CmoCh02G013340 (gene) Cucurbita moschata (Rifu) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.TTACTTTTTAGTTTTTGTGTTCAAGAAACCCCGCGATGATTCTTACATTCAGAACACACAAATGGCGCGGACTGCATACAGGAAAAAGTGAAGAATGAGCTAACGAGCTTAATGGGGAAGGAGATTCGGACTTCAAAGCTTGCAAAGCATTGAAAGGGGACTCGCTTCCTCAATTGGGAAGGAACATTACAGAAATTTGCAGAAGAGTTGAAGCAGAGCTCCAATGGAGACGACGCCTGAAGAAAGTGAAGACAAGAGCATCACAATCTCAATTTCACAACGCTCCCGTAGTGTATGGAGACGAATTTTAGCATTTTTTCCATTGCCTCGTGCTTTCAGTTTTCTTTGGAAGCTTTCGGGTTTCCCTCGCCGGAGGAGTCGCAAGATTGGTTTTCCTCTTCCTCAACGTTTGGAGTCGATAAACTCTTCTGTGTAAGTTACTTTCCACTCGGTTCTACACGTTTTCCTCCCCCTGGTTTGTTTGATTTTGCCTAATACGTGTAGAAGAATTATCGTCAATCGAGTTTACTCCTCGTCTTTGCTTGTAGAACATAGCATATTTTCTTCTGTTGAAATCTGTGCTTGTTAAGTTGTTTGTAATTGCAACTCTTTTTATCTTTAGTGATCCGAGTCCGCACCCTGTTGTGCTGGGCGAAATGGCAATCGATGTCACTAATTTACGTTTTCATGAAAGGCCAAGGTTATGATGTTGTATGAATCTTAAGGAAGTTCACAATTCCATCACAATGCAAGTTCTTACCAAGTTAAAGCGCAGGCTTTCTAGGGTTTATAGAGGGTACTGGTTATACATGGTAAATTTTACTCATCATTCTCTTATCTGTGATTCGCTTTGAGCATCATGAACACGTTTATGTCGGTCTTGATTACAATTAGCCGTTGCACTGTGCTCTCTACTGCATAGTTTACTTAGTTTATTAACCATTCTCGCTTGAACTAAACAATTTGGGAGCTCGGGTTGTGTGGGTCTTCTCATAGCAAAATGTTAATTTAGTTTTGAATGCTTTCAATTCTTCTCTAGTTGCATATTCAGACCACGATCTGATCATTGAAGTTGACCTATAAGGTTTGCCTCTATAAAATTCTCTAACGACTCCAAAGGTAGTTTGCAAACTAGCACTCACTCAGCAACGATTCAAGTCCTCCTCATGCCTCCTACAAAGAATGCACCATTGTGGGTACAAAACTAAGGAAAAATGTCTTTGAACGCGATCCAAAGTATTAGCCCTCCCAAGTAAATCTTGCCACACACAAAATTTCACGTTCTTAGAAATTTTAACCTTCAAGTGAAAGGCGAAAACAGTAATCTTAGGAGCAGCTAACAAGGTAGGAGGGAAAAACACAATTGTCTCTTTGTTAGTCTCAGTACGATGAAATCTTAGAGAGATCGAAGAAGGTCAGGTGAAGGCGACATCAAGGCTACCAAATGCAACCTTTTTTCAGAAAGGAAGTAAAGAAGAAGGAATAAGATGCAGAGGTTTATCACCCATCCGACACATGGTACTCCCAAAAATAAATTTATTATTCAAACTTTAATGCTAACTCTGCAATTTTAATGAAACTAAGTGTAACGGCTCAAGCCAACTGCTAGCAGATATTTTCCTCTTTGGGCTTTCCCTTCTAGGCTTCCCCTAAAGGTTTTAAAACGTGTCTGCTAGGGAGAGGTATTCACATCCTTATAAAGAATGCTTCGTTCTCCTCCCCAACCGATGTGGGATCTCACAATCCACCCTCCTTCGGGGCCAGCATCCTCGCTGGCACTCATTCTCTTCTCCAATCGATGTGGGACCCCTCAATCCACCCCTCCCTTAGAGCCCAACGTCCTTGCTGGCACATCGCTTTGTGTCCACCCCCCTTTAGGGCTCAGTCTCCTCACTGACGCATCGTCTGGTATTTGGCTCTGATACCATTTGTAACAGCCCAAGCCCACCGCTAACAAATATTGTTCTCTTTGGGCTTTCCCTTTCAGGCTTCCCTTCAAGGTTTTTAAAATGCGTTTGCTAGAGAGAGGTTTTCACACCCTTATAAAGAATGCTTCGCTCTCCTCTCCAACCGATGTCTCACACTAAGAGTGGAGTTTCAATAATAAAAGCTGGACTTCATTGACAATCTGTAAACTTCCTGTCAATCATGTTTTGCCAAGTGGACTAAGTATTTCTATTTTATTGAGCAAACAAGGCCAACCATTTGTATTTTGTTCAGTGCTTCAAAACGTTACAATTTTGTTCAATATTTAGGACCAGATGACATATTTTTGAAAAAAAACTTCTGATGTTTGAAATTTACAGAAGATGGGTGAGAGGGCTTCAATCTAGAGTTACAACAAACTTTTCCAGTTGTCAATAGAGTAGAGTAGCCATAGTGATTAAAAAGTTGGCAATAGACTGAAAAACCTATCAAAAGCTCATTATTCGTGGTTGAAAACCCTTTGTTTCCTTTTGAACCAAGTAGAATGGGGAGGGGGCTTATTAGTCCGAGGTTTATGTATGTCATTGCATATATTTTCTCAACATTGATTATTGTCTTTAAGCCTGAGTTGATTGATTGGAATCTTTTGCATCACTTTTGATGCATATTGTGACATGTAAAATGTGATAAATTTGAGTAATATTTAGCTGAGGACAATTTGATCATTGTGTGAAATGTAAATTTTTATGCCATGTACATGCTTTGTTGACAAGTGGATGTGTGCTCATCGTAATTGGTTGATGGAAACTGCAATCAGTTTAACAGTAACATGCCTGAAACCCGCGGAGGCATCTAGACTCTATGATGTTTTGGATGATATTTTGGAGCATTGTTTCTCGAGTTTGTATAACATTTGGAAGAACTTGCAGTTCTGGCAATCTCGTGCAGAGGTAAGTCTTTTTTGTTGCCTGGCGTTTTTTGATAAATTTATTTGATGTATATATAGAAGATGCAAGGAGGATAATTTAGGTCCCACATAAGCTTGTCTTTCGAGTGTCTTCAAAAGATCCATTACCCAGTGACATTCTTTCTTCAAAATGCAACATTAGATTATCACAATGGTCCAGCCAATACTAGTCATACTCCAGTCATTCCTTTTTAAGTGTATAGCATCTTCCAAAAAAATCCGATCAATGTAGAATAGCTTCAGCTCACCCAAAGTATACCAAAAAACTGAAAACAACGTGTCCTCTTAAGAGCAGTCAGGAACGATTATGAAACCTTCCCCTCTTTTTCCACACACATTCGTGGAGACAGATCATAAAGGAATCTTTTCCTGCAATGTATCTTTAGTAATAATCTTCTTGTGAGCAATGCTCAAGGAGAGTTTGAACTTATTTGGGCACCTCGACCTTTTAAATCAACTTTTTAGGTGCGAAGTCGACTGGAATCTGAAAAATATGAAGAAGGAACTACAAGAAAAATCTCTCTCGTCAAAAGTCCTTCCCTCATGATTGGATGAAAGATCTGTCGATCCCTTTCAGTTAATTATGCTCGATGACTTTTTAATGCAAGGCATATGATTGTTATCTTTCAGATTCCTATTAAAATTTGGTTGTGAGTGCTTATGTCATTGTTTTCATGAATTTTTCAGGGTACAAATGCTCAAAAAGCTTACTTTATGATTTGTGAGAGAGGTCCAAGGGCCTTTTTTAATGGAACAGTGCAGTTAATGCGCCAGATTTGTAGGGATGGTTTTTCTTTGCAACACGTAGCTCATGATGCATCTTGTTACATAGCTGACCGGATAACTATATTGAGCTACTTAAGAAATCATCTTGCAGCTTTTGTGGCTCAGGTTTGATTGGCTTTCAGCACTCACTTCTCAAATCCAATCCTATCACTTTTGTGGTTTTATTCTATCCTTGAAAAATACAGTCTCTCCTCGAGTCTCAACTCTCTCTCTCTCTCTCACACACACACACACAGTCTCAACTCTCTCTCTCTCTCTCTCACACACACACACACACACACTTGCACACAATTTTAGGACTTGGACTCACGAGACTGGCAGATTAATAGGAGATCAGATTGCAAATTTCTTTTTGGCTTCTGTACGGATTTCTGAGACAATGTTATCTTAACTAGTTTTATTCGTTAGTTATATAATGTTGTTGTCTCTTAACCTGTACTTTGATAAATAATTGCCCGCCCCCTTTTTTATTTCTTCTAATTTTTCTTTTAAGATAAGAAGCAGGCCAAATATAAAATAGGGGAAGATAAACCATCCTTCCATTTAATGGCCGAATGAGATTTAGATGAACCTCTCCTATTGGTTTTAATAACCGTATTTCCCATTGGCTCCATTGAGGTTGTCTCACCACAAATAGTGATTGTTGCAAGTTTAAATTAACTTGCCATTTTTCATATTTAATTTCAGAAGGTACATTTGACTTTTATAATAGAGAGAGGCTAACTAAATTCCTTGATACTTGATACTAGGTAACAAATGATCTAAATAAACTTTTTAGATATTAGGTAACAGTAAGTCTAAATAAATCCCTAGATACTTTGTAACAGGAGATCTAAATAAATTCAGGTAACTTCTAATTCTTTGACAGTTCCCATCGAGTTGAGTAATAGACATCGTTCATTCTTAGTTTGGATACTAACTCATGAAAAGAAAAGGCTCGGACTAGATGGAAATATTTGGTTTTTCACATTTTTTTGCATCCATTTGTCATGAAATATCAATTAAGTAGTTTCTTATAACTTGAGAGTTGTTGGGTGGCAATCTTCTTTTAGTAACTATTTGGGAGGTAGTAGTGATTGAGAAATTTCAAGGGCATTAAAAGGATAATGAGGACTTGCTTATCACAACGGAACTCATCTCCCTCCCTTTCTGCCTTTCCCTTCTTTGATATAATTGCAATTTATCTGCTTGACATTCAAATTTTTGTTGCTTATTTTGATTTTGTTCCCTTGTGGTTCCTGTAGGTCTTTATGAAAACTGACAATATTGGGACAGATTCAGGGAATGATCTACAAAATCCCTTACCATCATTGTT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ATGGAGACGACGCCTGAAGAAAGTGAAGACAAGAGCATCACAATCTCAATTTCACAACGCTCCCGTAGTGTATGGAGACGAATTTTAGCATTTTTTCCATTGCCTCGTGCTTTCAGTTTTCTTTGGAAGCTTTCGGGTTTCCCTCGCCGGAGGAGTCGCAAGATTGGTTTTCCTCTTCCTCAACGTTTGGAGTCGATAAACTCTTCTGTTGATCCGAGTCCGCACCCTGTTGTGCTGGGCGAAATGGCAATCGATGTCACTAATTTACGTTTTCATGAAAGGCCAAGTTTAACAGTAACATGCCTGAAACCCGCGGAGGCATCTAGACTCTATGATGTTTTGGATGATATTTTGGAGCATTGTTTCTCGAGTTTGTATAACATTTGGAAGAACTTGCAGTTCTGGCAATCTCGTGCAGAGGGTACAAATGCTCAAAAAGCTTACTTTATGATTTGTGAGAGAGGTCCAAGGGCCTTTTTTAATGGAACAGTGCAGTTAATGCGCCAGATTTGTAGGGATGGTTTTTCTTTGCAACACGTAGCTCATGATGCATCTTGTTACATAGCTGACCGGATAACTATATTGAGCTACTTAAGAAATCATCTTGCAGCTTTTGTGGCTCAGGTCTTTATGAAAACTGACAATATTGGGACAGATTCAGGGAATGATCTACAAAATCCCTTACCATCATTGTTGGTTGCATTGAATGGCTTATTTCTCGATCTAGAGACATCAATTTATGAACTGCATACAACACTTAATATGGATTTCCATCACAGATTTTCATTTCCTCTATTTAAAAAATTACCGGATGTGAACAAGGAAGGATCTCAGTGGACGAGTTGTGAAATTGGAGATGCTATCAACTTGCTTTGTCAGAACTTTCACAAGTTGGACTCTGTCATATCTATTATTCTTATTTCAATTAGAGATGAACTTTTTGCTACATTTAGAAAGAGGCATAAAGGTATCATGGATGGTCAAGATGTTCAGTTAACTACCGACTCCCTGCGCAGAATGTTACATGCTTTCAGTGAGCACACGGAAGGTCGGAAGTTTGCAGATGCTGCATCAGATGAAGAAATGTTTGCGAAGGTTATGTTCAGGTATGAGAAAGAATTGAGGCATCCCGTTCAAAACCTTCTTAGTGGAGAACTGGCCCGTGCTTTGCTTATCCAGGTGCAGAAGCTAAAATTGGATCTTGAGACGGCAATGCTTGAGCTTGACCAGATTCTCAAGGCAAATGAAATCAATTTCGCTGTTCTAGCTGCATTGCCAGCATTCTTTATCTCACTTCTTTTGTTGATGCTTTTGCGTGCATGGTATATGCAGGATACCAGAGCTGAAGGGAAGGGAAGAGCTGCTCGGCTTCAGAGAAGGCTATTAGTTGTGGAGGTGGAGAAAGCAATTATGCAATACCAGAGTTCTGTTGACCAAGGACATGTAAAAAATGCAGAAAGTAGTTTTGGGTTACTGTTGTATAGTTTGGGTCGACTATACCATGCTTCTGAGAAGCATGCCAAAGCAACTGGTGAATGGCTAGCTTGCCTTGGTTTATGTGTTTCTTACTCTGTTAATGCTGGCTTGTTCTGTATAGAGAAAGAGAATTTCAGTGAAGTTCATGATGCAAGAAGGTACCTATTACCCTTTACAAGTTCTAGGTCGGATCTTGATGCTACGACCTCTGAAGATCAAGCTGCTTCACTACACAAGAGAAGAAGAATTGCCTCTAGTGCTGACATTTCATCTCATGATCATTTGAAGGAGCTTAAAAATTCCTTTCCAACATTGCAGTCTCCTGATTACTATATGTCTCCAAGCTTAGAGGAACTGTCTATCCATGTCCTGGAAGATCCGGATTATGTTAGTCAGGTGTTAGATTTTACGATAGGACGTTGTGGTTATGGATCTGTCAAGTTTCTTGGGAAGACTGATATCAGATGGTTAGATTTAGACCAAATTGTCAAGTTTCATAGGAATGAAATAATTGTGTATGAAGATGAAACTACAAAGCCTGTAATTGATCAAGGCCTGAACAAGCCTGCTGAAGTTACTTTAGTTCTCCGGTCAATAACAGCCAGCTTTTTGGAGAGGCAATATGATAATGTTGTGAAGAAATTGAAGTACATTTCCGAGAGACAGGGAGCTCGCTTCATTTCATTTGATCCAGAAAATTGCAAATGGAAGTTCTCAGTTGACCATTTCAGCCGGTTTGGCTTGACGGAAGACGAAGAAGAAGATATTGTAATGGATGATGCTAATGCAGGACAAGATTCTGCAGAAATGAACTGCAACGAGATTTCTGATAATAATGAAAATAATTCAATGGATTTCACTGAATCTGTGCTTTGCCATTCTCTGCCTGCTCATCTTGGGCTTGATCCATTAAAGATGAAAGAAATGAGAATGGTCATATTTCCTGAAGATGAGCAGGAATTTGAGGATTATAGTGAATCCCCTAAATTTCAAAAGTCATTCACAGGTAGAGAACTTATGAGATCTCCTCTTAAGGATTCTTCTCAGAGAACGAGCCAAAAATTGAATTCTCCAGTTGTCAGAAAGACTCCATTAGCATTGCTTGAATATAAACAGGGTAGCCTTGACTCAAGTCCTCCGGGTTCTATTTTGCTGTCCCAACCAAAAAAGGTAACTCCTGTTAAGCCCTGGAAGGCAGAAGGTTTTAAGCTGGATCTCACGCAAGAAACTCCAATTACTATAAATCATTCTCGCAACATAGTCGATGCAGGTTTGTTTATGGGTAGGTCATTTCGCGTGGGATGGGGTCCTAATGGCATCCTAGTTCATACTGGAAATTTGGTGGGGAGTACAAATTCACAGAATGTCCTATCATCCGTAGTAAATGTAGAGAAAGTTGCCATTGATAATGTGGTCAGAGATGAAAATAGTAAAGTGTGTAAAGAACTAGTTGAATTTGCTTTTGATCTTCCTTTAAATTTACACAAGGAAATGAATCATGAATTTGAAGAAGAAGTGGGATCCTCCAATTTGAAACTTCAAAAGGTTGTCTTCAATCGTCTAATGCTTTCAGATATCTGTAGGGGCTATATAGATATTGTTGAAAGGCAACTTGAAGTTCCTGGATTACCTTCTTCTACTCGTGTAGTCTTGACACATCAGATAATGGTCTGGGAGTTAATAAAAGTTCTTTTTTCTGAAAGGGAAAATACTGGGAATTTGAGAAATTTGACCGATGATAATGAGGAAGACATGATGCAGGATATGAAAGAAGCTTCTCTGGAAGTTGACCTGGAAGCACTCCCTCTTATTCGGAGGGCTGAATTTAGCTGTTGGCTGCAAGAGAGTGTTTTCCCTCAGGTGCAATATGAATTGGGTTCATTAAATGATTCCAGTTATCTTGAACATATATTTCTTCTTATGACTGGGCGGCAGCTGGATGCAGCAGTCCAACTTGCTTCATCTAGAGGTGATGTGAGACTTGCTTGTTTGCTGAGTCAGGCTGGTGGATCCACTGTGAATCGCACAGATGTAGCTCTACAACTTGCTATTTGGAAAAAGCATGGAATGGATTTCAGCTTCATTGAGGAGGAACGGACAAGGTTATATGAGTTGCTGGCAGGGAATATATATGGTGCTTTGCACCATATTAAACTTGACTGGAAGAGATTCCTAGGGCTGTTGATGTGGTATCATCTACCACCAGATGCCACTTTGCCTGTAATCTTTCACTCTTATAAACATCTTCTTAAGAATCGAAGGGCCCCACTCCCTGTTCCAGTTTATGCTGATGAGCCGCAAGAACTTGCTCTGGAGTCTAATTCGAAGGAATGTCTTGACCTCTCATACTTTCTCATGCTTCTTCATGCTAATGAAGATCCTGAATTTGGTTGTCTTAAGACTATGTTAAGTGCCTTCTCATCAACAGATGACCCACTCGATTATCACATGATTTGGCATCAACGTGCAGTGTTGGAAGCTATTGGTGCAATCAGTTCTAATGATTTGCATAGTCTGGATATGGCATTCGTCTCTCAATTGTTGTGTTTGGGACAATGTCATTGGGCCATCTATGTGGTCCTTCACATGCCTTTCCGTGATGATTTTCCACACCTCCAGGCTAAAGTTATCAGGGAAATCCTATTCCAGTACTGTGAAATATGGAGTTCACAAGAATCACAATTAGAATTTATTGAGAACTTGGGTGTTCCAAGAATATGGCTACACGAGGCTATGGCAGTTTTTTTCAGTTACCATGGAAATCTTCCAGAGGCCCTTGAACATTTCATTGAATGTAGAAATTGGCATAGAGCTCATACTATTTTTATGACTTCAGTTGCTCACAGATTATTCCTGTCGGCTGAGCACTCGGATATATGGAAGCTTGCTACTTCAATGGAGACCCACAAGTCTGAAATAGTAAATTGGGAACTCGGAGCTGGACTTTATATATCGTTCTATTCACTACGAAGTTCTTTGCAGGAAACCGATGAAGCGAGCGAATTGGACTCGCTTGAAAGCCGAAATGCTGCTTGTGGGAAATTTCTTGGTCGATTAAATGAATCATTGGCAATTTGGGGTGACAAATTACCAGTTGAGGCAAGAGTTGTGTACTCAAAGATGGCCGAGGAGATCAGTAAATTACTTTTATCAGATATTGGGGAGGGTTCTACGCGTGATGCTCAGTTAAGCTGCTTTGACACTATTTTTACTGCCCCATTGCGAGAAGACCTGCGCTCAAGTCACTTGCAGGATGCAGTTTCTCTTTTTACTTGTTACCTGTCTGAAATCACATCATAG METTPEESEDKSITISISQRSRSVWRRILAFFPLPRAFSFLWKLSGFPRRRSRKIGFPLPQRLESINSSVDPSPHPVVLGEMAIDVTNLRFHERPSLTVTCLKPAEASRLYDVLDDILEHCFSSLYNIWKNLQFWQSRAEGTNAQKAYFMICERGPRAFFNGTVQLMRQICRDGFSLQHVAHDASCYIADRITILSYLRNHLAAFVAQVFMKTDNIGTDSGNDLQNPLPSLLVALNGLFLDLETSIYELHTTLNMDFHHRFSFPLFKKLPDVNKEGSQWTSCEIGDAINLLCQNFHKLDSVISIILISIRDELFATFRKRHKGIMDGQDVQLTTDSLRRMLHAFSEHTEGRKFADAASDEEMFAKVMFRYEKELRHPVQNLLSGELARALLIQVQKLKLDLETAMLELDQILKANEINFAVLAALPAFFISLLLLMLLRAWYMQDTRAEGKGRAARLQRRLLVVEVEKAIMQYQSSVDQGHVKNAESSFGLLLYSLGRLYHASEKHAKATGEWLACLGLCVSYSVNAGLFCIEKENFSEVHDARRYLLPFTSSRSDLDATTSEDQAASLHKRRRIASSADISSHDHLKELKNSFPTLQSPDYYMSPSLEELSIHVLEDPDYVSQVLDFTIGRCGYGSVKFLGKTDIRWLDLDQIVKFHRNEIIVYEDETTKPVIDQGLNKPAEVTLVLRSITASFLERQYDNVVKKLKYISERQGARFISFDPENCKWKFSVDHFSRFGLTEDEEEDIVMDDANAGQDSAEMNCNEISDNNENNSMDFTESVLCHSLPAHLGLDPLKMKEMRMVIFPEDEQEFEDYSESPKFQKSFTGRELMRSPLKDSSQRTSQKLNSPVVRKTPLALLEYKQGSLDSSPPGSILLSQPKKVTPVKPWKAEGFKLDLTQETPITINHSRNIVDAGLFMGRSFRVGWGPNGILVHTGNLVGSTNSQNVLSSVVNVEKVAIDNVVRDENSKVCKELVEFAFDLPLNLHKEMNHEFEEEVGSSNLKLQKVVFNRLMLSDICRGYIDIVERQLEVPGLPSSTRVVLTHQIMVWELIKVLFSERENTGNLRNLTDDNEEDMMQDMKEASLEVDLEALPLIRRAEFSCWLQESVFPQVQYELGSLNDSSYLEHIFLLMTGRQLDAAVQLASSRGDVRLACLLSQAGGSTVNRTDVALQLAIWKKHGMDFSFIEEERTRLYELLAGNIYGALHHIKLDWKRFLGLLMWYHLPPDATLPVIFHSYKHLLKNRRAPLPVPVYADEPQELALESNSKECLDLSYFLMLLHANEDPEFGCLKTMLSAFSSTDDPLDYHMIWHQRAVLEAIGAISSNDLHSLDMAFVSQLLCLGQCHWAIYVVLHMPFRDDFPHLQAKVIREILFQYCEIWSSQESQLEFIENLGVPRIWLHEAMAVFFSYHGNLPEALEHFIECRNWHRAHTIFMTSVAHRLFLSAEHSDIWKLATSMETHKSEIVNWELGAGLYISFYSLRSSLQETDEASELDSLESRNAACGKFLGRLNESLAIWGDKLPVEARVVYSKMAEEISKLLLSDIGEGSTRDAQLSCFDTIFTAPLREDLRSSHLQDAVSLFTCYLSEITS Homology
BLAST of CmoCh02G013340 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8LLD0 (Nuclear pore complex protein NUP96 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=NUP96 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 1239.2 bits (3205), Expect = 0.0e+00 Identity = 624/1023 (61.00%), Postives = 789/1023 (77.13%), Query Frame = 0
BLAST of CmoCh02G013340 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8GUK1 (Protein DGS1, mitochondrial OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=DGS1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 429.5 bits (1103), Expect = 1.7e-118 Identity = 250/564 (44.33%), Postives = 335/564 (59.40%), Query Frame = 0
BLAST of CmoCh02G013340 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P52948 (Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NUP98 PE=1 SV=4) HSP 1 Score: 272.7 bits (696), Expect = 2.6e-71 Identity = 285/1127 (25.29%), Postives = 488/1127 (43.30%), Query Frame = 0
BLAST of CmoCh02G013340 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P49793 (Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96 OS=Rattus norvegicus OX=10116 GN=Nup98 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 271.2 bits (692), Expect = 7.6e-71 Identity = 311/1195 (26.03%), Postives = 503/1195 (42.09%), Query Frame = 0
BLAST of CmoCh02G013340 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q6PFD9 (Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96 OS=Mus musculus OX=10090 GN=Nup98 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 261.5 bits (667), Expect = 6.0e-68 Identity = 307/1196 (25.67%), Postives = 505/1196 (42.22%), Query Frame = 0
BLAST of CmoCh02G013340 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1H2Q3 (nuclear pore complex protein NUP96 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111459484 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 2115.1 bits (5479), Expect = 0.0e+00 Identity = 1057/1060 (99.72%), Postives = 1058/1060 (99.81%), Query Frame = 0
BLAST of CmoCh02G013340 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1JXJ5 (nuclear pore complex protein NUP96 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111490694 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 2062.7 bits (5343), Expect = 0.0e+00 Identity = 1035/1060 (97.64%), Postives = 1042/1060 (98.30%), Query Frame = 0
BLAST of CmoCh02G013340 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DHS9 (nuclear pore complex protein NUP96 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111020613 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1861.7 bits (4821), Expect = 0.0e+00 Identity = 925/1058 (87.43%), Postives = 987/1058 (93.29%), Query Frame = 0
BLAST of CmoCh02G013340 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BNC9 (nuclear pore complex protein NUP96 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103491446 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1841.6 bits (4769), Expect = 0.0e+00 Identity = 915/1061 (86.24%), Postives = 978/1061 (92.18%), Query Frame = 0
BLAST of CmoCh02G013340 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7V5H9 (Nuclear pore complex protein NUP96 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold212G001210 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1831.6 bits (4743), Expect = 0.0e+00 Identity = 911/1061 (85.86%), Postives = 977/1061 (92.08%), Query Frame = 0
BLAST of CmoCh02G013340 vs. NCBI nr
Match: XP_022958180.1 (nuclear pore complex protein NUP96 [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 2115.1 bits (5479), Expect = 0.0e+00 Identity = 1057/1060 (99.72%), Postives = 1058/1060 (99.81%), Query Frame = 0
BLAST of CmoCh02G013340 vs. NCBI nr
Match: KAG7035903.1 (Nuclear pore complex protein NUP96 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]) HSP 1 Score: 2098.9 bits (5437), Expect = 0.0e+00 Identity = 1051/1060 (99.15%), Postives = 1054/1060 (99.43%), Query Frame = 0
BLAST of CmoCh02G013340 vs. NCBI nr
Match: XP_023533339.1 (nuclear pore complex protein NUP96 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 2085.8 bits (5403), Expect = 0.0e+00 Identity = 1043/1060 (98.40%), Postives = 1049/1060 (98.96%), Query Frame = 0
BLAST of CmoCh02G013340 vs. NCBI nr
Match: KAG6605954.1 (Nuclear pore complex protein NUP96, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 2065.4 bits (5350), Expect = 0.0e+00 Identity = 1033/1041 (99.23%), Postives = 1036/1041 (99.52%), Query Frame = 0
BLAST of CmoCh02G013340 vs. NCBI nr
Match: XP_022995012.1 (nuclear pore complex protein NUP96 [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 2062.7 bits (5343), Expect = 0.0e+00 Identity = 1035/1060 (97.64%), Postives = 1042/1060 (98.30%), Query Frame = 0
BLAST of CmoCh02G013340 vs. TAIR 10
Match: AT1G80680.1 (SUPPRESSOR OF AUXIN RESISTANCE 3 ) HSP 1 Score: 1239.2 bits (3205), Expect = 0.0e+00 Identity = 624/1023 (61.00%), Postives = 789/1023 (77.13%), Query Frame = 0
BLAST of CmoCh02G013340 vs. TAIR 10
Match: AT5G12290.1 (dgd1 suppressor 1 ) HSP 1 Score: 429.5 bits (1103), Expect = 1.2e-119 Identity = 250/564 (44.33%), Postives = 335/564 (59.40%), Query Frame = 0
BLAST of CmoCh02G013340 vs. TAIR 10
Match: AT1G10390.1 (Nucleoporin autopeptidase ) HSP 1 Score: 151.4 bits (381), Expect = 6.2e-36 Identity = 80/200 (40.00%), Postives = 119/200 (59.50%), Query Frame = 0
BLAST of CmoCh02G013340 vs. TAIR 10
Match: AT1G10390.2 (Nucleoporin autopeptidase ) HSP 1 Score: 151.4 bits (381), Expect = 6.2e-36 Identity = 80/200 (40.00%), Postives = 119/200 (59.50%), Query Frame = 0
BLAST of CmoCh02G013340 vs. TAIR 10
Match: AT1G59660.1 (Nucleoporin autopeptidase ) HSP 1 Score: 127.9 bits (320), Expect = 7.4e-29 Identity = 63/161 (39.13%), Postives = 98/161 (60.87%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucurbita moschata (Rifu) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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