CmoCh02G011360 (gene) Cucurbita moschata (Rifu) v1

Overview
NameCmoCh02G011360
Typegene
OrganismCucurbita moschata (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationCmo_Chr02: 6880549 .. 6886670 (-)
RNA-Seq ExpressionCmoCh02G011360
SyntenyCmoCh02G011360
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
GTTTCCAAAAGAAGAGCCAATGAAATGCTTTCGAGTAATCACGCCATTAGTATATACACAAGCAACCTCCATTGGACGCATGTTCAGCCAATCCCTTCCAGCGCCATGGTATTTTCTTGGTTTATTGCCTTACGATCGAAAATATTCTTCATCTCTTCCACAATTTCAATGAATTCAGCCGTTTCTGGAGGTGTTTTGAGTGGAACGAGAAGGTAAATTGGATTGGATGTTCTTGTGATGAGTGTTAAAATTTATGCGAGTTTTCTCCTATCTCGTTAATCAACTTTCACTCGTCTTGAAGAACAAAATTGGCGATTTCGGCATTTCATAGCTTTGATCGGTGCGTTGTTCTAATTGGTTATCTTCCTTCTGATTTAATTAGGGCTTCGAAGACAATATACTGCTGTAGTTCAATTATTTCTATTTGCAGTTAGAATGTTTAGATTATGAACAAGTTTTCTTCCATATCAAGGTATGTTTTTCCTATGTCAGGCCATTGTAGAAGGATTGCAGGAAAATGGTAAGTTGTGACTGGAAAAGTGGAGTAGAGCGTCTTACATTTTCTCTGTGCTGTAGTTTTCCCCACTAGACTAAATAATTCGTGGCAATATTCTTCCGTGAACATTTCTTTTTTTGATTTAACTTGGACATCCATTTTCTTTCTGATTTCAACTCATCTTGTCTGCCTATTGGAAACATGGACTTTTGTTTGGATTTGAAATAAACTGCTCATTCTCTTTGGACTGGAAAGGTTACTTTTAGAACAAATGAAGATTCATTGGGCTATTATGACGATAACTCAACTGAAAATAACTTGAAGTTTTTCTATTGAATTATGGTCCTCTTTAGGCTTTCTCTTTCGGACTTCCCTAAAAGTTTTTAAAACGTGTCTACTAGGGAGAGTTTTATGCACCCTTTATAAAGAATGTTCCGTTCTCCTCCTTAACCGATGTGGATCTCACAGTCCACCTGGCACTCGTTCCCTTTTCCAATCGATGTGGGACCCCCAACCCACCTCTCTTCGGGGCCCAACGTCCTTGCAAGCACACCGCCTCATGTCCACCCTCTTTGTGGCTCAGCCTCCTCGCTTGCACATCGCCCGGTGTCTAGCTCGAATACCATTTGTAACGGCCCAAGCTCACCACTAGCAGATATTGTCCTTTAAAATGCACCTACTAGGAAGAGGTTTCCACACCCTTATAAAGAATGTTTTGTTGTCCTCTCCAACGAACGTGGGATTTTACAAAGGTCATCGGATCTAATTACACAAGACTATTGGTTCTCTTGTTTGTTTATTCTGAAATGGAAACTCCTCCATGATTTGCTTCGTCTCTTAGCATTATTCGCATTTCTGGTCACCATGTTTTTTACTACTTGATGTCGTAGTTGTAATTTTAACCTACGAGCTTTGTCATTTTATGAATATTGGAAAAGGCATCTGGATACATCAACTAAGAGAACTAAAAGTTTCTTGGCCTGTTCTTGGGGAATCAAAAAAGGAAACAAAAATGGTCCTTTTATATGTATCTGTGACAGTCATCACCCCCTTGTCATAGCAGTTGGCAATAAGCCTCCATTCTTCAAAAAATTGCTTAGCTGCTTACCTTGGTGATATGTAAAGGATCAATATATGGCAAAAAGAAAGTGCATTGCACAAAAGTTCGAAGTGGGGGATCTCAATCGGCTCTCACCTTCAGTTGTTCCTTACCTCTACCTTACAGACAAGGGCCTTCAACTACGGCAATCACTTCAAACCTTCCACTTAAAGTCACATGCCTTAGATTTTTATCTATCTCAATCTGTCTTCTTCTACTTTGTCTTCTATGCTCAACAGGATTACATTGCAAAAAAAGGTATGATACTACATTATTTTTGTGAATGGCTTCATTGGCTGTTAGTGCTATACAGCGTTGTATTTGTGACTTTAGTTGTAGACTGCAAATTGATAATTGTAATACTTGTTGTCTACTGCACATTGAACTGCCTATGTGATTGATGACCGTGGGATCTTGTGCAACTTACATTTCTTCACAACATGTTGAATTAATTAGATGTACATTAAGAGGGTGTTCGGGTTACAGGGTGGTTTTGTTCGGCGTACGATGGAGAGGTAAGCCTATATATGATATGTTGGCCTATTTATCATATATTATAAATTTGTTAATCTTACAGGCTATATATACTCGGGAGTCAGGTATCGACTATTCACTAATTTTTGCACTTCACCACTCTGGTCGTCTCTAATCCGTGAGCCAAGTACTAGATGTATGCATGGTTAAAAATTACGGATCTCCGCAATGGTATGATATTGTTCACTTTGAGCATAAGCTCTCATGGCTTTGCTTTGGGCTTCCCCAAAAGGCCTCATACCAATGGAGACCTATTCCTTTATTTATAAACCTATGATCTTCCATTAAATTAACCAACGTGGGACTCACTCCCAATAGTCCTCAACAATCCTCCCCTCGAACAAGTACACTATAAGCCTCCCTTGAGGCTTATGGAACTCTTGAATAGCCTCCCCTTAATCGAGGTTCACAATTCTTTGTTCGATATTTAAGGATTCTATTGACATGGCTAAGTTTAGGACATGACTCTGATATTATGTTAGGAATCACGGATCTTCACAATGGTATGATATTGTCCACTTTGAGCATAAGCTTTCATGGCTTTGCTTTGGGCTTCACCAAAATGCCTCATACTATTGGAGATCTATTCCTTTACATATAAATCCACGATCTTCCACTAAATTAACTTAGGTGAGACTCACTCCCAATAATCTTCGACATGCATTAGACAGACGTACACGTTATACATTTTGCCTTTTGTATGTCTAGCACACTGTATATCCACGTGAAAGCACTTCATCTCTCTCTTAGTGACCCACGAGAAAACAAATGAAGTGCATTTTGTGCCTGATGTTCGGAAAGCTATGTAAAAACAAGCATATATGTGAAGGTTCTTTTCTTTCTGTCCAAAAACTCATTGAATTACATGAAGTATTATTTGGCTGCAGTTTTCTGTGAACTAACCAAAGGACTGTGCTGTGACAGCCAAAATCAAGTTGCCTGAGGAAGCTGCTTGGAAAGCAAACACGTACACCATGGATCCAATTATTCATTCTCATCAGCTCCATTTTTTAAAAGGATAATACAGCTTTCATTTGAAAGCTTATATTTATTTATTGCATCTGCAATGATGTGAAGAGTCAAATCTTTTGATCTCTTGGTCGAAGCTATATGTATAAACTAGTTGAACTATGTTCAGGTCGACAAAACTTACATGGTTGTTTGAACAATACTTATACACGGCTTAGTAGGAGCTTCGGTCTATGTTCTTCGTTGCTCTATACAATATAATAGAAAAGGAAATAGAATGACTTTGAAGCTTTTGTAGTTCTAGAATTTGATCATTTTATAGTTTAATTTAGTTGTTGAGATAAGTTTCCAGTTGAAATTGAACCATCATGTTTATTCATTTCCTTTCCTTTTACCTTTCTAAATATGGTTTGAAATTTATAAAGATTAATGTCTCTCAACCAAACAATCACGTGCTTCGTTTAATGCGCCAAATTCAACCATAAATGTGGTTGAATTCAAACCTGTTTTTTTTTGGTACTTTTCTTAATGATACAAACATGTGCCTTAAATGTAGTGAAAACCAATTAAAAAAAATTCCCTTTGCTTGGTTATTATTGTGCTATGAACTATTCATATGTTCTTGAGAGTCGGGCCGTCTTAAGAAACCATCTTTTCACCTTTTTAGTCAGATGTGCAATAATATAGATTCATTTTCAGTTCAATCCATCAGGTGAGTTGAAGATTCGAACTTTCAGTCTGTAGATGAGACTTATAATAGTCTAATGGATCGAGTTATACTCAGATTAGCTACCTACTCATTAGTTACTTTATTTCGAAGGTCAGTTACTTTTGTCTGGTATATCATTACTTATAAACCTACTATTAATCATTGAAAAATCAATTTAATGTTTGATTTTGCATTTCTACATTATTTCTCGTACCATAAAAATAGTTTTCAATAATGAAAAACACGTTCTTTTAGTAATTTAAATAGCATAAAAAATGATTTCAACCATTTCAATGTTATCCTCCAAACGAATTCTAAAATTTATCTAAAAAAAACATTCGAGATAAAAAAATTATTAAATTTTAAGATAATTTTCTTGTATTATTTTTATTTCGATAATTTAAAAAAATCTAAATTGTAAAACTTCATCACATAAAATGAGGTTTTTTTCTTTATATTATAAATATTAATGACATTCATATTTTAAACTTAAAAATTAAAAAGGAAAATAATAAAATAAATATATAAGAAACAAAAGGAAAGTATTAAACTTACAACATTTGGCATAATAATTATCAGTAACAAATATAAAAACAAATAAAATTTGTAAATTCAAATTTGATTAATAAATGTTCCCTTACCATTTTTCCTCCCAATTTTTATTTGGAAGAAAAATACATCATAAATAATTAACTATATTTAGCATATTACAAACCTTATACTAGAGTTAAAATCTAACTCTAGTTAAGGAAGTTTTTTTTTTTGTTCTCCCATAAAAAAATAATAATAAAAAAAAAAAGAGGAGAGAGAAAAAGTTAAATATTAACCAAATCCATAATTCTTAATTTTTTGTCTCCCCCAAAAATTCAGTTTTTTTTTTTTTTGGGGGCATTTGGAAAATCTCTCAGGCTCTCAGGGGGTTTTGACAAATGGGTCACTGTACATGGCGATGGTCTTCTCAGATTCAAATCACTTCAAACTCGGAACCCTCCTATTTTTTTTCGTATTAGGTAATTCTTTCTACCATATTCTAATTTTTATGATTCCGATTCAGTTTCCTTTCTGTTTACATCTGTTCCCCCTAAGTTTCGGTTGTTCTAGGGTTTCTTTTTCACTACTGGATTGCTTCAATTCAAATGCTCTTACCAAAATTTGACCGTTAACTTTGAGCTCTAATCCCTTGGTCTTGGATCATTCCTTAGTTGCTAGTTGTTCCGATTCGTTGTTTTTCTTAACTGTCGGTTACTGTTCACTGGCTTTCAAGTTCGGAATCGTTTTAATTTCGTAGCTGAATTTGCGATGGGGTTTTTAGGAGAATGTGGGTTTAAATTTGTGAAATATATCGTTAATTCAGCTTCTGGAACTGTCGATACAATGTGCGGTGGCTCGATCGGTCATTTCTCTGTGAAGAGTTCTTTGGCGTATGAGAATAATAAGACCCTGAAAGGAAAATGATCTTATGTGAATATTTTTATAAGTTTATCCGTATGCGTACAGGCTCTGATTTTGGGTGCGTGTATGTAAATTGTAATAGACAGTCTGATAAGCCAATACAAACAATGTTTTACGGGTTGCAATTTACTCTTCTTTCGACCTTGGAAGTTTTGAGGTTAAAGATTAAGAAATTGAATATATGACATAAAGGAAATGCTTCAAACATCCCAAGGACTTGCGAAAAATTGCGCCAATTGAAATTGTTGAAAGAGGATTTGGATAGGTTGCCTGAAATAGAAGCTAAGAGATCTGCCACGTTGTATGTCTCTTCCCAGTTTCTACAGCGTTTTTAAATATCCCTAGGTTCCTATTTGACCACGTTGTATGCCTGCAAATTATTTGCTCATTTGAGTTTTCAGCTGTGCACGGAAGAAAATATTATTATTAAAAACACATAAATAATCTATTCTAACGTTTCAGGCTAAAGGGACACTGAACAAAACATGCTTCACAGTCTATTTGTTAGCTCTAGAAATACGTCGTATTGAGTTGAATGAGTGAATTATCTTTTTTCGTAATAAGATGATGTCCGTGCCTACTATATGCATTGGGGAGTAAAGAAATTAAGGCAATTTATGATGAATAAGAAGATGTATTATAGACTTTGCATTAAATCTGAGTTGGATTTTGTTCAGTTTGTGCTTTATGATTAATATTGATATACATATTAATGCATGAATGTAATCAATCTATCTCTAAGTTTCTTAGGCAATTCCCTTTCCTCAACCTAACTCTCCATAAAAGATCCATTGTACTGCTTACACTTGCAGATGTCCGTATAACTTATTATTTGATTTTGTATCAGGTACTTTAACATCTAA

mRNA sequence

GTTTCCAAAAGAAGAGCCAATGAAATGCTTTCGAGTAATCACGCCATTAGTATATACACAAGCAACCTCCATTGGACGCATGTTCAGCCAATCCCTTCCAGCGCCATGGTATTTTCTTGGTTTATTGCCTTACGATCGAAAATATTCTTCATCTCTTCCACAATTTCAATGAATTCAGCCGTTTCTGGAGGTGTTTTGAGTGGAACGAGAAGGTAAATTGGATTGGATGTTCTTGTGATGAGTGTTAAAATTTATGCGAGTTTTCTCCTATCTCGTTAATCAACTTTCACTCGTCTTGAAGAACAAAATTGGCGATTTCGGCATTTCATAGCTTTGATCGGCCATTGTAGAAGGATTGCAGGAAAATGGTAAGTTGTGACTGGAAAAGTGGAGTAGAGCGTCTTACATTTTCTCTGTGCTGTAGTTTTCCCCACTAGACTAAATAATTCGTGGCAATATTCTTCCGTGAACATTTCTTTTTTTGATTTAACTTGGACATCCATTTTCTTTCTGATTTCAACTCATCTTGTCTGCCTATTGGAAACATGGACTTTTGTTTGGATTTGAAATAAACTGCTCATTCTCTTTGGACTGGAAAGGTTACTTTTAGAACAAATGAAGATTCATTGGGCTATTATGACGATAACTCAACTGAAAATAACTTGAAGTTTTTCTATTGAATTATGGTCCTCTTTAGGCTTTCTCTTTCGGACTTCCCTAAAAGTTTTTAAAACGTGTCTACTAGGGAGAGTTTTATGCACCCTTTATAAAGAATGTTCCGTTCTCCTCCTTAACCGATGTGGATCTCACAGTCCACCTGGCACTCGTTCCCTTTTCCAATCGATGTGGGACCCCCAACCCACCTCTCTTCGGGGCCCAACGTCCTTGCAAGCACACCGCCTCATGTCCACCCTCTTTGTGGCTCAGCCTCCTCGCTTGCACATCGCCCGGTGTCTAGCTCGAATACCATTTGTAACGGCCCAAGCTCACCACTAGCAGATATTGTCCTTTAAAATGCACCTACTAGGAAGAGGTTTCCACACCCTTATAAAGAATGTTTTGTTGTCCTCTCCAACGAACGTGGGATTTTACAAAGGTCATCGGATCTAATTACACAAGACTATTGGTTCTCTTGTTTGTTTATTCTGAAATGGAAACTCCTCCATGATTTGCTTCGTCTCTTAGCATTATTCGCATTTCTGGTCACCATGTTTTTTACTACTTGATGTCGTAGTTGTAATTTTAACCTACGAGCTTTGTCATTTTATGAATATTGGAAAAGGCATCTGGATACATCAACTAAGAGAACTAAAAGTTTCTTGGCCTGTTCTTGGGGAATCAAAAAAGGAAACAAAAATGGTCCTTTTATATGTATCTGTGACAGTCATCACCCCCTTGTCATAGCAGTTGGCAATAAGCCTCCATTCTTCAAAAAATTGCTTAGCTGCTTACCTTGGTGATATGTAAAGGATCAATATATGGCAAAAAGAAAGTGCATTGCACAAAAGTTCGAAGTGGGGGATCTCAATCGGCTCTCACCTTCAGTTGTTCCTTACCTCTACCTTACAGACAAGGGCCTTCAACTACGGCAATCACTTCAAACCTTCCACTTAAAGTCACATGCCTTAGATTTTTATCTATCTCAATCTGTCTTCTTCTACTTTGTCTTCTATGCTCAACAGGATTACATTGCAAAAAAAGGTATGATACTACATTATTTTTGTGAATGGCTTCATTGGCTGTTAGTGCTATACAGCGTTGTATTTGTGACTTTAGTTGTAGACTGCAAATTGATAATTGTAATACTTGTTGTCTACTGCACATTGAACTGCCTATGTGATTGATGACCGTGGGATCTTGTGCAACTTACATTTCTTCACAACATGTTGAATTAATTAGATGTACATTAAGAGGGTGTTCGGGTTACAGGGTGGTTTTGTTCGGCGTACGATGGAGAGGTAAGCCTATATATGATATGTTGGCCTATTTATCATATATTATAAATTTGTTAATCTTACAGGCTATATATACTCGGGAGTCAGGTATCGACTATTCACTAATTTTTGCACTTCACCACTCTGGTCGTCTCTAATCCGTGAGCCAAGTACTAGATGTATGCATGGTTAAAAATTACGGATCTCCGCAATGGTATGATATTGTTCACTTTGAGCATAAGCTCTCATGGCTTTGCTTTGGGCTTCCCCAAAAGGCCTCATACCAATGGAGACCTATTCCTTTATTTATAAACCTATGATCTTCCATTAAATTAACCAACGTGGGACTCACTCCCAATAGTCCTCAACAATCCTCCCCTCGAACAAGTACACTATAAGCCTCCCTTGAGGCTTATGGAACTCTTGAATAGCCTCCCCTTAATCGAGGTTCACAATTCTTTGTTCGATATTTAAGGATTCTATTGACATGGCTAAGTTTAGGACATGACTCTGATATTATGTTAGGAATCACGGATCTTCACAATGGTATGATATTGTCCACTTTGAGCATAAGCTTTCATGGCTTTGCTTTGGGCTTCACCAAAATGCCTCATACTATTGGAGATCTATTCCTTTACATATAAATCCACGATCTTCCACTAAATTAACTTAGGTGAGACTCACTCCCAATAATCTTCGACATGCATTAGACAGACGTACACGTTATACATTTTGCCTTTTGTATGTCTAGCACACTGTATATCCACGTGAAAGCACTTCATCTCTCTCTTAGTGACCCACGAGAAAACAAATGAAGTGCATTTTGTGCCTGATGTTCGGAAAGCTATGTAAAAACAAGCATATATGTGAAGCCAAAATCAAGTTGCCTGAGGAAGCTGCTTGGAAAGCAAACACGCTCTCAGGGGGTTTTGACAAATGGGTCACTGTACATGGCGATGGTCTTCTCAGATTCAAATCACTTCAAACTCGGAACCCTCCTATTTTTTTTCGTATTAGGTACTTTAACATCTAA

Coding sequence (CDS)

ATGAAGTGCATTTTGTGCCTGATGTTCGGAAAGCTATGTAAAAACAAGCATATATGTGAAGCCAAAATCAAGTTGCCTGAGGAAGCTGCTTGGAAAGCAAACACGCTCTCAGGGGGTTTTGACAAATGGGTCACTGTACATGGCGATGGTCTTCTCAGATTCAAATCACTTCAAACTCGGAACCCTCCTATTTTTTTTCGTATTAGGTACTTTAACATCTAA

Protein sequence

MKCILCLMFGKLCKNKHICEAKIKLPEEAAWKANTLSGGFDKWVTVHGDGLLRFKSLQTRNPPIFFRIRYFNI
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
CmoCh02G011360.1CmoCh02G011360.1mRNA