
CmoCh04G004480 (gene) Cucurbita moschata (Rifu) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRCDSpolypeptidethree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.TTATTGCGTGAAGAATGATCTAATTCATTCGACGAGCAAATTTTCATATCATGGCGGAAATGGATGCTGCGGGAGCTCCGGCTACTGACACTCCATCTTGGTTCACTCCCAAGAGGTGATTTTCTATTTGTTCGCGATGCTTTAAGATTCAATTGGTTGGTTGGTTGGCGAGAAAGTACAATTTGAATGGAGGAAGTCAAAATTGATTGATCTATCAAGTTGACTTCTAAATGGAAGTTATTCAGTTTAGGATAAGACTATTTTTCGGAGATTTATGGTTTTGTTAGTGTTCATCTGGTATCTAACTAAGTTACTTTGGGTATTTTGTCTGTGAATGTTCATGATCGGTGTTTGCTTGTTTCTTTCTGGAAAAAGCGATGAATTGCGGGAGATAAATGGATATTTTGTGTGCTACATTTGATCACTTATCTCTGTCTTGAAATAGGAATTATTCGTGTAATCGAGATGCATTTGTTCTTCTAAGGGAATAATGCCGAGCTAACAATGTGCAAAATAAGAGGAATAGCGCTTTAATCGGGAACCCTCGATATCTGGTCGTTTCTTGCGAGCATAGATCACCTGCAATTCAATTGGTTGGATGGTAATATTGTAAAGTCGCATGCTGTCAGTCCACCCCTGTGGTTTTCATTTTGATTACTGGATATCTTTTGTTTGCAATGGTGCTTCCCGAATGATTGCAATAGGCTTCCAACTCGTCTGTGGTCACAAGTTCCAAGACTCAGGTCTTATGGGGCAATGGTAGGAAGAACGAGTGGAGAGAATTTGGAGACTTTTAAAGACAGGCATAGGAACATAAAGGATTTTATTGCTTTAACTAGGTTCATAGGGTCGAATTGGTATAATCTCACTAATTATATTTGCCATTTATCTGATTAATTTTACCCTTTGGAGTACCTTTTTTTAACTTCATTGGGAGATTTCTTTTCCTTTCGAGCATGCATTATTTAATGACATTCAGATTCATATGAAAAAAGTTACCCAAACAAGTCAGGTTCTGTTTAGTATGGTGCTCATTGAATAAGCATTACTATTGCCTATTGGTGTAATCTACGAAAGGACTCGGGAATAAATGAGAATATTCATTGTATTTGTTAACAAAGTCATCATGCTTTCATTTCTTTTACTAGATGCTTGGACTCTTGGTTTTTAATCCTTACTTTTAGAACTATGATTAATTGGAAATTCTATTCATTTGTCTGGGGCTAATAGGAGATAAGGGTTTTGGTAATAGTTGTCGAAGTGCTGAAATATTACATACTGGTTACAGGAACAATGGATTAATTATAAACTATCCAGAATGGTTTGAGTATCAACCTTTTAGGATGCTATGGGCTCCATTAAGTACAATTGTTAGAATTATGATATCTTTATGCCTTTTTGAAGCTGAAGTGGCTCCAGACTCCTGACCAGAGGATTAATATAACGTCTTCAACTATTAAGTGAAATTTATGTTATGCTACTAATTTTTTAAGTTTTCAGGACTTCTTTTTTGGACCTCTTTATAGTCAGTAATCAGTTCATTAAACTTTAACTAGGGTGCAGACTCGTCCTATAGTCCATTGTCTTGTGTTTTTGTTTTAACAATATGTGTGATTGGAGATTTGGACTTCTAACCTCTTGGTGTATTGTCAGGCACGTTGTCTTGTGTACATCTTTTTTTTTCTCTCTCTCTCTTTTTTTTTAACAATATGTTTTATGCTACTTGAGCCATGCTTATGATGTCATATTGTTTTGTGTTGTACTTTTAGTTACCAGTAGTTTGGATAAATAAGTGTCATGTACTGCAAATTGATAACTGAATTTTCTTTTATTTCTTAATCTCTGCAGGCTTCTTGCTATATTCTGTGTAATCAACTTGTTAAATTACATAGATCGAGGAGCAATAGCTAGCAATGGTGTGAATGGAAGTCAAGGAACTTGCACAGCAAGTGGTACTTGCACATCTGGTACCGGGATACAGTAAGATATAGAAGCCTTTCAAAATAAATGGTGTTGGATATTTACCATGATGATTTTCTTTCTATTTTAAAATAGTTAGAATATGACAAGAATAAAACAAATATTCTCAAATTATAACTCGTTAAGAAATCTTTAAAGTTATGAGATCGCAAGAATTACTCGTTTATCTACCCTACATGGATTAACGGATTTGAACACTCATTTTGGGCCATTAGGCACACACATGCTTAATTGTGCAGAAGTTTATATGTAATCTTTTTTTTTACAAAAACAAAGTTTCTAGTAATATATCATTCTCTATCGTGATAAGTTTCTTTTTAAGTCTTCAAGTCTATTTGGTCCCTACATGTACTTAATTCTAGACATAAGAAAAGTAGGATAAATTTATCATGTAATGGACTAGTAAACTCACCTTCATTTTCAACTAATAAGGTAAAAAAATGTAATATTCCATATATAAAGAGTAATTCAAGTATTTGTTATTTTATGCTCTTTACTTTTAGATGATTTTTTAGCACTGTCTTTCATTTGATTGAATTTTTATATTATGGTTAGGTATCTCATAAAAAAAGTTATGGTTAACTATATAATTGGTAGAGATGCTTGTTAATAAATAAATGTCAATCCACAATTATGGCTTGCTCACCCCAACGAATGGCTCCATCCTTGGCTCGACACATTTTGAAGTTTTAGCTTTTATATCCAAACCTTATTGAATCACTGATATTGGAGATTTAGGTTGGAAAGGAACTATGGAATCTTAGTAACAAGGGAAAAAATTGGGAGGAATTTGAAAATGGCTGACAACTCTAGATTAATGCATTTGGTTCTCTGTAGAAAAGTTTTTTTGTAACTACATCATTTCTGTTATTAACTCAGATTGGAGTATTTTTTTTTTAAATTTTTAATGAGGTCCGTGAGTTTTAGACTTCTGCAAGTTTTTCTCTAAATCAATGAAAAATTCGTTGTTTTTATTTTTAAAAAAGAACTATTCTTGTGTCATCAATTTAGGCCTGAATATGTCTTTGGATTTAAAATATTATGATAAATAAATGTGGGAATTATGTCCTGAAAAACTTAGTCTCCTAAATATAATATTTAGCTCCATACTTGCACAACAATTTGCACTTTGACATTTCTTAGGCAATGTTGATATCCAGGGCTAGTTATTTGTGAAACTGAAAGACGCTAATAATTTTTTTAGCTATTTATTTTTTCATGTCATGTAGGCCCTATTGGTTGCTGGTGTTGACATCATTATATGTTAAATGTTGTTGTGAAATTATCTTATGTTAATATGACTGTTGGCATAAACTACTTCTGTACCTAACTATTTTTTGTGTCAAACTATTTTTAGAGGTGAGTTTAGCTTGAGCAATTTTGAGGATGGGGTTCTTTCTTCAAGTTTCATGGTTGGACTTCTAGTTTCTTGTCCAATATTTGCAACACTAGCAGAACGGTAAGTCAATGCATGTTCTACACTGATAGGAATTTCATATATCTGTATATGTTGCTCATTTTTGCCCAAGTAAGTTTAAGGTTAGAGGTTCAAAGTCCCAAACGCCTGTCATGTTGAATTGAAATTGAAAATTTTTTGAGAATTAAAGGTTTACCCAGTTATTTATTATTAATGTTATTGTTATTTTTAATGAGAAATCAAGCTTTCATCTAGAGAAAATGAAAGAATACAAAAGGGCATATGAAAGAACATCCCACCAAGAGAGGCCAAACAACTAGTTATACAAACATCCCTCAGTTCAAATAATATGACTTGGCAGATAATTACGAAAAGAGCATTATGCATAACAGGCAACCAACTCTCCTCCCAAGATCTCTCACAATCCTTAAAAATTCTATTATGTCACTCGATCCAGAGGCCCCAAAGGACTGCAAAAAAGCTAGTCTACCATGAAATCCGGCCCCCATCATGAAAAGGTAGATGCTGAAAAACCTCTTCACGATAGAATTGCAATCCCTATTCCTAGCCAAACGAACATCAAACAATTGGAAAAGCTGCCTCAAACAGACTGGGCAAATTGACAGGTCCTGAGTTTATTAAGAAGGTCCTCAATAGCACTTTTATAGAAAATGCACCAATTTGGACCCCACCACAAAGGAAAAACGCCAGTGAATTTTCAAACGAGGTTGTTTTCTGAGGTTAAAGTGAACTAAAGTATCTGAATATGATAAAATTTTGTAGCATGATGTCAGTGTCATTGTGGTAATGGAGAAGAATTGAACTTTTTTTTTTTTATGTACATGTGTGCGTGTTCTTCTTATTCTTCTTTATTCTTTTATTTTATTATTATCTTTTTGGCAGAATCAACCCATTTAGGCTCATTGGGGTTGGATTATCAGTTTGGACTTTTGCTGTTATTGGCTGTGCTGCTTCATTTAATTTCTGGTCCATATCAATATGCCGCATGTGAGTAATATTCTTTTCTCTTTCCTCCTTCCCTTCACGTTTGTGTTCTATTTTTCAAATCCATTTTTTGCAGATTGGTTATTGATTTTGGCATTGTAAAGAATTTTCTTTAATTTGATCTATTTTTTTGTTTTAATTTTGGCTCTTGCACTTCATTGCTTGCTTTAGGTTGGTTGGTGTTGGTGAAGCATCATTTGTAAGTCTTGCTGCACCGTTCATTGATGATAATGCACCTGCTTCTCAGGTTACATTCCTTTCATGTATTTGTTGTATTTTCTGGCTTGTGCCCGTTAGTGTTTCCCATATGATATACAAATTCGCAAGTGTTGTATACTGACATCATGTTTATAGCACAAGAATGTGATTTTTCAAGTTCTATAATAATGGATAGTCGGGTATACTCTTCTTCTGTGTCATAGGACATCAGTGGCATTAAATTTATCAAACTTTGATATTTCATTTGGGAACTTAAGCATAGAATGTAAAATTTAAAAATGCTAGTGGATCAGTGCTTCTTCTAATTATTAGTTATTTTTACCTTTTCTCCTTCGTGTTTTCTTAGTTAATTCTTTGTATTTTTGGTTATTTT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MAEMDAAGAPATDTPSWFTPKRLLAIFCVINLLNYIDRGAIASNGVNGSQGTCTASGTCTSGTGIQGEFSLSNFEDGVLSSSFMVGLLVSCPIFATLAERINPFRLIGVGLSVWTFAVIGCAASFNFWSISICRMLVGVGEASFVSLAAPFIDDNAPASQKSAWLGIFYMCIPSGYAIGYIFGGLVGGNYNWRIAFVGEAILMLPFVILGFVIKPLQLKGFSPSGSYGKLRSADLVASEVQETEASNGNGGAFSIAEDSSVKSSSFATNGRNQLSKFGKEMKELLVNKVYVINVLGYMAYNFVLGAYSYWGPKAGYSIYHLSNADLVFGGITVVSGILGTLGGGYVLDFMSNTISNGFKLLSVTTFVGAILCFSAFCFESVYIYLALFSIGELFVFAIQGPVNYINLEAVKPSLRPLSMAMSTVAIHIFGDVPSSPLVGVLQDHVNNWRVTSLILTAILFPAALIWFAGVFLPSVKSLDDDDHHEDSTTNQSSTTPLLEEKLINIAESSSEP Homology
BLAST of CmoCh04G004480 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9FLG8 (Probable sphingolipid transporter spinster homolog 2 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At5g64500 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 641.0 bits (1652), Expect = 1.2e-182 Identity = 325/486 (66.87%), Postives = 390/486 (80.25%), Query Frame = 0
BLAST of CmoCh04G004480 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: F4IKF6 (Probable sphingolipid transporter spinster homolog 3 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At2g22730 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 552.7 bits (1423), Expect = 4.2e-156 Identity = 280/457 (61.27%), Postives = 356/457 (77.90%), Query Frame = 0
BLAST of CmoCh04G004480 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q6NMN6 (Probable sphingolipid transporter spinster homolog 1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At5g65687 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 535.8 bits (1379), Expect = 5.3e-151 Identity = 271/494 (54.86%), Postives = 361/494 (73.08%), Query Frame = 0
BLAST of CmoCh04G004480 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: A2CER7 (Protein spinster homolog 3 OS=Danio rerio OX=7955 GN=spns3 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 118.2 bits (295), Expect = 2.7e-25 Identity = 119/477 (24.95%), Postives = 202/477 (42.35%), Query Frame = 0
BLAST of CmoCh04G004480 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q5XGK0 (Protein spinster homolog 1 OS=Xenopus laevis OX=8355 GN=spns1 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 113.2 bits (282), Expect = 8.5e-24 Identity = 119/457 (26.04%), Postives = 195/457 (42.67%), Query Frame = 0
BLAST of CmoCh04G004480 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1FMT4 (probable sphingolipid transporter spinster homolog 2 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111447236 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 993.8 bits (2568), Expect = 2.6e-286 Identity = 512/512 (100.00%), Postives = 512/512 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of CmoCh04G004480 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1J8R8 (probable sphingolipid transporter spinster homolog 2 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111484474 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 988.4 bits (2554), Expect = 1.1e-284 Identity = 509/512 (99.41%), Postives = 511/512 (99.80%), Query Frame = 0
BLAST of CmoCh04G004480 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BYL8 (probable sphingolipid transporter spinster homolog 2 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103494846 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 897.9 bits (2319), Expect = 2.0e-257 Identity = 453/513 (88.30%), Postives = 486/513 (94.74%), Query Frame = 0
BLAST of CmoCh04G004480 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0KZT1 (MFS domain-containing protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_4G179120 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 882.5 bits (2279), Expect = 8.6e-253 Identity = 444/512 (86.72%), Postives = 480/512 (93.75%), Query Frame = 0
BLAST of CmoCh04G004480 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1D6D9 (probable sphingolipid transporter spinster homolog 2 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111017695 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 867.1 bits (2239), Expect = 3.7e-248 Identity = 439/499 (87.98%), Postives = 470/499 (94.19%), Query Frame = 0
BLAST of CmoCh04G004480 vs. NCBI nr
Match: XP_022942046.1 (probable sphingolipid transporter spinster homolog 2 [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 993.8 bits (2568), Expect = 5.5e-286 Identity = 512/512 (100.00%), Postives = 512/512 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of CmoCh04G004480 vs. NCBI nr
Match: KAG7030916.1 (putative sphingolipid transporter spinster-like 2 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]) HSP 1 Score: 988.8 bits (2555), Expect = 1.8e-284 Identity = 510/512 (99.61%), Postives = 510/512 (99.61%), Query Frame = 0
BLAST of CmoCh04G004480 vs. NCBI nr
Match: XP_022986867.1 (probable sphingolipid transporter spinster homolog 2 [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 988.4 bits (2554), Expect = 2.3e-284 Identity = 509/512 (99.41%), Postives = 511/512 (99.80%), Query Frame = 0
BLAST of CmoCh04G004480 vs. NCBI nr
Match: KAG6600258.1 (putative sphingolipid transporter spinster-like 2, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 988.0 bits (2553), Expect = 3.0e-284 Identity = 509/509 (100.00%), Postives = 509/509 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of CmoCh04G004480 vs. NCBI nr
Match: XP_023547548.1 (probable sphingolipid transporter spinster homolog 2 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 985.7 bits (2547), Expect = 1.5e-283 Identity = 507/512 (99.02%), Postives = 508/512 (99.22%), Query Frame = 0
BLAST of CmoCh04G004480 vs. TAIR 10
Match: AT5G64500.1 (Major facilitator superfamily protein ) HSP 1 Score: 641.0 bits (1652), Expect = 8.4e-184 Identity = 325/486 (66.87%), Postives = 390/486 (80.25%), Query Frame = 0
BLAST of CmoCh04G004480 vs. TAIR 10
Match: AT2G22730.1 (Major facilitator superfamily protein ) HSP 1 Score: 552.7 bits (1423), Expect = 3.0e-157 Identity = 280/457 (61.27%), Postives = 356/457 (77.90%), Query Frame = 0
BLAST of CmoCh04G004480 vs. TAIR 10
Match: AT5G65687.1 (Major facilitator superfamily protein ) HSP 1 Score: 535.8 bits (1379), Expect = 3.8e-152 Identity = 271/494 (54.86%), Postives = 361/494 (73.08%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucurbita moschata (Rifu) v1
Date Performed: 2021-10-25 Position : 0 Zoom : x 1
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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