Cmc11g0296551 (gene) Melon (Charmono) v1.1

Overview
NameCmc11g0296551
Typegene
OrganismCucumis melo L. var. cantalupensis cv. Charmono (Melon (Charmono) v1.1)
DescriptionUnknown protein
LocationCMiso1.1chr11: 14839935 .. 14844047 (-)
RNA-Seq ExpressionCmc11g0296551
SyntenyCmc11g0296551
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonfive_prime_UTRCDSpolypeptidethree_prime_UTR
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TTTCCTCCCCACAAAACCCCAATTTCCCTCTTCCTTTCTCACAACCCACGCGATTTCAAACTCACCCATCCAGAATGCCGCCGACCCGAACGCTGCCGAACATCGTGGAATGCCGCCGACGCTTCCCATGCTCACCCATCCTGAACGCCGAACACCGAACACTAACTTCCATTCGAACGTCGAACGCCTAACGCGAACGCCACTCCCTTGCTCCCCTGCTCGCCGAACGTCGCTCCCCTATTCACCGAACGCCAAACACTACCGAATTTTGTGATGGGGATCTCGATTTTCCGATTCTTCTAATTGATATTTGTTCATCTTTTCATGATTTCTTGTTCTCTTTTGCTATCTTTGTTGTTTGTTAGACTGCTTGATTTGATTACTCTTGTGGGTTTCTTTTTGTTTCGTATCATGTTCTTAGACAAATTGAAAATAGCCAGCTAAGGGAAAAGAGAAATGGGATTAACCTTCACCAAGCTCTTCGATAGGCTTTTTGCCAAGAAGGAGATGTGGATTTTGATGGTTGGTCTTGATGCTGCTGAAAAGACCACGATCTTGTAAAAACTATCATATTTATTAGCGATAGCGTATATATTGTTATTAACAGTAAATGTGGGTGCCTTGTGTAACATTTTTGTCACGGGCTCAATTTGGCAACAAAGTAGTTTTGTATGATTATTGATCCTTCTCGTCTGCTAGTATTTTTATTATCTTTTTCCAGTAAAAATATGTTAACATTTCATTTTTAAATGTATTTCACCAATGCAGGAATTAAATACTGATGAGGATTTTATTTCTTGTTACGAGGAAATTATTCCATTGGTACAAACATTACCACTGGTGATACTGCACAAGGAGTCTATATTCTTAAATCTTCTTTCTAGAGTACAGATAAAAGCAAAGTTATCTCTCTTGAGCCTATATTGAGGTATGCCCAGTTTATTTGTTAATTATCTTTGTTTTTGATACCATACCTTAGATTTTAACTTGTCTTTTAACTTTTTATACTTATTTTTTTTTAAAAAAACCCTGAACGTTCAAAAACTAAGGTATAGTATTTCGCTCTTATTTCAGTTTTTGTATTCAATGCCATGCAGATTGACCATAAAGCTATGCTAAATTCCAATCCTTATTCTTTATTTTTTGTTTCAGTTTGTTCTATTTGCTTTTAAATTTTTTTGTTAGGGAAGTTAGTTATAAATAAAGGACAGGAGAACGTGAAAGGGGAGGAATATTTGGTATGTGAACTAGGGGTTTGAGAGTTATCTCAAGATAGGCTTGAGTGATCACAAGAAGGGAAGAGGTTAAAGTGTATTTTTTGTTTGGTTCTCACACCTTGAGGCAAGGTGTGTTTTAGTGGCCGGTATTGATAGTATTGGTATTAGAAGAATATTAGGAGTACTGTTAGGTATTTAAGCTCCTTGAAGAACCACACCCCAAAAGTCAGCGGTTTGGGTGAGAGAGGCAGAGAGCCCAGTCATCTAAGTACTACATTGGTTATCCCATTCTAACCAATGTAGGACAAAGGTATCCATTCTTATGCTTTCTTCTTGTATGGTACGAATTTTGTCACTTTCCATTTCAGGTTGATTGCGGCTTTGCAAGAGATCTGTTGGACTTTTTGCTGTTAGTTCTTTCTCCCTTGGACTGAAATCTTGTTTGTATTTATTTGTACATCATTCATTCATTTTTCTTTTTTTTTCATCCTGTGCCAATTTTTTCTTTTTCTTTCTTCTTTTCCGTAAGATTAGAGATAATCGAATTTGTTTGTTAAATCACGACCATAGATATTACAATATGCAACGGTATAAATGATATTGATGTTGCTTAAATGACACGGGGAATTCTCCAGGAAATGTAACAAAAGAAATTCTGATGATTCTGAAGTGTCTGATGCATGAGATTAACCCTCCATTTATATCGGATCGATTAACAACAGTTTATTCGCATTTGACTAATTTCGAATGGGCATTGATATATTAATTATTTGAATAGAAAAGGATAAATGTGAGCGTAGGAAATAGTGGATATGATATATAAACCTTATTGTGTATATAATTACTTCAAACTTAGAGAGATTGAAATATGAAATTTCAAGTAAGAGGGAGCTGTATGGTAAGGTATTCTAAAAATTAAGGTGAAGAAAGATGGCCTTGCTCTAAGAGAGAAGCAATGCAGTCATCAAACATCTCTTCCACACACTTGAACTTCATTCCCAATTTCTCAATCTTTGACATGTTGTAATCATAATATGGTCTGTTTGATGCCTCAAACCTGAAAAGTGAGATGTTCAACCTTATCCTTAACACCATTCTCAACAACACGTCTATTACAAAACTAATAACCGACACCGCTTAATAATCGTTTGGTTTTTGGAAAGTTATTTAGTTCTCTTGTCATTCTTTATAATGGTTTTTCATCTTTAGTAAGCATTATTTGAATTATTAACTAAATTCATAAAACAAAAACAAGATTTCACGGCCTTTTTATGACCATTCCGTTGTTTGTTTCTGAAAAATAGGCTTGTACGAACTACTCCTACCTTTATAAGTTTTATCCAATTCTACCGATGTTTTCAAACATTGGCCAAAGTCTTGAAAGCTAGAAAAATATTTTTAGTAACCATGTTTTTTTTTCTTGTTTTTTGTTTTTAAAAATTAAATTTATTCACTTTGATTTGTGTTTTTTAAGTACAAAAGTTCATTTCTTAGCTAAATTTCAAGAACAAATACTACTTTTTTACAAACTACTTTTCTTAGTTTTCAAAATTTGACTTGGTATTTTGAAAGATATTGGTAAAAGATCGATAACAAATCAAAAAAATTAGAAGTGGAAAAAGTATTTATAAACTTAATTTTCAAAACCAAATTATTATCGAACAAAGCTTTAAAGATTTATTTTTGTTTTTTCAATTTGACTAAAAATTCAAATCTTACGTTCAGAGGAAAATCATACCATTGGAAGTAGCTTACATTAATTTAAAAAGTTAAAAACTAAAAACATGAAGCTACTCTTTATTAGCTTTCTGACACTTGAAAATTGTATCATGTAAATGTGACAAAAACATGAAATTTGAAAATTGTATGAGAGAGAGTAACAAAACAAATCAAAAGAATGTATATTATAGGATGAGGTCGAGTTTATAAGTTTAAATTTCAAAAACCAAAATTGAAAGAAAAAGAAAATCAAATAGTGTTATCTGATAGTCTAAGTCTTTCAAAATTAAGCTTGATTCCAATCATAGGAAAAGTTGATTTCTTATCTAAAAGAAAATTTTGATGGTTAAGATGATTGAAGTATACTTTTTTGAAATAGGGAACAACGGATAGCGAGACGATAAGCGTGATGCCAAGTCATTGATTTCCAGCACAATTGAGGAGCAAATGTATCTGCCTTGAGCATCTTTGTTCTCAAAAGCAAGGATGTGTGAGAGGGCAACATCATCAATGTGAATATATCCTACCCTTCCAAGTGATTGGAAAGGCTCAGTCTCCCCTGCATTGTTTCATAAAACGACACAGTTTATATGCTTTCTGAAAACTAAGACTGAAATAGAAAGCCATTGAAGTTTCACACACCTTTAAGAAGGCCAAGGACAATGGATGCTGTATAACATAAATCCCGTGACAAATTAGGCCCGATGATCACTGAAGGGAGCACAGTTACTAAATCGATTCCATTTTCGTTGCAGAATTCCCACGCTGCCTTTTCTGCTAGAGTTTTTGCAAGAGCATACCACAGCTTTTGTTTGAGGTCCCACACAAGGTTTTTACGTAAGAAATGAGAAACACATTAAGAAATCAGTCCATCAACTTACGCCATCTTTCAATCCATATAGGCTATAAAATTCAAAATGATGGTTAATAGCAGTAGGGATATGTTGGATTAAGTAACGGGATTTTCTTTCTAATATTCGTAAGTATCTGGTCTGGACCAACTTGTTCACACTTTGACTACTCTCACAACACAGCCCTACAACCTTACTTATTTTGATAGCTAAGAAAATCGTGACTTAAATACATTTGTTTTGTTTTTGGTTTTTAATAGAACTTTATATTTGTATCATGGGTAAACTTCAAAAACAAAAAATAGATAAGAAGTCAAAAAAATTGT

mRNA sequence

TTTCCTCCCCACAAAACCCCAATTTCCCTCTTCCTTTCTCACAACCCACGCGATTTCAAACTCACCCATCCAGAATGCCGCCGACCCGAACGCTGCCGAACATCGTGGAATGCCGCCGACGCTTCCCATGCTCACCCATCCTGAACGCCGAACACCGAACACTAACTTCCATTCGAACGTCGAACGCCTAACGCGAACGCCACTCCCTTGCTCCCCTGCTCGCCGAACGTCGCTCCCCTATTCACCGAACGCCAAACACTACCGAATTTTGTGATGGGGATCTCGATTTTCCGATTCTTCTAATTGATATTTGTTCATCTTTTCATGATTTCTTGTTCTCTTTTGCTATCTTTGTTGTTTGTTAGACTGCTTGATTTGATTACTCTTGTGGGTTTCTTTTTGTTTCGTATCATGTTCTTAGACAAATTGAAAATAGCCAGCTAAGGGAAAAGAGAAATGGGATTAACCTTCACCAAGCTCTTCGATAGGCTTTTTGCCAAGAAGGAGATGTGGATTTTGATGGTTGGTCTTGATGCTGCTGAAAAGACCACGATCTTGTAAAAACTATCATATTTATTAGCGATAGCGTATATATTGTTATTAACAGTAAATGTGGGTGCCTTGTGTAACATTTTTGTCACGGGCTCAATTTGGCAACAAAGTAGTTTTGAATTAAATACTGATGAGGATTTTATTTCTTGTTACGAGGAAATTATTCCATTGGTACAAACATTACCACTGGTGATACTGCACAAGGAGTCTATATTCTTAAATCTTCTTTCTAGAGTACAGATAAAAGCAAAGTTATCTCTCTTGAGCCTATATTGAGGTATGCCCAGTTTATTTGTTAATTATCTTTGTTTTTGATACCATACCTTAGATTTTAACTTGTCTTTTAACTTTTTATACTTATTTTTTTTTAAAAAAACCCTGAACGTTCAAAAACTAAGGTATAGTATTTCGCTCTTATTTCAGTTTTTGTATTCAATGCCATGCAGATTGACCATAAAGCTATGCTAAATTCCAATCCTTATTCTTTATTTTTTGTTTCAGTTTGTTCTATTTGCTTTTAAATTTTTTTGTTAGGGAAGTTAGTTATAAATAAAGGACAGGAGAACGTGAAAGGGGAGGAATATTTGGTATGTGAACTAGGGGTTTGAGAGTTATCTCAAGATAGGCTTGAGTGATCACAAGAAGGGAAGAGGTTAAAGTGTATTTTTTGTTTGGTTCTCACACCTTGAGGCAAGGTGTGTTTTAGTGGCCGGTATTGATAGTATTGGTATTAGAAGAATATTAGGAGTACTGTTAGGTATTTAAGCTCCTTGAAGAACCACACCCCAAAAGTCAGCGGTTTGGGTGAGAGAGGCAGAGAGCCCAGTCATCTAAGTACTACATTGGTTATCCCATTCTAACCAATGTAGGACAAAGGTATCCATTCTTATGCTTTCTTCTTGTATGGTACGAATTTTGTCACTTTCCATTTCAGGTTGATTGCGGCTTTGCAAGAGATCTGTTGGACTTTTTGCTGGAACAACGGATAGCGAGACGATAAGCGTGATGCCAAGTCATTGATTTCCAGCACAATTGAGGAGCAAATGTATCTGCCTTGAGCATCTTTGTTCTCAAAAGCAAGGATGTGTGAGAGGGCAACATCATCAATGTGAATATATCCTACCCTTCCAAGTGATTGGAAAGGCTCAGTCTCCCCTGCATTGTTTCATAAAACGACACAGTTTATATGCTTTCTGAAAACTAAGACTGAAATAGAAAGCCATTGAAGTTTCACACACCTTTAAGAAGGCCAAGGACAATGGATGCTGTATAACATAAATCCCGTGACAAATTAGGCCCGATGATCACTGAAGGGAGCACAGTTACTAAATCGATTCCATTTTCGTTGCAGAATTCCCACGCTGCCTTTTCTGCTAGAGTTTTTGCAAGAGCATACCACAGCTTTTGTTTGAGGTCCCACACAAGGTTTTTACGTAAGAAATGAGAAACACATTAAGAAATCAGTCCATCAACTTACGCCATCTTTCAATCCATATAGGCTATAAAATTCAAAATGATGGTTAATAGCAGTAGGGATATGTTGGATTAAGTAACGGGATTTTCTTTCTAATATTCGTAAGTATCTGGTCTGGACCAACTTGTTCACACTTTGACTACTCTCACAACACAGCCCTACAACCTTACTTATTTTGATAGCTAAGAAAATCGTGACTTAAATACATTTGTTTTGTTTTTGGTTTTTAATAGAACTTTATATTTGTATCATGGGTAAACTTCAAAAACAAAAAATAGATAAGAAGTCAAAAAAATTGT

Coding sequence (CDS)

ATGCCGCCGACGCTTCCCATGCTCACCCATCCTGAACGCCGAACACCGAACACTAACTTCCATTCGAACGTCGAACGCCTAACGCGAACGCCACTCCCTTGCTCCCCTGCTCGCCGAACGTCGCTCCCCTATTCACCGAACGCCAAACACTACCGAATTTTGTGA

Protein sequence

MPPTLPMLTHPERRTPNTNFHSNVERLTRTPLPCSPARRTSLPYSPNAKHYRIL
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Cmc11g0296551 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Cmc11g0296551 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Cmc11g0296551 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Cmc11g0296551 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Melon (Charmono) v1.1
Date Performed: 2022-10-13
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 1..54
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 11..29

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Cmc11g0296551.1Cmc11g0296551.1mRNA