACCTATATGGTCTATGGTAGATTAAGCAACCTTTATGGTCTATGCCATGTTCATGCATGCATCGATCACATGACCTTTATGGTCTATGCTAGAAACCATTTGAAGTTGGTTGAGATTTTACCTTCTTCTCTGGTCCTCTTCATTCTGAAAAAGCTGCCTCCCAAAGTGGAATTACGCATTGCATACAGAAGGAAGCGAAGAATTGGGAATGAAAAGGTGTGTCTAAAGATGAGGCCATGA

Protein sequence

MLTMRWDALHRVSFARCHVWPHSPHLDEMPCAMLCFAGCHVHVCTDHATYMVYGRLSNLYGLCHVHACIDHMTFMVYARNHLKLVEILPSSLVLFILKKLPPKVELRIAYRRKRRIGNEKVCLKMRP
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucurbita moschata (Rifu) v1
Date Performed: 2021-10-25
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
IPR009457THH1/TOM1/TOM3 domainPFAMPF06454DUF1084coord: 70..109
e-value: 4.5E-6
score: 26.2

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
CmoCh18G006160.1CmoCh18G006160.1mRNA