
Cmc11g0294341 (gene) Melon (Charmono) v1.1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRCDSpolypeptidethree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.CCATTATTATTCTACCCTCACCTTTTATATATATTGTACCAGCACCAAAATTGAATAATCCATCCATATCCATAAAAAAAAAACTCTGCCTCTAAAATTATCAATGGCGAAATCTCTCCCACTTTACGAAAAGACAAATATCAAGAGGCCAACCCAAAGAGTATTGGATATTACCATATTCATCCTATTAGTTTCTCTCAATGCTTATCGAGTATTGTTGATCTACAATCATGGCTTCTCCTATCTCCAAATCATTGCATTCCTTTGTGAATTTTGGTTCTCTTTCATTTGGTTTCTTACTATTATCATCAAATGGAACCCCGTCCATTATGAAACTTACCCTCAACGCCTTCTCGAACGGTAAATACATAACTCTTTCTTTTTATTTGTTACATCTCTGTGGAACAACACTATTTATAATTATTTTTTAAAAATATATATATTTTTAATTACTTAATATTAACAATTCATTCCAAATATATTTTGTGTAGGGATGCTTTAGTCCGATTTAGCAACTCATTTGTCTTTTTTTTTTCCTCTTTTGAAAGTTAAACTTACATGCACATCTTCCACTACTATACACTCTACCTTTAAGAAGGGAAATATAATAATTTTTGTGTACTGAAGGGAGATGGAATATCCGGCGGTGGATATATTTATAACGACGGCAGATCCGGTGTTGGAACCGCCGATAATAACAGTAAACACCGTGTTGTCTTTGATGGCGTTGGATTATCCGGCAAACAAACTTGGTTGTTATGTGTCCGACGACGGCTGCTCTGCTCTAACGTTGTATGCATTAAAAGAAGCATTGAAATTTGGAAAGATTTGGGTTCCATTTTGCAAAAAATATGAAATTCAAGTTAGAGCTCCGTTTAGGTATTTCTCGAATGACTCAATGCCGCCTCATCTTCCTTCCTCCACACAATTCCTAAATGATTGGTATACGGTGAAGGTAATGATCGACAACGACACAACCCAAATTCTCTCTCTCTTTTATTTTCTTCAACTAACGATATAAACCACTTTAATTTTGGTTGTTGGATTTTAAATATTGATTGACAAGAAGCATATCAAGACAATCTCTGAATTTTTATAATTTATTATTTAATTTTTATGCACGTTTTATTGAAAATTATTTTTAAAGATAAAATATACCAAAGTATTTTATGTTATAGGAAAAAAATATTTAACCACTTATCTTTATGTATTGAAATTCAAGGTAGATACCAATTTGAAAATTGTCCATGGTAATTTGAAGACTGAAAAGTAATAATATTTATATGTATGGAAAGCGAAGGTAGAGTATGAGAAGCTTGAAGGAAAAATAAAGGAAGCAGAAGAAAGCAGATCATTTGGTATAGAAGAAGAAGATGGAATTGACCTGGCAGCTTTCTCCAATCTCCACACCAAAAATAACCATCCCACCATAGTTAAGGTGTACTCCTCTCTTCTTCTACTTATATATACCCGTGATCCCTTTTCTTTGGCGTTTTCTCTTTTCTTTGGGAGTTCTAGAATAGGTATAACTCTCTTGGTCGATAAGATTTTAGTTAATTAGTTTGAAGTTTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGTTTATATGGTCCATAATCTCATATTTCTCATTTACTTCTATTTTCACACCAAACACCATTGACCATCTCCCCCGTGATAAAGCCAATCCTTTCTAGTACTTCCAACATTCACCATTTCTTGGCTTTATTTTTGGAGAGAAAAAACCAATGTACAAAAAGAATGAGAAAAATAAAAGATATGAAATGAAAAGTTGAGTACCATTTTCGTCCCATTTTGATGAGTTTGGATTAATTCAAATCTTGAATTTCCGTAAACATATTTATTTACACAATTTCCCAAACTAGAGTTAAAAATGAATAAATGATTTTAAAAGTGATTGTAATTAAATGTTTTATATTATTAGATTTAGATGTTTAATTAATTAATACAATTAGAAGTTATATAATTTTTTTATTTTTTTTTTTGAAAAGGAAAGGACAAAAAATTTGTTATTTTTAATCCTCGACTCTTGTCGAGGAAGGTACCTTTTTATTCCTCTTTTCGTTCTACTGAGAAAATAGGTTTACATGATTCTAAAAATTTTGTCATAACTATTTTTAGTGACTCATGAAAGAATATAGATGACATGTGAAAGATATGTAATAATTAGTTGTTTCTTGACTTACATATTTAGTCAACAAATATCATTAATTGATATTTATTATCTATCACAATAATATTGATTATGAAAAATTATCATATTGTCATTGCACAATCAAAGATTTAAACCTTTGATCACATGAAGTATATATCATATGTCATTTAAGCCATATCATCATGTTCGTTTGTTTACTGAATAAATGAGAACTGTAAGTTTTATTTCCATCAGTATATTTAATAAATATTTGTTTCTTGTATTGGACTCAAAGGGATTTCAAATATTTATTTTGTTAAGCTCATCACAACAAACATAATATATAGTGGCCATATTTTATATAACTTATAAGTGTGTATTTATTTACAGATACTGTGGGAGAACAAAGAAGTATTAGATGAATTGCCACATCTAATATATGTATCAAGGGAGAAAAGTTTCAAACATCACCACCATTATAAAGCTGGTGCTATGAACGTTTTGGTAATTTAGTTTCTATAAATTATAATTAAAATTTATTCTCACCATTTAATTTAACTTTCATAGATAGTTCTGTTCGTTTTTTCCACTAATTTTGGTCATGGAGCAAAATGGTCATTTGACCATTCTAGTAAAAGTCAAACTGTGACTTTTTTAAGTCAAAAATCAACATTTTGGCTTTTTACCATTTTGTCCATCTTGACTAATTCCAACCTCCTAAACATGAATCCGTATTCATTTTTTTCAAATTCAAATCACATTTGAATATAAATCCGGTCAAAGTTTGACTTTTTAAAGTCAAAAGTCAACATTTTGACTTTTTATAATTTTGACCATTTCCATTAATTCCGAGCTTTCGAATATGAATCCCTATTCATATGTTTAACATTTAAATCACATTTAAACATAAAACTCTTACTTAAAGCTATAATCGACGACTATATCACATATAGTTGTCGATTTCTGTCTCTTTACATTAATCAAACAATTCGAATTATTCCAACATGTTGTTTTAAGTTAATTTCTTATGAGCTAGCAGAGGAACCTAATGTATCAATAGATCATGGCCTCCAACGATCCGAGATTAACTGGCCAAGCTAATCAACATTCGTTAACTAACGAGTCATTCCACTAAAGTCTCGTAGTTGCACTCCCCTCACTATAGATATATTTCTGTTCATATGATATAACTATGATCAGTAAGTTAATCCTTCACAGGTTTTTCGTAATCTCGGCTGGGTCAAAATACTGTTTTACACCTTGACCAAAGTTAGTGGGAAAATCCAACATTTTGTTGGATAATTCTACTAACTCTTGGTGAGCTTTCTGGAAGCTTATGTGGTTATGACACCAAGCCCACTAAGAGAAAATGGAATAGTGATTAATTCCACTAAATGTTAGTGGAATGCTAGGTGTTGAAATTTTGGCCAAATAATTACATGCAATTTTGCATGTAATTAGGTTATAAATAGTCCTCTTTTAAATTTGAAAAAAACTTTTGGCCATTTTGATGATTTTTTAATTTCAAAATCATTTTTTCTCTCTTTAAAAATTATACCTATCTCAACCTAATTCCCTTCAAATTTCCACATCTCTCTCTAATTCCTTCAATTAACGAGTCCCACAACCCGGTTATGAGTCTTGAGAATAGCGGGTCAACACTAGTGGTGGTCCCAGATTCGTGATCGTGAGGAGTTTTCGAGAAGAATTGGAGGATCGAGAGCTTCAAAGGTAATGTTTTCTTTTAACCCTAATTAGTGTAATTAGGGTGTCTTAAGCATGATTCACATCTAAATTAGTTTAGATGCATCTAGGGTAAATTTTTGATCCGTATTTCCGCTGTGTTTGTATGCTTTACATCAAGTTCATGTCAGAATAAATGGTTATTGTTCGTGTTTCTTCATGAATGTATCATGAATGGATGCATCATTAGTAGATGCATCACTTCATGAAAGTATTATAGAAAAAGGACACGACTTTTCAAATGACCATGAATAAGTCTATAAATACGGTCCTTTTTTATTTGGTTGGAGAAGAGAAACATTTCCATAGTCATTTGTCTTCTTCCGAATCGATTTCCTCTCCATTATCTAGAATTTTGACCTTCGGTAGATCCACAAAGTTTTGTTCGTTGATCTTCTAGACGGGGTGCTACTCTTAGAAGAAAGGTAATCTGTTCTATCTTGGGAGACAATTACTCTCAAAACTCAAGCACTAAGGTGAGTAAATTTGTATTAAGGAGACAACGTGAATTTGTTGGGCTCAGATCTATATCATGAAAGCGAGACGGGCCCTTTGATGATTCGATTCGTAAGAAAGCTAGTGGAGAATACCTCTTTGAATTGTATTCACTCCGGATTTCCCGTCTGCTTAGTTGACCAGGAGGAATTCGATGAAGGATGGGTCCTCCGATCTTAATACTCTGAAGCAAAAACAGAGGTTCAGATGCTCAAAGAACAAAGAATTTGAGGTGAGACTGAATCATTGAACAAAGGTTTGAGCCTCCGCAGTCAAACCTACTGAGCGGTGAGGATCGAAGCGGTTGAGGCAAGAATATGGCCAGGTAATTTCTCGATTATGTGTAATGGATACTGTACAAGCCTAATGCTCTTCGTTCGAGGGTGCAGAAAAAGCTTCTACTTTTCTAATGGAAACTACTTAAACAACCGTCTCAATGAACAAGGTGAAAAGAAGATGGAATCGCTCAATTACAACCTTGTTCATTGATTTCTCCGTAGCTCCGCGTAACGGACAAACTGAAACCTTTTATCATTGATTCTTTAGAAGCGGAAGCGGCTCAACTGTCAGGAGAGGCTCAATGCAATATGAGTTAGGACCAAAG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ATGGCGAAATCTCTCCCACTTTACGAAAAGACAAATATCAAGAGGCCAACCCAAAGAGTATTGGATATTACCATATTCATCCTATTAGTTTCTCTCAATGCTTATCGAGTATTGTTGATCTACAATCATGGCTTCTCCTATCTCCAAATCATTGCATTCCTTTGTGAATTTTGGTTCTCTTTCATTTGGTTTCTTACTATTATCATCAAATGGAACCCCGTCCATTATGAAACTTACCCTCAACGCCTTCTCGAACGGGAGATGGAATATCCGGCGGTGGATATATTTATAACGACGGCAGATCCGGTGTTGGAACCGCCGATAATAACAGTAAACACCGTGTTGTCTTTGATGGCGTTGGATTATCCGGCAAACAAACTTGGTTGTTATGTGTCCGACGACGGCTGCTCTGCTCTAACGTTGTATGCATTAAAAGAAGCATTGAAATTTGGAAAGATTTGGGTTCCATTTTGCAAAAAATATGAAATTCAAGTTAGAGCTCCGTTTAGGTATTTCTCGAATGACTCAATGCCGCCTCATCTTCCTTCCTCCACACAATTCCTAAATGATTGGTATACGGTGAAGGTAGAGTATGAGAAGCTTGAAGGAAAAATAAAGGAAGCAGAAGAAAGCAGATCATTTGGTATAGAAGAAGAAGATGGAATTGACCTGGCAGCTTTCTCCAATCTCCACACCAAAAATAACCATCCCACCATAGTTAAGATACTGTGGGAGAACAAAGAAGTATTAGATGAATTGCCACATCTAATATATGTATCAAGGGAGAAAAGTTTCAAACATCACCACCATTATAAAGCTGGTGCTATGAACGTTTTGACAAGAGTGTCTGGTGTATTAACAAATGCTCCATACATATTAAACGTGGATTGCGACATGTTTGCCAATAATCCCCAAGTTGTATTACATGCAATGTGTGTATTTCTCAACTCGAAAGATGATTTGGAAGATATCGGATATGTTCAAACTCCCCAATGCTTCTACGATGGCCTTAAGGATGACCCCTTTGGAAATCAACTAGTGGTTGTATTCCAGTACTATTCACGTGGGGTCATGGGACTTCAAGGACCTCTCTATAACGGGACTGGATGTTTCCATAGACGAAATGTTTTATATGGCCAATTTCCTCACCACACCACACATTTCATGGACGGAAAAGCTTCTGAACAAGAATTAATGAAACTATTTGGATACTCAAAATGTTTTGCAAAGTCAGCAAGTTATGCTTTTGAAGAAACCACACATGGCTATCATCCAAATGGCCTTTTCAATGATAATCTTGAAGCTGCTAAACAAGTTGCTGGATGTGGCTATGAGATCAACACTACTTGGGGTTCAAAGATAGGGTGGATATATGGATCTACAACTGAGGATATTTTAACGGGCTTAGTTATTCAAACAAGAGGGTGGAGATCCATTTACATTGCATTAAACCCTCCAGCATTCCTAGGTTGTGCAGCCTCACAACTTGTTGCTTCATTAACTCAACAGAAACGATGGGTCTCTGGTTTACTTGAAATTTTATTCAGCAAACACTTCCCTGTTTTTGGTACACTATTTGGGAAGCTACAATGGAAGCAATGTGCAGCCTACTTATGGCTCCTCACTTGGGGCCTTCGTTCCATTCCAGAGCTTTCCTATGCTTTACTTCCACCCTATTGTCTCATCACTAACTCCTCTTTCTTCCCGAATATGGAAGAAAGATCAATCTCCATCCCAATTTTTCTGTTCATCATTTACAACTTTCAACAATTATTACTATACAAAGAAACAGGACAATCAATAAGAGCTTGGTGGAATAACCAAAGAATGGGAAGGGTAAACACAATGTGTGCATGGTTGTTTGGATTAGGGAACGTGGTTCTAAAGTTTTTGGGTGTAAGGGAAGTTGTGTTCGAAGTAACAAAGAAAGAGACATATTGTGAGGCAGACTTGGTGGGGCATTTCATGTTTGATGAGTCCGCAATGTTTGTGCCAGCGACGACCCTTTTATTGCTCCAACTTATTGCTTTGCTTATGAGCTTCATAAGACAAGCTGGGAGAATGAGAAATACAGTGCTTGAGGTGATTTGTAGTGTATGGTTAGTTTTATGCTTTTGGCCATTTTTAAAGGGAATCTTTGTGTTTGGTAAAGGAAGATGTGGACTTCCTTTCAGCACCATCTACAAATCAGCTGCCTTAGCATTGTTGTTTGTGCTTTTGTGCCAAAGAACAACCGTGAATTAA MAKSLPLYEKTNIKRPTQRVLDITIFILLVSLNAYRVLLIYNHGFSYLQIIAFLCEFWFSFIWFLTIIIKWNPVHYETYPQRLLEREMEYPAVDIFITTADPVLEPPIITVNTVLSLMALDYPANKLGCYVSDDGCSALTLYALKEALKFGKIWVPFCKKYEIQVRAPFRYFSNDSMPPHLPSSTQFLNDWYTVKVEYEKLEGKIKEAEESRSFGIEEEDGIDLAAFSNLHTKNNHPTIVKILWENKEVLDELPHLIYVSREKSFKHHHHYKAGAMNVLTRVSGVLTNAPYILNVDCDMFANNPQVVLHAMCVFLNSKDDLEDIGYVQTPQCFYDGLKDDPFGNQLVVVFQYYSRGVMGLQGPLYNGTGCFHRRNVLYGQFPHHTTHFMDGKASEQELMKLFGYSKCFAKSASYAFEETTHGYHPNGLFNDNLEAAKQVAGCGYEINTTWGSKIGWIYGSTTEDILTGLVIQTRGWRSIYIALNPPAFLGCAASQLVASLTQQKRWVSGLLEILFSKHFPVFGTLFGKLQWKQCAAYLWLLTWGLRSIPELSYALLPPYCLITNSSFFPNMEERSISIPIFLFIIYNFQQLLLYKETGQSIRAWWNNQRMGRVNTMCAWLFGLGNVVLKFLGVREVVFEVTKKETYCEADLVGHFMFDESAMFVPATTLLLLQLIALLMSFIRQAGRMRNTVLEVICSVWLVLCFWPFLKGIFVFGKGRCGLPFSTIYKSAALALLFVLLCQRTTVN Homology
BLAST of Cmc11g0294341 vs. NCBI nr
Match: XP_004151936.2 (cellulose synthase-like protein H1 [Cucumis sativus] >KGN63235.1 hypothetical protein Csa_022495 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1404.4 bits (3634), Expect = 0.0e+00 Identity = 683/748 (91.31%), Postives = 716/748 (95.72%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc11g0294341 vs. NCBI nr
Match: XP_004151897.1 (cellulose synthase-like protein H1 [Cucumis sativus] >KGN63234.1 hypothetical protein Csa_022325 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1274.2 bits (3296), Expect = 0.0e+00 Identity = 626/750 (83.47%), Postives = 679/750 (90.53%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc11g0294341 vs. NCBI nr
Match: XP_004151937.3 (cellulose synthase-like protein H1 [Cucumis sativus] >KGN63423.2 hypothetical protein Csa_022385 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1260.0 bits (3259), Expect = 0.0e+00 Identity = 610/750 (81.33%), Postives = 674/750 (89.87%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc11g0294341 vs. NCBI nr
Match: XP_038902792.1 (cellulose synthase-like protein H1 isoform X2 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1231.5 bits (3185), Expect = 0.0e+00 Identity = 603/747 (80.72%), Postives = 659/747 (88.22%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc11g0294341 vs. NCBI nr
Match: XP_038900388.1 (cellulose synthase-like protein H1 isoform X1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1226.5 bits (3172), Expect = 0.0e+00 Identity = 600/748 (80.21%), Postives = 659/748 (88.10%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc11g0294341 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q339N5 (Cellulose synthase-like protein H1 OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=CSLH1 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 665.6 bits (1716), Expect = 6.5e-190 Identity = 364/757 (48.08%), Postives = 474/757 (62.62%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc11g0294341 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O80891 (Cellulose synthase-like protein B4 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=CSLB4 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 621.3 bits (1601), Expect = 1.4e-176 Identity = 354/765 (46.27%), Postives = 465/765 (60.78%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc11g0294341 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8RX83 (Cellulose synthase-like protein B3 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=CSLB3 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 613.6 bits (1581), Expect = 2.9e-174 Identity = 348/764 (45.55%), Postives = 468/764 (61.26%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc11g0294341 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O80899 (Cellulose synthase-like protein B2 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=CSLB2 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 566.6 bits (1459), Expect = 4.1e-160 Identity = 330/768 (42.97%), Postives = 459/768 (59.77%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc11g0294341 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q7PC71 (Cellulose synthase-like protein H2 OS=Oryza sativa subsp. indica OX=39946 GN=CSLH2 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 565.1 bits (1455), Expect = 1.2e-159 Identity = 329/772 (42.62%), Postives = 442/772 (57.25%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc11g0294341 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0LMT9 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_2G416250 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1404.4 bits (3634), Expect = 0.0e+00 Identity = 683/748 (91.31%), Postives = 716/748 (95.72%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc11g0294341 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0LQD3 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_2G416240 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1274.2 bits (3296), Expect = 0.0e+00 Identity = 626/750 (83.47%), Postives = 679/750 (90.53%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc11g0294341 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3C389 (cellulose synthase-like protein H1 isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103495979 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1223.4 bits (3164), Expect = 0.0e+00 Identity = 601/751 (80.03%), Postives = 665/751 (88.55%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc11g0294341 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1G5L2 (cellulose synthase-like protein H1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111451107 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1055.8 bits (2729), Expect = 8.3e-305 Identity = 521/750 (69.47%), Postives = 608/750 (81.07%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc11g0294341 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1CHW9 (cellulose synthase-like protein H1 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111011082 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1049.3 bits (2712), Expect = 7.7e-303 Identity = 523/754 (69.36%), Postives = 606/754 (80.37%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc11g0294341 vs. TAIR 10
Match: AT2G32540.1 (cellulose synthase-like B4 ) HSP 1 Score: 621.3 bits (1601), Expect = 1.0e-177 Identity = 354/765 (46.27%), Postives = 465/765 (60.78%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc11g0294341 vs. TAIR 10
Match: AT2G32530.1 (cellulose synthase-like B3 ) HSP 1 Score: 613.6 bits (1581), Expect = 2.1e-175 Identity = 348/764 (45.55%), Postives = 468/764 (61.26%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc11g0294341 vs. TAIR 10
Match: AT2G32620.1 (cellulose synthase-like B ) HSP 1 Score: 566.6 bits (1459), Expect = 2.9e-161 Identity = 330/768 (42.97%), Postives = 459/768 (59.77%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc11g0294341 vs. TAIR 10
Match: AT4G15290.1 (Cellulose synthase family protein ) HSP 1 Score: 542.7 bits (1397), Expect = 4.5e-154 Identity = 322/772 (41.71%), Postives = 450/772 (58.29%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc11g0294341 vs. TAIR 10
Match: AT2G32610.1 (cellulose synthase-like B1 ) HSP 1 Score: 521.2 bits (1341), Expect = 1.4e-147 Identity = 310/772 (40.16%), Postives = 445/772 (57.64%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Melon (Charmono) v1.1
Date Performed: 2022-10-13 Position : 0 Zoom : x 1
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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